玉米耐旱相关基因dbf1的序列变异分析

玉米dbf1基因在干旱胁迫下的编码产物与DIP1蛋白相结合,调控植物激素脱落酸(ABA)响应基因rab17的表达,从而提高耐旱性。以B73的dbf1基因组序列为模板,对104个玉米自交系的dbf1基因进行测序,研究玉米dbf1基因的序列多态性。多态性分析表明,在全长为2 118 bp的序列中共发现48个SNP和12个In Del。尽管大部分变异位点集中在非编码区,但编码区的1个In Del和3个非同义突变位点的变异可以产生氨基酸序列改变。玉米dbf1基因的全长序列和编码区序列的变异位点可以分别将该基因划分成33和11种单倍型,并且编码7种蛋白质。在供试材料中,dbf1基因至少经历了9次重组,中性检测表明,该基因的进化没有偏离中性选择。