局灶性癫痫患儿HLA-B*1502等位基因与抗癫痫发作治疗的关系

目的:探讨局灶性癫痫患儿HLA-B*1502等位基因检测与抗癫痫发作治疗的关系。方法:选择2017年6月至2020年6月于郑州大学第三附属医院就诊的局灶性癫痫并行HLA-B*1502等位基因检测的患儿138例,分析抗癫痫发作药物(ASM)的选择及药品不良反应(ADR)发生情况。结果:138例患儿中HLA-B*1502等位基因CC基因型(阴性组)117例(84.78%),CG或GC基因型(阳性组)21例(15.22%)。阴性组全部采用奥卡西平(OXC)治疗,控制率54.70%,有效率20.51%,无效率24.79%;其中10例(8.55%)存在ADR,减药或停药处理后症状均好转。21例阳性组患儿回避卡马西平,4例(19.05%)采用OXC治疗,17例(80.95%)采用非OXC治疗,采用OXC治疗的4例均未发现ADR。结论:HLA-B*1502等位基因检测阴性患儿使用OXC过程中仍需警惕ADR;阳性患儿也存在使用OXC的时机,但需小剂量缓慢滴定并观察有无ADR。

易感基因HLA-B*35及其亚型在中国大陆的分布

目的:明确易感基因HLA-B*35及其亚型在中国大陆人群总体及区域分布情况,以期为相关疾病,尤其是亚急性甲状腺炎的诊断和鉴别诊断提供参考。方法:中国大陆941 902例健康成人经HLA基因高分辨分型并按31个省市、自治区、直辖市进行分层,以探讨中国大陆健康成人及其HLA-B*35基因和其亚型总体和地区分布特征。结果:中国大陆健康成人群体HLA-B*35基因阳性率呈现北方人群高于其他地区人群;按地区分类,西北地区的HLA-B*35基因阳性率最高,华南地区阳性率较低;按省市自治区分别计算,阳性率由高到低排列分别为内蒙古自治区(11.99%)、新疆维吾尔自治区(11.76%)、宁夏回族自治区(11.75%)、青海省(11.61%)、甘肃省(11.14%),阳性率最低为广西壮族自治区(3.79%);HLA-B*3501和B*3503按地区分类时为西北最高,华南最低;按省市自治区分别统计,显示B*3501内蒙古自治区最高而广西壮族自治区最低,B*3503则表现为青海省最高,浙江省最低。结论:HLA-B*35在中国大陆地区呈现北高南低,不同地区B*35及其亚型分布,结果有助于相关疾病诊断及鉴别诊断。

HLA-B*58:01與別嘌醇皮膚不良反應關聯性研究

目的了解鏡湖醫院病人檢測HLA-B*58:01等位基因情況,以及與别嘌醇誘導的皮膚不良反應的相關性。方法採用回顧性分析方法,調查2021年11月~2022年6月開立HLA-B*58:01基因檢驗項目患者的藥物過敏史及用藥史等情況,應用統計軟件進行數據處理和分析。結果期間接受檢驗病人131例,21例(16%)檢驗結果為陽性。曾服用别嘌醇的病人中HLA-B*58:01基因陽性組發生皮膚不良反應3例(50%),HLA-B*58:01陰性組只有2例(3.6%),差異具有統計學意義(P<0.05)。結論檢測HLA-B*58:01等位基因攜帶率16%,HLA-B*58:01等位基因與别嘌醇所致皮膚不良反應具有顯著相關性,建議在開始使用别嘌醇之前應先進行檢測。並且使用較低初始劑量,用藥期間對腎功能進行評估,以盡量減低嚴重皮膚不良反應發生的風險。

Mamu-B* 007:03及其剪切异构体Mamu-B* 007:03-sv1基因的表达与细胞内定位

目的 Mamu-B*007:03-sv1是中国恒河猴主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)I类分子的一种剪切异构体,其α3结构域缺失。本实验初步获得其在细胞内的表达和定位信息,并与全长的Mamu-B*007:03基因的表达情况进行比较。方法分别构建Mamu-B*007:03-sv1-myc-pEGFPN3和Mamu-B*007:03-myc-pEGFPN3的真核表达载体,并将这两种重组质粒分别转染293T细胞。利用Western-blot免疫印迹实验检测这两种基因在细胞内的表达情况,并利用激光共聚焦显微镜技术分别分析这两种基因在细胞内的表达定位。结果 Mamu-B*007:03-sv1和Mamu-B*007:03基因均能在293T细胞内正常表达。Mamu-B*007:03-sv1发生了糖基化的修饰,Mamu-B*007:03基因在细胞膜上表达,Mamu-B*007:03-sv1基因在细胞内表达。结论 Mamu-B*007:03-sv1基因的α3结构域缺失,其细胞内的表达和定位与全长Mamu-B*007:03基因有明显差异,其功能有待于进一步探索。

奥卡西平导致的皮肤不良反应与HLA⁃B*1502、HLA⁃B*1301基因的关系

目的探讨奥卡西平(oxcarbazepine,OXC)导致的皮肤不良反应(cutaneous adverse reactions,cADRs)与HLA⁃B*1502、HLA⁃B*1301基因的关系。方法采用病例对照研究,联合多中心于2017年1月至2020年12月募集服用OXC后出现cADRs的患者、OXC耐受患者和健康体检者。提取外周血DNA,采用聚合酶链反应(PCR)和Sanger测序法检测HLA⁃B基因型;采用χ2检验比较病例组和耐受对照组、病例组和健康对照组之间HLA⁃B*1502、HLA⁃B*1301阳性率的差异。结果募集到15例OXC⁃cADRs、64例OXC耐受者及100例健康体检者。1例OXC导致Stevens⁃Johnson综合症(SJS)/中毒性表皮坏死松解症(TEN)患者为HLA⁃B*1502基因阳性,14例OXC导致轻度斑丘疹(maculopapular exanthem,MPE)患者中HLA⁃B*1502基因阳性率为14.29%(2/14),HLA⁃B*1502的阳性率在OXC导致MPE组与OXC耐受对照组、正常对照组之间的差异无统计学意义(P>0.05)。OXC⁃MPE组的HLA⁃B*1301基因阳性率为42.86%,显著高于OXC耐受组及正常对照组(均P<0.05)。结论OXC导致SJS/TEN可能与HLA⁃B*1502有关系;OXC导致MPE可能与HLA⁃B*1301有关系。

严重药物不良反应分子标志物HLA-B*58:01、HLA-B*15:02和HLA-A*31:01在山东汉族人群中的分布

目的调查山东汉族人群HLA-B*58:01、HLA-B*15:02和HLA-A*31:01等位基因携带率和等位基因频率,指导患者临床用药,并评估进行临床基因筛查的必要性。方法调查山东省骨髓库具有HLA-A、HLA-B位点高分辨数据的汉族人群样本,统计HLA-B*58:01、HLA-B*15:02和HLA-A*31:01等位基因携带率和等位基因频率,并按照志愿者籍贯进行分组,归为14个地市。结果山东汉族人群中,HLA-B*58:01、HLA-B*15:02、HLA-A*31:01等位基因携带率分别为8.65%、3.03%和7.3%。日照、东营、临沂地区HLA-B*58:01等位基因携带率达10%以上;枣庄、滨州和济南地区HLA-A*31:01等位基因携带率达8%以上;聊城、济南、淄博地区HLA-B*15:02等位基因携带率分别为3.96%、3.84%和3.77%。结论山东地区汉族人群患者在使用别嘌醇和卡马西平药物之前进行HLA-B*58:01和HLA-A*31:01基因筛查是有必要的,HLA-B*15:02等位基因携带率虽较低,但有条件的地区可以在开展用药前进行基因筛查,以减少严重药物不良反应的发生。

高尿酸血症患者降尿酸药物的应用及HLA-B*5801基因检测的合理性分析

目的分析高尿酸血症(HUA)患者降尿酸药物的用药合理性和HLA-B*5801基因检测的应用合理性。方法选取2015年8月至2019年4月在首都医科大学附属北京安贞医院进行HLA-B*5801基因检测的HUA患者517例,分析其HLA-B*5801基因检测结果及降尿酸药物别嘌醇和苯溴马隆的应用情况,分析其应用不合理率。结果517例HUA患者中应用别嘌醇治疗106例,无HLA-B*5801基因检测阳性者,1例(0.9%)患者的估算肾小球滤过率(eGFR)<15 ml/(min·1.73 m^2)为不合理用药;应用苯溴马隆治疗143例,无泌尿系结石及eGFR<20 ml/(min·1.73 m^2)患者,25例患者的24 h尿尿酸排出量>3.54 mmol为不合理用药;91例未测定尿尿酸排泄情况,为不合理用药,苯溴马隆的用药不合理率为81.1%(116/143);余268例患者通过低嘌呤饮食、碳酸氢钠碱化尿液、使用非布司他等措施治疗。517例HUA患者HLA-B*5801基因检测不合理应用率为68.1%(352/517),其中1例患者基因检测不合理原因为不适合应用别嘌醇进行降尿酸治疗[eGFR<15 ml/(min·1.73 m^2)],另外351例患者基因检测不合理原因为适合应用别嘌醇且基因检测结果为阴性,但未使用别嘌醇。结论本院降尿酸药物的使用和HLA-B*5801基因检测技术的应用均存在一定的不合理情况,建议临床医生对HUA患者进行降尿酸药物治疗前应完善eGFR、24 h尿尿酸排泄量检查,对于确定要使用别嘌醇治疗的患者再进行HLA-B*5801基因检测。

汉族人拉莫三嗪相关过敏反应与HLA-B*1502的相关性

目的研究在汉族人中拉莫三嗪相关过敏反应是否与HLA-B*1502有相关性。方法对在郑州人民医院诊断为癫痫的患者在服用拉莫三嗪前进行HLA-B*1502测定,将服用拉莫三嗪12周后出现过敏反应者作为实验组,未出现过敏反应者作为对照组1,服用其他非芳香族抗癫痫药物出现过敏反应者为对照组2,检测对照组2的HLA-B*1502阳性率,对3组间HLA-B*1502的阳性率进行比较。结果实验组HLA-B*1502的阳性率为41.86%,对照组1为14.02%,对照组2为13.33%.实验组阳性率高于对照组1(χ2=13.86,P<0.05)及对照组2(χ2=6.83,P=0.009),对照组1与对照组2比较差异无统计学意义(χ2=0.009,P=0.924)。结论HLA-B*1502可能与汉族人拉莫三嗪相关过敏反应相关。

卡马西平药品不良反应与HLA-B*1502基因多态性及血药浓度相关性研究

目的:研究卡马西平(cabamazepine,CBZ)药品不良反应(adverse drug reactions,ADRs)与遗传因素及血药浓度的关系,以促进CBZ临床安全和合理应用。方法:回顾性收集上海交通大学医学院附属瑞金医院2017-2019年住院患者资料,采集HLA-B*1502基因检测或CBZ血药浓度检测信息,分析这些患者HLA-B*1502基因型及CBZ血药浓度与ADRs的关系。结果:共纳入148例患者,其中101例进行了HLA-B*1502基因检测,34例患者基因型呈阳性,阳性率33.66%。148例患者中,78例(53.79%)使用CBZ进行治疗,其中有60例(86例次)进行了CBZ血药浓度检测,53例次CBZ血药浓度在推荐的浓度范围之内,占检测例次的61.63%,32例次(37.21%)低于推荐浓度范围。12例患者(15.38%)出现了CBZ相关的ADRs,其中1例HLA-B*1502纯合子突变型患者在服用CBZ后出现了较严重的皮肤ADRs。结论:HLA-B*1502基因型与CBZ皮肤ADRs有密切相关性。CBZ的治疗窗较窄,其ADRs发生率可能与其血药浓度有关。基因检测与血药浓度检测对于提高CBZ使用的安全性具有较重要意义。

海南地区癫痫儿童HLA-B*1502基因与芳香族抗癫痫药物治疗后皮肤型药物不良反应的相关性研究

目的探讨海南地区癫痫儿童HLA-B*1502基因与芳香族抗癫痫药物(AEDs)治疗后发生皮肤型药物不良反应(cADRs)的相关性。方法纳入本院2020年1月—2022年7月收治的癫痫儿童100例,均使用芳香族AEDs治疗,并根据是否发生cADRs分为cADRs组(n=32)与非cADRs组(n=68)。针对患儿进行HLA-B*1502基因检测,记录HLA-B*1502基因分型与等位基因频率。根据cADRs的严重程度,将轻微反应者纳入轻微组,将Stevens-Johnson综合征(SJS)、中毒性表皮坏死松解症(TEN)以及药物超敏综合征(DHS)者纳入重型组。比较不同严重程度患儿的HLA-B*1502基因分型;分析HLA-B*1502基因与cADRs的相关性。结果cADRs组HLA-B*1502TB位点的CT型比率高于非cADRs组(68.75%、36.76%),CC型比率低于非cADRs组(28.13%、63.24%),差异有统计学意义(P<0.05)。cADRs组HLA-B*1502TB位点的T等位基因频率为37.50%,高于非cADRs组的18.38%,差异有统计学意义(P<0.05)。轻微组与重型组HLA-B*1502基因的基因分型及等位基因频率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。Logistic回归分析显示,HLA-B*1502TB位点的CT基因分型及T等位基因会增加海南地区癫痫儿童AEDs治疗后cADRs的发生风险(P<0.05)。结论海南地区癫痫儿童经芳香族AEDs治疗后,cADRs的发生与HLA-B*1502基因密切相关。HLA-B*1502TB位点携带CT基因分型与T等位基因的患儿的cADRs发生风险更高。

负载SIV抗原肽的中国恒河猴Mamu-B*1703可溶性单体及其四聚体的制备和鉴定

目的:制备负载SIV抗原肽的中国恒河猴Mamu-B*1703可溶性单体及其四聚体。方法:以含Mamu-B*1703重链cDNA序列的pMD19-T克隆为模板,通过PCR的方法克隆Mamu-B*1703重链基因,进而构建羧基端融合生物素化酶BirA底物肽(BSP)的Mamu-B*1703重链胞外域融合蛋白的表达载体,并在大肠杆菌中获得表达。β微球蛋白、SIV抗原肽共存时,通过稀释法复性可溶性Mamu-B*1703单体,经生物素化并纯化后与荧光素标记的链亲和素按4∶1的比例混合形成四聚体。结果:ELISA检测显示获得具有正确构象的负载SIV抗原肽的Mamu-B*1703四聚体。结论:印度恒河猴Mamu-B*1701特异性抗原肽IW9,与中国恒河猴的Mamu-B*1703相结合形成可溶性Mamu-B*1703/IW9单体和四聚体。

中国北方汉族骨髓供者HLA-B*15组基因多态性的PCR-SBT分型研究

为了研究中国北方汉族骨髓供者HLA-B*15等位基因的分布特征,探讨其可能对临床供体选择的影响,从中华骨髓库陕西分库内随机抽取815名已知低分辨分型结果中国北方汉族骨髓供者,采用聚合酶链反应-碱基序列直接测序(PCR-SBT)方法对其中206例HLA-B*15阳性样本和另外附加17例样本进行HLA-B位点DNA测序分析,并应用同源模建分子模拟技术对所有结果模拟出三维结构,用计算机软件Swiss-PdbViewer比较模拟结构间的差异大小。结果表明:随机抽取的815例样本HLA-A、B、DRB1基因分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,HLA-B*15基因频率为0.1379,总共检出16种HLA-B*15等位基因,分属7种血清学特异性,以B*1501、B*1511、B*1502和B*1518为主,频率分别为0.0485、0.0215、0.0178和0.0160,累计频率构成比占全部B*15的75.11%,其余12种B*15等位基因频率均<0.0100。19例HLA-B*15,-测序分析表明,其中10例中低分辨水平上的纯合子中仅4例为真正意义上的B*15xx,-纯合子,且均由各自优势基因构成。三维结构模拟分析发现同一血清型中既存在结构差异微小的等位基因,如B*1501、1505、1507、1525、1527、1532(RMSD≤0.02nm),也存在差异较大的等位基因,如B*1502、1511、1521之间以及B*1503、1546之间(RMSD均为0.29nm),而一些分属不同血清型的等位基因之间结构却近似(RMSD值≤0.02nm)。结论:本研究应用PCR-SBT,首次取得了中国北方汉族样本量最大的高分辨水平HLA-B*15基因多态性分布特征,这将有助于临床患者寻找合适供者,并为移植免疫及本地区群体遗传学等方面的研究提供了重要依据,且对于临床选择最适供者,像HLA-B*15这样血清学特异性及基因亚型高度多态性的家族进行准确的高分辨分型是必要的。

基于L*a*b*彩色空间和局域动态阈值的药用植物叶片图像分割

叶片图像分割是自动化分类的先决步骤。提出一种基于L*a*b*彩色空间和局域动态阈值的叶片图像分割方法。该方法首先把叶片的RGB图像转换为L*a*b*图像;然后针对b*通道图像,估算出目标叶片所在的局部矩形范围;在此范围内,统计获得像素值分布直方图;最后利用最大类间方差阈值分割法,先算出局部矩形范围内的阈值继而进行全图的分割。实验结果表明:该方法对已采集的叶片图像,包括颜色偏暗的叶片的图像,均具有良好的分割效果。由于锁定目标叶片所处的局部矩形范围,找到了适应于目标叶片分割的阈值,从而更好地实现了南天竺等叶片图像的分割。此外,分割过程不包含数学形态学的开闭运算,使得叶片边缘的细节得以完整保留。

江西汉族人HLA-B*1502与卡马西平所致SJS/TEN相关性分析

目的：探讨具有江西汉族遗传背景人群中人类白细胞抗原（HLA）-B＊1502与卡马西平（CBZ）所致Stevens-Johnson综合征／中毒性表皮坏死症（SJS／TEN）相关性。方法：在具有江西汉族遗传背景人群中，收集CBZ所致SJS／TEN患者19例，以及90例服用CBZ无过敏患者和80例健康对照者，采用序列特异性引物聚合酶链反应法进行HLA—B＊1502的基因型测定．观察CBZ所致的SJS／TEN与HLA—B＊1502基因型是否存在关联。结果：CBZ所致SJSfrEN组HLA—B＊1502基因型携带率为100％，显著高于CBZ耐受组（15．5％）及健康对照组（18．75％），差异均具有统计学意义（P〈0．001）。CBZ耐受组HLA—B＊1502基因型携带率与健康对照组比较，差异无统计学意义（生0．684）。结论：具有江西汉族遗传背景人群中．HIJA—B＊1502与CBZ所致SJSfrEN有极强的相关性。

上海地区汉族白塞病与HLA-B*51关联研究

为探讨白塞病的发病机制与HLAI类基因之间的关系,我们采用聚合酶链反应/顺序特异的寡核苷酸探针(PCR-SSO)反向杂交方法,对上海地区汉族69例白塞病患者及296例正常对照进行HLA-A、B基因的检测。结果显示白塞病患者组中HLA-B*51基因检出频率(34.8%)显著高于正常对照组(12.8%),X2和RR值分别为19.11和3.62(P<0.0001,Pc<0.005)。完全型白塞病患者组HLA-B51基因频率(52.4%)更是远远高于对照组,X2和RR值分别为39.4和7.5,(P<0.00001,Pc<0.001)。此外,HLA-B*46基因检出频率(26.1%)较对照组(11.1%)高,Pc<0.05。推测上海地区汉族白塞病的发病与HLA-B*51基因相关;患者组中HLA-B*46频率升高,可能与HLA-B*51一起参与白塞病的发病或因与患者组中某些HLA单倍型组合之间存在连锁不平衡有关。

中国大陆汉族人卡马西平过敏性药疹与HLA-B*1502的关联性分析

【目的】探讨我国大陆地区汉族人群中HLA-B*1502与卡马西平引起的过敏性药疹的关联性。【方法】收集48例卡马西平过敏性药疹患者,其中9例为重型过敏性药疹患者(包括Stevens-Johnson综合征、中毒性表皮坏死松解症),39例为轻型过敏性药疹患者;以及80例服用卡马西平无过敏患者和62例正常对照者,采用PCR-SSP法进行HLA-B*1502的基因型测定,观察卡马西平引起过敏性药疹与HLA-B*1502基因型是否存在关联。【结果】卡马西平重型过敏性药疹组HLA-B*1502基因型携带率为100%,显著高于卡马西平无过敏组(13.75%)及正常对照组(17.74%),差异均具有统计学意义(P<0.001)。卡马西平轻型过敏性药疹组HLA-B*1502基因型携带率与卡马西平无过敏组(25.64%vs.13.75%,P=0.110)及正常对照组(25.64%vs.17.74%,P=0.341)比较,差异均无统计学意义。【结论】我国大陆地区汉族人群中,卡马西平引起的重型过敏性药疹与HLA-B*1502基因型具有高度关联性。尚未发现卡马西平引起的轻型过敏性药疹与HLA-B*1502基因型有关联。

HLA新等位基因HLA-B* 13∶42的确认及序列分析

目的认定1个人类白细胞抗原(HLA)新等位基因并分析其核苷酸序列。方法应用PCR-SBT进行HLA常规分型发现1个与HLA-B*13相关的异常等位基因,用针对于B*13的位点特异性SSSP引物测序,确认与同源性最高的HLA等位基因序列的差异。结果发现1个标本的HLA-B位点核苷酸序列与所有已知HLA-B位点等位基因核苷酸序列不一致,与同源性最高的等位基因B*13:02:01的差异是在第3外显子445位的G>T,其突变导致密码子GCC>TCC,结果造成B*13:02:01氨基酸序列中125位的Ala丙氨酸(A)变为丝氨酸(S)。结论该等位基因为HLA-B位点的1个新等位基因,该基因被世界卫生组织(WHO)HLA命名委员会命名为HLA-B*13:42。

多维索引hB树的改进方法——hB*树

本文在ｈＢ树基础上提出多属性索引方法——ｈＢ＊树．ｈＢ＊树索引结点溢出时先寻求避免分裂，以期得到较好的空间利用率；通过避免和消除多父结点，使ｈＢ＊树成为严格的树形结构．本文表明ｈＢ＊树提高了空间利用率，树形化的代价也不高．

HLA-B无效等位基因B*5408N的核苷酸序列分析

本研究探讨HLA新的等位基因HLA-B*5408N的分子基础。采用商用抽提试剂盒抽提样本DNA,利用单链特异性引物PCR方法扩增先证者HLA-B基因的第2-4外显子,对PCR扩增产物直接进行第2、3、4外显子双向测序分析。结果表明:先证者样本测序得到两个等位基因,其中一个等位基因为HLA-B*1527,另一个经blast验证其为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(DQ295998,DQ295999,DQ296000)。与最接近的HLA-B*5401等位基因序列相比,新的等位基因仅在第3外显子上有1个核苷酸不同,即第553位G→T,这导致第161位氨基酸Glu(GAG)→终止密码(TAG),蛋白质的翻译提前终止。血清学方法未能检出HLA-B54抗原。结论:该等位基因为HLA-B无效表达等位基因,已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*5408N。

HLA-B新等位基因B*3936的确认和测序分析

本研究确认HLA新等位基因HLA-B*3936并分析其序列。先证者为脐血造血干细胞捐献者,样本DNA抽提采用PEL-FREEZ抽提试剂盒,利用单链特异性引物PCR方法扩增先证者HLA-B基因的第2-4外显子,对PCR产物直接进行第2、3、4外显子双向测序分析。结果显示:先证者样本中存在2个HLA-B等位基因,其中1个等位基因为HLA-B*4002,另1个经Blast验证确定为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(DQ242650,DQ242651,DQ242652)。与最接近的B*3901等位基因比较,新的等位基因在第3外显子上有4个核苷酸的差异,其中第527位T→A、第538位C→T、第539位T→G、第544位A→G,这引起氨基酸第152位缬氨酸(Val)→谷氨酸(Glu)、第156位异亮氨酸(Ile)→色氨酸(Trp)、第158位苏氨酸(Thr)→丙氨酸(Ala)。实验结果提示该等位基因为新的HLA-B等位基因,已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*3936。