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长江中下游5个湖泊黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)种群线粒体细胞色素b基因的遗传变异分析
被引量:
23
1
作者
钟立强
刘朋朋
+5 位作者
潘建林
王明华
陈友明
秦钦
边文冀
陈校辉
《湖泊科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期302-308,共7页
对长江中下游5个湖泊的黄颡鱼种群的线粒体DNA细胞色素b基因进行了PCR扩增、测序,获得了955 bp的序列.分析显示,cyt b序列中A+T含量略高于G+C含量,共检测到54个变异位点,60个样本得到37个单倍型,平均单倍型多样性为0.945±0.018,核...
对长江中下游5个湖泊的黄颡鱼种群的线粒体DNA细胞色素b基因进行了PCR扩增、测序,获得了955 bp的序列.分析显示,cyt b序列中A+T含量略高于G+C含量,共检测到54个变异位点,60个样本得到37个单倍型,平均单倍型多样性为0.945±0.018,核苷酸多样性为0.00419±0.00043,遗传多样性表现中等.太湖种群与滆湖种群间的遗传距离最远为0.00651,鄱阳湖种群和巢湖种群之间遗传距离最近为0.00375.分子方差分析(AMOVA)表明,群体间遗传分化系数Fst为0.0684,几乎所有变异都来自群体内,群体间遗传分化极小.cyt b序列构建UPGMA系统进化树显示,5个种群没有分化成不同的分枝谱系,种群间存在广泛的基因交流.
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关键词
黄颡鱼
线粒体DNA
细胞色素
b
基因
遗传变异
长江中下游
下载PDF
职称材料
怒江濒危鱼类角鱼种群遗传结构研究
被引量:
8
2
作者
张东亚
陈勇
+4 位作者
刘绍平
汪登强
张家波
段辛斌
陈大庆
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2009年第2期3-7,共5页
测定了怒江角鱼(Epalzeorhynchus bicornis)4个群体共70尾个体的线粒体DNA cytb基因序列,以探讨种群遗传结构和遗传多样性。结果显示:1140 bp的cytb基因共检测到13个变异位点,70个样本得到16个单倍型,平均单倍型多样性(h)为0.579,核苷...
测定了怒江角鱼(Epalzeorhynchus bicornis)4个群体共70尾个体的线粒体DNA cytb基因序列,以探讨种群遗传结构和遗传多样性。结果显示:1140 bp的cytb基因共检测到13个变异位点,70个样本得到16个单倍型,平均单倍型多样性(h)为0.579,核苷酸多样性(π)为0.00070,遗传多样性表现为较低。木城群体和泸水群体之间的遗传距离最远0.00080,泸水群体和道街群体之间的遗传距离最近为0.00059。Fu′Fs中性检验和碱基岐点分布分析暗示了角鱼在历史上曾经历过遗传瓶颈和种群扩张。分子方差分析(AMOVA)表明,群体间总遗传分化系数Fst=0.0049(P>0.05),几乎所有变异均来自于群体内,群体间未出现遗传分化,提示群体内存在广泛的基因交流。
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关键词
角鱼(Epalzeorhynchus
b
icornis)
细胞色素
b
基因
遗传多样性
怒江
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职称材料
题名
长江中下游5个湖泊黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)种群线粒体细胞色素b基因的遗传变异分析
被引量:
23
1
作者
钟立强
刘朋朋
潘建林
王明华
陈友明
秦钦
边文冀
陈校辉
机构
江苏省淡水水产研究所
南京师范大学生命科学学院
出处
《湖泊科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期302-308,共7页
基金
江苏省科技支撑计划项目(BE2010376)
江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(11)1036]联合资助
文摘
对长江中下游5个湖泊的黄颡鱼种群的线粒体DNA细胞色素b基因进行了PCR扩增、测序,获得了955 bp的序列.分析显示,cyt b序列中A+T含量略高于G+C含量,共检测到54个变异位点,60个样本得到37个单倍型,平均单倍型多样性为0.945±0.018,核苷酸多样性为0.00419±0.00043,遗传多样性表现中等.太湖种群与滆湖种群间的遗传距离最远为0.00651,鄱阳湖种群和巢湖种群之间遗传距离最近为0.00375.分子方差分析(AMOVA)表明,群体间遗传分化系数Fst为0.0684,几乎所有变异都来自群体内,群体间遗传分化极小.cyt b序列构建UPGMA系统进化树显示,5个种群没有分化成不同的分枝谱系,种群间存在广泛的基因交流.
关键词
黄颡鱼
线粒体DNA
细胞色素
b
基因
遗传变异
长江中下游
Keywords
Pelteo
b
agrus fulvidraco
Mitochondrial DNA
eyt b
genetic diversity
middle and lower reaches of the Yangtze River
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
怒江濒危鱼类角鱼种群遗传结构研究
被引量:
8
2
作者
张东亚
陈勇
刘绍平
汪登强
张家波
段辛斌
陈大庆
机构
华中农业大学水产学院
中国水产科学研究院长江水产研究所
西南大学动物科技学院
中国水产科学研究院淡水渔业研究中心
出处
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2009年第2期3-7,共5页
基金
国家环境保护部项目(EPA4261)资助
文摘
测定了怒江角鱼(Epalzeorhynchus bicornis)4个群体共70尾个体的线粒体DNA cytb基因序列,以探讨种群遗传结构和遗传多样性。结果显示:1140 bp的cytb基因共检测到13个变异位点,70个样本得到16个单倍型,平均单倍型多样性(h)为0.579,核苷酸多样性(π)为0.00070,遗传多样性表现为较低。木城群体和泸水群体之间的遗传距离最远0.00080,泸水群体和道街群体之间的遗传距离最近为0.00059。Fu′Fs中性检验和碱基岐点分布分析暗示了角鱼在历史上曾经历过遗传瓶颈和种群扩张。分子方差分析(AMOVA)表明,群体间总遗传分化系数Fst=0.0049(P>0.05),几乎所有变异均来自于群体内,群体间未出现遗传分化,提示群体内存在广泛的基因交流。
关键词
角鱼(Epalzeorhynchus
b
icornis)
细胞色素
b
基因
遗传多样性
怒江
Keywords
Epalzeorhynchus
b
icornis
eyt b
Genetic diversity
Nujiang River
分类号
S965.116 [农业科学—水产养殖]
Q959.468 [生物学—动物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长江中下游5个湖泊黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)种群线粒体细胞色素b基因的遗传变异分析
钟立强
刘朋朋
潘建林
王明华
陈友明
秦钦
边文冀
陈校辉
《湖泊科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013
23
下载PDF
职称材料
2
怒江濒危鱼类角鱼种群遗传结构研究
张东亚
陈勇
刘绍平
汪登强
张家波
段辛斌
陈大庆
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2009
8
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职称材料
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