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Identification of refactoring opportunities for source code based on class association relationships
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作者 LIU Wei YANG Na +2 位作者 HUANG Xin-di HU Wei HU Zhi-gang 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS CSCD 2020年第12期3768-3778,共11页
In order to deal with the complex association relationships between classes in an object-oriented software system,a novel approach for identifying refactoring opportunities is proposed.The approach can be used to dete... In order to deal with the complex association relationships between classes in an object-oriented software system,a novel approach for identifying refactoring opportunities is proposed.The approach can be used to detect complex and duplicated many-to-many association relationships in source code,and to provide guidance for further refactoring.In the approach,source code is first transformed to an abstract syntax tree from which all data members of each class are extracted,then each class is characterized in connection with a set of association classes saving its data members.Next,classes in common associations are obtained by comparing different association classes sets in integrated analysis.Finally,on condition of pre-defined thresholds,all class sets in candidate for refactoring and their common association classes are saved and exported.This approach is tested on 4 projects.The results show that the precision is over 96%when the threshold is 3,and 100%when the threshold is 4.Meanwhile,this approach has good execution efficiency as the execution time taken for a project with more than 500 classes is less than 4 s,which also indicates that it can be applied to projects of different scales to identify their refactoring opportunities effectively. 展开更多
关键词 identification of refactoring opportunities abstract syntax tree class association relationships common association classes source code
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Research on Role Definition of Industry Association and Administrative Organ
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作者 FEI Kaizhi HUANG Lisha 《International English Education Research》 2015年第10期98-100,共3页
Industry association is an important part of China's economic and social life, which plays an important role in these areas. However, due to various reasons, there exist some objective difficulties and problems for i... Industry association is an important part of China's economic and social life, which plays an important role in these areas. However, due to various reasons, there exist some objective difficulties and problems for industry associations. In March 2013, Chinese government requires to clear relationship between govemment~ market and society, actively yet prudently carry forward the work of canceling the subordinate relations between industry associations and administrative organs, speed up the construction of modem social organizational system that is independent of government, and with well defined rights and responsibilities and self-governing by law. In such a background, it is especially necessary to deeply analyze the role definition of industry association and administrative organ, discuss how to clarify the role relationship between industry association and administrative organ, and consider how to promote the better and faster development of industry association. This paper has briefly introduced the development status and existing problems of industry association, and put forward relevant measures and suggestions to solve the problems. 展开更多
关键词 Industry association Administrative Organ Role relationship
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An Analysis of the Loan Exit Gaming on Relationship Lending in China 被引量:2
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作者 Zhiyong Shi Bo Zhang 《Chinese Business Review》 2005年第10期64-70,共7页
This paper analyzes the loan exit on relationship lending in China. We define the relationship lending and analyze the value that both banks and borrowers will obtain in relationship lending, as well as some risks the... This paper analyzes the loan exit on relationship lending in China. We define the relationship lending and analyze the value that both banks and borrowers will obtain in relationship lending, as well as some risks they will face, and then analyze the behaviors of loans exit with game theory. Our results suggest that, in general, relationship lending is helpful for the commercial banks and the enterprises to communicate information and enhance financing efficiency, while in the loan exit gaming, only when the decision of loan exit is made authentic promised by the banks, can the relationship lending effectively exert their positive function, and maintain the health cooperation between borrowers and lenders. 展开更多
关键词 relationship lending banking loan management gaming
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端粒长度与10种常见肌肉骨骼疾病的关系孟德尔随机化分析
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作者 罗伟东 蒲彬 +3 位作者 古鹏 黄枫 郑晓辉 陈福洪 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第3期654-660,共7页
背景:多项观察性研究表明,端粒长度与肌肉骨骼疾病之间存在潜在的关联,然而它们之间的潜在机制仍不清楚。目的:利用两样本孟德尔随机化分析来探索端粒长度与肌肉骨骼疾病之间的遗传因果关系。方法:从英国生物银行中获得端粒长度的全基... 背景:多项观察性研究表明,端粒长度与肌肉骨骼疾病之间存在潜在的关联,然而它们之间的潜在机制仍不清楚。目的:利用两样本孟德尔随机化分析来探索端粒长度与肌肉骨骼疾病之间的遗传因果关系。方法:从英国生物银行中获得端粒长度的全基因组关联研究汇总数据。从FinnGen财团中获得了关于10种常见肌肉骨骼疾病(骨坏死、骨髓炎、骨质疏松、类风湿关节炎、腰痛、椎管狭窄、痛风、肩周炎、强直性脊柱炎和下肢深静脉血栓)的全基因组关联研究汇总数据。使用逆方差加权、孟德尔随机化-Egger和加权中位数方法评估端粒长度与10种肌肉骨骼疾病的因果关系,逆方差加权作为主要的孟德尔随机化分析方法,并进行敏感性分析探讨结果稳健性。结果与结论:①逆方差加权法结果表明,遗传预测的端粒长度与类风湿关节炎(OR=0.78,95%CI:0.64-0.95,P=0.015)和骨坏死(OR=0.56,95%CI:0.36-0.90,P=0.016)风险之间存在负向因果关系,但未发现端粒长度与其他8种肌肉骨骼疾病之间存在因果关系(P均>0.05)。②敏感性分析结果表明因果关系稳健,孟德尔随机化-Egger截距分析未检测到潜在的水平多效性(P均>0.05)。③此项孟德尔随机化研究支持端粒长度对类风湿关节炎和骨坏死的保护作用的结论,然而,未来将需要更多的基础和临床研究来验证。 展开更多
关键词 端粒长度 肌肉骨骼疾病 孟德尔随机化 全基因组关联研究 单核苷酸多态性 因果关系 工具变量
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免疫细胞与膝骨关节炎之间因果作用:一项两样本双向孟德尔随机化分析 被引量:2
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作者 吴广涛 秦刚 +4 位作者 何凯毅 范以东 李威材 朱宝刚 曹英 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第5期1081-1090,共10页
背景:膝骨关节炎是一种常见的关节软骨及周围组织损伤的慢性炎症性疾病,而免疫细胞在膝骨关节炎免疫炎症反应中起到重要作用,但其中的具体机制仍有待深入研究。目的:采用孟德尔随机化方法来评估731种免疫细胞表型与膝骨关节炎风险之间... 背景:膝骨关节炎是一种常见的关节软骨及周围组织损伤的慢性炎症性疾病,而免疫细胞在膝骨关节炎免疫炎症反应中起到重要作用,但其中的具体机制仍有待深入研究。目的:采用孟德尔随机化方法来评估731种免疫细胞表型与膝骨关节炎风险之间的潜在因果关系。方法:使用全基因组关联分析(GWAS)目录中公开获取731种免疫细胞表型的全基因组关联分析统计数据(从GCST0001391到GCST0002121)和IEUGWAS数据库中膝骨关节炎的全基因组关联分析数据(ebi-a-GCST007090)。采用逆方差加权法、MR-Egger回归法、加权中位数法、加权模型法和简单模型法来研究免疫细胞与膝骨关节炎之间的因果关系。敏感性分析用于检验孟德尔随机化分析结果是否可靠,然后以同样方法进行反向孟德尔随机化分析。结果与结论:①正向分析结果表明,共有4种免疫细胞表型与膝骨关节炎有显著的因果关系(FDR<0.20),其中B细胞中的CD27 on CD24+CD27+(OR=1.026,P=0.00026,Pfdr=0.18)、髓系细胞中的CD33 on CD33dim HLA DR-(OR=1.014,P=0.00050,Pfdr=0.18)以及Treg细胞中的CD45RA+CD28-CD8br%CD8br(OR=1.001,P=0.00078,Pfdr=0.18)与膝骨关节炎风险呈直接的正向因果关联;单核细胞中PDL-1 on monocyte(OR=0.952,P=0.00098,Pfdr=0.18)与膝骨关节炎风险呈直接的负向因果关联。②反向分析结果表明,当膝骨关节炎作为暴露数据时,与731种免疫细胞表型均不具有显著因果关系(FDR<0.20)。③敏感性分析结果显示:双向孟德尔随机化的Cochran’s Q检验和MR-Egger回归法结果P值均大于0.05,表明免疫细胞表型与膝骨关节炎之间的因果效应分析不存在显著的异质性和多效性。④上述结果证实,CD27 on CD24+CD27+,CD33 on CD33dim HLA DR-,CD45RA+CD28-CD8br%CD8br以及PDL-1 on monocyte免疫细胞表型与膝骨关节炎之间可能具有较为显著的潜在因果关系,这为研究膝骨关节炎的生物学机制及探索膝骨关节炎的早期防治提供有价值的线索,也为干预性药物的开发提供了新的方向。 展开更多
关键词 骨关节炎 膝骨关节炎 免疫机制 免疫细胞 孟德尔随机化 因果关系 全基因组关联分析 逆方差加权法 敏感性分析
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肠道菌群与骨质疏松症的遗传关系:来自英国数据库211个肠道微生物群分析
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作者 方志杰 马抢平 +2 位作者 董万涛 吴俊媛 陆韵霖 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第18期3941-3947,共7页
背景:骨质疏松症被定义为一种慢性代谢性骨病,大量的证据表明肠道菌群与骨质疏松症有关。然而,肠道菌群对骨质疏松症的因果关系尚不清楚。目的:采用双样本孟德尔随机化方法来评估肠道菌群与骨质疏松症之间的潜在因果关系。方法:使用MiBi... 背景:骨质疏松症被定义为一种慢性代谢性骨病,大量的证据表明肠道菌群与骨质疏松症有关。然而,肠道菌群对骨质疏松症的因果关系尚不清楚。目的:采用双样本孟德尔随机化方法来评估肠道菌群与骨质疏松症之间的潜在因果关系。方法:使用MiBioGen联盟肠道菌群的全基因组关联分析汇总统计数据和英国生物样本数据库中骨质疏松症的全基因组关联分析数据。采用逆方差加权法(Inverse variance weighting,IVW)、MR-Egger回归法、加权中位数法、加权模型法和简单模型法来研究肠道菌群与骨质疏松症之间的因果关系。敏感性分析用于检验孟德尔随机化分析结果是否可靠。结果与结论:逆方差加权法结果表明,肠道菌群与骨质疏松症之间存在因果关系。克里斯滕森菌科R7属(MR Egger:β=-0.007;IVW:β=-0.004,P=0.028)、粪球菌3属(MR Egger:β=-0.008;IVW:β=-0.003,P=0.046)和毛螺菌属(MR Egger:β=-0.009;IVW:β=-0.004,P=0.003),可能是骨质疏松的保护性因素,而霍氏菌属(MREgger:β=0.006;IVW:β=0.002,P=0.033)和氧化真杆菌属(MREgger:β=0.001;IVW:β=0.003,P=0.046),可能为骨质疏松症潜在危险性因素。数据分析结果显示,氧化真杆菌属和霍氏菌属可增加骨质疏松风险,克里斯滕森菌科R7属、粪球菌3属和毛螺菌属可降低骨质疏松风险。此结论是否也适用于非欧洲人群,未来需要不同群体的大样本临床试验来验证。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 骨质疏松症 肠道菌群 单核苷酸多态性 因果关系 全基因组关联分析 逆方差加权法 敏感性分析
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Effects of Selenium on Fusarium Growth and Associated Fermentation Products and the Relationship with Chondrocyte Viability 被引量:2
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作者 YIN Hong ZHANG Yan +3 位作者 ZHANG Feng HU Jin Tao ZHAO Yu Meng CHENG Bo Lun 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2017年第2期134-138,共5页
This study determined the effects of selenium on the growth of Fusorium strains and the effects of products extracted from the fungal cultures on relevant indicators of chondrocytes injury.
关键词 Effects of Selenium on Fusarium Growth and Associated Fermentation Products and the relationship with Chondrocyte Viability
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基于多元关系融合的科学—技术—产业关联模式识别方法研究
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作者 刘佳 钟永恒 +4 位作者 何晓东 李贞贞 赵展一 王辉 宋姗姗 《现代情报》 CSSCI 北大核心 2024年第6期67-81,共15页
[目的/意义]基于多元关系挖掘科学—技术—产业之间的关联模式,对揭示技术关联的科学基础和产业方向,促进产学研深度融合具有重要意义。[方法/过程]首先,利用LDA模型与人工判断方法识别出论文、专利、产品主题,基于论文与专利主题的引... [目的/意义]基于多元关系挖掘科学—技术—产业之间的关联模式,对揭示技术关联的科学基础和产业方向,促进产学研深度融合具有重要意义。[方法/过程]首先,利用LDA模型与人工判断方法识别出论文、专利、产品主题,基于论文与专利主题的引用关系、主体关系、内容关系构建科学关联度指标,基于专利与产品主题的交叉关系构建产业关联度指标;然后,基于科学关联度和产业关联度二元维度识别各技术主题的科学—技术—产业关联模式;最后,选择量子通信技术领域进行实证研究。[结果/结论]量子通信领域的技术主题关联模式包括S模式、S-T模式、T-I模式、S-T-I模式。随着时间推移,科学—技术—产业之间的互动逐步加深;量子通信技术遵循“材料研究—应用模块—应用核心技术—应用系统”的演化路径。 展开更多
关键词 科学关联度 产业关联度 多元关系 技术关联 关联模式 量子通信
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Blood cell counts and nonalcoholic fatty liver disease: Evidence from Mendelian randomization analysis
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作者 Bin Hu Ai-Hong Wan +7 位作者 Xi-Qiao Xiang Yuan-Hao Wei Yi Chen Zhen Tang Chang-De Xu Zi-Wei Zheng Shao-Ling Yang Kun Zhao 《World Journal of Hepatology》 2024年第8期1145-1155,共11页
BACKGROUND Previous research has highlighted correlations between blood cell counts and chronic liver disease.Nonetheless,the causal relationships remain unknown.AIM To evaluate the causal effect of blood cell traits ... BACKGROUND Previous research has highlighted correlations between blood cell counts and chronic liver disease.Nonetheless,the causal relationships remain unknown.AIM To evaluate the causal effect of blood cell traits on liver enzymes and nonalcoholic fatty liver disease(NAFLD)risk.METHODS Independent genetic variants strongly associated with blood cell traits were extracted from a genome-wide association study(GWAS)conducted by the Blood Cell Consortium.Summary-level data for liver enzymes were obtained from the United Kingdom Biobank.NAFLD data were obtained from a GWAS meta-analysis(8434 cases and 770180 controls,discovery dataset)and the Fingen GWAS(2275 cases and 372727 controls,replication dataset).This analysis was conducted using the inverse-variance weighted method,followed by various sensitivity analyses.RESULTS One SD increase in the genetically predicted haemoglobin concentration(HGB)was associated with aβof 0.0078(95%CI:0.0059-0.0096),0.0108(95%CI:0.0080-0.0136),0.0361(95%CI:0.0156-0.0567),and 0.0083(95%CI:00046-0.0121)for alkaline phosphatase(ALP),alanine aminotransferase(ALT),aspartate aminotransferase,and gammaglutamyl transferase,respectively.Genetically predicted haematocrit was associated with ALP(β=0.0078,95%CI:0.0052-0.0104)and ALT(β=0.0057,95%CI:0.0039-0.0075).Genetically determined HGB and the reticulocyte fraction of red blood cells increased the risk of NAFLD[odds ratio(OR)=1.199,95%CI:1.087-1.322]and(OR=1.157,95%CI:1.071-1.250).The results of the sensitivity analyses remained significant.CONCLUSION Novel causal blood cell traits related to liver enzymes and NAFLD development were revealed through Mendelian randomization analysis,which may facilitate the diagnosis and prevention of NAFLD. 展开更多
关键词 Blood cell counts Liver enzymes Nonalcoholic fatty liver disease Genome-wide association Mendelian randomization study Causal relationship
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无息借款与受贿罪的成立
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作者 陈家林 王成星 《中南大学学报(社会科学版)》 CSSCI 北大核心 2024年第4期79-91,共13页
关于国家工作人员向他人无息借款是否成立受贿罪,我国刑法及司法解释均无明确规定,实践中对此类案件的定性也存在较大分歧。化解分歧的关键是准确把握受贿罪“权钱交易”之本质。无息借款中被免去的利息能够被评价为刑法意义上的财物。... 关于国家工作人员向他人无息借款是否成立受贿罪,我国刑法及司法解释均无明确规定,实践中对此类案件的定性也存在较大分歧。化解分歧的关键是准确把握受贿罪“权钱交易”之本质。无息借款中被免去的利息能够被评价为刑法意义上的财物。对“为他人谋取利益”的认定,应以一般人观念为判断基准,结合借贷双方的关系、利息数额的大小及借贷双方与他人的借款情况等因素,综合判断“无息借款中免去的利息”与“为他人谋取利益”是否存在对价关系。若对价关系成立,实行的着手应具体情况具体判断:退还或免除利息、约定或推定无息、特定关系人借款的着手时点分别为接收财物或作出意思表示时、借款合同生效时、可能退还或上交财物的最初时点。若对价关系不成立,则无息借款属正常的民间借贷行为。 展开更多
关键词 无息借款 受贿罪 为他人谋取利益 权钱交易 对价关系
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国立西南联合大学文科研究生培养模式的内容、特点及启示
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作者 郑刚 王瑾明 《宁波大学学报(教育科学版)》 2024年第1期99-107,共9页
全面抗战时期,西南联大弦歌不辍,对文科研究生培养进行了卓有成效的探索。云南昆明相对稳定的社会环境、文科教育深厚的历史传统以及凝聚民心的实现需要,为西南联大文科研究生培养奠定了基础。西南联大恢复文科研究生教育,逐步确立了严... 全面抗战时期,西南联大弦歌不辍,对文科研究生培养进行了卓有成效的探索。云南昆明相对稳定的社会环境、文科教育深厚的历史传统以及凝聚民心的实现需要,为西南联大文科研究生培养奠定了基础。西南联大恢复文科研究生教育,逐步确立了严格的招考制度,通过实施导师制、建立课程体系、开展多样化的科研训练等途径,形成了较为完善的文科研究生培养模式,并通过实施毕业考核、奖助学金等制度保障了研究生培养质量。西南联大培养了许多优秀的文科人才,研究生培养呈现出严进严出、课程教学与科学研究相结合、导学关系和谐融洽等特点,对当下研究生教育的改革与发展有启示意义。 展开更多
关键词 西南联大 文科研究生 科教融合 导学关系
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完全图高阶关系驱动的链接预测 被引量:1
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作者 张惠鹃 黄钦阳 +2 位作者 胡诗彦 杨青 张敬伟 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2024年第7期1825-1835,共11页
图卷积网络(graph convolutional network,GCN)因其在处理图数据方面的独特优势而被广泛应用于推荐系统中,它通过利用图中节点之间的依赖关系传播节点属性信息,极大地提高了节点表示的准确度从而提升推荐性能.然而现有基于GCN的推荐方... 图卷积网络(graph convolutional network,GCN)因其在处理图数据方面的独特优势而被广泛应用于推荐系统中,它通过利用图中节点之间的依赖关系传播节点属性信息,极大地提高了节点表示的准确度从而提升推荐性能.然而现有基于GCN的推荐方法仍因过平滑问题而难以进行更深层的建模,从而限制了用户与项目间高阶关系的表达.为此,提出了一种基于项目间关系的完全图高阶关系驱动的链接预测(link prediction driven by high-order relations in complete graph,LinkCG)方法.LinkCG通过用户-项目交互图与项目间隐式关联关系全局图组成的异构图预测用户到项目的链接,跳过了中间的用户节点直接利用完全图建模每个用户历史交互的项目间的局部隐式关联关系,获得项目间的高阶关系从而缓解数据稀疏性问题;此外,不同于基于节点嵌入的推荐方法,LinkCG通过赋予项目间的链接权重来表示项目间关系的紧密程度,并根据紧密程度进行链接预测,优化了模型的训练过程.在3个公开数据集上的实验结果表明,LinkCG作为只包含2个超参数的非深度学习模型,与一些先进的基于深度学习的基线方法相比提供了更好的性能.在社交关系数据上的应用进一步表明LinkCG能够从用户历史交互项目中获取足够丰富的用户偏好信息. 展开更多
关键词 推荐系统 链接预测 完全图 高阶关系 关联关系
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肠道菌群与卵巢癌风险的双样本孟德尔随机化研究 被引量:1
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作者 曹铁凤 黄佳明 沈慧敏 《实用妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期275-280,共6页
目的:分析肠道菌群紊乱与卵巢癌发病风险的因果关系。方法:MiBioGen联盟官网获取人类肠道菌群的全基因组关联研究(GWAS)数据作为暴露因素,从卵巢癌协会联盟(OCAC)获得卵巢癌数据作为结局,使用孟德尔随机化(MR)研究分析肠道菌群与卵巢癌... 目的:分析肠道菌群紊乱与卵巢癌发病风险的因果关系。方法:MiBioGen联盟官网获取人类肠道菌群的全基因组关联研究(GWAS)数据作为暴露因素,从卵巢癌协会联盟(OCAC)获得卵巢癌数据作为结局,使用孟德尔随机化(MR)研究分析肠道菌群与卵巢癌发病风险之间的因果关系。使用F<10作为条件删除弱工具变量,科克伦Q参数进行异质性检验;MR-Egger法进行水平多效性检验;MR-PRESSO法和留一法剔除异常的工具变量。结果:MR分析表明有2个门、1个纲、1个目、1个科和2个属的菌群与卵巢癌致病风险有因果关系。其中,蓝藻门(OR 1.167)、拟杆菌门(OR 1.238)、拟杆菌目(OR 1.329)、克里斯滕森菌科(OR 1.680)和食物谷菌属(OR 1.130)会增加卵巢癌风险(P<0.05),而埃希菌属(OR 0.786)和变形菌纲(OR 0.763)会降低卵巢癌风险(P<0.05)。此外,不同肠道菌群与不同类型卵巢癌存在因果关系,其中拟杆菌门(OR 1.354)、拟杆菌目(OR 1.400)、克里斯滕森菌科(OR 1.907)增加高级别浆液性癌发病风险(P<0.05),而变形菌纲(OR 0.773)降低高级别浆液性癌发病风险(P<0.05);蓝藻门(OR 1.638)增加透明细胞性癌风险(P<0.05),变形菌纲(OR 0.454)降低黏液性癌风险(P<0.05)。敏感性分析结果证明该研究结果可靠。结论:肠道微生物群与卵巢癌发病风险有因果关系,其中蓝藻门、拟杆菌门、拟杆菌目、克里斯滕森菌科和食物谷菌属为卵巢癌发病危险因素,而埃希菌属和变形菌纲为保护因素。 展开更多
关键词 肠道菌群 孟德尔随机化 全基因组关联研究 因果关系 卵巢癌
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两样本孟德尔随机化分析他汀类药物与骨关节炎风险的关系 被引量:5
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作者 武瑞骐 张璇 +2 位作者 周毅 孟林 李宏宇 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第26期4106-4112,共7页
背景:观察性研究表明,他汀类药物可能对骨关节炎(包括膝骨关节炎和髋骨关节炎)具有保护作用,然而他汀类药物与骨关节炎风险之间的关联尚未完全明确。目的:利用大规模人群全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据,通过孟德尔随机化分析探究他... 背景:观察性研究表明,他汀类药物可能对骨关节炎(包括膝骨关节炎和髋骨关节炎)具有保护作用,然而他汀类药物与骨关节炎风险之间的关联尚未完全明确。目的:利用大规模人群全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据,通过孟德尔随机化分析探究他汀类药物与骨关节炎风险之间的关联。方法:他汀类药物相关的单核苷酸多态性数据来自FinnGen最新第9版数据库,骨关节炎、膝骨关节炎和髋骨关节炎数据来自IEU Open GWAS、英国生物库和关节炎研究英国骨性关节炎遗传学(ArcOGEN)数据库。逆方差加权法为评估因果效应的主要分析方法。加权中位数法、简单中位数法、加权中值方法和MR-Egger回归用于补充说明。以比值比和95%CI评价他汀类药物与骨关节炎、膝骨关节炎和髋骨关节炎风险之间的因果关系。其次进行敏感性分析来验证结果的可靠性,使用Cochran’s Q检验异质性,MR-Egger-intercept检验是否存在水平多效性,留一法分析确定是否具有潜在影响的单核苷酸多态性等。结果与结论:①逆方差加权法结果表明,遗传预测的他汀类药物与骨关节炎(OR=0.998,95%CI:0.996-0.999,P=0.01)、膝骨关节炎(OR=0.964,95%CI:0.940-0.989,P=0.005)和髋骨关节炎(OR=0.928,95%CI:0.901-0.955,P=4.28×10^(-7))风险之间存在负向因果关系;②MR-Egger-intercept分析未检测到潜在的水平多效性(骨关节炎:P=0.658;膝骨关节炎:P=0.600;髋骨关节炎:P=0.141);③研究结果为观察性研究所述的他汀类药物降低骨关节炎、膝骨关节炎和髋骨关节炎风险提供了证据,他汀类药物治疗骨关节炎的具体机制需要进一步研究。 展开更多
关键词 他汀类药物 骨关节炎 孟德尔随机化 全基因组关联研究 单核苷酸多态性 因果关系
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他汀类药物与骨密度:一项药物靶向孟德尔随机化分析
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作者 马玮玮 熊勇 +3 位作者 陈虹谷 黄文茁 黄新 周晓红 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第27期4340-4345,共6页
背景:观察性研究表明他汀类药物可能对骨密度具有保护作用,这使其成为潜在的骨质疏松症治疗药物之一。目的:通过孟德尔随机化方法来评估药物靶点介导的脂质表型与骨密度之间的因果关系。方法:从IEU Open GWAS数据库获取了与他汀类药物... 背景:观察性研究表明他汀类药物可能对骨密度具有保护作用,这使其成为潜在的骨质疏松症治疗药物之一。目的:通过孟德尔随机化方法来评估药物靶点介导的脂质表型与骨密度之间的因果关系。方法:从IEU Open GWAS数据库获取了与他汀类药物相关的单核苷酸多态性以及骨密度相关数据。主要分析方法是逆方差加权法,同时也使用了加权中位数法、简单中位数法、加权中值方法和MR-Egger回归法。使用β值和95%CI来评估他汀类药物与骨密度之间的因果关系;另外,进行敏感性分析以验证结果的可靠性,使用Cochran’s Q检验来评估异质性,使用MR-Egger截距检验是否存在水平多效性。使用留一法分析确定是否有单个或多个单核苷酸多态性影响了结果。结果与结论:他汀类药物作用靶点——3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶介导的低密度脂蛋白胆固醇与足跟定量超声骨密度(β=-0.086,95%CI:-0.117至-0.055,P=5.42×10^(-8))和全身骨密度(β=-0.193,95%CI:-0.288至-0.098,P=7.35×10^(-5))呈显著相关。该研究结果支持了他汀类药物对骨密度的保护作用。这些发现不仅加深了对胆固醇相关基因和骨骼健康关系的理解,还揭示了改善骨密度的潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 他汀类药物 骨密度 孟德尔随机化 全基因组关联研究 因果关系
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SCtool:识别复杂性状和疾病间遗传关联的工具
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作者 郭煜 胡杨 王亚东 《生物信息学》 2024年第1期19-25,共7页
识别复杂性状和疾病间遗传关联可以提供有用的病因学见解,并有助于确定可能的因果关系的优先级。尽管已有很多工具可以实现复杂性状和疾病间遗传关联,但是某些工具代码可读性差、并且不同工具基于不同的计算机语言、工具间的串联性较差... 识别复杂性状和疾病间遗传关联可以提供有用的病因学见解,并有助于确定可能的因果关系的优先级。尽管已有很多工具可以实现复杂性状和疾病间遗传关联,但是某些工具代码可读性差、并且不同工具基于不同的计算机语言、工具间的串联性较差。因此,本研究基于全基因组关联研究(GWAS)数据,提出了SCtool,一个开源、跨平台和用户友好的软件工具。SCtool整合了ldsc,TwosampleMR和MR-BMA三种软件,其主要功能是基于GWAS汇总水平的数据,识别复杂性状和疾病、复杂性状和复杂性状以及疾病与疾病间的遗传相关性并探究其间潜在的因果关联。最后,使用SCtool揭示了全身性铁状态(铁蛋白,血清铁,转铁蛋白,转铁蛋白饱和度)与表观遗传时钟GrimAge之间的遗传关联。 展开更多
关键词 遗传相关性 因果关联 全基因组关联研究 工具
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凉水保护区红松与主要伴生树种的空间关系
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作者 游晨露 国庆喜 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期3072-3085,共14页
空间关系是影响森林生长与群落演替的重要因素,种间关系是其重要组成部分,研究空间关系有利于了解森林群落的生长更新、功能作用与演替进程。利用移动窗口法对凉水自然保护区10.4 hm^(2)样地不同径级的红松与主要伴生树种做空间相关性研... 空间关系是影响森林生长与群落演替的重要因素,种间关系是其重要组成部分,研究空间关系有利于了解森林群落的生长更新、功能作用与演替进程。利用移动窗口法对凉水自然保护区10.4 hm^(2)样地不同径级的红松与主要伴生树种做空间相关性研究,并进行多尺度比较,得到不同尺度下不同径级红松与主要伴生树种个体的空间关系特征。研究结果表明:(1)红松与伴生树种的相互关系复杂多样,多种相互关系并存,表现出阔叶红松林群落结构的复杂性与稳定性。大径级红松压制同径级伴生树种,二者呈极显著负相关,但其对小径级伴生树种有庇荫作用,二者呈极显著正相关。(2)红松与主要伴生树种的相互关系在不同尺度、径级上均有极显著差异。尺度越大,红松与主要伴生树种的相关系数变化速率越小;伴生树种的径级越大,红松与主要伴生树种的相关系数变化速率越大。(3)红松与伴生树种的相关性具有尺度特征,主要表现在大尺度(≥60 m)范围上,在小尺度(<60 m)上相关性较弱。红松与伴生树种在相同径级与不同径级的结合方式上表现出不同的空间关系。同径级的红松与伴生树的种间关系多表现为负相关,不同径级的红松与伴生树种种间关系多表现为正相关。(4)以种间关系确定样方最小面积,凉水保护区临界样地面积为60 m×60 m。该研究集中于不同尺度下不同径级的红松与伴生树种的种间关系,解释优势种红松与伴生树种在森林的空间关系以及群落结构特征,为东北地区阔叶红松林的森林管理提供参考意见。 展开更多
关键词 红松 伴生树种 种间关系 径级 尺度
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紫椴红松林群落主要乔木树种种间关系
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作者 郭昕 范春楠 +4 位作者 程岩 刘付鹏 宋广文 王馨曼 王唯瑾 《北华大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第5期573-580,共8页
以吉林松花江三湖国家级自然保护区紫椴红松林为研究对象,采用总体相关性检验(VR)、χ^(2)检验、联结系数(AC)、共同出现百分率(PC)和点相关系数(Ф)分析群落主要乔木树种在5个层级(Ⅰ级幼苗、Ⅱ级幼树、Ⅲ级小径树、Ⅳ级中径树、Ⅴ级大... 以吉林松花江三湖国家级自然保护区紫椴红松林为研究对象,采用总体相关性检验(VR)、χ^(2)检验、联结系数(AC)、共同出现百分率(PC)和点相关系数(Ф)分析群落主要乔木树种在5个层级(Ⅰ级幼苗、Ⅱ级幼树、Ⅲ级小径树、Ⅳ级中径树、Ⅴ级大树)的种间关系。结果表明:主要乔木树种总体相关性为显著正联结,各层级VR介于0.84~1.59;χ^(2)检验结果显示,紫椴-红松在各层级均为不显著联结,二者在Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ层级为正联结,在Ⅱ和Ⅴ层级为负联结。主要树种种间关系大多不显著,由Ⅰ级幼苗至V级大树不显著联结种对数占比增加;在Ⅱ和Ⅳ层级,负联结种对数占比最大;AC、PC和Ф值也均表明,紫椴-红松间虽然存在一定联结但联结程度较弱,其他主要树种种间关系多数处于松散的独立状态。总体而言,紫椴红松林群落主要乔木树种已建立了良好的种间关系,可相对稳定地共同利用林地资源。 展开更多
关键词 紫椴红松林 乔木树种 层级 种间关系 联结性
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吴茱萸汤治疗呕吐的方证关系研究 被引量:1
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作者 杨坤 甘丽华 郭超峰 《西部中医药》 2024年第5期97-100,共4页
目的:探索吴茱萸汤治疗呕吐的方证关系。方法:从中国知网数据库检索吴茱萸汤治疗呕吐的医案100个,将医案中的相关症状(体征)、治法、药物等信息进行规范化处理,建立数据库。应用关联规则数据挖掘方法分析医案中症状(体征)、药物、治法... 目的:探索吴茱萸汤治疗呕吐的方证关系。方法:从中国知网数据库检索吴茱萸汤治疗呕吐的医案100个,将医案中的相关症状(体征)、治法、药物等信息进行规范化处理,建立数据库。应用关联规则数据挖掘方法分析医案中症状(体征)、药物、治法的频数、支持度、置信度、提升度及其关联关系。结果:收集到的100个医案共涉及166个症状(体征),1432频次,其中以呕吐为首出现频次较高的症状(体征)19个;共涉及75味中药,671频次,其中以吴茱萸为首出现频次较高的中药13味;共涉及治法37种,385频次,其中以“降逆”为首出现频次较高的治法7种。共涉及提升度≥1.3的症状(体征)关联规则16个,提升度≥1.2的中药关联规则6个,均具有明显的核心化倾向。结论:运用关联规则的数据挖掘方法可以较好发现吴茱萸汤及其加减方治疗呕吐的症状(体征)、药物组方及治法的关联规律,可为临床遣方用药提供依据。 展开更多
关键词 呕吐 关联规则 吴茱萸汤 方证关系
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基于两样本孟德尔随机化探究甲状腺功能减退症与膝骨关节炎的因果关系
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作者 徐小东 王配婕 +3 位作者 谢文鹏 李琦 傅永升 王卫国 《风湿病与关节炎》 2024年第2期6-11,共6页
目的:通过两样本孟德尔随机化方法研究甲状腺功能减退症与膝骨关节炎发病风险的因果关系。方法:获取甲状腺功能减退症和膝骨关节炎的全基因组关联研究(GWAS)数据并进行汇总,两者的数据均来自欧洲人群;将单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量... 目的:通过两样本孟德尔随机化方法研究甲状腺功能减退症与膝骨关节炎发病风险的因果关系。方法:获取甲状腺功能减退症和膝骨关节炎的全基因组关联研究(GWAS)数据并进行汇总,两者的数据均来自欧洲人群;将单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量(IVs)并选择敏感的SNPs进行分析,通过逆方差加权法(IVW)、加权中位数法(WME)、MR-Egger回归法进行两样本孟德尔随机化分析,将OR值作为标准评估甲状腺功能减退症与膝骨关节炎发病风险的因果关系,通过异质性和多效性检验对得到的结果进行验证。结果:共纳入27个SNPs位点作为IVs,IVW法的OR=4.737,95%CI=[1.038,20.524],P=0.038,表明甲状腺功能减退症和膝骨关节炎之间有因果关系。MR-Egger回归方程截距项为0.001 5(P=0.775),表明该结果不受基因多效性的影响。结论:甲状腺功能减退症与膝骨关节炎存在因果关系,且膝骨关节炎的发病风险随着甲状腺功能减退症发病风险增加而增加。 展开更多
关键词 膝骨关节炎 甲状腺功能减退症 孟德尔随机化研究 全基因组关联分析 工具变量 单核苷酸多态性 因果关系
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