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申克孢子丝菌chs1基因生物信息分析
被引量:
1
1
作者
孙瑶
高文超
+7 位作者
何泰龙
黄家敏
黄丽林
张静
李美荣
张云青
尹颂超
黄怀球
《皮肤性病诊疗学杂志》
2017年第4期238-242,共5页
目的:对申克孢子丝菌几丁质合成酶基因(chs1)及其编码蛋白的结构和特性进行分析和预测。方法:利用NCBI网站、Ex PASy和CBS等工具预测申克孢子丝菌chs1基因及编码蛋白的结构和功能。结果:chs1 mRNA全长2 745 bp,编码914个氨基酸。BLAST...
目的:对申克孢子丝菌几丁质合成酶基因(chs1)及其编码蛋白的结构和特性进行分析和预测。方法:利用NCBI网站、Ex PASy和CBS等工具预测申克孢子丝菌chs1基因及编码蛋白的结构和功能。结果:chs1 mRNA全长2 745 bp,编码914个氨基酸。BLAST分析显示,申克孢子丝菌与巴西孢子丝菌、蓝菌属真菌、足马杜拉分枝菌等真菌chs氨基酸序列一致性达到99%,且有保守域。预测chs1蛋白相对分子量为102 714.7,理论等电点为6.71。预测chs1编码蛋白ɑ螺旋、β折叠、β转角、无规则卷的比例分别是38.40%、17.94%、10.39%、33.26%。chs1蛋白是一种疏水蛋白,包含9个跨膜区,未发现信号肽。结论:成功预测了chs1基因及编码蛋白质的生化性质及结构特征,为下一步对其进行克隆、表达和敲除奠定基础。
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关键词
申克孢子丝菌
chs1基因
生物信息学
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职称材料
题名
申克孢子丝菌chs1基因生物信息分析
被引量:
1
1
作者
孙瑶
高文超
何泰龙
黄家敏
黄丽林
张静
李美荣
张云青
尹颂超
黄怀球
机构
中山大学附属第三医院皮肤科
广东省妇幼保健院儿科
中山大学孙逸仙纪念医院皮肤科
出处
《皮肤性病诊疗学杂志》
2017年第4期238-242,共5页
基金
国家自然科学基金面上项目(编号:81371746)
广东省科技计划项目(编号:2013B010404013)
文摘
目的:对申克孢子丝菌几丁质合成酶基因(chs1)及其编码蛋白的结构和特性进行分析和预测。方法:利用NCBI网站、Ex PASy和CBS等工具预测申克孢子丝菌chs1基因及编码蛋白的结构和功能。结果:chs1 mRNA全长2 745 bp,编码914个氨基酸。BLAST分析显示,申克孢子丝菌与巴西孢子丝菌、蓝菌属真菌、足马杜拉分枝菌等真菌chs氨基酸序列一致性达到99%,且有保守域。预测chs1蛋白相对分子量为102 714.7,理论等电点为6.71。预测chs1编码蛋白ɑ螺旋、β折叠、β转角、无规则卷的比例分别是38.40%、17.94%、10.39%、33.26%。chs1蛋白是一种疏水蛋白,包含9个跨膜区,未发现信号肽。结论:成功预测了chs1基因及编码蛋白质的生化性质及结构特征,为下一步对其进行克隆、表达和敲除奠定基础。
关键词
申克孢子丝菌
chs1基因
生物信息学
Keywords
Sporothrix schenckii
chsl
bioinformatics
分类号
R379 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
申克孢子丝菌chs1基因生物信息分析
孙瑶
高文超
何泰龙
黄家敏
黄丽林
张静
李美荣
张云青
尹颂超
黄怀球
《皮肤性病诊疗学杂志》
2017
1
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