老年患者医院感染的肠外致病性大肠埃希菌毒力因子检测及SNP分析

目的了解老年患者医院感染肠外致病性大肠埃希菌(Ex PEC)30种毒力因子的检出情况及其分子流行病学特点。方法收集天津地区引起老年患者医院感染的非重复肠外致病性大肠埃希菌140株,采用多重PCR方法检测其毒力因子基因的存在情况,比较不同标本来源Ex PEC毒力因子基因的检出率。从检出fim H基因的菌株中选取50株,进行fim H基因的扩增与测序,将全部测序结果与大肠埃希菌对照株CFT037、UTI89和参考株K-12 Gen-Bank数据库中的fim H基因序列均输入软件DNAMAN 6.0.3.93中寻找单核苷酸多态性(SNPs),后将53个fim H基因序列输入软件MEGA4,进行基因分型和树状图的构建。分型结果结合病例回顾,综合分析医院内大肠埃希菌克隆流行情况。结果 Ex PEC中毒力因子基因fim H、tra T、fyu A、iut A和kps MT II的检出率较高,非尿标本来源Ex PEC的毒力因子基因kps M II、K5、pap C、pap EF、pap G allele II(Internal)、pap A、cnf1(CNF)、sfa/foc DE和rfc的检出率均比尿标本来源Ex PEC的高。53株菌fim H基因SNPs分析显示,在57个多态位点中发现有60种SNPs。53株菌被分为25个基因型,其中有11组菌株的基因指纹图谱分别完全一致。未发现不同医院的菌株具有相同的基因型。结论老年患者医院感染的肠外致病性大肠埃希菌携带多种毒力因子基因;非尿标本来源的大肠埃希菌可能比尿液标本来源的菌株致病性更强;fim H基因SNPs分型适用于医院大肠埃希菌克隆流行的调查,值得在今后的临床工作中推广。