东乡野生稻双元细菌人工染色体(BIBAC)文库的构建

双元细菌人工染色体(binarybacterialartificialchromosome,BIBAC)是能直接将大片段DNA转入植物的载体,是植物基因图位克隆和构建植物基因嵌入突变体库的重要工具。该研究以东乡野生稻为材料,构建其BIBAC文库。该文库由14592个克隆组成,平均插入片段大小为65kb,覆盖率为2倍基因组。稳定性检测结果表明,东乡野生稻基因组DNA能够在BIBAC载体中稳定存在。

高效制备双元细菌人工染色体(BIBAC)载体DNA的研究

高质量的BIBAC载体DNA的制备受到酶切、脱磷等许多因素的影响,是构建BIBAC文库的关键步骤之一.以BIBAC2载体为材料,对其进行了BamHI限制性酶切和CIAP脱磷,制备了可用于进一步构建文库的线性载体.在此基础上确定了适宜的酶量、酶切时间、脱磷酶的用量及失活等步骤的反应条件.

BIBAC2载体转化水稻的研究

双元细菌人工染色体（BIBAC）栽体具有克隆大片段DNA构建文库和农杆菌介导转化植物的双重功能．利用BIBAC载体，在双子叶植物烟草和番茄中已实现了大片段DNA的转移，但在单子叶植物中的应用还未见报道．本研究利用不同水稻基因型、不同农杆菌菌株，对水稻进行了BIBAC2栽体的转化研究．水稻成熟胚诱导愈伤组织经过1～2次继代培养，在含乙酰丁香酮的N6培养基上预培养3d，在含BIBAC2栽体的农杆菌中侵染10min，26℃下共培养3d．感染后的愈伤组织在含25～50mg／L潮霉素培养基上经过4～8周的筛选，共得到了66株抗性再生植株．通过对抗性植株中GUs基因的组织化学染色检测，NPTⅡ基因的PCR检测和ELISA检测，HYG基因的PCR检测，确认2株阳性植株来自EHA105菌系侵染的中花15号愈伤组织，1株阳性植株来自EHA105菌系侵染的中花8号愈伤组织，转化率分别为2．9％和0．9％．结果表明，B1BAC2栽体已被成功导入了水稻基因组中，转化效果EHA105菌株优于C58C1菌株，中花15号、中花8号优于中花10号和中花11号．结果还表明，利用三亲交配法可以将大于23．5kb的载体转化到农杆菌中．初步建立了BIBAC2栽体转化水稻的技术体系，为利用BIBAC系统向水稻转入大片段DNA和多个外源功能基因奠定了基础．

水稻双元细菌人工染色体载体系统转化体系的建立(英文)

普通双元载体已被广泛应用于农杆菌介导的植物转化,但这类载体通常只能转移5-20 kb的外源DNA片段;而双元细菌人工染色体(BIBAC)载体可以弥补普通双元载体的不足,通过它已在烟草、番茄等双子叶植物中实现了大片段 DNA(150 kb)的转移。BIBAC载体在单子叶植物转化中的应用尚未见报道。由于单、双子叶植物间以及大、小片段转化间的转化体系存在明显差异,常规的农杆菌介导的水稻转化体系不能适应BIBAC系统转化的要求。因此,建立适于BIBAC 系统的水稻转化体系是十分必要的。通过比较不同的受体材料,不同的预培养、共培养条件,不同的去除农杆菌及选择阳性愈伤的方式等对转化效率的影响,建立了适合水稻BIBAC系统的转化体系。该体系的技术要点包括:以水稻品种H1493 为转化受体;以含毒性辅助质粒pCH32的LBA4404菌株(HP4404)为侵染菌株;预培养的培养基pH5．6;以N6A代替AAM 悬浮农杆菌:侵染菌液浓度为OD600=1．0;共培养温度为24℃;采用过渡(Resting)培养除去农杆菌;采用二步法进行选择等。基于PCR检测、Southern印迹分析的结果表明,BIBAC载体所携带的插入片段及标记基因已整合到转化植株的基因组中。这个体系的建立为在水稻中利用BIBAC系统进行大片段DNA转化奠定基础。

毛竹大片段双元细菌人工染色体基因组文库的构建

从毛竹Phyllostachys pubescens幼嫩叶片中提取纯化得到高质量的基因组DNA,经限制性内切酶BamH I对它们进行梯度酶切,脉冲场电泳选择合适酶切DNA片段,与脱磷酸化处理过的质粒载体pCLD04541按质量比3∶1相互连接,转化大肠杆菌Escherichia coli DH10B感受态细胞进行蓝白斑筛选,挑取白色克隆,获得重组率较高的阳性克隆,构建了含有104个克隆的双元细菌人工染色体(BIBAC)基因组文库,并通过脉冲场电泳检测分析后确定,所构建的毛竹BIBAC文库平均插入片段为105 kb,约覆盖5倍毛竹基因组。该文库的构建为毛竹基因组研究做好了前期的基础工作。

双元细菌人工染色体基因组文库研究进展

酵母人工染色体(YAC)、细菌人工染色体(BAC)是伴随着人类基因组计划的实施而产生的,这些大片段基因克隆载体的应用推动了分子生物学、遗传学等学科的快速发展。以农杆菌介导的直接转化植物为代表的双元细菌人工染色体(BIBAC)载体的发展,加速植物基因组的研究,成为植物基因组分析、基因功能鉴定、染色体结构与功能关系研究的重要工具。介绍了人工染色体文库的发展史,根据建库经验,着重阐述了BIBAC文库的构建、鉴定与应用。

人参大片段DNA(100kb)转化灵芝的研究

为探讨人参大片段DNA转化灵芝的可能性,通过电击法将双元细菌人工染色体(BIBAC)载体上的100kb人参大片段DNA转化到灵芝原生质体内。研究发现,在电极间距为4mm,电压强度为240V时,将5μL的人参大片段DNA转化到75μL的灵芝原生质体,在选择培养基上获得了具有再生能力的转化子。根据克隆载体两侧的序列设计两对引物,对转化子进行PCR分析。试验结果表明人参大片段DNA已经转化到灵芝的基因组中。