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α-变形菌纲新的保守特征性插入缺失
被引量:
1
1
作者
吕志堂
王静
+1 位作者
周燕霞
张维维
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2016年第2期1-7,共7页
在基于16S rRNA基因的分类系统中α-变形菌被定为变形菌门的一个纲。本文根据系统发育基因组学分析,首次发现并鉴定了α-变形菌纲普遍存在的5个保守特征性插入缺失(CSIs)。23S rRNA基因具有1个98-105 nt的特征性缺失和1个5-7 nt的特...
在基于16S rRNA基因的分类系统中α-变形菌被定为变形菌门的一个纲。本文根据系统发育基因组学分析,首次发现并鉴定了α-变形菌纲普遍存在的5个保守特征性插入缺失(CSIs)。23S rRNA基因具有1个98-105 nt的特征性缺失和1个5-7 nt的特征性插入,DNA复制解旋酶(DnaB)具有1个17-29 aa的特征性插入,精氨酰-tRNA合成酶(ArgRS)具有1个15 aa的特征性插入,DNA促旋酶A亚基(GyrA)具有1个27-63 aa的特征性插入。α-变形菌纲的这些CSIs使得该纲与包括变形菌门其他纲在内的其他细菌显著区分开来,为该群细菌系统发育及系统分类研究提供了可靠手段。
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关键词
α-变形菌纲
保守特征性插入缺失
系统发育基因组学
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职称材料
题名
α-变形菌纲新的保守特征性插入缺失
被引量:
1
1
作者
吕志堂
王静
周燕霞
张维维
机构
河北大学生命科学学院河北省微生物多样性研究与应用实验室
药物化学与分子诊断教育部重点实验室(河北大学)
出处
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2016年第2期1-7,共7页
基金
河北省生物工程重点学科建设项目(1050-5030023)
河北省生物学强势特色学科建设项目(1050-5030004)
文摘
在基于16S rRNA基因的分类系统中α-变形菌被定为变形菌门的一个纲。本文根据系统发育基因组学分析,首次发现并鉴定了α-变形菌纲普遍存在的5个保守特征性插入缺失(CSIs)。23S rRNA基因具有1个98-105 nt的特征性缺失和1个5-7 nt的特征性插入,DNA复制解旋酶(DnaB)具有1个17-29 aa的特征性插入,精氨酰-tRNA合成酶(ArgRS)具有1个15 aa的特征性插入,DNA促旋酶A亚基(GyrA)具有1个27-63 aa的特征性插入。α-变形菌纲的这些CSIs使得该纲与包括变形菌门其他纲在内的其他细菌显著区分开来,为该群细菌系统发育及系统分类研究提供了可靠手段。
关键词
α-变形菌纲
保守特征性插入缺失
系统发育基因组学
Keywords
α-Proteobacteria
conserved signature indels(csis)
phylogenomics
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
α-变形菌纲新的保守特征性插入缺失
吕志堂
王静
周燕霞
张维维
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2016
1
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引证文献
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