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Hydrogen-bonded Three-Dimensional Networks Encapsulating One-dimensional Covalent Chains: [Cu(3-ampy)(H_2O)_4](SO_4)·(H_2O) (3-ampy = 3-Aminopyridine)
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作者 潘万龙 黄坤林 +1 位作者 许颜清 胡长文 《Chinese Journal of Structural Chemistry》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第7期822-826,共5页
A three-dimensional complex [Cu(3-ampy)(HEO)4](SO4)·(H2O) (3-ampy = 3-amino- pyridine) has been synthesized. Crystallographic data: C5H16CuN2O9S, Mr = 343.80, triclinic, space group P1, a = 7.675(2),... A three-dimensional complex [Cu(3-ampy)(HEO)4](SO4)·(H2O) (3-ampy = 3-amino- pyridine) has been synthesized. Crystallographic data: C5H16CuN2O9S, Mr = 343.80, triclinic, space group P1, a = 7.675(2), b = 8.225(3), c = 10.845(3)A, α= 86.996(4), β = 76.292(4), γ= 68.890(4)°, V = 620.0(3)A^3, Z = 2, Dc = 1.841 g/cm^3, F(000) = 354 and μ = 1.971 mm^-1. The structure was refined to R = 0.0269 and wR = 0.0659 for 1838 observed reflections (I 〉 2a(/)). The structure consists of [Cu(3-ampy)(H2O)4]^2+ cations, SO4^2- anions and lattice water molecules. 3-Ampy acting as a bidentate bridging ligand generates a 1D covalent chain. A supramolecular 2D framework is formed through π-π stacking of pyridine rings. The lattice water molecules and SO4^2- anions are located between the adjacent 2D frameworks. The hydrogen bonding interactions from lattice water molecules and SO4^2- anions to coordinate water extend the 2D framework into a 3D network. 展开更多
关键词 three-dimension covalent chains 3-aminopyridine hydrogen bonds π-π stacking
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单功能过氧化氢酶的高级结构 被引量:7
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作者 王伟 孙谧 刘万顺 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期197-202,共6页
单功能过氧化氢酶是在生物界广泛分布的抗氧化酶.近年来,人们在对单功能过氧化氢酶一级结构与生化性质深入研究的基础上,针对十几种单功能过氧化氢酶的高度保守的空间结构开展了研究.认识了其活性中心的血红素及周围保守残基,发现了酶... 单功能过氧化氢酶是在生物界广泛分布的抗氧化酶.近年来,人们在对单功能过氧化氢酶一级结构与生化性质深入研究的基础上,针对十几种单功能过氧化氢酶的高度保守的空间结构开展了研究.认识了其活性中心的血红素及周围保守残基,发现了酶的许多特殊结构,如方向不同的血红素,增强酶抗氧化性的侧链残基的共价键和保证酶高效催化的分子内通道等.本文综述了单功能过氧化氢酶空间结构研究现状,概括了酶构象的基本特点,分析了关注和争议较多的酶血红素、肽链侧链共价键及酶分子内通道等重点问题.深入研究单功能过氧化氢酶空间结构是一挑战性的课题,它将推动酶蛋白高级结构形成和酶催化模式等基础理论研究. 展开更多
关键词 单功能过氧化氢酶 高级结构 血红素 肽链侧链共价键 内通道
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重组毕赤酵母细胞壁蛋白的抽提和分析 被引量:1
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作者 林影 周新莹 +3 位作者 韩双艳 张莉 叶燕锐 郑穗平 《华南理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第5期101-106,120,共7页
建立稳定有效的细胞壁蛋白(CWPs)抽提方法,是开展毕赤酵母细胞壁蛋白质组学及甲醇代谢调控相关性研究的基础.为此,以具重组非共价结合壁蛋白Flo1p絮凝素的酵母GS115/KFS-CALB、具共价结合壁蛋白α凝集素的酵母GS115/KNS-CALB和具重组共... 建立稳定有效的细胞壁蛋白(CWPs)抽提方法,是开展毕赤酵母细胞壁蛋白质组学及甲醇代谢调控相关性研究的基础.为此,以具重组非共价结合壁蛋白Flo1p絮凝素的酵母GS115/KFS-CALB、具共价结合壁蛋白α凝集素的酵母GS115/KNS-CALB和具重组共价结合壁蛋白Pir1的酵母GS115/Pir1-CALB为对象,用热十二烷基磺酸钠(SDS)、昆布多糖酶、氢氟酸吡啶和温和碱水解对上述壁蛋白进行抽提,结果表明:3种壁蛋白已成功地展示于毕赤酵母细胞壁的表面;用这3种毕赤酵母锚定蛋白展示脂肪酶,对细胞的生长状况影响不大,而对展示酶的表达量影响较大,GS115/KFS-CALB、GS115/KNS-CALB和GS115/Pir1-CALB的脂肪酶水解比酶活最高达855.02、1239.40和210.47 U/g(以干细胞计);热SDS可有效抽提GS115/KFS-CALB上的Flo1p絮凝素,昆布多糖酶和氢氟酸吡啶可释放GS115/KNS-CALB上的α凝集素,而昆布多糖酶和温和碱可释放GS115/Pir1-CALB上的Pir1. 展开更多
关键词 巴斯德毕赤酵母 细胞壁蛋白 非共价结合 共价结合 抽提方法
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蛋白质二级结构的红外光谱 被引量:18
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作者 周瑞明 沈永嘉 《华东理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 1997年第4期422-425,共4页
蛋白质的多肽链组成了各种特定的三维空间构象,氢键在维系这种构造中起着十分重要的作用。本文通过红外光谱法研究了蛋白质的二级结构和氢键在维系这种构造中的作用,发现具有螺旋和折叠构象的多肽链主要以反式构象为特征排布。
关键词 蛋白质 红外光谱 多肽链 氢键 二级结构
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乙型肝炎病毒cccDNA与HBx蛋白在肝细胞性肝癌中表达的关系及意义 被引量:8
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作者 潘爱萍 黄古叶 +1 位作者 陈晶 何燕玲 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2009年第7期712-715,共4页
目的:探讨肝细胞性肝癌中乙型肝炎病毒(HBV)cccDNA与HBx蛋白表达的关系及其意义.方法:取42例肝细胞性肝癌患者的癌和癌旁组织,采用SABC法检测组织中的HBx蛋白;采用RT-PCR法检测组织中的HBV cccDNA水平.结果:HBx蛋白在癌及癌旁组织中的... 目的:探讨肝细胞性肝癌中乙型肝炎病毒(HBV)cccDNA与HBx蛋白表达的关系及其意义.方法:取42例肝细胞性肝癌患者的癌和癌旁组织,采用SABC法检测组织中的HBx蛋白;采用RT-PCR法检测组织中的HBV cccDNA水平.结果:HBx蛋白在癌及癌旁组织中的阳性例数分别为31例(73.8%)和35例(83.3%),无显著性差异;癌旁组织中cccDNA水平较癌组织中的高,但是统计学检验无显著性差异;癌组织和癌旁组织中HBx蛋白(+)者的cccDNA水平均明显高于HBx蛋白(-)者(P<0.05).HBx蛋白表达与cccDNA水平呈正相关(r=0.778,P<0.01).结论:HBx蛋白的表达与cccDNA水平明显相关,他们相互作用、相互影响并在肝癌的发生发展中起重要作用. 展开更多
关键词 共价闭合环状DNA 乙型肝炎病毒X蛋白 肝细胞性肝癌 适时聚合酶链反应
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大分子拥挤体系下葡聚糖对SPI的共价修饰 被引量:1
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作者 齐军茹 卓秀英 +2 位作者 杨晓泉 尹寿伟 黄立新 《华南理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第12期121-126,共6页
为探讨糖链对蛋白质的共价修饰作用,在大分子拥挤体系中通过Maillard反应制备了大豆分离蛋白(SPI)-葡聚糖共价复合物(SDC),通过十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳、荧光光谱、凝胶渗透色谱、圆二色光谱等方法研究了葡聚糖共价键入后对... 为探讨糖链对蛋白质的共价修饰作用,在大分子拥挤体系中通过Maillard反应制备了大豆分离蛋白(SPI)-葡聚糖共价复合物(SDC),通过十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳、荧光光谱、凝胶渗透色谱、圆二色光谱等方法研究了葡聚糖共价键入后对SPI功能和构象的影响.结果表明,大豆分离蛋白和葡聚糖发生共价结合;Maillard反应的适宜条件为SPI/葡聚糖质量比1∶1,温度60℃、反应时间30 h;在大分子拥挤体系中,与未经Maillard反应的SPI/葡聚糖混合物相比,SDC表面的疏水基团减少,乳化活性较高;与SPI相比,SDC的热稳定性提高;糖链的键入使SPI的结构发生了变化,柔韧性有所增加,更有利于发挥其功能. 展开更多
关键词 大分子拥挤 大豆分离蛋白 葡聚糖 共价键 MAILLARD反应
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食品功能因子传递系统——双层乳液研究进展 被引量:10
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作者 吕沛峰 王迪 +1 位作者 高彦祥 袁芳 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第21期285-292,共8页
双层乳液是多层乳液的一种,一般通过层-层静电自组装技术形成两层界面层,其两个界面层可由蛋白质、多糖等生物聚合物或磷脂、吐温等小分子表面活性剂以静电吸附或共价结合的方式形成于乳液液滴的表面。作为一种传递体系,与传统的单层乳... 双层乳液是多层乳液的一种,一般通过层-层静电自组装技术形成两层界面层,其两个界面层可由蛋白质、多糖等生物聚合物或磷脂、吐温等小分子表面活性剂以静电吸附或共价结合的方式形成于乳液液滴的表面。作为一种传递体系,与传统的单层乳液相比,双层乳液在结构稳定性和抵抗环境压力(如酸碱度、温度和离子强度等)方面更具优势,能对所包埋的生物活性物质提供更好的保护,且具有一定的控释能力。双层乳液因其独特的优势在食品工业生产以及功能食品的开发等领域具有广阔的发展前景。本文结合近年来双层乳液的研究,从双层乳液的制备、界面层的材料、理化稳定性、作为一种传递体系的特点及其在食品领域的应用等方面进行综述。 展开更多
关键词 双层乳液 蛋白质 多糖 静电吸附 共价键 传递系统
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超高压技术在肉类杀菌及品质改善中的应用进展 被引量:8
8
作者 甄宗圆 李志杰 +2 位作者 梁迪 李景军 李先保 《现代食品科技》 CAS 北大核心 2021年第8期350-356,374,共8页
超高压技术是一种新型的食品非热物理加工技术,在肉类杀菌和品质改善方面具有较高应用价值,是肉类食品领域的研究热点之一。由于存在一定局限性,超高压技术尚未在肉类工业中得到广泛应用。本文从超高压处理影响非共价键间的作用力、蛋... 超高压技术是一种新型的食品非热物理加工技术,在肉类杀菌和品质改善方面具有较高应用价值,是肉类食品领域的研究热点之一。由于存在一定局限性,超高压技术尚未在肉类工业中得到广泛应用。本文从超高压处理影响非共价键间的作用力、蛋白质结构、细胞结构以及细胞中水分的分布四个方面介绍其作用机理,并综述了目前超高压技术在改善肉类的嫩度、保水性、凝胶性、颜色、杀菌、冻藏品质等方面的研究及应用进展。在此基础上进行分析和展望,认为超高压技术在改善肉及肉制品嫩度、保水性、凝胶性等食用品质方面有望成为主要的研究和应用方向。为达到规模化生产的要求,未来在技术装备水平提升的基础上,应通过增强应用效果、提高应用效率、扩展应用范围等方式提升超高压技术在肉类工业中的应用水平和范围。 展开更多
关键词 超高压 肉类 蛋白质 非共价键 凝胶性
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Rapid Evaluation of Individual Hydrogen Bonding Energies in Linear Water Chains
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作者 HAO Jiaojiao LI Shushi JIANG Xiaonan HUANG Cuiying WANG Changsheng 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2014年第3期447-454,共8页
A model is proposed to rapidly evaluate the individual hydrogen bonding energies in linear water chains. We regarded the two O--H bonds of a water molecule as two dipoles. The magnitude of the O--H bond dipole mo- men... A model is proposed to rapidly evaluate the individual hydrogen bonding energies in linear water chains. We regarded the two O--H bonds of a water molecule as two dipoles. The magnitude of the O--H bond dipole mo- ment can be varied due to the other water molecules' presence. An analytic potential energy function, which explicitly contains the permanent dipole-dipole interactions, the polarization interactions, the van der Waals interactions and the covalent interactions, was therefore established. The individual hydrogen bonding energies in a series of linear water chains were evaluated via the analytic potential energy function and compared with those obtained from the CP-corrected MP2/aug-cc-pVTZ calculations. The results show that the analytic potential energy function not only can produce the individual hydrogen bonding energies as accurately as the CP-corrected MP2/aug-cc-pVTZ method, but is very efficient as well, demonstrating the model proposed is reasonable and useful. Based on the individual hy- drogen bonding energies obtained, the hydrogen bonding cooperativity in the linear water chains was explored and the natures of the hydrogen bonding in these water chains were discussed. 展开更多
关键词 Hydrogen bond Dipole-dipole interaction Polarization COVALENCY Water chain COOPERATIVITY
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Recent developments in peptide ligation independent of amino acid side-chain functional group 被引量:3
10
作者 Jinhua Yang Junfeng Zhao 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS CSCD 2018年第1期97-112,共16页
Chemical synthesis of peptides and proteins has evolved into an indispensable tool for chemical biology. Peptide ligation is a straightforward technique for joining two short peptide fragments together via a native pe... Chemical synthesis of peptides and proteins has evolved into an indispensable tool for chemical biology. Peptide ligation is a straightforward technique for joining two short peptide fragments together via a native peptide bond to afford a larger natural peptide or protein. However, the junction sites are limited to several specific amino acids because most peptide ligations involve participation of the side-chain functional groups of the junction-site amino acids. To overcome such intrinsic limitations, "general"peptide ligations which do not rely on the side-chain functional group have been developed. This review summarized the recent developments in peptide ligations that are independent of side-chain functional group of ligation-junction-site amino acid. 展开更多
关键词 peptide ligation amide bond formation independent of side-chain functional group amino acid protein
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豆腐柴对面团面筋网络结构劣变影响研究
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作者 张博安 杜文凯 +2 位作者 张亚辉 刘一 张海华 《中国粮油学报》 CAS 2024年第10期52-58,共7页
开发豆腐柴面条是挖掘豆腐柴资源的有效增值途径,但豆腐柴的存在使得面团的形成时间和稳定时间显著缩短。以不同添加量的豆腐柴-小麦粉混粉面团为研究对象,从分子及原子尺度上研究面团面筋网络结构的变化。结果发现,宏观上的劣变归因于... 开发豆腐柴面条是挖掘豆腐柴资源的有效增值途径,但豆腐柴的存在使得面团的形成时间和稳定时间显著缩短。以不同添加量的豆腐柴-小麦粉混粉面团为研究对象,从分子及原子尺度上研究面团面筋网络结构的变化。结果发现,宏观上的劣变归因于分子尺度上谷蛋白高分子聚合体含量的降低和二级结构的变化(α-螺旋结构降低、β-折叠结构的增多、无规则卷曲增多),而分子尺度结构的变化又是由原子尺度上面团中化学作用力所决定,即添加豆腐柴后面团中占优势的疏水作用变成了共价键,而面团中二硫键虽趋于稳定态的g-g-g构型但含量无显著变化,这也是豆腐柴面团稳定时间和形成时间降低的根本原因。 展开更多
关键词 豆腐柴 面团 面筋蛋白 二级结构 共价键
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基于规律成簇的间隔短回文重复序列及其相关蛋白技术检测乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA方法的建立 被引量:1
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作者 王俊文 田原 +7 位作者 范子豪 徐玲 高耀 曹亚玲 潘桢桢 张向颖 宋岩 任锋 《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》 CAS 2022年第5期320-327,共8页
目的建立一种基于规律成簇的间隔短回文重复序列及其相关蛋白(CRISPR/Cas13a)的乙型肝炎病毒(HBV)共价闭合环状DNA(HBV cccDNA)检测方法。方法提取2017年6月至2020年10月于首都医科大学附属北京佑安医院就诊的4例乙型肝炎患者肝脏总DNA... 目的建立一种基于规律成簇的间隔短回文重复序列及其相关蛋白(CRISPR/Cas13a)的乙型肝炎病毒(HBV)共价闭合环状DNA(HBV cccDNA)检测方法。方法提取2017年6月至2020年10月于首都医科大学附属北京佑安医院就诊的4例乙型肝炎患者肝脏总DNA后,使用HindⅢ内切酶和质粒安全性ATP依赖DNA酶(PSAD)分别进行酶切;根据松弛环状DNA(rcDNA)和cccDNA的结构差异,设计特异性扩增HBV cccDNA的引物,对酶切后的产物进行滚环扩增(RCA)和PCR扩增;并筛选crRNA,建立基于CRISPR/Cas13a技术的HBV cccDNA检测新方法。结果利用α-1-抗胰蛋白酶(A1AT)和HBV表面抗原(HBsAg)引物对双重酶切后的产物进行扩增,验证产物中HBV基因组的存在;利用HBV cccDNA和HBV rcDNA引物对PSDA酶切后的产物扩增,验证了产物中只存在HBV cccDNA;利用RCA后的阳性样本作为模板梯度稀释,然后进行PCR扩增转录后使用CRISPR/Cas13a检测,计算出检测下限为10拷贝/μl。结论本研究建立了RCA-PCR-CRISPR-Cas13a的新型检测方法,可对HBV cccDNA进行高灵敏度和高特异性检测,为乙型肝炎患者抗病毒治疗评估、治疗终点的确定以及调整治疗方案提供了有效的监测手段。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 共价闭合环状DNA 规律成簇的间隔短回文重复序列及其相关蛋白 微滴数字聚合酶链反应 荧光定量聚合酶链反应
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超高压对蛋白质的影响 被引量:28
13
作者 李仁杰 廖小军 +1 位作者 胡小松 吴继红 《高压物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期498-506,共9页
在现有的超高压对蛋白质影响研究的基础上,详细地总结了超高压对蛋白质的分子体积、非共价键和分子结构的影响。在超高压作用下,蛋白质的分子体积被压缩变小;压力通过改变蛋白质分子的氢键、离子键、水合作用和疏水相互作用来影响蛋白... 在现有的超高压对蛋白质影响研究的基础上,详细地总结了超高压对蛋白质的分子体积、非共价键和分子结构的影响。在超高压作用下,蛋白质的分子体积被压缩变小;压力通过改变蛋白质分子的氢键、离子键、水合作用和疏水相互作用来影响蛋白质结构;低于800MPa的压力会造成蛋白质分子的二级、三级和四级结构的改变,其中四级结构对压力最敏感,三级结构次之,二级结构的改变较小;高于8GPa的压力会影响蛋白质分子的一级结构。 展开更多
关键词 超高压 蛋白质 分子体积 非共价键 结构
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尿酸氧化酶的表达纯化及活性形式鉴定 被引量:2
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作者 吴伟立 李彦英 +3 位作者 苗林 徐金森 方宏清 陈惠鹏 《军事医学科学院院刊》 CSCD 北大核心 2005年第2期124-126,131,共4页
目的:在大肠杆菌内表达具有活性的黄曲霉尿酸氧化酶。方法:用重叠PCR从黄曲霉(Aspergillusflavus)3.1398中钓取了尿酸氧化酶(urateoxidase,UO,EC1.7.3.3)基因,克隆到原核表达载体pET22b中,转化大肠杆菌BL21(DE3),筛选到高表达的重组转... 目的:在大肠杆菌内表达具有活性的黄曲霉尿酸氧化酶。方法:用重叠PCR从黄曲霉(Aspergillusflavus)3.1398中钓取了尿酸氧化酶(urateoxidase,UO,EC1.7.3.3)基因,克隆到原核表达载体pET22b中,转化大肠杆菌BL21(DE3),筛选到高表达的重组转化子菌株。经乳糖诱导目的蛋白表达,阴离子交换柱纯化,获得纯品。SDS PAGE分析样品纯度。用尿酸缓冲液测定酶活性,用戊二醛交联结合质谱法测定相对分子质量。结果:目的蛋白为胞内可溶性表达,表达量达菌体总蛋白的35%,纯化后的样品纯度达99%,其酶比活力可达35U/mg。经质谱测定重组UO单体的相对分子质量为34×103。交联后相对分子质量为160×103。结论:黄曲霉尿酸氧化酶可在大肠杆菌中可溶表达,并具有活性,其活性形式为四聚体。 展开更多
关键词 尿酸氧化酶 重组蛋白质类 大肠杆菌 共价交联 聚合酶链反应
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