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题名黄瓜果实黑刺基因B2的遗传分析和定位
被引量:1
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作者
陈龙
杜慧
李恒松
潘俊松
何欢乐
蔡润
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机构
上海交通大学农业与生物学院
上海市农业技术推广服务中心
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出处
《上海交通大学学报(农业科学版)》
2016年第5期35-40,共6页
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基金
国家863计划课题(2012AAl00101)
上海市科委项目(13JCl403600)
上海市研究生教育创新计划项目(园艺学)
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文摘
以黄瓜黑刺自交系PI197088(P1)和白刺自交系SA0422(P2)为亲本构建的592株F2群体为材料,对黄瓜果实黑刺基因B2进行定位研究。采用以下方法:(1)遗传分析:性状调查结果为F2群体中黑刺株与白刺株的分离比为9∶7,初步判定黑刺性状由2对基因控制。(2)测序比对:比对亲本中的黑刺基因B(Csa4G003095),发现SA0422的B基因转录区存在单碱基突变,引起转录本拼接异常,导致编码产物出现18个氨基酸的缺失。(3)基因分型:用与B基因紧密连锁的SSR标记分析表型为白刺的单株,结果呈现3种不同的基因型,推测在PI197088和SA0422及其后代群体中,果实黑刺性状由B基因和另一个基因(命名为B2)共同控制。(4)基因定位:利用该F2群体,通过分离群体分组分析法(bulked segregant analysis,BSA),筛选获得与B2基因连锁的SSR标记5个,构建了B2基因的SSR标记连锁群。得到以下分析结果:研究分析表明黄瓜果实黑刺由2对基因(B和B2基因)控制,本研究将B2基因定位于黄瓜第5号染色体上,与两侧最近的连锁标记(SSR13237和SSR03514)的遗传距离分别为12.94和2.42cM,这些结论为后续的B2基因精细定位奠定了基础。
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关键词
黄瓜
果实黑刺基因b2
遗传分析
基因定位
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Keywords
Cucumis sativus L.
black spine gene b2
genetic analysis
gene mapping
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分类号
S642.2
[农业科学—蔬菜学]
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