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Mutation of Residue Arginine^18 of Cytochrome b559 α-Subunit and its Effects on Photosystem Ⅱ Activities in Chlamydomonas reinhardtii 被引量:1
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作者 Jing-Jing Ma Liang-Bi Li +1 位作者 Yu-Xiang Jing Ting-Yun Kuang 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2007年第7期1054-1061,共8页
It has been known that arginine is used as the basic amino acid in the α-subunit of cytochrome bsss (Cyt bsss) except histidine. However, previous studies have focused on the function of histidine in the activities... It has been known that arginine is used as the basic amino acid in the α-subunit of cytochrome bsss (Cyt bsss) except histidine. However, previous studies have focused on the function of histidine in the activities of photosystem (PS) Ⅱ and there are no reports regarding the structural and/or functional roles of arginine in PSll complexes. In the present study, two arginine18 (R18) mutants of Chlamydomonas reinhardtii were constructed using site-directed mutagenesis, in which R18 was replaced by glutamic acid (E) and glycine (G). The results show that the oxygen evolution of the PSII complex in the R18G and R18E mutants was approximately 60% of wild-type (WT) levels and that, after irradiation at high light intensity, oxygen evolution for the PSll of mutants was reduced to zero compared with 40% in WT cells. The efficiency of light capture by PSll (Fv/Fm) of R18G and R18E mutants was approximately 42%-46% that of WT cells. Furthermore, levels of the α-subunit of Cyt bsss and PsbO proteins were reduced in thylakoid membranes compared with WT. Overall, these data suggest that R18 plays a significant role in helping Cyt bss9 maintain the structure of the PSll complex and its activity, although it is not directly bound to the heme group. 展开更多
关键词 Chlamydomonas reinhardtii chloroplast transformation cytochrome b559 MUTATION photosystem Ⅱ.
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核桃举肢蛾线粒体CO I和Cytb基因片段序列分析 被引量:6
2
作者 王琦琦 陈丹丹 唐光辉 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2016年第1期145-152,共8页
核桃举肢蛾(Atrijuglans hetaohei)是危害核桃果实的主要害虫,严重影响核桃的产量和商品价值。在最新的形态学分类上,核桃举肢蛾属于鳞翅目、麦蛾总科、黑展足蛾属。通过同源序列比对探讨利用DNA条形码技术(DNA barcoding)对核桃举肢蛾... 核桃举肢蛾(Atrijuglans hetaohei)是危害核桃果实的主要害虫,严重影响核桃的产量和商品价值。在最新的形态学分类上,核桃举肢蛾属于鳞翅目、麦蛾总科、黑展足蛾属。通过同源序列比对探讨利用DNA条形码技术(DNA barcoding)对核桃举肢蛾进行分类鉴定的准确性。运用2对通用引物分别扩增核桃举肢蛾线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(CO I)基因和细胞色素b(Cytb)基因片段,并与鳞翅目麦蛾总科、巢蛾总科、凤蝶总科、螟蛾总科等昆虫的同源片段进行碱基组成多样性和系统进化分析,扩增得到核桃举肢蛾CO I基因664bp片段和Cytb基因479bp片段。结果表明:核桃举肢蛾线粒体CO I基因片段中,A、T、G和C 4种核苷酸的含量分别为29.5%、39.4%、15.1%和16.1%,A+T的含量(68.9%)明显高于G+C含量(31.1%),存在显著的AT使用倾向性。在Cytb基因片段中,A、T、G和C 4种核苷酸的含量分别为33.4%、41.5%、10.2%和14.8%,A+T的含量为74.9%,也明显高于G+C含量(26%)。两段序列都以T-A间颠换和T-C间转换为主要替换方式,且密码子第2位点保守性最强,第3位点变异率最高。基于CO I和Cytb基因片段构建的NJ系统进化树均显示核桃举肢蛾与麦蛾总科昆虫处于同一个分支之下。利用DNA条形码技术得到的核桃举肢蛾分子生物学分类结果与传统的形态学分类结果一致。 展开更多
关键词 核桃举肢蛾 细胞色素C氧化酶亚基I 细胞色素b 遗传多样性 系统进化
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基于Cytb和COⅠ基因的猎隼分子鉴定 被引量:2
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作者 关进科 李艳红 +3 位作者 胡杰 杨志松 姚刚 王敏 《四川动物》 CSCD 北大核心 2012年第4期564-569,共6页
通过与从GenBank中下载的8种隼属鸟类的Cytb和COⅠ部分序列进行同源比对,并以最大简约法(MP)和贝叶斯推断法(BI)构建系统树,对1只涉案的隼科鸟类进行了分子鉴定。结果表明:样品与猎隼Cytb和COⅠ的序列同源性最高,分别为98.91%~99.41%和... 通过与从GenBank中下载的8种隼属鸟类的Cytb和COⅠ部分序列进行同源比对,并以最大简约法(MP)和贝叶斯推断法(BI)构建系统树,对1只涉案的隼科鸟类进行了分子鉴定。结果表明:样品与猎隼Cytb和COⅠ的序列同源性最高,分别为98.91%~99.41%和99.67%~100%,样品与猎隼Cytb和COⅠ序列的遗传距离最小,分别为0.003~0.007和0.000~0.003;同时,样品和猎隼在两种系统树上都始终聚在一起。由此可推断该样品为猎隼,为2010年5月四川省丹巴县森林公安局受理的非法盗猎和贩运隼形目鸟类一案的审理提供了有力的证据。 展开更多
关键词 猎隼 细胞色素b基因 细胞色素c氧化酶亚基1基因 系统发育分析 分子鉴定
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Availability of Myoglobin as a Molecular Marker for Phylogenetic Relationships of Fish
4
作者 Ming-Chih Huang Yoshihiro Ochiai Shugo Watabe 《Journal of Agricultural Science and Technology(B)》 2018年第2期131-143,共13页
In order to elucidate the phylogenetic relationship of fish, DNA and deduced amino acid sequences of myoglobin (Mb) were used for the phylogenetic analyses based on different approaches, namely, maximum likelihood ... In order to elucidate the phylogenetic relationship of fish, DNA and deduced amino acid sequences of myoglobin (Mb) were used for the phylogenetic analyses based on different approaches, namely, maximum likelihood (ML), neighbor joining (NJ), unweighted pair group method with arithmetic means (UPGMA) and maximum parsimony (MP) methods in comparison with the conventional molecular markers, mitochondrial cytochrome b (cyt-b) and cytochrome c oxidase subunit I (COI). The phylogenetic trees drawn based on Mb sequences were similar to those by the traditional classification based on the other molecular markers. The primary and secondary structures, as well as the modeled tertiary structures of Mbs were similar to each other, but were clearly distinguishable among those species. Such differences in structure would be associated with adaptation of Mb molecule to the physiological conditions of each species. These results suggest that Mb can be a molecular marker for the phylogenetic relationship of fish. 展开更多
关键词 MYOGLObIN mitochondrial cytochrome b (cyt-b cytochrome c oxidase subunit I (COI) phylogeny.
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基于双重PCR技术的鹿茸及其伪品DNA指纹特征和鉴定 被引量:12
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作者 高丽君 何程远 +7 位作者 李盈诺 巴宏宇 李梓僮 夏薇 李明成 苑广信 张丽华 艾金霞 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期839-844,共6页
目的:分析鹿茸线粒体细胞色素b(Cytb)和细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因特异性,建立双重PCR技术鉴别鹿茸真伪的分子指纹特征。方法:利用碱变性法提取梅花鹿茸、马鹿茸、驯鹿茸和新西兰鹿茸的基因组DNA,应用引物设计软件Premier 5.0针对... 目的:分析鹿茸线粒体细胞色素b(Cytb)和细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因特异性,建立双重PCR技术鉴别鹿茸真伪的分子指纹特征。方法:利用碱变性法提取梅花鹿茸、马鹿茸、驯鹿茸和新西兰鹿茸的基因组DNA,应用引物设计软件Premier 5.0针对Cytb和COⅠ分别设计特异性引物(分别为Cytb 1、2和COⅠ1、2、3),采用单一及双重引物分别进行PCR扩增,筛选特异性强的引物,确定最佳PCR反应条件。结果:采用碱变性法提取的鹿茸基因组DNA片段长度为23 000bp,DNA纯度即A(260)/A(280)为1.80±0.02;应用单一引物进行PCR扩增无法鉴定鹿茸的真伪,而引物Cytb 1和COⅠ1组合后,解链温度为58℃时,梅花鹿茸(吉林、安徽)、马鹿茸均能扩增出395和525bp大小的2个片段,而驯鹿茸和新西兰鹿茸均未能扩增出相应片段;采用该提取方法及最优化的PCR反应条件,对市售样品进行检测,检测结果与实际情况完全一致。结论:双重PCR技术可从分子水平鉴别鹿茸的真伪,该方法特异性高、实用性强,且简便快捷,在鹿茸真伪鉴别方面具有较高的应用价值。 展开更多
关键词 鹿茸 细胞色素b 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ 双重聚合酶链反应 DNA指纹
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Iron components in PS I particles of spinach by Mossbauer spectroscopy
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作者 任黎 曾福礼 +2 位作者 梁厚果 杨文平 李发伸 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 1997年第3期257-263,共7页
Mossbauer spectrum measured for the iron components of photosystem Ⅱ (PS Ⅱ ) particles of spinach is a superposition of 4 doublets. Quadrupole splitting and chemical shifting of doublets I -IV are characteris-tics o... Mossbauer spectrum measured for the iron components of photosystem Ⅱ (PS Ⅱ ) particles of spinach is a superposition of 4 doublets. Quadrupole splitting and chemical shifting of doublets I -IV are characteris-tics of proteins with oxidized cytochrome b-559, reduced cytochrome b-559, Fe3 + -Q complex and Fe2+ -Q complex re-spectively . After the PS II particles are treated with La3+ , two doublets of Fe2+ disappear and Fe2+ is converted into Fe3+ , indicating that the reduced cytochrome b-559 has been converted into the oxidized cytochrome b-559, and Fe2+-Q complex into Fe3+-Q complex. The Mossbauer spectrum of PS II particles treated with La3+ and Ca2+ shows that Ca2+ can weaken the inhibitory effect of La3+ in part, and a portion of the reduced cytochrome b-559 and Fe-Q complex still exist. 展开更多
关键词 PS I particles Mossbauer spectrum Fe-Q complex cytochrome b-559 La^(3+) and Ca^(2+).
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DNA条形码技术在中国-哈萨克斯坦边境阿拉山口地区鼠类鉴定中的应用 被引量:6
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作者 王安东 尹小平 +3 位作者 田延河 梁臻 巴特 张江国 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2016年第5期459-462,共4页
目的以中国-哈萨克斯坦边境(中哈边境)阿拉山口地区常见鼠种为研究对象,使用线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)和细胞色素b(Cytb)基因,利用DNA条形码技术鉴定鼠种。方法 2013-2014年在中哈边境阿拉山口地区采集鼠类样本,形态学鉴定完... 目的以中国-哈萨克斯坦边境(中哈边境)阿拉山口地区常见鼠种为研究对象,使用线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)和细胞色素b(Cytb)基因,利用DNA条形码技术鉴定鼠种。方法 2013-2014年在中哈边境阿拉山口地区采集鼠类样本,形态学鉴定完毕后提取鼠肝脏DNA,用PCR方法扩增线粒体COⅠ和Cytb基因,进行测序及Blast分析,使用Mega 6.0软件构建分子进化树。结果共采集鼠类样本4属7种382只,COⅠ和Cytb基因鉴定与形态学鉴定结果相符。结论 DNA条形码技术可对鼠类进行有效的鉴定,为口岸快速准确地识别宿主及监控外来医学媒介生物提供了科学依据。 展开更多
关键词 DNA条形码 中国-哈萨克斯坦边境 种类鉴定 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ 细胞色素b
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复合聚合酶链反应鉴别龟甲正品与伪品的特征 被引量:7
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作者 邓莹 李明成 张丽华 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1022-1026,共5页
目的探讨复合聚合酶链反应(PCR)技术鉴别中药材龟甲真伪的分子标记特征。方法采用盐析法提取龟甲正品及其伪品线粒体DNA(MitochondrialDNA,mtDNA)。从GenBank数据库中下载乌龟mtDNA细胞色素b(cytochromeb,Cytb)和细胞色素C氧化... 目的探讨复合聚合酶链反应(PCR)技术鉴别中药材龟甲真伪的分子标记特征。方法采用盐析法提取龟甲正品及其伪品线粒体DNA(MitochondrialDNA,mtDNA)。从GenBank数据库中下载乌龟mtDNA细胞色素b(cytochromeb,Cytb)和细胞色素C氧化酶亚基I(cytochromeoxidasesubunit I,CoD的基因序列,用Premier5.0设计2对特异性引物,建立复合PCR技术对龟甲正品及其伪品进行扩增并测序。结果盐析法提取的龟甲mtDNA的大小均为16.6×10。bp,正品龟甲经复合PCR扩增在300~500bp间有2条明亮分明的条带,而伪品龟甲只出现1条或无条带。结论复合PCR技术鉴别龟甲真伪具有高度特异性、简便、准确、快捷、实用性强,对龟甲类药材的鉴定有很高的应用价值及准确性。, 展开更多
关键词 龟甲 复合PCR 细胞色素C氧化酶亚基I(CoI) 细胞色素b
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乙型肝炎病毒X蛋白与细胞色素C氧化酶亚单位Ⅲ结合的定位研究 被引量:1
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作者 李丹 陈治新 +2 位作者 陈芸 林纳 王小众 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期725-730,共6页
目的探索细胞色素C氧化酶亚单位Ⅲ(COXⅢ)与乙型肝炎病毒X蛋白(HBx)的具体结合位点。方法构建pAS2-1-X变异体重组载体,醋酸锂转化法将其转入酵母细胞,通过PCR法及测序法证实目的片段转入酵母细胞;Westem blot法明确变异体蛋白在... 目的探索细胞色素C氧化酶亚单位Ⅲ(COXⅢ)与乙型肝炎病毒X蛋白(HBx)的具体结合位点。方法构建pAS2-1-X变异体重组载体,醋酸锂转化法将其转入酵母细胞,通过PCR法及测序法证实目的片段转入酵母细胞;Westem blot法明确变异体蛋白在酵母细胞中能否正确表达,滤膜转印法排除自身激活作用;固体培养基交合实验及β-半乳糖苷酶活性实验检测HBx和COXⅢ的结合区域。结果成功构建含HBx第1~72位氨基酸的变异体重组载体pAS2-1-Xl和第1~117位氨基酸的变异体重组载体pAS2-1-X2,测序及PCR均证实片段的正确性。Western blot证实变异体蛋白在酵母细胞中可正确表达,且变异体蛋白无自身激活作用。交合实验及β-半乳糖苷酶活性检测将HBx和COXⅢ的结合区域定位于72~117位氨基酸。结论通过酵母双杂合实验证实HBx和COXⅢ的结合区域定位于72~117位氨基酸,此结合区域的明确有望帮助进一步阐明X蛋白在体内的作用机制,并可能为慢性乙型肝炎、肝硬化及肝癌的防治提供新思路。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 X蛋白 细胞色素C氧化酶亚单位Ⅲ 酵母双杂合 结合位点
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基于3种线粒体标记探讨中日沿海角木叶鲽遗传多样性差异
10
作者 崔静 徐明芳 +3 位作者 章群 李瑶 曾晓舒 李莎 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期87-99,共13页
角木叶鲽(Pleuronichthys cornutus)是东亚沿海重要的鲽形目经济鱼类,为更好地保护和开发利用其种质资源,有必要全面了解其遗传背景。本研究测定了中国和日本沿海7个群体200尾角木叶鲽线粒体控制区(CR)5'端、细胞色素b(Cytb)和NADH... 角木叶鲽(Pleuronichthys cornutus)是东亚沿海重要的鲽形目经济鱼类,为更好地保护和开发利用其种质资源,有必要全面了解其遗传背景。本研究测定了中国和日本沿海7个群体200尾角木叶鲽线粒体控制区(CR)5'端、细胞色素b(Cytb)和NADH脱氢酶第二亚基(ND2)基因序列,比较不同标记在解析遗传多样性和种群结构上的可行性与有效性,阐明中日沿海角木叶鲽群体间出现遗传分化的分子机制。CR序列分析发现中日沿海7个角木叶鲽群体遗传多样性表现出较高的单倍型多样性(Hd=0.9699)和较低的核苷酸多样性(π=0.0061);各群体间无显著的遗传分化(FST=–0.0197–0.0184,P>0.05);单倍型网络未显示出明显的地理聚群和谱系结构;分子方差分析(AMOVA)表明变异主要发生在群体内部(>99.17%)。进一步通过Cytb和ND2基因分别与CR序列对比分析,结果表明群体遗传多样性均表现为高Hd(0.9683–0.9829)低π(0.0050–0.0063)模式,仅有ND2基因分析FST值(FST=0.0302,P<0.05)显示了中国碣石(GDJS)和日本明石(JAP)群体间显著的低水平遗传分化现象。CR、Cytb和ND2的单倍型网络图均无明显的地理聚类和谱系结构,AMOVA分析也显示变异主要来源于群体内(>98.39%)。种群历史动态分析结果显示,角木叶鲽可能在第四纪中更新世晚期经历了群体扩张事件,扩张时间分别为31.93–9.58万年前(CR)、27.53–22.02万年前(Cytb)和26.99–18.75万年前(ND2)。综上所述,中日沿海的角木叶鲽具有较高遗传多样性,GDJS和JAP群体间存在低度分化;ND2基因比CR和Cytb序列更适于分析角木叶鲽种群遗传结构,选择多个遗传标记可有效弥补单一标记分析遗传多样性的局限性;推测冰期两大独立避难所的形成及GDJS和JAP群体距离相隔较远是其发生遗传分化的主要原因。研究结果为中日沿海角木叶鲽渔业资源的种质保护与可持续利用提供了理论依据。 展开更多
关键词 角木叶鲽 遗传多样性 控制区 细胞色素b NADH脱氢酶第二亚基
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重要蚊虫复合组DNA鉴定芯片靶基因的适用性分析 被引量:1
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作者 林诗颖 吴金枝 +3 位作者 郭舒乐 余思宸 郑爱萍 黄恩炯 《中国口岸科学技术》 2023年第2期72-80,共9页
通过分析白纹伊蚊亚组、尖音库蚊复合组和杂鳞库蚊复合组蚊虫核糖体内转录间隔区Ⅱ(Internal transcribed spacer,ITS2)、细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase subunitⅠ,COⅠ)及Cytb细胞色素b氧化酶基因(cytochrome b,Cytb),为... 通过分析白纹伊蚊亚组、尖音库蚊复合组和杂鳞库蚊复合组蚊虫核糖体内转录间隔区Ⅱ(Internal transcribed spacer,ITS2)、细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase subunitⅠ,COⅠ)及Cytb细胞色素b氧化酶基因(cytochrome b,Cytb),为3组蚊虫DNA鉴定芯片研制提供理论依据。提取以上3组蚊虫基因组DNA,PCR扩增COⅠ、ITS2以及Cytb基因,分析3个目的基因在3组蚊虫DNA鉴定芯片研制中的适用性。结果显示共获得8种蚊虫COⅠ、Cytb及ITS2基因序列24条;碱基组成结果显示COⅠ、Cytb的A+T含量高达74%,均高于ITS2;遗传距离显示3组蚊虫复合组的组间进化分歧数均大于0.200;3个基因的系统进化树显示,复合组(亚组)的蚊虫序列聚成一大簇,且可信度均大于98,尖音库蚊复合组内的蚊虫序列无法与各对应的序列聚成一簇。得出结论 COⅠ、ITS2及Cytb基因可联合用于杂鳞库蚊复合组蚊虫、白纹伊蚊亚组及尖音库蚊复合组中部分蚊虫的基因芯片鉴定,为蚊虫复合组的鉴定提供新方向。 展开更多
关键词 蚊虫复合组 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ) 核糖体内转录间隔区Ⅱ(ITS2) 细胞色素b氧化酶基因(Cytb) 鉴定
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