应用基因表达系列分析(SAGE)技术研究高温处理前后家蚕的基因表达差异

高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕SAGE文库分别包含3555107和3580976个原始标签,其中的标签种类分别为113684和131 296个,清洁标签的种类分别为45972和49467。比较2个文库清洁标签获得65 535种差异标签,共注释4249个基因,其中有1 062个差异表达的基因(P<0.05,错误检测率FDR≤0.001并且拷贝数的差异在2倍以上)。经GO分析发现2个文库中基因的分布极其相似,表明这些基因在不同的环境温度下有类似的生物学功能并参与类似的生理代谢过程。KEGG pathway分析显示有732个基因涉及176个KEGG路径,其中有40个为差异表达基因显著富集的路径(P<0.05),超过一半的路径与代谢、生物合成和信号传导有关。上述结果有助于对家蚕抗高温基因的鉴定以及探究基因调控的网络关系。

SAGE技术在大豆上的应用

随着功能基因组学研究的兴起 ,基因表达研究的分析方法也在不断发展。而基因序列表达分析技术 (SAGE)是一种以测序为基础 ,采用数字化分析手段 ,在转录物水平上研究细胞或组织基因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因 ,获得这些基因表达丰度的数量信息 ,还可比较不同组织、不同时空条件下基因表达的差异 ,从而发现新基因。SAGE技术在农作物方面的应用相对较少 ,但进展很快。笔者着重介绍了SAGE在大豆基因表达分析中的应用 ,简要评述此种方法的原理及优缺点 ,并分析了SAGE所存在的问题。

开放的差异基因表达技术研究进展

自 90年代早期发展以来 ,差异基因表达 (DGE)技术在许多领域得到了应用 .“开放”结构系统的DGE技术不需原始的生物学或序列信息 ,而且可应用于任何种群 .主要介绍 6项开放的DGE技术 :cDNA代表性差示分析 (cDNA RDA)、基因表达系统分析 (SAGE)、表达序列标签串联排列连接(TALEST) ,和早期的DGE技术差异显示 (DD)、随机引物聚合酶链反应 (AP PCR) ,以及一项受专利保护的技术———GeneCalling .通过几项重要的参数对这些技术进行了比较 ,认为DD虽然有其致命的弱点 ,但在目前仍然应用得非常广泛 .cDNA RDA能有效富增特异片段 ,扣除共有序列 ,如能和SAGE结合 ,将能进一步促进其发展 .TALEST和GeneCalling操作较简便 ,一次试验能获得大量的数据 ,但是分析这些数据比较麻烦 ,须借助另外的分析软件 .最后介绍了应用DGE技术取得的最新成果 .

差异表达基因的高通量筛选方法

cDNA阵列、基因芯片技术、iAFLP(introduced amplified fragment lengthpolymorphism)、SAGE(serial analysis of gene expression)技术、cDNA-AFLP、DDRT-PCR(differntialdisplay reverse-transcription PCR)、RC4D(RFLP-coupled differential display)以及抑制消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)都是能高效鉴别两个不同细胞群差异表达基因的方法。现对各种方法的原理进行简要介绍,并对其优缺点进行对比,并结合作者实验室的研究工作,列举了cDNA阵列和抑制消减杂交技术在生殖生物学领域中的应用情况。

几种基因差异表达筛选技术在动物发育与繁殖中的最新进展

抑制性消减杂交(SSH)、DNA芯片和基因表达系列分析(SAGE)技术都是高效鉴别不同细胞群之间差异表达基因的方法。作者对这3种方法在动物发育与繁殖领域中的最新应用进展作了简要阐述。

基因表达系列分析技术在真菌功能基因组学中的应用

基因表达系列分析(SAGE)是一种在mRNA水平上高通量、快速、灵敏分析细胞或组织基因表达信息,并在基因组学研究中广泛应用的技术。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因,比较不同时空条件下基因表达的差异,还可以在全基因组范围内获得基因的表达谱,从而发现新基因。综述基因表达系列分析技术在材料用量、标签长度、技术流程和标签测序等方面的研究进展及该技术在病原真菌、工业真菌和食用真菌功能基因组学中的应用。

基于剪枝算法解决多处理机调度问题的算法研究

针对当前算法求解多处理机调度问题的不足,从剪枝策略的角度提出了一种笨人算法。笨人算法的思路是:不断排除最差解,直到剩下唯一解。这种剪枝算法至少保证当前的选择不是最差的,并且对计算过程的最大复杂度作了一个估计。经过实验分析,对于N×N的MSP,多数情况下,笨人算法比贪心算法、遗传算法、差分进化算法的表现更为稳定和优秀,是一种有效的算法,也为相关问题的研究提供了一种新的思路。

刘宗周《人谱》书名及理论内涵探微

刘宗周命名《人谱》,其灵感是源于"家谱"概念的,而其目的就是要在人极的基础上构建一个人的谱系。两相比附,可以更加清楚地理解《人谱》书名及其理论内涵:家谱证身世,而《人谱》证心性;家谱寻远祖,而《人谱》寻"意"根;家谱别姓氏,而《人谱》别贤愚。总之,《人谱》书名之含义就是"谱人""证人"。证明人之所以为人,就是要证明人人具有尧舜之性,此为天命之善性。人由于受外物之熏染,难免会产生一些过错,但只要能够"慎独"与"诚意",就能够迁善改过,从而入于圣人之域。可见,《人谱》之书名,与众多著作顾名思义颇为不同,它不仅泛指著作内容,还涉及到著作的思想体系。通过细致的探究,不仅可以更好地理解刘宗周的理学思想,还能更好地促进其传播与接受。

在禽兽与圣人之间——略论孟子的主体定位观

孟子对“人”的定位 ,既是其思想体系的逻辑起点 ,也是我们走进孟子思想体系的认识起点。通过“人禽之辨”与“圣我之辨” ,孟子断定人在本质上不同于禽兽 ,但每一个人又与圣人属于同类。这一主体定位 ,既突出了人的绝对优越性 ,也表现了人的普遍平等性 ,同时蕴涵了人在禽兽与圣人之间丰富而又持久的两极性张力。把握孟子的主体定位观 ,将有助于我们切入孟子的思想体系 ,领悟孟子的文化基本精神 。

基因表达系列分析技术在植物基因表达分析中的应用

基因表达系列分析技术 (SAGE)是一种以测序为基础 ,采用数字化分析手段 ,在转录物水平上研究细胞或组织基因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因 ,获得这些基因表达丰度的数量信息 ,还可比较不同组织、不同时空条件下基因表达的差异 ,从而发现新基因。SAGE技术在植物方面的应用相对较少 ,但进展很快。本文着重介绍了SAGE在植物基因表达分析中的应用 ,分析SAGE所存在的问题。

新乡贤基层治理角色的差异化评价分析——以浙江省德清县新乡贤调查为例

乡贤是中国传统乡村社会一个重要群体,因其独特的社会地位与其在乡村社会中所发挥的作用历来成为我国乡村研究的重要主题。当前,这一群体以其新的面貌在乡村产业振兴和乡村治理中发挥着重要的作用随着我国乡村社会的转型和变迁.这一群体的构成及其面临的乡村环境均已发生变化.新乡贤需要变革群体架构、调整自身角色,迎合乡村建设的需要。经调查发现,不同乡村社会群体对新乡贤角色的认知角度不同,使得人们对新乡贤基层治理角色产生了差异化的评价,产生了对新乡贤角色定位不清晰、人们对其角色认同度不高等问题。本文选取浙江省德清县三个具有代表性的乡镇进行调查研究,从基层管理部门、村民及村委和乡贤本身三个层面厘清人们对新乡贤角色的作用的差异化评价,旨在剖析新乡贤参与基层治理的角色定位与乡村未来发展的助推作用。

藏族格言诗《萨迦格言》中的智者和愚人

兴于13世纪的藏族经典文学体裁格言诗以其丰富独特的比喻和深刻智慧的哲理在古今中外都颇负盛名。其中,《萨迦格言》是格言诗奠基之作,亦是格言诗不朽的丰碑。作者萨班·贡嘎坚赞从不同角度用大量笔墨塑造了智者和愚人的形象以形成鲜明对比,从而指导人们分辨智者和愚人的方法,教导人们近于智者,见贤思齐。论文选取次旦多吉汉译的《萨迦格言》,对比分析了智者和愚人的形象和差异,探究了人生智慧,对于培养个人的高尚道德和优秀品质具有重要意义。

在继承与颠覆中重塑自我——《痴人之爱》与《贤者之爱》之比较

日本现代女性作家山田咏美的《贤者之爱》,貌似正面挑战日本唯美派文豪谷崎润一郎的《痴人之爱》,实质上是在继承与颠覆中重塑自我。继承与颠覆并非相悖,颠覆是在继承的前提下或积极或消极的进步。山田咏美跟谷崎润一郎的小说世界颇有重叠之处,她巧妙地借助于谷崎润一郎的文学衣钵,植入了看似相似实质相异的文学境界,令读者在似曾相识的文学框架下得到了全新的文学体验。

基因表达系列分析技术在动物科学中的研究进展

基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)是一种快速分析特定组织或细胞内基因表达信息的技术,不但可以比较不同组织细胞在不同时间、空间条件下基因表达的差异,还能发现新基因。近几年来,SAGE技术在动物基因表达研究中的应用取得了飞速发展。就SAGE技术的原理、实验路线、优缺点和改进以及SAGE在动物科学研究中的研究现状及应用前景作一简要介绍。