期刊文献+
共找到212篇文章
< 1 2 11 >
每页显示 20 50 100
cDNA Cloning and Expression Analysis of the Chalcone Synthases (CHS) in <i>Osmanthus fragrans</i> 被引量:2
1
作者 Yan Ma Xiurong Xu +2 位作者 Ningning Zhang Jing Guo Dekui Zang 《American Journal of Molecular Biology》 2017年第1期41-48,共8页
In the flavonoid biosynthesis pathway, Chalcone synthase (CHS) is involved in the formation of the pigment and has been shown to be a rate-limiting enzyme for the synthesis of flavonoids. In this study, a PCR approach... In the flavonoid biosynthesis pathway, Chalcone synthase (CHS) is involved in the formation of the pigment and has been shown to be a rate-limiting enzyme for the synthesis of flavonoids. In this study, a PCR approach was used to clone a Chalcone synthases cDNA from flower of sweet osmanthus “Chenghong Dangui” and it was designated as OfCHS (O. fragrans, CHS). The cDNA was 1383 bp long and a coding sequence (CDS) of 1173 bp encoding a polypeptide of 391 amino acids with an estimated molecular mass of 39.9 kDa. The theoretical isoelectric point was 6.23. Phylogenetic analysis demonstrated that OfCHS clustered with Olea europaea, Solenostemon scutellarioides, Perilla frutescens, Antirrhinum majus and Digitalis lanata. We also detected the expression of OfCHS in different tissues in “Dangui” and in two cultivars with varied coloration, “Zi Yingui” and “Chenghong Dangui” at different floral stages using quantitative real-time PCR. We observed that OfCHS transcript was higher in leaves than in petals in “Dangui”. The transcripts of OfCHS in “Zi Yingui” petals were higher than those in “Dangui” at three stages especially at xianyan stage and there was no significant difference between the two cultivars in the full flowering stage. “Chenghong Dangui” has a relatively high anthocyanin content compared to “Zi Yingui”. The relative amount of anthocyanin of “Chenghong Dangui” initially increases, and then decreases during the bloom period. However, the expression of CHS is the highest at the initial flowering stage. These data suggest that the OfCHS does not play a key role in the accumulation of total flavonoid in this cultivar. These data could contribute to explain the different accumulation of flavonoids in petals of the two cultivars. 展开更多
关键词 OSMANTHUS fragrans chalcone synthaseS Expression ANALYSIS Content of Anthocyanin
下载PDF
Isolation and expression analysis of NtCHS6, a new chalcone synthase gene from Nicotiana tabacum 被引量:1
2
作者 CHEN Shuai ZHANG Yin-chao +6 位作者 PAN Xu-hao LI Yi-ting CUI Li-jie WU Feng-yan CAO Mo-ju YANG Ai-guo PAN Guang-tang 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2017年第7期1443-1450,共8页
Chalcone synthases (CHS, EC 2.3.1.74) are key enzymes that catalyze the first committed step in flavonoid biosynthesis. In this study, we isolated a chalcone synthase, named NtCHS6, from Nicotiana tabacum. This synt... Chalcone synthases (CHS, EC 2.3.1.74) are key enzymes that catalyze the first committed step in flavonoid biosynthesis. In this study, we isolated a chalcone synthase, named NtCHS6, from Nicotiana tabacum. This synthase shared high homology with the NSCHSL (Y14507) gene and contained most of the conserved active sites that are in CHS proteins. The phylogenetic analysis suggested that NtCHS6 protein shared a large genetic distance with other Solanaceae CHS proteins and was the most closely-related to an uncharacterized CHS from Solanum lycopersicum. The expression analysis indicated that NtCHS6 was abundantly expressed in leaves, especially in mature leaves. By scrutinizing its upstream promoter sequences, multiple cis-regulatory elements involved in light and drought responsive were detected. Furthermore, NtCHS6 expression decreased significantly under dark treatment and increased significantly under drought stress suggested that NtCHS6 expression exhibited both light responsiveness and drought responsiveness, and important roles in ultraviolet protection and drought tolerance. Our results might play 展开更多
关键词 chalcone synthase Nicotiana tabacum leaf-specific expression light responsiveness drought responsiveness
下载PDF
木薯查尔酮合酶MeCHS基因家族特征与表达分析
3
作者 安飞飞 齐剑雄 +3 位作者 陈松笔 罗秀芹 蔡杰 薛晶晶 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第12期2384-2391,共8页
查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)是类黄酮合成途径的第一个限速酶,在植物花色形成、生长发育以及非生物胁迫中发挥着重要作用。为明确木薯MeCHS基因家族的特性及在木薯块根采后腐烂(PPD)中的表达,本研究利用生物信息学方法对木薯MeCH... 查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)是类黄酮合成途径的第一个限速酶,在植物花色形成、生长发育以及非生物胁迫中发挥着重要作用。为明确木薯MeCHS基因家族的特性及在木薯块根采后腐烂(PPD)中的表达,本研究利用生物信息学方法对木薯MeCHS基因家族成员进行理化性质、蛋白质结构等分析。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测MeCHS基因在不同品种、不同组织及块根PPD过程中的表达情况,同时克隆并构建3个高表达的MeCHS基因的亚细胞定位载体并进行烟草瞬时转化以确定其定位。在木薯基因组中共鉴定出5个MeCHS基因家族成员,蛋白质二级结构以α-螺旋和不规则卷曲为主。qRT-PCR分析发现:MeCHS基因表达具有明显的组织特异性,在茎中表达水平最高;在木薯中主要表达的MeCHS基因为MeCHS1、MeCHS2和MeCHS3,且3个基因随着SC8块根贮藏时间的延长表达量逐步升高。将成功克隆得到的MeCHS1、MeCHS2和MeCHS3基因经农杆菌介导瞬时转化烟草下表皮细胞,显微观察表明3个基因均定位于细胞质,与预测结果相符。该研究结果可为进一步揭示木薯MeCHS基因家族的功能与提高木薯块根耐PPD能力提供理论依据。 展开更多
关键词 木薯 查尔酮合酶 QRT-PCR 克隆 表达分析
下载PDF
胭脂萝卜RsCHS1基因克隆及表达分析 被引量:1
4
作者 王川艺 黄红涛 +2 位作者 陈发波 郑张飞 方平 《河南农业科学》 北大核心 2023年第9期122-132,共11页
为解析RsCHS1基因在胭脂萝卜色素积累中的作用,以胭脂萝卜肉质根肉质cDNA为模板,同源克隆了RsCHS1基因的开放阅读框(ORF),采用生物信息学方法对RsCHS1蛋白的理化性质进行分析。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析了RsCHS1基因在胭脂萝卜... 为解析RsCHS1基因在胭脂萝卜色素积累中的作用,以胭脂萝卜肉质根肉质cDNA为模板,同源克隆了RsCHS1基因的开放阅读框(ORF),采用生物信息学方法对RsCHS1蛋白的理化性质进行分析。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析了RsCHS1基因在胭脂萝卜营养期叶、肉质根肉质和肉质根皮及花期花、荚果和肉质根肉质中的表达情况,同时构建RsCHS1基因过表达载体,异源转化拟南芥,进行RsCHS1基因功能验证。结果表明,克隆得到2个RsCHS1基因,其中RsCHS1-a基因ORF序列长765 bp,编码254个氨基酸;RsCHS1-b基因ORF序列长966 bp,编码321个氨基酸。编码蛋白二、三级结构预测显示,α-螺旋是RsCHS1主要结构元件,β-转角、片层结构、无规则卷曲分布于整个蛋白质中。qRTPCR结果表明,RsCHS1-a基因在肉质根肉质(26.8)、根皮(32.4)和花(6.7)中的相对表达量比叶(1.0)和果实(0.4)中高,RsCHS1-b基因在肉质根肉质(41.4)、根皮(41.9)和花(9.7)中的相对表达量比叶(1.0)和果实(0.6)中高,说明RsCHS1基因具有组织表达特异性。在拟南芥中过表达RsCHS1基因,发现转基因植株叶柄和茎累积大量花青素,表明RsCHS1基因在胭脂萝卜花青素积累中起到重要作用。 展开更多
关键词 胭脂萝卜 查尔酮合成酶基因(chs) 克隆 表达模式 花青素
下载PDF
葡萄CHS基因家族鉴定与表达分析 被引量:3
5
作者 成永娟 张明月 +2 位作者 曹雪璟 毛娟 陈佰鸿 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期861-874,共14页
【目的】明确葡萄查尔酮合成酶(chalconesynthase,CHS)基因家族响应外源激素和非生物胁迫的表达模式。【方法】利用生物信息学方法对葡萄CHS基因家族成员进行理化性质、系统进化、共线性、顺式作用元件等分析。采用实时荧光定量PCR(quan... 【目的】明确葡萄查尔酮合成酶(chalconesynthase,CHS)基因家族响应外源激素和非生物胁迫的表达模式。【方法】利用生物信息学方法对葡萄CHS基因家族成员进行理化性质、系统进化、共线性、顺式作用元件等分析。采用实时荧光定量PCR(quantitativereal-timePCR,qRT-PCR)检测VvCHS基因在外源激素和非生物胁迫下的表达情况,将筛选出的VvCHS3基因构建植物表达载体并进行烟草瞬时转化以确定其表达位置。【结果】在葡萄基因组中共鉴定出7个VvCHS基因成员,分布于5条不同的染色体上,蛋白质二级结构以α-螺旋和不规则卷曲为主。系统进化和基因对选择压表明,CHS基因家族基因可分为三大亚族,葡萄CHS基因家族与其他物种之间主要进行纯化选择。共线性分析表明,VvCHS3与VvCHS4、VvCHS3与VvCHS5、VvCHS4与VvCHS5之间存在共线性关系。顺式作用元件预测结果表明,大部分VvCHS基因成员可能同时对多种逆境胁迫有响应。qRT-PCR分析发现,VvCHS基因具有明显的组织特异性,在根中表达水平最高,茎中表达水平最低。在5mmol·L-1水杨酸(salicylicacid,SA)处理下,VvCHS3基因在茎中的表达水平显著高于对照,为对照的44.3倍,在0.1mmol·L-1茉莉酸甲酯(methyljasmonate,MeJA)处理下,VvCHS3基因在叶中显著上调表达,为对照的36.1倍。在400mmol·L-1NaCl处理下,VvCHS5基因在根中相对表达量高于对照,为对照的30.6倍。在4℃和10%聚乙二醇(polyethyleneglycol,PEG)处理下,VvCHS4基因在根中显著上调表达。成功克隆得到VvCHS3基因,经农杆菌介导瞬时转化烟草下表皮细胞,荧光倒置显微镜检测表明VvCHS3基因定位于细胞核和细胞膜,与预测结果相符。【结论】葡萄CHS基因家族参与SA和MeJA等外源激素的调控,同时响应低温、干旱和高盐胁迫。 展开更多
关键词 葡萄 查尔酮合酶 生物信息学 QRT-PCR 基因克隆
下载PDF
茶树CHS基因结构及编码区单核苷酸多态性分析 被引量:12
6
作者 张丽群 韦康 +3 位作者 王丽鸳 成浩 刘本英 龚武云 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期133-144,共12页
【目的】通过试验获得茶树CHS基因(CsCHS)gDNA序列,以进一步确定CsCHS基因结构;研究CsCHS编码区单核苷酸多态性,并结合茶树多酚含量进行关联分析,寻找基因中可能存在的与茶多酚含量存在显著或极显著相关关系的SNP位点。【方法】根据NCB... 【目的】通过试验获得茶树CHS基因(CsCHS)gDNA序列,以进一步确定CsCHS基因结构;研究CsCHS编码区单核苷酸多态性,并结合茶树多酚含量进行关联分析,寻找基因中可能存在的与茶多酚含量存在显著或极显著相关关系的SNP位点。【方法】根据NCBI数据库中已有CsCHS序列设计特异性引物,再分别以基因组DNA和cDNA为模板进行PCR扩增,经克隆、测序获得CsCHS1、CsCHS2、CsCHS3三个基因的gDNA和cDNA全长序列,通过序列比对方法确定CsCHS结构。利用Compute pI/Mw、SOPMA等软件对所得序列进行生物信息学分析,预测和比较CsCHS1、CsCHS2和CsCHS3三者蛋白质结构。以茶多酚含量差异较大的57份茶树品种为材料,分别以57份材料的cDNA为模板,用特异性引物进行PCR扩增,然后利用PCR产物直接测序法筛查CsCHS编码区序列的单核苷酸多态性。结合CsCHS编码区序列单核苷酸多态性和57份材料多酚含量,利用软件TASSEL进行关联分析,筛选基因中可能与茶多酚含量存在显著或极显著相关关系的SNP位点。【结果】试验获得CsCHS1、CsCHS2和CsCHS3的cDNA序列长度分别为1 277、1 320和1 242 bp,各自均包含一个长度为1 170 bp的开放阅读框;CsCHS1、CsCHS2和CsCHS3的gDNA序列长度分别为1 600、1 330和1 607 bp。通过gDNA序列和cDAN序列比对,结合真核生物内含子GT-AG法则,确定CsCHS1、CsCHS3分别包含2个外显子和1个内含子,内含子大小分别为323和356 bp,CsCHS2可能没有内含子。根据CsCHS1、CsCHS2和CsCHS3 cDNA序列推导三者对应氨基酸序列,比较三条氨基酸序列发现三者氨基酸同源性较高,达到92.6%—95.4%,CHS蛋白亚家族中的特征性保守位点在这三条序列中都能找到,生物信息学分析结果显示CsCHS1、CsCHS2和CsCHS3三者蛋白质结构高度相似。CsCHS1编码区序列中共发现71个SNP位点,SNP出现频率为1SNP/16.48 bp,无Indel,基因核苷酸多样性(π)值为0.01088;CsCHS2编码区序列中共发现55个SNP位点,SNP出现频率分别为1SNP/21.27 bp,CsCHS2核苷酸多样性(π)值(0.00530)明显低于CsCHS1;因扩增CsCHS3 cDNA序列的PCR反应成功率低,未对该基因遗传多样性进行分析。通过关联分析分别从CsCHS1和CsCHS2中找到2个和4个与茶叶多酚含量相关的SNP位点。【结论】CsCHS1和CsCHS3属于保守型CHS基因,且CsCHS1、CsCHS2和CsCHS3蛋白质结构高度相似,推测三者可能在茶树的不同部位或不同生长阶段发挥类似作用;CsCHS1和CsCHS2活跃,二者编码区内可能存在突变热点区。 展开更多
关键词 查尔酮合酶基因(chs) 单核苷酸多态性(SNP) tea plant (Camellia sinensis(L )) chalcone synthase gene (chs) single nucleotide polymorphism (SNP)
下载PDF
紫色马铃薯查尔酮合成酶基因(CHS)的克隆及分析 被引量:14
7
作者 胡朝阳 周友凤 +3 位作者 龚一富 金思 王何瑜 赵群芬 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期832-839,共8页
【目的】从紫色马铃薯中克隆CHS的cDNA全长序列,并分析其组织表达水平以及诱导剂处理后基因的表达与花青素含量积累之间的关系。【方法】采用RT-PCR和RACE方法克隆紫色马铃薯CHS的cDNA全长序列,通过在线软件进行核苷酸序列和氨基酸序列... 【目的】从紫色马铃薯中克隆CHS的cDNA全长序列,并分析其组织表达水平以及诱导剂处理后基因的表达与花青素含量积累之间的关系。【方法】采用RT-PCR和RACE方法克隆紫色马铃薯CHS的cDNA全长序列,通过在线软件进行核苷酸序列和氨基酸序列分析,半定量RT-PCR检测StCHS在紫色马铃薯组织中的表达特异性以及蔗糖和赤霉素处理后StCHS的表达。采用分光光度计法测定紫色马铃薯花青素含量。【结果】克隆获得紫色马铃薯CHS的cDNA全长1 490 bp,包含1 170 bp的ORF,该基因编码389个氨基酸。推测StCHS蛋白含有Cys164、Phe215、His303和Asn3364个活性位点,构成CHS蛋白的催化中心。StCHS的表达具有组织特异性,在茎、叶柄和叶中表达较强,在根、块茎和叶轴中几乎检测不到CHS的表达。赤霉素能促进CHS的表达从而促进花青素的积累;蔗糖能够显著促进紫色马铃薯花青素的积累,但对CHS的表达影响不明显。【结论】从紫色马铃薯中克隆获得CHS的cDNA全长序列,该基因表达具有组织特异性,StCHS是紫色马铃薯花青素合成途径中的一个限速酶基因。 展开更多
关键词 紫色马铃薯 查耳酮合成酶基因 花青素 赤霉素 蔗糖 基因表达
下载PDF
异黄酮合成代谢调控关键酶CHS、CHI的特性与研究前景 被引量:6
8
作者 李莉 孙欣 +1 位作者 马君兰 赵越 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期762-765,共4页
查尔酮合酶(Chalcone synthase,CHS)与查尔酮异构酶(Chalcone isomerase,CHI)是异黄酮合成途径中的两个关键酶,它们在植物中的表达效率直接影响到异黄酮的产量。本文综述了植物CHS、CHI的功能、特性、基因结构、进化以及基因表达调控等... 查尔酮合酶(Chalcone synthase,CHS)与查尔酮异构酶(Chalcone isomerase,CHI)是异黄酮合成途径中的两个关键酶,它们在植物中的表达效率直接影响到异黄酮的产量。本文综述了植物CHS、CHI的功能、特性、基因结构、进化以及基因表达调控等方面研究的新进展,并对CHS、CHI研究的应用前景进行了展望,在此基础上提出了从根本上提高异黄酮产量的可行途径以及一些亟代解决的问题。 展开更多
关键词 异黄酮 查尔酮合酶(chs) 查尔酮异构酶(chI)
下载PDF
转CiCHS基因拟南芥的黄酮代谢及抗氧化能力分析 被引量:5
9
作者 杨飞芸 刘坤 +2 位作者 崔爽 王瑞刚 李国婧 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期393-400,共8页
该研究克隆了中间锦鸡儿的查尔酮合成酶基因(CiCHS)并转入野生型拟南芥和tt4突变体,用qRT-PCR检测了转基因拟南芥中内源AtCHS基因的表达量,用分光光度法分析了转基因拟南芥的总黄酮、丙二醛含量及DPPH自由基清除能力,用HPLC法检测了转... 该研究克隆了中间锦鸡儿的查尔酮合成酶基因(CiCHS)并转入野生型拟南芥和tt4突变体,用qRT-PCR检测了转基因拟南芥中内源AtCHS基因的表达量,用分光光度法分析了转基因拟南芥的总黄酮、丙二醛含量及DPPH自由基清除能力,用HPLC法检测了转基因拟南芥的柚皮苷含量。结果显示:(1)转基因拟南芥中,内源AtCHS基因的表达量约为野生型的十分之一,总黄酮含量明显高于野生型;HPLC测得转基因株系中柚皮苷含量高于野生型;紫外照射处理前后转基因拟南芥中丙二醛积累量明显少于野生型。(2)转基因株系提取物对DPPH自由基清除能力显著高于野生型。(3)CiCHS基因互补拟南芥tt4突变体,转基因株系的种皮呈现浅棕色。研究表明,中间锦鸡儿CiCHS基因异源表达后生成了柚皮苷,使转基因植物的抗氧化性增强,部分恢复了tt4突变体的种皮颜色。 展开更多
关键词 中间锦鸡儿 查尔酮合成酶 柚皮苷 转基因拟南芥
下载PDF
大豆查尔酮合成酶(CHS)基因的克隆、表达及其在雪莲提取液中的代谢产物分析 被引量:19
10
作者 牛天敏 马会勤 陈尚武 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期58-63,共6页
以栽培大豆北丰12为材料,利用PCR方法克隆查尔酮合成酶(Chalcone synthase,CHS)全基因,采用SOE法克隆得到去掉内含子的查尔酮合成酶基因,核酸序列分析表明,该基因编码区长1170bp,编码390个氨基酸,与已报道的GMCHS8(GenBank:AY237728)的c... 以栽培大豆北丰12为材料,利用PCR方法克隆查尔酮合成酶(Chalcone synthase,CHS)全基因,采用SOE法克隆得到去掉内含子的查尔酮合成酶基因,核酸序列分析表明,该基因编码区长1170bp,编码390个氨基酸,与已报道的GMCHS8(GenBank:AY237728)的cDNA序列相似率达到97%。构建pET-GMCHS工程表达质粒,通过大肠杆菌E.coliBL21(DE3)高效表达系统表达大豆CHS。通过12%SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析表明,获得了分子量在42.9kDa的一条蛋白质特异表达带。液相色谱分析大肠杆菌E.coliBL21(DE3)高效表达系统在雪莲提取液中的代谢产物,样品和空白对照样对比,样品在273nm,3.0min出现新的吸收峰,质谱分析结果表明CHS利用雪莲提取液中代谢中间产物合成了新的黄酮类物质。 展开更多
关键词 GLYCINE MAX L.Merr. 查尔酮合成酶 基因克隆 表达E.coli 雪莲
下载PDF
金荞麦查尔酮合成酶基因CHS的克隆及序列分析 被引量:16
11
作者 蒙华 李成磊 +2 位作者 吴琦 邵继荣 陈惠 《草业学报》 CSCD 北大核心 2010年第3期162-169,共8页
采用同源克隆的方法获得金荞麦查尔酮合成酶基因(CHS)的保守片段554bp,进一步采用染色体步移法(genome-walking)和RT-PCR技术克隆到CHS基因的全长DNA序列和cDNA开放阅读框(ORF)序列。序列分析结果表明,金荞麦CHS基因DNA全长1650bp,含一... 采用同源克隆的方法获得金荞麦查尔酮合成酶基因(CHS)的保守片段554bp,进一步采用染色体步移法(genome-walking)和RT-PCR技术克隆到CHS基因的全长DNA序列和cDNA开放阅读框(ORF)序列。序列分析结果表明,金荞麦CHS基因DNA全长1650bp,含一个462bp的内含子;其cDNA编码区全长1188bp,编码395个氨基酸,命名为FdCHS,NCBI登录号为GU169470。该氨基酸序列与同为蓼科的掌叶大黄、虎杖CHS的氨基酸序列同源率分别达到94%和93%,且含有CHS活性位点和底物结合口袋位点等保守位点。 展开更多
关键词 金荞麦 查尔酮合成酶基因 克隆 序列分析
下载PDF
黄秋葵查尔酮合成酶基因AeCHS的克隆与表达分析 被引量:17
12
作者 王旭 韩春乐 +3 位作者 周亚楠 王春国 宋文芹 陈成彬 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期561-567,共7页
采用同源序列克隆和RT-PCR技术,首次克隆得到黄秋葵查尔酮合成酶基因(CHS)cDNA全长序列。序列分析表明,该序列全长1175 bp,包括一个1170 bp的完整ORF,编码389个氨基酸,命名为AeCHS。生物信息学分析表明,本研究所获得的AeCHS氨基酸序列... 采用同源序列克隆和RT-PCR技术,首次克隆得到黄秋葵查尔酮合成酶基因(CHS)cDNA全长序列。序列分析表明,该序列全长1175 bp,包括一个1170 bp的完整ORF,编码389个氨基酸,命名为AeCHS。生物信息学分析表明,本研究所获得的AeCHS氨基酸序列与同科植物黄蜀葵和陆地棉的同源性较高,分别达99.23%和97.44%,AeCHS推断的氨基酸序列含有CHS蛋白的标签序列GFGPG以及4个保守活性位点Cys164、Phe215、His303、Asn336。实时荧光定量PCR分析黄秋葵果实、花、叶片不同发育时期AeCHS基因的表达量,结果表明AeCHS基因在上述植物材料中表现出不同的表达模式:花>果实>叶片,具体到不同植物组织,AeCHS基因在生长6 d的果实、盛开的花朵以及植株顶端第4片叶子中的表达量较高。 展开更多
关键词 黄秋葵 查尔酮合成酶 基因克隆 荧光定量PCR
下载PDF
甜荞查尔酮合酶基因Chs的克隆及序列分析 被引量:10
13
作者 李成磊 张晓伟 +3 位作者 吴琦 赵海霞 陈惠 邵继荣 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期383-387,共5页
利用RT-PCR技术从甜荞中克隆得到查耳酮合酶(CHS)的cDNA开放阅读框(ORF)序列,命名为FeChs,NCBI登录号为GU172166.1。该序列长1 179 bp,编码392个氨基酸,与其它植物CHS基因的同源性为78%~92%,其推导的氨基酸序列含有CHS高度保守的活... 利用RT-PCR技术从甜荞中克隆得到查耳酮合酶(CHS)的cDNA开放阅读框(ORF)序列,命名为FeChs,NCBI登录号为GU172166.1。该序列长1 179 bp,编码392个氨基酸,与其它植物CHS基因的同源性为78%~92%,其推导的氨基酸序列含有CHS高度保守的活性位点及CHS的标签序列GFGPG。 展开更多
关键词 甜荞 查耳酮合成酶基因 克隆 序列分析
下载PDF
山茶属CHS基因家族的组成和分子进化初探(英文) 被引量:5
14
作者 杨俊波 田欣 +1 位作者 李德铢 郭振华 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2003年第6期659-666,共8页
用PCR方法从 4种山茶属 (Camellia) (山茶科 ) (Theaceae)植物的总DNA中分别扩增到CHS基因外显子 2的部分序列 ,经克隆、测序得到 16个该基因的序列 ,这些序列与来自GenBank的该属另一种植物的 3个序列及作为外类群的大豆 (Glycinemax (... 用PCR方法从 4种山茶属 (Camellia) (山茶科 ) (Theaceae)植物的总DNA中分别扩增到CHS基因外显子 2的部分序列 ,经克隆、测序得到 16个该基因的序列 ,这些序列与来自GenBank的该属另一种植物的 3个序列及作为外类群的大豆 (Glycinemax (L .)Merr.)的 2个序列一起进行分析。研究表明 ,山茶属CHS基因家族在进化过程中已分化为A、B、C三个亚家族 ,包括A1、A2、A3、B1、B2、C等 6类不同的基因成员 ;其中只有A2类成员为全部被研究的5种植物所共有 ,而其他 5类成员只在部分被研究的植物中发现 ;所有这些CHS成员具有很高的同源性 :在核苷酸水平上同一亚家族内基本上高于 90 % ,不同亚家族间也在 78%以上。从推测的氨基酸组成看 ,山茶属内CHS基因的功能已发生了分化 ,各类成员的碱基替代率有较大差异 ;从分子系统发育树和可能的氨基酸组成分析 ,山茶属具有新功能的基因成员是在经过基因重复后 ,或是由少数几个位点的突变而成 ,或是由逐渐积累的突变而形成的。进一步分析认为 ,该属CHS基因的分化直到近期还在活跃地进行 ,并且不同种的进化式样有一定的差别 。 展开更多
关键词 山茶属 chs基因家族 查尔酮合酶 分子进化
下载PDF
大豆类黄酮生物合成关键酶CHS基因的克隆及表达分析 被引量:8
15
作者 单丽伟 汪勇 +1 位作者 王美玲 王中华 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期2164-2168,共5页
根据查尔酮合成酶(CHS)基因DNA序列的保守区域设计了PCR引物,通过RT-PCR扩增从大豆叶片中克隆出3个参与类黄酮合成的CHS基因,分别命名为GmCHS1、GmCHS2和GmCHS3。在大豆基因组数据库进行同源比对,发现这3个基因分别与大豆基因组上Gm08g1... 根据查尔酮合成酶(CHS)基因DNA序列的保守区域设计了PCR引物,通过RT-PCR扩增从大豆叶片中克隆出3个参与类黄酮合成的CHS基因,分别命名为GmCHS1、GmCHS2和GmCHS3。在大豆基因组数据库进行同源比对,发现这3个基因分别与大豆基因组上Gm08g11610、Gm05g28610和Gm08g11520相对应,DNA序列一致性达95%~98%,推导氨基酸序列一致性达98%以上。进化分析显示,大豆中3个CHS蛋白与决明、菜豆CHS蛋白亲缘关系较近。表达分析显示,这3个基因在不同品种间有表达水平的差异,这可能是不同大豆品种中类黄酮含量不同的重要原因之一。 展开更多
关键词 大豆异黄酮 类黄酮 查尔酮合成酶
下载PDF
苦荞查尔酮合酶基因CHS的结构及花期不同组织表达量分析 被引量:13
16
作者 吴琦 李成磊 +3 位作者 陈惠 邵继荣 赵海霞 苟琳 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1151-1160,共10页
采用同源克隆、染色体步移和RT-PCR技术,首次克隆到苦荞查尔酮合酶基因(CHS)的全长DNA序列和cDNA开放阅读框(ORF)序列.序列分析表明,苦荞CHS DNA序列(GU172165)全长1 632 bp,含1个445 bp的内含子;cDNA编码区(HM852753)全长1 188 bp,编码... 采用同源克隆、染色体步移和RT-PCR技术,首次克隆到苦荞查尔酮合酶基因(CHS)的全长DNA序列和cDNA开放阅读框(ORF)序列.序列分析表明,苦荞CHS DNA序列(GU172165)全长1 632 bp,含1个445 bp的内含子;cDNA编码区(HM852753)全长1 188 bp,编码395个氨基酸,命名为FtCHS.生物信息学分析表明,FtCHS和推导的氨基酸序列与其它植物CHS基因同源率在95%以上,含有CHS多基因家族的标签序列(GFGPG)、活性位点、底物结合口袋位点和环化反应口袋位点.半定量RT-PCR分析苦荞花期FtCHS空间表达模型表明,其表达量未成熟种子>叶>茎>花>根>成熟种子,与苦荞芦丁含量的分布基本一致,具有组织特异性。 展开更多
关键词 苦荞 查尔酮合酶 基因克隆 半定量RT-PCR
下载PDF
向日葵查尔酮合酶HaCHS基因的克隆与逆境应答 被引量:15
17
作者 马立功 张匀华 +4 位作者 孟庆林 石凤梅 刘佳 李易初 王志英 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期19-26,共8页
为探讨查尔酮合成酶(CHS)基因在向日葵抗逆机制中的作用,在核盘菌诱导向日葵转录组文库的基础上,从向日葵耐病品种龙食葵2号中克隆了1个CHS的c DNA序列,该基因开放阅读框为1 197bp,编码398个氨基酸残基,分子量为43.54k D,等电点为6.17,... 为探讨查尔酮合成酶(CHS)基因在向日葵抗逆机制中的作用,在核盘菌诱导向日葵转录组文库的基础上,从向日葵耐病品种龙食葵2号中克隆了1个CHS的c DNA序列,该基因开放阅读框为1 197bp,编码398个氨基酸残基,分子量为43.54k D,等电点为6.17,命名为Ha CHS(Gen Bank登录号为KR921882)。氨基酸序列分析显示,Ha CHS具有CHS家族蛋白3个保守的功能活性位点(C^(167),H^(306)和N^(339))和特征多肽标签序列GVLFGFGPGL。系统进化分析表明,Ha CHS与菊科植物的大丽菊、紫茎泽兰和黑心菊等的CHS蛋白有很高的同源性,氨基酸序列相似性在93%~94%。实时荧光定量PCR结果表明,该基因在向日葵花中表达量最高为19.96,其次是盘、叶、茎和种,在根中的表达量最低为0.02。Ha CHS基因表达受核盘菌、创伤、4℃低温和茉莉酸(JA)等因素调控,但对脱落酸(ABA)和水杨酸(SA)处理的应答差异不显著。 展开更多
关键词 向日葵 查尔酮合酶基因 基因克隆 生物信息学分析 基因表达
下载PDF
苦荞查尔酮合酶基因FtCHS1启动子的克隆及分析 被引量:8
18
作者 赵学荣 杨燕 +4 位作者 雒晓鹏 姚攀锋 王安虎 赵海霞 吴琦 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期543-550,共8页
采用染色体步移技术,从苦荞(Fagopyrum tataricum Gaertn.)中克隆获得Ft CHS1基因5'端侧翼序列,共1038 bp,将其命名为PFt CHS1。生物信息学分析表明,PFt CHS1中A/T碱基含量为63.5%,含有4个可能的转录起始位点,分别位于起始密码子上... 采用染色体步移技术,从苦荞(Fagopyrum tataricum Gaertn.)中克隆获得Ft CHS1基因5'端侧翼序列,共1038 bp,将其命名为PFt CHS1。生物信息学分析表明,PFt CHS1中A/T碱基含量为63.5%,含有4个可能的转录起始位点,分别位于起始密码子上游-684^-734、-692^-742、-920^-970、-929^-979 bp处,该序列包含TATA-Box和CAAT-Box等启动子核心元件以及与光、低温和激素应答等相关的功能元件。本研究进一步构建了PFt CHS1-p BI101植物表达载体,并瞬时转化拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)叶片,结果显示该序列可驱动GUS报告基因的表达。低温(4℃)和光照(UV-B)处理苦荞幼芽后,采用荧光定量PCR技术分析Ft CHS1基因的表达量,结果表明PFt CHS1可响应低温和紫外环境胁迫,从而引起Ft CHS1基因表达量发生变化。 展开更多
关键词 苦荞 查尔酮合酶基因 启动子 序列分析
下载PDF
马铃薯野生种CHS基因cDNA的克隆与表达分析 被引量:10
19
作者 卢其能 杨清 +1 位作者 却志群 黄友明 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第5期17-22,共6页
设计简并引物,用RT-PCR法从马铃薯野生种(Solanum pinnatisectum)克隆到了CHS(Chalcone synthase,查尔酮合酶)基因的全长cDNA,并用半定量RT-PCR法进行了表达分析。序列分析表明,CHS基因编码一个389个氨基酸残基的多肽,在氨基酸水平... 设计简并引物,用RT-PCR法从马铃薯野生种(Solanum pinnatisectum)克隆到了CHS(Chalcone synthase,查尔酮合酶)基因的全长cDNA,并用半定量RT-PCR法进行了表达分析。序列分析表明,CHS基因编码一个389个氨基酸残基的多肽,在氨基酸水平上与其他茄科植物的同源性达到89%-93%,多重比较和系统发育分析均表明该基因为CHS家族中的一个新成员;检测了CHS基因的空间表达模式,该基因在花和匍匐茎中表达量最高,在根和块茎中没有检测到,这与花和匍匐茎呈淡紫色有花色苷合成,而根和块茎呈白色无花色苷合成是相一致的;发现在块茎中CHS受光诱导表达,光照后的第3天表达量最高,而在光照前检测不到,光照前块茎为白色,随着光照时间的延长,其表层颜色因积累花色苷而变成紫红色。 展开更多
关键词 查尔酮合酶 花色苷 CDNA克隆 表达谱 马铃薯野生种
下载PDF
苦荞中查尔酮合成酶基因(CHS)的克隆 被引量:3
20
作者 高帆 张宗文 +2 位作者 李艳琴 吴斌 宋韡 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第21期207-214,共8页
获得完整的苦荞查尔酮合成酶基因(CHS)信息并评价其进化地位,对分子辅助选育高黄酮含量的苦荞品种具有重要的指导意义。用RACE法克隆苦荞CHS基因,用生物信息学手段分析预测苦荞CHS基本理化性质和同源性,用临接法构建了该酶的系统发生树... 获得完整的苦荞查尔酮合成酶基因(CHS)信息并评价其进化地位,对分子辅助选育高黄酮含量的苦荞品种具有重要的指导意义。用RACE法克隆苦荞CHS基因,用生物信息学手段分析预测苦荞CHS基本理化性质和同源性,用临接法构建了该酶的系统发生树。获得1250bp的CHScDNA全长,含241bp的3’UTR和185bp的5’UTR;等电点(pI)和分子量(Mr)分别为5.33和35340.75Da;克隆获得975bp的开放性阅读框(ORF)。预测该基因编码含325个氨基酸残基的蛋白,氨基酸同源比对结果表明,苦荞CHS与蓼科的虎杖相似性很高;临接法构建的系统发生树结果表明,苦荞CHS与其他双子叶植物有共同的起源,与蓼科的金荞麦、甜荞、虎杖及石竹科的满天星亲缘关系较近。成功获得苦荞CHS基因的cDNA全长,克隆出完整的ORF,并确定了苦荞中该酶的进化地位和方向。 展开更多
关键词 苦荞 查尔酮合成酶 基因克隆
下载PDF
上一页 1 2 11 下一页 到第
使用帮助 返回顶部