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线粒体DNA COX3基因多态性与瓢鸡生长和屠体性状的相关性分析 被引量:4
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作者 李杨 杨向东 +3 位作者 王静 张斌 黄英 史宪伟 《中国家禽》 北大核心 2015年第8期12-15,共4页
采用DNA测序和PCR-RFLP方法,分析了瓢鸡线粒体DNA COX3基因(mt DNA COX3)变异,并与生长和屠体性状进行了关联分析。在瓢鸡线粒体DNA COX3基因发现C10669T多态位点,建立了Eco RV PCR-RFLP分子标记,利用该标记对300日龄具有生长和屠体性... 采用DNA测序和PCR-RFLP方法,分析了瓢鸡线粒体DNA COX3基因(mt DNA COX3)变异,并与生长和屠体性状进行了关联分析。在瓢鸡线粒体DNA COX3基因发现C10669T多态位点,建立了Eco RV PCR-RFLP分子标记,利用该标记对300日龄具有生长和屠体性状记录的82只瓢鸡进行了基因分型。结果表明,线粒体DNA COX3基因C10669T多态位点在瓢鸡群体中C基因为优势基因,基因频率为69.5%,多态信息含量和杂合度分别为0.3341与0.4240。C10669T位点基因型在体重、龙骨长、跖长、屠体重与胸肌率5个性状差异显著,C基因型个体普遍高于T基因型。线粒体DNA COX3基因对瓢鸡生长和屠体性状的作用机理有待进一步深入分析。 展开更多
关键词 瓢鸡 线粒体DNA cox3基因 多态性 生长性能 屠宰性能
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长爪沙鼠ATPase8,ATPase6,COX3基因的克隆及序列分析 被引量:3
2
作者 李长龙 柯贤福 +2 位作者 卢领群 郭红刚 萨晓婴 《中国比较医学杂志》 CAS 2011年第7期6-12,共7页
目的对长爪沙鼠线粒体ATPase8,ATPase6,COX3基因全序列进行测定,并对其进行鉴定及进化分析。方法根据长爪沙鼠已知基因序列设计引物,采用PCR产物测序法,对目的片段进行测序鉴定。结合已公布啮齿类动物ATPase8,ATPase6,COX3基因序列,分... 目的对长爪沙鼠线粒体ATPase8,ATPase6,COX3基因全序列进行测定,并对其进行鉴定及进化分析。方法根据长爪沙鼠已知基因序列设计引物,采用PCR产物测序法,对目的片段进行测序鉴定。结合已公布啮齿类动物ATPase8,ATPase6,COX3基因序列,分析其碱基组成、遗传距离、并基于最小进化法和UPGMA法构建系统进化树。结果获得长爪沙鼠线粒体ATPase8,ATPase6,COX3基因全序列,其与家鼠、小家鼠和仓鼠均具有较高的同源性(76~98%);进化分析结果显示,长爪沙鼠与家鼠、黑家鼠和仓鼠遗传距离较近;碱基G的含量分别为6.9%,10.7%,15.2%,符合mtDNA的特点;A+T含量分别为68.2%,64.1%,59.2%,明显低于G+C含量,符合哺乳动物的特点。结论本研究为首次获得长爪沙鼠ATPase8,ATPase6,COX3基因全序列,长爪沙鼠与家鼠、黑家鼠和仓鼠具有较近遗传距离,本研究为长爪沙鼠进化研究、线粒体的结构和功能研究奠定基础。 展开更多
关键词 长爪沙鼠 ATPase8 ATPase6 cox3 克隆 进化分析
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猬迭宫绦虫线粒体cox3基因的克隆及序列分析 被引量:4
3
作者 伍慧兰 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第11期73-75,共3页
本研究旨在阐明猬迭宫绦虫湖南分离株线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)基因部分序列(pcox3)的遗传变异情况。利用聚合酶链反应(PCR)扩增猬迭宫绦虫的pcox3,应用ClustalX 1.81程序对序列进行比对,同时利用DNAStar5.0中的Megalign程... 本研究旨在阐明猬迭宫绦虫湖南分离株线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)基因部分序列(pcox3)的遗传变异情况。利用聚合酶链反应(PCR)扩增猬迭宫绦虫的pcox3,应用ClustalX 1.81程序对序列进行比对,同时利用DNAStar5.0中的Megalign程序进行同源性分析,再用Phylip 3.67程序MP法绘制系统发育树,并与GenBank中已知猬迭宫绦虫相应基因序列进行比对分析。结果显示,所获得的pcox3序列长度一致,均为264bp,湖南分离株与已知猬迭宫绦虫位于同一分支,来自湖南省的猬迭宫绦虫pcox3序列有微小差异。本研究结果为猬迭宫绦虫进一步的分类、鉴定和遗传变异研究奠定了基础。 展开更多
关键词 猬迭宫绦虫 线粒体DNA cox3基因 序列分析
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老挝家蚕线粒体cox3基因序列分析及分子进化研究初探 被引量:4
4
作者 宋宏图 李兵 沈卫德 《江苏蚕业》 2006年第4期14-17,共4页
对老挝家蚕品种L11的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)cox3基因(cox3)进行PCR扩增、克隆和序列分析。结果表明,在测定的909bp的片段中,含有ATPase 6基因及tRNA-Gly基因的部分序列和cox3全序列。其中,cox3读码框包括789个核苷酸,编码... 对老挝家蚕品种L11的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)cox3基因(cox3)进行PCR扩增、克隆和序列分析。结果表明,在测定的909bp的片段中,含有ATPase 6基因及tRNA-Gly基因的部分序列和cox3全序列。其中,cox3读码框包括789个核苷酸,编码262个氨基酸。L11 cox3和已经公布的家蚕(中国家蚕品种夏芳、日本家蚕Aojuku、韩国家蚕Backojam)mtDNAcox3基因完全一致,但与日本野桑蚕、中国野桑蚕的氨基酸同源性分别为99%和98%。 展开更多
关键词 老挝家蚕 MTDNA cox3 基因 分子进化
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COX3对肿瘤作用机制的研究进展 被引量:3
5
作者 周肖 程爱兰 甘润良 《求医问药(下半月刊)》 2012年第2期530-530,F0003,共2页
环氧化酶(Cyclooxygenase,COX)是合成前列腺素过程中的重要限速酶,维持机体的各种生命过程,并引起多种疾病发生与发展;早期发现其有两个同工酶(COX1和COX2),2002年又发现新的同工酶,即COX3。近年来研究表明,COX3可能成为解热镇痛药的新... 环氧化酶(Cyclooxygenase,COX)是合成前列腺素过程中的重要限速酶,维持机体的各种生命过程,并引起多种疾病发生与发展;早期发现其有两个同工酶(COX1和COX2),2002年又发现新的同工酶,即COX3。近年来研究表明,COX3可能成为解热镇痛药的新靶点,在特定情况下还参与细胞凋亡,有文献报告其在肿瘤的形成与发展、转移中也扮演着一定的角色.。 展开更多
关键词 环氧合酶 cox3 肿瘤
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5株堆形艾美耳球虫线粒体cox3基因的扩增及序列分析 被引量:5
6
作者 谢雯琴 谭志坚 +5 位作者 符德文 丘丽玲 翁亚彪 刘毅 林瑞庆 徐民俊 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第6期63-66,共4页
以5株堆形艾美耳球虫为研究对象,对其线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)的部分基因(pcox3)进行了PCR扩增、测序及序列分析,并与GenBank上已发表的顶复门原虫相关序列进行比较,研究其线粒体cox3基因遗传变异情况。结果每个虫株均获得5... 以5株堆形艾美耳球虫为研究对象,对其线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)的部分基因(pcox3)进行了PCR扩增、测序及序列分析,并与GenBank上已发表的顶复门原虫相关序列进行比较,研究其线粒体cox3基因遗传变异情况。结果每个虫株均获得572bp的目的片段,利用DNAStar软件进行序列比对,5株堆形艾美耳球虫线粒体pcox3序列完全一致,与疟原虫和住白细胞虫相应序列的相似性分别为51%和50%,而与泰勒虫的相似性少于50%。本研究首次报道了堆形艾美耳球虫pcox3序列,结果显示不同来源的堆形艾美耳球虫pcox3序列没有差异,与毒力无关,为进一步研究艾美耳球虫的群体遗传学奠定了基础。 展开更多
关键词 堆形艾美耳球虫 线粒体DNA cox3 序列分析
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基于cox3基因分析蛇源裂头蚴种系发育关系 被引量:5
7
作者 谢雯琴 唐伟 +2 位作者 胡丹 杨凌宸 刘伟 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期622-624,共3页
为分析野生蛇源裂头蚴与其它绦虫的种群遗传关系,本研究采集湖南省8个地区野生蛇肌肉中的裂头蚴,采用PCR方法对其线粒体cox3基因序列进行扩增、测序及分析。结果显示,湖南省8个裂头蚴分离株cox3基因核苷酸部分序列长度均为342 bp,其cox... 为分析野生蛇源裂头蚴与其它绦虫的种群遗传关系,本研究采集湖南省8个地区野生蛇肌肉中的裂头蚴,采用PCR方法对其线粒体cox3基因序列进行扩增、测序及分析。结果显示,湖南省8个裂头蚴分离株cox3基因核苷酸部分序列长度均为342 bp,其cox3基因核苷酸同源性为98.2%~100.0%,种内遗传差异性为0~1.8%,与其它科绦虫cox3基因核苷酸同源性为63.4%~73.9%,种间遗传差异较大,为26.1%~36.6%。cox3基因的系统进化分析结果显示,湖南省8个裂头蚴分离株与已知猬迭宫绦虫位于同一分支,与其它绦虫所属分支相隔较远。上述结果表明,蛇源裂头蚴线粒体cox3基因序列种内差异远低于种间差异,可以作为研究蛇源裂头蚴种系遗传变异的分子标记。本研究为蛇源裂头蚴的分子流行病学及其群体遗传研究奠定了基础。 展开更多
关键词 裂头蚴 cox3基因 系统进化关系
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基于mtDNA COX3基因对西藏特色牦牛群体遗传结构的分析
8
作者 者玉琦 武志娟 +3 位作者 王吉坤 钟金城 柴志欣 信金伟 《草业学报》 CSCD 北大核心 2023年第9期231-240,共10页
为探究西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系,本研究利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、类乌齐牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、桑日牦牛、江达牦牛7个群体共140头个体的mtDNA COX3基因蛋白质编码区(C... 为探究西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系,本研究利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、类乌齐牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、桑日牦牛、江达牦牛7个群体共140头个体的mtDNA COX3基因蛋白质编码区(CDS)序列,利用DNAMAN、DNASP 5.1、MEGA 7.0软件分析了其序列多态性、单倍体多样性,并构建了系统发育树。结果表明,西藏牦牛群体的COX3基因CDS序列长度均为781 bp,共检测获得55个变异位点。在140头个体中共检测出11种单倍型,平均单倍型多样性(H_(d))及核苷酸多样性(P_(i))分别为0.665和0.00480,说明西藏牦牛具有丰富的遗传多样性。西藏7个牦牛群体可分为2大类,类乌齐牦牛单独聚为一类,其余牦牛群体为一类。此外,11种单倍型可分为2个聚类簇,说明西藏牦牛可能存在两个母系起源。西藏7个牦牛群体可划分到家牦牛、原牛和普通牛三大单倍型群体中,其中Hap_2、Hap_3、Hap_4、Hap_6、Hap_7、Hap_8、Hap_10、Hap_11这8个单倍型属于家牦牛支系,Hap_5和Hap_9属于原牛和普通牛支系,Hap_1属于野牦牛支系,说明家牦牛、原牛和普通牛是西藏牦牛的混合母系起源,但受家牦牛影响较大。研究结果旨在为西藏牦牛的演化、遗传多样性以及遗传资源保护和利用提供理论依据。 展开更多
关键词 西藏牦牛 cox3基因 遗传多样性 系统进化
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一种基于线粒体COX3基因的赤狐皮毛TaqMan探针荧光PCR检测方法的建立
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作者 张海滨 王建华 +5 位作者 殷其刚 肖妍 王禹 刘洋 吴冬雪 王乃福 《中国口岸科学技术》 2024年第1期92-96,共5页
为建立一种快速检测赤狐皮毛的方法,试验根据赤狐皮毛线粒体COX3基因保守区设计了特异性引物和Taq Man探针,通过优化反应条件建立了一种检测赤狐皮毛的Taq Man探针荧光PCR检测方法。结果表明,该方法对赤狐皮毛具有特异性,不与兔皮毛、... 为建立一种快速检测赤狐皮毛的方法,试验根据赤狐皮毛线粒体COX3基因保守区设计了特异性引物和Taq Man探针,通过优化反应条件建立了一种检测赤狐皮毛的Taq Man探针荧光PCR检测方法。结果表明,该方法对赤狐皮毛具有特异性,不与兔皮毛、山羊皮毛、绵羊皮毛、貂皮毛和貉子皮毛发生交叉反应。该方法对质粒标准对照(PUC-VV-)的最适线性检测范围为4.8×10^(1)~4.8×10^(8) copies/μL,标准曲线方程为Y=-3.4752X+40.118,相关系数(r^(2))为0.9897,检测下限为48 copies/μL。对3个不同浓度的pCR-GPTV-ITR进行组内试验和组间试验,每个浓度的重复试验Ct值的变异系数均小于1.5%,具有良好的重现性。采用该方法检测2份赤狐皮毛为阳性,其他10份动物皮毛样品为阴性。本方法的建立为赤狐皮毛检测提供了一种快速准确的技术手段。 展开更多
关键词 赤狐皮毛 cox3基因 荧光PCR方法
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猪蛔虫线粒体cox3基因部分序列的比较分析 被引量:2
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作者 吴昌义 李冰 +2 位作者 乔进平 黄小容 林瑞庆 《畜牧与兽医》 北大核心 2011年第1期60-62,共3页
以采自广东4个不同地方的猪蛔虫为研究对象,PCR扩增其线粒体细胞色素c酶第3亚基(cox3)基因的部分序列并进行序列测定,测序之后与网上已发表的相关蛔虫的cox3序列进行比较分析。结果显示所有样品都扩增出了520 bp的cox3的部分序列,序列... 以采自广东4个不同地方的猪蛔虫为研究对象,PCR扩增其线粒体细胞色素c酶第3亚基(cox3)基因的部分序列并进行序列测定,测序之后与网上已发表的相关蛔虫的cox3序列进行比较分析。结果显示所有样品都扩增出了520 bp的cox3的部分序列,序列分析表明,不同地区的猪蛔虫样品cox3序列之间存在的种内差异在0.2%~2.8%,与网上发表犬弓首蛔虫、猫弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔虫的相应序列差异明显,分别是16.8%~17.4%、18.0%~19.5%、18.2%~18.7%。研究结果为进一步研究猪蛔虫的分子遗传和种群遗传学奠定了基础。 展开更多
关键词 猪蛔虫 线粒体 cox3 序列分析
原文传递
蓖麻蚕线粒体基因组细胞色素氧化酶亚基Ⅲ的序列及其分子进化分析 被引量:29
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作者 魏兆军 赵巧玲 +3 位作者 张志芳 肖庆利 王章娥 何家禄 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期193-197,共5页
测定了蓖麻蚕Samiacynthiaricini线粒体基因组 (mtDNA)含完整的细胞色素氧化酶亚基Ⅲ (COX3)、tRNA Gly和部分的NADH亚基Ⅲ (ND3)基因的DNA片段序列。COX3基因编码框包含 789个核苷酸 ,编码 2 6 2个氨基酸的蛋白质。通过同源性比较 ,发... 测定了蓖麻蚕Samiacynthiaricini线粒体基因组 (mtDNA)含完整的细胞色素氧化酶亚基Ⅲ (COX3)、tRNA Gly和部分的NADH亚基Ⅲ (ND3)基因的DNA片段序列。COX3基因编码框包含 789个核苷酸 ,编码 2 6 2个氨基酸的蛋白质。通过同源性比较 ,发现COX3基因的 3′端比 5′端要保守 ,其编码的蛋白在C端有两个保守序列存在。COX3的下游为 6 6bp的tRNA Gly基因。蓖麻蚕的COX3与家蚕COX3同源性最高 ,核苷酸和氨基酸序列同源性分别是 80 2 %和 85 6 %。根据COX3氨基酸序列进行了 12种无脊椎动物的分子进化树分析 ,认为在采用线粒体基因序列进行分子进化分析时 ,应该综合考虑物种的繁殖模式及生态特点。 展开更多
关键词 蓖麻蚕 线粒体基因组 细胞色素氧化酶亚基Ⅲ 序列 cox3基因 分子进化
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湖南湘西地区鸡蛔虫遗传多样性及种系发育关系研究 被引量:2
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作者 宋金秋 李晖 李中波 《中国家禽》 北大核心 2022年第8期116-120,共5页
为研究湖南省湘西地区鸡蛔虫的遗传多样性及种系发育关系,试验以采集于湖南省湘西自治州20条鸡蛔虫为研究对象,采用PCR扩增其线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅲ(Cytochrome c oxidase subunit Ⅲ,cox3)和核糖体18S rRNA的部分序列。结果显示:... 为研究湖南省湘西地区鸡蛔虫的遗传多样性及种系发育关系,试验以采集于湖南省湘西自治州20条鸡蛔虫为研究对象,采用PCR扩增其线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅲ(Cytochrome c oxidase subunit Ⅲ,cox3)和核糖体18S rRNA的部分序列。结果显示:PCR扩增获得的鸡蛔虫cox3、18S rRNA基因序列的长度分别为399 bp、637 bp,种内差异分别为0~1.5%、0~1.6%,种间差异分别为13.0%~40.1%、5.18%~61.38%;构建了基于cox3、18S rRNA基因序列的种系发育树,来自于湖南省湘西地区的鸡蛔虫均处于发育树的同一分支上。研究表明来自于湖南湘西地区的鸡蛔虫间尽管存在一定程度的基因变异和遗传多样性,但它们之间的亲缘关系较近。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 cox3 18S rRNA 遗传多样性 种系发育
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中国近海外来囊藻(Colpomenia peregrina)种群遗传多样性研究 被引量:3
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作者 宋小含 孙忠民 +1 位作者 胡自民 段德麟 《海洋科学》 CAS 北大核心 2020年第1期89-96,共8页
外来囊藻(Colpomeniaperegrina)是一种在潮间带分布广泛的褐藻,它能附着在牡蛎壳上进行跨海区扩散,因而是研究生物多样性变动和生物地理格局形成的良好模型。外来囊藻在中国沿海虽有分布,但关于其种群遗传多样性和分化研究的报道尚为空... 外来囊藻(Colpomeniaperegrina)是一种在潮间带分布广泛的褐藻,它能附着在牡蛎壳上进行跨海区扩散,因而是研究生物多样性变动和生物地理格局形成的良好模型。外来囊藻在中国沿海虽有分布,但关于其种群遗传多样性和分化研究的报道尚为空白。本研究采集了中国近海13个外来囊藻种群样本。通过扩增301条线粒体cox3序列,发现了26个单倍型;通过重建单倍型网络图和基于最大似然法与贝叶斯法重建系统进化树,发现外来囊藻种内遗传多样性较高, 13个种群划分为3个遗传世系,其中浙江南麂列岛的7个种群组成遗传世系A,辽宁和山东的样本则分化为遗传世系B和C。中国近海外来囊藻的这种种群遗传结构可能源于更新世末次盛冰期黄渤海、东海边缘海的环境变化和海平面的大幅下降。遗传世系A具有的较高单倍型多样性,其原因可能是南麂列岛独特的地理位置和潮间带环境的共同作用。 展开更多
关键词 外来囊藻 线粒体cox3 遗传多样性 世系分化
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樱草杜鹃等10种藏药材的COXⅢ基因部分片段的扩增与序列分析 被引量:1
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作者 郝豆豆 张勇群 +1 位作者 雷鸣 拉多 《西藏科技》 2018年第1期56-61,共6页
文章以樱草杜鹃、大花黄牡丹、长鞭红景天、露蕊乌头、苞叶雪莲、藏橐吾、独一味、砂生槐、拉萨蒲公英、拉萨小檗10种藏药材为研究对象,提取基因组DNA,对其线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)的部分片段进行了PCR扩增、测序及序列分析... 文章以樱草杜鹃、大花黄牡丹、长鞭红景天、露蕊乌头、苞叶雪莲、藏橐吾、独一味、砂生槐、拉萨蒲公英、拉萨小檗10种藏药材为研究对象,提取基因组DNA,对其线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)的部分片段进行了PCR扩增、测序及序列分析,用Bioedit软件与Gen Bank数据库中相关植物的序列进行序列比对,并用MEGA6.0软件做系统进化树(NJ),运用Codon W软件计算密码子的RSCU值。通过PCR扩增获得了10种藏药材的长度为750bp的目的片段,通过序列比对发现cox3基因在不同植物中变异位点较少,序列比较保守;基于cox3部分基因序列构建的NJ树反映了物种的进化关系,可以作为物种系统发育分析的补充;密码子偏好性分析发现,cox3基因偏好使用以AU结尾的密码子。樱草杜鹃等10种藏药材的COXⅢ基因部分片段的扩增与序列分析从序列比对分析、构建系统进化树、密码子偏好性分析水平上分析了cox3基因部分序列在樱草杜鹃等10种藏药材的差异,为植物cox3基因的功能、表达研究奠定了基础。 展开更多
关键词 藏药材 cox3基因 序列分析
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Assessment of introduced Kappaphycus (Solieriaceae, Rhodophyta) species relationships in China with molecular markers 被引量:4
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作者 LIU Chenlin HUANG Xiaohang LIU Jianguo 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2013年第2期59-65,共7页
Due to morphological plasticity and paucity of diagnostic morphological characters, the taxonomy of Kap- paphycus gets more and more confused with the expanding of commercial cultivation. In this study, the phylogenet... Due to morphological plasticity and paucity of diagnostic morphological characters, the taxonomy of Kap- paphycus gets more and more confused with the expanding of commercial cultivation. In this study, the phylogenetic relationship of 13 strains of introduced Kappaphycus species in China was defined using DNA molecular markers, such as 18S rDNA, rbcL and cox2-cox3 spacer region. The resolutions obtained by three different molecular markers were compared: both cox2--cox3 spacer region and rbcL sequences are eligible in inter- species identification of Kappaphycus, whereas cox2-cox3 spacer region is more variable than rbcL sequence. There is several basepairs' discrepancy among 18S rDNA sequences, while it is 100% identical among both cox2-cox3 spacer region and rbcL sequences of the ten strains of K. alvarezii. We suppose that 18S rDNA sequence can provide more information in biogeography study of Kappaphycus than other two DNA sequences. 展开更多
关键词 18S rDNA cox2-cox3 spacer region molecular marker Kappaphycus rbcL
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一株引起无菌性脑膜脑炎柯萨奇B组3型病毒的分离和VP1基因分析 被引量:1
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作者 李华 杨卉娟 +4 位作者 柯华昕 陈俊英 施海晶 孙强明 马绍辉 《医学研究杂志》 2011年第7期77-80,共4页
摘要目的对一株从无菌性脑膜脑炎患者中分离到的柯萨奇B组3型病毒(coxsackievirusB3,CVB3)分离株KMA103-09进行VP1区的基因特征分析。方法采用Hep-2、RD细胞对患者粪便标本进行病毒分离,肠道病毒组合血清进行鉴别,反转录-聚合酶链... 摘要目的对一株从无菌性脑膜脑炎患者中分离到的柯萨奇B组3型病毒(coxsackievirusB3,CVB3)分离株KMA103-09进行VP1区的基因特征分析。方法采用Hep-2、RD细胞对患者粪便标本进行病毒分离,肠道病毒组合血清进行鉴别,反转录-聚合酶链反应(RT—PCR)扩增病毒目的片段,测序后进行VP1基因分析,用Mega4.1等软件分析处理。结果肠道病毒组合血清鉴别为柯萨奇病毒B组3型(Cox.B3),从病毒性脑膜脑炎患者粪便标本中,分离到CVB3,其VPl区的核苷酸长度为849bp,未发现核苷酸插入与丢失。与山东04433/SD/CHN/2004/CB3株、山东05280/SD/CHN/2005/CB3株及山东YZ127/SD/CHN/2005/CB3株氨基酸同源,与其余国内分离株同源性高于为99.29%,与国外毒株的同源性为95.41%-96.47%。在进化树上与AM06HZ/SD/CHN/2006/CB3株显示在同一个分支上。结论分离的肠道病毒为柯萨奇病毒B组3型(Cox.B3),分离株(KMA103—09)VP1区变异较小。 展开更多
关键词 无菌性脑膜脑炎 柯萨奇病毒B组3型(Cox.B3) VP1基因
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New record of Lobophora rosacea(Dictyotales; Phaeophyceae) from the South China Sea 被引量:1
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作者 SUN Zhongmin 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2017年第1期192-197,共6页
Lobophora rosacea C.W. Vieira, Payri et De Clerck is reported from the South China Sea for the first time. Our specimens are very similar to L. rosacea recently described from New Caledonia, not only in morphology but... Lobophora rosacea C.W. Vieira, Payri et De Clerck is reported from the South China Sea for the first time. Our specimens are very similar to L. rosacea recently described from New Caledonia, not only in morphology but also in rbcL and cox3 gene sequences. The fan-shaped thallus grows erectly, attaching to the substrate by a basal holdfast. The thallus is composed of a single layer of large medullary cells and three to four layers of cortical cells on both sides of the medulla. Mature sporophytes are detected, with sporangium sori scattered on both surfaces of the thallus. 展开更多
关键词 cox3 rbcL Dictyotales Lobophora rosacea molecular phylogeny phaeophyceae
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四种红翎菜科红藻的分子系统学研究
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作者 刘涛 孙琰 +3 位作者 金月梅 刘翠 张磊 张思 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期39-48,共10页
红翎菜科海藻藻体形态结构多样,部分个体在长期进化过程中发生了形态特征的变异,其分类学一直是研究的热点和难点。本研究选取了23Sribosomal RNA gene(UPA)、cox2-3和rbc spacer 3个片段运用PCR扩增的方法研究了红翎菜科4种海藻的序列... 红翎菜科海藻藻体形态结构多样,部分个体在长期进化过程中发生了形态特征的变异,其分类学一直是研究的热点和难点。本研究选取了23Sribosomal RNA gene(UPA)、cox2-3和rbc spacer 3个片段运用PCR扩增的方法研究了红翎菜科4种海藻的序列结构特征,结果表明琼枝、卡帕藻属2种海藻和麒麟菜的UPA长度均为326bp,GC含量46.0%~46.3%;cox2-3序列长度分别为141、139和141bp,GC含量19.3%~23.7%;rbc spacer序列长度分别为93、93和94bp,GC含量22.3%~23.7%。利用PAUP软件分别用邻接法(NJ)、最大似然法(ML)和最大简约法(MP)对红翎菜科海藻进行系统发育分析,结果表明3个属海藻均可以通过UPA、cox2-3和rbc spacer 3个片段得到有效的区分,并且这3个片段也均可进一步将卡帕藻属2个种区分开来。本文在分析基因片段的基础上,比较了3个属不同物种间的信息位点,为分子系统学研究提供了一定的数据支持。 展开更多
关键词 麒麟菜 卡帕藻属 琼枝 UPA cox2—3 rbc SPACER 系统发育
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A new species Lobophora tsengii sp.nov.(Dictyotales;Phaeophyceae)from Bach Long Vy(Bailongwei)Island,Vietnam
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作者 Zhongmin SUN Minh Dong DAO +1 位作者 Quoc Toan TRAN Duc Tien DAM 《Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2021年第6期2363-2369,共7页
A new species Lobophora tsengii is described from Bach Long Vy(Bailongwei)Island,Haiphong Province,Vietnam.The plants inhabit the subtidal zone and have predominantly erect fan-shaped thalli that attach to the substra... A new species Lobophora tsengii is described from Bach Long Vy(Bailongwei)Island,Haiphong Province,Vietnam.The plants inhabit the subtidal zone and have predominantly erect fan-shaped thalli that attach to the substrate by a basal holdfast.The thallus is commonly composed of a single layer of large medullary cells with four layers of cortical cells on either side of the medulla.The newly collected specimens from the island are morphologically similar to those from Hainan Island,China,but differ from the New Caledonian ones in having thicker thallus.In molecular phylogenetic analyses based on concatenated rbcL and cox3 s equences,the specimens from the island were 100%identical to those from Hainan Island,China,and they formed a clade separating from other Lobophora species.Additionally,based on analyses of numerous cox3 s equences,our specimens were also distinguished from the closely related taxa occurring in New Caledonia,Kenya,and West Australia.Combining the morphological and molecular analyses,we conclude that our specimens represent a new species of Lobophora,which is apparently endemic to the Beibu Gulf(Gulf of Tonkin)and adjacent waters. 展开更多
关键词 Bach Long Vy(Bailongwei)Island cox3 Lobophora molecular phylogeny morphology rbcL
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几种江蓠属海藻3个分子序列的系统学分析 被引量:1
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作者 赵小波 逄少军 刘峰 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期8-15,共8页
分析了我国沿海几种常见的江蓠属(Gracilaria)海藻的18S rRNA基因、cox2-3间隔区以及RUBISCO间隔区的分子序列,并结合GenBank现有的相关数据进行了分子系统学关系分析,为江蓠属的系统进化和分类地位提供了新的佐证。结果表明,基于cox2-... 分析了我国沿海几种常见的江蓠属(Gracilaria)海藻的18S rRNA基因、cox2-3间隔区以及RUBISCO间隔区的分子序列,并结合GenBank现有的相关数据进行了分子系统学关系分析,为江蓠属的系统进化和分类地位提供了新的佐证。结果表明,基于cox2-3间隔区、以及RUBISCO间隔区序列构建的MP(Maximum parsimony)进化树较为相似,而与基于18S rRNA构建的进化树略有不同。这主要是由于18S rRNA更为保守的原因;扁江蓠与脆江蓠在3个系统树中均聚合成支,显示了它们之间具有较近的亲缘关系;龙须菜与江蓠属海藻具有较远的遗传距离,在3个进化树中,龙须菜也均位于进化树的基部,单独成支,证实龙须菜并不隶属于江蓠属,且分化相对较早。 展开更多
关键词 江蓠属(Gracilaria) 18S rRNA cox2—3间隔区 RUBISCO间隔区
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