cffDNA浓度低NIPT检测失败样本的相关因素和妊娠结局分析

目的探讨分析胎儿游离DNA(cffDNA)浓度低无创产前基因检测(NIPT)检测失败样本的相关因素和妊娠结局。方法回顾性收集在2017年至2022年期间在广东省妇幼保健院接受NIPT检测,经两次采集外周血均因cffDNA浓度低NIPT检测失败的样本信息,包括孕妇的临床资料、产前诊断结果、超声结果以及妊娠结局。评估导致cffDNA浓度低相关因素以及后续残余风险。结果两次采血因cffDNA浓度低NIPT检测失败标本39例,其中双胎10例(25.64%),双胎之一停育/减胎7例(17.95%)。接受介入性产前诊断13例(33.33%),均未检出胎儿染色体异常。孕期超声发现胎儿发育异常9例(23.08%),胎儿宫内发育迟缓6例(15.38%)。所有孕妇均追踪到妊娠结局,其中早产10例(25.64%),自然流产2例(5.13%)。结论对于NIPT检测失败的病例,应明确原因,孕期出现并发症和不良妊娠结局风险增加,应建议接受进一步的遗传咨询、产前诊断和定期超声监测胎儿生长发育。

孕母血中cffDNA浓度与HCG及PAPP-A相关性的研究

目的建立临床检测孕妇外周血中游离胎儿DNA(cell-free fetal DNA,cffDNA)浓度的方法,并比较早孕母血中cffDNA浓度与人绒毛膜促性腺激素(Human chorionic gonadotropin,HCG)及妊娠相关蛋白-A(Pregnancy associated plasma protein-A,PAPP-A)的相关性。方法 (1)用Illumina Hi Seq 2000测序平台进行大规模基因并行测序,利用ELAND软件将其测序得到的原始数据与人类参考基因组进行比对,获得在参考序列上去重复序列的唯一位置的DNA序列,即唯一序列(Unique read),比对后获得的唯一序列不得少于2×106个序列数;(2)运用时间分辨免疫荧光法定量测定PAPP-A含量及游离β-h CG含量。结果建立检测cffDNA浓度的方法,并得出cffDNA,HCG及PAPP-A浓度的相关性;HCG与PAPP-A及cff NDA均呈不显著正相关;PAPPA与cffDNA呈显著正相关。结论成功建立运用第二代测序技术检测孕妇外周血中游离胎儿DNA的方法,该方法将可用于无创性产前诊断,亦可将cffDNA,HCG及PAPP-A三者的联合检测用于早孕期产前筛查。

基于胎儿游离DNA的地中海贫血无创产前诊断的研究进展

重型地中海贫血(地贫)目前尚无有效治疗措施,通过产前诊断阻止重型患儿出生是国内外公认的首选预防措施。目前,地贫的产前诊断仍依赖于有创的方法,即绒毛活检、羊水穿刺和脐静脉血穿刺,存在一定的宫内感染和流产风险,安全、无创、快速和准确的地贫产前诊断方法对高发区意义重大。孕妇外周血胎儿游离DNA(cffDNA)的发现,下一代测序(NGS)的快速发展与应用,使无创产前DNA检测(NIPT)成为现实。目前,利用cffDNA检测胎儿13、18和21号染色体非整倍体的NIPT技术已经成熟应用于临床,但地贫的NIPT仍处于研究探索阶段。文章主要基于cffDNA和NGS的地贫NIPT研究进展进行综述。

第二代测序技术与无创产前诊断

孕妇外周血中胎儿游离DNA(cell free fetal DNA,cffDNA)的发现开辟了无创产前诊断的新篇章,借助各种分子诊断技术针对cffDNA进行胎儿染色体疾病、遗传性疾病以妊娠相关疾病的研究迅速成为热点。以高通量、自动化为显著特征的第二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术诞生,极大加速了cffDNA的实验室研究进展。目前基于NGS平台,建立的胎儿21/18/13三体综合征的产前基因诊断技术已应用于临床,其他如性染色体非整倍体、双胎妊娠染色体非整倍体、胎儿染色体结构异常疾病以及孟德尔单基因遗传病的研究也因NGS的出现获得了显著的进步。本文就NGS的基本原理、cffDNA的生理特性及NGS在无创产前诊断研究中的进展进行综述。

无创产前基因检测技术在胎儿染色体非整倍体筛查中的应用研究

目的 探讨高通量测序平台的无创基因检测技术应用于产前诊断的可行性。方法 选择2012年4月到2013年5月在广东省妇幼保健院产前诊断中心就诊,孕龄12~32周的3711例单胎妊娠高危孕妇,记录临床指征、年龄、孕周等数据。采用高通量测序平台的无创产前基因检测技术对其外周血游离胎儿DNA进行分析。检测结果为高危的孕妇行羊膜腔穿刺或脐血穿刺术进行胎儿染色体核型分析。结果 3711例孕妇中游离胎儿DNA高通量基因测序技术检测出74例染色体高风险胎儿,羊水/脐血核型分析证实其中59例为染色体异常,分别为41例21-三体和8例18-三体,4例13-三体,5例性染色异常,1例其他常染色异常,1例21-三体和7例其他染色体异常证实为假阳性。结论 利用高通量测序平台的无创产前基因检测技术可快速、准确地检测出胎儿13、18、21染色体非整倍体异常,其敏感性、特异性与染色体核型分析技术具有较高的一致性。但是对于其他染色体异常准确性还有待技术完善来进一步提高,对于染色体微缺失、微重复的检测也日益受到众多专家学者的关注,这也是我们以后研究的方向之一。

α-地中海贫血无创产前诊断研究进展

α-地中海贫血是我国南部常见的单基因遗传病,其中以--SEA缺失型携带率最高,纯合的--SEA可致严重的胎儿贫血,可发生宫内死亡或在出生后24小时内死亡,重型地中海贫血尚无有效的治疗方法。目前常依赖有创产前诊断方法明确胎儿基因型,从而避免患病胎儿出生,而羊水穿刺、绒毛活检等有创方法有一定的流产及宫内感染风险,迫切需要一种无创、安全、快速的产前诊断方法。随着孕妇血浆中胎儿游离DNA(cffDNA)的发现,无创产前诊断方法得以实现,并已应用于胎儿非整倍体及多种单基因遗传病的诊断中。本文主要综述α-地中海贫血的无创产前诊断的平台发展。

无创产前基因检测技术在产前筛查中的临床应用

目的探讨无创产前基因检测(noninvasive prenatal genetic testing,NIPT)在胎儿染色体非整倍体疾病中的临床应用。方法选择2015年11月至2017年6月赤峰生殖健康专科医院确诊的高危孕妇3 929例和一般孕妇1667例,共5 596例,对其外周血中游离胎儿DNA(cell-free fetal DNA,cff DNA)进行测序分析,评估染色体非整倍体疾病的风险率,对高风险孕妇进行羊水穿刺以确诊。结果 NIPT结果高风险孕妇共54例,占调查资料总数的0.96%,包括21-三体33例、18-三体8例、13-三体3例,X染色体疑似异常10例。54例高风险孕妇中32例进行了羊水穿刺,19例直接引产,2例胎停育,1例未做羊水穿刺已生正常。结果显示NIPT的检出率为100%,准确率为85.2%。结论NIPT对孕妇外周血中cff DNA的检测准确率达85.2%,其高准确性、无创性等优点适合大规模的产前筛查。

双胎妊娠中无创产前检测的胎儿游离DNA浓度特征及检测失败原因分析

目的分析双胎妊娠中无创产前筛查检测的胎儿游离DNA浓度及检测失败原因,探讨无创产前基因检测(noninvasive prenatal testing,NIPT)在双胎妊娠中的筛查效果和临床价值。方法选择2017年11月至2023年6月接受NIPT产前筛查的1685例双胎孕妇和109784例单胎孕妇作为研究对象,对行NIPT检测孕妇的血浆中胎儿游离DNA(cell free fetal DNA,cffDNA)浓度情况和检测失败原因及双胎妊娠对三大目标染色体的筛查效果进行分析。结果1685例双胎妊娠孕妇中NIPT检测成功1669例,检测成功率为99.05%,检测失败16例,检测失败率为0.95%,cffDNA浓度均在0.84%~41.22%,平均循环游离DNA(cffDNA)浓度为(10.30±4.75)%。109784单胎妊娠孕妇NIPT检测成功109335例,检测成功率为99.59%,检测失败总计有449例,检测失败率为0.41%,cffDNA浓度均在0.94%~49.83%,平均cffDNA浓度为(9.52±3.92)%。双胎妊娠孕妇中有11例检测结果提示高风险,筛查阳性率为0.66%,其中确诊7例,阳性预测值为63.63%(7/11)。结论NIPT是双胎妊娠目标染色体筛查的重要手段,但仍存在假阳性、检测失败等局限性,其检测失败率高于单胎妊娠。

超顺磁性纯化磁珠筛选胎儿游离DNA技术在无创产前筛查中的应用比较

目的比较2种超顺磁性纯化磁珠筛选富集胎儿游离DNA(cffDNA)的技术在无创产前检测(NIPT)中的效能,探讨改良筛选富集游离DNA(cfDNA)技术的临床应用价值。方法回顾性分析2017年12月至2022年9月在北京市海淀区妇幼保健院接受NIPT检测的26252例孕妇的资料,根据磁珠筛选cffDNA的方法将其分为常规组(10573例)和改良富集组(15679例)。对NIPT提示高风险的孕妇进行介入性产前诊断。随访所有孕妇的妊娠结局。从文库片段大小、cffDNA浓度、重复检测率和临床检验方法学评价常用指标等方面比较两种方法的检测效能。结果改良磁珠筛选富集法使游离DNA文库主峰的片段长度由常规法的294 bp减小至267 bp;cffDNA浓度由9.08%提升为21.86%(P<0.01);重复检测率由2.02%降低至0.740%(χ2=83.90,P<0.01);检测失败率由0.057%降至0.006%(P<0.05)。改良富集组在高风险及低风险人群中的复合PPV均略低于常规组(64.3%/76.1%和35.3%/45.5%),但组间无差异。常规组检测的高风险人群中出现1例21三体假阴性,改良富集组未出现假阴性。结论改良磁珠筛选富集法可显著提高cffDNA的相对浓度,降低NIPT检测的失败率及复检率,从而减少cffDNA浓度低造成的假阴性,改善了NIPT检测的整体性能。

无创DNA检测在唐氏综合征产前筛查中的作用

目的:通过比较无创DNA检测和孕中期血清学筛查两种方法的筛查阳性率,从而肯定无创DNA检测在唐氏综合征产前筛查中的实用价值。方法:对500例单胎孕妇进行血清标记物(AFP+β-HCG)二联指标检测,应用配套软件计算唐氏综合征风险;对496例孕妇外周血中的游离DNA片段(含胎儿游离DNA)进行高通量测序,并将测序结果进行生物信息学分析,得出胎儿发生染色体非整倍体的风险率,并追踪胎儿和孕妇的情况。结果:唐氏综合征血清筛查组高危孕妇22例、阳性率为4.4%,假阳性率4.2%;无创DNA检测组筛查阳性孕妇3例,阳性率为0.6%,唐氏综合征检出率为100%。两种方法用于唐氏综合征产前筛查的差异有显著性(P<0.01)。结论:无创DNA检测适用范围广、准确率高,是产前筛查是唐氏综合征的有效方法。

利用孕妇外周血浆中小片段游离胎儿DNA进行β-地中海贫血无创性产前诊断

目的利用cffDNA对胎儿进行广西、广东地区常见的17种β-地中海贫血基因型的检测,与传统创伤性产前诊断相比较,探讨该方法的准确性和可行性。方法针对广西、广东地区常见的β-地中海贫血突变的基因型设计三对不同引物,并用生物素标记。对cffDNA进行二次PCR反应后,使用反向斑点杂交(revert dot-blot hybridization,RDB)检测胎儿的β-珠蛋白基因型,与创伤性产前诊断结果比较,观察准确率。结果37例cffDNA标本检测中,检出重型β-地中海贫血19例,轻型β-地中海贫血11例,正常7例,与创伤性产前诊断结果相比较出现3例误诊,准确率为91.9%(34/37)。结论利用cffDNA进行β-地中海贫血的检测,可能出现母源性DNA背景的污染,当胎儿基因型与母亲基因型相同时,必须提高警惕,进一步分析或者复查。因为该技术取样容易,对孕妇胎儿无风险,不受孕期时间影响,易为与孕妇接受,因此进一步改进该技术后有望可用于β-地中海贫血的诊断。

孕妇外周血中胎儿游离DNA在无创产前唐氏综合征诊断的应用探讨

目的探讨孕妇外周血中胎儿游离DNA(cff DNA)在临床无创产前唐氏综合征(21-三体)诊断中的应用。方法收集1735例孕12-24w的单胎孕妇外周血,抽提外周血DNA,利用新一代高通量测序技术进行检测和生物信息学分析,并对21-三体高风险孕妇选择羊水或脐带血染色体核型分析进行对照。结果 1735例标本中新型无创产前技术检测到21-三体阳性样本12例,经染色体核型分析确诊12例,无创产前技术对21-三体检测的灵敏度和特异度均为100%。结论 cff DNA进行临床无创产前21-三体诊断在产前筛查中具有广泛的应用前景。

母血浆游离胎儿DNA检测在无创性产前诊断中的应用

母血浆细胞游离胎儿DNA(cell-free fetal DNA,cffDNA)在无创性产前诊断中的研究取得了很大的进展,如文献报道可用于诊断性连锁遗传病、Rh血型不合、基因组印迹和某些染色体疾病等。目前的研究主要是对常见非整倍体疾病的诊断,已有多种通过cffDNA的检测对非整倍体疾病进行无创性产前诊断的方法见于报道。

肽核酸夹提高孕妇血浆胎儿父源性β珠蛋白突变基因检出率的研究

目的探讨利用肽核酸夹提高孕妇血浆胎儿父源性β珠蛋白突变基因的检出率，为地中海贫血（地贫）无创性产前诊断提供依据。方法选择妊娠7～20周的孕妇共38例，丈夫基因型为41-42M／N，而孕妇基因型正常或为其他β地贫基因突变。以羊水、脐带血或出生后婴儿外周血标本的检测结果作为金标准对照。用QIAamp DNA Blood Mini试剂盒提取孕妇血浆总游离DNA，再将总游离DNA经过10g／L琼脂糖凝胶电泳后回收长度100—300bp的DNA，然后应用回收后的DNA并加肽核酸夹进行PCR扩增，最后采用反向斑点杂交确定基因型并与金标准检测结果进行比较。同时设置扩增方法不同的A、B对照组，对照组A应用总游离DNA并加肽核酸夹，对照组β应用回收后的DNA不加肽核酸夹进行验证。结果共对38例孕妇外周血浆DNA标本的PCR产物进行杂交检测并和金标准结果进行比较。21例金标准基因型为41-42M／N的标本中，实验组、对照组A和B分别有19、8、12例检出41-42M，敏感度分别为90．5％、38．1％和57．1％；17例金标准基因型正常（N）的标本中，实验组、对照组A和B分别有1、1、2例出现假阳性，特异度分别为94．1％、94．1％和88．2％；准确度分别为92．1％、63．2％和71．1％。进行McNemar X2检验两两比较，实验组与对照组A和B的敏感度和准确度差异均有统计学意义（P〈0．05）。结论利用肽核酸夹对孕妇外周血浆中小片段游离胎儿DNA检测胎儿父源性β-珠蛋白基因突变的方法，不仅具有较高的敏感度、特异度和准确度，而且方法简便、实用。

无创产前基因检测对预防胎儿染色体非整倍体的应用探讨

目的统计无创产前基因检测对唐氏综合征的检测效率和探讨其对唐氏综合征的预防应用。方法收集1698例孕12-24周的单胎孕妇外周血并提取其游离DNA,利用新一代高通量测序技术进行检测并运用生物信息学分析其21-三体的概率,对检测结果为21-三体高风险孕妇进行羊水或脐带血染色体核型分析,评估该技术对21-三体检测的敏感性和特异性。结果 1698例样本,无创检出21-三体高风险样本13例,经染色体核型分析确诊11例,无创产前基因检测对21-三体检测的灵敏度100%和特异度99.9%。结论游离DNA(cff DNA)进行临床无创产前21-三体诊断在产前筛查中具有广泛的应用前景。

利用RASSF1A位点检测母体血浆中胎儿SNP分型

目的探讨利用母体血浆中高甲基化RASSF1A位点进行胎儿SNP分型的应用价值。方法随机收集10个未孕健康妇女和45例不同孕期(早期5例、中期20例、晚期20例)孕妇的血样本及相应胎儿组织(绒毛组织、羊水、胎盘组织);利用甲基化敏感限制性内切酶BstUI酶切后进行PCR,产物进行血细胞、血浆和胎儿组织(绒毛或胎盘)DNA RASSF1A序列的甲基化模式检测,并采用直接测序法对SNP rs4688725位点进行分型。结果经BstUI酶消化,RASSF1A序列在母体血细胞中均未检出,而在绒毛或胎盘组织中均能检出;在45名孕妇血浆中,RASSF1A序列均能被检出,且序列内的SNP分型与相应胎儿组织一致;在10名非孕妇女血浆中均未检出RASSF1A序列。结论母体和胎儿DNA中RASSF1A基因启动子区域的甲基化模式存在差异,可用于对母体血浆中的游离胎儿DNA进行SNP分型。

无创产前检测的发展进程

产前胎儿健康状况的测试和评估通常分为侵入性和非侵入性两种手段,常规的筛查方法包括母亲血液样本的生化检查和影像学超声检查。侵入性方法包括羊膜穿刺术(amniocentesis),绒毛膜取样(chorionic villus sampling,CVS),脐血取样等,这些方法虽能准确地诊断,但可能造成胎儿损伤,导致产妇流产等不良后果。随着基因组测序技术的发展,一种新的非侵入性检测方法,无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)无疑开辟了产前诊断的新纪元。NIPT是对母体外周血浆中胎儿游离DNA进行检测分析,从而判断胎儿是否患遗传性疾病的一种方法。NIPT的高灵敏度和特异性具有替代目前使用血清筛查和侵入性诊断的前景。随着科技的进步,未来NIPT在临床上应用的范围会越来越广泛。本文中针对母亲血中胎儿游离DNA,NIPT结合下一代测序检测遗传性疾病,母亲血浆中游离RNA,NIPT国内外临床应用等方面做简单介绍,对其今后发展趋势做出展望。

孕妇外周血游离胎儿DNA诊断胎儿染色体异常的研究进展

胎儿染色体异常是我国当前控制和预防出生缺陷的重点目标疾病。近年来开展的孕妇外周血游离胎儿DNA(cell-free fetal DNA,cff DNA)检测这一新技术对诊断胎儿染色体异常具有很高的敏感性和特异性,是对原有产前筛查和产前诊断技术的有效补充。本文就孕妇外周血游离胎儿DNA诊断胎儿染色体异常的研究进展进行综述。