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中国蚱科昆虫分布格局的特有性简约性分析 被引量:7
1
作者 刘殿锋 董自梅 +1 位作者 谷延泽 陶令霞 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期298-304,共7页
我们用特有性简约性分析方法对中国蚱科昆虫分布格局和各分布区之间的关系进行了探讨。根据蚱科昆虫的分布,构建特有性简约性分析所需的矩阵,以东北区作为外群,用最大简约法通过穷尽式搜索得到分布区分支图。分布区分支图上8大生物地理... 我们用特有性简约性分析方法对中国蚱科昆虫分布格局和各分布区之间的关系进行了探讨。根据蚱科昆虫的分布,构建特有性简约性分析所需的矩阵,以东北区作为外群,用最大简约法通过穷尽式搜索得到分布区分支图。分布区分支图上8大生物地理分布区可分成4个聚类群:第一个聚类群是东北区;第二个聚类群是蒙新区;华中区、华东区及华北区组成第三个聚类群;华南区、西南区及青藏区则组成第四个聚类群。分布区分支图表明东北区与蒙新区比其他生物地理分布区形成要早,其原因我们推测可能与更新世的冰川活动有关。总体上来说,中国蚱科昆虫生物多样性南部比北部丰富,我们认为可从两方面来解释,一是更新世森林避难所的形成,二是生态环境的恶化。 展开更多
关键词 蚱科 多样性 特有性简约性分析 分布区分支图
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中国鼠兔亚属(Subgenus Ochotona)种系发生的探讨 被引量:9
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作者 于宁 郑昌琳 冯祚建 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 1992年第4期255-266,共12页
本文对鼠兔亚属主要产于国内的14种,进行了严格的支序系统分析。通过对这14种形态特征分析、对比,找出了22个具有种系发生意义的性状,并用国内学者尚未采用的格局分支论的组分分析,重建了它们的种间分支亲缘关系。根据分支图及国内已有... 本文对鼠兔亚属主要产于国内的14种,进行了严格的支序系统分析。通过对这14种形态特征分析、对比,找出了22个具有种系发生意义的性状,并用国内学者尚未采用的格局分支论的组分分析,重建了它们的种间分支亲缘关系。根据分支图及国内已有的化石和地史资料,对该亚属的演化作了初步探讨。 展开更多
关键词 鼠兔亚属 鼠兔科 发生
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拟裸蝗属昆虫生物地理研究 被引量:3
3
作者 易传辉 和秋菊 欧晓红 《四川动物》 CSCD 北大核心 2007年第3期492-496,共5页
采用支序生物地理学的方法对拟裸蝗属昆虫生物地理进行了研究。研究表明各地区明显地分为两个类群,同时地区分化分4次完成,保山、个旧和昭通为较早分化地区。并推测拟裸蝗属的形成可能在第1次冰期,其起源地在云南、四川两省交界的横断... 采用支序生物地理学的方法对拟裸蝗属昆虫生物地理进行了研究。研究表明各地区明显地分为两个类群,同时地区分化分4次完成,保山、个旧和昭通为较早分化地区。并推测拟裸蝗属的形成可能在第1次冰期,其起源地在云南、四川两省交界的横断山东部地区,种的分化在第3次冰期之后,主要集中在新仙女木降温事件前后。冰期和间冰期的交互出现所导致的气温剧烈变化是促使其分化成种的主要原因。并认为拟裸蝗属昆虫今后的分布区域将进一步缩小,并向更高海拔的山地迁移。 展开更多
关键词 生物地理 支序图 地区关系 拟裸蝗属
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苦荞中查尔酮合成酶全长基因的克隆及其序列分析 被引量:1
4
作者 胡耀辉 王冠 +1 位作者 刘凯 于寒松 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期65-68,72,共5页
选用乌克兰伊琳娜苦荞为试验材料,以从叶片中提取的RNA为模板,应用RACE技术结合CODEHOP引物设计方法成功克隆出苦荞中查尔酮合成酶cDNA序列后,将其序列电子合并其全长后设计基因全长特异性引物。以DNA为模板进行PCR扩增出基因序列。通... 选用乌克兰伊琳娜苦荞为试验材料,以从叶片中提取的RNA为模板,应用RACE技术结合CODEHOP引物设计方法成功克隆出苦荞中查尔酮合成酶cDNA序列后,将其序列电子合并其全长后设计基因全长特异性引物。以DNA为模板进行PCR扩增出基因序列。通过生物信息学分析表明,该基因全长为1 906 bp,具有一个463 bp的内含子序列,编码区长度为1 188 bp,编码395个氨基酸。Blastn序列比对发现本试验所获得的CHS基因序列与相近物种Rheum palmatum(登录号:DQ205352.1)的CHS基因同源性达86%。将得到的序列命名为RaCHS并提交GenBank,登录号为HQ434624。应用Clustalxl.81和MEGA4软件构建系统进化树,并进行了同源性分析。 展开更多
关键词 苦荞 查尔酮合成酶 RACE 内含子 进化树
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Cloning and Analysis of a Chalone Synthase Gene from Fagopyrum tataricum
5
作者 刘凯 胡耀辉 +1 位作者 王冠 于寒松 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2012年第4期708-710,726,共4页
[Objective] This study aimed to clone a full-length CHS gene from buck- wheat. [Method] With total RNA extracted from buckwheat as the template, CHS cD- NA sequence was cloned from buckwheat by using RACE technology a... [Objective] This study aimed to clone a full-length CHS gene from buck- wheat. [Method] With total RNA extracted from buckwheat as the template, CHS cD- NA sequence was cloned from buckwheat by using RACE technology and CODEHOP primer design method, the full length gene was obtained by primers which were de- signed for amplification of full-length gene sequence with buckwheat DNA template. Clustalxl.81 and MEGA4 software were used for sequence analysis and construction of phylogenetic tree; NCBI Blastn and Biastp programs were applied for homology analysis of nucleic acid and protein. [Result] Bioinformatics analysis showed that the full length of this gene is 1 906 bp, containing a 463 bp intron sequence and a 1 188 bp coding region, encoding 395 amino acids. Blastn sequence alignment revealed that the CHS gene sequence obtained in this study shared 86% homology with the CHS gene of closely related species. [Conclusion] This study laid the foundation to clarify molecular basis of the synthesis of buckwheat bioflavanoids and explore an effective way to improve the content of buckwheat bioflavanoids. 展开更多
关键词 Fagopyrum tataricum CHS RACE INTRON cladogram
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分支分类学算法研究及其在生物分类中的应用 被引量:1
6
作者 石勤 王成章 《北京工业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期266-272,共7页
针对目前普遍采用的分支分类方法一般只能得到局部最优解这一问题,首先提出了一条与俭约性原理等价的定理,然后就使用同步系数进行分类时可能出现的情况进行了讨论,同时给出了几条有关定理.在此基础上,对最大同步法给出了一个反例... 针对目前普遍采用的分支分类方法一般只能得到局部最优解这一问题,首先提出了一条与俭约性原理等价的定理,然后就使用同步系数进行分类时可能出现的情况进行了讨论,同时给出了几条有关定理.在此基础上,对最大同步法给出了一个反例并提出了一种修正算法.实验结果表明该算法是正确的和可行的,且能保证不劣于最大同步法. 展开更多
关键词 分支分类学 分支谱系图 最大同步法 修正算法 生物分类 同步系数 生物演化
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分支分类问题的遗传算法 被引量:2
7
作者 郑更新 陈祖荫 +1 位作者 江毅 锡林花 《生物数学学报》 CSCD 1997年第2期129-134,共6页
分支分类问题可归结为聚类问题.通常的分支分类方法一般只能保证得到局部最优解.本文首先给出一种聚类方法,即同步插入法,然后将之转化为离散空间上的优化问题,并应用遗传算法以期得到全局最优解.实验结果表明该方法是正确和可行的.
关键词 分支分类 遗传算法 生物演化 生物数学
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探寻去除焦化废水有机污染物的高效菌群 被引量:1
8
作者 王丽丽 杨谦 张云澍 《科技通报》 2018年第5期251-254,259,共5页
以焦化废水的COD去除率和NH3-N去除率为衡量指标,探寻处理焦化废水有机污染物的高效菌群作为重点研究内容。为去除废水中石油类污染物,特从大庆石油污染土壤中分离出两株高效烃降解菌,对两株烃类降解菌进行生理生化鉴定和16s rDNA鉴定,... 以焦化废水的COD去除率和NH3-N去除率为衡量指标,探寻处理焦化废水有机污染物的高效菌群作为重点研究内容。为去除废水中石油类污染物,特从大庆石油污染土壤中分离出两株高效烃降解菌,对两株烃类降解菌进行生理生化鉴定和16s rDNA鉴定,经过初步鉴定为:Y5是绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)、W1是布雷氏柠檬酸杆菌(Citrobacter braakii)。本文选用酿酒酵母、产朊酵母、布雷氏柠檬酸杆菌、绿针假单胞菌共同参与降解,通过电催化法、生物氧化法处理焦化废水有机污染物,提高废水净化效果。最终按照厂家给定COD值、NH3-N值计算得出,COD去除率达38.9%45%,NH3-N去除率达81.2%84.4%,实测:真菌与降解烃类细菌的混合组COD去除率达35.8%,NH3-N去除率达78.2%,NH3-N去除率效果显著。 展开更多
关键词 焦化废水 COD NH3-N 进化树 菌种互作
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胎盘亚纲目间关系和分支分类问题 被引量:1
9
作者 赵铁桥 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2002年第2期384-392,共9页
主要根据近两年的文献 ,从分支系统学观点综述了现生胎盘类哺乳动物的目变动、目上组群和目间种系发生关系 ,给出了其 19目的分支图 ,讨论了目上水平分支分类的几个问题。
关键词 胎盘亚纲 分支分类 目间关系 分支图
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黑龙江水系鱼类染色体组型的研究 Ⅲ鳅科3种鱼的染色体数和组型,兼论核型与系统分类的关系 被引量:1
10
作者 王雪 谢莉莉 《黑龙江大学自然科学学报》 CAS 1990年第2期91-96,共6页
本文初次报道了分布于黑龙江水系的花斑付沙鳅、黑龙江花鳅和黑龙江泥鳅的染色体组型.结果2n均为50,核型组成不同.综合泥鳅属的地理分布、形态特征和核型分析结果,认为黑龙江泥鳅和泥鳅的分化可能为地理亚种的分化,并建议对泥鳅属2n=50... 本文初次报道了分布于黑龙江水系的花斑付沙鳅、黑龙江花鳅和黑龙江泥鳅的染色体组型.结果2n均为50,核型组成不同.综合泥鳅属的地理分布、形态特征和核型分析结果,认为黑龙江泥鳅和泥鳅的分化可能为地理亚种的分化,并建议对泥鳅属2n=50的类群的分类进行重新整理.鳅科的宗系关系与核型演化的方向是吻合的. 展开更多
关键词 鳅科 核型 分类 鱼类 染色体
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埃博拉病毒株糖蛋白的同源性分析
11
作者 王国戗 赵玉洲 +1 位作者 牛菊霞 贾安奎 《国际检验医学杂志》 CAS 2009年第2期127-129,共3页
目的分析埃博拉病毒糖蛋白氨基酸的同源性,为埃博拉病毒的相关研究奠定基础。方法从GenBank调取不同年份发表的不同亚型埃博拉病毒糖蛋白氨基酸序列,使用ClustalW1.83生物软件,将这些氨基酸序列作同源性比较,并建立氨基酸序列的进化树... 目的分析埃博拉病毒糖蛋白氨基酸的同源性,为埃博拉病毒的相关研究奠定基础。方法从GenBank调取不同年份发表的不同亚型埃博拉病毒糖蛋白氨基酸序列,使用ClustalW1.83生物软件,将这些氨基酸序列作同源性比较,并建立氨基酸序列的进化树。结果不同年份发表的同型埃博拉病毒糖蛋白的氨基酸序列之间同源性较高,相对比较保守;不同亚型间的埃博拉病毒的氨基酸序列同源性较差。结论埃博拉病毒糖蛋白的氨基酸序列比较保守,不易发生变异。 展开更多
关键词 埃博拉病毒 糖蛋白 氨基酸序列 进化树
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天蓝色链霉菌Streptomyces coelicolor中几丁质酶C(Chi C)的生物信息学分析
12
作者 魏巍 贺淹才 方柏山 《生物信息学》 2006年第4期157-159,共3页
利用生物信息学的方法,分析天蓝色链霉菌Streptomyces coelicolor中几丁质酶C(Chi C)的一些基本性质,并针对链霉菌属菌种的几个几丁质酶基因做了进化树,进而验证了天蓝色链霉菌中至少8种几丁质酶的分类;同时对天蓝色链霉菌Streptomy-ces... 利用生物信息学的方法,分析天蓝色链霉菌Streptomyces coelicolor中几丁质酶C(Chi C)的一些基本性质,并针对链霉菌属菌种的几个几丁质酶基因做了进化树,进而验证了天蓝色链霉菌中至少8种几丁质酶的分类;同时对天蓝色链霉菌Streptomy-ces coelicolor中几丁质酶C(Chi C)蛋白的高级结构作出了预测,得到其编码的属于18家族的蛋白质高级结构图谱。 展开更多
关键词 几丁质酶 天蓝色链霉菌 进化树 结构
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剑齿象系统发育的探讨 被引量:1
13
作者 陈萍 《淮南矿业学院学报》 1992年第1期1-8,共8页
本文以分支系统学为理论依据,分析了剑齿象演化中的近裔性状及其演化极向。以简约性原则建立了反映剑齿象属(Stegodon)各种间系统发育关系的分支图解。与传统的系统学不同,分支图解中不仅表明了某些种之间的租裔序列,而且主要反映了相... 本文以分支系统学为理论依据,分析了剑齿象演化中的近裔性状及其演化极向。以简约性原则建立了反映剑齿象属(Stegodon)各种间系统发育关系的分支图解。与传统的系统学不同,分支图解中不仅表明了某些种之间的租裔序列,而且主要反映了相应的“姐妹群”。同时,进一步运用国外较新的方法,对所建立的分支图解作了检验,并结合地质时代的分布将分支图解转化为系统树。 展开更多
关键词 长鼻目 剑齿象 发育
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湖南发现的中蹄蝠形态结构及系统发育研究 被引量:2
14
作者 冯磊 吴倩倩 +4 位作者 石胜超 任锐君 刘宜敏 余子寒 邓学建 《生命科学研究》 CAS CSCD 2017年第6期515-518,522,共5页
2015年7月26日在湖南省衡东县四方山国有林场仙妃洞(26°58′25″N,113°3′23″E,海拔463 m)进行哺乳动物多样性调查时通过雾网采集到一只蹄蝠标本(HUNNU15SF42,雌性),2016年7月28日在该处调查时通过同样的方法又采集到一只蹄... 2015年7月26日在湖南省衡东县四方山国有林场仙妃洞(26°58′25″N,113°3′23″E,海拔463 m)进行哺乳动物多样性调查时通过雾网采集到一只蹄蝠标本(HUNNU15SF42,雌性),2016年7月28日在该处调查时通过同样的方法又采集到一只蹄蝠标本(HUNNU16SF21,雄性),两只蝙蝠体型中等,头体长分别为66.46 mm和69.19 mm,颅全长分别为22.14 mm和21.88 mm,齿式为1.1.2.3/2.1.2.3=30。带回实验室经过形态对比和Cyt b基因序列鉴定,确认这两只蹄蝠为蹄蝠科(Hipposideridae)蹄蝠属(Hipposideros)中蹄蝠(Hipposideros larvatus),属于湖南省翼手目新纪录,标本保存于湖南师范大学脊椎动物标本馆。 展开更多
关键词 翼手目 中蹄蝠 系统进化树 新纪录 湖南省
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清水江鲤性腺的早期发育及Foxl 2基因功能初步分析 被引量:1
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作者 曾圣 刘伟 +3 位作者 杜强 王艳艳 周洲 胡世然 《贵州农业科学》 CAS 2020年第3期82-86,F0003,共6页
为清水江鲤的人工选育提供理论基础,通过组织学切片观察不同时期清水江鲤性腺,并通过RACE及RT-PCR克隆清水江鲤Foxl2基因,初步分析Foxl2的功能,以了解清水江鲤早期性腺发育及性腺发育过程中相关基因的表达。结果表明:清水江鲤性腺发育... 为清水江鲤的人工选育提供理论基础,通过组织学切片观察不同时期清水江鲤性腺,并通过RACE及RT-PCR克隆清水江鲤Foxl2基因,初步分析Foxl2的功能,以了解清水江鲤早期性腺发育及性腺发育过程中相关基因的表达。结果表明:清水江鲤性腺发育至孵化后90 d的组织学切片仍不能明显分辨性别,孵化后120 d的性腺出现初级精母细胞,孵化后150 d的性腺出现初级卵母细胞,孵化后240 d出现精细胞;清水江鲤存在2个同源基因(Foxl2a与Foxl2b)。Foxl2a和Foxl2b在清水江鲤雌性性腺的发育中具有重要作用。 展开更多
关键词 清水江鲤 基因克隆 HE染色 进化树
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剑齿象的接引式发育——安徽淮南一新种剑齿象属化石及其接引—分支系统(二)
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作者 刘嘉龙 陈萍 《淮南矿业学院学报》 1996年第2期1-5,70,共6页
本文在性状分析和性状接引方法的基础上提出剑齿象属(Stegodon)的两条形成支系,做出接引分支系统图和系统树.进一步阐明了剑齿象起源于淮河过渡区及其后的时空发展.
关键词 长鼻目 进化 剑齿象 接引式发育 古动物 化石
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New contributions to the phylogeny of the ciliate class Heterotrichea(Protista,Ciliophora):analyses at family-genus level and new evolutionary hypotheses 被引量:5
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作者 Yong Chi Xiangrui Chen +6 位作者 Yuqing Li Chundi Wang Tengteng Zhang Alex Ayoub Alan Warren Weibo Song Yuanyuan Wang 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2021年第4期606-620,共15页
Heterotrichous ciliates play an important role in aquatic ecosystem energy flow processes and many are model organisms for research in cytology,regenerative biology,and toxicology.In the present study,we combine both ... Heterotrichous ciliates play an important role in aquatic ecosystem energy flow processes and many are model organisms for research in cytology,regenerative biology,and toxicology.In the present study,we combine both morphological and molecular data to infer phylogenetic relationships at family-genus level and propose new evolutionary hypotheses for the class Heterotrichea.The main results include:(1)96 new ribosomal DNA sequences from 36 populations,representing eight families and 13 genera,including three poorly annotated genera,Folliculinopsis,Ampullofolliculina and Linostomella;(2)the earliest-branching families are Spirostomidae in single-gene trees and Peritromidae in the concatenated tree,but the family Peritromidae probably represents the basal lineage based on its possession of many"primitive"morphological characters;(3)some findings in molecular trees are not supported by morphological evidence,such as the family Blepharismidae is one of the most recent branches and the relationship between Fabreidae and Folliculinidae is very close;(4)the systematic positions of Condylostomatidae,Climacostomidae,and Gruberiidae remain uncertain based either on morphological or molecular data;and(5)the monophyly of each genus included in the present study is supported by the molecular phylogenetic trees,except for Blepharisma in the SSU r DNA tree and Folliculina in the ITS1-5.8 S-ITS2 tree. 展开更多
关键词 evolutionary hypothesis molecular cladogram morphological cladogram multi-gene systematic relationship
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广东国际旅行人员HIV-1基因亚型分析 被引量:5
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作者 李华 邢辉 +8 位作者 吴健 罗小光 刘胜牙 颜钟 黄康华 黄红敏 陈小刚 王向阳 邵一鸣 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2007年第1期4-8,共5页
〔目的〕通过对广东口岸国际旅行人员中HIV感染者的亚型分析,监测HIV毒株的流行状况及其变化。〔方法〕从22份HIV-1抗体阳性样品中提取RNA或DNA,逆转录后或直接巢式PCR扩增HIV env及gag基因,对PCR产物进行核苷酸序列测定和分析,确定基... 〔目的〕通过对广东口岸国际旅行人员中HIV感染者的亚型分析,监测HIV毒株的流行状况及其变化。〔方法〕从22份HIV-1抗体阳性样品中提取RNA或DNA,逆转录后或直接巢式PCR扩增HIV env及gag基因,对PCR产物进行核苷酸序列测定和分析,确定基因亚型。〔结果〕22份样品中共发现8种HIV-1亚型和重组型,其中CRF-BC重组型8份,CRF01-AE重组型4份,C亚型2份,B亚型2份,A1、G、J亚型及CRF02-AG重组型各1份,2份样品分型不明确。这些不同亚型的感染者来自包括中国在内的8个不同国家。〔结论〕国际旅行人员中HIV-1亚型和重组型种类复杂多样,是我国HIV毒株输入的主要来源。监测国际旅行人员中HIV感染者基因型分布及其变异,及时发现新型毒株对于艾滋病的预防和控制十分重要。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒1型 亚型 序列分析 系统进化树 国际旅行人员
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