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一种拓扑与生物功能一致的多网络比对算法
1
作者
夏金芳
陈璟
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2020年第10期2146-2151,共6页
生物网络比对是一种常用的研究生物分子间相互作用的方法,也是分析物种间功能差异的重要手段,有助于更好地理解生物进程及功能.本文提出的ConAlign是一种快速且有效的多对多的多网络全局比对算法.首先,利用网络节点间的拓扑相似性补充...
生物网络比对是一种常用的研究生物分子间相互作用的方法,也是分析物种间功能差异的重要手段,有助于更好地理解生物进程及功能.本文提出的ConAlign是一种快速且有效的多对多的多网络全局比对算法.首先,利用网络节点间的拓扑相似性补充序列相似性.然后,结合网络整体的拓扑相似性和指定约束条件将蛋白质相互作用网络进行比对.本算法分别在合成网络和真实网络上进行了实验,并与IsoRankN、BEAMS、SMETANA算法对比.实验结果表明,ConAlign算法识别出了更多的直系同源物,在生物和拓扑方面也表现优异,此外,在保证簇的拓扑与生物功能一致性的前提下,比对的效率也得到了提升.
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关键词
复杂网络
PPI网络
多网络比对
拓扑与生物功能一致性
图匹配
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职称材料
硫醇保护金团簇的实验和理论研究现状
2
作者
田志美
刘汪丹
程龙玖
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期1743-1753,共11页
硫醇保护的金团簇(Au_m(SR)_n,m和n为Au和SR的数目)由于其特殊的光学、电学性质以及特别的物理/化学性质,在纳米催化、生物医学和光学设备中具有潜在的应用价值。Au_(102)(SR)_(54)和Au_(25)(SR)_(18)-团簇单晶结构的确定是Au_m(SR)_n...
硫醇保护的金团簇(Au_m(SR)_n,m和n为Au和SR的数目)由于其特殊的光学、电学性质以及特别的物理/化学性质,在纳米催化、生物医学和光学设备中具有潜在的应用价值。Au_(102)(SR)_(54)和Au_(25)(SR)_(18)-团簇单晶结构的确定是Au_m(SR)_n团簇合成的两大突破,它们的结构揭示了Au_m(SR)_n团簇中Au-S键新的成键特征和新的原子堆积方式。本文总结了Au_m(SR)_n团簇实验合成单晶结构的研究成果,概述了有谱图无单晶结构的Au_m(SR)_n团簇的实验进展,介绍了密度泛函理论预测Au_m(SR)_n团簇的研究概况,并结合本课题组的研究课题归纳了解释团簇稳定性和化学成键方式的超原子复合物模型,超原子网络模型和超级共价键模型及其应用。最后,对Au_m(SR)_n团簇的研究趋势进行了展望。
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关键词
Aum(SR)n团簇
单晶结构
质谱
密度泛函理论方法
超原子复合物模型
超原子网络模型
超级共价键模型
原文传递
考虑线路介数和well-being风险贡献度的电网脆弱线路评估
被引量:
8
3
作者
熊世旺
郭创新
+2 位作者
何宇斌
王威
谢宇哲
《电力建设》
北大核心
2015年第12期84-90,共7页
输电线路脆弱性评估是电网脆弱性研究的重要内容,现有评价方法评价角度单一,且无法考虑天气因素的影响,缺乏实用性,为此,提出了一种评估输电线路脆弱性的新方法。基于加权介数模型,计算线路加权介数指标,基于w ell-being风险追踪模型,...
输电线路脆弱性评估是电网脆弱性研究的重要内容,现有评价方法评价角度单一,且无法考虑天气因素的影响,缺乏实用性,为此,提出了一种评估输电线路脆弱性的新方法。基于加权介数模型,计算线路加权介数指标,基于w ell-being风险追踪模型,计算考虑元件敏感度的w ell-being风险贡献度指标。同时,结合两状态天气模型,研究了恶劣天气对线路脆弱性的影响。结合线路介数和well-being风险贡献度提出了兼顾系统网络结构和运行状态特性的综合脆弱性指标,并给出了输电线路脆弱性评估方法流程。最后对IEEE-RTS系统进行仿真,结果证明了所提指标和方法的合理性和实用性,该方法可以辨识出处于电网关键输电通道上的脆弱线路,为电网运行维护提供参考。
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关键词
脆弱线路
复杂网络
线路介数
well-being风险贡献度
综合脆弱性
原文传递
题名
一种拓扑与生物功能一致的多网络比对算法
1
作者
夏金芳
陈璟
机构
江南大学人工智能与计算机学院
江南大学物联网技术应用教育部工程研究中心
出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2020年第10期2146-2151,共6页
基金
江苏省青年科学基金项目(BK20150159)资助。
文摘
生物网络比对是一种常用的研究生物分子间相互作用的方法,也是分析物种间功能差异的重要手段,有助于更好地理解生物进程及功能.本文提出的ConAlign是一种快速且有效的多对多的多网络全局比对算法.首先,利用网络节点间的拓扑相似性补充序列相似性.然后,结合网络整体的拓扑相似性和指定约束条件将蛋白质相互作用网络进行比对.本算法分别在合成网络和真实网络上进行了实验,并与IsoRankN、BEAMS、SMETANA算法对比.实验结果表明,ConAlign算法识别出了更多的直系同源物,在生物和拓扑方面也表现优异,此外,在保证簇的拓扑与生物功能一致性的前提下,比对的效率也得到了提升.
关键词
复杂网络
PPI网络
多网络比对
拓扑与生物功能一致性
图匹配
Keywords
complex netw ork
PPI
netw
ork
multiple
netw
ork
alignment
topology and biological function consistency
graph matching
分类号
TP393 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
硫醇保护金团簇的实验和理论研究现状
2
作者
田志美
刘汪丹
程龙玖
机构
安徽大学化学化工学院
阜阳师范学院化学与材料工程学院
出处
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期1743-1753,共11页
基金
国家自然科学基金项目(No.21273008
21573001)资助~~
文摘
硫醇保护的金团簇(Au_m(SR)_n,m和n为Au和SR的数目)由于其特殊的光学、电学性质以及特别的物理/化学性质,在纳米催化、生物医学和光学设备中具有潜在的应用价值。Au_(102)(SR)_(54)和Au_(25)(SR)_(18)-团簇单晶结构的确定是Au_m(SR)_n团簇合成的两大突破,它们的结构揭示了Au_m(SR)_n团簇中Au-S键新的成键特征和新的原子堆积方式。本文总结了Au_m(SR)_n团簇实验合成单晶结构的研究成果,概述了有谱图无单晶结构的Au_m(SR)_n团簇的实验进展,介绍了密度泛函理论预测Au_m(SR)_n团簇的研究概况,并结合本课题组的研究课题归纳了解释团簇稳定性和化学成键方式的超原子复合物模型,超原子网络模型和超级共价键模型及其应用。最后,对Au_m(SR)_n团簇的研究趋势进行了展望。
关键词
Aum(SR)n团簇
单晶结构
质谱
密度泛函理论方法
超原子复合物模型
超原子网络模型
超级共价键模型
Keywords
Aum(SR)ncluster
single crystal structure
mass spectroscopy
density functional theory method
superatom
complex
model
superatom-
netw
ork
model
super valence bond model
分类号
O614.123 [理学—无机化学]
O641.121 [理学—物理化学]
原文传递
题名
考虑线路介数和well-being风险贡献度的电网脆弱线路评估
被引量:
8
3
作者
熊世旺
郭创新
何宇斌
王威
谢宇哲
机构
浙江大学电气工程学院
国网浙江省电力公司宁波供电公司
出处
《电力建设》
北大核心
2015年第12期84-90,共7页
基金
国家重点基础研究发展计划项目(973)(2013CB228206)
国家自然科学基金项目(51177143)~~
文摘
输电线路脆弱性评估是电网脆弱性研究的重要内容,现有评价方法评价角度单一,且无法考虑天气因素的影响,缺乏实用性,为此,提出了一种评估输电线路脆弱性的新方法。基于加权介数模型,计算线路加权介数指标,基于w ell-being风险追踪模型,计算考虑元件敏感度的w ell-being风险贡献度指标。同时,结合两状态天气模型,研究了恶劣天气对线路脆弱性的影响。结合线路介数和well-being风险贡献度提出了兼顾系统网络结构和运行状态特性的综合脆弱性指标,并给出了输电线路脆弱性评估方法流程。最后对IEEE-RTS系统进行仿真,结果证明了所提指标和方法的合理性和实用性,该方法可以辨识出处于电网关键输电通道上的脆弱线路,为电网运行维护提供参考。
关键词
脆弱线路
复杂网络
线路介数
well-being风险贡献度
综合脆弱性
Keywords
vulnerable line
complex netw ork
line betw eenness
w ell-being risk contribution degree
integrative vulnerability
分类号
TM721 [电气工程—电力系统及自动化]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种拓扑与生物功能一致的多网络比对算法
夏金芳
陈璟
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2020
0
下载PDF
职称材料
2
硫醇保护金团簇的实验和理论研究现状
田志美
刘汪丹
程龙玖
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
原文传递
3
考虑线路介数和well-being风险贡献度的电网脆弱线路评估
熊世旺
郭创新
何宇斌
王威
谢宇哲
《电力建设》
北大核心
2015
8
原文传递
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