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Relationship between apurinic endonuclease 1 Asp148Glu polymorphism and gastrointestinal cancer risk: An updated meta-analysis 被引量:1
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作者 Zhi-Jun Dai Yong-Ping Shao +7 位作者 Hua-Feng Kang Wei Tang Dan Xu Yang Zhao Di Liu Meng Wang Peng-Tao Yang Xi-Jing Wang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2015年第16期5081-5089,共9页
AIM:To evaluate the relationship between apurinic endonuclease 1(APE1) Asp148 Glu polymorphism and the susceptibility to gastrointestinal(GI) cancers.METHODS:We searched Pub Med, ISI Web of Knowledge, and Chinese Nati... AIM:To evaluate the relationship between apurinic endonuclease 1(APE1) Asp148 Glu polymorphism and the susceptibility to gastrointestinal(GI) cancers.METHODS:We searched Pub Med, ISI Web of Knowledge, and Chinese National Knowledge Infrastructure(CNKI) databases updated on July 15, 2014 for relevant studies.Only case-control studies comparing APE1 Asp148 Glu polymorphism and GI cancer risk were included.We excluded studies reporting only standardized incidence ratios without control groups and those without detailed genotyping data.Meta-analysis was performed on 17 studies involving 4856 cancer patients and 6136 cancer-free controls.Review Manager version 5.1 was used to perform the meta-analysis.The pooled odds ratios(ORs) and 95% confidence intervals(CIs) were estimated under the allele contrast, homozygous, heterozygous, dominant and recessive genetic models.We also conducted subgroup analyses stratified by ethnicity and cancer type.Publication bias was evaluated using Begg's test.RESULTS:The meta-analysis showed a significant association between APE1 Asp148Glu polymorphism and GI cancer risk in three genetic models in the overall population(G vs T:OR=1.18;95%CI:1.05-1.32;TG vs TT:OR=1.28;95%CI:1.08-1.52;TG+GG vs TT:OR=1.32;95%CI:1.10-1.57).Stratified analysis by ethnicity revealed a statistically increased GI cancer risk in Asians(G vs T:OR=1.27;95%CI:1.07-1.51;GG vs TT:OR=1.58;95%CI:1.05-2.38;TG vs TT:OR=1.30;95%CI,1.01-1.67;and TG+GG vs TT:OR=1.38;95%CI:1.07-1.78),but not in Caucasians.Furthersubgroup analysis by cancer type indicated that APE1Asp148Glu polymorphism may contribute to gastric cancer risk.However,Asp148Glu has no significant association with colorectal or esophageal cancer risk in any genetic model.CONCLUSION:This meta-analysis suggests that the APE1 Asp148Glu polymorphism G allele is associated with an increased GI cancer risk,especially in gastric cancer. 展开更多
关键词 Apurinic endonuclease 1 Single nucleotidepolymorphism GASTROINTESTINAL CANCERS Cancer risk META-ANALYSIS
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Differential expression of hepatic apurinic/apyrimidinic endonuclease 1,a DNA repair enzyme,in chronic hepatitis 被引量:1
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作者 Shinichi Sumiyoshi Yoshimasa Kobayashi +2 位作者 Kinya Kawamura Kazuhito Kawata Hirotoshi Nakamura 《World Journal of Hepatology》 CAS 2013年第4期206-213,共8页
AIM:To determine hepatic expression of apurinic/apyrimidinic endonuclease 1(APE-1)and 8-hydroxydeoxyguanosine(8-OHdG)in patients with chronic hepatitis B and C.METHODS:Liver biopsies were obtained from 27 patients wit... AIM:To determine hepatic expression of apurinic/apyrimidinic endonuclease 1(APE-1)and 8-hydroxydeoxyguanosine(8-OHdG)in patients with chronic hepatitis B and C.METHODS:Liver biopsies were obtained from 27 patients with chronic hepatitis B virus(HBV),30 with chronic hepatitis C virus(HCV),6 with autoimmune hepatitis(AIH),and 6 with primary biliary cirrhosis(PBC).Normal liver tissue was obtained from surgical resection specimens of four patients.Hepatic APE-1 protein and mRNA expression were assayed by Western blot and by real-time polymerase chain reaction,respectively.Hepatocellular APE-1 and 8-OHdG expression were determined by immunohistochemistry.RESULTS:The staining intensity of hepatocellular nuclear APE-1 was lower in the HBV group than in the other groups(P < 0.05).Hepatic APE-1 protein levels were reduced in the HBV group relative to the other groups.Hepatic APE-1 mRNA levels were also lower in the HBV group.The proportion of hepatocytes with 8-OHdG-positive nuclei was increased in the HCV,AIH and PBC groups(P < 0.05),but not in the HBV group.Hepatocellular nuclear APE-1 levels were positively correlated with hepatocellular 8-OHdG levels in both the HBV and HCV groups(HBV,r = 0.34,P < 0.05;HCV,r = 0.54,P < 0.01).CONCLUSION:An imbalance between oxidative DNA damage and APE-1 expression may contribute to hepatocarcinogenesis in chronic viral hepatitis. 展开更多
关键词 Apurinic/apyrimidinic endonuclease 1 8-hydroxydeoxyguanosine OXIDATIVE STRESS VIRAL HEPATITIS
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血清脱嘌呤脱嘧啶核酸内切酶1自身抗体、生长分化因子15水平对结直肠癌患者术后复发转移的预测价值
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作者 沈磊 刘志宁 +1 位作者 杨金珠 宋琪 《实用临床医药杂志》 CAS 2024年第12期72-76,共5页
目的分析血清脱嘌呤脱嘧啶核酸内切酶1自身抗体(APE1-AAbs)、生长分化因子15(GDF-15)水平及对结直肠癌患者术后复发转移的预测价值。方法选取52例结直肠癌患者为观察组,并根据预后情况分为术后复发转移组(n=15)和术后未复发转移组(n=37... 目的分析血清脱嘌呤脱嘧啶核酸内切酶1自身抗体(APE1-AAbs)、生长分化因子15(GDF-15)水平及对结直肠癌患者术后复发转移的预测价值。方法选取52例结直肠癌患者为观察组,并根据预后情况分为术后复发转移组(n=15)和术后未复发转移组(n=37)。选取同期正常体检健康者52例为对照组。检测APE1-AAbs、GDF-15水平。采用Pearson相关性分析法分析APE1-AAbs、GDF-15与结直肠癌术后复发转移的相关性。绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析APE1-AAbs、GDF-15对结直肠癌术后复发转移的预测价值。结果观察组的APE1-AAbs、GDF-15水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。术后复发转移组的APE1-AAbs、GDF-15水平高于术后未复发转移组,差异有统计学意义(P<0.05)。APE1-AAbs、GDF-15水平与结直肠癌术后复发转移呈正相关(P<0.05)。APE1-AAbs、GDF-15联合预测结直肠癌术后复发转移的价值高于APE1-AAbs、GDF-15单独预测,差异有统计学意义(P<0.05)。结论APE1-AAbs、GDF-15在结直肠癌患者血清中呈高表达。APE1-AAbs、GDF-15或可作为结直肠癌术后复发转移的标志物。 展开更多
关键词 结直肠癌 脱嘌呤脱嘧啶核酸内切酶1自身抗体 生长分化因子15 术后复发转移
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减数分裂内切酶1高表达对肝细胞癌预后的影响
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作者 王可欣 陈椿 +6 位作者 贺梦雯 李乐 刘妍 王洪波 王春艳 赵景民 纪冬 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期643-650,共8页
目的探讨减数分裂内切酶1(EME1)的高表达对肝细胞癌(HCC)预后的临床意义。方法利用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库及高通量基因表达(GEO)数据库,对HCC肿瘤与非肿瘤组织差异表达基因进行筛选并进行生存分析。回顾性收集2010年1月-2014... 目的探讨减数分裂内切酶1(EME1)的高表达对肝细胞癌(HCC)预后的临床意义。方法利用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库及高通量基因表达(GEO)数据库,对HCC肿瘤与非肿瘤组织差异表达基因进行筛选并进行生存分析。回顾性收集2010年1月-2014年12月于解放军总医院第五医学中心行肝癌切除术的80例患者的病理组织样本,采用免疫组织化学法检测EME1的表达情况,进行生存分析,评估EME1对肝癌患者术后5年生存率的影响;采用基因富集分析预测EME1在HCC中的功能。结果TCGA数据库筛选出371例HCC癌组织及50例非肿瘤组织样本,分析显示EME1 mRNA在HCC癌组织中明显高表达。筛选GEO数据库中的107例样本(包括70例HCC癌组织,37例非肿瘤组织),癌组织的EME1 mRNA表达量明显高于非肿瘤组织(P<0.05)。生存分析显示EME1高表达组术后5年总体生存率明显低于低表达组(44.1%vs.53.0%,P<0.05)。免疫组化结果半定量分析显示,EME1高表达组的总体生存率明显低于低表达组(32.8%vs.45.0%,P<0.05),多因素COX分析显示,EME1高表达[风险比(HR)=2.234,95%CI 1.073~4.649,P=0.032]和中国肝癌分期(CNLC)高分期(HR=4.317,95%CI 1.799~10.359,P=0.001)是影响HCC患者术后5年生存率的独立危险因素。结论EME1在HCC组织中高表达,并与HCC患者的不良预后相关,可作为HCC治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 肝细胞癌 减数分裂内切酶1 免疫组化 生存分析
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Tea polyphenols increase X-ray repair cross-complementing protein 1 and apurinic/apyrimidinic endonuclease/redox factor-1 expression in the hippocampus of rats during cerebral ischemia/reperfusion injury
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作者 Zhi Wang Rongliang Xue +8 位作者 Xi Lei Jianrui Lv Gang Wu Wei Li Li Xue Xiaoming Lei Hongxia Zhao Hui Gao Xin Wei 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2012年第30期2355-2361,共7页
Recent studies have shown that tea polyphenols can cross the blood-brain barrier, inhibit apoptosis and play a neuroprotective role against cerebral ischemia. Furthermore, tea polyphenols can decrease DNA damage cause... Recent studies have shown that tea polyphenols can cross the blood-brain barrier, inhibit apoptosis and play a neuroprotective role against cerebral ischemia. Furthermore, tea polyphenols can decrease DNA damage caused by free radicals. We hypothesized that tea polyphenols repair DNA damage and inhibit neuronal apoptosis during global cerebral ischemia/reperfusion. To test this hypothesis, we employed a rat model of global cerebral ischemia/reperfusion. We demonstrated that intraperitoneal injection of tea polyphenols immediately after reperfusion significantly reduced apoptosis in the hippocampal CA1 region; this effect started 6 hours following reperfusion. Immunohistochemical staining showed that tea polyphenols could reverse the ischemia/reperfusion-induced reduction in the expression of DNA repair proteins, X-ray repair cross-complementing protein 1 and apudnic/apyrimidinic endonuclease/redox factor-1 starting at 2 hours. Both effects lasted at least 72 hours. These experimental findings suggest that tea polyphenols promote DNA damage repair and protect against apoptosis in the brain. 展开更多
关键词 global cerebral ischemia/reperfusion X-ray repair cross-complementing protein 1 apurinic/apyrimidinic endonuclease/redox factor-I tea polyphenols
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沉默减数分裂内切酶1(EME1)抑制肝癌细胞增殖的机制
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作者 陈椿 王可欣 +4 位作者 贺梦雯 李乐 王春艳 刘妍 纪冬 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第5期982-988,共7页
目的探讨减数分裂内切酶1(EME1)在肝癌组织中的表达及其对肝癌细胞生物学行为的影响。方法筛选TCGA数据库肝癌样本中的差异表达基因。采用免疫组化和Western Blot分析EME1在肝癌组织中的表达丰度。通过短发夹RNA(shRNA)构建慢病毒并感染... 目的探讨减数分裂内切酶1(EME1)在肝癌组织中的表达及其对肝癌细胞生物学行为的影响。方法筛选TCGA数据库肝癌样本中的差异表达基因。采用免疫组化和Western Blot分析EME1在肝癌组织中的表达丰度。通过短发夹RNA(shRNA)构建慢病毒并感染BEL-7404细胞干扰EME1基因表达,分为沉默组(shEME1)和对照组(shCtrl)。通过实时荧光定量PCR法和Western Blot检测两组EME1 mRNA和蛋白表达水平,Celigo计数法及MTT活性检测细胞增殖率,流式细胞术检测细胞周期,Caspase3/7活性检测细胞凋亡。两组间比较采用成组t检验。结果TCGA结果显示EME1的mRNA表达水平在肝癌组织中是癌旁组织的18.9倍(114.5±153.0 vs 8.0±7.2,t=5.00,P<0.001);EME1的蛋白表达水平在肝癌组织中是癌旁组织的7.0倍(免疫组化检测,8.4±2.6 vs 1.2±0.4,t=7.55,P<0.001)和2.5倍(Western Blot检测,249.0%±35.5%vs 100.0%±77.8%,t=3.02,P<0.05)。慢病毒感染后,相对于对照组,沉默组EME1的mRNA表达水平下降了29.9%(29.9%±0.9%vs 100.0%±3.6%,t=32.82,P<0.001),蛋白表达水平显著下降了35.7%(35.7%±14.9%vs 100.0%±28.9%,t=3.42,P<0.05);细胞计数下降了45.1%(4053±167 vs 8988±477,t=16.91,P<0.001)、细胞活性下降至66.9%(0.518±0.046 vs 0.774±0.022,t=8.74,P<0.001)及细胞克隆形成能力下降至29.0%(75±6 vs 260±9,t=28.92,P<0.001)。与对照组比较,沉默组G1期细胞(49.9%vs 44.0%,t=8.96,P<0.001)比例增多,G2/M期(15.9%vs 17.9%,t=9.13,P<0.001)与S期(34.2%vs 38.1%,t=6.91,P<0.001)的细胞比例减少;Caspase3/7活性增强了1.5倍(145.8%±5.9%vs 100.0%±2.3%,t=12.50,P<0.001)。结论EME1在肝癌组织中高表达,沉默EME1基因可抑制肝癌细胞增殖,促进细胞凋亡。 展开更多
关键词 肝细胞 减数分裂内切酶1 RNA 小分子干扰 细胞增殖
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FEN1调节肝细胞癌发生和预后的临床意义
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作者 赵建红 岑红兵 +1 位作者 杨志勇 陈峰 《局解手术学杂志》 2024年第4期349-354,共6页
目的 分析瓣状核酸内切酶1(FEN1)与肝细胞癌(HCC)发生和预后的关系。方法 选取2017年5月至2022年10月我院肝胆外科收治的91例HCC患者的HCC组织(HCC组)和90例肝硬化患者的LC组织(LC组),采集所有患者术前血清样本。另纳入90例健康志愿者... 目的 分析瓣状核酸内切酶1(FEN1)与肝细胞癌(HCC)发生和预后的关系。方法 选取2017年5月至2022年10月我院肝胆外科收治的91例HCC患者的HCC组织(HCC组)和90例肝硬化患者的LC组织(LC组),采集所有患者术前血清样本。另纳入90例健康志愿者的血清样本作为对照。免疫组织化学法分析组织FEN1表达,酶联免疫吸附试验法检测血清FEN1水平。记录HCC患者5年无病生存期(DFS)和总生存期(OS)。结果 LC组和HCC组患者血清FEN1水平均高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。HCC组织FEN1蛋白表达H评分与血清FEN1水平呈正相关(r_(s)=0.726,P<0.001)。血清FEN1诊断HCC或者鉴别诊断HCC和LC的曲线下面积(AUC)分别为0.943和0.897。血清FEN1水平>244.74 pg/mL为HCC患者5年DFS率和OS率的独立危险因素(P<0.05)。结论 FEN1在HCC组织和血清样本中过表达,并与HCC患者的不良预后呈正相关,可作为HCC患者的早期诊断和预后评估的生物标志物。 展开更多
关键词 瓣状核酸内切酶1 肝细胞癌 临床病理特征 诊断 预后
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姜黄素通过降低miR-135b-5p和FEN1表达增强卵巢癌OVCAR-3细胞顺铂敏感性
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作者 马蓉 李娟 王芳 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2024年第4期324-330,共7页
目的:探究姜黄素对卵巢癌OVCAR-3细胞顺铂敏感性的影响及其潜在机制。方法:(1)体外常规培养卵巢癌亲本细胞OVCAR-3并构建顺铂耐药OVCAR-3/DDP细胞,将OVCAR-3细胞分为Control(常规培养)、DDP-1(1μmol/L顺铂)、DDP-5(5μmol/L顺铂)、DDP-... 目的:探究姜黄素对卵巢癌OVCAR-3细胞顺铂敏感性的影响及其潜在机制。方法:(1)体外常规培养卵巢癌亲本细胞OVCAR-3并构建顺铂耐药OVCAR-3/DDP细胞,将OVCAR-3细胞分为Control(常规培养)、DDP-1(1μmol/L顺铂)、DDP-5(5μmol/L顺铂)、DDP-10(10μmol/L顺铂)、DDP-15(15μmol/L顺铂)、DDP-20(20μmol/L顺铂)、DDP-30(30μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-1(20μmol/L姜黄素+1μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-5(20μmol/L姜黄素+5μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-10(20μmol/L姜黄素+10μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-15(20μmol/L姜黄素+15μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-20(20μmol/L姜黄素+20μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-30组(20μmol/L姜黄素+30μmol/L顺铂);将OVCAR-3/DDP细胞分为Control(常规处理)、DDP-10(10μmol/L顺铂)、DDP-20(20μmol/L顺铂)、DDP-30(30μmol/L顺铂)、DDP-40(40μmol/L顺铂)、DDP-50(50μmol/L顺铂)、DDP-60(60μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-10(20μmol/L姜黄素+10μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-20(20μmol/L姜黄素+20μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-30(20μmol/L姜黄素+30μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-40(20μmol/L姜黄素+40μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-50(20μmol/L姜黄素+50μmol/L顺铂)、姜黄素+DDP-60组(20μmol/L姜黄素+60μmol/L顺铂),CCK-8法检测细胞活性,计算顺铂半数抑制浓度(IC 50),筛选顺铂和姜黄素的合适作用浓度。(2)将OVCAR-3细胞分为对照组(常规处理)、DDP组(20.5μg/mL顺铂)、姜黄素组(20μmol/L姜黄素)、姜黄素+DDP组(20μmol/L姜黄素+20.5μg/mL顺铂);将OVCAR-3/DDP细胞分为对照组(常规处理)、DDP组(42.1μg/mL顺铂)、姜黄素组(20μmol/L姜黄素)、姜黄素+DDP组(20μmol/L姜黄素+42.1μg/mL顺铂),采用流式细胞术检测细胞凋亡率,实时荧光定量(qRT)-PCR检测miR-135b-5p表达,qRT-PCR和免疫印迹法分别检测瓣状核酸内切酶-1(flap endonuclease 1,FEN1)mRNA和蛋白表达。结果:相同顺铂浓度时,与DDP组比较,姜黄素+DDP联合组OVCAR-3和OVCAR-3/DDP细胞活性明显降低(P均<0.001)。DDP作用于OVCAR-3和OVCAR-3/DDP细胞的IC 50分别为20.5μg/mL和42.1μg/mL。与OVCAR组或OVCAR/DDP组相较,姜黄素或顺铂致OVCAR-3和OVCAR-3/DDP细胞凋亡率明显增加(P均<0.001),两者联合作用时效果更显著。此外,姜黄素或顺铂处理可明显降低OVCAR-3和OVCAR-3/DDP细胞中miR-135b-5p表达及FEN1表达(P<0.01或<0.001),两者联合时效果更显著。结论:姜黄素可增强卵巢癌OVCAR-3细胞顺铂敏感性,其可能与降低miR-135b-5p和FEN1表达相关。 展开更多
关键词 姜黄素 miR-135b-5p 瓣状核酸内切酶-1(FEN1) 卵巢癌 顺铂敏感性
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APE1通过免疫抑制性肿瘤微环境介导结肠炎相关结直肠癌的发生发展
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作者 陈天一 李超凡 +5 位作者 包灵波 陈骞 胡那娜 杨宇馨 张蕾 王东 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第16期1825-1837,共13页
目的探讨脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(apurinic/apyrimidinic endonuclease 1,APE1)在慢性肠道炎症向结肠炎相关性结直肠癌(colitis-associated colorectal cancer,CAC)转化过程中的调控机制。方法将C64S点突变纯合子(APE1^(C64S))和野生... 目的探讨脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(apurinic/apyrimidinic endonuclease 1,APE1)在慢性肠道炎症向结肠炎相关性结直肠癌(colitis-associated colorectal cancer,CAC)转化过程中的调控机制。方法将C64S点突变纯合子(APE1^(C64S))和野生型(APE1^(WT))小鼠分别按随机数字表法分为实验组与对照组,实验组应用氧化偶氮甲烷(azoxymethane,AOM)及葡聚糖硫酸钠盐(dextran sulfate sodium salt,DSS)溶液构建CAC体内模型,采用免疫组化及多重免疫荧光分析各组小鼠结肠组织APE1表达及免疫细胞浸润情况。通过慢病毒转染构建APE1稳定敲低的小鼠结肠癌MC38细胞系,并对APE1^(WT)与APE1^(C64S)小鼠进行皮下荷瘤实验以确定肿瘤细胞来源的APE1导致免疫抑制性肿瘤微环境,采用免疫组化及多重免疫荧光分析荷瘤标本APE1、趋化因子(C-X-C基序)配体1[chemokine(C-X-C motif)ligand 1,CXCL1]表达及免疫细胞浸润情况。对来自陆军特色医学中心的1名28岁女性CAC患者的肿瘤标本采用免疫组化及多重免疫荧光分析肿瘤及邻近炎症组织中APE1、CXCL1的表达及免疫细胞浸润情况。结果与对照组及APE1^(WT)实验组相比,APE1^(C64S)实验组小鼠的疾病活动指数及肿瘤形成数量明显降低,多形核髓源抑制细胞(polymorphonuclear myeloid-derived suppressor cells,PMN-MDSCs)浸润显著减少,CD4^(+)及CD8^(+)T细胞显著增多(P<0.05)。APE1^(WT)与APE1^(C64S)皮下荷瘤小鼠肿瘤生长及各免疫细胞差异无统计学意义;而使用敲低APE1的肿瘤细胞进行荷瘤实验,发现肿瘤生长明显抑制,PMN-MDSCs浸润减少,同时CD4^(+)及CD8^(+)T细胞显著增多(P<0.05)。在CAC患者肿瘤组织中APE1高表达、PMN-MDSCs浸润增加,CD8^(+)T细胞在肿瘤组织中较炎症组织浸润显著减少(P<0.05)。结论肿瘤细胞中APE1的氧化还原功能可促进PMN-MDSCs肿瘤浸润,同时减少T细胞的数量,从而形成免疫抑制性肿瘤微环境介导CAC的发生发展。 展开更多
关键词 结肠炎相关性结直肠癌 炎症性肠病 脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1 多形核髓源性抑制细胞 结直肠癌 肿瘤微环境
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T7E1检测CRISPR-Cas9基因编辑效果实验设计 被引量:1
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作者 王宏刚 魏远 +1 位作者 李艳君 朱玉山 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2023年第5期38-41,共4页
CRISPR-Cas9是一种现代生命科学研究中普遍使用的新型基因编辑技术。为了升级课程内容体系,使实验教学贴近科研实际,提升实验课程教学质量,设计了T7核酸内切酶1(T7E1)检测CRISPR-Cas9基因编辑效果实验。以CRISPR-Cas9基因编辑技术对mfn... CRISPR-Cas9是一种现代生命科学研究中普遍使用的新型基因编辑技术。为了升级课程内容体系,使实验教学贴近科研实际,提升实验课程教学质量,设计了T7核酸内切酶1(T7E1)检测CRISPR-Cas9基因编辑效果实验。以CRISPR-Cas9基因编辑技术对mfn1编辑过的HeLa细胞为实验材料,提取基因组DNA,PCR扩增mfn1基因片段,切胶回收后,变性,退火,使用T7E1对编辑效果进行检测。经1%琼脂糖凝胶电泳,可观察到T7E1将略大于500 bp的mfn1基因片段切成两条大小约为250 bp的DNA片段,表明CRISPR-Cas9成功地对mfn1进行了编辑。 展开更多
关键词 T7核酸内切酶1 CRISPR-Cas9 实验教学 科研反哺教学
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FEN1、GTF2IP23、KDM4A在乳腺癌组织中的表达研究 被引量:2
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作者 谭秋芬 胡惠军 《国际检验医学杂志》 CAS 2023年第3期311-315,321,共6页
目的探讨瓣状核酸内切酶-1(FEN1)、转录因子Ⅱⅰ假基因23(GTF2IP23)、赖氨酸特异性去甲基化酶4A(KDM4A)在乳腺癌组织中的表达及相关性。方法选取2020年7月至2021年8月进行手术的女性乳腺癌患者72例及同期进行手术的乳腺良性肿瘤患者70例... 目的探讨瓣状核酸内切酶-1(FEN1)、转录因子Ⅱⅰ假基因23(GTF2IP23)、赖氨酸特异性去甲基化酶4A(KDM4A)在乳腺癌组织中的表达及相关性。方法选取2020年7月至2021年8月进行手术的女性乳腺癌患者72例及同期进行手术的乳腺良性肿瘤患者70例,收集乳腺癌患者手术切除癌组织、距癌组织5 cm癌旁组织标本及乳腺良性肿瘤患者肿瘤病理组织,连续切片后做免疫组化标记、进行免疫组化染色。反转录-实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测FEN1表达,Western blot法检测GTF2IP23、KDM4A表达,分析FEN1、GTF2IP23、KDM4A在乳腺癌组织中的表达相关性及联合检测对乳腺癌患者预后的预测价值。结果与癌旁组织相比,良性肿瘤组织、乳腺癌组织中FEN1、GTF2IP23、KDM4A表达较高(P<0.05);乳腺癌组织中FEN1、GTF2IP23、KDM4A表达高于癌旁组织(P<0.05)。乳腺癌组织中FEN1、GTF2IP23、KDM4A表达与年龄、肿瘤直径、病理分期、淋巴结转移、脉管侵犯、分化情况密切相关(P<0.05)。乳腺癌组织中FEN1与GTF2IP23、KDM4A表达呈正相关(r=0.404、0.553,均P=0.001);GTF2IP23与KDM4A表达也呈正相关(r=0.582,P=0.001)。与FEN1、GTF2IP23、KDM4A单项检测相比,三项联合检测对乳腺癌患者预后预测的灵敏度提高,特异度降低;FEN1、GTF2IP23、KDM4A的曲线下面积(AUC)分别为0.691、0.659、0.708(P<0.05)。结论FEN1、GTF2IP23、KDM4A在乳腺癌组织中呈高表达,三者具有相关性,同时与乳腺癌患者病理特征密切相关,能够较好预测乳腺癌患者的预后,为临床诊断及治疗乳腺癌提供理论依据。 展开更多
关键词 乳腺癌 瓣状核酸内切酶-1 转录因子Ⅱⅰ假基因23 赖氨酸特异性去甲基化酶4A
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Nei核酸内切酶Ⅷ样蛋白1对过氧化氢诱导的晶状体上皮细胞凋亡与自噬的影响
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作者 鲍思洁 李鹏飞 +3 位作者 康丽华 王从玉 王思文 管怀进 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2023年第12期934-939,共6页
目的探究Nei核酸内切酶Ⅷ样蛋白1(NEIL1)对过氧化氢(H_(2)O_(2))诱导的晶状体上皮细胞(LECs)凋亡与自噬的影响。方法以年龄相关性白内障(ARC)患者、接受透明晶状体摘除术的黄斑前膜患者的晶状体前囊膜样本和晶状体上皮细胞系SRA01/04细... 目的探究Nei核酸内切酶Ⅷ样蛋白1(NEIL1)对过氧化氢(H_(2)O_(2))诱导的晶状体上皮细胞(LECs)凋亡与自噬的影响。方法以年龄相关性白内障(ARC)患者、接受透明晶状体摘除术的黄斑前膜患者的晶状体前囊膜样本和晶状体上皮细胞系SRA01/04细胞为研究对象,采用RT-PCR实验检测NEIL1 mRNA表达。将SRA01/04细胞随机分为对照组、OE-Vector组和OE-NEIL1组,采用RT-PCR和Western blot检测过表达效率;将细胞随机分为对照组、H_(2)O_(2)组、OE-Vector H_(2)O_(2)组、OE-NEIL1 H_(2)O_(2)组,采用CCK-8法检测细胞活力,Western blot检测自噬相关蛋白(ATG7、P62、Beclin1、LC3-I和LC3-II)和凋亡相关蛋白(Bax和Bcl-2)的表达,荧光染色检测细胞凋亡与线粒体膜电位情况。结果ARC患者晶状体前囊膜样本中的NEIL1 mRNA表达显著低于黄斑前膜患者,且H_(2)O_(2)组SRA01/04细胞中NEIL1 mRNA的表达同样低于对照组(均为P<0.05)。RT-PCR与Western blot检测结果显示,OE-NEIL1组SRA01/04细胞中NEIL1 mRNA和蛋白表达均显著高于OE-Vector组(均为P=0.000)。与对照组相比,H_(2)O_(2)组SRA01/04细胞中细胞活力显著降低;Bax蛋白表达上调,Bcl-2蛋白表达下调;Mito-Tracker标记活细胞数显著减少,Annexin V-FITC标记的凋亡细胞数显著增多,差异均有统计学意义(均为P<0.05)。与OE-Vector H_(2)O_(2)组相比,OE-NEIL1 H_(2)O_(2)组SRA01/04细胞中细胞活力显著升高;自噬相关蛋白(ATG7、P62、Beclin1、LC3-I和LC3-II)表达均显著上调;Bax蛋白表达下调,Bcl-2蛋白表达上调;Mito-Tracker标记的活细胞数增加,Annexin V-FITC标记的凋亡细胞数减少,差异均有统计学意义(均为P<0.05)。结论在H_(2)O_(2)诱导氧化应激条件下,NEIL1可通过促进LECs的自噬,维持LECs内环境稳定,增加其细胞活力从而减少LECs凋亡,参与ARC的发生发展。 展开更多
关键词 Nei核酸内切酶Ⅷ样蛋白1 年龄相关性白内障 晶状体上皮细胞 凋亡 自噬
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肺鳞状细胞癌组织中Flap-核酸内切酶1和复制因子C2的表达及临床意义
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作者 李倩 金凤 +3 位作者 何佳慧 胡涛 吴峰 顾扬 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第6期655-660,共6页
目的探讨肺鳞状细胞癌组织中Flap-核酸内切酶1(Flap-endonuclease 1,FEN1)和复制因子C2(replication factor C2,RFC2)的表达及其临床意义。方法采用生物信息学方法分析FEN1、RFC2在肺鳞状细胞癌组织中的表达;采用免疫组化法检测80例肺... 目的探讨肺鳞状细胞癌组织中Flap-核酸内切酶1(Flap-endonuclease 1,FEN1)和复制因子C2(replication factor C2,RFC2)的表达及其临床意义。方法采用生物信息学方法分析FEN1、RFC2在肺鳞状细胞癌组织中的表达;采用免疫组化法检测80例肺鳞状细胞癌及癌旁组织中FEN1和RFC2蛋白的表达,利用RT-PCR法检测两者mRNA表达并分析相关性,分析FEN1、RFC2与临床病理特征的关系;收集患者随访资料,绘制患者的生存曲线。结果FEN1和RFC2在肺鳞状细胞癌组织中的高表达率分别为77.50%(62/80)、70.00%(56/80),在癌旁组织中的高表达率分别为42.50%(34/80)、32.50%(26/80),与公共数据库分析结果一致。RT-PCR结果显示,肺鳞状细胞癌组织中RFC2、FEN1 mRNA表达均高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.01);相关性分析结果显示,两者的表达存在明显正相关。不同TNM分期患者的FEN1、RFC2蛋白表达差异有统计学意义,是否存在胸膜侵犯与RFC2蛋白的表达差异有关。FEN1、RFC2高表达肺鳞状细胞癌患者的总生存期均低于低表达组。单因素分析结果表明:RFC2高表达、FEN1高表达、TNM分期与肺鳞状细胞癌患者的预后有关;多因素分析结果表明:TNM分期、FEN1和RFC2高表达是影响肺鳞状细胞癌患者预后的独立危险因素。结论FEN1和RFC2有助于评估肺鳞状细胞癌患者的预后,两者之间存在协同作用,可能成为新的肿瘤标志物。 展开更多
关键词 肺肿瘤 鳞状细胞癌 Flap-核酸内切酶1 复制因子C2 预后
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APE1免疫组化表达与恶性肿瘤相关性的Meta分析 被引量:10
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作者 何乐 刘勇 +6 位作者 张诗珩 罗皓 彭宇 李梦侠 戴楠 单锦露 王东 《重庆医学》 CAS 北大核心 2015年第26期3664-3668,共5页
目的通过Meta分析系统评价肿瘤组织中脱嘌呤脱嘧啶核酸内切酶1(APE1)的免疫组化表达,进一步探讨其与恶性肿瘤的关系及临床意义。方法检索PubMed、EMBASE、中国期刊全文数据库、万方数据库,检索时间为建库至2015年2月,使用stata13.0软件... 目的通过Meta分析系统评价肿瘤组织中脱嘌呤脱嘧啶核酸内切酶1(APE1)的免疫组化表达,进一步探讨其与恶性肿瘤的关系及临床意义。方法检索PubMed、EMBASE、中国期刊全文数据库、万方数据库,检索时间为建库至2015年2月,使用stata13.0软件对符合纳入标准的研究结果进行Meta分析。结果共纳入36篇文献,包括3 374例患者和521例正常对照。Meta分析显示,与正常组织相比,肿瘤组织中APE1出现胞浆异位表达(OR=17.82);而且,APE1表达不论是阳性细胞数量,还是表达水平均显著高于正常对照组(OR=37.56,OR=47.56)。APE1的异位表达主要在卵巢上皮癌、胰腺癌、大肠癌、膀胱移行细胞癌和肺癌;APE1阳性表达增高主要在肝癌、胰腺癌、膀胱移行细胞癌、外周T细胞淋巴瘤和非小细胞肺癌。APE1在淋巴结转移肿瘤组的阳性表达高于未转移组(OR=4.10);APE1高表达的肿瘤患者,其化疗敏感性较低表达患者差(OR=6.45)。结论 APE1的异位表达和(或)表达量增加与多种恶性肿瘤的发生、发展及预后具有显著的相关性。APE1可能是肿瘤诊断及预后的潜在标志物。 展开更多
关键词 脱嘌呤脱嘧啶核酸内切酶1 恶性肿瘤 免疫组化
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大肠癌APE1的表达特点及临床意义 被引量:6
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作者 向德兵 牟江洪 +3 位作者 谢家印 王东 肖华亮 李增鹏 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期115-116,共2页
目的探讨脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶(APE1)在大肠癌发生、发展中的作用。方法应用免疫组化SP法检测125例大肠癌、72例大肠腺瘤、60例癌旁大肠黏膜和40例正常大肠黏膜中APE1的表达情况,并分析APE1与大肠癌临床病理之间的关系。结果正常大... 目的探讨脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶(APE1)在大肠癌发生、发展中的作用。方法应用免疫组化SP法检测125例大肠癌、72例大肠腺瘤、60例癌旁大肠黏膜和40例正常大肠黏膜中APE1的表达情况,并分析APE1与大肠癌临床病理之间的关系。结果正常大肠黏膜APE1呈胞核表达,大肠腺瘤和大肠癌组织APE1表达特征发生改变,呈胞核表达、单纯胞质表达或核浆共同表达。APE1胞质异位表达率大肠癌组织为73·6%,大肠腺瘤组织为83·3%,二者无显著性差异(P>0·05),但均显著高于癌旁大肠黏膜(10%)和正常大肠黏膜(0%,P<0·01)。APE1胞质异位表达与大肠癌临床分期和淋巴结转移有关(P<0·01,P<0·05)。结论APE1胞质异位表达可能在大肠癌的发生、发展中起重要作用。 展开更多
关键词 脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶 结直肠肿瘤 基因表达
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APE1/Ref-1在卵巢癌中的功能研究进展 被引量:6
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作者 吕小慧 郭欣 +3 位作者 李佳 葛俊丽 刘淑娟 陈必良 《中国妇幼健康研究》 2016年第8期1027-1029,共3页
脱嘌呤/脱氧嘧啶核酸内切酶1(APE1),又称为氧化还原因子1(Ref-1),是一种具有双功能酶活性的生物大分子,不仅具有核酸内切酶活性,能修复DNA的损伤,而且具有氧化还原功能,可通过调控多种转录因子的转录活性实现对基因表达的干预。研究发现... 脱嘌呤/脱氧嘧啶核酸内切酶1(APE1),又称为氧化还原因子1(Ref-1),是一种具有双功能酶活性的生物大分子,不仅具有核酸内切酶活性,能修复DNA的损伤,而且具有氧化还原功能,可通过调控多种转录因子的转录活性实现对基因表达的干预。研究发现APE1/Ref-1在卵巢癌中呈高表达状态,并与肿瘤的发生、发展及预后有关。APE1/Ref-1因其与卵巢癌的密切关系,而成为极具潜力的肿瘤基因治疗的新靶点。该文就APE1/Ref-1的定位、分子结构、生物学功能及其在卵巢癌发生发展研究方面的进展作了一系列的回顾与总结。 展开更多
关键词 脱嘌呤/脱氧嘧啶核酸内切酶 卵巢癌 氧化还原 核酸内切酶
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APE1/Ref-1 siRNA抑制多发性骨髓瘤骨髓基质细胞IL-6及IL-8分泌的体外研究 被引量:8
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作者 谢家印 王东 +7 位作者 李梦侠 向德兵 杨镇洲 杨宇馨 李增鹏 曾林立 仲召阳 王阁 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第19期1850-1853,共4页
目的体外通过APE1/Ref-1 siRNA敲低多发性骨髓瘤骨髓基质细胞(bone marrow stromal cells,BMSCs)APE1/Ref-1的表达,观察BMSCs的增殖及分泌细胞因子IL-6、IL-8的变化,初步探讨BMSCs APE1/Ref-1表达的功能特点。方法通过免疫细胞化学染色... 目的体外通过APE1/Ref-1 siRNA敲低多发性骨髓瘤骨髓基质细胞(bone marrow stromal cells,BMSCs)APE1/Ref-1的表达,观察BMSCs的增殖及分泌细胞因子IL-6、IL-8的变化,初步探讨BMSCs APE1/Ref-1表达的功能特点。方法通过免疫细胞化学染色法定量检测35例初治、11例复发/难治多发性骨髓瘤患者及10例正常人BMSCs APE1/Ref-1的表达特点及其差异,经Adv5-APE1/Ref-1 siRNA感染BMSCs后,流式细胞仪检测BMSCs细胞周期的变化;ELISA法检测BMSCs分泌IL-6、IL-8的水平变化情况。结果多发性骨髓瘤BMSCs的APE1/Ref-1蛋白阳性表达率显著高于正常BMSCs APE1/Ref-1蛋白阳性表达率(P<0.05),且多发性骨髓瘤BMSCs的APE1/Ref-1呈细胞核及核浆共同表达方式。Adv5-APE1/Ref-1 siRNA感染敲低多发性骨髓瘤及正常BMSCs APE1/Ref-1的表达量呈进行性减少(P<0.01),同时发现APE1/Ref-1 siRNA对多发性骨髓瘤BMSCs抑制作用更明显。Adv5-APE1/Ref-1 siRNA感染BMSCs后对正常人及骨髓瘤患者BMSCs分泌细胞因子IL-6、IL-8的量有显著的抑制作用,特别是感染72h后,骨髓瘤患者及正常人的BMSCs分泌IL-6[初治患者(246.29±46.51)pg/ml,复发/难治患者(365.09±75.25)pg/ml]、IL-8[初治患者(118.77±18.08)pg/ml,复发/难治患者(188.71±33.76)pg/ml]的量最低,与其他时段比较差异有统计学意义(P<0.01)。结论多发性骨髓瘤BMSCs APE1/Ref-1的表达特点不同于正常BMSCs,可能导致其功能差异;APE1/Ref-1 siRNA敲低了MMBMSCs APE1/Ref-1的表达,同时明显抑制了其IL-6、IL-8的分泌,减少了对骨髓瘤细胞的促增殖和凋亡作用。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 骨髓基质细胞 RNA干扰 白细胞介素-6 白细胞介素-8
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APE1 siRNA重组腺病毒增强贝伐单抗对移植骨肉瘤的治疗作用 被引量:3
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作者 仲召阳 张沁宏 +3 位作者 卿毅 李梦侠 李增鹏 王东 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期331-335,共5页
目的:探讨以DNA损伤修复基因脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶基因(apurinic/aprimidinic endonuclease-1,APE1)为靶点的siRNA在骨肉瘤治疗中的作用及其与贝伐单抗(bevacizumab,Avastin)的协同效应。方法:建立人骨肉瘤9901细胞荷瘤裸鼠模型,16... 目的:探讨以DNA损伤修复基因脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶基因(apurinic/aprimidinic endonuclease-1,APE1)为靶点的siRNA在骨肉瘤治疗中的作用及其与贝伐单抗(bevacizumab,Avastin)的协同效应。方法:建立人骨肉瘤9901细胞荷瘤裸鼠模型,16只荷瘤鼠随机分为4组:EGFP对照组,APE1siRNA治疗组,Avastin治疗组和联合治疗组(Avastin+APE1siR-NA)。观察移植瘤生长情况并计算抑瘤率,免疫组织化学法检测肿瘤组织微血管密度和Ki67表达,TUNEL法检测肿瘤细胞凋亡,激光共聚焦检测肿瘤组织的缺氧状态,Western blotting检测肿瘤组织内VEGF蛋白的表达。结果:与APE1siRNA治疗组和Avastin治疗组相比,Avastin+APE1siRNA治疗组的抑瘤率显著增加(P<0.01)。各治疗组的微血管密度及Ki67表达明显低于对照组,且Avastin+APE1siRNA治疗组微血管密度和Ki67表达显著低于单独治疗组(P<0.01)。各治疗组的凋亡指数明显高于对照组,且Avastin+APE1siRNA治疗组明显高于单独治疗组(P<0.01)。APE1siRNA或Avastin治疗均可引起肿瘤组织缺氧,抑制肿瘤组织中VEGF的表达,Avastin+APE1siRNA治疗效果更加明显。结论:以APE1为靶点的siRNA能显著抑制裸鼠移植骨肉瘤的血管生成和瘤体生长,并诱导肿瘤细胞凋亡,且与Avastin具有协同作用。 展开更多
关键词 骨肉瘤 SIRNA 脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶 贝伐单抗 抗血管生成 凋亡
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血清APE1蛋白在结直肠癌临床诊断中的作用及意义 被引量:4
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作者 杨宇馨 何乐 +4 位作者 卢先锋 杨骁 仲召阳 王东 戴楠 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期88-93,共6页
目的探讨结直肠癌患者血清APE1蛋白的表达及其在临床诊断中的价值。方法利用ELISA法检测本院2010年1月至2015年9月肿瘤中心收治的202例结直肠癌患者和健康体检中心242例健康对照人群血清APE1蛋白的表达水平,通过免疫组化确定相应患者肿... 目的探讨结直肠癌患者血清APE1蛋白的表达及其在临床诊断中的价值。方法利用ELISA法检测本院2010年1月至2015年9月肿瘤中心收治的202例结直肠癌患者和健康体检中心242例健康对照人群血清APE1蛋白的表达水平,通过免疫组化确定相应患者肿瘤组织APE1蛋白的表达特征,同时采用C-12肿瘤蛋白芯片试剂盒检测上述人群CEA的表达水平。分析血清APE1蛋白与肿瘤组织APE1蛋白表达水平及年龄、性别、分期等临床指标的相关性,并绘制受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)评估血清APE1蛋白及CEA在结直肠癌诊断中的应用价值。结果 202例结直肠癌患者中位血清APE1蛋白浓度为0.331(0.007~4.359)ng/mL,显著高于对照组0.091(0~1.374)ng/mL(P<0.01)。Spearman相关分析显示血清APE1蛋白水平与肿瘤组织中APE1蛋白表达呈正相关(r=0.331,P=0.025),而与年龄、性别、分期等指标不相关。ROC曲线显示血清APE1蛋白的AUC为0.799(95%CI=0.756~0.843),灵敏度为76.20%,特异性为76.40%,血清CEA的AUC为0.736(95%CI=0.687~0.785),其灵敏度为51.00%,特异性为99.60%。血清APE1蛋白与CEA联合后其AUC为0.857(95%CI=0.819~0.896),灵敏度和特异性分别为72.30%和91.30%。结论结直肠癌患者血清APE1蛋白水平与肿瘤组织APE1表达呈正相关且较健康对照人群显著增高。血清APE1蛋白可与CEA联合作为结直肠癌辅助诊断的血清学标志物。 展开更多
关键词 APE1 结直肠癌 肿瘤标志物 诊断
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大肠癌Ref-1/APE的表达特点及其意义 被引量:4
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作者 牟江洪 肖华亮 +3 位作者 向德兵 张沁宏 李增鹏 王东 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期111-113,共3页
目的探讨大肠癌氧化还原因子-1(redoxfactor-1,Ref-1),又称脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶(apurinic/apyri-midinicendonuclease,APE),在大肠癌的表达特点及其与血管内皮生长因子(vascularendothelialgrowthfactor,VEGF)和血管密度的关系。方... 目的探讨大肠癌氧化还原因子-1(redoxfactor-1,Ref-1),又称脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶(apurinic/apyri-midinicendonuclease,APE),在大肠癌的表达特点及其与血管内皮生长因子(vascularendothelialgrowthfactor,VEGF)和血管密度的关系。方法应用免疫组化S-P法检测110例大肠癌和40例非癌区大肠组织中Ref-1/APE和VEGF的表达,采用血管内皮特异标记物CD31标记并计数肿瘤微血管密度(microvesseldensity,MVD),最后分析Ref-1/APE与VEGF和MVD的关系。结果所有大肠癌和非癌区大肠组织都有Ref-1/APE表达,但是其在细胞内的定位有所不同。40例非癌区大肠组织细胞核都有Ref-1/APE表达,仅5例有胞质表达(5/40,12·5%);而110例大肠癌中有79例(79/110,71·81%)细胞质有Ref-1/APE表达,比例显著高于非癌区大肠组织(P<0·01)。而且细胞质Ref-1/APE阳性表达的大肠癌较无细胞质表达者VEGF阳性率显著增加(P<0·05),MVD也显著增高(P<0·05)。结论大肠癌Ref-1/APE移位于细胞质的异常表达可能涉及大肠癌的发生,并且可能与VEGF表达和肿瘤血管生成有关。 展开更多
关键词 氧化还原因子-1 脱嘌呤 脱嘧啶核酸内切酶 血管内皮生长因子 血管密度 大肠癌
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