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甘蔗分子伴侣ShDnaJ基因克隆及在甘蔗线条花叶病毒胁迫下的表达分析
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作者 冯小艳 王文治 +4 位作者 王俊刚 沈林波 赵婷婷 冯翠莲 张树珍 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期2310-2319,共10页
【目的】克隆甘蔗分子伴侣基因Sh DnaJ,并分析其在甘蔗线条花叶病毒(SCSMV)胁迫下的表达模式,为探究ShDnaJ基因在甘蔗应答SCSMV侵染过程中的功能和作用机制提供理论参考。【方法】通过同源克隆技术克隆ShDnaJ基因完整开放阅读框(ORF)序... 【目的】克隆甘蔗分子伴侣基因Sh DnaJ,并分析其在甘蔗线条花叶病毒(SCSMV)胁迫下的表达模式,为探究ShDnaJ基因在甘蔗应答SCSMV侵染过程中的功能和作用机制提供理论参考。【方法】通过同源克隆技术克隆ShDnaJ基因完整开放阅读框(ORF)序列,利用生物信息学软件对其进行分析,再利用绿色荧光蛋白(GFP)融合表达法分析ShDnaJ蛋白的亚细胞定位,采用实时荧光定量PCR检测ShDnaJ基因在甘蔗不同组织及在SCSMV胁迫下的表达水平。【结果】ShDnaJ基因ORF全长1260 bp,编码419个氨基酸残基,蛋白分子量为45682.47 Da,理论等电点(pI)为8.78,属于稳定的亲水蛋白,含有DnaJ结构域,属于DnaJ超家族成员,定位于内质网。ShDnaJ蛋白的二级结构由113个α-螺旋、31个β-转角、78个延伸链和197个无规则卷曲组成。ShDnaJ蛋白与高粱SbDnaJ蛋白的氨基酸序列相似性最高,为96.93%,说明两者亲缘关系最近。ShDnaJ基因在甘蔗根、茎和叶中均有表达,且根和茎中的相对表达量显著高于叶中(P<0.05,下同),但未成熟茎Sh DnaJ基因的相对表达量高于成熟茎;成熟叶ShDnaJ基因的相对表达量高于未成熟叶。随着处理时间的推移,SCSMV胁迫组和对照组(磷酸缓冲液处理)中ShDnaJ基因的相对表达量整体呈下降趋势,但SCSMV接种后不同时间点ShDnaJ基因的相对表达量均显著高于对照组。【结论】ShDnaJ基因具有组织表达特异性,且组织的成熟程度会影响其表达水平。SCSMV胁迫下该基因表达上调,推测该基因参与调控甘蔗植株对SCSMV的抗性。 展开更多
关键词 甘蔗 分子伴侣dnaj 基因克隆 甘蔗线条花叶病毒(SCSMV) 表达分析
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DNAJB11基因在尤文氏肉瘤中的表达及预后价值
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作者 李鑫 刘震东 +1 位作者 李昂 王红强 《国际检验医学杂志》 CAS 2023年第10期1181-1187,1194,共8页
目的 探讨DnaJ热休克蛋白家族成员B11(DNAJB11)在尤文氏肉瘤(ES)中的预后、诊断价值及与免疫细胞浸润的关系,并预测具有潜在治疗价值的药物。方法 利用GEO数据库分析DNAJB11在ES样本与正常样本中的表达水平差异,并使用荧光定量PCR(RT-qP... 目的 探讨DnaJ热休克蛋白家族成员B11(DNAJB11)在尤文氏肉瘤(ES)中的预后、诊断价值及与免疫细胞浸润的关系,并预测具有潜在治疗价值的药物。方法 利用GEO数据库分析DNAJB11在ES样本与正常样本中的表达水平差异,并使用荧光定量PCR(RT-qPCR)进行验证。随后获取ICGC数据库中56例ES的RNA测序(RNA-seq)数据和临床相关信息进行后续分析,根据DNAJB11表达水平将患者分为高表达组、低表达组,通过“limma”包鉴定两组间的差异表达基因。采用Kaplan-Meier生存分析、单因素和多因素COX分析及受试者工作特征(ROC)曲线分析DNAJB11表达水平对ES患者预后的影响,GO和KEGG富集分析DNAJB11在ES病理进展中可能参与的生物学途径,ssGSEA算法分析DNAJB11表达水平与ES免疫细胞浸润的关系,CMap数据库筛选对ES具有治疗潜力的药物。结果 结合GEO、ICGC数据库与RT-qPCR分析结果发现,DNAJB11在ES中呈高表达(P<0.05),且DNAJB11高表达与ES发生转移有关。Kaplan-Meier生存曲线分析显示DNAJB11高表达与ES患者较差的预后相关(P=0.029)。多因素COX分析显示DNAJB11高表达是ES患者预后的独立危险因素(P=0.002,HR=1.055,95%CI:1.020~1.091)。ROC曲线分析显示,DNAJB11对ES预后有一定的预测价值。GO和KEGG富集分析显示,DNAJB11主要参与内质网应激反应、抗原加工及呈递和主要组织相容性复合体Ⅱ类蛋白复合物结合等通路。ssGSEA免疫评分结果提示DNAJB11高表达组具有较高的免疫细胞浸润丰度。CMap分析提示粗糠柴毒素、甲氟喹和依米丁可能是治疗ES的潜在治疗药物。结论 DNAJB11高表达预示患者预后较差,并对ES免疫微环境有一定的影响,DNAJB11有望成为治疗ES的新的生物靶点。 展开更多
关键词 尤文氏肉瘤 dnaj热休克蛋白家族成员B11 免疫微环境 预后
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辣椒锌指蛋白DnaJ-Like基因家族鉴定及对高温胁迫的表达响应 被引量:2
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作者 段敏杰 李怡斐 +4 位作者 杨小苗 王春萍 黄启中 黄任中 张世才 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期187-198,共12页
植物DnaJ-Like锌指蛋白(DNAJE)是近年来发现的一类具有重要功能的蛋白,在光合作用、质体发育与运动和植物抗逆及防御反应中发挥重要作用。基于辣椒全基因组数据,对辣椒DNAJE基因家族(CaDNAJE)进行鉴定,利用生物信息学方法对基因和蛋白... 植物DnaJ-Like锌指蛋白(DNAJE)是近年来发现的一类具有重要功能的蛋白,在光合作用、质体发育与运动和植物抗逆及防御反应中发挥重要作用。基于辣椒全基因组数据,对辣椒DNAJE基因家族(CaDNAJE)进行鉴定,利用生物信息学方法对基因和蛋白特征、比较进化、共线性关系及高温胁迫下基因表达模式等进行分析。结果表明,CaDNAJE基因家族有28个成员,不均匀的分布在10条染色体和3个Scaffold上,氨基酸序列长度为99-470 aa,分子量为10.05-52.26 kD,理论等电点(pI)为4.75-9.64,其编码蛋白主要定位在叶绿体和细胞核中;辣椒、番茄和拟南芥的比较进化分析可将其分为GroupⅠ和GroupⅡ2个亚族,同一亚族具有类似的蛋白保守motif和基因结构;CaDNAJE基因启动子区包含大量光响应、激素响应和胁迫应答元件;辣椒与拟南芥DNAJE之间存在10对共线性基因,辣椒种内仅有1对;辣椒不同组织转录组分析发现,GroupⅠ中多数成员在各组织中均有高表达,而GroupⅡ中除CaDNAJE2、CaDNAJE9等基因存在高表达外,多数基因表达量都很低甚至不表达;高温胁迫下,辣椒叶片过氧化氢含量急速上升后降低,丙二醛含量持续升高,抗氧化物酶活性也有不同程度的提高。同时,高温诱导热激转录因子Hsf和热激蛋白HSP耐热相关基因及CaDNAJE基因高表达,在不同胁迫时期发挥调控作用。推测CaDNAJE基因家族可能参与辣椒响应高温胁迫,提高其耐受力,以降低细胞损伤。 展开更多
关键词 辣椒 dnaj-Like锌指蛋白 全基因组鉴定 高温胁迫 基因表达 调控
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DnaJ热休克蛋白家族成员C9在肺腺癌中的表达及预后价值 被引量:1
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作者 王愿 李江涛 +3 位作者 姬巧霞 张焕 才虹美 李义帅 《实用临床医药杂志》 2023年第12期80-87,共8页
目的探讨DnaJ热休克蛋白家族成员C9(DNAJC9)在肺腺癌(LUAD)组织中的表达、预后、甲基化情况及与肿瘤免疫浸润的关系。方法利用肿瘤基因组计划(TCGA)中LUAD的表达及临床数据分析DNAJC9的差异表达及预后价值。采用免疫组化法检测40例LUAD... 目的探讨DnaJ热休克蛋白家族成员C9(DNAJC9)在肺腺癌(LUAD)组织中的表达、预后、甲基化情况及与肿瘤免疫浸润的关系。方法利用肿瘤基因组计划(TCGA)中LUAD的表达及临床数据分析DNAJC9的差异表达及预后价值。采用免疫组化法检测40例LUAD患者的癌组织及配对正常组织DNAJC9的蛋白表达;利用UALCAN数据库及TCGA Wanderer数据库对DNAJC9启动子区域甲基化位点进行分析;利用TIMER数据库和单样本基因集富集分析(ssGSEA)对DNAJC9表达与LUAD免疫浸润水平的关系进行分析;根据String数据库分析与DNAJC9相互作用的蛋白,利用FUNRICH富集分析工具对这些基因进行功能富集分析。结果DNAJC9在LUAD组织中的表达水平高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.01)。免疫组化法显示,DNAJC9蛋白在LUAD组织中的表达率为80.0%(32/40),高于癌旁组织的45.0%(18/40),差异有统计学意义(P<0.05)。高表达患者的总生存率、无疾病生存率和无进展生存率均低于低表达者,差异有统计学意义(P<0.05)。DNAJC9的表达与是否存在TP53突变显著相关(P<0.05)。DNAJC9基因启动子区域甲基化水平在肿瘤组织中低于正常组织,且和该基因序列表达相关的甲基化位点与其表达水平呈负相关(P<0.05)。DNAJC9表达与LUAD免疫细胞浸润水平相关。蛋白相互作用网络分析发现,微小染色体维持复合物成分6(MCM6)、核糖核苷酸还原酶催化亚基M1(RRM1)、核自身抗原精子蛋白(NASP)、皮瓣结构特异性内切酶(FEN1)、脱氧尿苷三磷酸酶(DUT)、复制因子C亚基4(RFC4)、序列相似的家族149成员B1(FAM149B1)、MutS同源2(MSH2)、染色体的结构维持2(SMC2)、小染色体维持复合体成分2(MCM2)等蛋白与DNAJC9密切相关。富集分析显示,这些基因参与DNA合成、G2/M检查点等信号通路及多种致癌过程。结论DNAJC9的低甲基化水平使DNAJC9在LUAD组织中呈高表达,其高表达提示预后不良,与免疫细胞的浸润相关。 展开更多
关键词 肺腺癌 dnaj热休克蛋白家族成员C9 免疫组化法 数据库 预后 免疫浸润
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DNAJB4与非小细胞肺癌免疫细胞浸润和患者预后的相关性分析
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作者 杨上英 黄明翔 +2 位作者 许德新 刘加夫 陈新富 《癌变.畸变.突变》 CAS 2023年第6期467-472,共6页
目的:探讨DNAJB4在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达,分析其与癌组织中免疫细胞浸润水平和NSCLC患者预后的相关性。方法:采用GEPIA数据库分析NSCLC患者癌组织和癌旁正常组织中DNAJB4 mRNA的表达差异。采用荧光定量PCR和免疫组+织化学方法检... 目的:探讨DNAJB4在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达,分析其与癌组织中免疫细胞浸润水平和NSCLC患者预后的相关性。方法:采用GEPIA数据库分析NSCLC患者癌组织和癌旁正常组织中DNAJB4 mRNA的表达差异。采用荧光定量PCR和免疫组+织化学方法检测组织中DNAJB4 mRNA和蛋白的表达。应用TIMER数据库分析DNAJB4表达与NSCLC中免疫细胞(B细胞、CD4 T+细胞、CD8 T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞)浸润水平的相关性,并探讨免疫细胞浸润对NSCLC患者预后的影响。通过Kaplan-Meier plotter数据库分析DNAJB4表达水平与NSCLC预后的关系。结果:与癌旁正常组织比较,DNAJB4在NSCLC组织中低表达(P<0.05)。DNAJB4表达水平与癌组织免疫细胞的浸润程度相关。肺腺癌中,DNAJB4的拷贝数变异对免疫细胞的浸润+水平有明显影响(P<0.05)。B细胞可作为肺腺癌预后的独立危险因素。肺鳞癌中,DNAJB4拷贝数变异对除CD8 T细胞外的免疫细胞浸润水平有显著影响(P<0.05)。生存分析显示低表达的DNAJB4与NSCLC患者的不良预后显著相关(P<0.05)。结论:DNAJB4在NSCLC组织中表达下调,参与NSCLC免疫细胞浸润,影响免疫微环境的平衡,进而造成NSCLC患者的不良预后。DNAJB4可能是NSCLC免疫细胞浸润及预后的生物学标志物。 展开更多
关键词 dnaj热休克蛋白家族成员B4 非小细胞肺癌 免疫浸润 预后
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Genome-wide analysis of soybean DnaJA-family genes and functional characterization of GmDnaJA6 responses to saline and alkaline stress
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作者 Binshuo Zhang Zhen Liu +10 位作者 Runnan Zhou Peng Cheng Haibo Li Zhiyang Wang Ying Liu Mingyang Li Zhenqing Zhao Zhenbang Hu Qingshan Chen Xiaoxia Wu Ying Zhao 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2023年第4期1230-1241,共12页
Plant Dna JA proteins act as molecular chaperones in response to environmental stressors.The purpose of this study was to characterize the function and regulatory mechanisms of Dna JA genes in soybean.Gene expression ... Plant Dna JA proteins act as molecular chaperones in response to environmental stressors.The purpose of this study was to characterize the function and regulatory mechanisms of Dna JA genes in soybean.Gene expression profiles in various soybean tissues at various stages of development indicated that Gm Dna JAs function in the coordination of stress and plant hormone responses.Gm Dna JA6 was identified as a candidate regulator of saline and alkaline stress resistance and Gm Dna JA6 overexpression lines showed increased soybean saline and alkaline tolerance.Dna J interacted with Hsp70,and Gm Hsp70 increased the saline and alkaline tolerance of plants with chimeric soybean hairy roots. 展开更多
关键词 SOYBEAN Heat shock proteins dnaj Salt stress Alkali stress
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利用花粉管通道转化谷子DNAj基因获得转基因小麦 被引量:8
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作者 王永芳 张军 +4 位作者 崔润丽 李伟 智慧 李海权 刁现民 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2009年第2期17-21,共5页
为提高小麦的抗旱能力,采用花粉管通道法将本实验室克隆的谷子抗逆相关基因DNAj转入小麦中。对授粉方式、柱头处理方式、质粒DNA浓度及DNA稀释试剂等因素对结实率的影响进行了对比,结果只有授粉方式对结实率的影响有显著差异,其他条件... 为提高小麦的抗旱能力,采用花粉管通道法将本实验室克隆的谷子抗逆相关基因DNAj转入小麦中。对授粉方式、柱头处理方式、质粒DNA浓度及DNA稀释试剂等因素对结实率的影响进行了对比,结果只有授粉方式对结实率的影响有显著差异,其他条件下结实率均未显示显著差异。对转化获得的703株T0小麦植株提取DNA进行分子检测,有1株小麦稳定扩增到了预期的1 260 bp的目的基因片段。虽然转化效率偏低(1.42‰),但说明利用花粉管通道法将谷子的抗逆相关基因DNAj导入小麦是可行的,为创造抗逆性改良的小麦新材料奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 dnaj基因 花粉管通道法 转化
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拟南芥DnaJ蛋白的过量表达对细菌耐盐性的影响 被引量:6
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作者 赵志常 张建军 +3 位作者 张皖蓉 刘震 李旭锋 杨毅 《广西师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2010年第1期54-57,共4页
热激蛋白是植物在各种环境胁迫下产生的一种蛋白,其表达与多种胁迫的抗性有一定关系。从野生型拟南芥cDNA中克隆获得了编码442个氨基酸序列的DnaJ基因,其与大肠杆菌DnaJ基因含有相同的J区和半胱氨酸富集区。将DnaJ基因构建到pET32a的原... 热激蛋白是植物在各种环境胁迫下产生的一种蛋白,其表达与多种胁迫的抗性有一定关系。从野生型拟南芥cDNA中克隆获得了编码442个氨基酸序列的DnaJ基因,其与大肠杆菌DnaJ基因含有相同的J区和半胱氨酸富集区。将DnaJ基因构建到pET32a的原核表达载体,过量表达DnaJ基因的细菌在含有0.5 mol/LNaCl的培养基中仍然可以生长,初步推断DnaJ的表达与耐盐性有关。 展开更多
关键词 热激蛋白 dnaj 过量表达 细菌耐盐性
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谷子DnaJ蛋白基因的克隆 被引量:11
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作者 崔润丽 智慧 +4 位作者 王永芳 李伟 李海权 黄占景 刁现民 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2007年第4期9-13,共5页
DnaJ蛋白是近年研究较多的同热激等胁迫反应相关的基因。本研究用0.8%NaCl胁迫下的谷子幼苗提取RNA,用反转录酶M-MLV扩增得到第一链cDNA,再以第一链cDNA为模板进行PCR扩增,克隆获得了完整的谷子DnaJ蛋白基因,该基因cDNA全长1 260 bp,编... DnaJ蛋白是近年研究较多的同热激等胁迫反应相关的基因。本研究用0.8%NaCl胁迫下的谷子幼苗提取RNA,用反转录酶M-MLV扩增得到第一链cDNA,再以第一链cDNA为模板进行PCR扩增,克隆获得了完整的谷子DnaJ蛋白基因,该基因cDNA全长1 260 bp,编码419个氨基酸,具有DnaJ蛋白分子伴侣系统的3个保守结构域。将谷子DnaJ蛋白基因构建入表达载体pGFP,获得了谷子DnaJ基因的表达载体。该基因的克隆和表达载体构建,为谷子DnaJ蛋白基因的功能分析以及谷子耐热抗旱机理研究有重要意义。 展开更多
关键词 谷子 dnaj 基因克隆
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肺炎链球菌dnaJ基因缺陷菌株的构建及毒力变化的初步研究 被引量:5
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作者 崔瑾 张群 +6 位作者 董杰 姜慧 周爱娥 董姗姗 张雪梅 尹一兵 王虹 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第19期2000-2003,共4页
目的构建肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,S.pn)dnaJ基因缺陷菌株,并对其毒力作初步研究。方法采用长臂同源多聚酶链式反应(long flanking homology polymerase chain reaction,LFH-PCR)技术将dnaJ基因替换为红霉素耐药基因(erm)... 目的构建肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,S.pn)dnaJ基因缺陷菌株,并对其毒力作初步研究。方法采用长臂同源多聚酶链式反应(long flanking homology polymerase chain reaction,LFH-PCR)技术将dnaJ基因替换为红霉素耐药基因(erm)后同源重组于肺炎链球菌,在含红霉素的血平板上筛选出dnaJ缺陷菌株。用PCR鉴定缺陷菌株,以细菌的吸光度值D(600 nm)观察体外缺陷菌株生长情况。将44只BALB/c小鼠采用随机数字表法分为2组,分别用野生菌株和缺陷菌株处理,腹腔攻毒100μl高(2×108cfu)、低(2×106cfu)剂量的菌液,各处理组的不同剂量组均有11只小鼠。记录小鼠死亡时间,计算存活率。60只BALB/c小鼠采用随机数字表分为2组,分别鼻腔滴注含菌量为2×107 cfu的30μl D39菌液和△dnaJ菌液,感染后6、12、24、36、48 h处死每组中的5只小鼠,分别取鼻咽灌洗液、肺组织(匀浆)和心脏血培养,根据每组平均菌落计数结果绘制细菌在宿主体内的定植曲线。结果 PCR结果显示dnaJ基因完全被erm基因所替代,构建dnaJ缺陷菌成功;单个菌落培养基生长情况表明体外热休克状态抑制dnaJ缺陷菌生长;小鼠毒力实验显示腹腔感染缺陷菌株的小鼠存活率可达到100%,而感染野生菌株的小鼠全部死亡,两者比较有统计学差异(P<0.01)。小鼠鼻腔感染模型中,缺陷菌株在各时间点鼻咽灌洗液和肺部的细菌载量均显著低于野生菌株,而且入血后可在感染24 h内被宿主清除,上述差异有统计学意义(P<0.01)。结论采用LFH-PCR技术作基因突变完全替代dnaJ基因,方法简便快捷;dnaJ的缺陷影响细菌在体外应激条件下的生长,并显著降低细菌在宿主体内的毒力和定植。 展开更多
关键词 肺炎链球菌 dnaj 长臂同源多聚酶链式反应 毒力
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菜豆DnaJ-like基因组DNA片段的克隆及其表达分析 被引量:5
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作者 张玉秀 张延红 +2 位作者 杨水云 柴团耀 赵文明 《西安交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第2期199-203,共5页
以PvSR6cDNA编码一种菜豆DnaJ like蛋白 ,并利用PCR的方法克隆出基因组部分序列 .核苷酸序列分析表明PvSR6基因在这段编码区内无内含子 ;Southernblot分析表明菜豆基因组中存在多个PvSR6基因拷贝 ;Northernblot分析结果表明PvSR6是组成... 以PvSR6cDNA编码一种菜豆DnaJ like蛋白 ,并利用PCR的方法克隆出基因组部分序列 .核苷酸序列分析表明PvSR6基因在这段编码区内无内含子 ;Southernblot分析表明菜豆基因组中存在多个PvSR6基因拷贝 ;Northernblot分析结果表明PvSR6是组成型表达蛋白 ,重金属Hg、Cd和As ,过量的Cu和Zn及受伤、高温、病毒侵染和水杨酸等均能强烈地诱导其基因在叶片中的表达 ,表明DnaJ 展开更多
关键词 基因克隆 菜豆 dnaj-like蛋白 基因表达 PvSR6基因 植物抗逆性 核苷酸序列分析
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DnaJ-like基因在不同环境胁迫下的表达研究 被引量:7
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作者 张玉秀 柴团耀 +1 位作者 李军超 赵文明 《西北植物学报》 CAS CSCD 2000年第2期171-174,共4页
Pv SR6( Phaseolus vulgaris stress- related)基因编码一种菜豆 Dna J- like蛋白。Northern blot结果表明 :Pv SR6基因在未处理的菜豆叶片中表达较少 ,重金属 ( Hg2 +和Cd2 + )、机械损伤、UV、高温和水杨酸等环境胁迫能强烈地促进其... Pv SR6( Phaseolus vulgaris stress- related)基因编码一种菜豆 Dna J- like蛋白。Northern blot结果表明 :Pv SR6基因在未处理的菜豆叶片中表达较少 ,重金属 ( Hg2 +和Cd2 + )、机械损伤、UV、高温和水杨酸等环境胁迫能强烈地促进其基因的转录 ,推测 Dna J- like蛋白在保护细胞膜和酶蛋白的结构和功能及提高植物的抗逆性方面有重要作用。 展开更多
关键词 dnaj-like蛋白 环境胁迫 基因表达 植物抗逆性
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cDNA文库与RACE方法结合克隆马铃薯DnaJ-like基因全长cDNA 被引量:7
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作者 李广存 金黎平 +3 位作者 王晓武 谢开云 谢丙炎 屈冬玉 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期649-654,共6页
以青枯病菌小种3号(生化变种2)PO41诱导24h和48h的马铃薯抗青枯病基因型ED13叶片为材料,应用SMART技术构建了一个富集青枯病抗性相关基因的cDNA文库。继而利用RACE技术与该cDNA文库相结合克隆了一个马铃薯分子伴侣基因的全长cDNA。该cDN... 以青枯病菌小种3号(生化变种2)PO41诱导24h和48h的马铃薯抗青枯病基因型ED13叶片为材料,应用SMART技术构建了一个富集青枯病抗性相关基因的cDNA文库。继而利用RACE技术与该cDNA文库相结合克隆了一个马铃薯分子伴侣基因的全长cDNA。该cDNA长735bp,5′端有25bp的非翻译区,3′端具有完整的polyA尾,包含一个编码177个氨基酸的完整开放阅读框架(GenBank登录号:DQ885360)。该分子伴侣基因与拟南芥DnaJ-like20的部分核苷酸序列具有84%的一致性,与其编码的氨基酸序列具有59%的一致性,暂命名为StDnaJ。目前在马铃薯中尚未发现与之同源的已知基因。半定量RT-PCR结果表明,该基因同时受青枯病菌的诱导和茉莉酸的调节,可能在青枯病菌和茉莉酸胁迫下具有促使胁迫损害细胞恢复活性的功能。 展开更多
关键词 马铃薯 CDNA文库 RACE dnaj-like基因
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无乳链球菌dnaJ基因缺失株的构建及其致病性研究 被引量:3
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作者 郭长明 吴植 +5 位作者 吴双 王永娟 王安平 刘广锦 刘永杰 朱善元 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第9期2507-2515,共9页
为研究dnaJ基因序列与细菌致病力的关系,本研究构建了dnaJ基因缺失株和互补株,并对其致病性进行验证。参照GenBank中无乳链球菌GD201008-001(登录号:NC_018646)目的基因序列分别设计引物,PCR克隆dnaJ基因上、下游同源臂基因序列,通过融... 为研究dnaJ基因序列与细菌致病力的关系,本研究构建了dnaJ基因缺失株和互补株,并对其致病性进行验证。参照GenBank中无乳链球菌GD201008-001(登录号:NC_018646)目的基因序列分别设计引物,PCR克隆dnaJ基因上、下游同源臂基因序列,通过融合PCR将两个片段连接到一起,构建dnaJ基因上、下游同源臂融合片段,PCR克隆含有启动子序列的dnaJ基因。将dnaJ基因上、下游同源臂融合片段和含有启动子序列的dnaJ基因分别连接链球菌-大肠杆菌穿梭质粒pSET4s和pSET2,电转化GD201008-001感受态细胞,构建dnaJ基因缺失株ΔdnaJ和互补株CΔdnaJ。通过分析ΔdnaJ和CΔdnaJ的遗传稳定性与形态学变化对dnaJ上、下游基因转录的影响,以及生长速率和斑马鱼攻毒试验评价dnaJ基因对无乳链球菌毒力的影响。经PCR鉴定和测序证明,ΔdnaJ和CΔdnaJ构建成功;与野生株GD201008-001相比,ΔdnaJ和CΔdnaJ在细菌染色形态上均无明显差异,但ΔdnaJ在液体培养基中的生长速度明显减缓;dnaJ基因的缺失未对相邻基因的转录造成影响;ΔdnaJ对斑马鱼的毒力明显下降,对斑马鱼的LD 50为5.68×10 4 CFU,约是野生株的241倍。dnaJ基因对无乳链球菌的毒力有显著影响,本试验结果为进一步探究无乳链球菌dnaJ基因的功能提供了参考依据。 展开更多
关键词 无乳链球菌 dnaj基因 基因缺失株 毒力
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DNAJ热激蛋白家族B8基因对肺腺癌侵袭转移的作用及其可能的机制 被引量:2
15
作者 于瑞莲 罗树春 +3 位作者 陈琳 李宏敏 安宁 曾铭 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期845-850,共6页
目的:探讨DNAJ热激蛋白家族B8基因(DNAJ heat shock protein family member B8,DNAJB8)在肺腺癌组织中的表达及其对肺腺癌细胞侵袭转移的作用和可能机制。方法:收集四川省人民医院2006年至2008年的肺腺癌手术切除标本102例,通过免疫组... 目的:探讨DNAJ热激蛋白家族B8基因(DNAJ heat shock protein family member B8,DNAJB8)在肺腺癌组织中的表达及其对肺腺癌细胞侵袭转移的作用和可能机制。方法:收集四川省人民医院2006年至2008年的肺腺癌手术切除标本102例,通过免疫组织化学(IHC)实验检测DNAJB8在肺腺癌组织中的表达情况,并分析其与临床病理参数及预后的关系。构建DNAJB8稳定敲低的肺腺癌A549细胞和DNAJB8稳定过表达的肺腺癌H1299细胞,CCK-8实验检测DNAJB8敲降或过表达对肺腺癌细胞增殖的影响,Transwell法检测其对肺腺癌细胞侵袭能力的影响,Western blotting检测其对肺腺癌细胞内侵袭相关蛋白MMP-2、MMP-9和ERK表达及活性的影响。裸鼠尾静脉注射DNAJB8稳定敲低的A549细胞构建肺腺癌转移模型,观察DNAJB8对A549细胞体内转移能力的影响。结果:DNAJB8在肺腺癌组织中的表达明显高于正常肺组织,其高表达与患者的淋巴结转移及TNM分期呈正相关,并且预示着患者有较差的预后(均P<0.01)。DNAJB8在A549细胞中的表达量高于H1299细胞,下调DNAJB8表达能够抑制A549细胞的侵袭[(41±3)vs(192±11)个,P<0.01],而上调DNAJB8的表达能够促进H1299细胞的侵袭[(235±14)vs(25±4)个,P<0.01]。实验组肺腺癌转移模型裸鼠肺脏肿瘤结节数显著低于对照组[(5±1)vs(17±3)个,P<0.01]。A549细胞中DNAJB8敲降后,MMP-2、MMP-9表达量和p-ERK水平均显著下降(均P<0.01);而H1299细胞高表达DNAJB8后,MMP-2、MMP-9表达量和p-ERK水平均显著升高(均P<0.01)。结论:DNAJB8能够促进肺腺癌的侵袭和转移,其机制可能与MEK/Erk信号通路有关。 展开更多
关键词 dnaj热激蛋白家族B8 肺腺癌 侵袭 转移
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海蓬子DnaJ-like基因片段的表达和生物信息学分析 被引量:5
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作者 张大栋 周春霖 +3 位作者 任丽娟 王茂文 汤日圣 马鸿翔 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2006年第3期222-224,共3页
从盐生植物海蓬子的抑制消减杂交文库中克隆了DnaJ-like基因的长609 bp的DNA序列,编码1个202 aa的开放阅读框,Northern B loting显示该基因在检测子(200 mmol/L NaC l)中的表达显著增强。生物信息学分析表明,在蛋白质水平上,该片段与拟... 从盐生植物海蓬子的抑制消减杂交文库中克隆了DnaJ-like基因的长609 bp的DNA序列,编码1个202 aa的开放阅读框,Northern B loting显示该基因在检测子(200 mmol/L NaC l)中的表达显著增强。生物信息学分析表明,在蛋白质水平上,该片段与拟南芥和水稻的同源性分别为6 e-68和1 e-58;在核酸水平上,该片段与拟南芥的同源性为3 e-24。保守区分析显示,该片段含有DnaJ-like基因完整的J功能域(J-Dom ain,66 aa),功能域在蛋白质水平与GenBank两种相关类型的J功能域的同源性分别为1 e-11和9 e-15。这为该基因的克隆及研究其在植物逆境胁迫中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 dnaj-like基因 表达 生物信息学分析 海蓬子
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猪附红细胞体DnaJ基因PCR诊断方法的建立及应用 被引量:2
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作者 张影 贾立军 +2 位作者 薛书江 钱年超 张守发 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2013年第1期24-27,共4页
为建立一种特异、敏感、准确的猪附红细胞体诊断技术,本试验根据GenBank上发表的猪附红细胞体全基因组(NC-015153.1)中的DnaJ基因序列设计合成了一对特异性引物,建立了猪附红细胞体DnaJ基因PCR诊断方法,进行了特异性和敏感性试验,并与... 为建立一种特异、敏感、准确的猪附红细胞体诊断技术,本试验根据GenBank上发表的猪附红细胞体全基因组(NC-015153.1)中的DnaJ基因序列设计合成了一对特异性引物,建立了猪附红细胞体DnaJ基因PCR诊断方法,进行了特异性和敏感性试验,并与姬姆萨染色镜检方法进行了临床应用比较。结果,猪附红细胞体DnaJ基因PCR诊断方法扩增片段大小为868bp(GenBank登录号为:JN247670),与GenBank中(NC_015153.1)同源性为99%,该方法扩增不出犬新孢子虫、牛附红细胞体、犬附红细胞体等基因片段,最低检测猪附红细胞体DNA量为124fg/μL,通过对53份猪血液样本的检测,并与血液涂片姬姆萨染色镜检比较,说明建立的PCR诊断方法具有特异、敏感、准确等优点,完全适用于猪附红细胞体的诊断。 展开更多
关键词 猪附红细胞体 dnaj基因 PCR
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胡萝卜体细胞胚DnaJ同源基因的分离及其表达特性分析 被引量:4
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作者 杨志攀 张雷 +2 位作者 刁丰秋 黄美娟 吴乃虎 《自然科学进展》 北大核心 2003年第2期157-163,共7页
DuaJ/Hsp40蛋白是DnaK/Hsp70的辅助分子伴侣,它通过调节DnaK/Hsp70的ATPase活性来影响蛋白复合体的合成与组装。运用改进的cDNA代表性差示分析方法从解调控胡萝卜体细胞胚中分离出Dnal基因同源区段,进而以它为探针筛选解调控12h的胡萝... DuaJ/Hsp40蛋白是DnaK/Hsp70的辅助分子伴侣,它通过调节DnaK/Hsp70的ATPase活性来影响蛋白复合体的合成与组装。运用改进的cDNA代表性差示分析方法从解调控胡萝卜体细胞胚中分离出Dnal基因同源区段,进而以它为探针筛选解调控12h的胡萝卜体细胞胚cDNA文库,从胡萝卜中分离得到DuaJ蛋白同源基因DcJ1.序列分析表明它的编码区为1257bp,编码418个氨基酸和1个终止密码子,包含3个保守的特征结构域。Southern杂交分析表明,DcJ1基因在核基因组中以单拷贝或低拷贝形式存在;而Northern杂交则显示该基因仅在根中特异表达,其表达强度随着胡萝卜体细胞胚的调控-解调控过程发生明显的变化,并且不受热激的诱导。由此可见,DcJ1基因的表达活性与胡萝卜体细胞胚根的早期发育之间存在着明显的相关性。 展开更多
关键词 胡萝卜 体细胞胚 dnaj基因 基因分离 基因表达 表达调控 热激蛋白
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水稻DnaJ蛋白的生物信息学分析 被引量:9
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作者 赵旭 刘向国 王爱荣 《亚热带农业研究》 2011年第3期206-211,共6页
DnaJ蛋白是一类很大的蛋白家族,因含有保守的DnaJ结构域而得名。本文对水稻DnaJ蛋白进行了生物信息学分析表明,水稻中共有101个DnaJ蛋白,分为典型的三大类。通过表达证据搜索发现,除了11个基因没有表达证据外,其他基因在水稻中都有表达... DnaJ蛋白是一类很大的蛋白家族,因含有保守的DnaJ结构域而得名。本文对水稻DnaJ蛋白进行了生物信息学分析表明,水稻中共有101个DnaJ蛋白,分为典型的三大类。通过表达证据搜索发现,除了11个基因没有表达证据外,其他基因在水稻中都有表达。此外,对水稻的DnaJ蛋白家族进行了初步的进化分析。 展开更多
关键词 水稻 dnaj蛋白 基因家族 基因表达 进化分析
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大豆GmDnaJ1蛋白对几种重金属胁迫的响应研究 被引量:2
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作者 黄守程 刘爱荣 叶梅荣 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期288-294,共7页
通过对大豆铝胁迫下的转录组测序分析,发现一个差异表达的基因,其编码一个具有101个氨基酸残基的Dna J-like分子伴侣蛋白-Gm Dna J1(Glycine max Dna J1),等电点为8.97;序列分析表明该蛋白具有典型的高度保守的J domain功能域,是一种类... 通过对大豆铝胁迫下的转录组测序分析,发现一个差异表达的基因,其编码一个具有101个氨基酸残基的Dna J-like分子伴侣蛋白-Gm Dna J1(Glycine max Dna J1),等电点为8.97;序列分析表明该蛋白具有典型的高度保守的J domain功能域,是一种类型III的J蛋白;通过对其序列的同源性及进化关系分析,推测该蛋白可能响应重金属胁迫。为进一步探究Gm Dna J1是否能够对重金属胁迫产生应答反应,试验分别以0或100μmol·L-1Cu2+、Pb2+和Cd2+溶液胁迫处理的不同时间(0、12、24、48和72 h)大豆根尖RNA为材料,通过实时定量PCR研究了该蛋白基因的表达特征。结果表明:与对照相比,Gm Dna J1受Cu、Pb和Cd等重金属的诱导而强烈表达,呈现先升高后降低的趋势,其中Pb、Cd处理24 h后表达水平达到峰值,而Cu处理48 h后达到峰值;此外,Gm Dna J1对Cu、Pb和Cd胁迫的响应程度也不同,表明该基因对这三种重金属的响应模式存在差异。根据以上研究结果,推测大豆Gm Dna J1蛋白不仅响应铝毒胁迫,而且可能在响应重金属胁迫方面具有重要的作用,参与了大豆对重金属毒害的抵抗。该结果为深入研究Gm Dna J1在重金属胁迫响应中的功能及其分子机制提供了一定的依据。 展开更多
关键词 大豆 dnaj-like蛋白 重金属胁迫 重金属响应 分子伴侣
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