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Physiological Response and Transcriptome Analysis of Cotton Leaves under Low Temperature Stress at the Two-leaf Stage
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作者 Xiaoman WANG Jianbing ZENG +5 位作者 Qiongshan WANG Songbo XIA Xiaogang WANG Jiaohai ZHANG Youchang ZHANG Shu BIE 《Asian Agricultural Research》 2021年第3期40-47,共8页
[Objectives]To investigate the effect of low temperature treatment on cotton leaves at the two-leaf stage.[Methods]Two cotton varieties(CN01 and SJB016(low temperature-tolerant))were used as the trial materials.They w... [Objectives]To investigate the effect of low temperature treatment on cotton leaves at the two-leaf stage.[Methods]Two cotton varieties(CN01 and SJB016(low temperature-tolerant))were used as the trial materials.They were treated at 25(CK)and 12℃(low temperature)for 0,3,6,12,24,48 and 72 h,respectively.Then,the changes in the contents of MDA,SS and Pro in the cotton leaves were analyzed.Based on the analysis results,RNA-seq verification was performed.[Results]Two cotton varieties(CN01 and SJB016(low temperature-tolerant))were used as the trial materials.They were treated at 25(CK)and 12℃(low temperature)for 0,3,6,12,24,48 and 72 h,respectively.Then,the changes in the contents of MDA,SS and Pro in the cotton leaves were analyzed.Based on the analysis results,RNA-seq verification was performed.[Conclusions]These genes may play an important role in improving the cold resistance of cotton. 展开更多
关键词 Cotton leaf Physiological response TRANSCRIPTOME Gene expression low temperature stress
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Low temperature stress on the hematological parameters and HSP gene expression in the turbot Scophthalmus maximus 被引量:5
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作者 纪利芹 蒋克勇 +4 位作者 刘梅 王宝杰 韩龙江 张明明 王雷 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2016年第3期430-440,共11页
To study the effect of low temperature stress on hematological parameters and HSP gene expression in the turbot (Seophthalmus maximus), water temperature was lowered rapidly from 18 to 1℃. During the cooling proces... To study the effect of low temperature stress on hematological parameters and HSP gene expression in the turbot (Seophthalmus maximus), water temperature was lowered rapidly from 18 to 1℃. During the cooling process, three individuals were removed from culture tanks at 18, 13, 8, 5, 3, and 1℃. Blood samples and tissues were taken from each individual, hematological indices and HSP gene expression in tissues were measured. The red blood cell count, white blood cell count, and hemoglobin concentration decreased significantly (P〈0.05) as temperature decreased. Enzyme activities of plasma alanine transaminase and creatine kinase increased as temperature decreased, whereas aspartic transaminase and γ-glutamyl transpeptidase activities displayed no obvious changes above 1℃ and lactate dehydrogenase activity increased first and then decreased. Blood urea nitrogen and uric acid levels were highest at 8℃, and creatinine concentration was highest at 3℃. The concentrations of plasma cortisol, cholesterol, and triglyceride all increased significantly (P〈0.05) as temperature decreased. The serum glucose concentration increased first and then decreased to the initial level. The HSP70 mRNA expression showed various patterns in different tissues, whereas HSP90 mRNA expression showed the same tendency in all tissues. Overall, these results indicate that temperature decreases in the range of 8 to 5℃ may induce a stress response in S. maximus and that temperature should be kept above 8℃ in the aquaculture setting to avoid damage to the fish. 展开更多
关键词 HEMATOLOGY HSP70 HSP90 mRNA expression low temperature stress fish
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De Novo Transcriptome Analysis in Hevea brasiliensis to Unveil Genes Involved in Low Temperature Stress Response
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作者 Bingsong Yang Xiaomeng Shi +1 位作者 Tingting Guo Meixia Liang 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2023年第2期559-575,共17页
Low temperature is one of the adversities threatening the growth and development and reduces the yield of rubber trees.However,molecular mechanisms toward rubber trees in response to low temperature are largely unclea... Low temperature is one of the adversities threatening the growth and development and reduces the yield of rubber trees.However,molecular mechanisms toward rubber trees in response to low temperature are largely unclear.In this study,7,159 and 7,600 differentially expressed genes(DEGs)were identified in‘Reyan 73397’rubber trees.Through GO analysis,the catalytic activity was the representative of the GO term in the only DEGs at the two studied temperatures(room temperature and 4°C,respectively),while KEGG analysis showed that carbon metabolism was the most important grouping under the comparison of these two temperatures.In addition,expression of 9 members of transcription factor MYB family genes were further verified by qRT-PCR,and MYB family genes may play important roles in the regulation of rubber trees under low temperature stress.This study provided a theoretical foundation for(1)revealing the molecular mechanisms of rubber trees in response to low temperature and(2)breeding of tolerant varieties of rubber trees. 展开更多
关键词 Hevea brasiliensis low temperature stress TRANSCRIPTOME differential expressed genes
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Characterization of T-complex polypeptide 1 (TCP-1) from the Chilo suppressalis HSP60 family and its expression in response to temperature stress 被引量:3
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作者 YU Tong-ying LU Ming-xing CUI Ya-dong 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2018年第5期1032-1039,共8页
Many proteins require assistance from molecular chaperones at various stages to attain correctly folded states and functional conformations during protein synthesis. In this study, the gene encoding T-complex polypept... Many proteins require assistance from molecular chaperones at various stages to attain correctly folded states and functional conformations during protein synthesis. In this study, the gene encoding T-complex polypeptide 1(TCP-1), which belongs to the heat shock protein 60(HSP60) family, was isolated and characterized from the rice stem borer, Chilo suppressalis, by RACE and q PCR, respectively. The full-length c DNA of Tcp-1 was 2 144 bp and encoded a 1 635-bp ORF; the deduced translational product contained 545 amino acids with 5′-and 3′-UTRs and an isoelectric point of 5.29. Cluster analysis confirmed that the deduced amino acid sequence shared high identity(60–99%) with TCP-1 from other insects. To investigate Tcp-1 expression in response to abiotic stress, q PCR was used to analyze expression levels of Tcp-1 m RNA in C. suppressalis larvae exposed to temperatures ranging from –11 to 43°C. With respect to heat shock, Tcp-1 expression was higher than the control after a 2-h exposure to 30 and 36°C and declined at 39 and 43°C. Difference in Tcp-1 expression was observed at temperatures ranging from –11 to 27°C. q PCR analyses revealed that Tcp-1 expression was the highest in hindgut tissue as compared to heads, epidermis, fat body, foregut, midgut, and malpighian tubules. Our results indicated that Tcp-1 expression was differentially expressed in C. suppressalis tissues, and was impacted by temperature stress. 展开更多
关键词 TCP-1 Chilo suppressalis expression analysis temperature stress insect tissues
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Molecular cloning, characterization and expression analysis of a catalase gene in Paphia textile 被引量:1
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作者 WU Xiangwei LI Jiakai +1 位作者 TAN Jing LIU Xiande 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2016年第8期65-73,共9页
Catalase is an important antioxidant protein that can protect organisms against various forms of oxidative damage by eliminating hydrogen peroxide. In this study, the catalase c DNA of Paphia textile(Pt CAT) was clo... Catalase is an important antioxidant protein that can protect organisms against various forms of oxidative damage by eliminating hydrogen peroxide. In this study, the catalase c DNA of Paphia textile(Pt CAT) was cloned using RTPCR and rapid amplification of c DNA ends(RACE). Pt CAT is 1 921 bp long and consists of a 5′-UTR of 50 bp, a 3′-UTR of 349 bp, and an ORF of 1 542 bp that encodes 513 amino acids with a molecular weight of 58.4 k D and an estimated isoelectric point of 8.2. Sequence alignment indicated that Pt CAT contained a highly conserved catalytic signature motif(^(61)FNRERIPERVVHAKGAG^(77)), a proximal heme-ligand signature sequence(^(352)RLFSYSDP^(359)), and three catalytic amino acid residues(H^(72), N^(145), and Y^(356)). Pt CAT also contains two putative N-glycosylation sites(^(34)NKT^(36) and ^(437)NFT^(439)) and a peroxisome-targeting signal(^(511)AQL^(513)). Furthermore, Pt CAT shares 53%–88% identity and 29%–89% similarity with other catalase amino acid sequences. Pt CAT m RNA was present in all tested organs, including the heart, digestive gland, adductor muscle, gonad, gill, and mantle, but its expression was highest in the digestive gland. High-temperature-induced stress produced two expression patterns of Pt CAT m RNA: first, an initial up-regulation followed by a down-regulation in the heart, digestive gland, and gonad and, second, consistent down-regulation in all other organs. These results demonstrate that Pt CAT is a typical member of the catalase family and might be involved in the responses to harmful environmental factors. 展开更多
关键词 Paphia textile catalase(CAT) cloning sequence analysis expression analysis high temperature stress
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Expression responses of five cold tolerant related genes to two temperature dropping treatments in sea cucumber Apostichopus japonicus
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作者 李成泽 常亚青 +2 位作者 庞震国 丁君 姬南京 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2015年第2期309-318,共10页
Environmental conditions, including ambient temperature, play important roles in survival growth development, and reproduction of the Japanese sea cucumber, Apostichopus japonicus. Low temperatures result in slowed gr... Environmental conditions, including ambient temperature, play important roles in survival growth development, and reproduction of the Japanese sea cucumber, Apostichopus japonicus. Low temperatures result in slowed growth and skin ulceration disease. In a previous study, we investigated the effect of low temperature on gene expression profiles inA.japonicus by suppression subtractive hybridization (SSH). Genes encoding Ferritin, Lysozyme, Hsp70, gp96, and AjToll were selected from a subtracted cDNA library of A. japonicus under acute cold stress. The transcriptional expression profiles of these genes were investigated in different tissues (coelomocyte, respiratory tree, intestine, longitudinal muscle) after exposure to acute and mild temperature dropping treatments. The results show that (1) the five cold-tolerance-related genes were found in all four tissues and the highest mRNA levels were observed in coelomocyte and respiratory tree; (2) under the temperature dropping treatments, three types of transcriptional regulation patterns were observed: primary suppression followed by up-regulation at -2℃, suppressed expression throughout the two treatments, and more rarely an initial stimulation followed by suppression; and (3) gene expression suppression was more severe under acute temperature dropping than under mild temperature dropping treatment. The five cold-tolerance-related genes that were ,distributed mainly in coelomocyte and respiratory tissues were generally down-regulated by low temperature stress but an inverse up-regulation event was found at the extreme temperature (-2℃). 展开更多
关键词 Apostichopusjaponicus transcriptional regulation low temperature stress gene expression
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结球甘蓝CBF家族特征分析及低温诱导基因BoCBF1、BoCBF2a和BoCBF3表达分析 被引量:1
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作者 张伟 余方伟 +2 位作者 李建斌 于利 王神云 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期156-164,共9页
转录因子CBF在植物对低温胁迫的响应和增强植物的抗寒性方面发挥着重要作用。为分析结球甘蓝CBF家族成员的氨基酸序列特征,探究其是否受低温诱导表达,本研究利用结球甘蓝923全基因组数据库对其进行蛋白质理化特征、系统发育关系、编码... 转录因子CBF在植物对低温胁迫的响应和增强植物的抗寒性方面发挥着重要作用。为分析结球甘蓝CBF家族成员的氨基酸序列特征,探究其是否受低温诱导表达,本研究利用结球甘蓝923全基因组数据库对其进行蛋白质理化特征、系统发育关系、编码基因结构以及2℃低温胁迫下编码基因表达水平分析。结果表明,共鉴定到7个BoCBF基因,系统发育分析后分成2个亚组(Ⅰ和Ⅱ)。BoCBF蛋白的氨基酸长度为203~283 aa,全部是亲水性蛋白质。在结球甘蓝02-12中,BoCBF1、BoCBF2a和BoCBF3基因在叶、花、芽和角果中基本不表达,在愈伤组织、根和茎中表达量较低。转录组测序和实时荧光定量PCR分析发现,在耐寒结球甘蓝923和不耐寒结球甘蓝D9中,BoCBF2b、BoCBF2c基因不受低温诱导表达,BoCBF2a基因低温诱导表达最为迅速,其次是BoCBF1和BoCBF3基因。BoCBF1、BoCBF2a和BoCBF3基因的相对表达量在低温胁迫3~6 h达到最大值,相对表达量达到最大值后急剧下降,在24 h降至最低。本研究结果为后续开展BoCBF1、BoCBF2a和BoCBF3基因调控结球甘蓝响应低温胁迫机理研究奠定了基础。 展开更多
关键词 结球甘蓝 CBF基因家族 低温胁迫 基因表达
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基于转录组测序的蝴蝶兰低温胁迫响应MYB转录因子挖掘
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作者 梁芳 张燕 +3 位作者 袁秀云 康莹莹 吴征 许申平 《河南农业科学》 北大核心 2024年第8期108-117,共10页
为了探究MYB转录因子在抗冷型蝴蝶兰低温胁迫响应中的功能,从蝴蝶兰低温胁迫转录组文库中筛选出31条具有完整开放阅读框的MYB转录因子基因序列,对其蛋白质结构域、理化性质、系统进化、表达特性等进行分析。结果表明,有19条序列属于R2R3... 为了探究MYB转录因子在抗冷型蝴蝶兰低温胁迫响应中的功能,从蝴蝶兰低温胁迫转录组文库中筛选出31条具有完整开放阅读框的MYB转录因子基因序列,对其蛋白质结构域、理化性质、系统进化、表达特性等进行分析。结果表明,有19条序列属于R2R3-MYB,其中所含R2氨基酸排列模式为W(T/S/I)X_(2)EDX_(2)LX_(7)GX_(3)WX_(2)(L/V/I)X_(3)(A/T/S)(G/S)LXR(C/T/S)GKSCRLRWXNY,R3氨基酸排列模式为(F/I/M/L)(S/T)X_(2)EX_(3)(I/V)(I/L/V)X(L/V)HX_(2)(L/W)G(N/T)(R/K)W(S/A)XIAX_(2)LPGRTDNE(I/V)KNXW-(N/R/H)(T/S/G);其余12条序列属于1R-MYB,R氨基酸排列模式为W(S/T)X(E/D)EHX_(2)FLX(A/G)X_(4)-(G/D)(R/K)G_(0~1)(A/D)W或W(S/T)X(E/K)(Q/E)(N/D)KXFE(R/K)AL(A/V)X_(3)(E/D)X(T/A)PXRW。这31条序列均具有Myb-DNA-binding结构域,平均相对分子质量为30 288.28,平均理论等电点为7.55,且都为疏水蛋白。蝴蝶兰MYB转录因子TRINITY_DN61754_c4_g1在抗冷品种大辣椒中的表达量于低温处理前后基本不变,但在不抗冷品种富乐夕阳中低温处理早期表达量就开始下降;TRINITY_DN74288_c0_g1在大辣椒中低温处理后48 h表达量显著增加,而在富乐夕阳中低温处理24 h后的表达量显著降低。结合其与小兰屿蝴蝶兰MYB转录因子的同源性分析及功能预测,推测这2个基因可能在蝴蝶兰低温胁迫响应过程发挥重要的作用。 展开更多
关键词 蝴蝶兰 MYB转录因子 低温胁迫 基因表达 基因挖掘
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低温胁迫对枇杷生理特性及抗寒相关基因差异表达的影响
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作者 潘翠萍 陶炼 +3 位作者 谢红江 李华佳 邓群仙 王永清 《中国农学通报》 2024年第13期64-69,共6页
研究低温胁迫下2个枇杷幼果种胚生理指标变化及抗寒相关EjICE1基因的表达规律,为枇杷抗寒新材料的筛选及枇杷抗寒分子机理的解析提供理论依据。以洞庭枇杷(黄肉,DT)及洞庭枇杷突变型(白肉,DTM)挂果容器苗为材料,研究人工模拟低温对枇杷... 研究低温胁迫下2个枇杷幼果种胚生理指标变化及抗寒相关EjICE1基因的表达规律,为枇杷抗寒新材料的筛选及枇杷抗寒分子机理的解析提供理论依据。以洞庭枇杷(黄肉,DT)及洞庭枇杷突变型(白肉,DTM)挂果容器苗为材料,研究人工模拟低温对枇杷相对电导率(REC)、丙二醛(MDA)含量、超氧化物歧化酶(SOD)活性、过氧化物酶(POD)活性、过氧化氢酶(CAT)活性及EjICE1基因的表达规律的影响。结果表明,低温胁迫下2个枇杷幼果种胚相对电导率REC均呈“S”型曲线变化,Logistic方程显示,洞庭枇杷和突变型(DTM)半致死温度LT50分别为-4.759、-2.811℃,突变型(白肉,DTM)幼果的抗寒能力强于洞庭枇杷;2个枇杷的SOD、POD及CAT活性及洞庭枇杷(DT)的MDA含量均呈现出先升后降的变化趋势,但达到最大阈值的时间点不同,而突变型(DTM)MDA含量则呈现缓慢上升趋势,洞庭枇杷SOD在1℃达到最大阈值,丙二醛(MDA)含量、POD及CAT活性在-1℃达到最大阈值;突变型(DTM)SOD、POD及CAT活性在-3℃达到最大阈值,丙二醛(MDA)含量则在-5℃达到最大阈值。EjICE1基因在2个枇杷中的表达呈先升后降的趋势,突变型(DTM)EjICE1基因的表达水平均高于同时期的洞庭枇杷,最大表达量出现在-3℃,洞庭枇杷EjICE1基因最大表达量出现在-1℃,在-5℃时2个枇杷中EjICE1基因的表达均被强烈抑制。突变型(DTM)幼果的抗寒能力强于亲本洞庭枇杷(DT),低温胁迫下,突变型(DTM)具有较高的保护酶活性,能快速激活抗寒相关基因的表达,启动低温应答机制,进而抵御和适应低温伤害。 展开更多
关键词 枇杷 低温胁迫 半致死温度 生理特性 基因表达
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山药块茎膨大期DoCDPK1基因生物信息学及低温胁迫下的表达分析
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作者 高晶晶 张艳芳 +3 位作者 邢丽南 葛明然 季祥 霍秀文 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第7期42-51,共10页
钙依赖性蛋白激酶(CDPK)在植物的生长发育及逆境胁迫方面发挥着重要作用。以大和长芋和毕克齐山药为试验材料,克隆钙依赖性蛋白激酶基因DoCDPK1,并对其进行生物信息学分析,为DoCDPK1基因的功能研究奠定基础。采用生物信息学方法分析DoCD... 钙依赖性蛋白激酶(CDPK)在植物的生长发育及逆境胁迫方面发挥着重要作用。以大和长芋和毕克齐山药为试验材料,克隆钙依赖性蛋白激酶基因DoCDPK1,并对其进行生物信息学分析,为DoCDPK1基因的功能研究奠定基础。采用生物信息学方法分析DoCDPK1基因结构,构建瞬时表达载体,对DoCDPK1蛋白进行亚细胞定位;采用qRT-PCR分析DoCDPK1基因在不同山药品种的不同发育阶段及低温胁迫处理下的表达模式。结果表明(:1)DoCDPK1基因序列长度为2023 bp,编码521个氨基酸。(2)DoCDPK1与几内亚薯蓣CDPK蛋白序列的一致性为97%,且DoCDPK1存在STKc_CAMK结构域。(3)瞬时表达分析表明,DoCDPK1蛋白定位于细胞核与细胞膜。(4)大和长芋山药中的CDPK活性更高,DoCDPK1可能参与调控山药块茎膨大后期的生长发育。(5)经4℃低温胁迫后,CDPK活性降低,DoCDPK1表达量上调,且表达水平在不同时间处理下存在差异。综上所述,DoCDPK1可能参与调控山药块茎膨大后期的生长发育及低温胁迫响应过程。 展开更多
关键词 山药 钙依赖性蛋白激酶 亚细胞定位 低温胁迫 基因表达量
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基于Web of Science全球小麦低温逆境的研究态势分析
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作者 张林 陈翔 +5 位作者 刘绿洲 陈建 张梦祥 任驿 魏凤珍 李金才 《江汉大学学报(自然科学版)》 2024年第1期16-27,共12页
低温逆境已成为限制全球小麦稳产丰产与优质的主要农业气象灾害之一。为客观全面地了解全球小麦低温逆境领域的研究现状和发展趋势,基于Web of Science核心数据库中2000-2020年发表的以“小麦”和“低温”为研究主题的相关文献为数据源... 低温逆境已成为限制全球小麦稳产丰产与优质的主要农业气象灾害之一。为客观全面地了解全球小麦低温逆境领域的研究现状和发展趋势,基于Web of Science核心数据库中2000-2020年发表的以“小麦”和“低温”为研究主题的相关文献为数据源,利用CiteSpace可视化分析软件对检索到与主题密切相关的475篇文献从发文数量、发文国家、发文作者、研究机构、研究热点等方面进行统计分析。结果表明:自2000年以来,小麦低温逆境领域年发文数量总体呈波动上升趋势;以中国、美国和加拿大等国家为代表的农业大国均致力于该领域的研究;美国学者Skin⁃ner是该领域发文量最多的作者,与其他学者合作密切的有李向楠和Fowler;该领域文献多发表于《Molecular Genetics and Genomics》和《Annual Review of Plant Biology》等优质期刊上;俄罗斯科学院是该领域发文量最多的科研机构;耐低温小麦新品种培育、耐寒分子生物学研究以及提高小麦产质量等方面成为该领域的研究热点。 展开更多
关键词 小麦 低温逆境 Web of Science 研究热点 文献分析
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低温促进毛竹叶片类黄酮合成及相关基因的表达模式分析 被引量:2
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作者 肖晓燕 朱成磊 +4 位作者 杨克彬 刘燕 李紫阳 郭栋 高志民 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期101-110,共10页
类黄酮在植物耐低温胁迫方面发挥着重要作用,为揭示低温对毛竹(Phyllostachys edulis)叶片中类黄酮合成的影响,采用分光光度法测定了不同生长时期和低温胁迫下毛竹幼苗叶片中的类黄酮含量,通过生物信息学方法对毛竹类黄酮早期生物合成... 类黄酮在植物耐低温胁迫方面发挥着重要作用,为揭示低温对毛竹(Phyllostachys edulis)叶片中类黄酮合成的影响,采用分光光度法测定了不同生长时期和低温胁迫下毛竹幼苗叶片中的类黄酮含量,通过生物信息学方法对毛竹类黄酮早期生物合成关键酶基因进行了鉴定,并用qPCR方法分析了其表达模式。结果表明,随着叶片的生长,类黄酮含量呈现先升高后降低的趋势,而低温下,功能叶片中类黄酮含量则呈现上调趋势,且在8 h时达极显著水平。在毛竹基因组中鉴定了类黄酮早期生物合成3个酶基因家族共29个成员,包括20个查尔酮合酶基因(PeCHSs)、8个查尔酮异构酶基因(PeCHIs)和1个黄酮-3-烃化酶基因(PeF3H1),这些基因的启动子中均含有响应低温及其他非生物胁迫的调控元件。PeCHSs倾向在根和叶中表达,而PeCHIs为组成型表达。在不同生长时期的叶片中,仅PeCHS1表达与类黄酮的含量变化趋势一致;而低温胁迫下,3个PeCHSs、2个PeCHIs和PeF3H1在功能叶片中呈上调表达,与类黄酮含量变化趋势一致。因此,毛竹可能通过提高类黄酮早期生物合成酶基因的表达量促进类黄酮的合成来响应低温胁迫。 展开更多
关键词 毛竹 类黄酮 分子特征 低温胁迫 基因表达
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水杨酸引发提高低温下水稻种子萌发活力的生理与分子效应 被引量:2
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作者 陈兵先 张琪 +2 位作者 戴彰言 周旭 刘军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1220-1236,共17页
【目的】研究水杨酸(SA)引发对低温下水稻种子萌发活力的影响及生理响应,揭示SA引发对脱落酸(ABA)和赤霉素(GA)代谢途径相关基因以及细胞壁松弛基因的诱导模式,为水稻种子低温萌发研究提供理论依据。【方法】以籼型三系杂交水稻泰丰优20... 【目的】研究水杨酸(SA)引发对低温下水稻种子萌发活力的影响及生理响应,揭示SA引发对脱落酸(ABA)和赤霉素(GA)代谢途径相关基因以及细胞壁松弛基因的诱导模式,为水稻种子低温萌发研究提供理论依据。【方法】以籼型三系杂交水稻泰丰优208种子为材料,通过种子引发处理,分析SA对种子低温萌发活力及生理的影响,并通过qRT-PCR技术分析ABA、GA和扩展蛋白基因响应SA引发的表达模式。【结果】低温(15℃)显著推迟水稻种子萌发进程。在低温下萌发1 d种子中,其内源SA浓度是常温(28℃)下的1.7倍;但对于5 d的幼苗而言,低温下的SA浓度仅为常温下浓度的0.6%。SA引发可有效提高种子在低温下的萌发活力,尤其以2000μmol·L^(-1)SA效果最为显著,该浓度显著提高了低温下种子的发芽指数、活力指数、芽长、根长、鲜重和干重,其中活力指数分别为未引发种子(CK1)和水引发种子(CK2)的3和2倍。在生理指标方面,SA引发提高了低温萌发过程中种子的可溶性糖、脯氨酸以及活性氧含量,增加了总淀粉酶、β-淀粉酶、超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)活性,降低了丙二醛(MDA)含量。与CK1相比,2000μmol·L^(-1)SA引发将种子ABA含量降低了79%,同时将IAA和GA1含量增加了32.2%和2.66倍。在基因表达方面,对于2000μmol·L^(-1)SA引发的种子,ABA合成基因OsNCED2和OsNCED3的表达量分别比CK1降低了94.26%和90.24%;而ABA分解基因OsABA8’ox2和OsABA8’ox3的表达量分别为CK1的5.9和3.9倍。与CK1相比,SA引发显著上调了GA合成基因OsCPS1、OsKAO和OsGA20ox1的表达量,并显著下调GA分解基因OsGA2ox2和OsGA2ox6的表达量。在几个候选的细胞壁松弛因子扩展蛋白基因中,除了OsEXPB11外,其余几个同源基因均在一定程度上被引发而上调表达。与CK1相比,2000μmol·L^(-1)SA引发分别使OsEXPA2、OsEXPB4和OsEXPB6的表达量上调12.2、5.9和6.1倍。【结论】SA引发可显著缓解低温对于水稻种子萌发和幼苗生长的影响。可能是由于SA提高SOD、CAT等抗氧化酶活性,降低MDA的产生,增加可溶性糖和脯氨酸的含量,进而增强种子和幼苗对于低温的耐受能力。另一方面,SA引发通过降低种子内源ABA含量,增加GA1含量,增强总淀粉酶和β-淀粉酶活性,促进细胞壁松弛相关基因的表达,从而促进低温下的种子萌发和幼苗生长。 展开更多
关键词 水稻 低温胁迫 种子引发 水杨酸 生理指标 基因表达
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毛竹ICE基因家族的全基因组鉴定及低温胁迫下的表达模式分析
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作者 王书伟 周明兵 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期568-576,共9页
【目的】对毛竹Phyllostachys edulis ICE基因家族进行鉴定及分析,找出响应毛竹抗寒关键家族成员,研究毛竹ICE基因的生物学功能、响应低温胁迫的分子机制及遗传转化,为提高毛竹抗寒性奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法分析毛竹... 【目的】对毛竹Phyllostachys edulis ICE基因家族进行鉴定及分析,找出响应毛竹抗寒关键家族成员,研究毛竹ICE基因的生物学功能、响应低温胁迫的分子机制及遗传转化,为提高毛竹抗寒性奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法分析毛竹ICE基因家族成员,并对4、0、−2℃低温处理0(对照)、0.5、1.0、24.0、48.0 h的毛竹生理指标和ICE基因的表达模式进行分析。【结果】共鉴定了4个毛竹ICE基因。保守结构域和多重序列比对分析表明:PeICE基因结构高度相似。系统发育关系及启动子顺式作用元件分析显示:PeICE基因与水稻Oryza sativa亲缘关系更近,同时存在大量与非生物胁迫相关的顺式作用元件。活性氧自由基(ROS)染色发现随着处理时间增长,ROS染色逐渐加深,但是其0℃处理24.0 h、−2℃处理1.0 h后染色逐渐减弱。脯氨酸(Pro)质量摩尔浓度、超氧化物歧化酶(SOD)活性显示:4和0℃条件下,Pro质量摩尔浓度和SOD活性整体增加,但−2℃时低于对照。过氧化物酶(POD)活性显示:在3个低温处理下均增加。ICE基因表达模式分析发现:4、0℃处理时PeICE表达量整体增加,且都以PeICE3增量最明显;而−2℃处理下PeICE整体表达量水平低于对照。【结论】随着温度降低和处理时间增强,毛竹受到的损伤不断增强,其内酶活系统以及ICE基因积极响应低温胁迫,其中,PeICE3对低温胁迫最为敏感,但在−2℃时,ICE基因表达量并未增加,推测该基因家族响应了寒冷胁迫而非冷冻胁迫。 展开更多
关键词 毛竹 低温胁迫 ICE基因家族 基因鉴定 表达分析
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甘蓝型油菜BnAR基因家族全基因组鉴定与响应低温胁迫的表达分析
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作者 郭志婷 秦梦凡 +7 位作者 李浩东 赵飞雪 李心茹 杜媛媛 包顺君 李鸿洋 徐佳丽 黄镇 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2024年第6期27-37,共11页
为了解甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中BnAR基因的基本信息、进化关系及其在低温胁迫下的表达模式,对甘蓝型油菜BnAR基因家族成员进行全基因组鉴定,并探究低温胁迫下家族成员的表达情况。结果表明:甘蓝型油菜参考基因组中共鉴定出14个B... 为了解甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中BnAR基因的基本信息、进化关系及其在低温胁迫下的表达模式,对甘蓝型油菜BnAR基因家族成员进行全基因组鉴定,并探究低温胁迫下家族成员的表达情况。结果表明:甘蓝型油菜参考基因组中共鉴定出14个BnAR基因家族成员,分布在8条染色体上,将其命名为BnAR-1~BnAR-14,可分为ADC和DapDC两个亚家族;启动子顺式作用元件分析发现,BnAR基因家族成员的启动子区含有多种与激素和胁迫响应相关的元件;甘蓝型油菜组内共线性分析发现11对基因具有共线性关系,Ka/Ks分析发现所有同源基因的比值均小于0.5,说明BnAR基因家族在进化过程中受到严格的纯化选择;转录组数据分析表明,14个BnAR基因均响应低温胁迫,其中BnAR-4、BnAR-5、BnAR-11和BnAR-13受低温胁迫程度最为强烈,荧光定量PCR验证结果与转录组数据高度一致,因此可将这4个基因作为候选基因进行后续的功能验证。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 BnAR基因家族 生物信息学 表达模式:低温胁迫
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春尺蠖热激蛋白AcinHsp70基因的克隆、分子特性与表达分析 被引量:1
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作者 陈龙 朱圣杰 +3 位作者 崔阔澍 路慧 王靖 郝雅娴 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期128-136,共9页
【目的】克隆春尺蠖热激蛋白Hsp70基因,分析其理化性质与表达情况,探究该基因在春尺蠖应对外界不利环境中的作用。【方法】基于前期所测转录组数据(春尺蠖幼虫不同低温胁迫),克隆获取Hsp70基因,命名为AcinHsp70(GenBank登录号:OP750249)... 【目的】克隆春尺蠖热激蛋白Hsp70基因,分析其理化性质与表达情况,探究该基因在春尺蠖应对外界不利环境中的作用。【方法】基于前期所测转录组数据(春尺蠖幼虫不同低温胁迫),克隆获取Hsp70基因,命名为AcinHsp70(GenBank登录号:OP750249);利用生物信息分析软件对Hsp70基因的理化性质进行分析;采用qPCR技术检测AcinHsp70基因在不同温度(-10、-5、0、5和25℃)胁迫中回温与不回温及4℃不同时间处理下的表达谱。【结果】春尺蠖AcinHsp70基因完整CDS序列全长1899 bp,编码633个氨基酸,蛋白质预测分子量为69.91 kDa,预测等电点为5.51。在N端均不含信号肽且无跨膜区。磷酸位点检测分别发现丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸位点24、26和8个;未发现糖基化位点。该蛋白的平均亲水性为-0.507,预测不稳定系数为33.19,故该蛋白属于亲水稳定蛋白,亚细胞定位结果显示,其主要位于细胞质。序列一致性比对与系统进化树分析结果显示,春尺蠖与庆网蛱蝶(Melitaea cinxia)亲缘关系最近,序列一致性达92.91%。基因表达结果显示,不同温度(-10℃除外)胁迫下,AcinHsp70基因表达量均无明显差异,回温后表达量显著上调。AcinHsp70基因表达量总体呈先升后降趋势,在4℃处理1 h后表达量达到最大值。【结论】AcinHsp70基因与春尺蠖应对低温胁迫的响应密切相关,结果有助于揭示该基因在低温胁迫下的分子功能。 展开更多
关键词 春尺蠖 热激蛋白70 分子特性 低温胁迫 表达谱
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甜椒幼苗低温胁迫的生理响应与转录组分析
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作者 马馨怡 林艺辉 +4 位作者 余松金 倪辉 林蔚 韦幂 陈汉鑫 《福建农业科技》 CAS 2024年第4期6-16,共11页
为了阐明甜椒响应低温胁迫的分子机制,对低温胁迫时甜椒幼苗的MDA含量、SOD活性以及光合作用相关参数进行了测定,并结合转录组测序分析。结果表明:低温胁迫3 d时甜椒MDA含量显著升高,SOD活性显著降低,光合相关参数显著下降;与低温处理... 为了阐明甜椒响应低温胁迫的分子机制,对低温胁迫时甜椒幼苗的MDA含量、SOD活性以及光合作用相关参数进行了测定,并结合转录组测序分析。结果表明:低温胁迫3 d时甜椒MDA含量显著升高,SOD活性显著降低,光合相关参数显著下降;与低温处理前相比,转录组测序分析结果显示检测出差异基因主要涉及酶系统、光合作用、信号传导以及相关转录因子,其中SOD相关基因CaSOD呈示上调表达,光合作用关键基因CaCP4与CaHCR的表达量则显著下调。研究结果为深入解析甜椒幼苗响应低温胁迫的分子机制及甜椒抗低温育种奠定了基础。 展开更多
关键词 甜椒 低温胁迫 转录组 差异表达基因
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黄瓜CsWRKY20基因的克隆及其生物信息学和高温胁迫响应分析
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作者 陈岳 鲍文敏 +1 位作者 徐俐琴 张微微 《山东农业科学》 北大核心 2024年第7期32-38,共7页
黄瓜(Cucumis sativus)是中国设施栽培的主要蔬菜作物之一。高温会造成黄瓜生长受阻、抗性降低,导致产量和品质下降。本研究采用同源克隆方法,从黄瓜叶片的cDNA中克隆了一个WRKY转录因子基因CsWRKY20。生物信息学分析结果表明,CsWRKY20... 黄瓜(Cucumis sativus)是中国设施栽培的主要蔬菜作物之一。高温会造成黄瓜生长受阻、抗性降低,导致产量和品质下降。本研究采用同源克隆方法,从黄瓜叶片的cDNA中克隆了一个WRKY转录因子基因CsWRKY20。生物信息学分析结果表明,CsWRKY20基因的CDS长1 602 bp,共编码533个氨基酸;CsWRKY20蛋白分子量为132 959.43 Da,等电点为4.97,定位于细胞核,含有两个典型的保守WRKY结构域,与甜瓜CmWRKY20蛋白的亲缘关系最近。qRT-PCR检测CsWRKY20基因在黄瓜不同器官中的表达情况,发现其在营养器官和生殖器官中均有表达,在果刺中表达量最高。五叶期黄瓜幼苗受42℃高温胁迫1 h后,CsWRKY20的表达水平显著升高,6 h后相对表达量恢复到初始水平。本研究结果可为黄瓜耐高温品种选育提供一定的理论基础。 展开更多
关键词 黄瓜 WRKY转录因子 生物信息学分析 高温胁迫 基因表达分析
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不同产地草果种质资源抗寒性评价
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作者 赵新宇 苏俊宇 +3 位作者 杨伟 杨建宁 童开荣 杨志清 《中国农学通报》 2024年第15期73-79,共7页
本研究旨在筛选抗寒能力较强的草果种质资源,为草果的杂交育种和栽培提供重要依据,推动草果产业的可持续发展。将出苗至移栽满6个月的不同产地的草果植株作为材料,进行低温胁迫3 d(低温恒温培养箱参数:4℃,12 h黑暗,12 h光照,90%湿度),... 本研究旨在筛选抗寒能力较强的草果种质资源,为草果的杂交育种和栽培提供重要依据,推动草果产业的可持续发展。将出苗至移栽满6个月的不同产地的草果植株作为材料,进行低温胁迫3 d(低温恒温培养箱参数:4℃,12 h黑暗,12 h光照,90%湿度),测定其生理生化指标,运用相关性分析、主成分分析和隶属函数分析对不同产地的草果种质资源进行抗寒性综合评价。结果表明:低温胁迫下(4℃),草果叶片叶绿素含量和抗氧化酶活性下降,电导率、丙二醛含量、可溶性糖含量、可溶性蛋白含量呈现不同程度上升。通过隶属函数分析得到抗寒性强弱综合排序依次为:DH-LC>BS-TC>NJ-GS-GLB>WS-MG>PE-ZY>PE-LC。6个不同产地的供试种质中DH-LC的抗寒能力最强,可将DH-LC作为草果抗寒杂交育种和栽培的良好材料。 展开更多
关键词 草果 种质资源 低温胁迫 抗寒性筛选 隶属函数分析
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嗜卷书虱Cu/Zn-SOD1,Cu/Zn-SOD2和Fe/Mn-SOD的克隆及对高低温胁迫的响应
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作者 王潇 徐德均 +4 位作者 朱斌健 徐俊延 敖国红 张长禹 韩开宇 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期1-8,共8页
【目的】揭示嗜卷书虱Liposcelis bostrychophila超氧化物歧化酶基因在响应高低温胁迫中的作用。【方法】通过RT-PCR克隆嗜卷书虱3个超氧化物歧化酶基因Cu/Zn-SOD1,Cu/Zn-SOD2和Fe/Mn-SOD cDNA,利用生物信息学方法分析其序列特征;采用RT... 【目的】揭示嗜卷书虱Liposcelis bostrychophila超氧化物歧化酶基因在响应高低温胁迫中的作用。【方法】通过RT-PCR克隆嗜卷书虱3个超氧化物歧化酶基因Cu/Zn-SOD1,Cu/Zn-SOD2和Fe/Mn-SOD cDNA,利用生物信息学方法分析其序列特征;采用RT-qPCR技术检测Cu/Zn-SOD1,Cu/Zn-SOD2和Fe/Mn-SOD在高温(42℃)和低温(4℃)胁迫下0,1和2 h时成虫中的相对表达量。【结果】克隆获得嗜卷书虱LbCu/Zn-SOD1,LbCu/Zn-SOD2和LbFe/Mn-SOD(GenBank登录号分别为OQ938782,OQ938783和OQ938784),开放阅读框(ORF)分别长465,630和636 bp,分别编码154,209和211个氨基酸,编码蛋白质相对分子量分别为15.85,22.33和23.72 kD,等电点分别为6.17,7.68和6.79;LbCu/Zn-SOD1和LbCu/Zn-SOD2分别具有1个和2个Cu/Zn超氧化物歧化酶特征,LbFe/Mn-SOD具有1个Fe/Mn超氧化物歧化酶特征。系统进化分析结果表明,昆虫Cu/Zn-SOD1,Cu/Zn-SOD2和Fe/Mn-SOD高度保守。高温42℃胁迫诱导嗜卷书虱成虫中LbCu/Zn-SOD1,LbCu/Zn-SOD2和LbFe/Mn-SOD的表达,其中LbCu/Zn-SOD1和LbCu/Zn-SOD2表达量在1和2 h时均显著高于对照;LbFe/Mn-SOD表达量在1 h时显著低于对照,而在2 h时显著高于对照。低温4℃胁迫下,与对照相比,嗜卷书虱成虫中LbCu/Zn-SOD1和LbCu/Zn-SOD2的表达量在1 h时无显著差异,而LbFe/Mn-SOD的表达量显著降低,LbCu/Zn-SOD1,LbCu/Zn-SOD2和LbFe/Mn-SOD的表达量在2 h时均显著升高。【结论】超氧化物歧化酶基因LbCu/Zn-SOD1,LbCu/Zn-SOD2和LbFe/Mn-SOD参与了嗜卷书虱对极端温度胁迫的耐受性。 展开更多
关键词 嗜卷书虱 超氧化物歧化酶 基因克隆 温度胁迫 表达分析
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