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Detection of Hepatitis B Virus DNA by Duplex Scorpion Primer-based PCR Assay 被引量:1
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作者 孔德明 沈含熙 宓怀风 《Chinese Journal of Chemistry》 SCIE CAS CSCD 2004年第9期903-907,共5页
The application of a new fluorogenic probe-based PCR assay (PCR duplex scorpion primer assay) to the detection of Hepatitis B virus (HBV) DNA in human sera was described. Duplex scorpion primer is a modified variant o... The application of a new fluorogenic probe-based PCR assay (PCR duplex scorpion primer assay) to the detection of Hepatitis B virus (HBV) DNA in human sera was described. Duplex scorpion primer is a modified variant of duplex Amplifluor, and the incorporation of a PCR stopper between probe and primer sequences improve the detection specificity and sensitivity. Combined with PCR amplification, this probe can give unambiguous positive results for the reactions initiated with more than 20 HBV molecules. In addition, the particular unimolecular probing mechanism of this probe makes the use of short target-specific probe sequence possible, which will render this probe applicable in some specific systems. 展开更多
关键词 duplex scorpion primer hepatitis B virus (HBV) DNA fluorogenic probe
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复合式蝎形引物实时定量检测端粒酶延伸产物 被引量:7
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作者 黄艳萍 孔德明 +2 位作者 张晓滨 沈含熙 宓怀风 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第3期274-278,共5页
针对端粒酶延伸产物中靶基因序列的特殊性 ,开发了一种可产生荧光的复合式蝎形引物 ,该引物的 5′端带有可特异性检测靶基因的探针序列 ,PCR阻断剂将其与引物序列连接 .当复合式蝎形引物延伸 ,探针序列与同一分子内的靶基因杂交 ,荧光... 针对端粒酶延伸产物中靶基因序列的特殊性 ,开发了一种可产生荧光的复合式蝎形引物 ,该引物的 5′端带有可特异性检测靶基因的探针序列 ,PCR阻断剂将其与引物序列连接 .当复合式蝎形引物延伸 ,探针序列与同一分子内的靶基因杂交 ,荧光信号产生 .运用该技术 ,建立了定量检测端粒酶延伸产物的实时荧光PCR方法 .该法可在快速PCR循环条件下 ,对 0 .15~ 1.5 0× 10 3 amol/ μL范围内的样品进行定量检测 ,线性相关系数R2 =0 .9992 .该法操作简便 。 展开更多
关键词 复合式蝎形引物 实时检测 定量检测 端粒酶 延伸产物 荧光定量PCR技术 恶性肿瘤 诊断
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一种快速检测HBV基因的荧光定量PCR法的建立 被引量:5
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作者 赵清 许颂霄 +3 位作者 袁军 罗进勇 单幼兰 尹一兵 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期244-246,共3页
目的利用二聚体蝎型荧光探针技术,建立一种能用于临床的快捷、敏感、特异、价格低廉的HBV实时荧光定量PCR检测方法。方法根据HBV基因组保守区域precore/core设计二聚体蝎型荧光探针和引物,构建质粒标准品,优化荧光定量PCR条件,并进行方... 目的利用二聚体蝎型荧光探针技术,建立一种能用于临床的快捷、敏感、特异、价格低廉的HBV实时荧光定量PCR检测方法。方法根据HBV基因组保守区域precore/core设计二聚体蝎型荧光探针和引物,构建质粒标准品,优化荧光定量PCR条件,并进行方法学评价。结果所建方法的检测范围为101~108copies/μl,灵敏度达到10copies/μl,低拷贝样品的批内和日间重复性(CV)分别为1.71%和2.57%,高拷贝样品的批内和日间CV分别为3.00%和3.86%。与商品化TaqMan试剂盒相比,本法阳性检出率较高,且检测时间缩短了45min(约减少1/3),成本降低50%。结论成功建立了快速检测HBVDNA的二聚体蝎型荧光定量PCR方法,为研发适合临床应用的HBV基因定量检测试剂盒奠定了基础。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 二聚体蝎型荧光探针 荧光定量PCR
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二聚体蝎型探针荧光定量PCR快速检测临床标本结核分枝杆菌DNA 被引量:2
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作者 王虹 钟敏 +2 位作者 舒朝忠 陈淑惠 尹一兵 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期661-663,666,共4页
目的比较二聚体蝎型探针荧光定量PCR与抗酸染色、L-J培养法、结核分枝杆菌直接试验(MTD)的检出率、检测时间等,探讨二聚体蝎型探针荧光定量PCR检测临床标本中结核分枝杆菌DNA(TB-DNA)的实际应用价值。方法以建立的结核二聚体蝎型探针荧... 目的比较二聚体蝎型探针荧光定量PCR与抗酸染色、L-J培养法、结核分枝杆菌直接试验(MTD)的检出率、检测时间等,探讨二聚体蝎型探针荧光定量PCR检测临床标本中结核分枝杆菌DNA(TB-DNA)的实际应用价值。方法以建立的结核二聚体蝎型探针荧光定量PCR方法为基础,对43例结核确诊患者的标本及11例非肺结核患者的痰标本进行检测,并与抗酸染色、L-J培养法、结核分枝杆菌直接试验(MTD)进行比较。结果二聚体蝎型探针荧光定量PCR能快速准确的检测临床标本中的TB-DNA。其标准品浓度在102~106copies/μl时,方法能够保持良好的线性关系(相关系数为0.9994),阳性检出率(100%)显著高于抗酸染色法(16.28%)和培养法(37.21%)的检出率,与MTD试验的检出率(100%)一致。MTD试验检测时间约4~5h,而二聚体蝎型探针FQ-PCR检测约需80min即可得到检测结果,检测费用仅为MTD的1/4。结论二聚体蝎型探针荧光定量PCR用于临床标本结核分枝杆菌DNA的检测具有快速价廉、敏感特异的特点,该方法作为定量检测结核分枝杆菌的分子诊断新途径值得临床推广应用。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 荧光定量PCR 二聚体蝎型探针
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荧光定量PCR检测梅毒螺旋体方法的建立及初步应用 被引量:3
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作者 赵丹 杨小猛 +2 位作者 陈倩瑜 欧彩兰 林凌云 《检验医学与临床》 CAS 2015年第3期324-326,共3页
目的:采用二聚体蝎型探针技术建立一种高敏感性和特异性的检测梅毒螺旋体(T P )的荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法。方法根据T P特异性外膜蛋白Gpd的基因序列设计引物和荧光探针,采用基因工程技术构建可用于T P定量的标准品,优化... 目的:采用二聚体蝎型探针技术建立一种高敏感性和特异性的检测梅毒螺旋体(T P )的荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法。方法根据T P特异性外膜蛋白Gpd的基因序列设计引物和荧光探针,采用基因工程技术构建可用于T P定量的标准品,优化荧光定量PCR的反应体系和反应条件,建立检测T P的二聚体蝎型探针定量PCR。采用本研究建立方法和商品化荧光定量PCR试剂盒检测40例临床标本,对比分析检测结果的统计学差异。结果成功构建了T P重组质粒标准品和T P的二聚体蝎型探针定量PCR ,该方法线性范围为101~108 copy/mL ,灵敏度为10 co py/m L ,特异性和敏感性均为100.0%;二聚体蝎型探针定量PC R对疑似梅毒病例阳性检出率显著高于目前商品化Taqman荧光定量PCR试剂盒(82.5% vs 62.5%,P<0.05)。结论成功建立了二聚体蝎型探针荧光定量PCR快速检测T P的方法,为临床上T P的早期诊断和防控奠定了基础。 展开更多
关键词 二聚体蝎型探针 荧光定量聚合酶链反应 梅毒螺旋体
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