藏北草原高原鼠兔密度调查方法探讨

2006年对藏北高寒草原牧场的高原鼠兔种群密度进行了抽样堵洞调查,以夹捕法调查作为补充,同时通过捕尽法确定洞口系数约为0.11,在此基础上以有效洞口数推算调查点高原鼠兔绝对密度约为53.72只/hm2。通过相关分析,建立高原鼠兔种群-洞口密度增长模型,可根据洞口密度估算高原鼠兔种群密度,为西藏草原鼠类防治提供参考。

一种灵活的精度可控的可搜索对称加密方案

中查找到关键词记录的这3种搜索情况.同时,系统也结合3种搜索设计了一种模糊增强搜索进一步增强系统的实用性.FASSE方案的具体实现语言是Java编程开发语言,并且最终实验得出FASSE在https://eprint.iacr.org/complete/的论文数据集中平均搜索完每一篇论文的时间为114.26ms.

采用BWT的多核并行的子串匹配算法

针对P-BWT精确匹配算法存在只支持短串查询并且只能工作在单处理器上的问题,提出了一个多核并行的支持任意查询长度的精确查询算法.改进了P-BWT索引上的查询过程,当一个查询串跨越了多个数据分片时,首先在其匹配的最后一个分片上查询,然后依次在前面分片上进行验证.进一步提出了一个多核并行查询算法来减少搜索和验证过程的迭代次数.实验结果表明,所述算法可以高效并行地完成子串匹配任务.

秃病蚤蒙冀亚种与长爪沙鼠密度的状态空间模型

给出了一个描述秃病蚤蒙冀亚种Nosopsylluslaevicepskuzenkovi与长爪沙鼠Merionesunguiculatus密度的状态空间模型 ,模型为xt+1 =- 0 336xt+0 0 5 7yt +0 10 7zt,yt+1 =0 5 86xt - 0 36 9yt - 0 2 74zt,zt+1 =0 189xt +0 2 47yt - 0 30 9zt,其中xt,yt 和zt 分别为t月份的沙鼠密度 ,巢秃病蚤和体秃病蚤指数。结果表明 ,模型能够较好地描述野外秃病蚤蒙冀亚种与长爪沙鼠间的关系 。

基于BWC的XML文本数据索引技术

在XML文档中,相当大的部分是由文本数据组成的,针对XML文本数据占用空间较大、对压缩文本数据有效搜索效率较低的难点,基于BWC提出了压缩XML文本数据索引的技术,通过构造全文本数据模型,并利用整体压缩自索引存储XML文档的文本数据,实验结果表明,该技术不仅有效支持XPath查询语言文本搜索,而且内存消耗相对较小,实现了中小规模数据的内存搜索.

黄鼠洞干蚤和宿主密度的年间动态关系

根据内蒙古自治区正镶白旗乌宁巴图苏木1981～1993年达乌尔黄鼠Citellusdauricus密度和洞干蚤指数监测资料进行分析，得到如下结果。共检桐干蚤9种，其中方形黄鼠蚤蒙古亚种Citellophilustesquorummongolicus（66．0％）为优势蚤种，光亮额蚤Frontopsyllaluculenta（23．6％）为次优势蚤种，阿巴盖新蚤Neopsyllaabagaitui和二齿新蚤N．bidentatiformis为常见种，余为少见种。鼠密度与洞干蚤指数关系显著（P＜0．03），关系为洞干蚤指数=0．2491＋0．0596鼠密度。洞干蚤指数和染蚤率关系不显著（0．05＜P＜0．10）。方形黄鼠蚤数量的高低显著地影响洞干蚤的多样性和均匀性。洞干蚤和体蚤指数的关系是显著的（P＜0．05），关系为洞干蚤指数＝0．2709＋0．0504体蚤指数。洞干蚤和巢蚤指数的关系是显著的（P＜0.07），关系为洞干蚤指数=0.27652＋0．00348巢蚤指数。三种蚤指数之间有如下近似关系：巢蚤指数：体蚤指数：洞干蚤指数=100：10：1。

基于BWC的XML文本数据索引技术研究

在XML文档中,相当大的部分是由文本数据组成的,针对XML文本数据占用空间较大、对压缩文本数据有效搜索效率较低的难点,基于BWC提出了压缩XML文本数据索引的技术,通过构造全文本数据模型,并利用整体压缩自索引存储XML文档的文本数据,实验结果表明,该技术不仅有效支持XPath查询语言文本搜索,而且内存消耗相对较小,实现了中小规模数据的内存搜索.

序列比对算法中的BW变换索引技术研究及其改进

面向大规模长序列的序列比对问题是生物信息学中最重要的基础问题之一。针对序列比对算法的主流索引技术BW变换(BWT)进行研究,提出一种新的二阶BWT索引方法。与传统BWT方法的逐位索引查找不同,改进后的BWT方法按双位索引查找。实验结果表明,改进后的方法减少了序列比对算法中的循环遍历和计算次数,降低了序列比对算法中索引方法的复杂度,提高了查找效率,尤其适合长序列和大规模序列的索引和查找。

拉萨半干旱河谷新植林鼠(兔)害调查及防治试验

2009—2010年对拉萨半干旱河谷地带新植林采用堵洞与夹日法进行了鼠(兔)种类和密度调查,结果表明鼠(兔)种类有黑唇鼠兔Ochotona curzoniae Hodgson和白尾松田鼠Pitymys leucurusBlyth,在新植林地洞口密度为905.07洞/hm2,有效洞口率是31.66%,有效洞口系数为0.18,鼠(兔)密度为50.64只/hm2。饲养和实地监测发现,两种鼠(兔)对新植林地的金丝垂柳、白榆、藏青杨、北京杨4种树的危害株率均在25%以上。选用P-1拒避剂、0.2%莪术醇抗生育剂和克鼠星1号杀鼠剂单独、交叉施药进行防治实验,结果表明单独施用克鼠星杀鼠剂的效果是暂时的,单独施用拒避剂和莪术醇抗生育剂的效果是缓慢的,同时混合施用3种药剂18个月后捕鼠(免)率、有效洞数、植株受害率分别下降了90%,81.23%,85%,效果较持久。

基于码书索引变换的高通量DNA序列数据压缩算法

提出一种高通量DNA序列数据的压缩算法.该算法先采用码书索引变换模型,将传统码书索引值的表示方法变换成由四个标准碱基字符替代的四进制数值方式,并采用一种界定替换串与非替换串的简明编码方法,接着通过信息熵的大小来决定是否进行块排序压缩变换(BWT),最后进行前移编码变换和Huffman熵编码.在多种测序数据集上的实验结果表明,CITD在大多数情况下可以获得比本文所对比的高通量DNA专用压缩方法更优的压缩性能.

一种带有长度和位置约束的字符串索引方法

提出了一种基于BWT(Burrows-wheeler-transform)的字符串集合的索引方法,以解决带有匹配字符串长度和匹配子串位置约束的子串确切匹配查找问题.讨论了BWT和基于BWT索引进行确切子串查找的基本原理.分析了字符串集合、匹配字符串长度和匹配子串位置约束对原BWT索引的影响.重点解决了快速地从匹配后缀位置到字符串ID和匹配子串位置的计算问题.在3个真实的数据集上进行了比对实验,结果表明:所提出的基于BWT索引方法在没有增加原索引大小的情况下,大大提升了带有匹配字符串长度和匹配位置约束的确切子串的查找的性能,因此该算法更加适用于大规模的字符串集合的索引进行近似字符串匹配和连接.