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Specific protein expression in a rat model of early focal cerebral ischemia:Fluorescent two-dimensional difference gel electrophoresis
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作者 Xueling Ma Wei Yang +4 位作者 Xinmei Jiang Fuchun Li Xia Li Linlin Ye Kangding Liu 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2010年第3期209-213,共5页
BACKGROUND: The use of fluorescent two-dimensional difference gel electrophoresis (2D-DIGE) has been shown to compensate for the shortcomings of conventional two-dimensional gel electrophoresis, such as poor repeat... BACKGROUND: The use of fluorescent two-dimensional difference gel electrophoresis (2D-DIGE) has been shown to compensate for the shortcomings of conventional two-dimensional gel electrophoresis, such as poor repeatability and large systematic errors. However, little information is presently available regarding the use of 2D-DIGE to investigate mechanisms of ischemic cerebrovascular diseases. Plasma and body fluids have been utilized in proteomic technology to study ischemic cerebrovascular diseases. OBJECTIVE: To perform proteomic analysis of fresh rat brain tissue in peripheral ischemic regions using 2D-DIGE 6 hours after middle cerebral artery occlusion (MCAO), and to identify specific proteins closely associated with early ischemic cerebrovascular diseases. DESIGN, TIME AND SETTING: Proteomics-based, randomized, controlled, animal experiment was performed at the Laboratories of Neurology and Proteomics, Jilin University between January and April 2006. MATERIALS: 2, 3, 5-triphenyl tetrazolium chloride was purchased from Sigma, USA. Ettan DALTSix system, DeCyder DIA V5.0 differential analysis software, and Ettan matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometer (MALDI-TOF-MS) were purchased from Amersham Bioscience, Sweden. METHODS: Eight healthy, male, Wistar rats were randomized to experimental and control groups, with four rats in each group. In the experimental group, rat models of focal cerebral ischemia were established by MCAO. In the control group, the internal and external carotid arteries were exposed and then immediately sutured, and the remaining procedures were identical to the experimental group. MAIN OUTCOME MEASURES: At 6 hours after cerebral ischemia, protein expression in the peripheral ischemia region of the experimental group was compared with the control group using 2D-DIGE. Protein spots that exhibited statistical differences between experimental and control groups with 〉 1.4 attributable risk were screened using DeCyder DIA V5.0 differential analysis software. Differential proteins were identified using MALDI-TOF-MS. RESULTS: Triphenyl tetrazolium chloride staining results revealed pink, normal brain tissue and white, ischemic brain tissue, suggesting successful MCAO establishment. The average matching rate of four 2D-DIGE gels was 92.4%. There were (1 758 ± 43) protein spots on each gel, with similar distribution modes. At 6 hours after focal cerebral ischemia, 13 protein spots exhibited marked expression changes, including significantly increased (n = 7) and decreased (n = 6) expression (P 〈 0.05). MALDI-TOF-MS results revealed two differential protein spots: a-tubulin and heat shock protein 27, which were significantly decreased in the experimental group compared with the control group (P 〈 0.05). CONCLUSION: Thirteen protein spots with expression changes were revealed by 2D-DIGE proteomics technology. Of them, a-tubulin and heat shock protein 27 expressions were markedly decreased during the early stage of cerebral ischemia. These two proteins were presumed to be proteins associated with early ischemic cerebrovascular diseases. 展开更多
关键词 fluorescent two-dimensional difference gel electrophoresis cerebral ischemia mass spectrometry rats PROTEOMICS neural regeneration
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Proteome analysis of round-headed and normal spermatozoa by 2-D fluorescence difference gel electrophoresis and mass spectrometry 被引量:9
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作者 Ting-Ting Liao Zhen Xiang Wen-Bing Zhu Li-Qing Fan 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2009年第6期683-694,共12页
Globozoospermia is a severe form of teratozoospermia characterized by round-headed spermatozoa with an absent acrosome, an aberrant nuclear membrane and midpiece defects. Globozoospermia is diagnosed by the presence o... Globozoospermia is a severe form of teratozoospermia characterized by round-headed spermatozoa with an absent acrosome, an aberrant nuclear membrane and midpiece defects. Globozoospermia is diagnosed by the presence of 100% round-headed spermatozoa on semen analysis, and patients with this condition are absolutely infertile. The objective of this study was to investigate the differences in protein expression between human round- headed and normal spermatozoa. Two-dimensional (2-D) fluorescence difference gel electrophoresis (DIGE) coupled with mass spectrometry (MS) was used in this study. Over 61 protein spots were analysed in each paired normal/round-headed comparison, using DIGE technology along with an internal standard. In total, 35 protein spots identified by tandem mass spectrometry (MS/MS) exhibited significant changes (paired t-test, P 〈 0.05) in the expression level between normal and round-headed spermatozoa. A total of nine proteins were found to be upregulated and 26 proteins were found to be downregulated in round-headed spermatozoa compared with normal spermatozoa. The differentially expressed proteins that we identified may have important roles in a variety of cellular processes and structures, including spermatogenesis, cell skeleton, metabolism and spermatozoa motility. 展开更多
关键词 differential protein GLOBOZOOSPERMIA mass spectrometry (MS) two-dimensional difference gel electrophoresis (2-D DIGE)
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Gelsolin表达下调降低鼠源肝癌细胞的侵袭能力 被引量:2
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作者 王绍清 孙明忠 +2 位作者 刘淑清 王波 唐建武 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2009年第16期948-952,共5页
目的:研究高低淋巴道转移力细胞株Hca-F(淋巴道转移>80%)和Hca-P(淋巴道转移<30%)细胞中gelsolin的表达及其对Hca-F细胞侵袭能力的影响,阐明gelsolin在肝癌淋巴道转移过程中发挥的作用方法:应用荧光差异双向凝胶电泳技术及质谱定... 目的:研究高低淋巴道转移力细胞株Hca-F(淋巴道转移>80%)和Hca-P(淋巴道转移<30%)细胞中gelsolin的表达及其对Hca-F细胞侵袭能力的影响,阐明gelsolin在肝癌淋巴道转移过程中发挥的作用方法:应用荧光差异双向凝胶电泳技术及质谱定量和鉴定gelsolin在Hca-F细胞和Hca-P细胞中的表达;构建pSileneer-shR-NA-gelsolin表达载体,稳定转染Hca-F细胞并获得gelsolin的表达稳定下调的Hca-F细胞株,同时建立稳定转染pSilencer-无关序列Hca-F细胞株作为对照,在mRN水平和蛋白水平检测干扰后gelsolin的表达;Transwell 小室体外侵袭试验观察下调gelsolin表达后对Hca-F 细胞侵袭能力的影响结果:Gelsolin基因在Hca-F细胞中表达高于是Hca-P细胞( F/P= 1.7 );获得gelsolin稳定下调的Hca-F细胞株,RT-PCR和Wesiern Blot分析结果表明在稳定转染Hca-F细胞中,gelsolin在基因水平和蛋白水平的表达明显下调;在体外侵袭实验中,Hca-F细胞、对照组细胞、干扰组细胞穿过人工基底膜的细胞在570nm处的吸光度分别为0.2007±0.0129、0.2236±0.0446和0.1557±0.0051;表明下调gelsolin蛋白表达后,干扰组细胞穿过人工基底膜的细胞吸光度显著降低(P<0.05)。下调Hca-F细胞中gelsolin的表达后,转移的肿瘤细胞数量减少,癌细胞的侵袭能力下降结论:通过抑制gelsoin基因和蛋白的表达,可以降低鼠源肝癌细胞Hca-F侵袭能力的作用。 展开更多
关键词 gelSOLIN 荧光差异双向凝胶电泳 肝肿瘤 侵袭 淋巴道转移
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采用定量蛋白质组学技术筛选小鼠肝癌淋巴道转移相关蛋白 被引量:21
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作者 孙成荣 唐建武 +7 位作者 孙明忠 刘淑清 张宏颖 王波 宋波 张亚楠 张竹清 赵志英 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第8期856-864,共9页
淋巴道转移是上皮来源恶性肿瘤转移的早期阶段,其发生机制不清,一直是肿瘤学研究面临的难题,为寻找淋巴道转移相关蛋白,以一对来源于同一亲本细胞,且淋巴道转移潜能显著不同的小鼠肝癌腹水型细胞株为研究对象,其中Hca-F为高淋巴道转移... 淋巴道转移是上皮来源恶性肿瘤转移的早期阶段,其发生机制不清,一直是肿瘤学研究面临的难题,为寻找淋巴道转移相关蛋白,以一对来源于同一亲本细胞,且淋巴道转移潜能显著不同的小鼠肝癌腹水型细胞株为研究对象,其中Hca-F为高淋巴道转移力细胞株,Hca-P为低淋巴道转移力细胞株,采用定量蛋白质组学技术——荧光差异双向凝胶电泳,建立了高低淋巴道转移力小鼠肝癌细胞荧光差异蛋白表达图谱,高通量筛选与肿瘤淋巴道转移相关的蛋白质.经DeCyde软件分析,共得到163个有统计学差异的蛋白质点,选择2倍以上的差异性蛋白质点23个,经质谱鉴定得到17个蛋白质,在Hca-F中高表达的蛋白质有7个:转羟乙醛酶、波形蛋白、肌酸激酶(脑)、膜联蛋白7、膜联蛋白5、烯酰辅酶A水合酶1(过氧化物酶体)、核内异质核糖核蛋白A2/B1异构体1.而在Hca-F中低表达的蛋白质有10个:真核翻译延长因子2、Ero1样蛋白、乙醛脱氢酶2(线粒体)、苹果酸盐脱氢酶2(NAD)、β-内酰胺酶2、谷胱甘肽S转移酶"1、泛素C末端水解酶同工酶L3、内质网蛋白29(前体)、溶血磷脂酶1、微管不稳定蛋白.这些差异性蛋白质的功能涉及到代谢、蛋白质分泌、蛋白质结合、核苷酸结合,钙离子结合、凋亡和调节生长等过程.对这些蛋白质功能的进一步验证,将有助于解析肿瘤淋巴道转移的分子机制. 展开更多
关键词 肝癌 淋巴道转移 定量蛋白质组 荧光差异双向凝胶电泳 质谱
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人膝骨关节炎血清生物学标志物的筛选 被引量:7
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作者 曾花 蔡道章 +5 位作者 陈郁鲜 曾春 叶志强 庄泽 黎明涛 胡坤华 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期884-888,共5页
目的:比较膝骨关节炎患者与正常人血清蛋白质组的差异,筛选其能用于骨关节炎诊断、治疗或发病机制研究的血清生物学标志物。方法:利用双向荧光差异凝胶电泳技术比较膝骨关节炎患者血清(4例)与健康志愿者血清(4例)蛋白图谱的差异,使用基... 目的:比较膝骨关节炎患者与正常人血清蛋白质组的差异,筛选其能用于骨关节炎诊断、治疗或发病机制研究的血清生物学标志物。方法:利用双向荧光差异凝胶电泳技术比较膝骨关节炎患者血清(4例)与健康志愿者血清(4例)蛋白图谱的差异,使用基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱及生物信息学相关技术对获得的差异蛋白进行鉴定和初步分析,并用Western blotting进一步验证所鉴定的蛋白。结果:成功建立了骨关节炎血清差异蛋白质组学的研究方法;通过质谱分析初步鉴定出8个差异蛋白,其中5个蛋白在膝骨关节炎组表达上调,3个蛋白在膝骨关节炎组表达下调。Western blotting进一步验证得到α2-巨球蛋白在膝骨关节炎组表达上调,与双向荧光胶内差异凝胶电泳技术联合质谱分析的结果一致。结论:膝骨关节炎患者血清与正常人血清蛋白表达存在明显差异,其中α2-巨球蛋白可作为骨关节炎潜在的疾病相关生物学标志物进一步研究,为骨关节炎的诊断、治疗和发病机制的研究提供新的线索和实验基础。 展开更多
关键词 骨关节炎 血清 生物学标记物 双向荧光差异凝胶电泳
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双向凝胶电泳中三种蛋白质检测方法的比较 被引量:11
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作者 马增春 高月 +1 位作者 吕俊萍 王升启 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期551-556,共6页
高通量双向电泳是蛋白质组学的核心 ,双向电泳凝胶上蛋白质点的检测方法应具有灵敏度高、线性范围宽和兼容质谱鉴定等优点 .采用差异凝胶电泳 (differencegelelectrophoresis ,DIGE)技术以Cy3(1 (5 carboxypentyl) 1′ propylindocar... 高通量双向电泳是蛋白质组学的核心 ,双向电泳凝胶上蛋白质点的检测方法应具有灵敏度高、线性范围宽和兼容质谱鉴定等优点 .采用差异凝胶电泳 (differencegelelectrophoresis ,DIGE)技术以Cy3(1 (5 carboxypentyl) 1′ propylindocarbocyaninehalideN hydroxysuccinimidylester)和Cy5 (1 (5 carboxypentyl) 1′ methylindodicarbocyaninehalideN hydroxysuccinimidylester)荧光分别标记正常和TNF α处理细胞的蛋白质 ,用Cy2 (3 (4 carboxymethyl)phenylmethyl) 3′ ethyloxacarbocyaninehalideN hydroxysuccinimidylester)荧光标记正常和TNF α处理细胞蛋白质的等量混合样品作为内标 ,混合 3种荧光标记的蛋白质后 ,在同一等电聚焦胶条进行聚焦 ,然后在聚丙烯酰胺凝胶上进行第二向电泳 ,用 3种波长的激光激发扫描得到凝胶图象 ,DIGE中多个样品在同一条件下电泳 ,因而匹配率高 ,且引入内标使蛋白质点的检测与定量更为准确 .DIGE技术与质谱相结合 ,实现了高通量和相对准确定量 .与硝酸银和考马斯亮蓝染色结果相比较 ,DIGE技术具有灵敏度高。 展开更多
关键词 荧光标记 双向电泳 图象分析 蛋白质组学
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CA125阴性卵巢癌血清标志物差异蛋白质组学的研究 被引量:12
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作者 赵群 段微 +2 位作者 吴玉梅 钱小红 邓小虹 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2008年第5期337-341,共5页
目的:通过二维差异凝胶电泳(2-DEDIGE)和基质辅助激光解吸离子化-飞行时间(MALDI-TOF/TOF)串联质谱差异蛋白质组学方法寻找CA125阴性卵巢上皮癌血清标志物,以提高卵巢上皮癌诊断的灵敏度和特异度。方法:收集103例卵巢上皮癌,60例正常对... 目的:通过二维差异凝胶电泳(2-DEDIGE)和基质辅助激光解吸离子化-飞行时间(MALDI-TOF/TOF)串联质谱差异蛋白质组学方法寻找CA125阴性卵巢上皮癌血清标志物,以提高卵巢上皮癌诊断的灵敏度和特异度。方法:收集103例卵巢上皮癌,60例正常对照,63例卵巢良性肿瘤、63例盆腔良性病变的血清。按年龄匹配,选取6例CA125阴性卵巢癌和6例正常对照组的血清等容积混合。祛除血清高丰度白蛋白和IgG后进行2-DEDIGE。实验重复3次。通过DeCyder软件分析得出有显著差异的蛋白质点,MALDI-TOF/TOF鉴定差异蛋白质。分别用WesternBlot和ELISA方法验证获选的血清标志物。结果:(1)经2-DEDIGE实验得出有显著差异的蛋白质点41个,MALDI-TOF/TOF成功鉴定了其中的28个蛋白质点。上调最显著的蛋白质点为结合珠蛋白(haptoglo-bin,Hp),下调最显著的蛋白质为转铁蛋白(transferrin,Tf);(2)WesternBlot和ELISA验证结果显示,CA125阴性卵巢上皮癌血清Hp和Tf与正常对照有显著差异(P<0.001);(3)CA125+Hp+Tf联合检测(两者或两者以上阳性判断为阳性)诊断卵巢上皮癌的灵敏度和特异度高于CA125、Hp和Tf单独检测。结论:Hp和Tf是卵巢上皮癌血清中差异表达的蛋白质,可作为卵巢上皮癌的血清标志物。CA125+Hp+Tf联合检测有助于提高卵巢上皮癌诊断的灵敏度和特异度,有助于提高CA125阴性卵巢上皮癌的检出率。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 肿瘤标记 生物 双向差异凝胶电泳 触珠蛋白类 转铁蛋白
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基于差异凝胶双向电泳技术的冠心病不稳定性心绞痛血瘀证患者血浆差异蛋白特征研究 被引量:17
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作者 赵慧辉 陈建新 +1 位作者 史琦 王伟 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期488-492,共5页
目的通过对冠心病心绞痛血瘀证患者和健康人血浆的差异凝胶电泳图谱检测,寻找其血浆差异蛋白,探索其蛋白质组学特点。方法采用差异凝胶双向电泳和串联质谱对12例冠心病不稳定性心绞痛气虚血瘀证患者、12例痰瘀互阻证患者和12名健康人去... 目的通过对冠心病心绞痛血瘀证患者和健康人血浆的差异凝胶电泳图谱检测,寻找其血浆差异蛋白,探索其蛋白质组学特点。方法采用差异凝胶双向电泳和串联质谱对12例冠心病不稳定性心绞痛气虚血瘀证患者、12例痰瘀互阻证患者和12名健康人去高丰度蛋白血浆进行比较蛋白质组学研究,寻找心绞痛血瘀证血浆差异蛋白。结果初步发现在冠心病不稳定性心绞痛气虚血瘀证和痰瘀互阻证两组患者表达均变化的蛋白有Haptoglobin β chain、DBP、HBB、HBA、Transthyretin、ApoA-Ⅰ、ApoA-Ⅳ。仅在冠心病不稳定性心绞痛痰瘀互阻证表达变化的蛋白有Haptoglobin α1 chain、α-1-acid glycoprotein、ApoC-Ⅲ、ApoA-Ⅱ、ApoC-Ⅱ、ApoJ、Haptoglobin α 2 chain。仅在冠心病不稳定性心绞痛气虚血瘀证表达变化的蛋白α1-antitryp-sin、Fibrinogen γ chain、Fibrin β。结论冠心病不稳定性心绞痛气虚血瘀证与痰瘀互阻证在蛋白质层面的部分共性特征表现为炎症反应、代谢紊乱(包括血脂、血氧等)。 展开更多
关键词 不稳定性心绞痛 血瘀证 差异凝胶双向电泳 蛋白质组学
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杨树接种溃疡病菌Botryosphaeria dothidea后蛋白质表达差异分析 被引量:7
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作者 理永霞 吕全 +3 位作者 梁军 严冬辉 贾秀贞 张星耀 《南京林业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期1-6,共6页
应用双向凝胶电泳技术,分析了抗病毛白杨和感病北京杨接种溃疡病菌Botryosphaeria do-thidea前后的蛋白质表达差异。通过比较两个树种接菌前后的双向凝胶电泳图谱,结果得到在两树种之间共有35个3倍蛋白质差异点,其中接种前毛白杨与北京... 应用双向凝胶电泳技术,分析了抗病毛白杨和感病北京杨接种溃疡病菌Botryosphaeria do-thidea前后的蛋白质表达差异。通过比较两个树种接菌前后的双向凝胶电泳图谱,结果得到在两树种之间共有35个3倍蛋白质差异点,其中接种前毛白杨与北京杨相比上调蛋白4个,下调15个;接种后相比则上调蛋白7个,下调9个。同一树种内,毛白杨接种后与对照相比检测到8个上调蛋白,6个下调蛋白;北京杨接种后与对照相比有8个上调蛋白、10个下调蛋白。对这些差异蛋白产生条件及含量进行分析,笔者认为接菌前抗病毛白杨与感病北京杨相比上调蛋白可能与杨树抗溃疡病的组成型抗病机制有关,接菌后抗病毛白杨与感病北京杨相比上调蛋白可能与杨树对溃疡病的诱导型抗病机制密切相关。最后利用质谱技术鉴定出其中的4个差异蛋白分别是核酮糖二磷酸羧化酶小链、预测蛋白、过氧化物歧化酶、异戊烯二磷酸-异构酶,这些差异蛋白可能与杨树对溃疡病的抗性有一定关系。 展开更多
关键词 北京杨 毛白杨 溃疡病菌 双向凝胶电泳 差异蛋白质
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冠心病血瘀证血小板差异功能蛋白筛选、鉴定及功能分析 被引量:32
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作者 李雪峰 蒋跃绒 +2 位作者 高铸烨 殷惠军 陈可冀 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期467-473,共7页
目的寻找冠心病血瘀证患者冠脉事件关键血小板功能蛋白。方法纳入冠心病血瘀证组患者,设立正常对照组,每组分4个小组,即两组各有4次重复。抽取外周血,分离血小板并提取蛋白,将各个提取血小板蛋白样本按小组等体积混合、定量。用荧光差... 目的寻找冠心病血瘀证患者冠脉事件关键血小板功能蛋白。方法纳入冠心病血瘀证组患者,设立正常对照组,每组分4个小组,即两组各有4次重复。抽取外周血,分离血小板并提取蛋白,将各个提取血小板蛋白样本按小组等体积混合、定量。用荧光差异显示二维凝胶电泳技术筛选、基质辅助激光解析/电离-飞行时间质谱技术鉴定血小板差异功能蛋白。对鉴定成功差异蛋白,用Western-blotting进一步验证。结果筛选出13个差异蛋白点,质谱成功鉴定7个:isoform 1 of integrinalpha-Ⅱb、isoform 2 of integrinalpha-Ⅱb、actin-cytoplasmic1、actin-cytoplasmic 2、cDNAFLJ52842、cDNAFLJ55253、cDNAFLJ43573fis。其中isoform2ofintegrinalpha-Ⅱb(CD41)和actin-cytoplasmic2(Actinγ)成功验证。结论 CD41和Actinγ是冠心病血瘀证的标志蛋白。其他血小板功能蛋白的异常表达可能在冠心病血瘀证事件发生发展中起关键作用。 展开更多
关键词 冠心病血瘀证 血小板差异功能蛋白 荧光差异显示二维凝胶电泳 基质辅助激光解析/电离-飞行时间质谱
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不稳定型心绞痛患者血浆蛋白标记物的蛋白质组学筛选 被引量:8
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作者 胡水旺 沈安娜 +2 位作者 郑德仲 黄敬 胡兆霆 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期532-537,共6页
目的分析冠心病不稳定型心绞痛(UAP)与稳定型心绞痛(SAP)患者血浆中的差异蛋白质,筛选可能与UAP早期诊断密切相关的血浆蛋白标记物。方法分别收集2014年6月-2015年4月南方医科大学第三附属医院UAP及SAP血浆标本各60例,另收集体检科收集... 目的分析冠心病不稳定型心绞痛(UAP)与稳定型心绞痛(SAP)患者血浆中的差异蛋白质,筛选可能与UAP早期诊断密切相关的血浆蛋白标记物。方法分别收集2014年6月-2015年4月南方医科大学第三附属医院UAP及SAP血浆标本各60例,另收集体检科收集的血浆标本作为正常对照组(n=60)。随机取对照组(n=10)、UAP组(n=10)与SAP组(n=10)空腹血浆标本各100μl,分别等量混合成3组样本,去除血浆高丰度蛋白后,利用双向差异凝胶电泳(DIGE)技术进行蛋白分离,经差异软件分析后,采集UAP和SAP之间变化2倍以上的差异蛋白质点,利用基质辅助激光解吸电离-飞行时间/飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF MS)对差异蛋白点进行鉴定。每组随机选取40份血浆样本,选取UAP特异性差异蛋白进行ELISA验证。结果 UAP与SAP组患者血浆相比较,共筛选出10个表达量差异2倍以上的差异蛋白点,包括9个上调蛋白点,1个下调蛋白点。经质谱鉴定后,表达上调的蛋白包括纤维蛋白原γ链(FGG)、补体C4-B(C4B)、免疫球蛋白κ链C结构域(IGKC)和血红蛋白α亚基(HBA1);表达下调的蛋白是结合珠蛋白(HP)。与对照组比较后,在这些差异蛋白中共找到2个UAP特异性相关蛋白,即IGKC和HP。选取IGKC进行ELISA验证,结果表明,与对照组和SAP组相比较,UAP组样本中IGKC特异性表达上调(P<0.05),与DIGE验证结果一致。结论筛选到UAP特异性相关蛋白IGKC和HP,IGKC有可能成为UAP早期筛查及诊断的特异性生物标记物。 展开更多
关键词 心绞痛 不稳定型 血浆 生物学标记 蛋白质组学 双向差异凝胶电泳
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不同生长时期梅花鹿鹿茸差异蛋白质组学分析 被引量:7
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作者 张然然 刘华淼 +4 位作者 邵元臣 周盼伊 苏莹 王磊 邢秀梅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期493-501,共9页
旨在从分子水平认识鹿茸生长机制,本研究以10、40、60与130d的梅花鹿鹿茸为试验材料,运用双向凝胶电泳(2-DE)、质谱鉴定技术与生物信息学方法对梅花鹿鹿茸生长过程中差异表达蛋白质进行研究。结果显示,有46种蛋白质差异性表达,且主要参... 旨在从分子水平认识鹿茸生长机制,本研究以10、40、60与130d的梅花鹿鹿茸为试验材料,运用双向凝胶电泳(2-DE)、质谱鉴定技术与生物信息学方法对梅花鹿鹿茸生长过程中差异表达蛋白质进行研究。结果显示,有46种蛋白质差异性表达,且主要参与细胞骨架、转运过程、信号转导、细胞凋亡、骨发育、蛋白质合成、核酸代谢、免疫、能量代谢、细胞增殖、抗氧化、蛋白质折叠等生物学过程。结合鹿茸的快速生长与快速骨化的独特生长过程,对差异表达蛋白质中的骨发育相关蛋白、抗氧化蛋白、细胞凋亡相关蛋白做进一步分析,发现P4HB、SPARC、过氧化物还原酶2、过氧化物还原酶4、半乳糖凝集素1、视黄酸结合蛋白1等6种蛋白质在鹿茸快速生长与快速骨化过程中起着重要的作用,为鹿茸生长与骨化机制的进一步研究奠定基础。 展开更多
关键词 梅花鹿 鹿茸 不同生长时期 双向凝胶电泳 蛋白质组学
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基于蛋白质组学技术的鹿茸不同部位差异蛋白筛选 被引量:8
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作者 刘华淼 鞠妍 +1 位作者 张然然 邢秀梅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期618-626,共9页
旨在了解梅花鹿鹿茸不同部位蛋白表达差异,本研究以腊片部位、血片部位和骨片部位的梅花鹿鹿茸组织为试验材料,运用双向电泳(2-DE)和MALDI-TOF-TOF串联质谱技术对不同部位梅花鹿鹿茸差异表达蛋白质进行鉴定,并对差异蛋白进行生物信息学... 旨在了解梅花鹿鹿茸不同部位蛋白表达差异,本研究以腊片部位、血片部位和骨片部位的梅花鹿鹿茸组织为试验材料,运用双向电泳(2-DE)和MALDI-TOF-TOF串联质谱技术对不同部位梅花鹿鹿茸差异表达蛋白质进行鉴定,并对差异蛋白进行生物信息学分析。结果表明,成功筛选出37个差异表达蛋白,主要涉及多细胞生物体发生、解毒、细胞成分组织或生物发生、细胞聚集、定位、对刺激的反应、生物黏附、发育、单一生物体发生、免疫系统等生物学过程。其中鹿茸腊片、血片、骨片组织中分别有18、5与14个蛋白质表达上调。对差异表达蛋白作进一步分析发现,转录延伸因子(EFB1)、视黄酸结合蛋白(CRABP1)在鹿茸的快速生长中起重要调控作用,而载脂蛋白A1(APOA1)、脂肪酸结合蛋白4(FABP4)、转甲状腺素蛋白(TTR)在鹿茸的快速骨化中起重要的调控作用,对鹿茸快速生长与骨化机制的进一步研究具有重要意义。 展开更多
关键词 梅花鹿 鹿茸 不同部位 双向凝胶电泳 蛋白质组学
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LCM纯化的鼻咽癌间质和正常鼻咽间质的定量蛋白质组学研究 被引量:6
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作者 李美香 肖志强 +7 位作者 彭芳 李国庆 张鹏飞 李茂玉 李萃 李峰 刘迎福 陈主初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1122-1133,共12页
间质在肿瘤发生发展中的作用越来越受到重视.为寻找与鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)发生发展相关的特异性间质蛋白,采用激光捕获显微切割技术(laser capture microdissection,LCM)纯化鼻咽癌间质和正常鼻咽黏膜间质,荧光差异双... 间质在肿瘤发生发展中的作用越来越受到重视.为寻找与鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)发生发展相关的特异性间质蛋白,采用激光捕获显微切割技术(laser capture microdissection,LCM)纯化鼻咽癌间质和正常鼻咽黏膜间质,荧光差异双向凝胶电泳(fluorescent two-dimensional difference gel electrophoresis 2-D,DIGE)结合质谱技术分离鉴定间质相关蛋白.Westernblot及免疫组织化学技术验证了其中3个差异蛋白(CapG、L-plastin和S100A9),证实了2D-DIGE结果的可靠性.建立了LCM纯化的鼻咽癌间质和正常鼻咽间质的荧光差异蛋白表达图谱,高通量筛选与肿瘤发生相关的间质蛋白,共得到34个有统计学意义的蛋白质点,质谱鉴定得到20个差异蛋白.研究结果提示:这些差异表达的蛋白质将有助于阐明鼻咽癌细胞和周围间质的关系.对间质蛋白功能的进一步研究,将有助于解析间质在肿瘤发生中的作用机制,并为从间质途径寻找肿瘤治疗靶标提供新思路. 展开更多
关键词 鼻咽癌 间质 激光捕获显微切割 荧光差异双向凝胶电泳 质谱 免疫组织化学
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早期糖尿病肾病肾阳虚证的血浆蛋白质组学分析 被引量:7
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作者 卢洪梅 汤水福 胡坤华 《广州中医药大学学报》 CAS 北大核心 2014年第6期890-894,1027,共6页
【目的】寻找糖尿病肾病肾阳虚证敏感的血浆分子标志物。【方法】对4例早期糖尿病肾病肾阳虚证患者的血浆和4例正常人血浆进行荧光差异双向电泳(2-D DIGE)分析,选择表达差异大于1.5倍的蛋白斑点进行质谱分析。【结果】成功建立糖尿病肾... 【目的】寻找糖尿病肾病肾阳虚证敏感的血浆分子标志物。【方法】对4例早期糖尿病肾病肾阳虚证患者的血浆和4例正常人血浆进行荧光差异双向电泳(2-D DIGE)分析,选择表达差异大于1.5倍的蛋白斑点进行质谱分析。【结果】成功建立糖尿病肾病肾阳虚证血浆和正常血浆的胶内差异双向凝胶电泳图谱,通过分析共鉴定出9种差异蛋白质,包括补体C3、补体C4、载脂蛋白E、泛素化因子等。【结论】荧光差异双向电泳能够客观地显示糖尿病肾病肾阳虚证血浆与正常血浆之间的蛋白质表达差异,经鉴定的9种蛋白有可能为糖尿病肾病的早期诊断以及中医证型研究提供潜在的血浆分子标志物。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 肾阳虚证 蛋白质组学 荧光差异双向电泳
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大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A和其保持系的不同器官蛋白质组比较 被引量:8
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作者 曾维英 杨守萍 +1 位作者 盖钧镒 喻德跃 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期8-14,共7页
质核互作雄性不育在杂种优势利用中起着重要作用,探讨质核互作雄性不育发生的机理具有重要的理论和实践意义。本研究开展大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A与其保持系NJCMS1B的不同器官蛋白质组比较分析。以大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A... 质核互作雄性不育在杂种优势利用中起着重要作用,探讨质核互作雄性不育发生的机理具有重要的理论和实践意义。本研究开展大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A与其保持系NJCMS1B的不同器官蛋白质组比较分析。以大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A和其保持系NJCMS1B的种子、叶片和花药为材料,采用双向凝胶电泳技术对其蛋白质进行分离,考马斯亮蓝染色,获得重复性好的蛋白质双向电泳图谱,利用PDQuest软件处理分析,寻找差异表达蛋白。结果发现不育系NJCMS1A与其保持系NJCMS1B的种子2-DE图谱间存在7个差异表达蛋白点,其中3个在NJCMS1A中表达而在NJCMS1B中缺失,3个在NJCMS1A中缺失而在NJCMS1B中表达,1个在NJCMS1A中表达量明显增强;苗期叶片2-DE图谱间基本一致,没有差异表达蛋白点;单核小孢子期花药2-DE图谱间有9个差异表达蛋白点,其中3个在NJCMS1A中表达而在NJCMS1B中缺失,6个在NJCMS1A中缺失而在NJCMS1B中表达;二胞花粉期花药2-DE图谱间有24个差异表达蛋白点,其中10个在NJCMS1A中表达而在NJC-MS1B中缺失,12个在NJCMS1A中缺失而在NJCMS1B中表达,2个在NJCMS1B中表达量明显增强。两系花药间存在较多差异表达蛋白点,种子间仅有少量差异表达蛋白点,而苗期叶片间基本没有差异表达蛋白点,说明不育基因表达具有时空性和器官特异性,与育性有关的蛋白主要在花药中表达。 展开更多
关键词 大豆 质核互作雄性不育 不同器官 蛋白质组 双向凝胶电泳
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不同生态型芦苇叶片蛋白质双向电泳系统的筛选和优化 被引量:9
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作者 林文芳 陈林姣 +1 位作者 彭浩 朱学艺 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1209-1214,共6页
通过优化组合植物蛋白质提取方法及与之匹配的蛋白质裂解液,采用改进的O′Farrel双向电泳系统,以自然生境野生芦苇叶片为材料,筛选出一种适合纤维含量高、革质化明显的4种不同生态型芦苇(水生芦苇、轻度盐化草甸芦苇、重度盐化草甸芦苇... 通过优化组合植物蛋白质提取方法及与之匹配的蛋白质裂解液,采用改进的O′Farrel双向电泳系统,以自然生境野生芦苇叶片为材料,筛选出一种适合纤维含量高、革质化明显的4种不同生态型芦苇(水生芦苇、轻度盐化草甸芦苇、重度盐化草甸芦苇、沙丘芦苇)叶片蛋白质分析的双向电泳系统,即以饱和酚-醋酸铵/甲醇沉淀法提取叶片蛋白质样品,经裂解液[8mol/L尿素,2mol/L硫脲,4%CHAPS,65mmol/LDTT,2%Ampholine(pH3.5 ̄10∶pH5 ̄8=1∶4)]裂解后按80!g上样,银染后获得背景清晰、蛋白质分辨率较高的双向电泳图谱.该系统用于水稻等植物叶片蛋白质双向电泳分析,同样获得较好的电泳图谱和分辨率. 展开更多
关键词 芦苇 不同生态型 蛋白质制样 裂解液 双向电泳
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琼玉膏对D-半乳糖所致衰老大鼠差异蛋白质表达的影响 被引量:4
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作者 刘焕兰 武夏林 曲卫玲 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期32-36,共5页
目的采用蛋白质组学方法,在下丘脑中探索琼玉膏对衰老大鼠产生调节作用的相关蛋白质,从而在分子水平上解释抗衰老方剂琼玉膏的作用机理。方法将2~3月龄42只SD大鼠,随机分为正常对照组、模型组、琼玉膏组,每组14只。给药结束后,抽... 目的采用蛋白质组学方法,在下丘脑中探索琼玉膏对衰老大鼠产生调节作用的相关蛋白质,从而在分子水平上解释抗衰老方剂琼玉膏的作用机理。方法将2~3月龄42只SD大鼠,随机分为正常对照组、模型组、琼玉膏组,每组14只。给药结束后,抽提下丘脑全蛋白。利用荧光双向差异凝胶电泳、图像分析、胶内酶切、质谱鉴定等蛋白质组学技术,分离、分析、鉴定大鼠下丘脑差异蛋白质;通过数据库检索和生物信息学方法,分析差异蛋白的功能及属性。结果1.成功复制亚急性衰老大鼠动物模型;2.获得了正常对照组、模型组和琼玉膏组下丘脑组织的全蛋白表达荧光双向差异凝胶电泳图谱;3.运用蛋白质组学技术,比较正常对照组、模型组及琼玉膏组的下丘脑组织,确认了15种表达量发生了变化的蛋白质。结论鉴定出差异蛋白主要涉及有突触形成相关蛋白、线粒体相关蛋白、能量代谢相关蛋白、抗氧化、细胞骨架蛋白、细胞分化、增殖和凋亡蛋白等,为进一步筛选特异相关蛋白和药物靶位治疗奠定基础。 展开更多
关键词 琼玉膏 延缓衰老 蛋白质组学 荧光双向差异凝胶电泳 下丘脑
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口腔扁平苔藓患者血清差异蛋白表达检测及意义 被引量:3
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作者 刘健 刘铁军 +3 位作者 安欣 李昆珊 贾楠 许彦枝 《山东医药》 CAS 北大核心 2016年第16期11-14,I0002,共5页
目的探讨口腔扁平苔藓(OLP)患者血清差异蛋白表达及意义。方法选择6例OLP患者(观察组)和6例健康志愿者(对照组),抽取空腹静脉血后采用苯酚抽提法提取血清蛋白,Bradford法测定蛋白含量,双向荧光差异凝胶电泳法分离检测差异蛋白点,液相色... 目的探讨口腔扁平苔藓(OLP)患者血清差异蛋白表达及意义。方法选择6例OLP患者(观察组)和6例健康志愿者(对照组),抽取空腹静脉血后采用苯酚抽提法提取血清蛋白,Bradford法测定蛋白含量,双向荧光差异凝胶电泳法分离检测差异蛋白点,液相色谱-质谱联用技术鉴定差异蛋白。选择其中研究较少的蛋白,采用Western blotting法检测两组蛋白相对表达量。结果两组血清差异蛋白点(583±183)个,其中重复性好的蛋白差异点20个,质谱分析蛋白序列鉴定出12种蛋白质。12种蛋白质中,7种(补体C3、激肽原、α-2-巨球蛋白、人抗凝血酶Ⅲ、分泌型Ig A、补体C9、β-1-金属结合球蛋白)在观察组血清中表达降低,5种(结合珠蛋白、铜蓝蛋白、载脂蛋白AⅠ、维生素D、人类因子B)表达升高。观察组血清补体C3和人抗凝血酶Ⅲ蛋白相对表达量均低于对照组,载脂蛋白AⅠ高于对照组(P均<0.01)。结论 OLP患者血清中存在12种差异蛋白质,血清补体C3和人抗凝血酶Ⅲ蛋白表达均降低,载脂蛋白AⅠ表达升高,其发病可能与免疫功能降低及感染有关。 展开更多
关键词 口腔扁平苔藓 双向荧光差异凝胶电泳 蛋白质组 补体C3 载脂蛋白AⅠ 人抗凝血酶Ⅲ
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荧光差异双向凝胶电泳筛选肾透明细胞癌及癌旁组织中的差异表达蛋白 被引量:3
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作者 陈壮飞 肖耀军 +5 位作者 黄泽海 陈彤 赵善超 姜耀东 吴芃 郑少斌 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1517-1522,共6页
目的寻找肾癌相关肿瘤标记物,用于肾癌临床诊断、药物治疗靶点的选择及预后监测。方法采用荧光差异双向凝胶电泳技术筛选15例肾透明细胞癌及癌旁正常肾组织差异表达蛋白质点。统计学采用t检验进行定量比较,以两组蛋白含量比值在1.5倍及... 目的寻找肾癌相关肿瘤标记物,用于肾癌临床诊断、药物治疗靶点的选择及预后监测。方法采用荧光差异双向凝胶电泳技术筛选15例肾透明细胞癌及癌旁正常肾组织差异表达蛋白质点。统计学采用t检验进行定量比较,以两组蛋白含量比值在1.5倍及以上,P<0.05,被认为是差异表达蛋白质点。用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱或串联质谱技术进行差异表达蛋白质点鉴定。结果共筛选分离出27个差异表达蛋白质点,经质谱技术共成功鉴定了26种蛋白质,11种蛋白质在肾癌组织中上调,15种蛋白质下调。其功能覆盖细胞活动的多个方面,其中线粒体短/支链特异性酰基辅酶A脱氢酶、醛糖1-表异构酶、PRDX4、CAPG、β-防御素107、微纤丝相关糖蛋白4等6种蛋白是我们首次采用蛋白质组学技术成功筛选的肾癌差异表达蛋白质,并发现了1个预测蛋白(UCRIL)。结论荧光差异双向凝胶电泳在肾癌组织中获得较好的筛选效果,新筛选的差异表达蛋白有望成为肾癌分子生物学标记物,为后续研究提供了实验依据。 展开更多
关键词 肾癌 肿瘤标记物 荧光差异双向凝胶电泳 定量蛋白质组学
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