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BATMAN-TCM在线分析工具预测玄胡索散治疗骨关节炎作用及初步验证研究 被引量:19
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作者 汤化琪 梁瑞敏 +5 位作者 陈宇 罗世林 张硕峰 罗杰 王景红 孙毅坤 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2018年第1期142-145,I0016,I0017,共6页
目的:利用Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mech ANism of Traditional Chinese Medicine(BATMAN-TCM)在线分析工具预测玄胡索散治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)作用并进行初步试验验证。方法:在数据库中检索玄胡索... 目的:利用Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mech ANism of Traditional Chinese Medicine(BATMAN-TCM)在线分析工具预测玄胡索散治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)作用并进行初步试验验证。方法:在数据库中检索玄胡索散中单味药化学成分信息,利用BATMAN-TCM预测其潜在作用靶点、通路与疾病,构建化学成分-靶点-疾病网络,预测其治疗OA的作用。采用前交叉韧带横断联合半月板切除术造OA大鼠模型,经玄胡索散治疗后观察其对OA大鼠膝关节组织病理学与总胶原的影响,初步验证预测结果。结果:经BATMANTCM预测发现玄胡索散能作用于多条与OA相关通路,并具有治疗多种骨相关疾病的功效,动物试验表明玄胡索散能明显抑制OA大鼠膝关节软骨损伤(P〈0.05)与胶原降解(P〈0.05)。结论:BATMAN-TCM预测结果较为可靠,玄胡索散具有治疗OA的潜在作用。 展开更多
关键词 玄胡索散 batman-TCM 骨关节炎 试验验证
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改进BATMAN-adv的电力系统状态监测通信研究 被引量:2
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作者 陈东升 戴和原 《电力信息与通信技术》 2016年第7期23-28,共6页
随着无线通信在电力物联网监测中的广泛应用,电网中各环节状态参数类型的多样化直接导致了传输网络中传输业务的增加,对通信网络的吞吐量和稳定性提出了较高的要求。基于BATMAN-adv(Better Approach to Mobile Ad-hoc Networking Advanc... 随着无线通信在电力物联网监测中的广泛应用,电网中各环节状态参数类型的多样化直接导致了传输网络中传输业务的增加,对通信网络的吞吐量和稳定性提出了较高的要求。基于BATMAN-adv(Better Approach to Mobile Ad-hoc Networking Advanced)的无线Mesh网络通过对多网卡Mesh协议的支持,解决了无线Mesh网络多跳衰减的问题。文章针对BATMAN-adv Mesh路由选择标准唯一而导致的路由选择正确率和带宽下降问题,提出了一种智能链路选取方案,利用数据发送速率阈值改进路由协议标准。实际应用表明,改进BATMANadv可有效提高网络传输性能,对电力系统中的状态监测系统的稳定性具有重大的实际意义。 展开更多
关键词 输电线路监测 无线MESH网络 batman-adv 路由协议标准 传输成功率
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基于BATMAN-TCM在线分析平台的浙贝母-瓜蒌配伍治疗慢性阻塞性肺病的网络药理学研究 被引量:7
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作者 曹铭晨 徐龙 +6 位作者 辛兆洋 方孟香 邢晓敏 陈萧 汪川 魏欣欣 任炜 《山东科学》 CAS 2021年第1期10-20,共11页
基于中药分子机理的生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)挖掘浙贝母-瓜蒌治疗慢性阻塞性肺病的分子作用机制。应用BATMAN-TCM预测浙贝母-瓜蒌的潜... 基于中药分子机理的生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)挖掘浙贝母-瓜蒌治疗慢性阻塞性肺病的分子作用机制。应用BATMAN-TCM预测浙贝母-瓜蒌的潜在靶点,GeneCards数据库检索慢性阻塞性肺病的靶点;应用Cytoscape 3.7.1软件构建化合物-疾病-靶点相互作用网络、蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的生物通路富集分析。结果筛选得到浙贝母-瓜蒌中21种活性成分,基于STRING构建的浙贝母-瓜蒌靶点PPI网络包含131个节点和236条相互作用关系,关键节点包括ANXA1、EDN1、HDAC1、RXRA、ADRA2A、OXT、RXRB等。GO富集分析途径主要涉及离子门控通道活性、底物特异性通道活性、被动跨膜转运活性、细胞外配体门控离子通道活性、神经递质受体活性、配体门控离子通道活性等。KEGG通道分析主要涉及神经活动配体-受体相互作用、cAMP信号通路、钙离子信使通路、类胆碱能突触、逆行内源性大麻素信号传导、5-羟色胺能突触、多巴胺能突触等途径。研究结果提示浙贝母-瓜蒌关键的作用靶点包括ANXA1、HDAC1等,信号通路方面涉及类胆碱能、5-羟色胺、多巴胺等神经受体相关通路,体现了中药复方的整体性特点,为进一步研究浙贝母-瓜蒌的分子作用机制提供了新思路。 展开更多
关键词 浙贝母-瓜蒌 batman-TCM GO KEGG 网络药理学 慢性阻塞性肺病
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基于Android的BATMAN协议应用框架的研究 被引量:2
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作者 刘旭东 何泾沙 《电子设计工程》 2013年第20期10-13,17,共5页
随着互联网技术的发展,目前越来越多的应用转向了移动终端,以移动终端为代表的移动互联网时代已经到来。Android作为移动设别的主流操作系统,具有开源,免费等优势,但是在Android系统中,并没有提供ad hoc网络连接。在灾难救援、战场通信... 随着互联网技术的发展,目前越来越多的应用转向了移动终端,以移动终端为代表的移动互联网时代已经到来。Android作为移动设别的主流操作系统,具有开源,免费等优势,但是在Android系统中,并没有提供ad hoc网络连接。在灾难救援、战场通信、智能家电领域基于Android的ad hoc网络都具有极大的研究价值。通过对Android系统的剖析,以及对ad hoc网络路由协议的理解,研究最新的移动路由协议,构建一套支持在Android中建立自组网络框架是非常有研究和使用价值的。本文通过分析Android系统,研究用于移动ad hoc网络的BATMAN协议,提出了一套在Android系统中应用BATMAN作为路由协议,实现ad hoc网络连接的方案,并提出了相应的实现方式。 展开更多
关键词 ANDROID AD HOC网络 batman协议 软件框架
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基于BATMAN-TCM平台探讨刘尚义国医大师抗瘤四味方干预前列腺癌机制 被引量:5
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作者 孙波 李文 +1 位作者 秦忠 陈云志 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2020年第10期131-133,I0041,共4页
目的通过网络药理学方法探讨国医大师刘尚义教授抗瘤四味方干预前列腺癌的的机制。方法运用在线BATMAN-TCM平台对抗瘤四味方干预前列腺癌进行网络药理学分析。结果抗瘤四味方含78种化合物,其中预测对前列腺癌靶标基因12个,涉及跨膜转运... 目的通过网络药理学方法探讨国医大师刘尚义教授抗瘤四味方干预前列腺癌的的机制。方法运用在线BATMAN-TCM平台对抗瘤四味方干预前列腺癌进行网络药理学分析。结果抗瘤四味方含78种化合物,其中预测对前列腺癌靶标基因12个,涉及跨膜转运、细胞信号转导、生物合成过程、分解代谢过程、应激反应等细胞生理病理过程。结论抗瘤四味方具有通过调节雄激素受体、维生素D受体等环节发挥抗前列腺癌的作用机制。 展开更多
关键词 batman-TCM 国医大师 前列腺癌 分子机制 生物信息
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Batman-Adv协议客户端声明过程的改进
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作者 王子凡 王成安 《四川兵工学报》 CAS 2014年第12期112-114,121,共4页
分析了基于数据链路层寻址的Batman-Adv路由协议客户端声明机制,提出了使用转换表序号和前端阻断等方法对其进行了优化改进,新机制有效降低了网络开销和节点的运算量,并使该协议支持用户快速的跨区转换;最后通过仿真对机制的有效性进行... 分析了基于数据链路层寻址的Batman-Adv路由协议客户端声明机制,提出了使用转换表序号和前端阻断等方法对其进行了优化改进,新机制有效降低了网络开销和节点的运算量,并使该协议支持用户快速的跨区转换;最后通过仿真对机制的有效性进行了验证。 展开更多
关键词 路由协议 batman-Adv 客户端声明 转换表 无线网状网
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基于BATMAN adv协议的自组网系统研究与实现
7
作者 王真真 黄涛 +3 位作者 尹晓伟 宋树丽 左珺 陈书旺 《火控雷达技术》 2019年第2期76-81,89,共7页
无线自组织网络是其具备自我形成,自我修复和自组织特点的多节点参与的网络,网络拓扑结构问题是我们必须考虑的问题。针对此问题选择BATMAN adv作为系统的路由协议,可以快速适应拓扑结构的改变,提高了网络的传输效率。首先对路由协议原... 无线自组织网络是其具备自我形成,自我修复和自组织特点的多节点参与的网络,网络拓扑结构问题是我们必须考虑的问题。针对此问题选择BATMAN adv作为系统的路由协议,可以快速适应拓扑结构的改变,提高了网络的传输效率。首先对路由协议原理,协议算法,路由场景做出进一步的分析;其次对无线自组网系统的搭建和协议的配置作出描述;最后对无线自组网系统的主要性能:传输时延、丢包率、吞吐量进行了测试。验证了该系统在传输效率上有很大的优势,并提高了系统中的能量利用率。 展开更多
关键词 无线自组网 batman ADV 路由场景 LINUX
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基于BATMAN-TCM平台探析小活络丹治疗冻结肩机制的网络药理学研究
8
作者 郭慧 胡晓丽 +1 位作者 刘剑锋 白雪婷 《山西中医药大学学报》 2023年第3期291-298,共8页
目的:通过网络药理学方法探析小活络丹治疗冻结肩的作用机制。方法:运用中药分子机制的生物信息学分析工具(a Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of Traditional Chinese Medicine,BATMAN-TCM)提取小活络丹的药物... 目的:通过网络药理学方法探析小活络丹治疗冻结肩的作用机制。方法:运用中药分子机制的生物信息学分析工具(a Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of Traditional Chinese Medicine,BATMAN-TCM)提取小活络丹的药物有效成分以及潜在基因靶点,利用GeneCards平台检索冻结肩的作用靶点,对二者的检测结果提取交集靶点,构架蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析、基因本体功能富集分析(gene ontology,GO)以及京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and gnomes,KEGG)生物通路富集分析,构建“药物-成分-靶点-通路-疾病”网络。结果:筛选出小活络丹有效活性成分43个,涉及基因靶点346个,冻结肩疾病靶点1382个,药物与疾病交集靶点83个;PPI网络分析共获得83个节点,386条边,平均节点度值9.3,磷酸肌醇3激酶调控亚基(PIK3R1)、整联蛋白β2(ITGβ2)、组蛋白脱乙酰基酶2(HDAC2)等13个关联性最强的靶点可能是治疗冻结肩的核心靶点;GO功能分析中涉及生物过程(biological process,BP)的有238条,细胞组成(cellular component,CC)60条,分子功能(molecular function,MF)54条;KEGG通路富集分析出79条信号通路,主要包括神经活性配体-受体相互作用、c AMP信号通路等;复杂网络分析共有417个节点,935条边,平均度值4.48,度值最高的成分是没药中的肉桂醛和丁香酚,可能是小活络丹治疗冻结肩发挥关键作用的活性成分。结论:小活络丹治疗冻结肩具有多成分、多途径、多靶点的作用特点,为临床治疗冻结肩进一步提供理论依据。 展开更多
关键词 冻结肩 batman-TCM 小活络丹 网络药理学
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基于BATMAN的无线自组网系统中乒乓切换的研究 被引量:1
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作者 肖衡 梁加明 冯璐 《汽车实用技术》 2021年第2期20-21,27,共3页
文章主要针对BATMAN协议在多节点移动组网应用场景中所在节点处于各种干扰环境中,导致路由乒乓切换的问题,提出了更新门限阈值的方案。方案的优势就是当路由节点受到干扰来回切换时,提供快速切换制度,提高数据传输效率。通过对无线自组... 文章主要针对BATMAN协议在多节点移动组网应用场景中所在节点处于各种干扰环境中,导致路由乒乓切换的问题,提出了更新门限阈值的方案。方案的优势就是当路由节点受到干扰来回切换时,提供快速切换制度,提高数据传输效率。通过对无线自组网系统进行测试,表明文章所提出的优化方案能够有效地解决上述问题。 展开更多
关键词 batman 乒乓切换 自组网
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HWMP和Batman-adv路由协议对比研究
10
作者 林金锋 《软件》 2019年第6期119-122,共4页
根据无线网络的特点和需求,IEEE802.11工作组提出了二层路径转发的概念,即在数据链路层通过Mac地址进行数据转发。HWMP(Hybrid Wireless Mesh Protocol)和Batman-adv(Better Approach to Mobile Ad-hoc Networking Advanced)都是基于数... 根据无线网络的特点和需求,IEEE802.11工作组提出了二层路径转发的概念,即在数据链路层通过Mac地址进行数据转发。HWMP(Hybrid Wireless Mesh Protocol)和Batman-adv(Better Approach to Mobile Ad-hoc Networking Advanced)都是基于数据链路层的路由协议,本文通过对两种协议的原理进行介绍,并在相同条件下进行对比实验,分析两种路由协议的传输稳定性和路由收敛性。结果表明Batman-adv路由协议在传输稳定性方面比HWMP表现更优,在收敛性方面表现HWMP和Batman-adv路由协议表现都较好。 展开更多
关键词 无线MESH 路由协议 batman-adv HWMP 稳定性 收敛性
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BATMAN CHAPTER ONE: HELP ME
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作者 ROY SPENCER 《计算机光盘软件与应用(COMPUTER ARTS数码艺术)》 2007年第11期110-111,共2页
虽然对这位身披斗篷的十字军战士的诠释有点像蹲着的暗夜骑士,但在面对危险时他仍旧显得如此高大……
关键词 极简单主义 Rodriguez 蝙蝠侠 batman CHAPTER One:Help Me》 动画 电影
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恐怖笼罩着Gotham城 BATMAN AND ROBIN
12
《网上出版》 1997年第2期38-40,共3页
好莱坞历久不衰的现代童话侠客片蝙蝠侠(BATMAN)又全新登场了!这一次当然少不了闪闪发光的黑色铠甲,金发碧眼的美女,造型怪诞的超级战车……,可是令人兴奋的是动作片顶级高手施瓦辛格也身着奇装火爆登场,到底本片的主角是谁?蝙蝠侠还是... 好莱坞历久不衰的现代童话侠客片蝙蝠侠(BATMAN)又全新登场了!这一次当然少不了闪闪发光的黑色铠甲,金发碧眼的美女,造型怪诞的超级战车……,可是令人兴奋的是动作片顶级高手施瓦辛格也身着奇装火爆登场,到底本片的主角是谁?蝙蝠侠还是大块头施瓦辛格?一股新的邪恶力量已从阴森的魔怪大厦里开始了罪恶的行动。 展开更多
关键词 施瓦辛格 蝙蝠 batman AND ROBIN Gotham 现代童话 动作片
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一亿五千万美元打造的年轻蝙蝠侠——《蝙蝠侠5》Batman Begins
13
作者 黑爵士 《世界科幻博览》 2005年第6期39-40,共2页
导演:克里斯托弗·诺兰(代表作《记忆碎片》)主演:克里斯蒂安·贝尔、渡边谦、连恩·尼森、加里·奥德曼、摩根·弗里曼、迈克尔·凯恩、凯蒂·霍姆斯类型:动作/犯罪/惊悚/梦幻出品:华纳兄弟映期:2005年6... 导演:克里斯托弗·诺兰(代表作《记忆碎片》)主演:克里斯蒂安·贝尔、渡边谦、连恩·尼森、加里·奥德曼、摩根·弗里曼、迈克尔·凯恩、凯蒂·霍姆斯类型:动作/犯罪/惊悚/梦幻出品:华纳兄弟映期:2005年6月17日不会像漫画电影蝙蝠侠的故事已经被好莱坞电影、电视剧、漫画书翻来覆去地演绎了无数遍,但他的身世却从未真正被披露过。我们仅仅知道蝙蝠侠在童年的时候,曾经目睹双亲被人谋杀。布鲁斯·韦恩(蝙蝠侠的原名)又是怎么变成蝙蝠侠的呢?紧身蝙蝠衣和那辆超酷的蝙蝠车又是从哪里得到的呢?或者,像导演诺兰所说的:"一个生活在一个真实的世界里、天生不具任何神力的人,是怎么变得无往不胜的呢?" 展开更多
关键词 好莱坞电影 诺兰 蝙蝠车 克里斯托弗 batman BEGINS 布鲁斯 凯恩 克里斯蒂 凯蒂 华纳
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基于网络药理学及中医传承辅助平台对中医药治疗脑卒中用药规律及机制的研究
14
作者 孙作艳 王道艳 陈忠光 《医药前沿》 2024年第13期11-16,共6页
目的:采用网络药理学结合中医传承辅助平台的方法,探讨中医药治疗中风方剂核心中药配伍的用药规律及潜在作用机制。方法:检索中国知网、万方、维普等数据库中运用中医方剂治疗中风的临床研究文献,运用中医传承辅助平台软件(V2.5)建立数... 目的:采用网络药理学结合中医传承辅助平台的方法,探讨中医药治疗中风方剂核心中药配伍的用药规律及潜在作用机制。方法:检索中国知网、万方、维普等数据库中运用中医方剂治疗中风的临床研究文献,运用中医传承辅助平台软件(V2.5)建立数据库,分析中医药治疗中风的用药规律及核心中药配伍,通过BATMAN-TCM在线分析工具对核心中药配伍进行KEGG通路分析,揭示核心中药配伍治疗中风的潜在作用信号通路。结果:共筛选符合条件的方剂共76种,包含中药161种,使用频次前6位中药分别是甘草、川芎、当归、茯苓、黄芪、半夏。采用关联规则挖掘方法,得到常用药物组合17组,包含中药15味,使用前三的组合分别是甘草-茯苓、川芎-当归、川芎-地龙。通过无监督的熵层次聚类算法得到8种新处方。临床治疗中风的核心中药配伍起作用的潜在信号通路为神经营养素信号转导通路和神经活性的配体-受体相互作用信号通路。结论:甘草-茯苓、川芎-当归、川芎-地龙为中医药治疗中风的常见用药组合,其作用机制与神经营养素信号转导通路、神经活性的配体-受体相互作用信号通路作用机制有关。 展开更多
关键词 中风 中医药 网络药理学 中医传承辅助平台 batman-TCM
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交通干线无线宽带覆盖网络传输性能研究 被引量:4
15
作者 朱铨 蒋新华 邹复民 《计算机工程与应用》 CSCD 2012年第9期15-17,50,共4页
对交通干线无线宽带覆盖网络骨干链路的传输性能进行研究,建立了WMN骨干链路的传输模型,研究了对其多跳传输性能产生影响的主要因素。针对WMN骨干链路多跳传输带宽急剧下降和无线骨干链路的带宽瓶颈等两个多跳传输难题,提出了基于802.11... 对交通干线无线宽带覆盖网络骨干链路的传输性能进行研究,建立了WMN骨干链路的传输模型,研究了对其多跳传输性能产生影响的主要因素。针对WMN骨干链路多跳传输带宽急剧下降和无线骨干链路的带宽瓶颈等两个多跳传输难题,提出了基于802.11n的多模Mesh节点结构,实现了其原型系统。实验结果表明其具有超过165Mb/s的基准带宽,在60Mb/s的限速应用环境下,每跳的带宽衰减小于1%,满足了地面无线网络覆盖的需求。 展开更多
关键词 802.11n batman.adv 多模Mesh 多跳传输性能 无线网络覆盖
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借用网络数据库分析葛根化学成分及其与现代疾病的关系 被引量:3
16
作者 施伟丽 信琪琪 +2 位作者 袁蓉 丛伟红 陈可冀 《环球中医药》 CAS 2018年第4期610-615,共6页
葛根始载于中国最早的中药学著作《神农本草经》中,随着科技的发展和临床经验的不断积累,葛根的应用不断得到深入。本文借助TCMSP数据库、台湾中医药资料库、Batman TCM数据库对葛根成分及治疗的相关疾病进行了汇总和分析,发现不同数据... 葛根始载于中国最早的中药学著作《神农本草经》中,随着科技的发展和临床经验的不断积累,葛根的应用不断得到深入。本文借助TCMSP数据库、台湾中医药资料库、Batman TCM数据库对葛根成分及治疗的相关疾病进行了汇总和分析,发现不同数据库得到的结果不尽相同,其中葛根化学成分分析结果中,大豆苷、葛根素、滨蒿内酯、尿囊素为3个数据库所共有,且葛根主用于心绞痛、高血压、心力衰竭等心血管疾病的治疗。大数据时代的来临为中药的整合和深入研究带来了新的发展契机,在借助大数据便利的同时,也应重视其结果在基础实验中的验证。 展开更多
关键词 葛根 TCMSP数据库 台湾中医药资料库 batman TCM数据库
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无人机自组网系统设计与实现 被引量:3
17
作者 姚荣彬 李晓欢 唐欣 《现代信息科技》 2019年第10期60-61,64,共3页
无人机即时快速自组网已经成为多无人机协作应用的瓶颈问题,本文设计了一种大范围、连续覆盖的无人机自组网系统。该系统基于Batman-adv路由协议,通过混频器将无线信号进行上下变频,实现了多无人机即时快速自组网。测试结果表明,该系统... 无人机即时快速自组网已经成为多无人机协作应用的瓶颈问题,本文设计了一种大范围、连续覆盖的无人机自组网系统。该系统基于Batman-adv路由协议,通过混频器将无线信号进行上下变频,实现了多无人机即时快速自组网。测试结果表明,该系统发射信号质量良好,具备多个无人机节点的自组网与通信能力,验证了自组网系统的可行性。 展开更多
关键词 无人机 自组网 batman-adv TCP/IP 紧急通信
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基于数据挖掘和网络药理学探讨孙思邈治疗消渴病的遣方用药规律 被引量:1
18
作者 邵鑫 冉颖卓 +3 位作者 刘晶 方家 杨鑫 胡钢 《内蒙古中医药》 2022年第9期116-120,共5页
目的:探讨孙思邈治疗消渴病的遣方用药规律。方法:整理《千金要方》卷二十一、《千金翼方》卷十九中治疗消渴病的76首方剂用药,将其录入仓公诊籍国医脉案数据记录挖掘系统统计药物使用、性味归经频次,采用关联分析、聚类分析法挖掘孙思... 目的:探讨孙思邈治疗消渴病的遣方用药规律。方法:整理《千金要方》卷二十一、《千金翼方》卷十九中治疗消渴病的76首方剂用药,将其录入仓公诊籍国医脉案数据记录挖掘系统统计药物使用、性味归经频次,采用关联分析、聚类分析法挖掘孙思邈治疗消渴病的用药特点和配伍规律,并通过生物信息学分析工具BATMAN-TCM对聚类分析所得核心方药进行GO富集分析和KEGG分子信号通路富集分析,预测其治疗糖尿病的可能分子作用靶点。结果:共纳入方剂76首,所用药物136味。药物使用频次前5位分别为天花粉、甘草、麦门冬、黄连、生地黄;频次前3位的药类分别为清热泻火药、补气药、补阴药;药性使用前4位分别为平、寒、微寒、温,药味使用频次前4位分别为甘、苦、辛、微苦;前5位归经依次是胃经、肺经、心经、脾经、肾经;关联分析得到常用2味、3味药物组合共计30个;聚类分析得到3类常用方药组合;GO富集分析共获得8个分子功能、8个细胞组分、20个生物过程,KEGG分子信号通路富集分析得到28条细胞信号通路。结论:孙思邈治疗消渴病用药以清热滋阴,补气益肾为主,寒温并用、阴阳互补,核心方药治疗糖尿病是多靶点、多通路的复杂机制,其机制与调节细胞内能量代谢、抑制炎症因子、调节肠道菌群等相关。 展开更多
关键词 消渴病 孙思邈 《千金方》 用药规律 数据挖掘 网络药理学 batman-TCM
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基于对枸杞、姜黄、甘草的生物信息学分析探究GRIN3A在前列腺癌中的治疗意义 被引量:4
19
作者 王庆哲 张恩崇 宋永胜 《实用药物与临床》 CAS 2020年第1期14-20,共7页
目的综合分析枸杞、姜黄、甘草在前列腺癌中的治疗作用,发掘新的靶向治疗基因。方法BATMAN-TCM数据库预测3类药材靶向蛋白基因,使用TCGA数据库筛选出差异表达基因。在Cytoscape中选择候选核心基因,通过生存分析确定最终核心基因。对核... 目的综合分析枸杞、姜黄、甘草在前列腺癌中的治疗作用,发掘新的靶向治疗基因。方法BATMAN-TCM数据库预测3类药材靶向蛋白基因,使用TCGA数据库筛选出差异表达基因。在Cytoscape中选择候选核心基因,通过生存分析确定最终核心基因。对核心基因进行单基因GSEA分析以及COX回归分析。结果3类药材共同靶向基因180个,其中在TCGA数据库前列腺肿瘤组织与正常组织间差异表达的基因有11个。Cytoscape中筛选出候选差异基因PTGS2、GRIN3A、CACNA1D。生存分析显示,仅GRIN3A与患者不良预后相关。单基因GSEA提示,GRIN3A相关的生物学活动对前列腺癌的发生发展具有促进作用。单因素及多因素COX回归提示,GRIN3A为疾病的独立预后因素。结论GRIN3A在枸杞、姜黄、甘草对前列腺癌的治疗机制中发挥重要作用,该基因具有成为前列腺癌靶向治疗位点的潜能。 展开更多
关键词 GRIN3A基因 前列腺癌 中药 TCGA batman-TCM
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通过网络药理学探究四君子汤在前列腺癌治疗中的机制 被引量:4
20
作者 王庆哲 张恩崇 +1 位作者 鞠培新 宋永胜 《实用药物与临床》 CAS 2020年第4期299-304,共6页
目的探索四君子汤在前列腺癌治疗中的机制。方法 BATMAN-TCM数据库预测四君子汤成分及靶蛋白基因,使用TCGA数据库筛选出差异表达基因。构建PPI网络筛出候选关键基因,GEPIA数据库验证表达量,确定关键基因。生存分析和tdROC曲线验证关键... 目的探索四君子汤在前列腺癌治疗中的机制。方法 BATMAN-TCM数据库预测四君子汤成分及靶蛋白基因,使用TCGA数据库筛选出差异表达基因。构建PPI网络筛出候选关键基因,GEPIA数据库验证表达量,确定关键基因。生存分析和tdROC曲线验证关键基因对前列腺癌的意义。结果四君子汤靶蛋白基因共1 622个,其中在TCGA数据库前列腺癌组织与正常组织间差异表达的基因有69个。PPI网络中候选关键基因为UGT1A1、ALB、PTGS2、CYP19A1和ADCY8。经GEPIA数据库表达量验证,PTGS2为关键基因。生存分析提示该基因表达量增高可改善预后。tdROC曲线表明PTGS2对预后具有良好的预测作用。结论四君子汤可通过靶向PTGS2基因加强表达,从而逆转前列腺癌的发生发展。 展开更多
关键词 PTGS2基因 前列腺癌 中药 TCGA batman-TCM
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