基于数据挖掘的范忠泽治疗大肠癌用药规律研究

目的借助"中医处方辨证论治特征分析及数据挖掘软件",采用数据挖掘方法总结范忠泽教授治疗大肠癌的处方用药规律。方法收集范忠泽教授治疗大肠癌的门诊处方,运用"中医处方辨证论治特征分析及数据挖掘软件"中的药物频次统计及关联规则等方法,挖掘其中的用药规律和组方特点。结果 (1)本研究共纳入病例212例,处方762首;其中高频次使用的药物有茯苓、白术、半枝莲、黄芪、野葡萄藤、党参等16味,高频药对有茯苓-白术、茯苓-半枝莲、半枝莲-黄芪等32对,3味药物组有茯苓-半枝莲-黄芪、茯苓-白术-黄芪、白术-半枝莲-黄芪等23组,4味药物组有茯苓-白术-半枝莲-黄芪、茯苓-白术-黄芪-党参、茯苓-半枝莲-黄芪-党参等17组。结论总结出范忠泽教授治疗大肠癌的16味高频用药,32个常用药对,23个3味药组,17个4味药组;数据挖掘方法可用于名老中医经验的研究。

基于数据挖掘和网络药理学的左右半结肠癌中医组方用药规律差异及作用机制研究

目的 基于数据挖掘和网络药理学方法分析左、右半结肠癌临床组方用药规律及作用机制,为中医防治左右半结肠癌提供指导。方法 基于广州中医药大学第一附属医院2017年1月1日至2020年6月30日住院结肠癌患者施治方药信息,使用数据挖掘关联规则及聚类分析等算法,研究中医组方规律;使用网络药理学方法研究核心关联规则药物的成分、靶点及涉及的基因本体结果与京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路,阐明其作用机制。结果 共纳入383首方药信息,左半结肠癌使用典型药物为48味,右半结肠癌味57味,两者共同使用典型药物44味。左半结肠癌典型方药“半枝莲-法半夏-陈皮”抗癌关键成分主要包括:麻黄素、γ-氨基丁酸及葫芦巴碱等;作用核心靶点包括:ESR1、FASLG、KITLG等;抗癌作用机制发挥涉及的主要的生物学过程包括氧水平反应、肽链内切酶活性调节及凋亡信号通路调控,涉及的信号通路主要有MAPK信号通路、RAS信号通路及PI3K-AKT信号通路。右半结肠癌典型方药“地榆-生甘草-槐花”抗癌的关键成分主要包括:白桦脂醇、延胡索乙素及熊果酸;作用核心靶点主要包括:IFNG、MAPK3、PTGS2;抗癌作用机制发挥涉及的主要的生物学过程包括:类固醇代谢过程、防御反应的正向调控及炎症反应的正向调控;涉及的通路主要包括:IL-17信号通路、VEGF信号通路及TNF信号通路。结论 中医治疗左右半结肠癌的用药规律存在一定差异。左半结肠癌方药以清热解毒、行气活血为特点,右半结肠癌则以健脾益气,养血补血为特点。左右半结肠癌的典型方药可通过多成分-多靶点-多通路的作用特点起到防治结肠癌的作用,研究结果可为中医论治左右半结肠癌的临床实践及基础研究提供参考。

基于中医数据挖掘探讨桃红四物汤治疗结肠癌机制网络药理学研究

目的通过网络药理学方法挖掘并研究桃红四物汤治疗结肠癌的化学基础和分子作用机制。方法根据组成桃红四物汤的6味药物为关键词,分别输入TCMSP数据库与TCMID数据库进行检索,筛选药物活性成分;通过UniProt规范化配对耙点名称;以“Colon Cancer”为检索词,在数据库DisGeNET以及OMIM检索结肠癌对应基因靶点;通过Venny 2.1得到药物有效活性成分调控结肠癌的靶点基因;将靶点基因导入到STRING,获得PPI互作图,Cytoscape绘制桃红四物汤有效成分-结肠癌-靶点基因-作用通路的网络图并进行分析,根据节点确定核心蛋白,导入DAVID,获得GO与KEGG并完成富集分析。将作用靶点导入KEGG,得出KEGG信号图并进行分析,探讨桃红四物汤治疗结肠癌的作用靶点及相关通路信息,预测治疗结肠癌的机制。结果检索出桃红四物汤61种活性成分,对应的药物基因223个,结肠癌基因靶点为161个。整理得到桃红四物汤有效成分与结肠癌靶基因的共同靶点为46个,挑选出药物有效成分为31个,通过PPI蛋白互作网络分析及有效成分-结肠癌-基因靶点-通路网络结构分析得出,其药物作用核心靶点为PTGS2、HSP90AA1、AKT1、TNF、TP53。获得GO过程122条,KEGG通路生物信息为85条。结论桃红四物汤通过癌症通路癌、症蛋白聚糖、癌症通路、大肠癌、PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路、Micro RNA等通路作用于PTGS2、HSP90AA1、AKT1、TNF、TP53等核心靶点治疗结肠癌,其中癌症通路所包含的桃红四物汤的核心靶点基因计数及占比最多,被认为核心通路,通过数据挖掘出桃红四物汤治疗结肠癌的潜在的有效成分、靶点基因、生物过程及信号通路及其治疗其他恶性肿瘤及传染病的潜在价值,为下一步研究提供依据。

基于贝叶斯分类器的结肠癌数据分类

基于基因表达谱的肿瘤诊断方法有望成为临床医学上一种快速而有效的诊断方法,但由于基因表达谱数据存在高维数、小样本以及噪音大等特点,使得对其分类存在很大困难,所以很有必要寻找更为可行有效的分类方法。用贝叶斯分类器建立预测分类模型作为基因表达谱数据分类的一种新思路,以结肠癌的基因表达谱作为实验数据,利用M ATLAB的贝叶斯网络工具箱进行了实验,并用4-折交叉验证法测试识别准确率。实验结果表明上述方法是可行有效的。

基于肿瘤基因表达谱的基因功能模块识别

为了揭示肿瘤发生发展的分子机制,结合基因功能分类体系数据库(gene ontology,简称GO),采用网络分解算法对结肠癌基因表达谱数据进行了研究．研究结果表明,与结肠正常组织基因模块相比,结肠癌基因模块与细胞周期调节、抗细胞程序性死亡、信号转导、细胞增殖等功能类相关,由此推论结肠癌基因功能模块结构的改变导致了结肠癌的发生．

基于数据挖掘探讨首都国医名师王沛治疗结肠癌用药规律

目的探讨首都国医名师王沛教授治疗结肠癌的用药规律。方法收集王沛教授治疗结肠癌的门诊病案,录入中医传承计算平台(V3.0),对处方用药的性味归经、药物频次功效分类进行统计分析,通过关联规则、聚类分析得出高频药物组合。结果共收集处方65首,涉及中药150味,药性以温、寒、平为主,药味以甘、苦、辛为主,归经以肝、脾、肾经为主,按功效分类以补虚药、清热药、利水渗湿药及活血化瘀药为主,常用茯苓、猪苓、半枝莲、生黄芪、莪术等药,以及猪苓-茯苓、生黄芪-炙黄芪、半枝莲-莪术等药物组合;根据关联规则分析,得到高关联药对29对,包括猪苓-炙黄芪-生黄芪、茯苓-半枝莲-猪苓、半枝莲-莪术-猪苓等;聚类分析得到的6类药物组合,以健脾利湿、益气活血、清热解毒、涩肠止血为主。结论王沛教授多从脾湿、正虚、热毒、血瘀、出血论治结肠癌,治以健脾利湿、益气扶正、清热解毒、活血化瘀、涩肠止血,符合中医治疗肿瘤扶正祛邪思想,可供临床参考。