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利用DDRT-PCR分析茶树冬季冷驯化过程中基因表达的差异 被引量:7
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作者 梅菊芬 汤茶琴 +1 位作者 徐德良 王新超 《热带作物学报》 CSCD 2011年第4期648-652,共5页
采用DDRT-PCR方法对茶树冬季冷驯化过程中3个样品基因差异表达进行初步研究。结果表明,抗寒性不同的茶树存在基因差异表达。从134条差异片段得到稳定扩增的差异片段31条。根据差异片段的序列设计引物对部分片段进行RT-PCR鉴定假阳性,得... 采用DDRT-PCR方法对茶树冬季冷驯化过程中3个样品基因差异表达进行初步研究。结果表明,抗寒性不同的茶树存在基因差异表达。从134条差异片段得到稳定扩增的差异片段31条。根据差异片段的序列设计引物对部分片段进行RT-PCR鉴定假阳性,得到10个阳性片段,其中6个表达量增加,4个表达量降低。经过BLAST比对分析,这些基因与多种植物基因同源性较高,如nectainⅢ蛋白基因(3)、甘油磷酸二酯磷酸二酯酶蛋白家族基因(48)、微管蛋白特异性C伴侣基因(52)、光合系统Ⅱ蛋白D1基因(80、138)、卵磷脂胆固醇酰基转移酶(147),15、82、134和葡萄的蛋白同源性较高。72经比对没有同源性序列。 展开更多
关键词 茶树 冷驯化 基因表达差异 ddrt-pcr
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Primarily screening and analyzing ESTs differentially expressed in rats' primary liver cancer 被引量:9
2
作者 Dandan Liu Lijuan Zhi +9 位作者 Mingxia Ma Dan Qiao Meijuan Wang Yawei Wang Baijie Jin Anqi Li Guting Liu Yiqing Zhang Yanyan Song Hongxu Zhang 《Chinese Journal of Cancer Research》 SCIE CAS CSCD 2013年第1期71-78,共8页
Objective: To screen and analyze key express sequence tags (ESTs) which were differentially displayed in every period of SD rats' primary hepatic carcinoma and reveal the molecular mechanism of carcinogenesis. Met... Objective: To screen and analyze key express sequence tags (ESTs) which were differentially displayed in every period of SD rats' primary hepatic carcinoma and reveal the molecular mechanism of carcinogenesis. Methods: Using diethylnitrosamine (DENA) as a cancerigenic agent, animal models with different phases of primary hepatic cancer were constructed in SD rats. Rats were respectively sacrificed at d 14, d 28, d 56, d 77, d 105 and d 112 after the rats received DENA by gavage, then the livers were harvested. One part of the livers was classified according to their pathological changes, while the other was reserved for molecular mechanism studies on hepatocarcinogenesis. The differentially expressed genes were isolated from both normal and morbid tissues by mRNA differential display technique (DDRT-PCR). After the fragments were sequenced, bioinformatics were .used to analyze the results. Results: Twelve differentially expressed cDNA fragments were obtained. Nine fragments had the homology with known cDNA clones, especially EST-7 was similar to BN/SsNHsdMCW mitochondrion gene and the identity was 100% which suggested EST-7 may be the part of BN/SsNHsdMCW mitochondrion gene. In contrast, other three fragments (EST-1, EST-3 and EST-5) had extremely low identity to any genes registered in GENBANK databases. Conclusions: BN/SsNHsdMCW mitochondrion gene was expressed in different periods of hepatocarcinogenesis. Moreover, EST-I, EST-3 and EST-5 were suggested to contribute to the development of rat hepatocarcinogenesis, and thus may be candidates of new targets of oncogenes or cancer suppressor genes. 展开更多
关键词 Animal models of primary liver cancer ddrt-pcr differential display reverse transcription pcr ESTs (express sequence tags) mitochondrion gene
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Differential Gene and Protein Expression in Soybean at Early Stages of Incompatible Interaction with Phytophthora sojae 被引量:1
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作者 LI Yong-gang YANG Ming-xiu +3 位作者 LI Yan LIU Wen-wen WEN Jing-zhi LI Yong-hao 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2011年第6期902-910,共9页
Soybean root and stem rot caused by Phytophthora sojae is a destructive disease worldwide. Using genetic resistance is an important and major component in the integrated pest management of this disease. To understand ... Soybean root and stem rot caused by Phytophthora sojae is a destructive disease worldwide. Using genetic resistance is an important and major component in the integrated pest management of this disease. To understand molecular mechanisms of root and stem rot resistance in soybeans, the gene and protein expression in hypocotyls and stems of variety Suinong 10 carrying resistance genes Rps1a and Rps2 was investigated by using mRNA differential display reverse transcription PCR and two-dimensional electrophoresis at 0, 0.5, 1, 2, and 4 h after inoculation with P. sojae race 1. The results of the comparison of gene and protein expression showed that at least eight differential fragments at the transcriptional level were related to metabolic pathway, phytoalexin, and signal transduction in defense responses. Sequence analyses indicated that these fragments represented cinnamic acid 4-hydroxylase gene, ATP b gene coding ATP synthase b subunit and ubiquitin-conjugating enzyme gene which upregulated at 0.5 h post inoculation, blue copper protein gene and UDP-N-acetyl-a-D-galactosamine gene which upregulated at 2 h post inoculation, TGA-type basic leucine zipper protein TGA1.1 gene, cyclophilin gene, and 14-3-3 protein gene which upregulated at 4 h post inoculation. Three resistance-related proteins, a-subunit and b-subunit of ATP synthase, and cytochrome P450-like protein, were upregulated at 2 h post inoculation. The results suggested that resistance-related multiple proteins and genes were expressed in the recognition between soybean and P. sojae during zoospore germination, penetration and mycelium growth of P. sojae in soybean. 展开更多
关键词 Phytophthora sojae resistance mechanism incompatible interaction mRNA differential display reverse transcription pcr two-dimensional electrophoresis
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荧光差异显示PCR分离果蝇七氟醚敏感性相关基因 被引量:5
4
作者 刘红 任笑蒙 +1 位作者 陈兰英 刘进 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期715-722,共8页
吸入麻醉药是临床上常用的一类全身麻醉药 .为深入研究吸入麻醉药的作用机理 ,以本实验室创建的对七氟醚敏感的果蝇品系 (F PS1 )和耐药 (F PR1 )的果蝇品系为研究模型 ,以野生型黑腹果蝇 (Drosophilamelanogaster)为对照 ,应用荧光mRN... 吸入麻醉药是临床上常用的一类全身麻醉药 .为深入研究吸入麻醉药的作用机理 ,以本实验室创建的对七氟醚敏感的果蝇品系 (F PS1 )和耐药 (F PR1 )的果蝇品系为研究模型 ,以野生型黑腹果蝇 (Drosophilamelanogaster)为对照 ,应用荧光mRNA差异显示PCR (fluorescentdifferentialdisplayreversetranscriptional PCR ,fluoroDDRT PCR)方法 ,分离与吸入麻醉药七氟醚敏感性相关的候选基因(EST) .在分离到的 32个差异片段中 ,经Northern印迹杂交鉴定后 ,得到 1个阳性片段 (No .4 1 ) ,其在敏感品系果蝇中表达较高 .通过cDNA末端快速扩增技术 (rapidamplificationofcDNAends ,RACE)克隆和拼接获得了 1 75kb的全长cDNA ,该基因位于Chr2R 4 5F3区域内 ,为一已知序列的新基因 .实验结果与前期工作用遗传学定位方法所得结果一致 ,从而可推测决定七氟醚敏感性的相关基因可能位于果蝇第 2号染色体上 . 展开更多
关键词 荧光mRNA差异显示pcr 七氟醚敏感性基因 果蝇 麻醉药 作用机理
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猪瘟病毒强毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR快速鉴别检测方法的建立 被引量:9
5
作者 郭抗抗 邓力 +3 位作者 井勇 张彦明 王晶钰 宁蓬勃 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2010年第6期13-18,共6页
【目的】建立猪瘟病毒强毒株和兔化弱毒疫苗株的RT-PCR快速鉴别检测方法。【方法】根据Gen-Bank中36株猪瘟病毒(CSFV)强毒株和兔化弱毒疫苗株的基因序列,分别设计了针对CSFV强毒和兔化弱毒疫苗株的特异性引物,建立了一种能区分CSFV强毒... 【目的】建立猪瘟病毒强毒株和兔化弱毒疫苗株的RT-PCR快速鉴别检测方法。【方法】根据Gen-Bank中36株猪瘟病毒(CSFV)强毒株和兔化弱毒疫苗株的基因序列,分别设计了针对CSFV强毒和兔化弱毒疫苗株的特异性引物,建立了一种能区分CSFV强毒和兔化弱毒疫苗株的RT-PCR检测方法。【结果】建立的RT-PCR检测方法可以从CSFV强毒株和兔化弱毒疫苗株中分别扩增出大小为187和492 bp的特异性片段,对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪圆环病毒2型(PCV2)和猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)等猪源性病毒的检测结果均为阴性,说明该方法具有较好的特异性。对10份疑似猪瘟临床样品进行检测后发现,利用该方法可以从中分别检测出CSFV强毒和疫苗毒。【结论】建立了可鉴别检测CSFV强毒株和弱毒疫苗株的RT-PCR方法,为猪瘟的早期诊断及疫苗免疫猪和野毒感染猪的鉴别提供了技术参考。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 猪瘟兔化弱毒疫苗 反转录-聚合酶链式反应 鉴别检测
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基于SYBR Ⅰ实时荧光定量PCR对猪流行性腹泻病毒野毒和疫苗弱毒鉴别诊断方法的建立 被引量:7
6
作者 修金生 陈小权 +1 位作者 王斌 李涛 《中国动物传染病学报》 CAS 2012年第5期16-21,共6页
本研究参考GenBank中登录的猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)野毒株和弱毒疫苗株(CV777弱毒疫苗株)在高度保守ORF3基因核苷酸序列的差异,设计一对特异性荧光定量引物,分别建立基于SYBRⅠ实时荧光定量RT-PCR方法... 本研究参考GenBank中登录的猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)野毒株和弱毒疫苗株(CV777弱毒疫苗株)在高度保守ORF3基因核苷酸序列的差异,设计一对特异性荧光定量引物,分别建立基于SYBRⅠ实时荧光定量RT-PCR方法。结合熔解曲线分析可见,其野毒株和弱毒疫苗株熔解温度(Tm)分别为(81.84±0.17)℃和(83.16±0.14)℃,扩增产物的熔解曲线分析均只出现1个单特异峰,对传染性胃肠炎病毒、猪轮状病毒、猪细小病毒、猪流感病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪伪狂犬病毒、猪瘟病毒均检测不到荧光信号。结合熔解曲线可直接鉴别猪群中PEDV的感染情况和程度,可对免疫猪群PEDV野毒感染和疫苗免疫做出快速准确的鉴别诊断,尤其是对PEDV弱毒疫苗免疫后仍爆发PEDV野毒感染的研究更有临床意义。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 SYBRⅠ荧光定量RT-pcr 熔解曲线 鉴别诊断
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鉴别猪瘟病毒强毒和疫苗弱毒的RT-PCR检测方法的建立 被引量:6
7
作者 陈本龙 张立怀 +1 位作者 王建华 王乃福 《中国动物检疫》 CAS 2013年第11期71-74,共4页
根据Genbank上发表的猪瘟病毒(CSFV)全基因组序列,选择猪瘟强毒株和兔化弱毒疫苗株序列存在的差异区域,分别设计合成两条特异性的上游引物,一条只针对强毒毒株,一条只针对兔化弱毒疫苗株;同时选择高保守区域序列,设计合成了一条强毒和... 根据Genbank上发表的猪瘟病毒(CSFV)全基因组序列,选择猪瘟强毒株和兔化弱毒疫苗株序列存在的差异区域,分别设计合成两条特异性的上游引物,一条只针对强毒毒株,一条只针对兔化弱毒疫苗株;同时选择高保守区域序列,设计合成了一条强毒和兔化弱毒共用的下游引物,成功建立了一种能够区分猪瘟病毒强毒株和兔化弱毒疫苗株的RT-PCR检测方法。应用该方法从猪瘟强毒株和兔化弱毒株中扩增出了大小分别为680bp和785bp的特异性片段。该方法对PRRSV、BVDV、PRV、PCV等病毒基因组扩增,结果均为阴性;该方法可以检测出最低为0.5pg的猪瘟病毒RNA,具有高度的特异性和敏感性。本方法的建立为猪瘟的实验室检测和流行病学调查奠定了坚实的基础。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 强弱毒鉴别 RT-pcr
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基于PCR的基因差异表达分析技术 被引量:4
8
作者 齐小辉 马玺 +1 位作者 李姗姗 周东坡 《生物技术通讯》 CAS 2004年第4期389-391,共3页
基因差异表达分析是研究许多生物学过程的分子基础的一条直接、有效的途径。自DDRT-PCR技术建立以来,一系列基于PCR的基因差异表达分析技术,如SAGE、SSH、RDA和DNA微阵列等相继发展起来,为分析和克隆差异表达的基因提供了更为快速、灵... 基因差异表达分析是研究许多生物学过程的分子基础的一条直接、有效的途径。自DDRT-PCR技术建立以来,一系列基于PCR的基因差异表达分析技术,如SAGE、SSH、RDA和DNA微阵列等相继发展起来,为分析和克隆差异表达的基因提供了更为快速、灵敏的工具。本文对这几种方法进行了简要综述,比较了不同方法的优缺点,并展望了今后基因差异表达研究技术的发展方向。 展开更多
关键词 pcr 基因差异表达 抑制消减杂交 代表性差异分析 DNA微阵列
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差异显示反转录-PCR及抑制性扣除杂交在基因表达差异分析中的应用 被引量:2
9
作者 黄升谋 邹应斌 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 2002年第2期183-185,共3页
差异显示反转录 -PCR和抑制性扣除杂交是目前广泛应用于基因表达差异分析的方法 ,它们分别具有灵敏度高假阳性率低等特点 ,对其原理、技术。
关键词 差异显示反转录-pcr 抑制性扣除杂交 基因表达差异分析 应用
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口蹄疫病毒RT-PCR检测与血清型鉴别 被引量:2
10
作者 程蜀黔 王天齐 +3 位作者 罗莉 史开志 蔺俐仲 余启茂 《中国动物检疫》 CAS 2011年第2期37-39,66,共4页
针对编码非结构蛋白的3D基因合成一对引物进行口蹄疫病毒RT-PCR扩增,不同血清型病毒的RNA样本均显现一条457bp的目的带,与预期设计的长度相符合。在敏感性试验中,O型、A型和AsiaⅠ型病毒的最小RNA检出量分别为0.8ng、8ng和8ng。根据GenB... 针对编码非结构蛋白的3D基因合成一对引物进行口蹄疫病毒RT-PCR扩增,不同血清型病毒的RNA样本均显现一条457bp的目的带,与预期设计的长度相符合。在敏感性试验中,O型、A型和AsiaⅠ型病毒的最小RNA检出量分别为0.8ng、8ng和8ng。根据GenBank发表的口蹄疫病毒VP1和2A基因序列,采用多重RT-PCR鉴别口蹄疫病毒血清型,O型、A型和AsiaⅠ型病毒的特异性扩增片段分别为200bp、340bp和500bp。对9份乳鼠感染病料进行检测,确诊为O血清型口蹄疫病毒感染。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 反转录-聚合酶链式反应 血清型 鉴别
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Stem cell properties and neural differentiation of sheep amniotic epithelial cells
11
作者 Xuemin Zhu Xiumei Wang +7 位作者 Guifang Cao Fengjun Liu Yinfeng Yang Xiaonan Li Yuling Zhang Yan Mi Junping Liu Lingli Zhang 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2013年第13期1210-1219,共10页
This study was designed to verify the stem cell properties of sheep amniotic epithelial cells and their capacity for neural differentiation. Immunofluorescence microscopy and reverse transcription-PCR revealed that th... This study was designed to verify the stem cell properties of sheep amniotic epithelial cells and their capacity for neural differentiation. Immunofluorescence microscopy and reverse transcription-PCR revealed that the sheep amniotic epithelial cells were positive for the embryonic stem cell marker proteins SSEA-1, SSEA-3, SSEA-4, TRA-1-60 and TRA-1-81, and the totipotency-associated genes Oct-4, Sox-2 and Rex-1, but negative for Nanog. Amniotic epithelial cells expressed β-Ⅲ-tubulin, glial fibrillary acidic protein, nestin and microtubule-associated protein-2 at 28 days after induction with serum-free neurobasal-A medium containing B-27. Thus, sheep amniotic epithelial cells could differentiate into neurons expressing β-Ⅲ-tubulin and microtubule-associated protein-2, and glial-like cells expressing glial fibrillary acidic protein, under specific conditions. 展开更多
关键词 neural regeneration stem cells SHEEP amniotic epithelial cells isolation and culture stem cecharacteristics differentiATION differentiation potential reverse transcription-pcr immunofluorescence microscopy grants-supported paper NEUROREGENERATION
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低密度脂蛋白诱导下调的新基因cDNA的克隆及组织表达 被引量:22
12
作者 张文成 陈保生 +2 位作者 曾武威 吴刚 薛红 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2003年第3期279-282,共4页
用改进的mRNA差异显示 PCR技术分析ECV30 4在低密度脂蛋白的诱导下表达水平明显差异的cDNA。获得一差异表达的 2 6 5bp新EST ;以该EST为探针 ,从人主动脉cDNA文库中筛选到一个 172 6bp的cDNA克隆 ,其 74 8 12 6 6bp之间的 5 19个碱基... 用改进的mRNA差异显示 PCR技术分析ECV30 4在低密度脂蛋白的诱导下表达水平明显差异的cDNA。获得一差异表达的 2 6 5bp新EST ;以该EST为探针 ,从人主动脉cDNA文库中筛选到一个 172 6bp的cDNA克隆 ,其 74 8 12 6 6bp之间的 5 19个碱基构成一个完整的开放阅读框架 ,编码 172个氨基酸组成的蛋白质。其羧基端 94 172区间氨基酸序列中含有三个重复的C2H2型锌指蛋白基序CX2CX3FX5LX2HX3H ,NorthenBlot证实两组ECV30 4中均出现一条 1 7kb的区带 ,LDL诱导后其表达降低了 2 2倍。与差异显示 PCR的结果一致 ,该基因被定名为LRZFG。LRZFG是多组织表达的基因 。 展开更多
关键词 低密度脂蛋白 MRNA差异显示 基因克隆 CDNA 动脉粥样硬化
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过量表达Wnt-1基因诱导P19细胞的神经分化 被引量:9
13
作者 杨靖 孙红 +1 位作者 边玮 景乃禾 《生理学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第3期289-295,共7页
Wnt-1基因在小鼠神经发育过程中起着重要作用。该基因在胚胎性癌细胞P19向神经分化过程中存在瞬时性表达。利用克隆到的Wnt-1基因转染P19细胞(Wnt-1/P19),可使细胞不经视黄酸(RA)诱导,自发向神经细胞方向分化。早期神经分化关... Wnt-1基因在小鼠神经发育过程中起着重要作用。该基因在胚胎性癌细胞P19向神经分化过程中存在瞬时性表达。利用克隆到的Wnt-1基因转染P19细胞(Wnt-1/P19),可使细胞不经视黄酸(RA)诱导,自发向神经细胞方向分化。早期神经分化关键基因MASH-1在Wnt-1/P19细胞的神经分化过程中的表达,晚于RA诱导引起的P19细胞的分化过程。 展开更多
关键词 WNT-1 反转录pcr P19细胞 过量表达 神经分化
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NDGA诱导人胶质瘤细胞株分化过程中基因组甲基化及甲基转移酶的变化及意义 被引量:4
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作者 卢佳友 卞修武 +2 位作者 赵雯 徐承平 蒋雪峰 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期283-286,共4页
目的 了解去甲二氢愈创木酸 (Nordihydroguaiareticacid ,NDGA)处理前后两种人胶质瘤细胞系CHG 5、SHG 4 4甲基转移酶 (DNAmethyltransferase ,DNMT)活性、DNMTmRNA表达和基因组甲基化程度的改变。方法 以NDGA处理人恶性胶质瘤细胞系C... 目的 了解去甲二氢愈创木酸 (Nordihydroguaiareticacid ,NDGA)处理前后两种人胶质瘤细胞系CHG 5、SHG 4 4甲基转移酶 (DNAmethyltransferase ,DNMT)活性、DNMTmRNA表达和基因组甲基化程度的改变。方法 以NDGA处理人恶性胶质瘤细胞系CHG 5及SHG 4 4,观察两种细胞增殖和分化状态 ;采用同位素微量示踪法测定甲基转移酶活性和基因组DNA甲基化程度 ;应用RT PCR法测定DNMTmRNA表达水平。结果 NDGA处理后两种细胞增殖速度明显减缓 ,分化水平升高 ;DNMT活性显著降低、基因组甲基化程度明显升高 ;而DNMTmRNA改变不明显。结论 NDGA能抑制甲基转移酶的活性 ,升高基因组甲基化水平 ,这些作用可能与其诱导恶性胶质细胞瘤分化的机制有关。 展开更多
关键词 胶质瘤 去甲二氢愈创木酸 NDGA 甲基化 细胞增殖 CHC-5 SHC-44 甲基转移酶
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Notch信号分子于小鼠牙髓干细胞样细胞表达的研究 被引量:5
15
作者 陆群 吴补领 +2 位作者 王冀姝 韩骅 周学东 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期54-56,共3页
目的 研究Notch基因在小鼠牙髓干细胞样细胞表达。方法 采用酶消化培养法获得小鼠的单个牙髓细胞悬液 ,调整细胞密度为 1× 10 4 个 孔细胞 ,干细胞培养液培养 14d,挑选细胞克隆扩增 ,提取细胞的总RNA ,反转录聚合酶联反应 (RT_P... 目的 研究Notch基因在小鼠牙髓干细胞样细胞表达。方法 采用酶消化培养法获得小鼠的单个牙髓细胞悬液 ,调整细胞密度为 1× 10 4 个 孔细胞 ,干细胞培养液培养 14d,挑选细胞克隆扩增 ,提取细胞的总RNA ,反转录聚合酶联反应 (RT_PCR)检测Notch基因的表达。结果 小鼠牙髓细胞呈集落状生长 ,克隆形成率约为 1 6~ 2 5个 10 4 细胞 ,所形成的集落细胞结合紧密 ,细胞胞体小、胞核大 ,RT_PCR结果显示Notch的mRNA在牙髓干细胞样细胞中有表达。结论 培养的集落状生长的小鼠牙髓细胞具有干细胞增殖快的特性 ,Notch基因于牙髓干细胞中表达 。 展开更多
关键词 Notch信号分子 小鼠 牙髓干细胞 细胞表达 牙齿发育 反转录聚合酶联反应
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一种快速筛选阳性克隆的方法——反向Northern印迹杂交技术 被引量:10
16
作者 刘红 任笑蒙 陈兰英 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2002年第3期278-280,共3页
本实验采用反向Northern印迹杂交 (reverseNorthernblot)技术 ,对经反转录差异显示PCR(differentialdisplayre versetranscriptionalPCR ,DDRT PCR)获得的 5 6个差异片段 (cDNA)进行阳性片段的初步筛选 ,获得 8个候选阳性片段 ,经North... 本实验采用反向Northern印迹杂交 (reverseNorthernblot)技术 ,对经反转录差异显示PCR(differentialdisplayre versetranscriptionalPCR ,DDRT PCR)获得的 5 6个差异片段 (cDNA)进行阳性片段的初步筛选 ,获得 8个候选阳性片段 ,经Northern印迹杂交实验 ,确证 5个阳性片段。实验表明该方法是一种快速检测和筛选阳性克隆片段的方法 ,并具有简便、经济的优点。它不仅可用于各种分离差异片段的方法中差异片段的初步筛选 。 展开更多
关键词 快速筛选 阳性克隆 反向Northern印迹杂交技术 基因诊断
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茶树冷驯化过程中基因表达差异的初步分析 被引量:10
17
作者 梅菊芬 王新超 +1 位作者 杨亚军 黎星辉 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期286-292,共7页
采用mRNA差别显示的方法对茶树冷驯化过程中基因差异表达进行了初步研究,从58条差异片段得到稳定扩增的差异片段23条,用RT-PCR的方法鉴定其假阳性,得到5个阳性片段,其中3个片段在冷驯化过程中表达量增加,另外2个片段的表达量降低。经过B... 采用mRNA差别显示的方法对茶树冷驯化过程中基因差异表达进行了初步研究,从58条差异片段得到稳定扩增的差异片段23条,用RT-PCR的方法鉴定其假阳性,得到5个阳性片段,其中3个片段在冷驯化过程中表达量增加,另外2个片段的表达量降低。经过BLAST比对分析,其中一个片段序列与高粱反式玉米素-O-葡糖基转移酶同源性较高;一个与黄瓜叶绿体合成相关蛋白基因同源性较高;一个为茶树核酮糖-1,5-双磷酸羧化酶/加氧酶小亚基基因片段;一个与细胞色素b亚基有较高同源性;还有两个片段序列比对没有同源序列,可能为新基因。 展开更多
关键词 茶树 冷驯化 基因表达差异 特异片段
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mRNA差别显示技术及其在植物基因研究中的应用 被引量:9
18
作者 马月萍 戴思兰 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期81-84,共4页
mRNA差别显示技术是近年发展起来的一种用于分离和克隆正常与异常细胞之间差异表达基因的PCR方法 ,是目前筛选差异表达基因的有效方法之一 .自问世以来在动物遗传育种方面取得了很大的成绩 ,广泛用于人类及其他动物生长发育基因调控、... mRNA差别显示技术是近年发展起来的一种用于分离和克隆正常与异常细胞之间差异表达基因的PCR方法 ,是目前筛选差异表达基因的有效方法之一 .自问世以来在动物遗传育种方面取得了很大的成绩 ,广泛用于人类及其他动物生长发育基因调控、基因克隆的研究 .在植物基因研究方面应用起步较晚 ,现已开始用于植物基因分析、杂种优势机理等方面的研究 .在此 ,该文介绍了mRNA差别显示技术的原理、步骤、优缺点及其发展 ,并对其在植物特异基因分离方面的研究及其应用前景做了探讨 . 展开更多
关键词 MRNA差别显示技术 植物基因研究 应用 技术原理 特异基因分离
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IBV肾型毒株与呼吸型疫苗株鉴别方法的建立与应用 被引量:3
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作者 徐雪 高冬生 +9 位作者 王川庆 陈陆 杨霞 皇甫和平 刘慧敏 郑鹿平 杨猛 张金来 李昆明 张九洲 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2011年第1期8-14,共7页
【目的】建立基于鸡传染性支气管炎病毒(IBV)S1基因的反转录-复合PCR方法,为IBV流行毒株和呼吸型疫苗株的分型鉴定提供技术支持。【方法】根据IBVN基因序列设计合成1对特异性通用引物,建立IBV的分子生物学检测方法,用以对IBV进行检测。... 【目的】建立基于鸡传染性支气管炎病毒(IBV)S1基因的反转录-复合PCR方法,为IBV流行毒株和呼吸型疫苗株的分型鉴定提供技术支持。【方法】根据IBVN基因序列设计合成1对特异性通用引物,建立IBV的分子生物学检测方法,用以对IBV进行检测。通过对GenBank上公布的IBVS1基因全序列的分析比对,找出呼吸型疫苗株和地方肾型流行毒株相对保守的差异序列,设计合成2对引物,建立可以对这2类IBV毒株进行鉴别的反转录-复合PCR方法,同时对该方法的敏感性和重复性进行检测,并对该方法进行了实际应用。【结果】建立了区别IBV肾型毒株和呼吸型毒株的分型方法,该方法敏感性好,能检出经106稀释后的基因组RNA,且具有可重复性;临床应用显示,该方法对呼吸型毒株和近年来的地方肾型分离株具有较好的分型效果,而对较早时期的肾型分离株(YI株和澳大利亚T株)的扩增结果为阴性;经鉴定,近年来感染鸡群并引起高死亡率的分离毒株主要为肾型IBV。【结论】建立了区别IBV肾型毒株和呼吸型毒株的分型方法,该方法特异性强、敏感性高、重复性好,能将我国地方流行的肾型IBV毒株与呼吸型疫苗株完全区分开来。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 反转录-复合pcr 毒株鉴别 N基因 S1基因 呼吸型疫苗株 肾型毒株
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细菌侵染的两种鲤鱼病生理反应及抗病性分析 被引量:1
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作者 耿波 孙效文 +2 位作者 梁利群 曹鼎臣 欧阳红生 《生物技术通报》 CAS CSCD 2006年第C00期445-449,共5页
通过人工接种嗜水气单胞菌(A.hydrophila)对受到细菌侵染的鲤鱼两个品种松浦鲤和德国镜鲤的病生理进行检测和分析,并采用DDRT-PCR方法对两种鲤的明显的抗感病个体基因差异进行初步分析。对血红蛋白(Hb)、红细胞(RBC)、血小板(PLT)、白细... 通过人工接种嗜水气单胞菌(A.hydrophila)对受到细菌侵染的鲤鱼两个品种松浦鲤和德国镜鲤的病生理进行检测和分析,并采用DDRT-PCR方法对两种鲤的明显的抗感病个体基因差异进行初步分析。对血红蛋白(Hb)、红细胞(RBC)、血小板(PLT)、白细胞(WBC)记数,尿素氮(BUN)、白蛋白(ALB)、总蛋白(TP)、谷丙转氨酶(ALT)、甘油三酯(TG)、胆固醇(TC)、血糖(GLU)等生理生化指标进行了检测。人工接种试验表明,松浦鲤具有较强的抗病性,而德国镜鲤抗病性很差而感病性很强。DDRT-PCR结果表明,抗性基因在不同的鲤鱼群体之间及同种鲤鱼群体的不同抗感病个体之间表达水平不同。生理生化指标的变化反映出这两种鲤的抗性差异,在外来致病菌的刺激下,实验鲤体内的生理生化水平发生了变化,其中一些生化指标如谷丙转氨酶和总蛋白大幅度下降,其它生理指标表现出上升的趋势。总之松浦鲤在面对致病菌的侵染时从表型到生理生化水平上均表现出较强的抗病性。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 病生理 抗病性 差异显示技术
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