蛋白质家族模体(motif)的评价策略

模体是刻画蛋白质家族组成结构和执行功能的重要部分 ,但是对于通过各种生物信息学方法识别出的模体 ,目前没有很好的办法辨别真假和优劣。文中提出一种新的模体评价策略 ,从分类器的观点出发 ,对不同方法在同一个蛋白质家族上建立的不同模体进行比较 ,从而推断出最具有生物意义的模体。本文在PROSITE数据库中选取 7个细胞因子家族 ,采用MEME和HMMER两种模体识别方法分别识别每个家族的模体 ,将每个模体看作一个分类器 ,通过计算同一家族的每个模体的敏感性和特异性并比较它们对应的接收机操作特性曲线 ,进而比较不同模体 ,确定真的模体和排除假的模体 ,从而获得每个蛋白质家族的最佳模体的模型。这种策略可以应用于对任意蛋白质家族模体识别结果的评价。此外 ,还可以利用最佳模体搜索数据库的结果预测每个家族的新成员。

基于DRAGON程序的多种中子输运计算方法对比分析

为了对比分析多种三维全堆芯pin-by-pin中子输运计算方法的计算能力,尤其是研究评估特征线法(MOC)求解强非均匀性大规模问题的能力,基于DRAGON4.07程序,以C5G7组件、堆芯基准题为算例,比较分析了MOC方法(步特征线法MOC-SC和菱形差分特征线法MOC-DD)、碰撞概率法(CP)、界面流法(IC)的计算效率、计算精度、计算存贮及计算规模。分析结果表明:对于C5G7-UO2组件问题,MOC-SC的计算精度与CP方法相当,优于MOC-DD和IC方法,计算时间约为CP方法的2倍,内存占用量远小于CP方法;对于二维C5G7堆芯问题,MOC方法的计算精度、计算效率及内存占用量均优于CP和IC方法;而用MOC方法实现大规模三维问题的pin-by-pin计算时,还依赖于并行加速手段,尤其是计算存贮问题的突破。

近62 a华南“龙舟水”气候特征及变化

每年端午节前后龙舟竞渡之时,是华南前汛期降水最多、最为集中的时段,容易引发严重洪涝灾害,并对早稻生产造成严重影响,称之为“龙舟水”。对华南“龙舟水”期间暴雨过程的频次和强度进行研究是当前防灾减灾的迫切需求。利用1961—2022年华南192个国家气象观测站逐日降水资料,采用EOF、线性趋势、M-K突变等方法,分析了华南“龙舟水”期间降水量的时空特征及变化;构建了一个表征华南“龙舟水”暴雨过程的综合强度指数,由此分析华南近62 a“龙舟水”期间暴雨过程频次、强度以及“龙舟水”强度年景指数的特征和变化。结果表明,华南“龙舟水”一致性变化是其最主要的特点。1961—2022年“龙舟水”期间,华南共出现229次暴雨过程,平均每年3.7次。近62 a来华南区域平均“龙舟水”降水量和暴雨过程频次变化趋势不显著,但“龙舟水”强度年景指数以1.2·(10 a)^(-1)的速率显著上升。评估得到近62 a华南“龙舟水”最强暴雨过程出现在2022年6月4—21日,华南“龙舟水”强年有4 a,分别出现在2022年、2020年、2008年和2006年。

同源异型盒基因A5、三结构域蛋白14与结直肠癌的关系

目的探讨结直肠癌组织同源异型盒基因A5(HOXA5)、三结构域蛋白14(TRIM14)蛋白表达水平与临床病理特征及患者预后的关系。方法回顾性收集整理2016年5月至2018年5月期间于河南中医药大学郑州人民医院确诊的120例结直肠癌患者癌组织及癌旁组织标本及相关临床资料,采用免疫组化法检测组织HOXA5、TRIM14蛋白表达水平;分析HOXA5、TRIM14水平与结直肠癌患者临床病理特征及预后的关系;采用Kaplan-Meier法分析组织中HOXA5、TRIM14表达与结直肠癌5年生存率的关系;采用Cox比例风险回归模型分析结直肠癌5年预后影响因素。结果结直肠癌组织中TRIM14蛋白阳性率为73.33%,明显高于癌旁组织的10.00%,HOXA5蛋白阳性率为27.50%,明显低于癌旁组织的81.67%,差异均有统计学意义(P<0.05)。TRIM1蛋白阳性表达患者肿瘤低分化比例为42.05%,浸润深度T_(3)~T_(4)比例为72.73%,有淋巴结转移比例为47.73%,有远处转移比例为29.55%,明显高于TRIM1蛋白阴性表达的12.50%、37.50%、12.50%、6.25%,差异均有统计学意义(P<0.05);HOXA5蛋白阴性表达患者肿瘤低分化比例为41.38%,浸润深度T3~T4比例为77.01%,有淋巴结转移比例为48.28%,有远处转移比例为29.89%,明显高于HOXA5蛋白阳性表达的15.15%、27.27%、12.12%、6.06%,差异均有统计学意义(P<0.05)。结直肠癌组织中HOXA5阴性表达和TRIM14阳性表达患者的5年生存率分别为57.47%、59.09%,明显低于HOXA5阳性表达患者的90.91%和TRIM14阴性表达患者的87.50%,差异均有统计学意义(P<0.05)。死亡组患者有淋巴结转移比例为85.00%,有远处转移比例为55.00%,明显高于生存组的15.00%、7.50%,差异均有统计学意义(P<0.05)。经Cox比例风险回归模型分析结果显示,TRIM14是结直肠癌患者5年内死亡的独立危险因素,HOXA5是结直肠癌患者5年内死亡的保护因素(P<0.05)。结论结直肠癌组织中TRIM14呈高表达状态,HOXA5呈低表达状态,两者均与TNM分期、肿瘤分化程度、浸润深度等临床病理特征及预后相关,有作为预后标志物及治疗靶点的潜力。

基于模体和复杂网络的成都市交通旅客出行研究

设计出行模体模型,对旅客出行序列进行抽取转化,构建基于铁路和航空出行旅客的出行模体,基于四川省成都市的旅客出行数据进行实证分析。2节点至4节点构成的旅客出行模体,可以表示绝大多数的旅客出行模式。主要出行模体为2个节点间的单向单次出行和往返出行,并且随时间推移,铁路出行对用户的吸引力逐渐增加,航空出行逐渐减少。研究铁路旅客出行网络和航空旅客出行网络特征,2种出行网络均为异质性网络,网络中大度节点倾向于连接小度节点,网络聚类系数较大,网络中不同站点连接紧密。成都市的铁路人群出行网络结构稳定且大多集中于我国东南部地区,航空出行网络逐步发展且具有更高的分散性。网络效率研究结果表明,旅客出行网络连通性一般,多集中在特定地区。

火龙果主要生物活性成分及其功能特性研究进展

火龙果是一种热带水果,广泛种植在世界各地的热带或亚热带地区。大量研究表明,火龙果中含有丰富的营养成分以及多糖、多酚、甜菜素等生物活性物质,具有抗氧化、抗炎、降脂等功能特性。本文综述了近年来火龙果营养物质及其功能特性的研究进展,并对未来火龙果生物活性物质开发的研究方向进行了详细讨论,以期为火龙果的进一步研究提供参考依据。

论香港地区龙狮运动发展的基本特征——以1997年回归为纪元

龙狮运动是香港地区社会喜闻乐见的传统民俗文化之一,在香港地区具有良好的发展基础和传播优势.1997年香港回归后,在香港特区政府、社会各界的共同努力下,龙狮运动得到了长足发展,并逐步形成了5个特征,分别是:政府社会双轮驱动、学校推广潜力巨大、非遗传承成为显学、创新发展与时俱进、两地交流青少担纲.

宋金时期磁州窑白地黑花瓷缠枝牡丹纹研究

宋金时期磁州窑瓷器装饰以白地黑花装饰最为突出,其创造性地将中国绘画技法以图案装饰形式在瓷器上进行绘制,装饰纹样常有花卉植物纹样等,其中缠枝牡丹纹出现最为频繁。笔者采用资料搜集及对比分析等研究方法,对宋金时期磁州窑白地黑花瓷中缠枝牡丹纹发展脉络进行梳理,归纳分析白地黑花装饰中缠枝牡丹纹的构成组织方式及艺术表现形式,探索其文化底蕴与美学特征,从而发掘其在历史长河中的艺术价值。

口腔鳞状细胞癌组织TRIM14和HOXB7蛋白表达与患者临床病理特征及预后的关系

目的 探讨三结构域蛋白14(TRIM14)、同源异型盒基因B7(HOXB7)蛋白在口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者癌组织中的表达水平与患者临床病理特征及预后的关系。方法 收集2016年1月至2018年1月行手术治疗的OSCC患者148例的癌组织与癌旁正常组织,免疫组化法分析组织中TRIM14、HOXB7表达情况;Kaplan-Meier生存曲线分析OSCC患者癌组织TRIM14、HOXB7表达水平与生存率之间的关系;COX回归分析OSCC患者预后不良的影响因素。结果 OSCC癌组织TRIM14、HOXB7高表达率均高于癌旁正常组织(P<0.05)。OSCC癌组织TRIM14、HOXB7表达与肿瘤T分期、M分期、淋巴结转移、周围组织浸润、分化程度相关(P<0.05)。OSCC患者5年生存率为49.32%(73/148),Kaplan-Meier生存曲线表明TRIM14、HOXB7高表达患者生存率低于TRIM14、HOXB7低表达患者(χ^(2)=14.480、24.841,P<0.001)。多因素COX分析结果显示,T3-T4分期、M1分期、淋巴结转移、周围组织浸润、癌组织TRIM14、HOXB7高表达均是OSCC患者预后不良的危险因素(P<0.05)。结论 OSCC患者癌组织TRIM14与HOXB7蛋白表达水平均上调,其表达与患者临床病理特征和5年生存预后明显相关。

基于C5G7-MOX的中子输运计算方法比较及MOC参数敏感性初步分析

特征线方法(Method of Characteristics,MOC)因其具备强大的几何处理能力,且在计算过程中亦能兼顾计算成本和计算精度,被广泛应用于高保真数值模拟计算中。常见的中子输运计算方法除MOC外,还包括碰撞概率法(Collision Probability method,CP)和界面流法(Interface Current method,IC)等。本文从方法理论以及数值计算两方面将MOC、CP和IC进行比较分析,评估其在pin-by-pin计算中的能力。同时在MOC计算中,不同的参数选择会对计算成本和计算精度产生影响,因此有必要进行敏感性分析以寻求最佳参数。本文首先将三种计算方法从原理上进行比较分析,再基于2D C5G7-MOX基准题完成了数值计算及MOC参数敏感性初步分析。计算结果表明:MOC在计算精度、计算效率和内存开销上均优于CP和IC。MOC的计算耗时和内存开销分别为23.9 min和37.5 MB,与参考解的相对误差仅为6.04×10^(-4)。而CP和IC的计算耗时分别为MOC的56.7倍和15.6倍,内存开销分别为MOC的407.7倍和32.8倍。进一步通过参数敏感性分析发现:网格划分对计算内存开销以及计算时间的影响最大,而极角的选择对计算精度的影响最大,并且给出一组综合优化建议参数:网格划分6×6,极角为GAUS且数目为2,方位角个数为30。该组参数的计算耗时为45.4 min,内存开销为264.7 MB,相对误差为5.9×10^(-5),归一化后的栅元均方根误差为0.002 55。

火龙果粉冷冻-真空微波干燥工艺优化及贮藏品质

为优化火龙果粉的冷冻干燥结合真空微波干燥工艺并研究其贮藏品质,以火龙果为原料,以复水比和维生素C保留率加权转化的综合评分为指标,通过单因素和响应面试验优化火龙果粉的工艺条件并分析其贮藏品质。结果表明,优化后的工艺条件为采用冷冻干燥将火龙果干燥到水分含量35%后,再采用真空度40 Pa、微波功率1 500 W的真空微波干燥继续将其干燥至水分含量3.5%。该条件下,产品实际综合评分为85.17,与理论预测值基本吻合。联合干燥技术的产品在25℃、相对湿度65%的条件下贮藏30 d时,火龙果粉中的VC保留率为(83.36±0.65)%,感官评分65.6,VC的保留率和感官评分均较高,具有较好的贮藏品质。

明清陶瓷龙缸设计数理解析

龙缸是明清时期景德镇御窑厂生产的重要器物,本文通过比对明清龙缸的集中生产时段、体量尺寸、装饰技艺及装饰题材的数字特征,运用定量分析与定性分析相结合的方法,厘清明清龙缸生产的社会、技术、文化、艺术发展状况。本文通过分析得出龙缸由庄严肃穆的礼器逐渐转变为贴近生活的陈设器,并对其功能转变的社会历史根源进行解析。

斗门“龙舟水”时空特征及与天文潮的相关分析

利用斗门区1967—2022年“龙舟水”降水资料,通过M-K检验、Morlet小波分析、克里格网格化等统计方法分析“龙舟水”的时空分布特征,并对其与天文潮的相关性进行了讨论,结果表明:(1)近56年斗门区“龙舟水”的变化趋势不明显,呈轻微减少的态势;但出现异常偏多年份的概率相对偏高,占比达16.1%。(2)近56年斗门区“龙舟水”的时间变化具有显著的年际和年代际变化特征,并具有1~5年的变化周期。(3)M-K检验和滑动t检验表明斗门“龙舟水”降水量在1967—2022年间并未发生突变。(4)在空间分布上,受山脉地形影响,雨量大值区主要集中在斗门区的西部至南部及东北部地区,呈西南-东北走向,与境内山脉地形走向基本一致。(5)“龙舟水”峰值年的出现时间与天文潮朔、望日时间高度重叠,其中望日对“龙舟水”降水的影响更大,相关系数达66.7%。

高职院校舞龙舞狮运动特色课程的建设与开发

该研究以中华优秀传统文化的传承为背景,通过实证研究法,探索舞龙舞狮运动特色课程的建设与开发在高职院校体育教学改革中的应用和意义。研究发现,舞龙舞狮运动不仅具有丰富的文化内涵,还能有效提升高职院校学生的体质和团队协作能力。多所高职院校的实践活动证明,融入舞龙舞狮等传统运动元素的体育课程备受学生喜爱和追捧。这些发现为高职体育教育改革提供了新视角和方法,体现了高职体育教学传承和发展传统文化的重要性,同时能够助力传统文化的发扬和传承。

火龙果镰刀菌果腐病病原菌鉴定及生物学特性研究

采用形态学特征观察、rDNA-ITS序列、EF-1α序列比对和系统发育树分析的方法对引起火龙果镰刀菌果腐病病原菌进行鉴定,并初步研究其生物学特性。结果表明：引起火龙果镰刀菌果腐病是单隔镰刀菌（Fusarium dimerum Penzig in Saccardo）,这是该菌引起火龙果果腐病在国内的首次报道。该菌菌丝生长的适宜温度25~35℃,最适温度30℃,适宜产孢温度25~35℃,最适产孢温度30~35℃,致死温度75℃（10 min）;适宜pH5~9,最适pH7,最适产孢pH4;连续光照、D-果糖为碳源、牛肉膏和蛋白胨为氮源时最有利于该菌菌丝生长;完全黑暗、D-半乳糖为碳源、尿素为氮源时最有利于该菌产孢。综合分析认为,该菌耐高温,光照充足、弱酸和富含有机营养的环境有利于该菌的生长和繁殖。

清代龙袍上龙纹眉眼的演变和辨识

龙纹是龙袍上最受关注的纹样,清代龙袍上的龙纹特征明显,容易识别,而且其细节的演变过程呈现一定的规律性。这里分析了清代各个时期龙袍上龙纹眉眼的时代特征,以作为龙袍和龙纹断代的一个指标。

火龙果黑斑病菌[Bipolariscactivora(Petrak)Alcorn]生物学特性研究

为了明确分离自火龙果黑斑病的病原种类、生物学特性及防治方法 ,对该病菌进行了种类鉴定、生物学特性研究以及室内药剂筛选。结果表明,引起该火龙果病害的病原菌为仙人掌平脐蠕孢[Bipolaris cactivora(Petrak)Alcorn]。该病菌菌丝生长最适温度是30℃,产孢最适温度20℃。菌丝生长最适pH为5,产孢最适pH8。光照对菌丝生长无显著影响,黑暗条件有利于产孢。菌丝生长最佳碳源是葡萄糖和D-果糖,产孢最佳碳源为甘露醇。菌丝生长和产孢的最佳氮源均为蛋白胨,菌丝致死温度为70℃,10 min。丙环唑对病菌的毒性最强,其次是咪鲜胺、腈菌唑、苯醚甲环唑和异菌脲。该病菌有很强的环境适应性,应采用有效药剂进行针对性防治。

非物质文化遗产保护视野下“人龙舞”的文化传承研究

运用文献资料法、专家访谈法以及田野调查法,对国家级非物质文化遗产"人龙舞"的起源、社会文化特征以及传承途径进行了研究,结果表明:"人龙舞"具有鲜明的民俗体育文化特征,同时具有中原文化、海洋文化、民俗文化和武术文化的特征;其传承方式可分为横向和纵向传承,主要包括群体传承、社会传承和学校传承等;新形势下,民俗体育旅游开发为"人龙舞"文化传承提供了新的思路。

舞龙运动训练强度、供能与项目特点关系的评定研究

采用生化实验、录像解析、文献资料、数理统计等方法,对湖南师大等8所高校的80名舞龙运动员自选套路训练中运动强度、供能及其项目特点进行评定。结果认为:舞龙训练运动强度、供能项目特征性强;舞龙运动的训练手段与方法应采用与比赛相似的、适应舞龙项目特征的专项训练。在此基础上对舞龙运动的科学研究进行了展望。

北京奥运龙形水系水质特征分析与评价

根据2012年对北京市奥林匹克公园龙形水系水质逐月监测结果,采用综合营养状态指数法(TLI)和水质综合标识指数法(WQI)分别对该水系水体富营养化现状和水质级别进行评价。结果表明:龙形水系水质偏碱性,水中溶解氧常年处于过饱和状态,化学耗氧量(COD Mn)、生化需氧量(BOD5)、悬浮物、叶绿素a、总氮和总磷等水质指标随时间变化较大,水体中总磷一直维持在较低水平,是龙形水系水体富营养化的限制因子;水系水体营养状态从春季到秋季由轻富营养到中营养转变,其水质级别基本上都在Ⅲ类水质标准以上,达到了水环境功能目标要求;沉水植物种植水域水质优于非沉水植物种植水域;水系河道设计也能影响水系的水质。本研究结果可为北京市奥林匹克公园龙形水系水环境保护提供科学依据。