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黄瓜黑色果刺基因染色体定位及候选基因分析 被引量:11
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作者 刘书林 顾兴芳 +4 位作者 苗晗 王烨 Yiqun Weng Todd C Wehner 张圣平 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期122-132,共11页
【目的】黄瓜作为重要的果菜类蔬菜,果实品质一直是黄瓜育种研究的重点。果实品质包括内在品质和外观品质,其中外观品质对黄瓜的商品性具有重要影响。果刺颜色作为黄瓜重要的品质性状之一,对其进行遗传分析和基因定位将有助于了解果刺... 【目的】黄瓜作为重要的果菜类蔬菜,果实品质一直是黄瓜育种研究的重点。果实品质包括内在品质和外观品质,其中外观品质对黄瓜的商品性具有重要影响。果刺颜色作为黄瓜重要的品质性状之一,对其进行遗传分析和基因定位将有助于了解果刺颜色遗传的分子机理,为黄瓜果实性状改良提供理论依据和技术支撑,同时也可为刺色基因的精细定位及克隆奠定基础。【方法】研究利用黄瓜白色果刺自交系GY14(P1)和黑色果刺自交系NC76(P2)为亲本构建遗传群体,进行黄瓜果刺颜色的遗传分析。以F2分离群体为试材,应用分离群体分组分析法(BSA)和2 112对SSR引物进行SSR分析,结合9 930黄瓜全基因组序列信息和100份核心种质重测序结果开发新标记,对初定位区域进行标记加密。采用JoinMap 4.0作图软件和MapInspect软件构建连锁群并完成连锁群与染色体的对应,实现黄瓜黑色果刺性状的基因定位。运用生物信息学,在定位区域进行候选基因分析。利用包含156个株系的重组自交系(RILs)群体,对黑色果刺基因紧密连锁的两侧翼分子标记进行验证,确定标记用于分子标记辅助选择(MAS)育种的准确性。【结果】研究表明,黄瓜自交系NC76的黑色果刺符合质量性状遗传特点,由显性单基因B控制,黑色对白色为显性。初步定位筛选获得了与B基因连锁的8对SSR引物,将B定位于黄瓜4号染色体(Chr.4)上,最近的连锁标记为SSR22231,遗传距离为10.8 cM;根据初定位区域的序列信息,设计合成了新的SSR引物212对和Indel引物25对,利用这些引物对双亲和F2群体DNA进行分析,最终构建了一个包含14个SSR标记和1个InDel标记的分子标记连锁群,获得与B连锁的两侧翼标记SSRB-181和SSRB-130,遗传距离分别为2.0 cM和1.6 cM,该区段物理距离为422.1 kb,有60个预测候选基因,推测Csa4G003095和Csa4G001690是与黑色果刺形成相关性较大的候选基因。与B紧密连锁的两侧翼标记用于MAS育种的准确率分别为96.8%和96.2%,其中SSRB-181对黑色果刺植株鉴定的准确率达到100%,将在MAS育种发挥重要作用。【结论】黄瓜自交系NC76的黑色果刺性状由显性单基因控制,该基因位于Chr.4上422.1 kb范围内,两侧翼标记为SSRB-181和SSRB-130,遗传距离为3.6 cM。本研究结果为黑色果刺基因的精细定位和克隆及MAS育种奠定了良好基础。 展开更多
关键词 黄瓜 黑色果刺 染色体定位 SSR标记 候选基因 CUCUMIS SATIVUS L
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黄瓜果实黑刺基因定位及候选基因多样性研究 被引量:5
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作者 彭佳林 聂京涛 +3 位作者 曲美玲 潘俊松 何欢乐 蔡润 《上海交通大学学报(农业科学版)》 2015年第4期12-19,共8页
果刺颜色影响黄瓜(Cucumis sativus L.)商品品质,是外观品质育种的重要性状之一。利用黄瓜黑刺自交系S52,黑刺野生种hardwickii以及3个白刺材料S1003、WI1983G和397为试材,分别构建BC1或F2遗传群体,对黄瓜黑刺性状(black spine,B)进行... 果刺颜色影响黄瓜(Cucumis sativus L.)商品品质,是外观品质育种的重要性状之一。利用黄瓜黑刺自交系S52,黑刺野生种hardwickii以及3个白刺材料S1003、WI1983G和397为试材,分别构建BC1或F2遗传群体,对黄瓜黑刺性状(black spine,B)进行遗传分析与基因定位,并使用14个不同遗传背景的黑刺或白刺材料用于B候选基因Csa4G003095序列多样性研究。结果表明,S52、hardwickii中果实黑刺由显性单基因控制,利用3个群体均将B定位于第4染色体的短臂上,最近两侧翼标记(SSRB-130和SSRB-107)与B的遗传距离分别为2.01cM和0.78cM。序列分析发现,4个黑刺黄瓜材料的Csa4G003095预测编码的氨基酸序列没有差异,但10个白刺材料在该基因编码区的变异很大,引起其编码蛋白的一小段或大段氨基酸缺失,功能缺失造成了刺色变异,验证了Csa4G003095即为黄瓜黑刺基因B。同时,B基因侧翼标记InDelB01、SSRB-99、SSRB-130可用于黑刺辅助选择育种,准确率在97.9%以上。 展开更多
关键词 黄瓜 黑色果刺 基因定位 标记辅助选择
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黑脊倒刺鲃的繁殖与养殖技术 被引量:9
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作者 黄洪贵 黄种持 +2 位作者 林学文 赖铭勇 凌伟专 《福建水产》 2004年第3期12-16,共5页
Black spine barbus fish, Spinibarbus caldwelli (Nicholes) is mainly distributed in Qiantang River, Pearl River, Yuan River and Hainan Island, it is an important commercial fish species in the producing area. The artic... Black spine barbus fish, Spinibarbus caldwelli (Nicholes) is mainly distributed in Qiantang River, Pearl River, Yuan River and Hainan Island, it is an important commercial fish species in the producing area. The article describes the biology characteristics, technique of artificial breeding and aquaculture. It will be significant and valuable for stock preservation and commercial aquaculture of barbus fish. 展开更多
关键词 黑脊倒刺鲃 繁殖性能 养殖技术 生物学特性
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黄瓜果实黑刺基因B2的遗传分析和定位 被引量:1
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作者 陈龙 杜慧 +3 位作者 李恒松 潘俊松 何欢乐 蔡润 《上海交通大学学报(农业科学版)》 2016年第5期35-40,共6页
以黄瓜黑刺自交系PI197088(P1)和白刺自交系SA0422(P2)为亲本构建的592株F2群体为材料,对黄瓜果实黑刺基因B2进行定位研究。采用以下方法:(1)遗传分析:性状调查结果为F2群体中黑刺株与白刺株的分离比为9∶7,初步判定黑刺性状由2对基因... 以黄瓜黑刺自交系PI197088(P1)和白刺自交系SA0422(P2)为亲本构建的592株F2群体为材料,对黄瓜果实黑刺基因B2进行定位研究。采用以下方法:(1)遗传分析:性状调查结果为F2群体中黑刺株与白刺株的分离比为9∶7,初步判定黑刺性状由2对基因控制。(2)测序比对:比对亲本中的黑刺基因B(Csa4G003095),发现SA0422的B基因转录区存在单碱基突变,引起转录本拼接异常,导致编码产物出现18个氨基酸的缺失。(3)基因分型:用与B基因紧密连锁的SSR标记分析表型为白刺的单株,结果呈现3种不同的基因型,推测在PI197088和SA0422及其后代群体中,果实黑刺性状由B基因和另一个基因(命名为B2)共同控制。(4)基因定位:利用该F2群体,通过分离群体分组分析法(bulked segregant analysis,BSA),筛选获得与B2基因连锁的SSR标记5个,构建了B2基因的SSR标记连锁群。得到以下分析结果:研究分析表明黄瓜果实黑刺由2对基因(B和B2基因)控制,本研究将B2基因定位于黄瓜第5号染色体上,与两侧最近的连锁标记(SSR13237和SSR03514)的遗传距离分别为12.94和2.42cM,这些结论为后续的B2基因精细定位奠定了基础。 展开更多
关键词 黄瓜 果实黑刺基因B2 遗传分析 基因定位
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The Structure of Internal Blood Vessels in Mongolian Fetal Vertebral Bodies
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作者 Oyuntsetseg Demed Yansanjav Damdinjav +2 位作者 Avirmed Amgalanbaatar Enebish Sundui Amgalanbaatar Dorjkhuu 《Open Journal of Applied Sciences》 2013年第1期62-66,共5页
Purpose: Investigate specific characteristic of blood supply of fetal vertebral bodies. Material & Methods: 16 - 30 week aged 20 fetuses (10 male, 10 female) were used for the study. Norms and requirements of Bio-... Purpose: Investigate specific characteristic of blood supply of fetal vertebral bodies. Material & Methods: 16 - 30 week aged 20 fetuses (10 male, 10 female) were used for the study. Norms and requirements of Bio-Medical Ethics have not been violated in the use of human material in the study. Black-ink perfusion and cast of substance absorbing X-ray were applied in the fetuses. Results: Three concentric zones could be distinguished in the vascular architecture of the fetal vertebral bodies. 1) The peripheral zone of perichondrial vessels;2) The intermediate zone of radial vessels. 3. The central zone of the ossification centre vessels. We used black-ink perfusion and cast of substance absorbing X-ray were applied in the fetuses. Periosteum of fetal vertebral bodies are distributed originating from fine arteries of 70 - 120 diameter and arterioles of 30 - 50 diameter which are part of arteries of network of micro blood circulation. Venules are followed along two sides of this arteriole and short precapillaries are branched out in tree-like manner from it forming capillary network surrounding arteriole and capillary plexuses. Postcapillaries branched from the network are being emerged the venules accompanied arterioles. Conclusions: Micro blood circulatory system of the vertebrae has angion structure. The peripheral zone of perichondrial vessels has combined blood supply surrounded by blindly ending capillary network drained up and down from the central zone. The central zone of vertebral body is supplied with blood by the main arteriole. 展开更多
关键词 FETUS VASCULARIZATION spine VERTEBRAL BODIES INTRAOSSEOUS Arteries PERIOSTEUM X-Ray Angiography black-Ink Perfusion
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