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成人动脉和心脏cDNA文库的构建及新全长cDNAs的克隆 被引量:17
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作者 魏英杰 丁金凤 +8 位作者 赵勇 王新日 刘玉清 许有元 熊辉 周严 惠汝太 高润霖 强伯勤 《中国循环杂志》 CSCD 北大核心 1999年第6期369-371,共3页
目的 :构建成人动脉和心脏互补脱氧核糖核酸 (c DNA)文库 ,克隆多个新的全长互补脱氧核糖核酸 (c DNAs)。  方法 :应用成人动脉和心脏组织 ,采用 Stratagene的建库试剂盒构建 c DNA文库。将随机克隆 5 '端表达序列标签序列与 Gen ... 目的 :构建成人动脉和心脏互补脱氧核糖核酸 (c DNA)文库 ,克隆多个新的全长互补脱氧核糖核酸 (c DNAs)。  方法 :应用成人动脉和心脏组织 ,采用 Stratagene的建库试剂盒构建 c DNA文库。将随机克隆 5 '端表达序列标签序列与 Gen Bank/ EMBL/ DDBJ数据库进行同源性比较 ,新的全长 c DNAs采用步移法完成全序列测定获得。  结果 :所建动脉 c DNA文库包含 2 .4× 10 6个独立重组克隆 ,插入片段平均长度为 2 .0 kb;心脏 c DNA文库包含 1.0× 10 6个独立重组克隆 ,平均长度为 1.8kb。首批得到了 8条新的全长 c DNAs,已在 Gen Bank登记注册。  结论 :构建符合要求的 c DNA文库是克隆新的全长 c DNAs的一条快速有效的途径。 展开更多
关键词 动脉 心脏 基因文库 CDNA cdnas 克隆
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烟草质体分裂相关基因NtFtsZ cDNAs的克隆及功能分析 被引量:2
2
作者 王东 孔冬冬 +3 位作者 胡勇 鞠传丽 何奕昆 孙敬三 《自然科学进展》 北大核心 2002年第10期1042-1047,共6页
通过RT-PCR和cDNA末端快速扩增(RACE)方法从烟草中克隆了两个质体分裂相关基因NtFtsZ1-1和NtFtsZ1-2的cDNA,推导的氨基酸序列分析表明,两者均具有FtsZ蛋白的典型特征和GTP结合位点;N端氨基酸序列分析也表明,NtFtsZ1-1和NtFtsZ1-2都具有... 通过RT-PCR和cDNA末端快速扩增(RACE)方法从烟草中克隆了两个质体分裂相关基因NtFtsZ1-1和NtFtsZ1-2的cDNA,推导的氨基酸序列分析表明,两者均具有FtsZ蛋白的典型特征和GTP结合位点;N端氨基酸序列分析也表明,NtFtsZ1-1和NtFtsZ1-2都具有质体导肽特征,发现了在高等植物中至少存在两个具有质体导肽的FtsZ;基于氨基酸序列的分子谱系分析也支持这一结果,核酸杂交表明两者在植物的不同发育时期具有相似的表达诺,将这两个基因转入E.coli中表达,它们能影响宿主菌的正常分裂,初步验证了其功能,这些研究提示在高等植物中FtsZ可能具有更多样化的功能。 展开更多
关键词 质体分裂相关基因 NtFtsZ cdnas 烟草 FtsZ基因 质体导肽 原核表达 基因克隆
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斜带石斑鱼生长激素/催乳素家族基因cDNAs的分子克隆及其进化意义 被引量:5
3
作者 贾海波 周莉 +1 位作者 石耀华 桂建芳 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期242-248,共7页
从斜带石斑鱼垂体提取总RNA ,再取其 5 0ng合成SMARTcDNA。从所构建的垂体SMARTcDNA质粒文库中筛选到生长激素 /催乳素基因家族的 2个成员的全长cDNA片段 :生长激素 (GH )基因全长为 938bp ,编码 2 0 4个氨基酸 ;催乳素基因 (PRL)全长为... 从斜带石斑鱼垂体提取总RNA ,再取其 5 0ng合成SMARTcDNA。从所构建的垂体SMARTcDNA质粒文库中筛选到生长激素 /催乳素基因家族的 2个成员的全长cDNA片段 :生长激素 (GH )基因全长为 938bp ,编码 2 0 4个氨基酸 ;催乳素基因 (PRL)全长为 14 2 9bp ,编码 2 12个氨基酸。采用计算机软件Mega 2和CLUSTALW1 6 4b对 9种鱼的生长激素 /催乳素基因家族的 3个成员 (GH、PRL和生长催乳素SL)的氨基酸序列进行系统分析 ,构建NJ分支系统树 ,对于序列中的插入 /缺失位点则采用PairaiseDeletion ,10 0 0次自展(Bootstrap)分析计算各节点支持率。根据 3个基因的氨基酸序列构建的系统树表明 ,石斑鱼与金头鲷、金鲈和牙鲆聚成一类 ,虹鳟与大马哈鱼聚成一类 ,鲫鱼与鲶鱼聚成一类 ,鳗鲡成另外一类。根据石斑鱼全长cDNA推断的氨基酸序列比较表明 ,SL相对GH和PRL有较高的保守性。石斑鱼的GH、PRL和SL的氨基酸同源性在2 4 %~ 31% ,但其C -端的氨基酸同源性较高 ,尤其是C -端的 3个Cys是严格保守的。其中SL与GH的同源性 (30 8% )高于与PRL的同源性 (2 5 6 % ) ,GH和PRL的同源性最低 (2 4 1% )。 展开更多
关键词 斜带石斑鱼 生长激素/催乳素基因 SMART cDNA 垂体 同源性
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Cloning and Expression Analysis of Two Wheat cDNAs Encoding Cinnamoyl-CoA Reductase 被引量:4
4
作者 蔺占兵 马庆虎 麻密 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2001年第10期1043-1046,共4页
Cinnamoyl-CoA reductase (CCR) is responsible for the first committed reaction in monolignol biosynthesis, which diverts phenylpropanoid-derived metabolites into the biosynthesis of lignin. To gain a better understandi... Cinnamoyl-CoA reductase (CCR) is responsible for the first committed reaction in monolignol biosynthesis, which diverts phenylpropanoid-derived metabolites into the biosynthesis of lignin. To gain a better understanding of the lion biosynthesis in wheat development, two cDNAs encoding CCR were identified from wheat (Triticum aestivum L. cv. H4564). DNA sequence analyses indicated that the two cDNAs represent two classes of CCR. RT-PCR and Northern blot hybridization demonstrated that one of them, W-cr6, was expressed actively in stem and leaf tissue, the other one, W-cr19, was expressed in root and stem tissue. The results suggested that there are at least two genes encoded for CCR existing in wheat genome. 展开更多
关键词 Triticum aestivum cDNA cloning cinnamoyl-CoA reductase LIGNIN
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Selenoprotein W cDNAs From Five Species of Animals 被引量:4
5
作者 P. D. WHANGER S. C. VENDELAND +2 位作者 Q-P GU M. A. BEILSTEIN AND L. W. REAM(Department of Agricultural Chemistry, Oregon State University,Corvallis, Oregon 97331, USA) 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 1997年第2期190-197,共8页
The nucleotide sequences of the open reading frames of cDNAs for selenoprotein W from skeletal muscle of rat, mouse, sheep, rhesus monkey and human are reported. Theoretical translation of the coding sequences indicat... The nucleotide sequences of the open reading frames of cDNAs for selenoprotein W from skeletal muscle of rat, mouse, sheep, rhesus monkey and human are reported. Theoretical translation of the coding sequences indicated highly similar proteins of 88 (mouse and rat) or 87 (human, monkey and sheep) amino acids. In 73 of 88 positions the specified amino acids are identical for all five proteins. TGA encoding selenocysteine is the 13th codon of all the cDNAs. The rnouse, rat and sheep open reading frames terminate with TGA but the human and rhesus monkey coding regions terminate with TAA. The encoded amino acid sequences are identical for the rat and mouse proteins, and for the human and monkey proteins. The similarity of the cDNAs continues in the 3' noncoding regions through the putative selenocysteine insertion sequence (SEClS) elements which are required for correct interpretation of the selenocysteine codon. The region between the SECIS elements and the polyadenylation signals showed much lower similarity. The cloned rat gene for selenoprotein W is 5000 bases long,with the 663 bases of the cDNA in six exons. The transcription start site was identified by nuclease protection assay to be 16 bases upstream of the longest cDNA clone. A canonical TATA box occurs 150 bases upstream, but the assay did not indicate the presence of longer mRNAs 展开更多
关键词 CDNA RNA Selenoprotein W cdnas From Five Species of Animals Beilstein
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Molecular Cloning and Sequence Analyses of cDNAs Encoding Seven C-type Lectin-like Protein Subunits from Daboia russellii siamensis 被引量:1
6
作者 钟树荣 金扬 +2 位作者 李东升 王婉瑜 熊郁良 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期337-343,共7页
Total mRNA was extracted from a venom gland of snake Daboia russellii siamensis following the manufacturer's protocol of the PolyATtract System 1000 kit purchased from Promega Biotech. cDNAs encoding C-type lectins w... Total mRNA was extracted from a venom gland of snake Daboia russellii siamensis following the manufacturer's protocol of the PolyATtract System 1000 kit purchased from Promega Biotech. cDNAs encoding C-type lectins were amplified by RT-PCR and subcloned into a pMD18-T vector. Fourteen positive clones were selected for nucleotide sequencing and seven cDNAs encoding various snake venom C-type lectin-like protein precursors, designated as DRS-L1, DRS-L2, DRS-L3, DRS-L4 DRS-L5, DRS-L6 and DRS-L7, were obtained. Amino acid sequences of these proteins were deduced and each contains a carbohydrate recognition domain. Of all the deduced protein sequences, only DRS-L1 seemed to represent a closer sequence similarity to α subunits of other known snake venom C-type lectin-like proteins using the BLAST program. Homology comparison combined with analysis of cysteine position indicate that DRS-L1 and DRS-L2 are probably the light chain LC2 and LC1 of factor X activator from Daboia russellii siamensis venom, respectively. DRS-L3 and DRS-L4 might be the β subunits of higher molecular weight C-type lectin-like proteins while DRS-L5 and DRS-L6 might be β subunits of lower molecular weight C-type lectin-like proteins. DRS-L7 might be the β subunit of a platelet membrane glycoprotein Ib-binding protein similar to echicetin. 展开更多
关键词 Daboia russellii siamensis SV-CTTLs SV-CTLPs cDNA Sequence analysis
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Isolation and Preliminary Characterization of Differential Displayed cDNAs in Brassica juncea Exposed to Heavy Metal 被引量:3
7
作者 LANGMing-Lin ZHANGYu-Xiu +2 位作者 ZHOUJie WANGRi-Lin CHAITuan-Yao 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第9期1007-1009,共3页
Heavy metal contamination of soil has become a major environmental concern worldwide over the past several decades,the exploitation and application of heavy metal hyperaccumulating plants will defend the safety of foo... Heavy metal contamination of soil has become a major environmental concern worldwide over the past several decades,the exploitation and application of heavy metal hyperaccumulating plants will defend the safety of food and environment on which human life relied,whereas using natural hyperaccumulators is insufficient,due 展开更多
关键词 芸苔 重金属 基因 差异显示 污染 土壤 CDNA
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Rodent epididymal cDNAs identified by sequence homology to human and canine counterparts 被引量:4
8
作者 Katrin Kppler-Hanno Christiane Kirchhoff 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2003年第4期277-286,共10页
<abstract>Aim: Identification of the rodent counterparts of human and canine epididymal cDNAs HE3, HE4 and Ce8/Ly6G5C by sequence homology and analysis of their expression patterns and regulation level in the ra... <abstract>Aim: Identification of the rodent counterparts of human and canine epididymal cDNAs HE3, HE4 and Ce8/Ly6G5C by sequence homology and analysis of their expression patterns and regulation level in the rat. Methods: 'Electronic screening' of Expressed Sequence Tag (EST) and genomic databases, followed by RT-PCR and Northern blot analysis. Results: Rodent ESTs and genomic sequences homologous to HE3, HE4 and Ce8/Ly6G5C were identified in the public databases and the 'full-length' rat cDNAs cloned. To emphasise their homology to the human and canine genes, they were named Me3/Re3, Me4/Re4 and Re8 for mouse and rat counterparts, respectively. mRNA expression patterns were analysed in rats, including rat HEl and HE5/CD52 counterparts as controls. Re3 and Re8 mRNAs were only found in the rat epididymis, while Re4 showed a broader tissue distribution. Within the epididymis, Re3 and Re4 mRNAs were detected in all regions; Re8, on the other hand, was restricted to the caput. During postnatal development, Re3 and control mRNAs were found from the earliest stages investigated, while Re8 mRNA was observed only from day 24 postnatum, corresponding to the onset of spermatogenesis in the prepubertal testis. Castration and testosterone supplementation of adult male rats suggested that none of the cloned mRNAs was directly androgen-regulated. Efferent duct ligation, however, showed that Re8 mRNA levels depended on testicular factors other than androgens. Conclusion: The novel rodent cDNAs can now be used to monitor epididymal gene expression more closely and to set up various regulatory and functional studies. 展开更多
关键词 EPIDIDYMIS cDNA homology cloning HE3- HE4- and Ce8-homologous proteins
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表达基因鉴定的一种新策略:筛选poly(dA/dT)^-cDNAs
9
作者 陈蓉芳 张天宝 印木泉 《国外医学(分子生物学分册)》 CSCD 2001年第5期318-320,共3页
低丰度表达基因及组织细胞等特异基因的鉴定是人类表达基因鉴定的瓶颈 ,Wang等认为cDNA中的长序列poly(dA/dT)是限制低丰度表达基因等鉴定效率的主要原因。为此提出了一种新策略 ,即用 3′端锚定oligo(dT) 11代替常规oligo(dT)引物逆转... 低丰度表达基因及组织细胞等特异基因的鉴定是人类表达基因鉴定的瓶颈 ,Wang等认为cDNA中的长序列poly(dA/dT)是限制低丰度表达基因等鉴定效率的主要原因。为此提出了一种新策略 ,即用 3′端锚定oligo(dT) 11代替常规oligo(dT)引物逆转录合成cDNA ,并将 3′端携带 11个 (dA/dT)s序列的cDNA称之为poly(dA/dT) -cDNA。筛选poly(dA/dT) 展开更多
关键词 表达基因鉴定 差减法 标准化法 人类基因组 筛选poly(dA/dT)cdnas
原文传递
猪瘟疫苗的研究现状与发展趋势
10
作者 贾华强 《畜牧兽医科技信息》 2024年第1期45-48,共4页
猪瘟是由猪瘟病毒感染引起的一种急性、热性、高度接触性传染病,主要特征是发病急、高热稽留和细小血管壁变性,从而引起泛发性小点状出血、梗死和坏死。该病传染性强,病死率高,对养猪业危害巨大。OIE将其列为法定报告疾病,我国将其列为... 猪瘟是由猪瘟病毒感染引起的一种急性、热性、高度接触性传染病,主要特征是发病急、高热稽留和细小血管壁变性,从而引起泛发性小点状出血、梗死和坏死。该病传染性强,病死率高,对养猪业危害巨大。OIE将其列为法定报告疾病,我国将其列为一类动物疫病。猪瘟病毒是其病原体,尽管猪瘟病毒各个毒株的毒力不同,但是它们都使养猪业产生了巨大损失,威胁着全世界的猪肉生产和国家人口的粮食安全。 展开更多
关键词 猪瘟疫苗 灭活疫苗 弱毒疫苗 亚单位疫苗 核酸疫苗 嵌合病毒活疫苗 合成肽疫苗 基因缺失疫苗 全长感染性cDNA标记疫苗 研究现状 发展趋势
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玉米大斑病菌cDNA文库的构建及转录因子StMR1互作蛋白的筛选 被引量:1
11
作者 王秋月 段鹏亮 +3 位作者 李海笑 刘宁 曹志艳 董金皋 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期281-289,共9页
【目的】筛选玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)转录因子的互作蛋白,解析黑色素调控转录因子StMR1调控玉米大斑病菌致病性的分子机制。为解析玉米大斑病菌侵染过程中转录因子的调控网络,阐明病菌的致病机理提供参考。【方法】收集玉... 【目的】筛选玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)转录因子的互作蛋白,解析黑色素调控转录因子StMR1调控玉米大斑病菌致病性的分子机制。为解析玉米大斑病菌侵染过程中转录因子的调控网络,阐明病菌的致病机理提供参考。【方法】收集玉米大斑病菌菌丝和孢子不同萌发阶段作为试验材料,采用Gateway方法构建玉米大斑病菌cDNA文库,使用同源重组的方法构建转录因子StMR1的诱饵载体,采用酵母双杂交技术筛选其互作蛋白并进行一对一验证。【结果】构建的玉米大斑病菌文库插入的平均片段长度大于1000 bp,初级文库及次级文库的库容量为1.2×107和1.04×107CFU,重组率为100%,可以用于酵母双杂交筛选。成功构建可以用于筛库的诱饵载体pGBKT7-StMR1,经初筛与复筛得到3个互作蛋白,一对一验证短链脱氢酶、糖基转移酶、富含亮氨酸重复序列蛋白均与转录因子StMR1存在互作。【结论】成功构建了丰富度高且质量好的玉米大斑病菌cDNA文库并筛选到了与转录因子StMR1互作的蛋白。 展开更多
关键词 玉米大斑病菌 CDNA文库 转录因子 酵母双杂交 互作蛋白
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山药DoWRKY40基因表达特征分析及互作蛋白筛选 被引量:1
12
作者 邢丽南 张艳芳 +3 位作者 葛明然 赵令敏 陈妍 霍秀文 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期118-128,共11页
【目的】WRKY作为植物特异型转录因子,参与植物生长发育过程。克隆山药DoWRKY40基因,分析其表达模式,通过酵母双杂交技术筛选与DoWRKY40互作的蛋白,探究WRKY40在山药膨大过程中的调控机制。【方法】以‘大和长芋’山药为材料克隆DoWRKY4... 【目的】WRKY作为植物特异型转录因子,参与植物生长发育过程。克隆山药DoWRKY40基因,分析其表达模式,通过酵母双杂交技术筛选与DoWRKY40互作的蛋白,探究WRKY40在山药膨大过程中的调控机制。【方法】以‘大和长芋’山药为材料克隆DoWRKY40基因,并进行生物信息学分析、表达模式分析、亚细胞定位,构建山药块茎不同发育时期酵母文库,筛选与DoWRKY40互作蛋白。【结果】DoWRKY40的开放阅读框长为927 bp。DoWRKY40蛋白属于WRKY家族的第II组,含有一个典型的WRKY转录因子保守结构域,定位于细胞核。与几内亚薯蓣亲缘关系较近。DoWRKY40基因在山药块茎生长发育的120 d表达量最高,且在叶、茎和块茎中均有表达,具有组织特异性。山药cDNA文库的库容量为1.484×10^(8);pGBKT7-WRKY40诱饵载体无自激活活性。酵母双杂交法从山药文库中筛选到4类与DoWRKY40相互作用的蛋白,分别参与植物生长发育、细胞周期调节与细胞扩增、信号转导及环境胁迫应答等。【结论】克隆得到DoWRKY40基因,其响应山药的生长发育过程,筛选到的4类互作蛋白表明其在山药细胞膨大及信号转导中起调控作用。 展开更多
关键词 山药 WRKY40基因 表达特征 亚细胞定位 CDNA文库 酵母双杂交 互作蛋白筛选
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白菜种子cDNA酵母文库的构建及BrTTG1互作蛋白的筛选及分析
13
作者 任延靖 张鲁刚 +2 位作者 赵孟良 李江 邵登魁 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期223-232,共10页
【目的】通过构建白菜种子的cDNA文库,筛选WDR 40蛋白TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)的互作蛋白,探究TTG1参与MBW三元复合体调控种皮原花青素形成的分子机制。【方法】以棕籽白菜自交系‘B147’的种子为材料,提取总RNA并建立cDNA文库... 【目的】通过构建白菜种子的cDNA文库,筛选WDR 40蛋白TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)的互作蛋白,探究TTG1参与MBW三元复合体调控种皮原花青素形成的分子机制。【方法】以棕籽白菜自交系‘B147’的种子为材料,提取总RNA并建立cDNA文库,通过gateway技术构建诱饵载体pGBKT7-TTG1并进行酵母双杂交筛库。【结果】酵母文库库容为1.2×10^(7)CFU,文库滴度是5.0×10^(7)CFU/mL,插入片段平均长度大于1000 bp,诱饵载体在酵母中无自激活活性。通过构建的诱饵载体pGBKT7-TTG1与构建的cDNA文库杂交,共获得了38个阳性互作蛋白,功能预测显示其中一个蛋白注释为MYB转录因子,注释为MYB73,序列分析结果显示该基因含有R2R3-MYB型抑制子保守基序C1和C2,推测该基因为白菜中参与种皮颜色形成的R2R3-MYB型抑制子,暗示着白菜中可能存在不同MYB转录因子参与的调控网络,影响着原花青素的形成。【结论】本研究构建了白菜种子组织的酵母双杂交cDNA文库,获得了38个TTG1阳性互作蛋白,首次挖掘到了可能影响白菜种皮颜色原花青素形成的R2R3-MYB型抑制子MYB73,为后期探究白菜种皮原花青素的调控网络奠定良好的基础。 展开更多
关键词 白菜种皮颜色 CDNA文库 酵母双杂交 互作蛋白 MYB73 基因克隆 表达分析
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灰霉菌胁迫下番茄叶片cDNA文库构建及SlbZIP1互作蛋白筛选鉴定
14
作者 马燕 韩玉龙 +3 位作者 吴兴兴 李爽 丁小雨 杨玉婷 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第18期35-41,共7页
为筛选番茄在灰霉菌侵染下与bZIP转录因子SlbZIP1(Solyc01g008730.2.1)互作的蛋白,以感病番茄Moneymaker为材料,提取接种灰霉菌胁迫处理后0、24、48、72、96 h的番茄叶片的总RNA,通过三框法构建cDNA酵母文库,计算文库库容量、重组效率... 为筛选番茄在灰霉菌侵染下与bZIP转录因子SlbZIP1(Solyc01g008730.2.1)互作的蛋白,以感病番茄Moneymaker为材料,提取接种灰霉菌胁迫处理后0、24、48、72、96 h的番茄叶片的总RNA,通过三框法构建cDNA酵母文库,计算文库库容量、重组效率。同时,以SlbZIP1为诱饵,利用构建的文库探索其在灰霉菌侵染过程中的互作蛋白,并对其中可能参与病原菌防御反应的潜在蛋白在酵母中进行互作验证。结果表明,酵母文库库容达到1.5×10^(6)CFU,重组效率为98%。酵母双杂交共计筛选到14个与SlbZIP1互作的潜在蛋白。进一步互作验证表明,SlbZIP1与谷氧还蛋白SlGRXC9、SlGRXC6、bZIP转录因子SlTGA2.2及钙调蛋白SlCaM1均存在互作。上述结果可为进一步阐明SlbZIP1对腐生型真菌病害的抗病分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 番茄 灰霉菌 CDNA文库 bZIP转录因子 互作蛋白
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矢车菊不同颜色花瓣酵母cDNA文库的构建
15
作者 邓成燕 王佳颖 戴思兰 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期115-122,共8页
【目的】矢车菊花瓣的蓝色呈色和品种间花色变异的分子调控机制尚不明晰。本研究采用Gateway技术构建了矢车菊6个不同花色品种花瓣的酵母cDNA文库,以期进一步通过酵母单杂交或双杂交技术筛选参与调控花瓣呈色的关键互作蛋白。【方法】... 【目的】矢车菊花瓣的蓝色呈色和品种间花色变异的分子调控机制尚不明晰。本研究采用Gateway技术构建了矢车菊6个不同花色品种花瓣的酵母cDNA文库,以期进一步通过酵母单杂交或双杂交技术筛选参与调控花瓣呈色的关键互作蛋白。【方法】本研究以白色、粉色、红色、蓝色、紫色和墨色矢车菊花瓣为材料,提取总RNA后分离和纯化mRNA,合成双链cDNA后依次进行BP重组反应和LR重组反应,分别获得初级和次级文库。最后将次级文库质粒转化酵母Y187,获得矢车菊不同颜色花瓣的酵母cDNA文库。【结果】质量鉴定结果显示:初级文库的库容量为1.3×10^(7) CFU,重组率为100%,且插入片段长度均在1000 bp以上;次级文库的库容量为1.6×10^(7) CFU,重组率为100%,且插入片段长度均在1000 bp以上。酵母文库的滴度为3.5×10^(7) CFU/mL,随机挑选的24个单克隆经PCR检测后均扩增出明亮条带,重组率为100%,插入片段长度均大于1000 bp。【结论】本研究构建的矢车菊不同颜色花瓣酵母cDNA文库的质量较高,能满足酵母文库筛选的试验要求,为后续探究矢车菊花瓣的蓝色呈色和品种间花色变异的分子调控机制提供了材料基础。 展开更多
关键词 矢车菊 花色 酵母 CDNA文库 GATEWAY技术
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橡胶树棒孢霉落叶病菌酵母单杂交cDNA文库及CcCas5启动子诱饵载体的构建
16
作者 胡国豪 杨子平 +2 位作者 刘铜 张荣意 侯巨梅 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期205-212,共8页
为了筛选出与CcCas5启动子结合的转录因子,本研究构建了橡胶树棒孢霉落叶病菌的酵母单杂交cDNA表达文库和CcCas5启动子诱饵载体,并对3-氨基-1,2,4-三唑(3-amino-1,2,4-triazole,3-AT)的最佳抑制浓度进行了筛选。结果显示,构建的酵母单杂... 为了筛选出与CcCas5启动子结合的转录因子,本研究构建了橡胶树棒孢霉落叶病菌的酵母单杂交cDNA表达文库和CcCas5启动子诱饵载体,并对3-氨基-1,2,4-三唑(3-amino-1,2,4-triazole,3-AT)的最佳抑制浓度进行了筛选。结果显示,构建的酵母单杂交cDNA表达文库总容量为3.49×10^(6)cfu,插入片段主要分布于750~2000 bp之间,重组率为95.8%;克隆了CcCas 5基因2600 bp的启动子序列,预测获得真菌主要的10大类转录因子的结合位点165个;构建了分别携带1500 bp和1000 bp启动子序列的酵母单杂交启动子诱饵载体,10 mmol/L的3-AT能抑制pHis2.1-pCcCas5-1000和pHis2.1-pCcCas5-1500的背景表达。试验结果为通过酵母单杂交筛选与CcCas5启动子结合的转录因子和进一步研究转录因子对CcCas5表达的调控作用奠定基础。 展开更多
关键词 橡胶树 多主棒孢 CcCas5 启动子 酵母单杂交 CDNA文库
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人肺腺癌细胞分化相关基因cDNAs的克隆 被引量:2
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作者 黎伯铨 雷薇 +5 位作者 王志华 张雪艳 蔡岩 王秀琴 吴旻 毛宝龄 《中国科学(C辑)》 CSCD 1997年第1期89-96,共8页
在用10^(-5)mol/L全反式维甲酸(RA)诱导人肺腺癌细胞系GLC-82分化的基础上,以M13噬菌粒pSPORT1为载体,应用定向克隆技术,分别构建了未经RA诱导和RA诱导1d及4d细胞的3个cDNA文库.以含重组子的诱导文库单链DNA为靶标(Target)同未诱导文库... 在用10^(-5)mol/L全反式维甲酸(RA)诱导人肺腺癌细胞系GLC-82分化的基础上,以M13噬菌粒pSPORT1为载体,应用定向克隆技术,分别构建了未经RA诱导和RA诱导1d及4d细胞的3个cDNA文库.以含重组子的诱导文库单链DNA为靶标(Target)同未诱导文库的cDNA驱除子(Driver)进行消减杂交,富集RA特异性单链DNA,将富集的单链DNA回复为双链后转化感受态菌,建立细胞诱导分化过程中活化表达基因的cDNA消减文库,得到124个cDNA消减克隆.经同源性分析和与文库总cDNA作Southern印迹杂交,进而与RA诱导前后细胞的RNA作Northern印迹杂交,筛选出2个(RA5,RA28)诱导后呈早期瞬时表达和1个(RA42)呈早期并持续表达的cDNA克隆,cDNA全长分别为1.8,1.5和0.7kb.序列测定及初步功能分析结果表明,RA5,RA28和RA42这3个首次报道的序列,可能是人肺腺癌细胞分化相关基因的cDNA克隆. 展开更多
关键词 肺肿瘤 腺癌 分化相关基因 CDNA 克隆
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黄瓜单性结实果实酵母双杂交文库的构建及CsCML25互作蛋白的筛选
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作者 徐建 姚协丰 +4 位作者 娄丽娜 朱凌丽 张曼 羊杏平 徐锦华 《种子科技》 2024年第7期1-4,共4页
为研究黄瓜单性结实形成的分子调控机制,以黄瓜单性结实自交系‘EC1’为材料,分别取开花前1 d至开花后4 d的子房,提取RNA后等量混合,采用SMART方法构建酵母双杂cDNA文库。结果表明,构建的文库总克隆数为1.16×107 CFU,平均插入片段... 为研究黄瓜单性结实形成的分子调控机制,以黄瓜单性结实自交系‘EC1’为材料,分别取开花前1 d至开花后4 d的子房,提取RNA后等量混合,采用SMART方法构建酵母双杂cDNA文库。结果表明,构建的文库总克隆数为1.16×107 CFU,平均插入片段长度≥1000 bp,阳性率为100%,符合建库的标准,可用于后续的酵母双杂交筛选。以黄瓜单性结实关键调控因子CsCML25为诱饵,构建pGBKT7-CML25诱饵蛋白表达载体,经自激活活性分析及不同浓度3AT对诱饵蛋白自激活活性抑制效果分析,使用SD-TLH+20 mM 3AT平板可完全抑制诱饵蛋白自激活活性。利用酵母双杂交筛选构建的黄瓜单性结实果实cDNA文库,得到96个初始阳性克隆。利用DNA测序、BLAST分析以及酵母回转验证等方法,最终获得27个可能与CsCML25相互作用的候选蛋白,为从分子水平探究CsCML25调控黄瓜单性结实的机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 黄瓜 单性结实 CDNA文库 酵母双杂交 CsCML25
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Cloning of Salt Tolerance-Related cDNAs from the Mangrove Plant Sesuvium portulacastrum L. 被引量:6
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作者 Hui-Cai Zeng Liu-Hong Deng Chun-Fa Zhang 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2006年第8期952-957,共6页
In an attempt to isolate and identify the target genes relevant to salt tolerance in a mangrove plant (Sesuvium portulacastrum L.), a subtracted cDNA library was constructed via suppressive subtractive hybridization... In an attempt to isolate and identify the target genes relevant to salt tolerance in a mangrove plant (Sesuvium portulacastrum L.), a subtracted cDNA library was constructed via suppressive subtractive hybridization (SSH), in which the poly(A)+RNA isolated from salt-tolerant S. portulacastrum leaves was used as a tester, whereas the driver was poly(A)+RNA, derived from salt-sensitive S. portulacastrum leaves. Screening of this subtracted cDNA library revealed five clones, of which the expression levels in the salt-tolerant plant were markedly higher than those observed in the salt-sensitive plant, indicating that these candidate clones may be involved in salt-tolerance pathways. Among the clones isolated, P66, P175, and P233 are novel because no significant similarity was obtained upon alignment with the GenBank database. Clone P89 demonstrated high homology with NADPH of Arabidopsis thaliana, whereas clone P152 was highly homologous with the gene encoding late embryogenesis abundant (LEA) protein of A. thaliana. The full-length gene of clone P152, with a predicated 344 amino acid residues, was shown to bear LEA-2 domains, a signature motif for proteins that have been enriched under salty and drought conditions. It is thus implied that clone P152 would be a salt-tolerance gene of S. portulacastrum. In addition, we have also developed a strategy for the extraction of total RNA from mangrove plants. 展开更多
关键词 MANGROVE salt tolerance-related cdnas Sesuvium portulacastrum suppressive subtractive hybridization.
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褐黄血蜱脂肪酸结合蛋白对褐黄血蜱卵及其原生质蛋白影响的研究
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作者 王兰兰 刘金宝 程天印 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期342-349,共8页
为了解蜱类脂肪酸结合蛋白(FABP)及其基因的结构和功能,本研究基于褐黄血蜱转录组文库中的Contig 879序列设计引物,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)扩增其两翼缺失部分,拼接后得到编码褐黄血蜱FABP (HfFABP)的全长cDNA序列;采用qPCR法... 为了解蜱类脂肪酸结合蛋白(FABP)及其基因的结构和功能,本研究基于褐黄血蜱转录组文库中的Contig 879序列设计引物,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)扩增其两翼缺失部分,拼接后得到编码褐黄血蜱FABP (HfFABP)的全长cDNA序列;采用qPCR法检测该基因在褐黄血蜱的不同发育阶段、不同组织器官中的转录水平;采用平行反应监测(PRM)法分析HfFABP dsRNA干扰对褐黄血蜱产卵和孵化,以及卵原生质蛋白的影响。结果显示,HfFABP的cDNA全长1 443 bp,ORF长396 bp,编码132个氨基酸的多肽。HfFABP基因在雌蜱中的转录水平高于幼蜱、若蜱和雄蜱;在蜱的卵巢、中肠和体壳中的转录水平高于其在唾液腺中的转录水平;吸血使HfFABP基因的转录水平升高。HfFABP dsRNA干扰使蜱产卵减少,其中约30%的卵大小不均、蜡质增多、塌瘪易裂;表观正常的卵孵化率降低,原生质中的FABP、卵黄蛋白原(Vitellogenin)、弹性蛋白酶抑制剂(Neutrophil elastase inhibitor)、天冬氨酸蛋白酶(Aspartic protease)和热休克蛋白83 (Heat shock protein 83)等12种蛋白的丰度大幅下降(P<0.01、P<0.05)。上述结果首次表明HfFABP在蜱卵发育过程中发挥重要作用,本研究为HfFABP在抑制雌蜱生殖中的应用提供科学依据。 展开更多
关键词 褐黄血蜱 脂肪酸结合蛋白(FABP) cDNA末端快速扩增技术(RACE) 平行反应监测(PRM)
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