期刊文献+
共找到247篇文章
< 1 2 13 >
每页显示 20 50 100
基于CRISPR/Cas9的棉花GhbHLH71基因编辑突变体的分析
1
作者 上官小霞 杨琴莉 李换丽 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期138-148,共11页
碱性/螺旋-环-螺旋(basic/helix-loop-helix,bHLH)转录因子在植物的生长发育、次生代谢、信号转导、逆境胁迫等方面起重要的调控作用。棉花GhbHLH71基因c DNA全长996 bp,编码331个氨基酸残基,蛋白序列中含有保守的bHLH结构域,属于bHLH... 碱性/螺旋-环-螺旋(basic/helix-loop-helix,bHLH)转录因子在植物的生长发育、次生代谢、信号转导、逆境胁迫等方面起重要的调控作用。棉花GhbHLH71基因c DNA全长996 bp,编码331个氨基酸残基,蛋白序列中含有保守的bHLH结构域,属于bHLH转录因子家族成员。实时荧光定量分析结果表明,GhbHLH71基因在棉花纤维快速伸长期3~12 DPA (days post anthesis,DPA)相对高表达,暗示其主要在棉花纤维发育过程中发挥作用。构建该基因的CRISPR/Cas9基因编辑载体进行了棉花遗传转化,T_0代再生株经过Cas9基因的PCR检测以及靶位点突变情况检测分析,获得6个T_0代基因编辑突变体。T_1代不同突变株系在棉花生长发育期的表型性状与对照相比无明显差异,但成熟纤维的长度与对照相比皆明显变短。T_2代突变株系可以稳定遗传T_1代株系纤维变短的表型。其中4#和8#株系连续2代的纤维长度与对照相比缩短比率皆达20%以上,表明GhbHLH71基因的突变主要影响了棉花纤维细胞的伸长。本研究为深入了解棉花中bHLH转录因子的生物学功能以及棉花纤维发育的分子机制提供了一定的参考。 展开更多
关键词 棉花 bhlh转录因子 Ghbhlh71基因 纤维发育 CRISPR/Cas9基因编辑
下载PDF
bHLH96的克隆及其在薄荷萜烯生物合成调控中的功能
2
作者 王斌 袁晓 +3 位作者 蒋园园 王玉昆 肖艳辉 何金明 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期281-293,共13页
【目的】薄荷精油是日化、医药和食品工业中的重要原料,bHLH转录因子在调控植物挥发性次生代谢产物合成中具有重要作用。探究bHLH蛋白在薄荷挥发性物质合成调控中的作用,为通过代谢或基因工程改良薄荷种质提供重要基因资源,拓展有关植... 【目的】薄荷精油是日化、医药和食品工业中的重要原料,bHLH转录因子在调控植物挥发性次生代谢产物合成中具有重要作用。探究bHLH蛋白在薄荷挥发性物质合成调控中的作用,为通过代谢或基因工程改良薄荷种质提供重要基因资源,拓展有关植物挥发性次生代谢产物合成途径与调控机制的认识。【方法】利用转录组测序和RT-qPCR技术分析bHLH96在薄荷根、茎、叶中的表达,并通过RT-PCR法克隆其全长序列,再利用DNA重组技术构建植物表达载体pBI121-bHLH96,利用农杆菌介导法在薄荷叶片中过表达,检测过表达bHLH96对薄荷叶片萜烯化合物含量和合成相关基因表达的影响。【结果】薄荷bHLH96的编码区全长861 bp,编码286个氨基酸残基。薄荷bHLH96是一个细胞核定位蛋白,植物bHLH96蛋白间的序列相似性为45.45%-73.68%,薄荷bHLH96与薰衣草LaMYC4和丹参SmbHLH94等唇形科植物bHLH蛋白的亲缘关系较近。在薄荷叶片中瞬时过表达bHLH96,显著影响15种萜烯化合物的相对含量。过表达bHLH96显著上调萜烯合成相关基因OC2、SM1、KS1、ND和EAO1的表达,显著下调NLS1、LS1和iPR的表达。【结论】薄荷bHLH96可能通过调控萜烯合成相关基因的表达,影响相关萜合成酶的活性,从而调控薄荷萜烯物质的合成。 展开更多
关键词 薄荷 精油 挥发性化合物 合成调控 bhlh转录因子
下载PDF
兰州百合鳞茎花青素合成相关MYB与bHLH转录因子的筛选分析
3
作者 范文广 李保豫 +6 位作者 田辉 李欣 任海伟 曹莹莹 姜欣彤 柴佳靖 陈少青 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期57-66,共10页
百合鳞茎在采后贮藏过程中,由于花青素的积累导致鳞茎变紫红色,进而影响其价值。该文基于兰州百合鳞茎转录组数据,利用生物信息学技术分析花青素相关转录因子,共分析了50个MYB转录因子与73个bHLH转录因子,包括序列的比对、理化性质分析... 百合鳞茎在采后贮藏过程中,由于花青素的积累导致鳞茎变紫红色,进而影响其价值。该文基于兰州百合鳞茎转录组数据,利用生物信息学技术分析花青素相关转录因子,共分析了50个MYB转录因子与73个bHLH转录因子,包括序列的比对、理化性质分析、亚细胞定位、系统进化关系以及保守结构域预测。MYB分类结果显示,50个MYB转录因子中有2个属于1R-MYB类,44个属于R2R3-MYB类,3个属于3R-MYB类,1个属于4R-MYB类。50个MYB不稳定蛋白均为亲水性蛋白,亚细胞定位表明48个MYB定位于细胞核。73个bHLH均为不稳定蛋白,且72个都为亲水性,亚细胞定位显示58个bHLH定位于细胞核。通过与模式植物拟南芥MYB和bHLH转录因子构建进化树分析、保守结构域预测、基因表达量分析以及转录因子与结构基因的相关性分析,初步筛选出3个MYB基因和1个bHLH基因可促进兰州百合鳞茎花青素合成,为进一步深入研究兰州百合鳞茎花青素调控基因提供了理论支持。 展开更多
关键词 兰州百合(Lilium davidii var.unicolor) 鳞茎 MYB转录因子 bhlh转录因子 花青素合成
下载PDF
FabHLH37调控草莓抗灰霉病的功能分析
4
作者 刘晓宇 张欣 +3 位作者 彭悦 于淼 熊劲松 程宗明 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期213-221,共9页
[目的]本文旨在通过验证草莓bHLH(basic/helix-loop-helix)家族转录因子FabHLH37的功能,解析其调控草莓抗灰霉病的机制,为草莓的抗病育种提供新的基因资源。[方法]以栽培草莓品种‘红颜’为试验材料,提取灰霉菌侵染后的草莓果实总RNA并... [目的]本文旨在通过验证草莓bHLH(basic/helix-loop-helix)家族转录因子FabHLH37的功能,解析其调控草莓抗灰霉病的机制,为草莓的抗病育种提供新的基因资源。[方法]以栽培草莓品种‘红颜’为试验材料,提取灰霉菌侵染后的草莓果实总RNA并反转录为cDNA,克隆FabHLH37编码区序列,并使用在线软件对其进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR(qPCR)分别检测该基因在草莓不同组织及果实接种灰霉菌后的相对表达量;利用烟草瞬时表达系统研究该基因的亚细胞定位;通过草莓果实瞬时表达系统研究FabHLH37抗灰霉病功能。[结果]FabHLH37基因CDS全长789 bp,编码262个氨基酸,理论等电点(pI)为6.61,相对分子质量为2.9×10^(5)。进化分析显示FabHLH37与月季、苹果等蔷薇科植物bHLH37蛋白同源关系较近。亚细胞定位分析显示FabHLH37特异性定位于细胞核。qPCR分析表明FabHLH37在草莓根中表达量最高,叶次之,灰霉病菌侵染可以显著诱导FabHLH37基因的表达。草莓果实瞬时表达结果显示,与对照相比,过表达FabHLH37的草莓果实接种灰霉菌后感病程度轻,而沉默FabHLH37的草莓果实相反。进一步的qPCR检测发现,在草莓果实瞬时表达体系中,FaPR1/4/5-1、FaBG2-1、FaCHI3-1、FaSOD、FaPAL等多个防御基因的表达量与FabHLH37的表达量呈正相关,即过量表达FabHLH37可显著提高这些基因的表达量,而沉默FabHLH37则显著降低这些基因的表达量。[结论]FabHLH37可通过诱导防御基因的表达从而正向调控草莓灰霉病。 展开更多
关键词 草莓 灰霉病 bhlh转录因子bhlh37 防御基因
下载PDF
火龙果HubHLH基因家族的全基因组分析及其对冬季补光诱导开花的表达响应
5
作者 李佳雪 丁一 +8 位作者 王猛 李涛 郭攀阳 刘成立 韦双双 黄家权 李洪立 胡文斌 汤华 《热带生物学报》 2024年第2期198-209,共12页
为了获得较完整的候选基因,探讨HubHLH基因在火龙果(Hylocereus undatus)冬季补光诱导开花过程的表达响应,对火龙果HubHLH基因家族进行全基因组分析。鉴定出153个HubHLH基因;这些基因的编码蛋白含有176~687个氨基酸,分子量大小为19.28~7... 为了获得较完整的候选基因,探讨HubHLH基因在火龙果(Hylocereus undatus)冬季补光诱导开花过程的表达响应,对火龙果HubHLH基因家族进行全基因组分析。鉴定出153个HubHLH基因;这些基因的编码蛋白含有176~687个氨基酸,分子量大小为19.28~74.44 kDa,等电点(pI)为4.81~9.88,均为亲水蛋白,亚细胞定位预测大多定位到细胞核。为鉴定HubHLH基因家族的同源性,本研究将153个火龙果HubHLH和120个拟南芥AtbHLH蛋白进行系统发育比较分析。系统发育比较分析结果:火龙果HubHLH基因家族成员被分为12个组,25个亚族;对HubHLH基因家族的保守motif、基因结构及在染色体的位置分布的分析结果表明,同一亚族的基因具有相似的基序组成和基因结构。对HubHLH基因家族的内部复制事件的分析结果表明,有78条片段复制被鉴定为片段重复基因,说明片段复制是HubHLH基因家族的主要扩张力量。此外,基于已测定的关于火龙果冬季补光诱导开花的4个时期转录组数据,筛选到59个HubHLH基因在冬季补光诱导成花过程中有差异表达,随后对这59个HubHLH基因进行GO功能富集,发现它们在红光或远红光的反应、对光刺激的反应、有性生殖功能、对辐射的反应等功能上均有富集,说明HubHLH基因家族可能在冬季补光诱导火龙果成花过程中起到了调控作用。 展开更多
关键词 火龙果 bhlh基因家族 全基因组 补光诱导开花 基因差异表达
下载PDF
扭果花旗杆bHLH转录因子家族成员鉴定与表达分析
6
作者 胡尔西旦·吐尔逊 谷玉风 +1 位作者 刘欣欣 葛风伟 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期13-21,共9页
基于扭果花旗杆(Dontostemon elegans Maxim.)转录组数据,鉴定其bHLH转录因子家族成员,并通过生物信息学方法分析该转录因子家族成员的理化性质、保守基序及结构域、系统进化关系、组织表达模式及逆境胁迫表达模式。结果表明:从扭果花... 基于扭果花旗杆(Dontostemon elegans Maxim.)转录组数据,鉴定其bHLH转录因子家族成员,并通过生物信息学方法分析该转录因子家族成员的理化性质、保守基序及结构域、系统进化关系、组织表达模式及逆境胁迫表达模式。结果表明:从扭果花旗杆转录组数据库中共筛选出66个bHLH转录因子家族成员,其氨基酸残基数为63~668,理论等电点为pI 4.74至pI 10.17,理论相对分子质量为7396.56~73508.47,65个家族成员属于亲水蛋白,60个家族成员定位在细胞核中;所有家族成员含有motif1和(或)motif2,且都含有保守的bHLH_SF超家族结构域。扭果花旗杆bHLH转录因子家族成员可划分为13个亚家族,亚家族ⅩⅣ含有的扭果花旗杆bHLH家族成员最多(10个)。组织表达模式分析结果表明:扭果花旗杆bHLH基因在不同组织中的相对表达量有所差异,De11684.2214、De11684.23639和De11684.33169在叶中的相对表达量最高,De11684.2906和De11684.31669在茎中的相对表达量最高,De11684.7549在根中的相对表达量最高,De11684.7900在根和叶中的相对表达量接近且显著(P<0.05)高于茎。扭果花旗杆bHLH基因对不同逆境胁迫有不同程度的响应:在150 mmol·L^(-1)NaCl胁迫下,7个bHLH基因的相对表达量在不同时间均显著上调;在250 mmol·L^(-1)聚乙二醇(PEG)胁迫下,6个bHLH基因的相对表达量在2 h时显著下调;在4℃胁迫下,6个bHLH基因的相对表达量在8 h时显著上调。综合分析表明:扭果花旗杆bHLH转录因子家族成员具有bHLH转录因子家族的基本特征;bHLH基因具有组织表达特异性,bHLH家族成员可能参与盐胁迫和低温胁迫的调控过程。 展开更多
关键词 扭果花旗杆 bhlh 转录因子 表达分析 非生物胁迫
下载PDF
A bHLH transcription factor,CsSPT,regulates high-temperature resistance in cucumber 被引量:1
7
作者 Yonggui Liang Chenyu Yang +7 位作者 Fangyan Ming Bingwei Yu Zhihua Cheng Yixi Wang Zhengkun Qiu Xiaolan Zhang Bihao Cao Shuangshuang Yan 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2024年第2期503-514,共12页
High-temperature stress threatens the growth and yield of crops. Basic helix-loop-helix(bHLH) transcription factors(TFs) have been shown to play important roles in regulating high-temperature resistance in plants. How... High-temperature stress threatens the growth and yield of crops. Basic helix-loop-helix(bHLH) transcription factors(TFs) have been shown to play important roles in regulating high-temperature resistance in plants. However, the bHLH TFs responsible for high-temperature tolerance in cucumbers have not been identified. We used transcriptome profiling to screen the high temperature-responsive candidate bHLH TFs in cucumber. Here, we found that the expression of 75 CsbHLH genes was altered under high-temperature stress. The expression of the CsSPT gene was induced by high temperatures in TT(Thermotolerant) cucumber plants. However, the Csspt mutant plants obtained by the CRISPR-Cas9 system showed severe thermosensitive symptoms, including wilted leaves with brown margins and reduced root density and cell activity.The Csspt mutant plants also exhibited elevated H_(2)O_(2) levels and down-regulated photosystem-related genes under normal conditions.Furthermore, there were high relative electrolytic leakage(REC), malondialdehyde(MDA), glutathione(GSH), and superoxide radical(O_(2)^(·-)) levels in the Csspt mutant plants, with decreased Proline content after the high-temperature treatment. Transcriptome analysis showed that the photosystem and chloroplast activities in Csspt mutant plants were extremely disrupted by the high-temperature stress compared with wildtype(WT) plants. Moreover, the plant hormone signal transduction, as well as MAPK and calcium signaling pathways were activated in Csspt mutant plants under high-temperature stress. The HSF and HSP family genes shared the same upregulated expression patterns in Csspt and WT plants under high-temperature conditions. However, most bHLH, NAC, and bZIP family genes were significantly down-regulated by heat in Csspt mutant plants. Thus, these results demonstrated that CsSPT regulated the high-temperature response by recruiting photosynthesis components, signaling pathway molecules, and transcription factors. Our results provide important insights into the heat response mechanism of CsSPT in cucumber and its potential as a target for breeding heat-resistant crops. 展开更多
关键词 CUCUMBER bhlh CsSPT PHOTOSYNTHESIS High temperature
下载PDF
金钗石斛bHLH转录因子家族全基因组鉴定及表达分析
8
作者 王健 杨莎 +3 位作者 孙庆文 陈宏宇 杨涛 黄园 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期203-218,共16页
【目的】bHLH转录因子广泛存在于植物中,是调控植物生长发育和响应逆境胁迫的重要转录因子家族之一。从金钗石斛全基因组中鉴定DnbHLHs转录因子家族,分析其表达特点,为后续深入研究DnbHLHs转录因子的生物学功能奠定基础。【方法】利用... 【目的】bHLH转录因子广泛存在于植物中,是调控植物生长发育和响应逆境胁迫的重要转录因子家族之一。从金钗石斛全基因组中鉴定DnbHLHs转录因子家族,分析其表达特点,为后续深入研究DnbHLHs转录因子的生物学功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法从金钗石斛全基因组中鉴定出bHLH转录因子家族成员,并对其理化特征、系统进化关系、基因结构、染色体定位和启动子顺式作用元件等进行分析,利用转录组数据和RT-qPCR分析DnbHLHs转录因子的组织表达模式和不同非生物胁迫下的表达规律。【结果】在金钗石斛中共鉴定出137个bHLH转录因子,DnbHLHs蛋白的氨基酸数量为85-1260,分子量为9855.23-140024.19 Da,等电点为4.52-10.66,不稳定系数为31.94-87.42,脂溶指数为56.66-106.06,亲水指数为-0.815-0.185。DnbHLHs分布于金钗石斛的19条染色体上,都存在bHLH结构域,与拟南芥的bHLH同源,且组内、种间存在着共线性关系。基因表达模式分析显示,DnbHLHs家族成员存在组织表达特异性,且DnbHLH26和DnbHLH33对多种逆境胁迫有响应。【结论】从金钗石斛全基因组中鉴定出137个DnbHLHs转录因子家族成员,该家族成员的理化性质和保守基序存在特异性和多样性的特征,不同DnbHLHs转录因子之间具有组织表达差异性,且DnbHLH26主要受高盐和高温胁迫的诱导,DnbHLH33主要受高盐、高温和低温胁迫的诱导。 展开更多
关键词 金钗石斛 转录因子 bhlh 生物信息学 表达模式分析
下载PDF
铁皮石斛DobHLH96基因克隆及表达分析
9
作者 张红瑞 理雅 +3 位作者 于白音 刘博婷 陈洁 刘羽佳 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第1期63-70,共8页
为了探究DobHLH96基因的生物学特性及其在响应逆境胁迫中的功能,利用同源克隆技术从广东丹霞铁皮石斛中克隆得到DobHLH96基因的cDNA全长序列。结果显示,DobHLH96开放阅读框全长为960 bp,编码319个氨基酸残基,理论相对分子量为31.2 ku,... 为了探究DobHLH96基因的生物学特性及其在响应逆境胁迫中的功能,利用同源克隆技术从广东丹霞铁皮石斛中克隆得到DobHLH96基因的cDNA全长序列。结果显示,DobHLH96开放阅读框全长为960 bp,编码319个氨基酸残基,理论相对分子量为31.2 ku,等电点为6.51,具有HLH结构域,符合bHLH结构特征。系统进化树结果显示,DobHLH96蛋白序列与鼓槌石斛中的氨基酸序列同源性最高。DobHLH96在铁皮石斛花器官中的相对表达量最高,具体的花组织排序为花蕾>花柱>萼片。分析结果显示,DobHLH96启动子元件具有与非生物胁迫、干旱、脱水、低温胁迫及脱落酸(ABA)响应等相关的顺式作用元件,而低温、干旱和ABA处理均能显著诱导DobHLH96基因的表达,并且在3种处理下该基因的表达模式基本一致,推测铁皮石斛的DobHLH96基因可能在转录水平上参与ABA介导的低温、干旱胁迫响应,可作为候选基因进一步研究其在抵御逆境胁迫中的调控功能。研究结果为深入研究DobHLH96基因的生物学功能提供了理论依据。 展开更多
关键词 铁皮石斛 bhlh转录因子 Dobhlh96基因 同源克隆 非生物胁迫 表达分析
下载PDF
干旱胁迫下大苞萱草bHLH转录因子家族鉴定与分析 被引量:1
10
作者 陈丽飞 刘云怡慧 +3 位作者 李嘉峻 白云 孟缘 周蕴薇 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期1027-1038,共12页
【目的】为探究大苞萱草bHLH基因家族成员特性,基于对干旱胁迫下大苞萱草叶和根转录组测序结果,鉴定并分析大苞萱草bHLH基因家族成员。【方法】利用生物信息学方法对大苞萱草bHLH转录因子家族基因进行系统发育、理化性质、二级结构、保... 【目的】为探究大苞萱草bHLH基因家族成员特性,基于对干旱胁迫下大苞萱草叶和根转录组测序结果,鉴定并分析大苞萱草bHLH基因家族成员。【方法】利用生物信息学方法对大苞萱草bHLH转录因子家族基因进行系统发育、理化性质、二级结构、保守结构域及基因表达等分析。【结果】共鉴定出55个大苞萱草bHLH家族基因并分为11个亚族;bHLH蛋白理化性质差异较大,总平均亲水性为负值,均为亲水性蛋白;亚细胞定位预测大苞萱草bHLH蛋白主要分布在细胞核中;基因表达分析表明,叶中有26个上调基因,26个下调基因,根中有32个上调基因,22个下调基因,差异基因HmbHLH50的表达量变化显著,可能与大苞萱草的抗旱能力相关。【结论】本研究为挖掘bHLH转录因子家族基因的功能奠定基础,也为深入解析大苞萱草的抗旱机制提供理论依据。 展开更多
关键词 大苞萱草 干旱胁迫 bhlh基因家族
下载PDF
甘蔗ScbHLH13基因的RT-PCR克隆与功能分析 被引量:1
11
作者 莫广玲 余陈静 +6 位作者 梁艳兰 周定港 罗俊 王莫 阙友雄 黄宁 凌辉 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期2485-2497,共13页
bHLH转录因子是植物体内重要的调节因子,对植物的生长发育、次生代谢以及花青素生物合成等方面具有调节作用。本研究以高粱bHLH13(XM_002440799.2)为探针序列,从甘蔗中通过RT-PCR克隆获得一个ScbHLH13基因,并对其在不同胁迫响应转录组... bHLH转录因子是植物体内重要的调节因子,对植物的生长发育、次生代谢以及花青素生物合成等方面具有调节作用。本研究以高粱bHLH13(XM_002440799.2)为探针序列,从甘蔗中通过RT-PCR克隆获得一个ScbHLH13基因,并对其在不同胁迫响应转录组数据中进行表达模式分析,同时对该基因及其所编码蛋白进行了理化性质预测以及系统进化、原生质体亚细胞定位和实时荧光定量PCR表达量分析。结果显示,ScbHLH13所编码蛋白包含586个氨基酸残基,以无规则卷曲和α螺旋为主,亲水且不稳定,呈弱碱性;具有典型核定位信号,无跨膜结构;其序列内包括bHLH-MYC、HLH 2个典型保守结构域,属于bHLH超家族成员。在系统进化中ScbHLH13属于Ⅲ (d+e)类组,与高粱亲缘关系最近。在转录组数据中, ScbHLH13的表达在甘蔗品种ROC22上受低氮胁迫和黑穗病菌侵染抑制,轻微受高粱花叶病毒侵染诱导;而在Badila受低氮、在YC05-179受甘蔗黑穗病菌侵染诱导。亚细胞定位结果显示,在烟草表皮细胞中瞬时表达ScbHLH13定位于细胞核和细胞膜,在甘蔗原生质体瞬时表达ScbHLH13则定位于细胞核。qRT-PCR分析表明,ScbHLH13在甘蔗原生质体中过表达并不能诱导花青素合成代谢通路上主要基因的表达,说明ScbHLH13与甘蔗中花青素合成相关下游基因表达调控相关性较低。本研究借助甘蔗原生质体瞬时表达系统上对ScbHLH13进行了初步的表达调控探究,为进一步研究甘蔗功能基因研究以及bHLH基因家族的结构与功能研究奠定了一定的基础。 展开更多
关键词 甘蔗 原生质体 bhlh转录因子 Scbhlh13基因
下载PDF
苦荞转录因子基因FtbHLH3的克隆、亚细胞定位及表达分析
12
作者 吕秋谕 孙培媛 +3 位作者 冉彬 王佳蕊 陈庆富 李洪有 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期194-203,共10页
bHLH(basic helix-loop-helix)转录因子在植物黄酮化合物生物合成中具有重要的调控作用。为探究苦荞[Fagopyrum tataricum(L.)Gaertn]中bHLH转录因子在黄酮化合物生物合成中的功能和分子调控机制,利用RT-PCR(reverse transcriptionpolym... bHLH(basic helix-loop-helix)转录因子在植物黄酮化合物生物合成中具有重要的调控作用。为探究苦荞[Fagopyrum tataricum(L.)Gaertn]中bHLH转录因子在黄酮化合物生物合成中的功能和分子调控机制,利用RT-PCR(reverse transcriptionpolymerase chain reaction)技术从苦荞中克隆了一个bHLH转录因子基因FtbHLH3,并对其进行生物信息学、亚细胞定位、转录激活活性、基因表达、基因共表达和基因表达量与总黄酮含量相关性分析。结果表明,FtbHLH3全长CDS序列为783 bp,编码260个氨基酸。保守结构域和系统进化分析表明,FtbHLH3是一个非Ⅲf亚家族bHLH转录因子成员。亚细胞定位和转录激活活性分析显示,FtbHLH3定位于细胞核,不具有转录激活活性。基因共表达分析表明,FtbHLH3与苦荞中拟南芥TT8同源基因FtTT8和12个黄酮化合物生物合成结构基因共表达。不同组织部位中基因表达量与总黄酮含量间相关性分析表明,FtbHLH3的表达量与总黄酮含量间具有较高的正相关性。本研究结果表明,FtbHLH3是一个定位于细胞核,不具有转录激活活性的非Ⅲf亚家族bHLH转录因子,可能通过与其他转录因子互作来调控苦荞黄酮化合物的生物合成。 展开更多
关键词 苦荞 Ftbhlh3 bhlh转录因子 基因克隆 亚细胞定位 转录激活 黄酮
下载PDF
水稻OsbHLH109基因的表达分析
13
作者 蔡欣 黄钰杏 +4 位作者 崔明月 林明丽 王一婷 卢月 王丽敏 《广东农业科学》 CAS 2023年第12期120-130,共11页
【目的】bHLH转录因子家族是真核生物中重要的转录因子家族,在植物生长发育、次生代谢和逆境应答中发挥重要作用。分析水稻(Oryza sativa L.)bHLH转录因子基因OsbHLH109(LOC_Os01g67480)对逆境胁迫和激素的响应模式,为进一步研究OsbHLH... 【目的】bHLH转录因子家族是真核生物中重要的转录因子家族,在植物生长发育、次生代谢和逆境应答中发挥重要作用。分析水稻(Oryza sativa L.)bHLH转录因子基因OsbHLH109(LOC_Os01g67480)对逆境胁迫和激素的响应模式,为进一步研究OsbHLH109在逆境胁迫和激素响应过程中的功能提供理论依据。【方法】对OsbHLH109进行生物信息学分析,同时利用定量PCR(qRT-PCR)技术分析OsbHLH109在水稻品种中花11不同组织、不同激素和非生物胁迫处理下的表达模式。【结果】OsbHLH109编码区全长为1164 bp,包含6个外显子,编码388个氨基酸,是一个含有HLH保守结构域的bHLH转录因子。系统进化分析显示,OsbHLH109与玉米等单子叶植物中的同源蛋白亲缘关系较近,与双子叶植物中的同源蛋白亲缘关系相对较远。顺式作用元件分析表明,OsbHLH109的启动子区含有24个植物激素响应元件和25个环境胁迫响应元件。qRTPCR分析表明,OsbHLH109在水稻根、茎、叶和幼穗等组织中均有表达,但在叶片中的表达量最高;激素和非生物胁迫处理结果表明,叶片中OsbHLH109对细胞分裂素(6-Benzylaminopurine,6-BA)、生长素(Indole acetic acid,IAA)、赤霉素(Gibberellic acid,GA3)、脱落酸(Abscisic acid,ABA)等激素处理的响应表达均达到显著差异水平;且叶片中OsbHLH109在低温、干旱、高温、盐胁迫等逆境处理的响应表达均达到显著差异水平,表明OsbHLH109的表达受6-BA、IAA、GA3、ABA、高温、低温、PEG6000和NaCl的诱导,推测其在水稻非生物胁迫响应过程中具有重要作用。【结论】水稻OsbHLH109为bHLH转录因子家族成员,主要在叶片中高表达,OsbHLH109基因的表达受高温、低温、盐害等外界因素调控,同时响应6-BA、IAA、GA3、ABA等激素信号,推测其可能通过ABA等激素信号转导途径参与水稻的非生物胁迫响应。 展开更多
关键词 水稻 bhlh转录因子 Osbhlh109 表达分析 非生物胁迫
下载PDF
茶树CsbHLH 71基因克隆及转录活性分析 被引量:3
14
作者 吴应奇 宋小凤 +3 位作者 邓见田烨 白思蕾 李娟 王坤波 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期37-44,共8页
bHLH转录因子在植物类黄酮代谢过程中具有重要调控作用。该研究采用PCR方法,从‘碧香早’茶树中获得了与儿茶素含量高度负相关的CsbHLH71基因,并对其进行生物信息学分析、亚细胞定位及转录活性分析,为探究CsbHLH71基因在调控茶树儿茶素... bHLH转录因子在植物类黄酮代谢过程中具有重要调控作用。该研究采用PCR方法,从‘碧香早’茶树中获得了与儿茶素含量高度负相关的CsbHLH71基因,并对其进行生物信息学分析、亚细胞定位及转录活性分析,为探究CsbHLH71基因在调控茶树儿茶素生物合成的分子机制奠定基础。结果表明:(1)通过RNA-seq测序筛选成功获得一个茶树CsbHLH71基因,该基因CDS序列全长912 bp,编码303个氨基酸;氨基酸序列第101-160位含有一个碱性螺旋-环-螺旋保守结构域,属于bHLH家族转录因子;序列对比和系统进化树结果显示,其与杜鹃花、河滨葡萄等物种的bHLH氨基酸序列有较高的相似性。(2)qRT-PCR结果显示,不同浓度微生物肥处理下茶树CsbHLH71基因的表达水平显著上调,且在1000倍处理下效果最显著,说明高浓度的微生物肥能促进茶树CsbHLH71基因的表达。(3)亚细胞定位分析表明CsbHLH71蛋白定位在细胞核。(4)转录活性分析发现,茶树CsbHLH71蛋白在酵母和烟草中均具有转录抑制活性,为转录抑制子,证实了CsbHLH71蛋白具有转录抑制剂的功能。研究推测,CsbHLH71蛋白可能负调控茶树中儿茶素积累。 展开更多
关键词 茶树 bhlh 亚细胞定位 转录活性分析
下载PDF
植物bHLH转录因子调控铁稳态的研究进展 被引量:1
15
作者 李宇 李素贞 +1 位作者 陈茹梅 卢海强 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期26-36,共11页
铁是植物生长发育所必需的微量营养元素,生长在中性或碱性土壤中的植物普遍存在缺铁现象。而植物的正常生长发育需要保持体内铁的平衡,这种铁稳态在转录和转录后水平上都受到严格的调控。植物中铁稳态的调控网络由许多转录因子参与,其... 铁是植物生长发育所必需的微量营养元素,生长在中性或碱性土壤中的植物普遍存在缺铁现象。而植物的正常生长发育需要保持体内铁的平衡,这种铁稳态在转录和转录后水平上都受到严格的调控。植物中铁稳态的调控网络由许多转录因子参与,其中碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop helix,bHLH)家族的成员不可或缺。本文拟对植物中调控铁平衡的关键bHLH转录因子进行梳理汇总,对这些转录因子在植物生长发育中调节铁稳态的机制进行综述,以期为揭示植物铁稳态调节的研究提供理论基础。 展开更多
关键词 铁缺乏 碱性螺旋-环螺旋家族(bhlh) 拟南芥 水稻
下载PDF
基于转录组的洋葱bHLH转录因子家族鉴定与生物信息学分析 被引量:1
16
作者 陈微 潘美红 +6 位作者 惠林冲 李威亚 郇国磊 何林玉 缪美华 陈振泰 杨海峰 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第5期11-18,共8页
bHLH转录因子家族是真核生物中重要的转录因子家族,在植物生长发育、次生代谢和逆境应答中发挥重要作用。本研究利用转录组数据对洋葱基因家族成员进行筛选和鉴定,并对家族成员进行理化性质、保守基序、亚细胞定位、系统发育和蛋白互作... bHLH转录因子家族是真核生物中重要的转录因子家族,在植物生长发育、次生代谢和逆境应答中发挥重要作用。本研究利用转录组数据对洋葱基因家族成员进行筛选和鉴定,并对家族成员进行理化性质、保守基序、亚细胞定位、系统发育和蛋白互作生物信息学分析,同时对bHLH基因家族在洋葱幼苗中的表达情况进行分析。结果表明,从洋葱转录组共鉴定到36个bHLH基因,预测编码蛋白质含有的氨基酸数量为127~610个,且均为亲水性蛋白,系统发育分析表明,洋葱bHLH基因家族分为12个亚族,同一亚族的大多数基因具有相似的保守基序,大多数bHLH基因在洋葱幼苗中表达,不同基因的表达量水平差异较大。本研究结果为进一步研究洋葱bHLH转录因子家族的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 洋葱 bhlh 转录因子 生物信息学分析
下载PDF
日本百脉根LjbHLH34基因克隆及耐旱功能鉴定 被引量:1
17
作者 刘福 陈诚 +2 位作者 张凯旋 周美亮 张新全 《草业学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期178-191,共14页
干旱是影响植物生长发育的重要环境因素。本研究分析了日本百脉根抗旱相关基因LjbHLH34的耐旱功能,初步解析其响应干旱胁迫的分子机制,以期为百脉根抗旱分子育种提供理论基础。本研究克隆得到的LjbHLH34基因大小为711 bp、编码236个氨基... 干旱是影响植物生长发育的重要环境因素。本研究分析了日本百脉根抗旱相关基因LjbHLH34的耐旱功能,初步解析其响应干旱胁迫的分子机制,以期为百脉根抗旱分子育种提供理论基础。本研究克隆得到的LjbHLH34基因大小为711 bp、编码236个氨基酸,属bHLH转录因子家族成员。系统进化树分析显示,LjbHLH34蛋白与拟南芥bHLHⅣ亚家族中AtbHLH34和AtbHLH104亲缘关系较近。实时荧光定量分析表明LjbHLH34在日本百脉根的根中表达量最高,叶中次之,茎中最少,暗示其在日本百脉根多个组织中发挥作用;同时LjbHLH34基因也受聚乙二醇(PEG)和脱落酸(ABA)诱导表达。在酵母中检测发现LjbHLH34具有转录激活活性;亚细胞定位试验表明LjbHLH34蛋白定位于细胞核中。将LjbHLH34基因转入拟南芥获得过表达株系。在200 mmol·L^(-1)甘露醇胁迫下,LjbHLH34转基因拟南芥的根长明显长于野生型。干旱处理后,野生型拟南芥比转基因拟南芥萎蔫程度更加明显,而转基因株系的相对含水量和超氧化物歧化酶(SOD)活性显著高于野生型,丙二醛(MDA)积累显著低于野生型。qRT-PCR检测发现在干旱处理之后,与抗逆相关的基因AtCAT1、AtCAT3和AtRD22在转基因株系中的表达量显著升高。上述结果表明LjbHLH34正调控植物的抗旱性。 展开更多
关键词 bhlh转录因子 干旱胁迫 基因克隆 日本百脉根
下载PDF
生菜bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析 被引量:1
18
作者 隋心意 赵小刚 +2 位作者 毛欣 李亚灵 温祥珍 《中国农学通报》 2023年第3期104-110,共7页
本研究旨在对生菜(Lactuca sativa L.)bHLH转录因子进行全基因组鉴定与系统分析,以期为生菜bHLH家族基因的生物学功能的研究提供理论基础。通过Pfam下载bHLH结构域的隐马氏模型,利用HMMER3.0和SMART鉴定生菜bHLH基因。使用ExPASy ProtPa... 本研究旨在对生菜(Lactuca sativa L.)bHLH转录因子进行全基因组鉴定与系统分析,以期为生菜bHLH家族基因的生物学功能的研究提供理论基础。通过Pfam下载bHLH结构域的隐马氏模型,利用HMMER3.0和SMART鉴定生菜bHLH基因。使用ExPASy ProtParam tool、DNAMAN 5.0、ClustalX和MEGA 7.0等软件对bHLH的蛋白序列进行生物信息学分析。在生菜全基因组中共鉴定出135个bHLH转录因子,其编码蛋白的相对分子量为17843.82~75409.15 Da,理论等电点为0.63~9.51,其中有92个酸性蛋白,43个碱性蛋白。123个bHLH蛋白为不稳定蛋白,135个bHLH蛋白均为亲水性蛋白。各家族成员均含有N端碱性结构域和C端HLH结构域,其中N端可结合特定的DNA顺式元件,C端可维持bHLH蛋白二级结构的稳定。系统进化分析将生菜中135个bHLH蛋白分为10个亚家族。通过全基因组分析,共鉴定出135个生菜bHLH转录因子,为生菜bHLH家族基因的功能研究提供借鉴。 展开更多
关键词 生菜 bhlh 进化树分析 序列比对 全基因组鉴定
下载PDF
核桃JrbHLH转录因子家族鉴定与响应冷胁迫基因表达分析
19
作者 刘凯 李洋 +4 位作者 张强 王红霞 张井刚 何富强 陈春晴 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期50-62,共13页
为了探究核桃bHLH转录因子家族在响应冷胁迫过程中的作用,本研究通过转录组数据结合隐马尔可夫模型筛选技术在核桃全基因组挖掘出bHLH转录因子家族成员并进行结构分析,进一步对该家族成员响应冷胁迫的差异表达基因进行冷胁迫不同时间与... 为了探究核桃bHLH转录因子家族在响应冷胁迫过程中的作用,本研究通过转录组数据结合隐马尔可夫模型筛选技术在核桃全基因组挖掘出bHLH转录因子家族成员并进行结构分析,进一步对该家族成员响应冷胁迫的差异表达基因进行冷胁迫不同时间与不同组织中的表转录水平分析。结果表明,核桃bHLH转录因子家族包含72个基因,编码72条蛋白,开放阅读框为393-1839 bp,编码的蛋白长度为130-612个氨基酸,等电点为4.61-9.51,均为亲水性蛋白;各成员均含有典型的碱性区域和螺旋-环-螺旋结构域;与拟南芥同家族聚类分析发现,核桃bHLH家族成员可分布到15个亚群,且同源性较高。结合转录组数据筛选到16个响应冷胁迫的差异表达基因,在冷胁迫不同时间后出现不同程度响应,并且在不同组织中存在特异性表达。本研究将为核桃bHLH转录因子家族在响应冷胁迫过程中的作用研究奠定基础。 展开更多
关键词 核桃 冷胁迫 bhlh转录因子家族 表达分析
下载PDF
木薯蛋白激酶MeSnRK2.12与转录因子MebHLH1的互作鉴定及其表达分析
20
作者 郁雪婷 李可 +3 位作者 李梦桃 鲍茹雪 陈新 王文泉 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期2594-2600,共7页
蛋白激酶SnRK2s (Sucrose Non-fermenting Related Protein Kinase 2)是植物抗逆境机制中的关键组分。木薯是全球重要的食品和工业作物,具有高淀粉累积和耐逆境的特点。迄今对木薯MeSnRK2家族成员参与逆境下淀粉合成调控的内在机制尚不... 蛋白激酶SnRK2s (Sucrose Non-fermenting Related Protein Kinase 2)是植物抗逆境机制中的关键组分。木薯是全球重要的食品和工业作物,具有高淀粉累积和耐逆境的特点。迄今对木薯MeSnRK2家族成员参与逆境下淀粉合成调控的内在机制尚不清楚。本文围绕SnRK2家族受ABA微弱诱导的成员MeSnRK2.12展开研究,先对其进行生物信息学分析后发现其启动子区分布逆境响应元件:干旱胁迫MBS和ABA应答ABRE等顺式作用元件,且其氨基酸序列与AtSnRK2.8和OsSAPK1/2高度同源。ABA和PEG6000处理木薯SC8植株后发现, MeSnRK2.12可以在2 h内快速响应ABA和PEG6000处理,其转录活性在根中被抑制;在茎中被诱导上调,最高值分别为对照的15.0倍和8.0倍;在叶中也呈现上调趋势,但程度低于茎中。亚细胞定位试验结果显示MeSnRK2.12分布于细胞质和细胞核,利用酵母双杂交和双分子荧光互补(BiFC)试验均验证了MeSnRK2.12和转录因子MebHLH1间存在互作,且前期研究发现MebHLH1可以上调木薯蔗糖合酶基因MeSus1的转录活性,而蔗糖合酶的活性与植物库强直接相关。因此,推测MeSnRK2.12不仅在木薯应对逆境胁迫中发挥具有作用,还可能参与ABA信号介导的淀粉合成调控,有助于木薯在逆境条件下获得相对较高的淀粉产量。 展开更多
关键词 木薯 SnRK2s bhlh ABA PEG
下载PDF
上一页 1 2 13 下一页 到第
使用帮助 返回顶部