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基于WGCNA挖掘天津猴鸡裸颈性状相关基因
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作者 吴鹏飞 夏树立 +2 位作者 于海涛 赵向华 王康 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期881-889,共9页
天津猴鸡是中国珍贵的裸颈鸡遗传资源,为在全基因组范围内探究其裸颈发育相关基因,本研究采集天津猴鸡杂交F_(1)代裸颈鸡和常羽鸡颈部皮肤组织用于转录组测序。加权基因共表达网络分析(WGCNA)结果显示,识别到的10个基因模块中只有蓝绿色... 天津猴鸡是中国珍贵的裸颈鸡遗传资源,为在全基因组范围内探究其裸颈发育相关基因,本研究采集天津猴鸡杂交F_(1)代裸颈鸡和常羽鸡颈部皮肤组织用于转录组测序。加权基因共表达网络分析(WGCNA)结果显示,识别到的10个基因模块中只有蓝绿色(turquoise)和蓝色(blue)基因模块与裸颈表型显著相关,共计583个基因;GO功能富集分析富集到脂滴组织、甘油三酯储存负调控以及肌肉收缩等脂肪和肌肉相关生物学过程等条目;KEGG通路分析也富集到多条脂肪代谢相关通路,包括PPAR信号通路和甘油酯代谢等;蛋白质互作网络分析结果显示ACTN2基因编码的蛋白质的连通性最高,其次是MYL10基因编码的蛋白质,另外,还发现多个密切参与毛囊发育的基因,包括SOX9和PPARGC等。本研究结果将为进一步揭示并完善鸡裸颈的形成和发育奠定基础,同时对天津猴鸡的保护、开发和利用具有重要意义。 展开更多
关键词 天津猴鸡 裸颈性状 加权基因共表达网络分析(WGCNA)
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浙江省四个地方品种鸡体尺比较分析
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作者 顾文杰 张城 +3 位作者 李冲 侯凤香 李紫薇 张雅文 《家禽科学》 2024年第7期43-48,I0007,共7页
为了比较温州红鸡与其他浙江地方品种鸡体尺的差异性,试验随机选取300日龄温州红鸡、灵昆鸡、仙居鸡和雁荡麻鸡四个地方品种鸡作为试验对象,进行体尺测定及比较分析。结果表明:温州红鸡公鸡体重为(2755.6±282.2)g、体斜长为(27.7&#... 为了比较温州红鸡与其他浙江地方品种鸡体尺的差异性,试验随机选取300日龄温州红鸡、灵昆鸡、仙居鸡和雁荡麻鸡四个地方品种鸡作为试验对象,进行体尺测定及比较分析。结果表明:温州红鸡公鸡体重为(2755.6±282.2)g、体斜长为(27.7±1.0)cm、龙骨长为(15.7±0.9)cm、胸深为(11.6±0.8)cm、胫长为(11.3±0.6)cm、胫骨长为(17.6±0.8)cm,均显著高于其他三个鸡种(P<0.05);温州红鸡母鸡龙骨长为(12.4±0.8)cm、胫长为(8.9±0.5)cm、胫骨长为(13.6±0.6)cm,均显著高于其他三个鸡种(P<0.05)。温州红鸡胫长及胫骨长之和与体斜长的比值(公鸡104.3%±2.9%、母鸡106.5%±4.4%)均显著高于其他鸡种(P<0.05);温州红鸡、灵昆鸡和雁荡麻鸡的颈椎数为14个,仙居鸡的颈椎数为13和14个。温州红鸡的颈长为(24.9±1.1)cm,显著高于其他三个鸡种(P<0.05),颈长和体斜长的比值是(92.2%±5.2%),也显著高于其他三个鸡种(P<0.05)。试验结果说明温州红鸡的体尺与浙江省其他三个地方品种在体型外貌上有较大差异,其突出特点是体大、腿长和颈长,具有较高的遗传资源保护和开发利用价值。 展开更多
关键词 温州红鸡 遗传资源 体尺 胫长 颈长
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基于简化基因组测序的天津猴鸡遗传进化研究 被引量:3
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作者 夏树立 周成浩 +6 位作者 赵向华 于海涛 张会永 殷建玫 薛倩 韩威 李国辉 《中国家禽》 北大核心 2022年第7期1-5,共5页
为从基因组水平探究天津猴鸡群体遗传进化过程中的选择信号,补充完善地方鸡种选择信号图谱,发掘天津猴鸡的重要种质特性基因,试验根据纬度分布、遗传关系等条件筛选包括天津猴鸡群体在内的20个地方鸡种及2个引进鸡品种作为研究对象,利... 为从基因组水平探究天津猴鸡群体遗传进化过程中的选择信号,补充完善地方鸡种选择信号图谱,发掘天津猴鸡的重要种质特性基因,试验根据纬度分布、遗传关系等条件筛选包括天津猴鸡群体在内的20个地方鸡种及2个引进鸡品种作为研究对象,利用简化基因组测序技术开展基因组测序,分析比较天津猴鸡群体与其他鸡种群体的遗传差异,并对进化过程中受到选择的基因进行基因功能注释。结果显示:在天津猴鸡群体中检测出265869个SNP标记;遗传结构上天津猴鸡群体与狼山鸡等聚为一类,亲缘关系较近;受选择基因主要参与氨基酸生物合成、细胞内信号转导以及神经系统发育等通路或生物学过程;检测到6个与种质特性相关的受选择基因,与神经系统发育、激素调节和抗热应激等生理功能紧密相关。研究结果部分揭示了天津猴鸡的裸颈性状形成和抗热应激特性,为天津猴鸡的保护和种质特性评价提供重要理论依据。 展开更多
关键词 天津猴鸡 裸颈性状 遗传多样性 选择信号
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云南3个新发掘地方鸡种mtDNA D-loop区序列遗传多样性分析 被引量:2
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作者 王坤 豆腾飞 +4 位作者 李琦华 柳明正 李丰耘 贾俊静 葛长荣 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第10期3232-3241,共10页
为研究在云南省怒江州及山区发现的3个地方鸡种翻毛鸡(FM)、赤脖鸡(CB)和YN鸡的群体遗传背景,试验采用线粒体DNA(mitochondral DNA,mtDNA)D-loop区序列为遗传标记,对3个鸡种共168个样品进行了检测分析。结果显示,翻毛鸡、赤脖鸡和YN鸡3... 为研究在云南省怒江州及山区发现的3个地方鸡种翻毛鸡(FM)、赤脖鸡(CB)和YN鸡的群体遗传背景,试验采用线粒体DNA(mitochondral DNA,mtDNA)D-loop区序列为遗传标记,对3个鸡种共168个样品进行了检测分析。结果显示,翻毛鸡、赤脖鸡和YN鸡3个地方鸡种共定义了27种单倍型,其单倍型多样度分别为0.947、0.938和0.596;核苷酸多样度分别为0.01268、0.01434、0.00239。系统发生树分析显示,本研究检测的168个样品分布在A、B、C、E、F和G 6个世系中,其中翻毛鸡包含E、F和G 3个世系;赤脖鸡包含A、B、C、E、F和G 6个世系,E、F和G世系为其主要世系;YN鸡包含E、F和G 3个世系,其中E世系是其主要世系。YN鸡主要与印度亚种、白洛克鸡、白来航鸡和新汉夏鸡等蛋鸡品种进化关系较近,而赤脖鸡血缘较杂乱,与滇南亚种、海南亚种、指名亚种、印度尼西亚斗鸡及老挝鸡进化关系较近;翻毛鸡与赤脖鸡共享了较多的单倍型,2个品种间的进化关系较近。本试验结果为新发现的3个云南地方鸡品种的母系起源和遗传评估提供了依据。 展开更多
关键词 翻毛鸡 赤脖鸡 YN鸡 mtDNA D-loop区 遗传多样性
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鸡裸颈基因研究进展 被引量:1
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作者 安建勇 王文杰 《中国家禽》 北大核心 2018年第5期47-50,共4页
裸颈鸡主要分布在热带、亚热带和赤道地区,尤其是高温潮湿气候地区。羽毛覆盖率比常羽鸡低,具有明显的抗热应激特性。基因定位研究表明,裸颈基因(Na)位于3号染色体长臂770 kb的一个区段内,基因功能研究确定为一73 kb插入导致BMP12表达... 裸颈鸡主要分布在热带、亚热带和赤道地区,尤其是高温潮湿气候地区。羽毛覆盖率比常羽鸡低,具有明显的抗热应激特性。基因定位研究表明,裸颈基因(Na)位于3号染色体长臂770 kb的一个区段内,基因功能研究确定为一73 kb插入导致BMP12表达量上调而产生。裸颈是胚胎期羽毛发育调节的结果,羽毛发育通过反馈-扩散的行为模式进行自组织,激活因子-抑制因子的相互作用强弱最终确定了羽毛分布的密度,WNT/β-catenin和FGF为激活因子,BMP基因家族为羽毛发育的抑制因子,但这两大通路上下游起作用的相关基因并不清晰,仍需要进一步研究。文章对裸颈鸡的性状特征、裸颈基因的定位以及裸颈性状形成的分子机理进行了综述,旨在为裸颈鸡的开发和研究指明方向。 展开更多
关键词 裸颈 基因
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四种家养珍禽蛋物理性状测定与分析 被引量:2
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作者 吴琼 邢秀梅 +2 位作者 于淼 杨童奥 杨福合 《特产研究》 2014年第4期3-5,共3页
通过对中国环颈雉、珍珠鸡、贵妃鸡和火鸡新鲜蛋的主要物理性状指标进行测定、计算,取得了这4种类型珍禽蛋的蛋形指数、蛋壳厚度、蛋黄颜色及蛋黄、蛋白和蛋壳在总蛋重中各自所占的比例及蛋比重等物理性状指标。本试验结果为珍禽种蛋的... 通过对中国环颈雉、珍珠鸡、贵妃鸡和火鸡新鲜蛋的主要物理性状指标进行测定、计算,取得了这4种类型珍禽蛋的蛋形指数、蛋壳厚度、蛋黄颜色及蛋黄、蛋白和蛋壳在总蛋重中各自所占的比例及蛋比重等物理性状指标。本试验结果为珍禽种蛋的选择、分级、保存、运输和加工及珍禽优良品种的选育和饲养管理提供参考。 展开更多
关键词 中国环颈雉蛋 珍珠鸡蛋 贵妃鸡蛋 火鸡蛋 物理性状测定
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骨肉分离技术国内技术现状与发展趋势
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作者 王秀珍 张宝奎 《肉类工业》 2015年第11期51-52,共2页
国产骨肉分离机产能从200kg/h发展到3 500kg/h,有些机型技术先进,性能稳定,设备性能和肉糜质量达到了世界先进水平。尤其以高转速骨肉分离机为代表的先进骨肉分离设备,配用鸡脖分离专用滤网,加工的鸡脖肉糜品质极佳,无骨渣,肉质结构好,... 国产骨肉分离机产能从200kg/h发展到3 500kg/h,有些机型技术先进,性能稳定,设备性能和肉糜质量达到了世界先进水平。尤其以高转速骨肉分离机为代表的先进骨肉分离设备,配用鸡脖分离专用滤网,加工的鸡脖肉糜品质极佳,无骨渣,肉质结构好,可以在相关产品中作为主料使用。未来骨肉分离设备将向专业化、产品高品质、低维护、成套化方向发展;骨肉分离机市场向两极化发展。 展开更多
关键词 骨肉分离技术 高速 肉糜 鸡脖 滤网
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SLC45A2基因在“豫粉1号”浅芦花羽色中的表达及酪氨酸对其在黑色素细胞中表达量的影响 被引量:5
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作者 宋素芳 宋幸辉 +3 位作者 蔺成刚 李东华 王鑫磊 孙桂荣 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2019年第9期64-67,共4页
SLC45A2是羽色遗传的重要候选基因,本实验以“豫粉1号”H系为研究对象,其颈部背侧具有黑白相间的芦花色羽毛,颈部腹侧为白色羽毛,利用qRT-PCR技术测定SLC45A2在颈部不同部位(颈部背侧和颈部腹侧)的相对表达量,并研究了在黑色素细胞中添... SLC45A2是羽色遗传的重要候选基因,本实验以“豫粉1号”H系为研究对象,其颈部背侧具有黑白相间的芦花色羽毛,颈部腹侧为白色羽毛,利用qRT-PCR技术测定SLC45A2在颈部不同部位(颈部背侧和颈部腹侧)的相对表达量,并研究了在黑色素细胞中添加不同浓度(0、10^-9、10^-8、10^-7、10^-6 mol/L)的酪氨酸对SLC45A2表达量的影响。结果表明:SLC45A2在颈部背侧浅芦花和腹侧白色中的表达量差异显著;黑色素细胞添加不同浓度的酪氨酸可以显著影响SLC45A2的表达量,生物信息学分析表明,该基因编码蛋白为跨膜蛋白、不可溶性蛋白。由此表明,SLC45A2可以通过调控黑色素细胞的合成,进而影响“豫粉1号”H系浅芦花羽色的形成。 展开更多
关键词 “豫粉1号”蛋鸡 SLC45A2 浅芦花羽色 颈部 黑色素细胞 生物信息学分析
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