Psathyrostachys huashanica和Pseudoroegneria strigosa细胞色素c成熟蛋白亚基ccmFN基因的序列分析

研究报道了禾本科小麦族物种Psathyrostachys huashanica和Pseudoroegneria strigosa的细胞色素c成熟蛋白亚基ccmFN基因部分序列。序列分析显示,Psathyrostachys huashanica和Pseudoroegneria strigosa的ccmFN序列相似性为99%。它们与小麦的ccmFN具有98%的相似性,与水稻和玉米分别有97%和93%的相似性。还讨论了该基因具有的系统学意义。

10种藏药材ccmFN基因片段密码子偏好性分析

目的分析苞叶雪莲、砂生槐、西藏大戟、拉萨小檗、桃儿七、樱草杜鹃、大花黄牡丹、总状绿绒蒿、拉萨蒲公英、藏橐吾10种藏药材的ccmFN基因片段密码子偏好性。方法运用Codon软件对ccmFN基因部分片段密码子组成、密码子使用性各参数和同义密码子相对使用度进行计算和统计分析,从而分析密码子的使用情况;利用ENC绘图、PR2绘图推测影响密码子偏性的因素。结果 ccmFN基因部分片段共同的偏好密码子为GCU、GAU、GAG、GGA、AUU、UUA、CUA、AAU、CCC、CAG、CGU、CGG,且偏好使用以U/A结尾的密码子。ENC绘图表明,10种单子叶植物受自然选择作用的影响比10种双子叶植物和10种藏药材大;PR2绘图表明,密码子第3位的碱基A和T使用不对称,从而影响密码子的偏好使用。结论 ccmFN基因部分片段密码子使用偏好性在苞叶雪莲等10种藏药材、10种双子叶植物、10种单子叶植物中差异不大,表明此区域在植物中具有保守性,突变作用是导致密码子偏好的主要因素。