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Science Letters:Assignment of CCR7 gene to chicken chromosome 27 by radiation hybrid panel mapping
1
作者 TIAN Yong LU Li-zhi +5 位作者 FU Yan TAO Zheng-rong SHEN Jun-da WANG De-qian YUAN Ai-ping YIN Zhao-zheng 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2007年第5期314-317,共4页
The protein encoded by CC chemokine receptor 7 (CCR7) is a member of the G protein-coupled receptor family. This receptor was identified as a gene induced by the Epstein-Barr virus (EBV), and is thought to be a mediat... The protein encoded by CC chemokine receptor 7 (CCR7) is a member of the G protein-coupled receptor family. This receptor was identified as a gene induced by the Epstein-Barr virus (EBV), and is thought to be a mediator of EBV effects on B lymphocytes. This receptor is expressed in various lymphoid tissues and activates B and T lymphocytes. It has been shown to control the migration of memory T cells to inflamed tissues, as well as stimulate dendritic cell maturation. To map the CCR7 gene in chicken chromosome, a 6 000 rads chicken-hamster radiation hybrid panel (ChickRH6) was used. PCR of samples from ChickRH6 revealed that the location of CCR7 gene is linked to the maker SEQ0347 (6 cR away) with LOD score of 16.6 and that the marker SEQ0347 is located on chromosome 27 at 27 cR of RH (radiation hydrid) map. We compared the corresponding human mRNA sequence with the predicted coding sequence of chicken CCR7 gene, and found that the assembled contig shared a high percentage of similarity with that of the human gene. 展开更多
关键词 Radiation hybrid panel MAPPING ccr7 gene CHICKEN
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CCR5 gene expression in fulminant hepatitis and DTH in mice 被引量:5
2
作者 GUO Bao-Yu ZHANG Su-Ying +5 位作者 Naofumi Mukaida Akihisa Harada Kouji Kuno WANG Jian-Bin SUN Shu-Han Kouji Matsushima 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1998年第1期19-23,共5页
IMS To isolate mouse CCR5 cDNA (muCCR5) and study its expression in vivo.METHODS Marathon PCR was used to isolate muCCR5 cDNA and two animal models were designed to investigate the gene expression in vivo, one was m... IMS To isolate mouse CCR5 cDNA (muCCR5) and study its expression in vivo.METHODS Marathon PCR was used to isolate muCCR5 cDNA and two animal models were designed to investigate the gene expression in vivo, one was mouse fulminant hepatitis induced by Propionibacterium acnes (P.acnes) and the other was that with delayed type hypersensitivity reaction (DTH). A specific GSTNH2terminus of muCCR5 fusion protein antibody F(ab′)2 was prepared and clarified. RTPCR and immunohistochemical analysis were used to observe the expression level of CCR5 gene in mice.RESULTS A positive reaction of mouse macrophage was found in DTH but not expressed in P.acnes induced fulminant hepatitis by RTPCR and immunohistochemical analysis.CONCLUSION This muCCR5 expression may be involved in an allergic process mediated by cellular immunity but not acute inflammatory reaction induced by P.acnes.. 展开更多
关键词 ccr5 gene DNA complementary gene expression cloning molecular HEPATITIS hypersensitivity delayed disease models animal polymerase chain reaction IMMUNOHISTOCHEMISTRY
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美洲南瓜CCR基因表达特点的研究 被引量:9
3
作者 陈刚 薛应钰 +2 位作者 白江平 徐秉良 梁巧兰 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期898-903,共6页
采用qRT-PCR方法对2种(有壳和裸仁)美洲南瓜的胚珠、授粉后10~60d的种皮以及叶片、茎秆、柱头等组织中CCR基因表达进行了分析。结果显示:(1)从胚珠到授粉后60d,2种美洲南瓜种皮中CCR基因的表达量均呈增加-降低-增加-再降低的趋势,且不... 采用qRT-PCR方法对2种(有壳和裸仁)美洲南瓜的胚珠、授粉后10~60d的种皮以及叶片、茎秆、柱头等组织中CCR基因表达进行了分析。结果显示:(1)从胚珠到授粉后60d,2种美洲南瓜种皮中CCR基因的表达量均呈增加-降低-增加-再降低的趋势,且不同时间(天)CCR基因的表达量存在显著或极显著差异。(2)2种美洲南瓜胚珠中CCR基因的表达量存在差异但不显著,裸仁美洲南瓜CCR基因的表达量为有壳美洲南瓜的1.2倍。(3)随授粉后时间的延长,有壳美洲南瓜种皮中CCR基因的表达量逐渐高于裸仁美洲南瓜,在授粉后10~60d时,有壳美洲南瓜种皮中CCR基因的表达量均显著或极显著大于裸仁美洲南瓜,且分别为裸仁美洲南瓜的1.2~5.1倍。研究表明,CCR基因参与美洲南瓜种皮发育与形成,CCR基因在裸仁美洲南瓜叶片、茎秆、柱头等组织中的表达量均大于有壳美洲南瓜,且同一品种、不同组织中CCR基因的表达量存在组织特异性,表达量与组织木质化的程度呈正相关。 展开更多
关键词 裸仁美洲南瓜 种皮 ccr基因 QRT-PCR 组织特异性
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茶树‘紫娟’肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)克隆及序列分析 被引量:6
4
作者 陈林波 宋维希 +4 位作者 李晓霞 夏丽飞 周萌 梁名志 焉文光 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期80-85,共6页
通过克隆茶树肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)的cDNA序列,为研究其蛋白结构和功能奠定基础。对利用cDNA-AFLP技术获得的‘紫娟’茶树成熟叶片上调的差异表达片段TDF,设计特异引物,利用RACE末端扩增技术,分别扩增出5′端和3′端目的片段,测... 通过克隆茶树肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)的cDNA序列,为研究其蛋白结构和功能奠定基础。对利用cDNA-AFLP技术获得的‘紫娟’茶树成熟叶片上调的差异表达片段TDF,设计特异引物,利用RACE末端扩增技术,分别扩增出5′端和3′端目的片段,测序后进行拼接获得茶树肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)cDNA全长序列,并进行序列分析。结果表明:克隆的茶树CsCCR基因cDNA全长1 259bp(GenBank登录号为KJ995737),其中开放阅读框957bp。同源比对发现,与蓖麻、丹参、草莓、番茄的CCR蛋白同源性分别为67%、68%、69%和70%。 展开更多
关键词 茶树 肉桂酰辅酶A还原酶 基因克隆 序列分析
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芒果CCR基因的克隆及其序列分析 被引量:4
5
作者 张宇 张波 +5 位作者 赵志常 高爱平 陈业渊 黄建峰 党志国 罗睿雄 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第B12期16-19,共4页
为了研究芒果CCR基因在芒果对芒果树抗性的功能。采用传统的RT-PCR和RACE方法从芒果的枝梢中克隆得到了1个参与木质素生物合成的肉桂酰辅酶-A还原酶基因(CCR)的全长c DNA序列,进而对得到的序列采用TMHMM、DNAMAN等软件进行生物信息学分... 为了研究芒果CCR基因在芒果对芒果树抗性的功能。采用传统的RT-PCR和RACE方法从芒果的枝梢中克隆得到了1个参与木质素生物合成的肉桂酰辅酶-A还原酶基因(CCR)的全长c DNA序列,进而对得到的序列采用TMHMM、DNAMAN等软件进行生物信息学分析,发现芒果CCR基因包含编码区、3'和5'非翻译区的长度为1 292 bp的c DNA序列,编码305个氨基酸;对跨膜结构域进行了预测,发现该基因无跨膜结构域;蛋白二级结构元件以无规则卷曲和β-螺旋为主;聚类分析发现,该基因与美洲山杨木、油茶等植物的亲缘关系较近,而与百合、橡胶树等亲缘关系较远。从芒果中克隆得到了一个CCR基因,并对其生物信息学进行了分析,为后续转基因工作打下了基础。 展开更多
关键词 芒果 肉桂酰辅酶A还原酶 基因克隆 序列分析
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木质素生物合成酶CCR基因的生物信息学分析 被引量:7
6
作者 陈刚 徐秉良 白江平 《生物信息学》 2013年第1期50-57,共8页
肉桂酰辅酶A还原酶(Cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是催化木质素特异途径的第一个关键酶,是调节碳素流向木质素潜在的控制关节点,对木质素单体的生物合成起着重要作用。通过NCBI数据库收集来自裸子植物、单子叶植物及双子叶植物的35条CC... 肉桂酰辅酶A还原酶(Cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是催化木质素特异途径的第一个关键酶,是调节碳素流向木质素潜在的控制关节点,对木质素单体的生物合成起着重要作用。通过NCBI数据库收集来自裸子植物、单子叶植物及双子叶植物的35条CCR基因的完整信息,对35条CCR基因的cDNA及其编码的氨基酸序列的进化规律、理化性质、结构域、导肽、信号肽、跨膜结构域、亲/疏水性以及蛋白质结构等性状进行了生物信息学分析与预测,构建了CCR基因的系统发育树。分析结果表明,单子叶植物CCR基因中GC的含量明显高于双子叶植物;CCR基因编码的氨基酸序列存在9个保守区域;所编码氨基酸的理化性质基本一致,但单子叶、双子叶及裸子植物的CCR基因编码主要氨基酸的种类和含量存在着差异;CCR蛋白的N-端存在一个脱氢酶/差向异构酶/辅酶Ⅰ结合蛋白的结构域,无导肽、信号肽及跨膜结构域,属亲水性蛋白;进化树绘制以及同源建模结果表明,CCR基因的进化和植物的进化基本一致,CCR蛋白三级结构模型的空间结构稳定,建模结果可靠。分析结果对于深入研究CCR蛋白在木质素合成中的作用具有一定的理论指导意义。 展开更多
关键词 木质素 ccr基因 生物信息学 进化树 同源建模
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东方百合LsCCR1基因的克隆及表达分析 被引量:1
7
作者 李晓荣 王桂凤 +1 位作者 席梦利 施季森 《分子植物育种》 CAS CSCD 2008年第1期141-147,共7页
百合茎秆的挺度直接关系到百合花采收后的货架寿命等重要商品性状,而这些商品性状与植物茎秆中的木质素的含量高低有关。本文应用RLM-RACE技术,从东方百合索蚌植株中克隆了木质素合成相关基因--肉桂酰辅酶A还原酶,定名为LsCCR1。该基因c... 百合茎秆的挺度直接关系到百合花采收后的货架寿命等重要商品性状,而这些商品性状与植物茎秆中的木质素的含量高低有关。本文应用RLM-RACE技术,从东方百合索蚌植株中克隆了木质素合成相关基因--肉桂酰辅酶A还原酶,定名为LsCCR1。该基因cDNA全长为1499bp,包括完整的阅读框,编码388个氨基酸。多重比对分析发现百合LsCCR1基因与其他植物上已经发现的CCR基因同源性多介于55% ̄66%之间。利用半定量PCR检测LsCCR1基因在百合不同组织中的表达差异,结果显示LsCCR1基因主要在百合的茎秆中表达,根部次之,叶片、鳞茎及花蕾中表达量较少,其表达模式与拟南芥、桉树及大麦中CCR基因的表达模式类似。 展开更多
关键词 东方百合 茎秆 木质素合成 ccr 基因表达
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棉花GhCCR4基因表达载体构建及GUS基因的瞬时表达 被引量:4
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作者 秦超 倪志勇 +3 位作者 郝晓燕 王娟 吕萌 范玲 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期639-642,共4页
研究以GUS基因为报告基因,构建CCR4基因的瞬时表达载体,首先酶切带有CCR4基因的pGEM-T-CCR4载体,获得CCR4基因目的片段,然后将其克隆到瞬时表达载体pGUS/NIa中,获得由CaMV35S启动子调控目的基因的pGUS-CCR4融合表达载体,使目的基因能够... 研究以GUS基因为报告基因,构建CCR4基因的瞬时表达载体,首先酶切带有CCR4基因的pGEM-T-CCR4载体,获得CCR4基因目的片段,然后将其克隆到瞬时表达载体pGUS/NIa中,获得由CaMV35S启动子调控目的基因的pGUS-CCR4融合表达载体,使目的基因能够和GUS基因同时表达。采用基因枪法将pGUS-CCR4转化到洋葱表皮细胞中,暗培养24h,经GUS组织化学染色,检测到多个洋葱细胞呈现蓝色,表明构建的瞬时表达载体可在植物细胞中高效表达。为进一步在棉花中研究GhCCR4基因的功能奠定了实验基础。 展开更多
关键词 ccr 载体构建 瞬时表达 GUS基因
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马尾松肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)克隆及分析(英文) 被引量:9
9
作者 陈碧华 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第12期46-53,共8页
对马尾松肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)进行扩增、克隆和测序(GenBank登录号:EU753854)。应用MEGA4.0.2软件对不同树种CCR基因的核苷酸和氨基酸序列进行比对,结果表明:马尾松CCR基因的外显子和内含子数目与火炬松、杨树、银合欢、光皮桦... 对马尾松肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)进行扩增、克隆和测序(GenBank登录号:EU753854)。应用MEGA4.0.2软件对不同树种CCR基因的核苷酸和氨基酸序列进行比对,结果表明:马尾松CCR基因的外显子和内含子数目与火炬松、杨树、银合欢、光皮桦、冈尼桉、柳桉、蓝桉的外显子和内含子数目相同,都有5个外显子和4个内含子。马尾松CCR基因编码区975bp,编码324个氨基酸。马尾松外显子Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,V分别为133,155,186,353,148bp,而内含子Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ分别为1450,216,737,941bp。马尾松CCR外显子和内含子连接处序列除内含子Ⅱ/外显子Ⅲ出现GTPuGG/外显子Ⅲ,其余遵循外显子/GTPuAG/外显子组成规律。马尾松外显子Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ核苷酸数目与桉属、杨属、桦木属和松属树种相同,但外显子Ⅰ和外显子Ⅴ不尽相同。比对的树种间在该基因编码区核苷酸序列和氨基酸序列上相对保守,也存在一定差异。马尾松与火炬松、光皮桦、银合欢、杨树、冈尼桉、柳桉、蓝桉各物种间编码区核苷酸序列相似性大小分别为99.2%,67.8%,68.0%,68.9%,69.5%,69.3%,69.9%,而相应的氨基酸序列间相似性大小分别为99.1%,73.5%,72.5%,74.4%,75.0%,74.4%,75.0%。马尾松与其他13个树种CCR序列构建的系统进化树表明:3个针叶树种形成1个独立分支,而且最早进化。 展开更多
关键词 马尾松 肉桂酰辅酶A还原酶基因(ccr) 克隆 序列分析 系统进化树
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广西罗城仫佬族人群HIV-1感染相关基因CCR5多态性的初步研究 被引量:2
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作者 陈森洲 陈哲 +2 位作者 樊晓晖 杨海波 赖振屏 《华夏医学》 CAS 2007年第6期1176-1178,共3页
目的:了解广西仫佬人群中HIV辅助受体CCR5△32和CCR5-894C缺失等位基因突变频率和多态性的特点,为评估该民族人群对HIV的遗传易感性和艾滋病的防治提供理论依据。方法:以197例仫佬族为研究对象,应用PCR和DNA测序等方法检测CCR5△32和CCR... 目的:了解广西仫佬人群中HIV辅助受体CCR5△32和CCR5-894C缺失等位基因突变频率和多态性的特点,为评估该民族人群对HIV的遗传易感性和艾滋病的防治提供理论依据。方法:以197例仫佬族为研究对象,应用PCR和DNA测序等方法检测CCR5△32和CCR5-894C缺失突变体。结果:未发现CCR5△32和CCR5-894C缺失突变体。结论:由于未发现CCR5△32和CCR5-894C缺失突变体,推测仫佬族人群对HIV-1病毒感染可能具有较大的遗传易感性。 展开更多
关键词 基因多态性 HIV-1 ccr5
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杯果木CCR基因克隆和同源进化分析 被引量:1
11
作者 陈碧华 《桉树科技》 2009年第1期7-12,共6页
从粗毛杯果木和软叶杯果木基因组中克隆CCR基因,经测序验证扩增片断长度均为2321bp,包含部分外显子3、4和部分5,以及内含子3和4。同源性比较分析表明:粗毛杯果木与伞房属树种CCR的同源相似性达到98%~87%,与桉属树种CCR的同源相似性达到... 从粗毛杯果木和软叶杯果木基因组中克隆CCR基因,经测序验证扩增片断长度均为2321bp,包含部分外显子3、4和部分5,以及内含子3和4。同源性比较分析表明:粗毛杯果木与伞房属树种CCR的同源相似性达到98%~87%,与桉属树种CCR的同源相似性达到97%~84%;而软叶杯果木与伞房属树种CCR的同源相似性达到98%~87%,与桉属树种CCR的同源相似性达到95%~84%。总体上,该2个杯果木树种与伞房属CCR同源相似性较高,而与桉属CCR同源相似性较低。3个属中最长保守序列位于Exon5的第3147~3175位点,共29个碱基。保守区域主要集中于Exon5,少数于Intron4。桉属总变异率大于杯果木属和伞房属。桉属Exon4变异率大于属内其它Exon或Intron;同样发现Exon4的简约信息位点百分数大于属内其它Exon或Intron,但杯果木属中的Intron3变异率高于属内其它Exon或Intron。伞房属以Exon5的变异率最高。Exon或Intron平均变异率均以桉属最多,其次是杯果木属,最少的是伞房属。使用MEGA3.1软件构建的CCR进化树表明,桉属、伞房属和杯果木属分别形成单系,其亲缘关系可以明显区分开来。杯果木属最早产生分歧,并形成单独一个分枝;其次是伞房属,也形成单独一个分枝,进化较杯果木属迟;最迟进化的是桉属,也形成单独一个分枝。这种结果与形态学比较接近,易为人们所接受。 展开更多
关键词 粗毛杯果木 软叶杯果木 ccr基因 基因克隆 同源性 分子进化
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白藜芦醇对人外周血单核/巨噬细胞CCR5表达的影响
12
作者 郭继强 孙爱萍 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2008年第2期102-106,共5页
目的:观察白藜芦醇对人外周血单核/巨噬细胞CC型趋化因子受体5(CCR5)表达的调节作用。方法:采用F icoll-Hypaque密度梯度离心法分离人外周血单个核细胞,再经贴壁法纯化单核/巨噬细胞。采用IFN-γ(1×105U/L)诱导单核/巨噬细胞表达CC... 目的:观察白藜芦醇对人外周血单核/巨噬细胞CC型趋化因子受体5(CCR5)表达的调节作用。方法:采用F icoll-Hypaque密度梯度离心法分离人外周血单个核细胞,再经贴壁法纯化单核/巨噬细胞。采用IFN-γ(1×105U/L)诱导单核/巨噬细胞表达CCR5,再分别加入不同浓度的白藜芦醇(0.5,5,25,50和100μmol/L)进行干预。培养24 h后收集细胞,RT-PCR法检测外周血单核/巨噬细胞CCR5 mRNA表达水平;流式检测单核/巨噬细胞CCR5表达阳性率。同时将CCR5荧光素酶报告基因(pGL3-Basic-CCR5)转染各组细胞,检测各转染组的荧光素酶相对活性。结果:中、高浓度白藜芦醇处理组(25,50和100μmol/L)的CCR5 mRNA表达水平、CCR5阳性细胞率和CCR5-luc报告基因的荧光素酶相对活性比对照组均有所降低,低浓度白藜芦醇处理(0.5和5μmol/L)对单核/巨噬细胞CCR5的表达无明显影响。结论:中、高浓度白藜芦醇可抑制外周血单核/巨噬细胞CCR5的表达。 展开更多
关键词 白藜芦醇 单核/巨噬细胞 巨噬细胞移动抑制因子 报告基因 趋化因子受体
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象草PpCCR基因正、反义表达载体的构建及对烟草的转化 被引量:3
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作者 彭小群 张博雅 +2 位作者 刘洁雯 王亚 解新明 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1586-1593,共8页
象草(Pennisetum purpureum)是一种广泛种植于热带和亚热带地区的多年生资源植物,但其木质素含量过高,影响了对其的开发与利用。为探讨肉桂酰辅酶A还原酶(Cinnamoyl-Co A Reductase,CCR)基因对木质素合成的影响,本研究以华南象草为材料... 象草(Pennisetum purpureum)是一种广泛种植于热带和亚热带地区的多年生资源植物,但其木质素含量过高,影响了对其的开发与利用。为探讨肉桂酰辅酶A还原酶(Cinnamoyl-Co A Reductase,CCR)基因对木质素合成的影响,本研究以华南象草为材料,构建了CCR基因正反义表达载体,并利用农杆菌侵染法转化烟草。通过Wiesner和Maule染色法对转基因植株进行木质素的组织化学染色。结果发现,转基因植株的木质素单体组成并没有明显改变;但Pp CCR过表达烟草,转基因株系木质化细胞增多;Pp CCR反义表达烟草,转基因株系木质化细胞排列相对松散。同时反义表达CCR,在木质素含量下降最明显的植株中茎秆呈红褐色。上述结果表明,CCR对木质素的合成起重要作用,这为进一步对象草进行遗传改良奠定了基础。 展开更多
关键词 象草 ccr基因 表达载体 遗传转化 烟草
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趋化因子MIP-1α和MCP-1及其受体CCR-1和CCR-2在慢性髓系白血病细胞中的表达 被引量:2
14
作者 王伟良 沈悌 +2 位作者 惠玉荣 顾惜春 李蓉生 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2006年第3期433-436,共4页
本文旨在研究MIP-1α和MCP-1及其受体CCR-1和CCR-2在慢性髓系白血病细胞中的表达,同时观察P210bcr/abl融合蛋白中酪氨酸激酶对MIP-1α和MCP-1及其受体CCR-1和CCR-2mRNA表达的影响。在bcr/abl融合基因阴性和阳性慢性髓系白血病细胞中,采... 本文旨在研究MIP-1α和MCP-1及其受体CCR-1和CCR-2在慢性髓系白血病细胞中的表达,同时观察P210bcr/abl融合蛋白中酪氨酸激酶对MIP-1α和MCP-1及其受体CCR-1和CCR-2mRNA表达的影响。在bcr/abl融合基因阴性和阳性慢性髓系白血病细胞中,采用半定量RT-PCR方法检测MIP-1α、MCP-1、CCR-1、CCR-2mRNA的表达水平。结果表明MIP-1αmRNA和CCR-1mRNA在bcr/abl融合基因阳性细胞中不表达,但在bcr/abl融合基因阴性细胞中表达,而MCP-1mRNA和CCR-2mRNA在bcr/abl融合基因阳性和阴性细胞中均不表达。当P210bcr/abl融合蛋白中酪氨酸激酶被抑制后,MIP-1α和CCR-1的mRNA表达水平恢复至正常水平。结论:P210bcr/abl融合蛋白抑制慢性髓系白血病细胞中MIP-1α和CCR-1mRNA的表达,但对MCP-1和CCR-2mRNA的表达无影响。 展开更多
关键词 慢性髓系白血病 BCR/ABL融合基因 P210bcr/abl融合蛋白 MIP-1Α ccr-1 MCP-1 ccr-2
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毛白杨融合基因4CL1-CCR对烟草木质素沉积的影响
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作者 胡嘉祺 齐芪 +1 位作者 蒋湘宁 盖颖 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第10期63-69,共7页
【目的】将毛白杨编码4CL1(4-香豆酸辅酶A连接酶)和CCR(香豆酰辅酶A还原酶)的基因连接在一起形成融合基因4CL1-CCR,在体外对其编码的融合酶4CL1-CCR进行活性分析,发现此融合酶具有4CL1和CCR的催化活性,并在大肠杆菌体内证明4CL1-CCR可... 【目的】将毛白杨编码4CL1(4-香豆酸辅酶A连接酶)和CCR(香豆酰辅酶A还原酶)的基因连接在一起形成融合基因4CL1-CCR,在体外对其编码的融合酶4CL1-CCR进行活性分析,发现此融合酶具有4CL1和CCR的催化活性,并在大肠杆菌体内证明4CL1-CCR可以高效催化香豆酸等酚酸生成相应的醛。在前期研究基础上,本研究将融合基因转化烟草,对转基因烟草植株的木质素各单体的组成和木质部形态进行分析,以揭示融合基因在植物体内的功能。【方法】用硫酸解法结合GC-MS分析烟草茎中各个单体的含量;间苯三酚染色法和木质素由紫外激发荧光法用于观测细胞的木质化状态;并通过半定量PCR法对转基因烟草中参与木质素合成关键基因的表达进行分析。【结果】与野生型烟草相比,转基因烟草茎中木质素G+S总量增加10.89%~36.44%;其中转基因烟草中G型木质素单体含量显著增多,S型单体含量无明显变化。显微结构观察可见,转基因烟草木质部宽度增加,细胞壁显著增厚,木质素沉积状态没有变化,表现为高密度木质素区域仍然为细胞角隅和复合胞间层,而低密度区域为次生细胞壁。半定量PCR分析显示在转基因烟草中C3H、CAD和COMT的表达量较野生型烟草均有不同程度的提高,而由G型木质素单体向S型木质素单体转化的关键基因F5H的表达没有显著变化。【结论】人工融合基因4CL1-CCR可以在植物中表达并发挥其功能,在未改变木质素密度分布的前提下,增加烟草茎细胞中木质部细胞数量和木质素的含量,并使细胞壁增厚。 展开更多
关键词 4CL1 ccr 融合基因 木质素
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石榴肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达分析 被引量:13
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作者 董丽丽 龚凌燕 +2 位作者 陈磊 涂佳丽 张水明 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期747-753,共7页
[目的]肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)是木质素合成的关键酶。本文旨在通过克隆和鉴定石榴CCR基因(Pg CCR)来探究石榴木质素的合成机制以及培育软籽石榴新品种。[方法]以石榴品种‘红玉石籽’(Punica granatum‘Hongyushizi’)籽粒为材料... [目的]肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)是木质素合成的关键酶。本文旨在通过克隆和鉴定石榴CCR基因(Pg CCR)来探究石榴木质素的合成机制以及培育软籽石榴新品种。[方法]以石榴品种‘红玉石籽’(Punica granatum‘Hongyushizi’)籽粒为材料,利用RACE和RT-PCR的方法,获得Pg CCR基因的全长序列。通过实时荧光定量PCR分析Pg CCR基因在不同品种、不同组织、籽粒不同发育时期的表达水平。[结果]Pg CCR基因c DNA全长序列1 017 bp,编码338个氨基酸,包含被认为是CCR蛋白催化位点的保守序列KNWYCYGK。系统进化树分析表明,Pg CCR与其他物种起源相同,而与葡萄Vv CCR的亲缘关系最近。Pg CCR基因在不同品种的石榴籽粒中均有表达,其中‘红玉石籽’中表达较高,‘会理软籽’和‘突尼斯软籽’中表达量较低。Pg CCR在叶、花、茎中均有表达,茎中的表达量最高,而叶片中的表达量最低。Pg CCR在‘红玉石籽’籽粒的不同时期均有表达,20-80 d相对表达量逐步上升,并在80 d时达到峰值,80 d以后表达量逐渐下降。[结论]克隆得到石榴CCR基因,其表达水平与木质素的合成及含量有一定相关性。 展开更多
关键词 石榴 肉桂酰辅酶A还原酶基因(ccr) 基因克隆 表达分析
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌染色体盒的研究进展 被引量:8
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作者 孙丹丹 马笑雪 +1 位作者 胡建 罗恩杰 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2011年第3期73-80,共8页
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的产生是由甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌(MSSA)获得外源性的SCCmec所致。MRSA菌株可以产生一种新的青霉素结合蛋白PBP2a,PBP2a降低了与β-内酰胺类抗生素的亲合力,从而对β-内酰胺类抗生素产生耐药性。P... 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的产生是由甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌(MSSA)获得外源性的SCCmec所致。MRSA菌株可以产生一种新的青霉素结合蛋白PBP2a,PBP2a降低了与β-内酰胺类抗生素的亲合力,从而对β-内酰胺类抗生素产生耐药性。PBP2a由mecA基因编码,mecA基因存在于葡萄球菌盒式染色体(Staphylococcal cassette chromosome mec,SCCmec)中,SCCmec是一种可移动的遗传元件,该元件还携带除mecA基因外的其他抗菌药物的耐药基因,造成多重耐药(Multidrug-resistance,MDR)。SCCmec目前主要分为8型,其中又分为若干亚型。SCCmec的基因型与MRSA的流行背景有关,不同地区的SCCmec基因分型分布可能不同。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 MECA基因 ccr基因 SCCmec元件 耐药性
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HIV-1感染者及其密切接触者HIV-1抗性基因的研究 被引量:2
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作者 张静 于修平 +3 位作者 李盛长 宋长芹 傅继华 尤向东 《山东大学学报(医学版)》 CAS 2004年第1期50-53,共4页
目的:研究CCR2-64I、SDF1-3'A2种HIV-1抗性基因在山东省HIV-1感染者及其密切接触者中的分布,以及它们对艾滋病病程进展和人群易感性的影响。方法:利用体外扩增PCR和限制性片段长度多态性分析RFLP检测目标人群中的HIV-1抗性基因,用... 目的:研究CCR2-64I、SDF1-3'A2种HIV-1抗性基因在山东省HIV-1感染者及其密切接触者中的分布,以及它们对艾滋病病程进展和人群易感性的影响。方法:利用体外扩增PCR和限制性片段长度多态性分析RFLP检测目标人群中的HIV-1抗性基因,用统计学方法分析基因分布频率与病程进展和易感性的关系。结果:CCR2-64I、SDF1-3'A的突变频率分别为23.64%、23.94%,含SDF1-3'A1的患者平均潜伏期为(8.33±1.16)年,含CCR2-64I患者平均潜伏期为(8.94±1.17)年,野生纯合子患者为(7.42±1.33)年。结论:本研究首次阐明了CCR2-64I、SDF1-3'A在山东省HIV-1感染者及其密切接触者中分布的特点,并发现2种抗性基因的存在均可延缓感染者的病程。 展开更多
关键词 人免疫缺陷病毒I型 受体 ccr2 抗性基因
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TNF-α及CCR5Δ32基因多态性与A(H1N1)pdm09相关性的Meta分析 被引量:1
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作者 陈涛 肖梦 +3 位作者 禇堃 唐晓君 杨静 舒跃龙 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1909-1914,共6页
目的探讨肿瘤坏死因子-α(TNF-α)及CCR5Δ32基因多态性与A(H1N1)pdm09的相关性。方法全面检索PubMed、Cochrane Library、OVID、EBSCO、Web of Science于2019年2月7日及以前发表的相关文献,收集TNF-α及CCR5Δ32基因多态性与A(H1N1)pd... 目的探讨肿瘤坏死因子-α(TNF-α)及CCR5Δ32基因多态性与A(H1N1)pdm09的相关性。方法全面检索PubMed、Cochrane Library、OVID、EBSCO、Web of Science于2019年2月7日及以前发表的相关文献,收集TNF-α及CCR5Δ32基因多态性与A(H1N1)pdm09相关的观察性研究,并按照NOS量表进行严格地质量评价,采用Revman 5.0和Stata 11.0软件进行Meta分析。结果经筛选,共8篇符合排除纳入标准的研究被纳入本次Meta分析,结果显示,TNF-α的基因多态性与A(H1N1)pdm09的发病风险可能具有相关性。rs361525位点携带A等位基因的患者A(H1N1)pdm09是G等位基因的2.25倍(A vs.G:OR=2.25,95%CI:1.09~4.65,P=0.03);rs361525位点AA基因型的携带者感染A(H1N1)pdm09的可能性分别为GG基因型、AG+GG基因型携带者的4.34倍(95%CI:1.65~11.41,P=0.003)、4.38倍(95%CI:1.67~11.48,P=0.003)。rs361525位点的AA+AG基因型可能是人群感染A(H1N1)pdm09的危险因素(rs1800750:AA+AG vs.GG:OR=2.42,95%CI:1.24~4.71,P=0.01)。亚组分析的结果提示,rs361525位点的A等位基因、AA+AG基因型是高加索人种感染A(H1N1)pdm09的危险因素,AA基因型是墨西哥人种感染A(H1N1)pdm09的危险因素(P<0.05)。CCR5的基因多态性与A(H1N1)pdm09的严重程度均无统计学意义(P>0.05)。结论TNF-α基因的rs361525位点具有等位基因A或者AA基因型,或rs1800750位点具有基因型AA+AG的人群可能更易感染A(H1N1)pdm09。 展开更多
关键词 肿瘤坏死因子-Α ccr 基因多态 流行性感冒
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌SCCmec中ccr复合体基因型分析 被引量:1
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作者 孔秀凤 王磊 +5 位作者 王淑香 郭文学 王玉宝 刘德梦 宋诗铎 祁伟 《国际流行病学传染病学杂志》 CAS 2009年第1期12-14,共3页
目的了解MRSA临床株葡萄球菌盒染色体mec(SCCmec)中盒染色体重组酶(ccr)复合体型别的特点。方法收集MRSA临床株78株,应用多重引物PCR扩增ccr复合体各型中的特异性序列,确定ccr型别。结果78株MRSA中,1株ccr1(1.28%)、3株ccr2... 目的了解MRSA临床株葡萄球菌盒染色体mec(SCCmec)中盒染色体重组酶(ccr)复合体型别的特点。方法收集MRSA临床株78株,应用多重引物PCR扩增ccr复合体各型中的特异性序列,确定ccr型别。结果78株MRSA中,1株ccr1(1.28%)、3株ccr2(3.85%)、11株ccr3(14.10%)、3株ccr5(3.85%)。52株同时携带两种及以上ccr基因,其中50株携带ccr3、ccr5(64.10%)、1株携带ccr2、ccr5(1.28%)、1株携带ccr2、ccr3、ccr5(1.28%),另有8株未检测到ccr基因。结论本研究中MRSA的ccr基因型以ccr3、ccr5复合型为主,并可能存在一些新型ccr复合体。 展开更多
关键词 甲氧西林 葡萄球菌 金黄色 SCCMEC ccr基因复合体
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