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免耕水稻土固定CO2自养微生物多样性
被引量:
13
1
作者
钱明媚
肖永良
+1 位作者
彭文涛
曹慧
《中国环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期3754-3761,共8页
使用^(13)CO_2为标记物,采用稳定性同位素核酸探针(DNA-SIP)技术和微宇宙模拟的方法,对两种南方免耕水稻土中的固定CO_2自养微生物群落结构和多样性进行了研究.实验结果表明,经80d的培养后,从^(13)CO_2标记处理的士样提取的DNA经氯化铯...
使用^(13)CO_2为标记物,采用稳定性同位素核酸探针(DNA-SIP)技术和微宇宙模拟的方法,对两种南方免耕水稻土中的固定CO_2自养微生物群落结构和多样性进行了研究.实验结果表明,经80d的培养后,从^(13)CO_2标记处理的士样提取的DNA经氯化铯密度梯度离心后其浮力密度显著区分于^(12)CO_2对照组表明土壤样品中的固定CO_2自养微生物对CO_2具有同化利用.RT-PCR结果表明两种标记土样DNA密度梯度离心分层的cbbLR基因的拷贝数最高分别为1.36×10~5拷贝/g干土和2.21×10~5拷贝/g干土.克隆文库分析和系统发育分析表明两种土壤中的固定CO_2自养微生物群落结构具有一定差异Bradyrhizobium和Rubriviv二是为FG土壤中的主要类群,占全部克隆数的60.40%和13.86%.而TF土壤的主要类群是Rhodopseudomonas,Rhodospirillum,Methylibium和Variovorax,分别占全部克隆数的20.90%、11.94%,16.42%和10.45%.两种^(13)CO_2标记土样的cbbLR基因文库OTU类型、多样性指数均高于^(12)CO_2对照文库,其群落结构也有明显的变化.因此,免耕水稻土存在高度多样性的二氧化碳固定自养微生物,在农田土壤碳素循环方面具有重要作用.
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关键词
固碳微生物
免耕水稻土
cbb
lr
基因
DNA-SIP
PCR-RFLP分析
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职称材料
岩溶地区不同土地利用方式土壤固碳细菌群落结构特征
被引量:
12
2
作者
张双双
靳振江
+1 位作者
贾远航
李强
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期412-420,共9页
固碳细菌是土壤碳循环重要的微生物群落,研究其群落结构特征对认识土壤生态系统的固碳机制具有重要意义.以桂林毛村岩溶实验场的岩溶区、混合区与非岩溶区为研究样区,采集稻田、玉米和柑橘园表层土壤,以cbb LR为固碳细菌的指示基因,采...
固碳细菌是土壤碳循环重要的微生物群落,研究其群落结构特征对认识土壤生态系统的固碳机制具有重要意义.以桂林毛村岩溶实验场的岩溶区、混合区与非岩溶区为研究样区,采集稻田、玉米和柑橘园表层土壤,以cbb LR为固碳细菌的指示基因,采用高通量测序方法,对比在三类区域土壤中固碳细菌的群落丰度、组成及多样性特征的异同.结果表明,三类区域土壤中固碳细菌属于变形菌门和放线菌门.其中,变形菌门的α-变形菌纲(α-Proteobacteria,24.6%)为三类区域土壤中的优势纲,以根瘤菌为主的兼性自养菌是主要的固碳细菌.在岩溶区,伯克氏菌目(Burkholderiales)、红假单胞菌属(Rhodopseudomonas)、固氮螺菌属(Azospirillum)、费氏根瘤菌(Sinorhizobium fredii HH103)、豌豆根瘤菌(Rhizobium leguminosarum bv.trifolii)等微生物的丰度均高于混合区和非岩溶区;而慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)为混合区与非岩溶区土壤中的优势种群.冗余分析(redundancy analysis)表明,pH、土壤有机碳(SOC)、可溶性有机碳(DOC)、总氮(TN)和阳离子交换量(CEC)等土壤因子是影响固碳细菌群落结构差异的主要生态因子.以上结果表明,岩溶区的土壤特性对固碳细菌的群落结构有显著影响.
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关键词
岩溶区
固碳细菌
cbb
lr
基因
根瘤菌
高通量测序
原文传递
题名
免耕水稻土固定CO2自养微生物多样性
被引量:
13
1
作者
钱明媚
肖永良
彭文涛
曹慧
机构
南京农业大学生命科学学院
出处
《中国环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期3754-3761,共8页
基金
国家自然科学基金项目(41371262,40871125)
文摘
使用^(13)CO_2为标记物,采用稳定性同位素核酸探针(DNA-SIP)技术和微宇宙模拟的方法,对两种南方免耕水稻土中的固定CO_2自养微生物群落结构和多样性进行了研究.实验结果表明,经80d的培养后,从^(13)CO_2标记处理的士样提取的DNA经氯化铯密度梯度离心后其浮力密度显著区分于^(12)CO_2对照组表明土壤样品中的固定CO_2自养微生物对CO_2具有同化利用.RT-PCR结果表明两种标记土样DNA密度梯度离心分层的cbbLR基因的拷贝数最高分别为1.36×10~5拷贝/g干土和2.21×10~5拷贝/g干土.克隆文库分析和系统发育分析表明两种土壤中的固定CO_2自养微生物群落结构具有一定差异Bradyrhizobium和Rubriviv二是为FG土壤中的主要类群,占全部克隆数的60.40%和13.86%.而TF土壤的主要类群是Rhodopseudomonas,Rhodospirillum,Methylibium和Variovorax,分别占全部克隆数的20.90%、11.94%,16.42%和10.45%.两种^(13)CO_2标记土样的cbbLR基因文库OTU类型、多样性指数均高于^(12)CO_2对照文库,其群落结构也有明显的变化.因此,免耕水稻土存在高度多样性的二氧化碳固定自养微生物,在农田土壤碳素循环方面具有重要作用.
关键词
固碳微生物
免耕水稻土
cbb
lr
基因
DNA-SIP
PCR-RFLP分析
Keywords
carbon dioxide-fixing microbes
no-tillage paddy soil
cbb lr gene
DNA-SIP
PCR-RFLP analysis
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
Q938 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
岩溶地区不同土地利用方式土壤固碳细菌群落结构特征
被引量:
12
2
作者
张双双
靳振江
贾远航
李强
机构
桂林理工大学环境科学与工程学院
桂林理工大学岩溶地区水污染控制与用水安全保障协同创新中心
桂林理工大学广西矿冶与环境科学实验中心
桂林理工大学广西环境污染控制理论与技术重点实验室
中国地质科学院岩溶地质研究所自然资源部/广西壮族自治区岩溶动力学重点实验室
出处
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期412-420,共9页
基金
国家自然科学基金项目(41867008
41361054
+3 种基金
41003038)
广西自然科学基金项目(2011GXNSFA01018006)
桂林理工大学博士启动基金项目(2004041)
广西高等学校高水平创新团队及卓越学者计划项目(002401013001)
文摘
固碳细菌是土壤碳循环重要的微生物群落,研究其群落结构特征对认识土壤生态系统的固碳机制具有重要意义.以桂林毛村岩溶实验场的岩溶区、混合区与非岩溶区为研究样区,采集稻田、玉米和柑橘园表层土壤,以cbb LR为固碳细菌的指示基因,采用高通量测序方法,对比在三类区域土壤中固碳细菌的群落丰度、组成及多样性特征的异同.结果表明,三类区域土壤中固碳细菌属于变形菌门和放线菌门.其中,变形菌门的α-变形菌纲(α-Proteobacteria,24.6%)为三类区域土壤中的优势纲,以根瘤菌为主的兼性自养菌是主要的固碳细菌.在岩溶区,伯克氏菌目(Burkholderiales)、红假单胞菌属(Rhodopseudomonas)、固氮螺菌属(Azospirillum)、费氏根瘤菌(Sinorhizobium fredii HH103)、豌豆根瘤菌(Rhizobium leguminosarum bv.trifolii)等微生物的丰度均高于混合区和非岩溶区;而慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)为混合区与非岩溶区土壤中的优势种群.冗余分析(redundancy analysis)表明,pH、土壤有机碳(SOC)、可溶性有机碳(DOC)、总氮(TN)和阳离子交换量(CEC)等土壤因子是影响固碳细菌群落结构差异的主要生态因子.以上结果表明,岩溶区的土壤特性对固碳细菌的群落结构有显著影响.
关键词
岩溶区
固碳细菌
cbb
lr
基因
根瘤菌
高通量测序
Keywords
karst area
CO2-fixing bacteria
cbb lr gene
Bradyrhizobium
high-throughput sequencing
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
免耕水稻土固定CO2自养微生物多样性
钱明媚
肖永良
彭文涛
曹慧
《中国环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015
13
下载PDF
职称材料
2
岩溶地区不同土地利用方式土壤固碳细菌群落结构特征
张双双
靳振江
贾远航
李强
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2019
12
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