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长顺绿壳蛋鸡mtDNA D-loop区遗传多样性分析 被引量:3
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作者 韩雪 朱丽莉 +1 位作者 粟朝芝 陶宇航 《中国家禽》 北大核心 2015年第12期14-17,共4页
为更好地对长顺绿壳蛋鸡进行品种保护和利用,并从母系遗传角度深入阐明长顺绿壳蛋鸡的群体遗传背景,利用PCR直接测序法,测定了114只长顺绿壳蛋鸡的线粒体DNA(mt DNA)D-loop第1高变区568 bp片段序列。结果表明:在所分析的长顺绿壳蛋鸡mt ... 为更好地对长顺绿壳蛋鸡进行品种保护和利用,并从母系遗传角度深入阐明长顺绿壳蛋鸡的群体遗传背景,利用PCR直接测序法,测定了114只长顺绿壳蛋鸡的线粒体DNA(mt DNA)D-loop第1高变区568 bp片段序列。结果表明:在所分析的长顺绿壳蛋鸡mt DNA D-loop区序列中,A、C、G、T平均比例为27.1%、29.5%、13.4%、30.0%;共检测到核苷酸变异位点37个,核苷酸多样度为0.0111,24种单倍型,单倍型多样度为0.845,表明长顺绿壳蛋鸡遗传多样性较丰富,具有较好的选育潜力。聚类分析结果表明,长顺绿壳蛋鸡与红原鸡亲缘关系较近。 展开更多
关键词 长顺绿壳蛋鸡 MTDNA D-loop 遗传变异
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内循环SBR处理含染料废水的研究 被引量:29
2
作者 文湘华 王东海 钱易 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第S1期54-57,共4页
研究开发了内循环SBR (ILSBR)新型反应器 ,并对其处理含活性翠蓝染料 (RTB)废水的效果 ,营养物浓度、RTB浓度、混合液停留时间等对污染物去除效果的影响 ,反应器内微生物特性等进行了试验研究 .结果表明 ,该反应器对有机物及染料的去除... 研究开发了内循环SBR (ILSBR)新型反应器 ,并对其处理含活性翠蓝染料 (RTB)废水的效果 ,营养物浓度、RTB浓度、混合液停留时间等对污染物去除效果的影响 ,反应器内微生物特性等进行了试验研究 .结果表明 ,该反应器对有机物及染料的去除效果优于传统活性污泥法反应器 ;RTB对微生物生长有限制作用 ;营养物浓度存在最佳范围 ;周期延长有利于污染物去除 ;ILSBR反应器具有良好的优势微生物筛选及保持功能 ,有利于难降解物质的去除 . 展开更多
关键词 活性翠蓝 内循环SBR(ILSBR) 微生物 废水处理
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基于红外光谱技术光纤通信的实验设计 被引量:3
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作者 郭宏 朱昊 +1 位作者 尉昊赟 杨怀栋 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2019年第2期117-120,共4页
介绍了光纤通信的原理及应用,分析了实验的可行性,提供了线路的设计参数及对光电器件的要求,使用实验室自制的光纤耦合装置。要求学生自行完成实验板的设计、安装、调试的全部过程。分析对频率解调的对策,蓝牙信号输出与发射电路的对接... 介绍了光纤通信的原理及应用,分析了实验的可行性,提供了线路的设计参数及对光电器件的要求,使用实验室自制的光纤耦合装置。要求学生自行完成实验板的设计、安装、调试的全部过程。分析对频率解调的对策,蓝牙信号输出与发射电路的对接方式等实验常见问题。学生完成此实验可加深对理论课程的理解掌握,从理论到实践对光纤通讯的实验设计获得更深入的理解,提升自己动手解决实际问题的能力,推动光电技术及系统课程的改进,提高教学质量;为学生后续课程提供课题研究的学习模式和实验方法。 展开更多
关键词 光纤 光源 PIN管 锁相环 蓝牙
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基于环介导等温扩增技术检测橡树疫霉菌 被引量:18
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作者 戴婷婷 陆辰晨 +2 位作者 沈浩 王源超 郑小波 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期23-28,共6页
应用环介导等温核酸扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)建立了基于颜色判定的简单、快速和灵敏的橡树疫霉菌(Phytophthora ramorum)检测方法。以ITS为靶序列对橡树疫霉菌的分子检测存在无法区分近似种的问题,笔者... 应用环介导等温核酸扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)建立了基于颜色判定的简单、快速和灵敏的橡树疫霉菌(Phytophthora ramorum)检测方法。以ITS为靶序列对橡树疫霉菌的分子检测存在无法区分近似种的问题,笔者在橡树疫霉菌的基因组研究中,发现了PrA3aPro类转座子序列。生物信息学分析表明,该序列非常适合作为大豆疫霉分子检测的靶标。利用LAMP技术,以PrA3aPro为靶序列,设计LAMP特异性引物,建立LAMP反应体系与条件,并进行灵敏度和特异性试验。结果表明:整个检测过程仅需1 h,即可通过肉眼直接目测试验结果。在等温条件下(64℃)进行核酸扩增反应1 h,然后经3种方法验证扩增结果:1)浊度仪验证浊度变化;2)琼脂糖凝胶电泳验证;3)在扩增前加入染料HNB(羟基萘酚蓝)作为反应指示剂,根据HNB的颜色变化判定。特异性试验中,在橡树疫霉菌株中能够产生浊度曲线,扩增到梯形条带,同时HNB显色观察到天蓝色的阳性反应,而在其他疫霉、腐霉和真菌供试菌株中均没有观察到这些现象。在灵敏度试验中,PrA3aPro-LAMP技术最低检测限为1 ng.μL-1。该方法的建立为橡树疫霉菌的检疫及其所致病害的快速诊断提供了新的技术。 展开更多
关键词 橡树疫霉菌 环介导等温扩增 PrA3aPro 羟基萘酚蓝(HNB)
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可视化环介导等温扩增技术在肺炎支原体检测中的应用 被引量:6
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作者 严春霞 闻人庆 +1 位作者 陆伟宏 何国产 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2016年第2期85-89,共5页
目的建立可视化肺炎支原体环介导等温扩增(LAMP)检测体系,并对其敏感性和特异性进行验证,以期开发出适合各级医院和现场高通量检测的肺炎支原体试剂盒。方法克隆肺炎支原体P1基因质粒,并以此为模板建立LAMP体系,优化肺炎支原体LAMP体系... 目的建立可视化肺炎支原体环介导等温扩增(LAMP)检测体系,并对其敏感性和特异性进行验证,以期开发出适合各级医院和现场高通量检测的肺炎支原体试剂盒。方法克隆肺炎支原体P1基因质粒,并以此为模板建立LAMP体系,优化肺炎支原体LAMP体系的各组分和反应参数,添加反应指示剂羟基萘酚蓝,用已知浓度的肺炎支原体P1质粒检测体系敏感性;以相近种类支原体和细菌检测体系特异性。结果建立的可视化肺炎支原体LAMP体系能特异性检测肺炎支原体,检测限为2×102copies/m L。结论建立的可视化肺炎支原体LAMP检测体系可应用于人肺炎支原体检测,价格低廉,无需贵重仪器设备,操作简便,适合各级医院和现场高通量肺炎支原体检测。 展开更多
关键词 肺炎支原体 环介导等温扩增 可视化 羟基萘酚蓝
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等温扩增技术快速检测棕榈疫霉 被引量:6
6
作者 戴婷婷 吴小芹 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第10期161-166,共6页
【目的】棕榈疫霉是农林业生产上的一种危害严重的病原菌,建立棕榈疫霉的快速分子检测技术对于预测疫病发生情况、及时采取有效的防治方法控制疫病的传播和流行、减少经济损失具有重要意义。【方法】采用环介导等温核酸扩增技术(loop-me... 【目的】棕榈疫霉是农林业生产上的一种危害严重的病原菌,建立棕榈疫霉的快速分子检测技术对于预测疫病发生情况、及时采取有效的防治方法控制疫病的传播和流行、减少经济损失具有重要意义。【方法】采用环介导等温核酸扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),建立了以基因间隔区(intergenic spacer,IGS)为靶标的快速、简单、特异和灵敏的棕榈疫霉菌的检测方法。以IGS基因为靶序列,利用环介导等温核酸扩增技术,设计了多组LAMP引物,同时建立并优化了LAMP反应体系与条件,最终筛选出1组扩增反应结果较好的LAMP引物,采用该组引物进行特异性、灵敏度和实际应用的验证。在扩增前加入染料羟基萘酚蓝(HNB)作为反应指示剂,根据HNB的颜色变化判定反应结果。【结果】整个检测过程在等温64℃条件下仅需80 min即可通过肉眼直接目测试验结果。在特异性试验中,通过HNB显色只有在棕榈疫霉菌株中能观察到天蓝色的阳性反应,而在其他疫霉、腐霉和真菌的供试菌株仍为紫色的阴性反应;在灵敏度试验中,PpIGS-LAMP技术检测灵敏度达到10fg.μL^(-1)目标菌纯DNA;在实际应用中,PpIGS-LAMP技术能够快速检测出采自田间的木薯根部土壤中目标菌和人工接种发病木薯组织样品的目标菌。【结论】本研究在国内外首次采用环介导等温扩增技术检测棕榈疫霉,建立了1种快速、高灵敏度、高特异性、可视化的棕榈疫霉的LAMP检测方法。建立的棕榈疫霉菌的LAMP检测方法在80 min内可完成待检样品的检测过程,显著缩短检测时间,降低基层部门的检测成本,为棕榈疫霉引起疫病的检疫和所致病害的快速诊断提供了新的检测技术。 展开更多
关键词 棕榈疫霉 环介导等温扩增 PpIGS 羟基萘酚蓝
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环介导等温扩增技术快速检测HPV18方法的建立 被引量:2
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作者 苏华 陈琛 +1 位作者 马先 许玉环 《临床和实验医学杂志》 2018年第10期1034-1037,共4页
目的应用环介导等温扩增技术(LAMP)对人乳头瘤病毒18(HPV18)进行基因检测,建立一种快速、可视的HPV18核酸检测方法。方法针对HPV18病毒特异性E6区设计LAMP检测引物,通过调整反应物浓度建立LAMP反应体系,用羟基萘酚蓝(HNB)染料对产物进... 目的应用环介导等温扩增技术(LAMP)对人乳头瘤病毒18(HPV18)进行基因检测,建立一种快速、可视的HPV18核酸检测方法。方法针对HPV18病毒特异性E6区设计LAMP检测引物,通过调整反应物浓度建立LAMP反应体系,用羟基萘酚蓝(HNB)染料对产物进行可视化判定。通过检测其他不同基因型别的病毒评估引物特异性,检测倍比稀释的临床标本确定其灵敏度,通过LAMP法检测临床标本验证其与PCR法的一致性。结果利用LAMP方法检测到HPV18病毒E6引物的特异性好,恒温65℃条件下反应60 min即可较好完成检测。LAMP特异性好,灵敏度高,灵敏度为2.5×10~3拷贝/ml。LAMP可视化结果判定与PCR凝胶电泳结果相当,二者有较好的一致性(P>0.05)。结论建立了HPV18病毒的LAMP快速、可视化检测方法,该法操作简便快捷,具有很好的开发应用前景。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒18 环介导等温扩增法 羟基萘酚蓝
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两种贵州地方鸡线粒体DNA控制区全序列分析 被引量:2
8
作者 王文涛 陈彬 傅筑荫 《湖北农业科学》 北大核心 2011年第15期3114-3115,3119,共3页
采用PCR和直接测序的方法测定兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列,分析比较两者mtDNA D-loop序列3个区的变异。结果表明,兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列长分别为1 231和1 230 bp,其中兴义矮脚鸡mtDNA控制... 采用PCR和直接测序的方法测定兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列,分析比较两者mtDNA D-loop序列3个区的变异。结果表明,兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列长分别为1 231和1 230 bp,其中兴义矮脚鸡mtDNA控制区的碱基摩尔分数分别为A 26.92%、T33.41%、G 13.39%、C 26.29%,长顺绿壳蛋鸡的分别是A 27.13%、T 33.58%、G 13.20%、C 26.09%。t检验显示两种贵州地方鸡种间线粒体DNA控制区碱基A与C的含量差异显著,说明A与C之间的颠换较多。兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡的遗传距离是0.038 6,根据分子钟计算,二者大约在193万年前分歧进化。 展开更多
关键词 线粒体DNA控制区 兴义矮脚鸡 长顺绿壳蛋鸡 遗传变异
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肠出血性大肠杆菌O157:H7的快速可视化检测 被引量:8
9
作者 吕恒 张锦海 +3 位作者 顾海涛 王平 王长军 王玉邦 《东南国防医药》 2013年第4期321-324,共4页
目的应用环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术和羟基萘酚蓝(Hydroxynaphthol blue,HNB)指示剂建立肠出血性大肠杆菌(EHEC)O157∶H7快速可视化检测方法。方法针对EHEC O157∶H7脂多糖编码基因rfbE保守区设... 目的应用环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术和羟基萘酚蓝(Hydroxynaphthol blue,HNB)指示剂建立肠出血性大肠杆菌(EHEC)O157∶H7快速可视化检测方法。方法针对EHEC O157∶H7脂多糖编码基因rfbE保守区设计LAMP引物及环引物,反应体系加入染料HNB作为LAMP扩增的指示剂,结合LAMP浊度仪优化扩增条件,根据HNB的颜色变化进行结果判定,并评价检测方法的特异性和灵敏度。结果本方法最低检出限约为100拷贝/反应管,高于普通PCR;检测特异性高,仅EHEC O157∶H7反应管HNB颜色由紫罗兰变成天蓝色,而肠产毒性大肠杆菌(ETEC)、肠致病性大肠杆菌(EPEC)、肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)、肠聚集性大肠杆菌(EAEC)、宋内志贺菌、福氏志贺菌均不发生变色反应;体系的扩增效率高于普通PCR,40 min内出结果。结论建立的基于颜色判定的EHEC O157∶H7 LAMP检测方法具有特异、灵敏、设备要求简单等特点,适用于EHEC O157∶H7现场快速检测。 展开更多
关键词 肠出血性大肠杆菌O157∶H7 可视化检测 环介导等温扩增 羟基萘酚蓝
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Chemical mixing by turbulent convection in the overshooting region below the convective envelope of RGB stars
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作者 Xiang-Jun Lai Yan Li 《Research in Astronomy and Astrophysics》 SCIE CAS CSCD 2011年第11期1351-1370,共20页
Based on the turbulent convection model (TCM), we investigate chemical mixing in the bottom overshooting region of the convective envelope of intermediatemass stars, focusing on its influence on the formation and ex... Based on the turbulent convection model (TCM), we investigate chemical mixing in the bottom overshooting region of the convective envelope of intermediatemass stars, focusing on its influence on the formation and extension of blue loops in the Hertzsprung-Russell (HR) diagram. A diffusive mixing model is adopted during the Red Giant Branch (RGB) phase. The properties of the blue loop are changed by modification of the element profiles above the H-burning shell, which results from the incomplete mixing in the bottom overshooting region when the stellar model evolves up along the RGB. Such modification of the element profiles will lead to an increase of opacity in the region just above the H-burning shell and a decrease of opacity in the outer homogeneous convection zone, which will result in a quick decrease of the H-shell nuclear luminosity LH when the stellar model evolves from the RGB tip to its bottom and, finally, a much weaker and smaller convection zone will be obtained in the stellar envelope. This helps to form a longer blue loop. The extension of the blue loop is very sensitive to the parameters (Cx and αTCM) of the diffusive mixing model and of the TCM. The results mainly show that: 1) comparing the results of the classical model with the mixing-length theory, the lengths of the obtained blue loops with different combinations of the values of Cx and αTCM are all increased and the length of the blue loop increases with the values of parameters Cx and αTCM; 2) the diffusive mixing model can significantly extend the time of stellar models lingering on the blue side of the HR diagram, even though the length of the blue loop for the 7M⊙ star has a less prominent difference between the classical and diffusive mixing model; 3) both the observations referring to the location of the Cepheid instability strip and the number ratio NB/NR of blue to red evolved stars in the Galactic open clusters can confine the two parameters in a range of 0.5 ≤ αLTCM ≤ 0.9 and 10-5 ≤ Cx ≤ 10-4 for the model of 5M⊙. However, for the case of the 7M⊙ star, there seems to be no such definite range to even only account for the observed number ratio NB/NR. In any case, our results based on the diffusive mixing model are on the whole in accordance with not only other theoretical ones but also the observations. 展开更多
关键词 stars convection-star interiors-star HR diagram-blue loops-Cepheids-Galactic open clusters
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百宜黑鸡与长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列分析 被引量:1
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作者 王文涛 阳光远 陈彬 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第5期158-160,共3页
采用PCR和直接测序的方法测定百宜黑鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列,并分析mtDNA D-loop序列3个区的变异。结果表明,百宜黑鸡和长顺绿壳蛋鸡mtDNA控制区全序列长度分别为1 231 bp、1 230 bp,2种贵州地方鸡之间,mtDNA D-loop序... 采用PCR和直接测序的方法测定百宜黑鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列,并分析mtDNA D-loop序列3个区的变异。结果表明,百宜黑鸡和长顺绿壳蛋鸡mtDNA控制区全序列长度分别为1 231 bp、1 230 bp,2种贵州地方鸡之间,mtDNA D-loop序列Ⅰ区序列变异率为4.43%,变异速率最快,其他两区的变异率分别为:Ⅱ区0.64%,Ⅲ区1.56%。百宜黑鸡mtDNA控制区的碱基含量分别为A 27.10%、T 33.63%、G 13.12%、C 26.16%,长顺绿壳蛋鸡的碱基含量分别是A 27.13%、T 33.58%、G 13.20%、C 26.09%。百宜黑鸡和长顺绿壳蛋鸡的遗传距离是0.036 2,根据分子钟计算,二者大约在181万a前分歧进化。 展开更多
关键词 线粒体DNA控制区 百宜黑鸡 长顺绿壳蛋鸡 遗传变异
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PMA-LAMP法可视化检测乳中沙门氏菌 被引量:5
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作者 王冠蕾 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2020年第4期51-54,64,共5页
建立一种荧光染料叠氮溴化丙锭(PMA)与环介导等温扩增(LAMP)相结合的技术,同时利用羟基萘酚蓝(HNB)染料对婴儿配方奶粉中沙门氏菌活菌进行快速可视化检测。以沙门氏菌siiA基因为靶点,设计特异性引物,利用PMA抑制死菌DNA的扩增反应,反应... 建立一种荧光染料叠氮溴化丙锭(PMA)与环介导等温扩增(LAMP)相结合的技术,同时利用羟基萘酚蓝(HNB)染料对婴儿配方奶粉中沙门氏菌活菌进行快速可视化检测。以沙门氏菌siiA基因为靶点,设计特异性引物,利用PMA抑制死菌DNA的扩增反应,反应前向体系中加入HNB染料,通过颜色变化对目标菌进行快速检测。结果表明,PMA的最佳处理浓度为3μg/mL,体系中HNB的最优浓度为150μmol/L,所构建的PMA-LAMP-HNB方法对沙门氏菌纯培养物的检测灵敏度为4.6×10^1CFU/mL,对人工污染婴儿配方奶粉中该菌的检测灵敏度为6.3×10^1CFU/g,是传统PCR方法的100倍,且总检测时间不超过1 h 30 min。 展开更多
关键词 沙门氏菌 叠氮溴化丙锭 环介导等温扩增 羟基萘酚蓝 婴儿配方奶粉
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基于可视化环介导等温扩增技术快速检测金黄色葡萄球菌 被引量:19
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作者 郭建平 万佳佳 +4 位作者 陆兆新 吕凤霞 张充 赵海珍 别小妹 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第20期325-331,共7页
应用环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)建立基于颜色判定的快速、灵敏的金黄色葡萄球菌检测方法.根据金黄色葡萄球菌特异性靶基因SAR0395设计LAMP引物,建立可视化LAMP检测方法.优化的反应体系为:1.6μmo... 应用环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)建立基于颜色判定的快速、灵敏的金黄色葡萄球菌检测方法.根据金黄色葡萄球菌特异性靶基因SAR0395设计LAMP引物,建立可视化LAMP检测方法.优化的反应体系为:1.6μmol/L内引物(FIP和BIP),0.2μmol/L外引物(F3和B3),4.0 mmol/L MgSO4,1.0 mmol/L dNTPs,0.4 U/μL Bst 2.0 WarmStartTMDNA聚合酶,120μmol/L羟基萘酚蓝,扩增温度60℃,扩增时间60 min.在可视化LAMP体系中添加两条环引物(LF和LB)反应时间可缩短至20 min.该可视化LAMP反应60 min,其基因组灵敏度可以达到0.0103 fg/μL,菌落灵敏度可以达到1.9 CFU/mL;利用46株金黄色葡萄球菌和24株非金黄色葡萄球菌证实该可视化LAMP具有良好的特异性和可靠性.本研究中建立的可视化LAMP可为金黄色葡萄球菌的快速检测提供一种新的技术. 展开更多
关键词 可视化 环介导等温扩增技术 检测 金黄色葡萄球菌 羟基萘酚蓝
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叠氮溴化丙锭-羟基萘酚蓝-环介导等温扩增法检测畜禽肉中单核细胞李斯特菌 被引量:5
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作者 戴小芳 陈琼 +3 位作者 董华夏 向春燕 虞伟明 郦娟 《肉类研究》 北大核心 2020年第5期48-52,共5页
将叠氮溴化丙锭(propidium monoazide,PMA)、羟基萘酚蓝(hydroxynaphthol blue,HNB)与环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术相结合,建立一种可视化PMA-HNB-LAMP方法快速检测畜禽肉中单核细胞李斯特菌(Liste... 将叠氮溴化丙锭(propidium monoazide,PMA)、羟基萘酚蓝(hydroxynaphthol blue,HNB)与环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术相结合,建立一种可视化PMA-HNB-LAMP方法快速检测畜禽肉中单核细胞李斯特菌(Listeria monocytogenes)。结果表明,当PMA终质量浓度为5.0μg/mL、孵育和曝光时间均为15 min时,可有效抑制10~5 CFU/m L的单核细胞李斯特菌死菌DNA的聚合酶链式反应扩增,而对活菌DNA的扩增不具有抑制作用。LAMP反应体系中HNB终浓度为210μmol/L时,检测显色结果肉眼可见。该方法的纯菌液灵敏度为2.4×10~2 CFU/m L,人工污染肉制品的检出限为2.3×10~4 CFU/m L。分别采用国标法、PMA-HNB-LAMP法和HNB-LAMP法检测20份市售畜禽肉样,3种方法的单核细胞李斯特菌检出率分别为5%、10%和20%。PMA-HNB-LAMP法在一定程度上可解决LAMP法的假阳性问题,并且具有操作简单、可视性强的优点。 展开更多
关键词 单核细胞李斯特菌 叠氮溴化丙锭 羟基萘酚蓝 环介导等温扩增 畜禽肉
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大豆茎褐腐病菌环介导等温扩增检测技术的建立 被引量:2
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作者 吴旭东 陆辰晨 +4 位作者 沈浩 吴翠萍 张海峰 王源超 郑小波 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期568-574,共7页
[目的]应用环介导等温核酸扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)建立基于颜色判定的简便、快速和灵敏的大豆茎褐腐病菌[Phialophora gregata f.sp.sojae(PGS)]检测方法。[方法]利用LAMP技术,以ITS为靶序列,设计了4条... [目的]应用环介导等温核酸扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)建立基于颜色判定的简便、快速和灵敏的大豆茎褐腐病菌[Phialophora gregata f.sp.sojae(PGS)]检测方法。[方法]利用LAMP技术,以ITS为靶序列,设计了4条特异性的LAMP引物和2条环引物,在此基础上建立了检测大豆茎褐腐病菌的LAMP体系。[结果]整个检测过程仅需1 h就可通过肉眼直接目测试验结果。在等温条件下(64℃)进行核酸扩增反应1 h,在扩增前加入染料HNB(羟基萘酚蓝)作为反应指示剂,根据HNB的颜色变化可以判断PGS的存在与否。特异性试验中,大豆茎褐腐病菌菌株DNA扩增后HNB呈天蓝色的阳性反应,而在其他大豆常见病害的供试菌株中均呈紫色的阴性反应。在灵敏度试验中,ITS-LAMP技术最低检测限为10 pg·μL-1,对于进口大豆残体样本中PGS的检测灵敏度为每10 g大豆植株残体50个孢子。[结论]该方法的建立为检疫性病害大豆茎褐腐病菌的检测提供了新的技术平台,符合我国口岸对大豆茎褐腐病菌快速检测的迫切需要。 展开更多
关键词 大豆茎褐腐病菌 环介导等温扩增 ITS 羟基萘酚蓝(HNB)
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中等质量星演化中的蓝拐和CNO双循环
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作者 许华蓥 《云南天文台台刊》 CSCD 北大核心 2002年第1期78-79,共2页
天体物理学家第一次成功地计算中等质量恒星演化到中心氦燃烧阶段 ,就发现蓝拐现象 ,它是赫罗图上形成黄巨星分支的重要理论条件。但由于蓝拐对很多输入物理 ,如对流的混合长理论 ,对流超射 ,初始元素丰度等都十分敏感稍稍不同就会抑制... 天体物理学家第一次成功地计算中等质量恒星演化到中心氦燃烧阶段 ,就发现蓝拐现象 ,它是赫罗图上形成黄巨星分支的重要理论条件。但由于蓝拐对很多输入物理 ,如对流的混合长理论 ,对流超射 ,初始元素丰度等都十分敏感稍稍不同就会抑制或触发蓝拐 ,因此蓝拐的激发机制一直没有满意的理论。本文回顾了蓝拐的研究历史 ,并对中等质量恒星在演化过程中的蓝拐的激发机制问题进行理论分析 ,给出一个蓝拐整个过程的物理图象。本文探寻了氢燃烧核反应的CNO循环过程对蓝拐的影响 ,用两种不同的方法处理CNO循环 ,在第一种模型中保持14N丰度不变 ;而在第二种模型中计算了16 O向14N的转化过程。结果模型一中出现了蓝拐而模型二中没有蓝拐。在对两种模型的比较中 ,我们进一步研究蓝拐的触发机制。我们注意到蓝拐的一个重要特征 ,恒星内部的核反应产能增加决定了蓝拐光度的上升 ;同时对于一个内部产能恒定的恒星 ,恒星外壳的膨胀和收缩将决定恒星表面的有效温度。根据这点 ,对恒星内部和外壳的各种物理量进行了研究 ,并着重注意了恒星外壳对内部产能变化的反应。我们发现RGB阶段产生的氢丰度不连续区的跳变是恒星光度上升的一个关键因素 ,当氢壳层的外边缘接触到氢跳变的时候 ,突然增加的氢丰度使氢燃烧壳层变宽 。 展开更多
关键词 蓝拐 中等质量星 赫罗图 CNO循环 氢轮廓
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非糜烂性反流病在蓝激光放大内镜下的形态学改变 被引量:2
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作者 孙旭彤 姜顺顺 +1 位作者 续婷婷 赵红 《临床医学进展》 2020年第6期1085-1090,共6页
目的:探讨非糜烂性反流病(Non-Erosive Reflux Disease, NERD)在蓝激光放大内镜下的黏膜形态学改变。方法:选取53例非糜烂性反流病患者作为NERD组,招募20名志愿者作为健康对照组,两组均进行蓝激光放大内镜检查,分别在白光和蓝激光成像亮... 目的:探讨非糜烂性反流病(Non-Erosive Reflux Disease, NERD)在蓝激光放大内镜下的黏膜形态学改变。方法:选取53例非糜烂性反流病患者作为NERD组,招募20名志愿者作为健康对照组,两组均进行蓝激光放大内镜检查,分别在白光和蓝激光成像亮度(Blue Laser Imaging Bright, BLI-bright)模式下观察食管下段黏膜,再以蓝激光成像加放大(Blue laser imaging + Magnification Endoscopy, BLI + ME)模式观察食管乳头内毛细血管襻(Intrapapillary capillary loop, ICPL)形态并分型。结果:BLI + ME模式下健康对照组食管IPCL呈茶色规律排列的卷发状、小螺旋状。84.9%的NERD组表现为IPCL形态扩张和(或)延长,但仍排列规律,与健康对照组比较差异有显著性(P 【0. 05)。结论:NERD在蓝激光放大内镜下可见黏膜微结构改变,表现为IPCL延长和(或)扩张。 展开更多
关键词 非糜烂性反流病 蓝激光放大内镜 食管乳头内毛细血管襻
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寨卡病毒可视化RT-LAMP检测方法的建立与应用 被引量:6
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作者 艾乐乐 丁晨曦 +5 位作者 龚秀芳 朱长强 张琪 韩一芳 谭伟龙 王长军 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 北大核心 2017年第2期103-108,共6页
本研究建立了一种简单、快速、准确的寨卡病毒可视化逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)检测方法。在线设计3套LAMP引物,利用实时浊度仪筛选最佳引物,加入羟基萘酚蓝,评估可视化RT-LAMP检测方法的灵敏度和特异性。建立的可视化RT-LAMP方法... 本研究建立了一种简单、快速、准确的寨卡病毒可视化逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)检测方法。在线设计3套LAMP引物,利用实时浊度仪筛选最佳引物,加入羟基萘酚蓝,评估可视化RT-LAMP检测方法的灵敏度和特异性。建立的可视化RT-LAMP方法可检测的最低浓度为101copies/μL,高于普通PCR和荧光定量PCR 1~2个数量级;同时,该方法不与其他虫媒病毒产生交叉反应。该方法可为虫媒监测和临床诊断提供实验依据。 展开更多
关键词 寨卡病毒 逆转录环介导等温扩增 可视化检测 羟基萘酚蓝
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畜禽肉中金黄色葡萄球菌活菌可视化LAMP检测方法的研究 被引量:4
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作者 陈琼 董华夏 +3 位作者 戴小芳 刘萍 晏涛 郦娟 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2020年第20期235-240,245,共7页
目的:建立一种设备要求简单、结果可视化的用于定性检测畜禽肉中金黄色葡萄球菌活菌的快速检测方法。方法:通过对羟基萘酚蓝(hydroxynaphthol blue,HNB)浓度、叠氮溴化丙啶(propidium monoazide,PMA)浓度等的优化,结合环介导恒温扩增技... 目的:建立一种设备要求简单、结果可视化的用于定性检测畜禽肉中金黄色葡萄球菌活菌的快速检测方法。方法:通过对羟基萘酚蓝(hydroxynaphthol blue,HNB)浓度、叠氮溴化丙啶(propidium monoazide,PMA)浓度等的优化,结合环介导恒温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),建立一种PMA-HNB-LAMP联用的可视化的用于快速检测畜禽肉中金黄色葡萄球菌活菌的方法,对其特异性、灵敏度进行测试,并用于人工污染样品和实际样品的检测。结果:本研究成功建立了LAMP扩增体系,并通过添加210μmol/L HNB到LAMP扩增体系中,得到了差异明显的阴阳性结果。建立的HNB-LAMP法特异性强,其纯菌液灵敏度为104 CFU/mL,样品基质灵敏度为105 CFU/mL。本研究中用于处理样品的PMA浓度为10μg/mL,处理条件为室温下避光孵育5 min,曝光15 min。在检测人工污染的样品时,PMA-HNB-LAMP法和传统微生物法检测结果一致。结论:本研究成功建立了可快速检测畜禽肉中金黄色葡萄球菌活菌的可视化PMA-HNB-LAMP法。 展开更多
关键词 环介导恒温扩增技术 叠氮溴化丙啶 羟基萘酚蓝 金黄色葡萄球菌
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单增李斯特菌反转录环介导等温扩增检测方法的建立 被引量:10
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作者 徐匆 罗华建 +5 位作者 黄皓 梁卫驱 胡珊 李艳芳 胡楚维 罗鸿斌 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2020年第6期297-302,共6页
本研究针对单增李斯特菌的快速检测方法进行开发,首先根据单增李斯特菌hly A基因序列保守区设计2对引物,在同一体系中对单增李斯特菌的RNA进行反转录及环介导等温扩增,同时使用羟基萘酚蓝(终浓度200μM)作为反转录环介导等温扩增产物的... 本研究针对单增李斯特菌的快速检测方法进行开发,首先根据单增李斯特菌hly A基因序列保守区设计2对引物,在同一体系中对单增李斯特菌的RNA进行反转录及环介导等温扩增,同时使用羟基萘酚蓝(终浓度200μM)作为反转录环介导等温扩增产物的指示剂,在不开盖进行凝胶电泳检测的情况下,可直接根据体系颜色变化判读结果,能够在20 h内(包括增菌时间)检测出样本中是否存在单增李斯特菌的RNA。本研究建立的RT-LAMP-HNB检测方法对单增李斯特菌RNA的检出限为5.8×10^-3μg/m L,起始接种浓度检出限为10 CFU/10 mL,灵敏度是RT-PCR的10倍,且能够检测出是牛奶中否存在的单增李斯特活菌,具有实际应用价值。本研究开发的检测方法具有快速、准确、便捷、灵敏度高等特点,适用于在基层或不便利地区推广使用。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 反转录-环介导等温扩增(RT-LAMP) 羟基萘酚蓝(HNB) hlyA基因 快速检测
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