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猪囊尾蚴抗原-B基因cDNA编码区的克隆 被引量:13
1
作者 王庆敏 戴建新 +1 位作者 张平武 孙树汉 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期73-75,共3页
[目的 ]扩增和克隆猪带绦虫囊尾蚴 Ag B基因的 c DNA编码区。 [方法 ]提取猪囊尾蚴总 RNA中 ,利用 RT- PCR技术扩增出 Ag B基因 c DNA编码区 ,然后将其克隆到载体 p UC118中进行序列分析。 [结果 ]PCR反应产物为单一条带 ,大小为 2 .6 k... [目的 ]扩增和克隆猪带绦虫囊尾蚴 Ag B基因的 c DNA编码区。 [方法 ]提取猪囊尾蚴总 RNA中 ,利用 RT- PCR技术扩增出 Ag B基因 c DNA编码区 ,然后将其克隆到载体 p UC118中进行序列分析。 [结果 ]PCR反应产物为单一条带 ,大小为 2 .6 kb。测序结果与澳大利亚株猪囊尾蚴 Ag B序列有 99.8%的同源性 ,二者的氨基酸序列有 99.3%的同源性。 [结论 ]成功地克隆了猪囊尾蚴 Ag B基因 c DNA编码区。 展开更多
关键词 猪带绦虫囊尾蚴 AgB基因 cdna编码区 基因克隆
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人脑髓鞘碱性蛋白cDNA重组质粒pRK41转化及全长编码区体外扩增 被引量:1
2
作者 程汉华 陈俊杰 +3 位作者 王若菡 李昌龙 史英丽 杨鲁川 《华西医科大学学报》 CAS CSCD 1993年第1期1-4,共4页
作者将含人脑髓鞘碱性蛋白(MBP)编码区和3’端非翻译区(1.2kb)的重组质粒pRK41—1.2转化宿主菌E.coli JM109,用非同位素标记鼠MBP cDNA克隆片段作探针,经菌落原位杂交筛选出阳性克隆并以此为模板,采用聚合酶链反应(PCR)技术扩增出含21.5... 作者将含人脑髓鞘碱性蛋白(MBP)编码区和3’端非翻译区(1.2kb)的重组质粒pRK41—1.2转化宿主菌E.coli JM109,用非同位素标记鼠MBP cDNA克隆片段作探针,经菌落原位杂交筛选出阳性克隆并以此为模板,采用聚合酶链反应(PCR)技术扩增出含21.5kd MBP全长编码序列(600bp),又经限制性内切酶BamHⅠ和KpnⅠ消化,电泳结果进一步证实该PCR产物的特异性,为人MBP全长编码序列。 展开更多
关键词 cdna 分子杂交 聚合酶链反应 重组
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The Principle of Modulated Evolution Between cDNA Coding Region and Nontranslated Region—Non-neutral Evolution at Molecular Level
3
作者 贺福初 吴祖泽 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 1993年第16期1391-1395,共5页
A cDNA encoding a protein is composed of coding region and nontranslated region (NTR). There are two parts of NTR. i.e. 5’ NTR or 3’ NTR, upstream or downstream the coding region respectively. According to neutral t... A cDNA encoding a protein is composed of coding region and nontranslated region (NTR). There are two parts of NTR. i.e. 5’ NTR or 3’ NTR, upstream or downstream the coding region respectively. According to neutral theory of molecular evolution, the following expectations might be true at cDNA level: (i)evolutionary rate of NTR is higher than that of coding region; (ii) synonymous substitutions in coding region evolution are more than missense substitutions; (iii) transition substitutions are more than 展开更多
关键词 cdna coding region nontranslated region MODULATED EVOLUTION NEUTRAL EVOLUTION
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基于游程和扩展指数哥伦布编码的任意形状感兴趣区域图像编码 被引量:9
4
作者 徐勇 徐智勇 张启衡 《光学精密工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第1期175-182,共8页
给出一种上下文自适应的游程编码和扩展指数哥伦布编码。利用游程编码算法对图像小波系数及ROI掩模进行上下文自适应建模并输出三元组样本;然后扩展普通的指数哥伦布编码,使其可以编码由游程编码建模输出的三元组样本,在对小波系数编码... 给出一种上下文自适应的游程编码和扩展指数哥伦布编码。利用游程编码算法对图像小波系数及ROI掩模进行上下文自适应建模并输出三元组样本;然后扩展普通的指数哥伦布编码,使其可以编码由游程编码建模输出的三元组样本,在对小波系数编码的同时可以携带感兴趣区域掩模标记信息。由此得到一种可以区别感兴趣区域和背景区域的高效编码算法,并以此算法为基础提出一种感兴趣区域编码的编解码框架,该框架包括5/3小波变换、小波域掩模标记生成、不均匀最佳量化、游程编码和扩展的指数哥伦布编码。该算法的游程建模过程简单,熵编码算法可用闭合公式表达,具有较高的可实现性。实验结果表明,提出的算法支持多个任意形状的感兴趣区域,感兴趣区域相对于背景区域的编码优先级可调,并且可以获得高于基于BbB-shift的SPIHT算法的压缩性能。 展开更多
关键词 图像编码 感兴趣区域编码 自适应游程编码 指数哥伦布编码
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二值图像中的游程编码区域标记 被引量:31
5
作者 徐利华 陈早生 《光电工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第6期63-65,共3页
由于处理时间及存储空间的限制,常规的区域标记算法往往无法满足实时图像处理的需要。针对这些不足,提出了一种新的快速区域标记算法。通过改变游程编码的存储结构,建立编码间的亲缘关系,实现快速地址寻访,完成二值图像中所有区域目标... 由于处理时间及存储空间的限制,常规的区域标记算法往往无法满足实时图像处理的需要。针对这些不足,提出了一种新的快速区域标记算法。通过改变游程编码的存储结构,建立编码间的亲缘关系,实现快速地址寻访,完成二值图像中所有区域目标对象的标记过程。与传统的标记算法相比,降低了算法复杂度,缩短了处理时间。 展开更多
关键词 二值图像 区域标记 游程编码 实时图像处理
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一种基于游程码的并行区域标记算法 被引量:3
6
作者 陆克中 丁凤霞 +1 位作者 孙宏元 林晓辉 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2008年第16期49-50,53,共3页
区域标记是图像处理中常用的方法,为了满足实时图像处理要求,提出了一种基于游程码的并行区域标记算法.该算法采用带状方式划分子图,各计算节点先通过基于游程码的方法对子图进行本地标记,然后管理进程再通过计算子图边界游程码的连通... 区域标记是图像处理中常用的方法,为了满足实时图像处理要求,提出了一种基于游程码的并行区域标记算法.该算法采用带状方式划分子图,各计算节点先通过基于游程码的方法对子图进行本地标记,然后管理进程再通过计算子图边界游程码的连通关系完成全局标记.实验表明,该算法结果正确,性能较好,效率较高,具有近似于线性的加速比。 展开更多
关键词 二值图像 区域标记 并行算法 游程码 实时图像处理
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小麦长链非编码RNA的预测及功能分析 被引量:4
7
作者 束永俊 张晶红 +3 位作者 王明波 郭东林 王晓萍 郭长虹 《生物信息学》 2013年第2期153-157,共5页
生物体有部分基因被转录成RNA,但是不编码相应蛋白质,称为长链非编码RNA(lncRNA)。它们参与基因的表观调控,这一过程对动物、植物的生长发育都有重要作用,但是,目前植物中发现和研究的lncRNA较少。为了研究lncRNA在植物中的功能,本研究... 生物体有部分基因被转录成RNA,但是不编码相应蛋白质,称为长链非编码RNA(lncRNA)。它们参与基因的表观调控,这一过程对动物、植物的生长发育都有重要作用,但是,目前植物中发现和研究的lncRNA较少。为了研究lncRNA在植物中的功能,本研究建立了基于小麦全长cDNA的lncRNA识别程序。从6162条小麦全长cDNA中发现了231条lncRNAs,并从中鉴定出两个新miRNAs,这表明lncRNAs可以通过形成miRNAs前体基因形成其功能。此外,通过序列富集分析,我们从小麦lncRNAs中鉴定出三个保守的调控元件,结果显示小麦lncRNAs可能通过和其它蛋白质或DNA等分子作用,进而参与小麦生长、发育等过程的调控,这些结果对进一步研究植物体内的lncRNA的功能和作用机制具有重要意义。 展开更多
关键词 小麦 长链非编码RNA 全长cdna 微小RNA
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核酸序列非编码区关联长度的计算 被引量:2
8
作者 蔡禄 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1995年第2期152-157,共6页
首次计算DNA非编码区的关联长度;发现70%左右的序列关联长度≤2。约15%的序列具有中程关联(3≤s≤6),约15%的序列为长程关联(s≥7).并作了初步的理论解释。
关键词 核酸 非编码区 关联长度 序列分析 DNA
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二值图像连通域的分段标记算法及实现 被引量:16
9
作者 王静 《红外与激光工程》 EI CSCD 北大核心 2010年第4期761-765,共5页
在基于图像的精确制导中对标记算法的时间性能要求很高,常规的标记算法无法满足高速实时图像处理的需要。在分析现有算法的基础上,引入段的概念,以段为标记单位记录连通区域,在对图像一次扫描的过程中完成连通性传递闭包的计算。在标记... 在基于图像的精确制导中对标记算法的时间性能要求很高,常规的标记算法无法满足高速实时图像处理的需要。在分析现有算法的基础上,引入段的概念,以段为标记单位记录连通区域,在对图像一次扫描的过程中完成连通性传递闭包的计算。在标记的同时记录标记目标的边沿像素坐标值,计算目标的形心、面积、轨迹、灰度等特征。给出了算法的思路和实现步骤。使用该算法标记128×128的二值图像,用TMS320C6414 600 MHz simulator,可以在0.4 ms内完成。将文中算法与其他4种连通区域标记算法进行时间性能对比,明显优于其他算法。软件仿真结果也显示分段标记算法的正确性与稳定性。适用于高速运动目标的实时截获与跟踪。 展开更多
关键词 区域标记 游程码 目标识别 二值图像
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核酸序列非编码区关联长度的计算 被引量:1
10
作者 蔡禄 毛爱华 《包头钢铁学院学报》 1994年第2期46-53,共8页
首次计算DNA非编码区的关联长度。发现70%左右的序列关联长度≤2,约15%的序列具有中程关联(3≤S≤6),约15%的序列为长程关联(S≥7)。并从理论角度作了分析和解释。
关键词 核酸 非编码区 关联长度 分子序列
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基于位平面特征的SAR图像筛选
11
作者 胡粲彬 刘方 周军红 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2009年第11期3021-3026,共6页
为了获取含有感兴趣特定目标的SAR图像,根据SAR图像目标的成像特性,提出了一种基于位平面特征的SAR图像筛选方法。在对图像适当的灰度预处理基础上,分析特定目标的先验知识,利用对位平面的复杂度度量、游程度量以及频谱度量,定义了位平... 为了获取含有感兴趣特定目标的SAR图像,根据SAR图像目标的成像特性,提出了一种基于位平面特征的SAR图像筛选方法。在对图像适当的灰度预处理基础上,分析特定目标的先验知识,利用对位平面的复杂度度量、游程度量以及频谱度量,定义了位平面价值度量准则,同时结合图像的灰度直方图特征对图像进行筛选。实验以机场目标为对象对SAR图像进行快速筛选,并对机场目标进行提取,效果良好,能够满足预期的要求。 展开更多
关键词 感兴趣区域 灰度直方图 二值分解 灰度编码分解 游程
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胞质雄性不育白菜叶绿体ndhJ-trnF区域序列发生变异
12
作者 蒋明 曹家树 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第5期497-502,共6页
以来自Polima胞质甘蓝型油菜雄性不育源转育获得的不育白菜'Bpol97-05A'和其回交亲本即保持系'Bajh97-01B'为材料,利用cDNA扩增片段长度多态性(cDNA-AFLP)技术获得一条长约330bp的特异片段P1708,RT-PCR验证确认该序列... 以来自Polima胞质甘蓝型油菜雄性不育源转育获得的不育白菜'Bpol97-05A'和其回交亲本即保持系'Bajh97-01B'为材料,利用cDNA扩增片段长度多态性(cDNA-AFLP)技术获得一条长约330bp的特异片段P1708,RT-PCR验证确认该序列为不育白菜材料所特有,经测序和BLAST比对,发现该片段除54bp的插入序列外,其余部分与大白菜和甘蓝叶绿体ndhJ-trnF基因之间的一段序列完全一致.根据基因区域两端的保守部位设计引物,以Polima不育白菜DNA和可育甘蓝型油菜的DNA为模板,分别获得了长约1900bp的序列,比较序列发现:不育白菜与可育白菜、甘蓝型油菜的DNA序列存在一定差异,'Bpol97-05A'中除多个位点发生变异外,另有108bp的插入序列,该插入由2个长度为54bp的重复序列组成,重复序列中除5′端3个碱基CTT外,其余部分均与trnF基因3′端51bp完全相同. 展开更多
关键词 白菜 cdna扩增片段长度多态性(cdna-AFLP) ndhJ-trnF区域 序列变异 细胞质雄性不育 叶绿体基因
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大麦HvRBR基因克隆与序列分析 被引量:1
13
作者 王颜 王际睿 +1 位作者 郑有良 魏育明 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期1554-1562,共9页
【目的】从栽培大麦(Hordeum vulgare)中分离并克隆对植物细胞周期起负调控作用的RBR(retinoblastoma-related),鉴定大麦RBR(HvRBR)分子特征,明确其与同源基因间的亲缘关系和分类地位,为探索动、植物生长发育过程中细胞增殖和分化相关... 【目的】从栽培大麦(Hordeum vulgare)中分离并克隆对植物细胞周期起负调控作用的RBR(retinoblastoma-related),鉴定大麦RBR(HvRBR)分子特征,明确其与同源基因间的亲缘关系和分类地位,为探索动、植物生长发育过程中细胞增殖和分化相关调控途径的研究提供理论依据。【方法】通过对植物RBR生物信息学分析,根据RBR保守区域序列设计通用引物,采用PCR方法从栽培大麦DNA和苗期总cDNA中分别分段克隆,获得特征序列后在DNAMAN软件下进行序列分析、多重序列比对并构建系统树。【结果】从栽培大麦籽粒皱缩突变材料GSHO1854中获得全长为5547bp的大麦HvRBR序列(GU121481),其cDNA编码区(GU121480)全长3179bp,包含一个编码975个氨基酸的开放阅读框。由其推导的氨基酸序列与已报道的RBR蛋白序列有较高的一致性。在A、B保守区之间有一个间隔区,虽然同源性较低,但是所有氨基酸序列的相似位点都包含一个半胱氨酸残基,这说明该半胱氨酸残基形成的分子内或分子间二硫键可能对整个RBR蛋白的结构和功能产生重要的影响。系统进化分析表明HvRBR与水稻同源性最高(84.3%),与苜蓿、拟南芥等双子叶植物的同源性较低(50%)。【结论】首次从大麦中得到与植物细胞周期起调控、细胞增殖和分化相关的RBR蛋白编码基因HvRBR。对栽培大麦籽粒皱缩突变材料GSHO1854的HvRBR进行了分子克隆和鉴定,并通过系统进化分析将HvRBR归为植物RBR家族C亚族。 展开更多
关键词 大麦 RBR蛋白 全编码区cdna 序列分析
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星空背景图像序列压缩编码方法研究 被引量:1
14
作者 鲍冠伯 张金芳 +1 位作者 吕品 袁麟 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2008年第27期187-190,共4页
在分析星空背景图像的特点基础上,提出了一种适用于星空背景图像序列的压缩编码方法。算法首先估计出图像序列的星空背景,采用基于自适应滤波的区域门限分割算法,在保持背景图像中星体灰度的基础上去除噪声,再对分割后的背景图像进行游... 在分析星空背景图像的特点基础上,提出了一种适用于星空背景图像序列的压缩编码方法。算法首先估计出图像序列的星空背景,采用基于自适应滤波的区域门限分割算法,在保持背景图像中星体灰度的基础上去除噪声,再对分割后的背景图像进行游程编码;其次,采用数学形态学的方法提取出运动目标图像,并计算出运动目标图像在图像序列每一帧中的位置,最后将运动目标图像和它在每帧中的位置编码嵌入到背景图像编码流,形成最终的星空背景图像序列编码结果。实验表明,该方法对于星空背景图像序列具有很强的压缩能力,恢复出的图像序列消除了噪声影响并保留了原始图像的基本信息,同时具有较好的视觉效果,便于后续的应用处理。 展开更多
关键词 星空背景 背景估计 区域自适应滤波 游程编码 码流合成
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对象化过程中的快速标号算法研究
15
作者 李龙翔 胡晓东 +2 位作者 沈占锋 明冬萍 宋卓沁 《计算机工程与应用》 CSCD 2012年第6期193-195,共3页
面向对象的遥感信息提取技术由于其更符合人脑思维方式、更容易与地学知识结合,目前已经成为遥感信息自动提取的主流方向。对象化处理是面向对象遥感信息处理的重要步骤,实现了从分割影像到对象矢量影像的转变。提出了一种快速标号方法... 面向对象的遥感信息提取技术由于其更符合人脑思维方式、更容易与地学知识结合,目前已经成为遥感信息自动提取的主流方向。对象化处理是面向对象遥感信息处理的重要步骤,实现了从分割影像到对象矢量影像的转变。提出了一种快速标号方法,可以快速为分割图像中的对象赋给唯一值标签并同时统计对象的其他特征,可以显著地提高去除小班块、矢量化预处理等操作的运行速度,在对象化过程中有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 面向对象信息提取 对象化 行程编码 快速标号 去除小斑块
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人肝再生增强因子阅读框的cDNA克隆和序列分析 被引量:14
16
作者 刘杞 王志毅 +2 位作者 罗娅 黄爱龙 张定凤 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 1999年第3期155-158,共4页
目的获取人肝再生增强因子(ALR)阅读框的cDNA克隆,为进一步研究打下基础。方法从人胎肝中提取总RNA作为模板,以寡聚dT为引物逆转录台成第一链cDNA,用我们设计的引物和PCR方法扩增双链cDNA。PCR产物约3... 目的获取人肝再生增强因子(ALR)阅读框的cDNA克隆,为进一步研究打下基础。方法从人胎肝中提取总RNA作为模板,以寡聚dT为引物逆转录台成第一链cDNA,用我们设计的引物和PCR方法扩增双链cDNA。PCR产物约380bp并被亚克隆人pUC19,经测序和PCGENE软件分析。结果获得人ALR完整阅读框的cDNA片段,长度为378bP。与大鼠ALR和最近报道的人ALR序列比较同源性分别为86、5%和99.2%。结论成功地克隆人ALR完整阅读框的cDNA,同时提示人ALR参与了人胎儿晚期发育过程中胎肝的生长调节。 展开更多
关键词 肝再生增强因子 阅读框 cdna 克隆
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改进扩展指数哥伦布算法的图像感兴趣区域编码 被引量:1
17
作者 刘占伟 李华 赵志凯 《数学的实践与认识》 北大核心 2020年第21期51-58,共8页
为了提高对图像中感兴趣区域的压缩编码效率,借助小波-Contourlet变换(WBCT)的多尺度和多方向分解的特点,提出了一种改进的自适应扩展指数哥伦布编码压缩算法.首先生成图像中感兴趣区域的掩膜标记,对源图像和掩膜进行WBCT变换,得到小波-... 为了提高对图像中感兴趣区域的压缩编码效率,借助小波-Contourlet变换(WBCT)的多尺度和多方向分解的特点,提出了一种改进的自适应扩展指数哥伦布编码压缩算法.首先生成图像中感兴趣区域的掩膜标记,对源图像和掩膜进行WBCT变换,得到小波-Contourlet域的掩膜和子带系数.然后根据掩膜信息对子带系数进行不均匀量化,并进行‘Z’字形扫描和游程编码,从而得到三元数组,利用改进的自适应扩展指数哥伦布算法对三元数组进行压缩编码.最后对压缩码流进行混合解码、反量化和逆变换得到感兴趣区域压缩图像.实验结果表明:提出的改进编码算法与另外两种算法相比,能够得到更优的视觉效果和更高的峰值信噪比,实现了对感兴趣区域的高效压缩,验证了算法的有效性和优越性. 展开更多
关键词 图像压缩 感兴趣区域 扩展指数哥伦布编码 小波-CONTOURLET变换 游程编码 三元数组
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