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长链非编码RNA LINC00996通过抑制CDKN2A促进胃癌进展
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作者 程国雄 刘明 +1 位作者 陈正伟 叶巧萍 《世界华人消化杂志》 CAS 2024年第4期302-312,共11页
背景长链非编码RNA长基因间非蛋白编码RNA 996(long intergenic non-protein coding RNA 996,LINC00996)在多种肿瘤中发挥促癌或抑癌作用,而其在胃癌中的表达和作用尚不清楚.目的探索LINC00996在胃癌组织和细胞系中的表达,并探讨其对胃... 背景长链非编码RNA长基因间非蛋白编码RNA 996(long intergenic non-protein coding RNA 996,LINC00996)在多种肿瘤中发挥促癌或抑癌作用,而其在胃癌中的表达和作用尚不清楚.目的探索LINC00996在胃癌组织和细胞系中的表达,并探讨其对胃癌细胞生物学行为的作用及机制.方法用生物信息学法分析胃癌中LINC00996的表达,及其对胃癌患者总生存期的影响.用RT-qPCR检测胃癌及癌旁组织、胃癌及正常胃上皮细胞系中LINC00996表达.胃癌细胞(SGC7901、NCI-N87)转染针对LINC00996的小干扰RNA(si-LINC00996)和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制蛋白2A(cyclin-dependent kinase inhibitor 2A,CDKN2A)的小干扰RNA(si-CDKN2A)后,用细胞计数试剂盒-8法、EDU染色法、流式细胞术法、划痕法和Transwell法分别检测细胞增殖、细胞周期、凋亡、迁移与侵袭;Western blot法检测细胞中CDKN2A、周期蛋白D1、B淋巴细胞瘤-2(B-cell lymphoma-2,Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bcl-2 associated X protein,Bax)和劈开的半胱胺酸蛋白酶-3(Cleaved cysteinyl aspartate-specific proteinase-3,Cleaved caspase-3)表达.结果LINC00996在胃癌组织和细胞中表达较癌旁组织和胃正常细胞系显著升高(P<0.05),Kaplan Meier Plotter数据库显示LINC00996高表达组的胃癌患者的总生存期较低表达组显著缩短(P<0.05).敲降LINC00996能抑制胃癌细胞增殖、细胞周期运行、迁移、侵袭(P<0.05),促进细胞凋亡(P<0.05);降低cyclin D1和Bcl-2表达(P<0.05);升高CDKN2A、Bax和Cleaved caspase-3表达(P<0.05).敲降CDKN2A能部分逆转敲降LINC00996对胃癌细胞的作用(P<0.05).结论敲降LINC00996能通过上调CDKN2A诱导胃癌细胞凋亡,抑制其增殖、迁移与侵袭. 展开更多
关键词 长基因间非蛋白编码rna 996 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制蛋白2A 胃癌 增殖 凋亡 迁移 侵袭
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Inhibition of DNA-dependent Protein Kinase Catalytic Subunit by Small Molecule Inhibitor NU7026 Sensitizes Human Leukemic K562 Cells to Benzene Metabolite-induced Apoptosis 被引量:6
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作者 游浩 孔萌萌 +9 位作者 王立萍 肖潇 廖汉林 毕卓悦 燕虹 王红 汪春红 马强 刘燕群 毕勇毅 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2013年第1期43-50,共8页
Benzene is an established leukotoxin and leukemogen in humans. We have previously re- ported that exposure of workers to benzene and to benzene metabolite hydroquinone in cultured cells induced DNA-dependent protein k... Benzene is an established leukotoxin and leukemogen in humans. We have previously re- ported that exposure of workers to benzene and to benzene metabolite hydroquinone in cultured cells induced DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (DNA-PKcs) to mediate the cellular response to DNA double strand break (DSB) caused by DNA-damaging metabolites. In this study, we used a new, small molecule, a selective inhibitor of DNA-PKcs, 2-(morpholin-4-yl)-benzo[h]chomen-4-one (NU7026), as a probe to analyze the molecular events and pathways in hydroquinone-induced DNA DSB repair and apoptosis. Inhibition of DNA-PKcs by NU7026 markedly potentiated the apoptotic and growth inhibitory effects of hydroquinone in proerythroid leukemic K562 cells in a dose-dependent manner. Treatment with NU7026 did not alter the production of reactive oxygen species and oxidative stress by hydroquinone but repressed the protein level of DNA-PKcs and blocked the induction of the kinase mRNA and protein expression by hydroquinone. Moreover, hydroquinone increased the phos- phorylation of Akt to activate Akt, whereas co-treatment with NU7026 prevented the activation of Akt by hydroquinone. Lastly, hydroquinone and NU7026 exhibited synergistic effects on promoting apop- tosis by increasing the protein levels of pro-apoptotic proteins Bax and caspase-3 but decreasing the protein expression of anti-apoptotic protein Bcl-2. Taken together, the findings reveal a central role of DNA-PKcs in hydroquinone-induced hematotoxicity in which it coordinates DNA DSB repair, cell cycle progression, and apoptosis to regulate the response to hydroquinone-induced DNA damage. 展开更多
关键词 BENZENE DNA-dependent protein kinase catalytic subunit 2-(morpholin-4-yl)- benzo[h]chomen-4-one AKT DNA double strand break
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双链RNA依赖的蛋白激酶与阿尔茨海默病相关性研究进展 被引量:1
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作者 龚奕 肖星洋 +2 位作者 胡有生 谢义炜 伍知辉 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期425-434,共10页
阿尔茨海默病(AD)是一种严重威胁人类健康的疾病,也是引起人类死亡的三大因素之一。双链RNA依赖的蛋白激酶(PKR)又称为前炎症细胞因子,是人类先天免疫干扰素刺激因子之一。在AD发生和发展中,PKR表达上调并持续激活,一方面引发脑组织细... 阿尔茨海默病(AD)是一种严重威胁人类健康的疾病,也是引起人类死亡的三大因素之一。双链RNA依赖的蛋白激酶(PKR)又称为前炎症细胞因子,是人类先天免疫干扰素刺激因子之一。在AD发生和发展中,PKR表达上调并持续激活,一方面引发脑组织细胞发生整合应激反应,另一方面间接上调β位淀粉样前体蛋白裂解酶1的表达,促进β淀粉样蛋白(Aβ)的积累,而Aβ的积累又可以激活PKR,进一步促进Aβ的积累,形成一个Aβ持续积累的循环。PKR还可以促进Tau蛋白磷酸化,降低神经细胞微管稳定性。脑组织炎症反应、Aβ的积累所引起神经毒性和微管稳定性的破坏会导致AD发生发展,引起患者记忆和认知的下降,因此PKR是AD发生发展中的关键分子。有效进行PKR检测可以预测AD进展,为临床治疗AD提供先机。目前PKR已成为研发治疗AD药物的靶点,因此靶向PKR的抑制剂有望控制PKR的活性,从而有效控制AD发生发展。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 双链rna依赖的蛋白激酶 Β淀粉样蛋白 TAU蛋白
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METTL3介导的PDK1 mRNA m^(6)A修饰通过Akt/mTOR信号通路促进肺上皮细胞增殖
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作者 靳艾 李梦宇 孙青竹 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期934-946,共13页
腺苷N6-位点甲基化(m^(6)A)在细胞增殖过程中发挥重要作用。RNA甲基转移酶3(METTL3)作为催化m^(6)A关键酶,其介导m^(6)A修饰在肺上皮细胞增殖中的作用机制尚不明确。本研究旨在探讨METTL3介导m^(6)A修饰调控肺上皮细胞增殖的效应及机制... 腺苷N6-位点甲基化(m^(6)A)在细胞增殖过程中发挥重要作用。RNA甲基转移酶3(METTL3)作为催化m^(6)A关键酶,其介导m^(6)A修饰在肺上皮细胞增殖中的作用机制尚不明确。本研究旨在探讨METTL3介导m^(6)A修饰调控肺上皮细胞增殖的效应及机制。结果显示,在肺上皮细胞中敲低METTL 3显著抑制细胞生长,而过表达METTL3则促进了细胞增殖(P<0.05)。进一步的蛋白质免疫印迹结果显示,细胞生长和增殖的关键蛋白质PCNA在METTL 3敲降的肺上皮细胞中蛋白质水平的表达显著下调,并且Akt以及mTOR的磷酸化水平显著降低(P<0.05)。细胞免疫荧光结果发现,METTL 3敲降的肺上皮细胞中m^(6)A修饰水平显著降低(P<0.05)。实时荧光定量PCR及蛋白质免疫印迹结果表明,Akt-mTOR信号通路上游调控分子PDK1的mRNA和蛋白质表达水平在METTL 3敲降的肺上皮细胞中显著下降(P<0.05)。机制上,m^(6)A-IP-qPCR和RIP-qPCR结果进一步表明,METTL3催化PDK 1 mRNA的3′UTR区域m^(6)A修饰,进而被YTH N6-甲基腺苷RNA结合蛋白1(YTHDF1)识别,增强其mRNA的稳定性。总之,本研究揭示了METTL3通过增强PDK1 m^(6)A修饰,进而激活Akt-mTOR信号通路,促进细胞增殖。本研究为METTL3在上皮细胞增殖中的新角色提供了证据,同时为治疗肺上皮细胞损伤修复提供了新的治疗靶点。 展开更多
关键词 甲基转移酶3 rna m^(6)A修饰 细胞增殖 肺上皮细胞 磷酸肌醇依赖性蛋白激酶-1
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双链RNA激活的蛋白激酶(PKR)的克隆表达及其对丙型肝炎病毒蛋白合成的抑制作用 被引量:3
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作者 贾因棠 魏来 +2 位作者 蒋栋 丛旭 费然 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期24-30,共7页
α干扰素为治疗丙型肝炎病毒(HCV)感染的主要药物,但部分患者呈干扰素耐受而不能获得持久的病毒阴转,其可能的原因之一是病毒通过其编码的蛋白(NS5A及E2)抑制干扰素诱导的抗病毒效应分子———双链RNA激活的蛋白激酶(PKR)的活性.而关于... α干扰素为治疗丙型肝炎病毒(HCV)感染的主要药物,但部分患者呈干扰素耐受而不能获得持久的病毒阴转,其可能的原因之一是病毒通过其编码的蛋白(NS5A及E2)抑制干扰素诱导的抗病毒效应分子———双链RNA激活的蛋白激酶(PKR)的活性.而关于PKR是否在IFN-α抗HCV的机理中起抑制作用目前仍有争议.为研究PKR对HCV蛋白合成环节是否有抑制作用,通过构建野生型PKR真核表达载体(pPKRwt)及主要起负性调节作用的缺失突变PKR真核表达载体(pPKRΔ6),并将pPKRwt/pPKRΔ6与HCV复制子RNA同时转染Huh7细胞进行共表达,用Western印迹检测HCV IRES下游的NPTⅡ蛋白表达水平,与转染空载体的对照细胞及单用IFN-α处理的细胞相比较.结果显示:表达PKRwt的细胞中NPTⅡ蛋白水平低于转染空载体的对照细胞,但高于经IFN-α单独处理的细胞;表达PKRΔ6的细胞中NPTⅡ蛋白水平与对照细胞无明显差别,但PKRΔ能部分抵消IFN-α的抑制作用,说明在IFN-α抑制HCV IRES指导的蛋白合成中,PKR有一定的抑制作用,但可能还有其它的PKR非依赖机制参与. 展开更多
关键词 双链rna依赖的蛋白激酶 丙型肝炎病毒 复制子 Α干扰素 内部核糖体进入位点
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日本血吸虫小热休克蛋白Sjp40的RNA干扰效应 被引量:3
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作者 陈敏芳 麦荣嘉 +1 位作者 莫倩珍 周晓红 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期456-461,共6页
目的研究日本血吸虫小热休克蛋白(sHSP)Sjp40基因的RNA干扰效应及其干扰后日本血吸虫HSP60、HSP70、HSP90基因在mRNA水平出现的协同效应,观察各期虫体Sjp40、SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因mRNA表达水平。方法以双链RNA(dsRNA)实现RNA... 目的研究日本血吸虫小热休克蛋白(sHSP)Sjp40基因的RNA干扰效应及其干扰后日本血吸虫HSP60、HSP70、HSP90基因在mRNA水平出现的协同效应,观察各期虫体Sjp40、SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因mRNA表达水平。方法以双链RNA(dsRNA)实现RNA干扰。体外转录合成dsRNA,将Sjp40的dsRNA(dsSjp40)及阴性对照GFP的dsRNA(dsGFP)通过浸泡法转染到日本血吸虫成虫中,体外培养7 d后用TRIZOL法提取其总RNA及总蛋白,实时荧光定量PCR(qPCR)检测Sjp40基因及SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因mRNA的表达,Western blot检测Sjp40蛋白表达产物。提取各期虫体总RNA,qPCR检测Sjp40、SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因的mRNA表达。结果转染后Sjp40 dsRNA转染组目的基因的转录水平较阴性对照GFP dsRNA转染组下降了80%左右;蛋白质水平较空白对照及阴性对照组(dsGFP)出现明显降低,qPCR结果显示在Sjp40基因RNA干扰后SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因的mRNA表达水平未发现明显变化。此四种HSPs在日本血吸虫生活史不同时期mRNA表达存在明显差异,Sjp40基因在虫卵期mRAN水平表达相对其他HSPs基因高。结论 dsSjp40 RNAi可特异性抑制Sjp40的表达,但对SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因mRNA的表达没有明显的影响。 展开更多
关键词 日本血吸虫 小热休克蛋白 rna干扰 DSrna
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双链RNA依赖的蛋白激酶(PKR)的真核表达、纯化及鉴定 被引量:2
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作者 关振宏 李影 +1 位作者 张茂林 段铭 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第28期13521-13523,共3页
[目的]获得真核表达的Flag-PKR融合蛋白,以用于流感病毒相关的PKR信号通路调控机制研究。[方法]以RT-PCR方法扩增PKR目的基因,将其克隆至真核表达载体pcDNA3.0-Flag中。将所构建的重组质粒pcDNA3.0-Flag-PKR转染293T细胞,利用Flag抗体... [目的]获得真核表达的Flag-PKR融合蛋白,以用于流感病毒相关的PKR信号通路调控机制研究。[方法]以RT-PCR方法扩增PKR目的基因,将其克隆至真核表达载体pcDNA3.0-Flag中。将所构建的重组质粒pcDNA3.0-Flag-PKR转染293T细胞,利用Flag抗体偶联的琼脂糖凝胶(anti-Flag M2-Agarose)纯化Flag-PKR融合蛋白,所得产物进行SDS-PAGE、Western blot及体外活性鉴定。[结果]重组质粒转染293T细胞,Western blot显示表达出的融合蛋白能够被抗Flag的抗体特异性识别,其相对分子量约为69 kDa,与Flag-PKR融合蛋白大小相符;体外磷酸化试验表明,Flag-PKR融合蛋白能够发生自动磷酸化。[结论]在293T细胞中表达、纯化了有活性的Flag-PKR融合蛋白,为PKR信号通路的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 流感病毒 双链rna依赖的蛋白激酶 真核表达 纯化
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RNA:诱导基因沉默 被引量:1
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作者 帅丽芳 赵勇 +1 位作者 孙金海 高宏伟 《生物技术通报》 CAS CSCD 2004年第6期17-21,25,共6页
在生物体中 ,双链RNA (double strandRNA ,dsRNA)裂解后的小RNA可以诱导细胞质和基因组水平外源基因沉默。所谓基因沉默 (genesilencing)是指生物体中特定基因由于种种原因不表达。小RNA能诱导互补信使RNA在转录后降解 ,对于植物 ,可通... 在生物体中 ,双链RNA (double strandRNA ,dsRNA)裂解后的小RNA可以诱导细胞质和基因组水平外源基因沉默。所谓基因沉默 (genesilencing)是指生物体中特定基因由于种种原因不表达。小RNA能诱导互补信使RNA在转录后降解 ,对于植物 ,可通过同源DNA序列甲基化使转录基因沉默。RNA沉默是基因组水平的免疫现象 ,代表了进化过程中原始的基因组对抗外源基因序列表达的保护机制 ,在动植物进化中起着重要作用 ,RNA沉默具有抵抗病毒入侵、抑制转座子活动、防止自私基因序列的过量增殖等作用 ,并调控蛋白编码基因的表达 。 展开更多
关键词 表达 诱导基因 信使rna 基因组 调控蛋白 编码基因 抗病毒 rna沉默 基因沉默 rna
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RNA干扰技术抑制哺乳动物细胞绿色荧光蛋白表达的研究 被引量:2
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作者 吴伟东 方驰华 《现代医院》 2007年第2期4-8,共5页
目的本研究旨在探讨阳离子脂质体的体外转染效率、化学合成双链RNA(dsRNA)诱导RNA干扰(RNAi)的效应强度及其作用特点,为采用RNAi技术开展基因治疗提供实验依据。方法①采用磷酸钙沉淀法构建293T/GFP细胞株。②体外化学合成dsRNA,经由三... 目的本研究旨在探讨阳离子脂质体的体外转染效率、化学合成双链RNA(dsRNA)诱导RNA干扰(RNAi)的效应强度及其作用特点,为采用RNAi技术开展基因治疗提供实验依据。方法①采用磷酸钙沉淀法构建293T/GFP细胞株。②体外化学合成dsRNA,经由三种不同的阳离子脂质体TransIT-TKO,Oligofectamine reagent,Lipofectamine2000导入293T/GFP细胞,通过荧光显微镜、流式细胞仪测定荧光强度的变化,观察不同阳离子脂质体的体外转染效率。③采用dsRNA-Lipofectamine2000复合物转染293T/GFP细胞。dsRNA分设5个不同的浓度(0.01,0.02,0.04,0.08,0.16μmol/L)转染细胞48h以观察剂量效应关系。dsRNA0.08μmol/L/Lipofectamine20008μl转染细胞,于4个不同的时间点(12h,24h,48h,72h)观察时间效应关系。结果绿色荧光蛋白序列特异性dsRNA(dsRNA-eGFP)经由三种不同的阳离子脂质体导入细胞均可产生RNAi效应,序列非特异性dsRNA(dsRNA-unrelated)无抑制效应。在三种不同的阳离子脂质体中,Lipofectamine2000的转染效率最强,转染48h可将293T/GFP细胞荧光强度降低约80%,与空白载体组比较差异显著,TransIT-TKO组,Oligofectamine reagent组分别降低41.02%、37.45%,与空白载体组比较无显著性差异,而且TransIT-TKO、Oligofectamine的细胞毒性较强。结果还表明dsRNA/Lipo-fectamine2000诱导的RNAi效应具有剂量及时间双重依赖性,dsRNA0.08μmol/L/Lipofectamine20008μl/6孔培养板转染细胞48h的抑制效应最强。结论①体外化学合成的dsRNA可有效诱导哺乳动物细胞出现序列特异性基因沉默效应。②三种不同的阳离子脂质体中Lipofectamine2000的转染效率最强,且细胞毒性轻微。③dsRNA/Lipofectamine2000诱导的RNAi效应具有剂量及时间双重依赖性。 展开更多
关键词 rna干扰 双链rna 绿色荧光蛋白
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双链RNA依赖的蛋白激酶在非小细胞肺癌预后预测及靶向治疗中的作用
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作者 郭琤琤 黄河 +5 位作者 梁超勇 田莹 刘婷智 李学莹 洪煌明 林桐榆 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期781-786,812,共7页
【目的】探索双链RNA依赖的蛋白激酶(PKR)联合其他肿瘤代谢相关蛋白能否作为非小细胞肺癌(NSCLC)的更有效的预测因子;同时拟研究部分肿瘤代谢相关化合物,如胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)抑制剂、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)抑制剂等... 【目的】探索双链RNA依赖的蛋白激酶(PKR)联合其他肿瘤代谢相关蛋白能否作为非小细胞肺癌(NSCLC)的更有效的预测因子;同时拟研究部分肿瘤代谢相关化合物,如胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)抑制剂、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)抑制剂等与PKR表达的关系,拟求达到更好的靶向治疗及个体化治疗的目的。【方法】免疫组化检测212例NSCLC中PKR、IGF-1R表达情况,并用于Kaplan-Meier生存分析。Western Blotting检测13种肺癌细胞株PKR、p-PKR表达;磺基罗丹明B法(SRB)检测PPP、Rapamycin等药物作用后对高表达及低表达p-PKR细胞的抑制率。【结果】全组NSCLC患者中,PKRlow/IGF-1Rhigh患者的5年总生存率(21.6%)明显低于PKRhigh/IGF-1Rlow患者(74.6%)及其他患者(58.2%)(P<0.0001),单、多因素分析提示PKR/IGF-1R联合标记物为NSCLC患者总生存率的独立预后因素。SRB结果提示,第1~3天,IGF-1R抑制剂PPP 3μmol/L在6个肺癌细胞株中均能显著抑制细胞生长,在0.3μmol/L剂量低表达PKR和/或p-PKR的H1792和H292细胞株中,较其他细胞株更能抑制细胞生长。而mTOR抑制剂Rapamycin采用1、0.1及0.01μmol/L 3个剂量级在各细胞株均未见明显抑制细胞生长的区别。【结论】PKR联合IGF-1R可预测NSCLC的预后,PKR低表达的H1792、H292细胞株中,IGF-1R抑制剂PPP具有显著抑制作用,但对于mTOR抑制剂Rapamycin,未见明显作用,提示可通过检测PKR的表达来选择适合IGF-1R抑制剂PPP的病人。 展开更多
关键词 双链rna依赖的蛋白激酶(PKR) IGF-1R mTOR 靶向治疗 预后
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血清HBV-LP联合PRKRA对HBV相关原发性肝癌术后复发风险的预测价值
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作者 蒋石艳 左丽 +2 位作者 陈美利 黄河龙 简雪瑶 《青岛大学学报(医学版)》 CAS 2024年第3期407-411,共5页
目的 分析血清乙型肝炎病毒大蛋白(HBV-LP)和干扰素诱导型双链RNA依赖性蛋白激酶激活剂A(PRKRA)水平对乙型肝炎病毒相关原发性肝癌(HBV-PLC)术后复发风险评估的价值。方法 收集确诊为HBV-PLC病人105例,根据术后是否复发分为未复发组(38... 目的 分析血清乙型肝炎病毒大蛋白(HBV-LP)和干扰素诱导型双链RNA依赖性蛋白激酶激活剂A(PRKRA)水平对乙型肝炎病毒相关原发性肝癌(HBV-PLC)术后复发风险评估的价值。方法 收集确诊为HBV-PLC病人105例,根据术后是否复发分为未复发组(38例)和复发组(67例)。比较两组病人临床基线资料、生化指标结果和病理资料;采用ELISA法检测病人血清HBV-LP和PRKRA水平;采用Pearson相关性分析血清HBV-LP和PRKRA的关系,Cox回归模型分析HBV-PLC术后复发的危险因素;绘制受试者工作特征(ROC)曲线,分析HBV-LP联合PRKRA检测对HBV-PLC术后复发风险的预测价值。结果 两组病人性别、年龄、吸烟史、饮酒量、血清生化指标和肝硬化等差异无统计学意义(P>0.05),两组甲胎蛋白(AFP)<25μg/L、肿瘤大小、肿瘤包膜、肝转移、血管侵袭和肿瘤分化程度差异有统计学意义(χ^(2)=4.217~10.849,P<0.05)。与未复发组比较,复发组病人血清HBV-LP和PRKRA水平明显升高(t=6.501、3.615,P<0.01)。HBV-PLC病人血清HBV-LP与PRKRA水平呈正相关(r=0.839,P<0.01)。肿瘤直径(2~5 cm)、肿瘤包膜、肿瘤低分化、血清HBV-LP和PRKRA是HBV-PLC术后复发的危险因素(HR=1.083~6.938,P<0.05)。ROC曲线分析显示,血清HBV-LP和PRKRA水平及二者联合对HBV-PLC病人术后复发有预测价值,ROC曲线下面积分别为0.796、0.685、0.822。结论 血清HBV-LP和PRKRA水平升高是HBV-PLC病人术后复发的独立危险因素,二者联合检测对HBV-PLC病人术后复发具有良好的预测价值。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 干扰素诱导的双链rna依赖激活剂 肝肿瘤 肿瘤复发 局部
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PDK1基因shRNA慢病毒载体构建及干扰效应鉴定
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作者 郝南 农德勇 +4 位作者 李钻 林俊浩 黄桂海 李锡明 李伟 《中国临床新医学》 2021年第8期773-778,共6页
目的构建PDK1基因短发夹RNA(shRNA)慢病毒载体,鉴定其对PC-3细胞PDK1基因的干扰效应。方法在GenBank数据库检索PDK1基因序列,参考该序列设计PDK1特异性过干扰序列,酶切过表达用载体LV3,纯化酶切产物后进行定向连接。将重组干扰病毒质粒... 目的构建PDK1基因短发夹RNA(shRNA)慢病毒载体,鉴定其对PC-3细胞PDK1基因的干扰效应。方法在GenBank数据库检索PDK1基因序列,参考该序列设计PDK1特异性过干扰序列,酶切过表达用载体LV3,纯化酶切产物后进行定向连接。将重组干扰病毒质粒与慢病毒包装质粒共转染293T细胞,测定病毒滴度。将构建的慢病毒感染PC-3细胞,采用real-time RT-PCR法鉴定其PDK1基因干扰效应。结果测序结果证实成功构建PDK1基因RNA干扰(RNAi)慢病毒载体,慢病毒滴度为1×108 TU/ml。real-time RT-PCR结果显示,LV3-PDK1-shRNA慢病毒感染PC-3细胞可显著抑制其PDK1 mRNA的表达(P<0.05)。结论成功构建PDK1基因RNAi慢病毒载体,获得稳定沉默PDK1基因的PC-3细胞株,为后续研究PDK1基因在前列腺癌细胞模型中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 rna干扰 3-磷脂酰肌醇依赖的蛋白激酶-1 转染 前列腺癌 慢病毒载体
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水稻钙依赖型蛋白激酶OsCPK9基因RNAi表达载体的构建及遗传转化 被引量:9
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作者 韦淑亚 张莹莹 +6 位作者 赵旭东 刘小东 罗青晨 卫秋慧 陈鹏 何光源 杨广笑 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期581-588,共8页
水稻钙依赖型蛋白激酶(CDPKs)是一个响应逆境胁迫并在植物发育过程中起重要作用的蛋白激酶。我们采用RT-PCR从水稻品种日本晴(Oryza sativa L.cv.Nipponbare)中克隆了OsCPK9基因靠近翻译起始位点下游的一段280 bp的特异基因片段。将该... 水稻钙依赖型蛋白激酶(CDPKs)是一个响应逆境胁迫并在植物发育过程中起重要作用的蛋白激酶。我们采用RT-PCR从水稻品种日本晴(Oryza sativa L.cv.Nipponbare)中克隆了OsCPK9基因靠近翻译起始位点下游的一段280 bp的特异基因片段。将该片段以正、反向分别连接到来源于小麦TAK14基因的548 bp内含子片段(NCBI accession number:AF325198)两侧,从而获得pSK-OsCPK9-RNAi的中间表达载体。进而将其克隆到植物双元表达载体pCAMBIA1301中,构建shRNAi表达载体pCAMBIA-OsCPK9-RNAi。经酶切和测序鉴定正确后,利用农杆菌介导转化水稻。通过抗性筛选和标记基因hyg和gus进行PCR鉴定,筛选到20株转基因水稻植株,实时荧光定量PCR分析显示,部分转基因植株OsCPK9的表达受到显著抑制。 展开更多
关键词 OsCPK9 水稻 rnaI CDPK 遗传转化
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宫颈病变中双链RNA依赖的蛋白激酶与HPV感染的相关性
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作者 李蕾 瞿全新 《国际妇产科学杂志》 CAS 2009年第6期476-478,F0003,共4页
目的:通过检测双链RNA依赖的蛋白激酶(PKR)、人乳头瘤病毒(HPV)在宫颈病变组织中的表达,探讨PKR在宫颈病变发生发展中的意义及可能机制。方法:选择临床病历资料和病理资料完整的宫颈癌患者共37例、同期宫颈上皮内瘤样病变(CIN)Ⅰ~Ⅲ患... 目的:通过检测双链RNA依赖的蛋白激酶(PKR)、人乳头瘤病毒(HPV)在宫颈病变组织中的表达,探讨PKR在宫颈病变发生发展中的意义及可能机制。方法:选择临床病历资料和病理资料完整的宫颈癌患者共37例、同期宫颈上皮内瘤样病变(CIN)Ⅰ~Ⅲ患者56例为研究对象,因子宫肌瘤等良性病变切除子宫的正常宫颈组织30例为对照。采用免疫组织化学SABC法检测PKR及HPV16/18E6的表达,分析二者与宫颈病变发生发展的关系。结果:宫颈癌组织中PKR表达阳性率为54.1%,高于CINⅢ,CINⅠ~Ⅱ组和正常宫颈组,差异有统计学意义(P<0.05);在宫颈癌组中PKR表达与HPV16/18E6表达存在负相关(r=-0.554,P<0.05);在CINⅢ组中PKR表达与HPV16/18E6表达存在正相关(r=0.480,P=0.032)。结论:PKR的异常表达在CINⅢ向宫颈癌发展过程中可能发挥主要作用,此外SABC法测定PKR和E6的表达有可能成为筛选子宫颈癌的早期指标。 展开更多
关键词 双链rna依赖的蛋白激酶 人乳头瘤病毒 宫颈上皮内瘤样病变 宫颈癌 免疫组织化学
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Effects of PI3-k/Akt short hairpin RNA on proliferation, fibronectin production and synthesis of thrombospondin-1 and transforming growth factor-beta(1 ) in glomerular mesangial cells induced by sublytic C5b-9 complexes 被引量:5
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作者 Gao, L. Zhang, Y. Qiu, W. Xu, W. Feng, X. Ren, J. Jiang, X. Wang, H. Zhao, D. Wang, Y. 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期344-344,共1页
关键词 连接蛋白 凝血栓蛋白 临床分析 治疗方法 白血病
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宫颈病变组织中双链RNA依赖的蛋白激酶表达
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作者 李蕾 瞿全新 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2009年第4期266-268,F0003,共4页
目的:检测宫颈癌及癌前病变组织中双链RNA-依赖的蛋白激酶(PKR)的表达,探讨PKR在宫颈病变发生发展中的意义及可能的机制。方法:选择临床病历资料和病理资料完整的宫颈癌患者共37例、同期宫颈上皮内瘤样病变(CINⅠ~CINⅢ)患者56例为研... 目的:检测宫颈癌及癌前病变组织中双链RNA-依赖的蛋白激酶(PKR)的表达,探讨PKR在宫颈病变发生发展中的意义及可能的机制。方法:选择临床病历资料和病理资料完整的宫颈癌患者共37例、同期宫颈上皮内瘤样病变(CINⅠ~CINⅢ)患者56例为研究对象,因子宫肌瘤等良性病变切除子宫的正常宫颈组织30例作为对照。采用免疫组织化学SABC法检测PKR的表达,分析PKR在宫颈病变发生、发展中的作用。结果:宫颈癌组织中PKR表达阳性率为54.1%(20/37),宫颈癌分期等临床病理资料均无明显相关(P>0.05);宫颈癌组PKR表达高于CINⅢ,CINⅠ~Ⅱ组和正常宫颈组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:PKR的异常表达在宫颈病变的发展过程中可能具有重要作用。 展开更多
关键词 双链rna-依赖的蛋白激酶 宫颈上皮内瘤样病变 宫颈癌 免疫组织化学法
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核蛋白TAR DNA/RNA结合蛋白43与小鼠肌萎缩侧索硬化症的关系
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作者 唐伟博 刘丽 申景岭 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期440-446,共7页
目的利用HB9启动子构建小鼠脊髓运动神经元特异表达人类TAR DNA/RNA结合蛋白43(hTDP-43)突变转基因小鼠,建立肌萎缩侧索硬化症(ALS)疾病模型,探究hTDP-43突变导致ALS发生的机制。方法体外构建HB9启动子连接突变hTDP-43载体,通过原核注... 目的利用HB9启动子构建小鼠脊髓运动神经元特异表达人类TAR DNA/RNA结合蛋白43(hTDP-43)突变转基因小鼠,建立肌萎缩侧索硬化症(ALS)疾病模型,探究hTDP-43突变导致ALS发生的机制。方法体外构建HB9启动子连接突变hTDP-43载体,通过原核注射制备并筛选阳性转基因小鼠品系(Q331K位点和M337V位点突变各8~10只)。通过步态分析、转棒疲劳仪实验和悬挂实验检测小鼠运动能力;通过免疫组织化学法、免疫荧光染色和Western blotting分别检测hTDP-43、磷酸化hTDP-43(p-hTDP-43),Caspase-3、剪切Caspase-3(cleaved Caspase-3)、泛素蛋白、β-微管蛋白Ⅲ(Tuj1)、Ki67和细胞周期依赖性激酶5(CDK5)蛋白的表达情况。结果脊髓运动神经元表达突变hTDP-43蛋白的转基因小鼠双后肢向躯干侧回缩,运动机能随月龄增加呈现进程性减退。转基因小鼠脊髓运动神经元可见hTDP-43,p-hTDP43,Caspase-3,cleaved Caspase-3阳性染色和泛素蛋白阳性包涵体,体外分离培养脊髓胸腰段运动神经元发现hTDP-43和泛素蛋白共定位于胆碱乙酰基转位酶(ChAT)阳性的运动神经元,并伴随CDK5异位表达。结论小鼠脊髓运动神经元表达突变的hTDP-43蛋白,可促使分化的成熟神经元重新进入细胞周期,导致ALS发生。 展开更多
关键词 TAR DNA/rna结合蛋白43 肌萎缩侧索硬化症 细胞周期依赖性激酶5 神经退行性疾病 脊髓运动神经元 免疫印迹法 小鼠
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Localization and function of a eukaryotic-initiation-factor-2-associated 67-kDa glycoprotein
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作者 Shiyong Wu,Edison Biotechnology Institute,Department of Chemistry and Biochemistry,Ohio University,Athens,OH 45701,United States 《World Journal of Biological Chemistry》 CAS 2010年第10期313-320,共8页
AIM: To study the localization and function of a eukaryotic initiation factor 2 (eIF2α)-associated 67-kDa glycoprotein (p67).METHODS: Immunofluorescence staining,35S-Met/Cys metabolic labeling,Western blotting analys... AIM: To study the localization and function of a eukaryotic initiation factor 2 (eIF2α)-associated 67-kDa glycoprotein (p67).METHODS: Immunofluorescence staining,35S-Met/Cys metabolic labeling,Western blotting analysis,sucrose gradient centrifugation and high speed centrifugation were used to determine the localization of proteins in transiently transfected COS-1 cells.Transient co-transfection followed by co-immunoprecipitation was used to study the interaction between p67 and double-stranded RNA (dsRNA)-dependent protein kinase (PKR).Wheat germ agglutinin agarose beads were used to absorb glycosylated proteins.In vivo 32P-labeling followed by immunoprecipitation and Western blotting were used to measure PKR autophosphorylation,eIF2α phosphorylation,and p67 expression in normal and breast cancer cells.RESULTS: The image from immunofluorescence staining showed that p67 was overexpressed in the cytosol but not in the nucleus.In a sucrose gradient,approxi-mately 30% of the overexpressed p67 was bound with ribosomes.p67 interacted with the kinase domain,butnot the dsRNA-binding domains of PKR.Only the glycosylated p67 was associated with the ribosome,and p67 did not compete with PKR for ribosome binding.In breast cancer cells,there was increased autophosphorylation of PKR but no phosphorylation of eIF2α,compared with normal breast cells.α The ratio of glycosylated/deglycosylated p67 was altered in breast cancer cells.CONCLUSION: Glycosylation of p67 is required for its ribosomal association and can potentially inhibit PKR via interaction with the kinase domain of PKR. 展开更多
关键词 EUKARYOTIC translation INITIATION factor 2 p67 double-stranded rna dependent protein kinase PHOSPHORYLATION Cancer
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胃腺癌组织RBMS1、AKAP12表达变化及其临床意义
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作者 房志学 叶凡 +2 位作者 周宇帆 周轲 李琢 《山东医药》 CAS 2023年第13期20-23,39,共5页
目的探讨胃腺癌组织RNA结合基序单链相互作用蛋白1(RBMS1)、A激酶锚定蛋白12(AKAP12)表达变化及其临床意义。方法选择胃腺癌患者102例,取手术切除的胃癌组织及其癌旁组织(距肿瘤组织边缘5 cm以上,经病理检查明确为正常胃组织),采用免疫... 目的探讨胃腺癌组织RNA结合基序单链相互作用蛋白1(RBMS1)、A激酶锚定蛋白12(AKAP12)表达变化及其临床意义。方法选择胃腺癌患者102例,取手术切除的胃癌组织及其癌旁组织(距肿瘤组织边缘5 cm以上,经病理检查明确为正常胃组织),采用免疫组化法检测RBMS1、AKAP12表达。比较胃癌组织与癌旁正常组织RBMS1、AKAP12阳性表达率,采用Pearson线性相关分析法分析胃癌组织RBMS1阳性表达与AKAP12阳性表达的关系。分析胃癌组织RBMS1、AKAP12阳性表达与临床病理特征的关系以及二者表达与预后的关系。结果胃癌组织RBMS1阳性表达率显著高于癌旁正常组织,AKAP12阳性表达率显著低于癌旁正常组织(χ^(2)分别为75.583、53.204,P均<0.05)。胃癌组织RBMS1阳性表达与AKAP12阳性表达呈负相关关系(r=-0.625,P<0.05)。胃癌组织RBMS1、AKAP12阳性表达与TNM分期、淋巴结转移有关(P均<0.05),与性别、年龄、肿瘤最大径、肿瘤部位、组织分化程度无关(P均>0.05)。所有患者术后随访2~36个月,中位随访时间25.30个月。随访期间失访1例,死亡30例,3年总体生存率为70.30%(71/101)。胃癌组织RBMS1阳性表达者与阴性表达者3年总体生存率分别为66.20%(47/71)、80.00%(24/30),胃癌组织AKAP12阳性表达者与阴性表达者3年总体生存率分别为82.14%(23/28)、65.75%(48/73)。胃癌组织RBMS1阳性表达者3年总体生存率显著低于其阴性表达者(χ^(2)=4.310,P<0.05),胃癌组织AKAP12阳性表达者3年总体生存率显著高于其阴性表达者(χ^(2)=4.569,P<0.05)。结论胃腺癌组织RBMS1高表达、AKAP12低表达,二者表达变化与肿瘤TNM分期、淋巴结转移和患者预后密切相关。 展开更多
关键词 胃腺癌 rna结合基序单链相互作用蛋白1 A激酶锚定蛋白12 临床病理特征 预后
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HH胶囊体外抗乙型肝炎病毒的作用及其机制 被引量:9
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作者 张传涛 廖志航 +3 位作者 吴疆 范昕建 孟宪丽 陈东辉 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2010年第7期652-656,共5页
目的:研究HH胶囊体外抗乙型肝炎病毒的作用及其对抗病毒蛋白2'5'-寡腺苷酸合成酶(2'5'-Oligoadenylate Synthetase,2'5'-OAS)、RAN依赖蛋白激酶(RAN-dependent protein kinase,PKR)的影响.方法:HepG2.2.15是目... 目的:研究HH胶囊体外抗乙型肝炎病毒的作用及其对抗病毒蛋白2'5'-寡腺苷酸合成酶(2'5'-Oligoadenylate Synthetase,2'5'-OAS)、RAN依赖蛋白激酶(RAN-dependent protein kinase,PKR)的影响.方法:HepG2.2.15是目前最常用的乙型肝炎病毒感染的体外实验模型,将细胞随机分为空白对照组、阳性对照组(3TC)、不同浓度的HH胶囊组.用CCK-8检测药物细胞毒性,酶联免疫法检测乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)和乙型肝炎病毒e抗原(HBeAg);荧光定量聚合酶链反应法检测乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸(HBVDNA);用Westernblot、荧光定量PCR方法分别检测细胞内抗病毒蛋白2'5'-OAS、PKR及其mRNA水平.结果:HH胶囊的TC50是2.11g/L、312.00mg/L、156.00mg/L、78.00mg/L、39.00mg/LHH胶囊均可以降低细胞外HBeAg(0.285±0.007,0.462±0.008,0.565±0.009,0.733±0.008vs1.334±0.007)和HbsAg(0.834±0.008,1.021±0.011,1.347±0.017,1.548±0.015vs2.593±0.008)水平,312.00mg/L、156.00mg/LHH胶囊均可以减低细胞内乙型肝炎病毒DNA[(3.423±0.110)×109copies/L,(3.640±0.082)×109copies/Lvs(6.857±0.060)×109copies/L]、细胞外乙型肝炎病毒DNA(6547±87、7710±62vs24300±200),312.00mg/LHH胶囊可以增加细胞内OASmRNA(0.885±0.038vs0.688±0.068)、PKRmRNA(0.139±0.06vs0.058±0.005)表达及其OAS、PKR蛋白水平.结论:HH胶囊具有良好的抗乙型肝炎病毒作用,推测可能与增加细胞内OAS、PKR及其mRNA水平有关. 展开更多
关键词 HH胶囊 乙型肝炎病毒 寡腺苷酸合成酶 RAN依赖蛋白激酶
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