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Recovery of a Far-Eastern Strain of Tick-Borne Encephalitis Virus with a Full-Length Infectious cDNA Clone 被引量:2
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作者 Penghui Li Chen Yao +10 位作者 Ting Wang Tong Wu Wenfu Yi Yue Zheng Yuanjiu Miao Jianhong Sun Zhongyuan Tan Yan Liu Xiaowei Zhang Hanzhong Wang Zhenhua Zheng 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2021年第6期1375-1386,共12页
Tick-borne encephalitis virus(TBEV) is a pathogenic virus known to cause central nervous system(CNS) diseases in humans, and has become an increasing public health threat nowadays. The rates of TBEV infection in the e... Tick-borne encephalitis virus(TBEV) is a pathogenic virus known to cause central nervous system(CNS) diseases in humans, and has become an increasing public health threat nowadays. The rates of TBEV infection in the endemic countries are increasing. However, there is no effective antiviral against the disease. This underscores the urgent need for tools to study the emergence and pathogenesis of TBEV and to accelerate the development of vaccines and antivirals. In this study, we reported an infectious c DNA clone of TBEV that was isolated in China(the WH2012 strain). A beta-globin intron was inserted in the coding region of nonstructural protein 1(NS1) gene to improve the stability of viral genome in bacteria. In mammalian cells, the inserted intron was excised and spliced precisely, which did not lead to the generation of inserted mutants. High titers of infectious progeny viruses were generated after the transfection of the infectious clone. The cDNA-derived TBEV replicated efficiently, and caused typical cytopathic effect(CPE) and plaques in BHK-21 cells. In addition, the CPE and growth curve of cDNA-derived virus were similar to that of its parental isolate in cells. Together, we have constructed the first infectious TBEV cDNA clone in China, and the clone can be used to investigate the genetic determinants of TBEV virulence and disease pathogenesis, and to develop countermeasures against the virus. 展开更多
关键词 Tick-borne encephalitis virus(TBEV) infectious cdna clone INTRON Virus replication
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Construction of Full-length Infectious Clone for Encephalomyocarditis Virus BJC3 and Identification of the Rescued Virus
2
作者 ZHANG Guo-qing ZHU Shu +4 位作者 GE Xin-na GUO Xin CHEN Yan-hong ZHA Zhen-lin YANG Han-chun 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第S1期63-69,共7页
The objective of this study was to construct the infectious clone of encephalomyocarditis virus (EMCV) BJC3 strain.The genomic cDNA of the virus was amplified by three overlapping segments using RT-PCR,and cloned into... The objective of this study was to construct the infectious clone of encephalomyocarditis virus (EMCV) BJC3 strain.The genomic cDNA of the virus was amplified by three overlapping segments using RT-PCR,and cloned into low-copy plasmid pWSK29 to construct the full-length cDNA clone pWSKBJC3/ w.The pWSKBJC3/w was in vitro transcribed and transfected into BHK-21 cells to rescue the virus.The results showed that the full-length cDNA clone was infectious and the virus could be rescued in BHK-21 cells.The rescued virus designated RvBJC3W was identified by RT-PCR and indirect immunofluorescence assay(IFA).The rescued virus had similar growth characteristics to its parental virus BJC3 and retained pathogenicity for mice.Our results indicate that the first infectious cDNA clone of EMCV in China has been successfully established and provides an essential tool for investigating the molecular basis of pathogenicity of EMCV. 展开更多
关键词 encephalomyocarditis virus(EMCV) infectious cdna clone virus rescue growth characteristics PATHOGENICITY
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猫杯状病毒HRB-SS株感染性cDNA克隆的构建与病毒的拯救 被引量:1
3
作者 孙伟尧 宋海军 +2 位作者 刘春国 杨德成 王靖飞 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1080-1084,共5页
为构建猫杯状病毒(FCV)HRB-SS株的感染性克隆,本研究合成3’端含有丁肝病毒核酶(HdvRz)序列的HRB-SS株全长基因组序列,将该序列插入p OK12-CMV载体,获得含FCV HRB-SS全长基因组cDNA克隆的重组质粒p FCV-HRB-SS。将重组质粒p FCV-HRB-SS... 为构建猫杯状病毒(FCV)HRB-SS株的感染性克隆,本研究合成3’端含有丁肝病毒核酶(HdvRz)序列的HRB-SS株全长基因组序列,将该序列插入p OK12-CMV载体,获得含FCV HRB-SS全长基因组cDNA克隆的重组质粒p FCV-HRB-SS。将重组质粒p FCV-HRB-SS转染猫肾细胞(CRFK),48 h即可观察到典型细胞病变,将病变细胞的上清接种未感染的CRFK细胞进行传代培养,连续传5代,从感染的细胞上清中获得拯救病毒。采用FCV VP1蛋白MAb,经间接免疫荧光试验检测,结果显示拯救病毒与亲本病毒均可观察到特异性绿色荧光,而未感染病毒的对照组细胞无荧光信号;各组细胞负染色后经电镜观察均可见病毒粒子呈典型的杯状结构。提取拯救病毒和亲本病毒基因组RNA,反转录为c DNA作为模板,经RT-PCR扩增、Kpn I酶切鉴定及测序分析,结果显示,拯救病毒含C^(5724)G位点突变的分子标记,消除了Kpn I酶切位点,不同于亲本病毒。上述结果表明获得拯救病毒r FCV HRB-SS。采用蚀斑形成试验和绘制病毒的一步生长曲线进一步检测r FCV HRB-SS,结果显示,r FCV HRB-SS与亲本病毒具有一致的复制水平和体外生长能力。本研究利用真核启动子构建的FCV HRB-SS株全长感染性cDNA克隆系统可直接在细胞内转录,减少了体外操作流程,有效防止了操作污染,具有操作简便,拯救效率高的优势,为后续FCV基因功能的研究和新型疫苗的研发奠定了基础。 展开更多
关键词 猫杯状病毒 感染性cdna克隆 反向遗传操作系统
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盖塔病毒SC483株cDNA感染性克隆的构建
4
作者 杜炳辰 王铭 +8 位作者 刘春国 王世达 魏新宇 路雅曼 孙振钊 刘在斯 魏丽丽 王靖飞 杨德成 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第17期3479-3486,共8页
【背景】盖塔病毒(Getah virus,GETV)是一种由蚊虫传播的病毒,分类学上属于披膜病毒科甲病毒属成员。该病毒宿主范围广,可感染猪、马、牛、狐狸等多种哺乳动物,人也可以感染,但在人群中造成的危害尚不知晓。动物感染主要临床表现为发热... 【背景】盖塔病毒(Getah virus,GETV)是一种由蚊虫传播的病毒,分类学上属于披膜病毒科甲病毒属成员。该病毒宿主范围广,可感染猪、马、牛、狐狸等多种哺乳动物,人也可以感染,但在人群中造成的危害尚不知晓。动物感染主要临床表现为发热、皮疹、关节炎、繁殖障碍和死胎。GETV在世界范围内流行较为广泛,近年来在我国的流行呈上升趋势,2018年我国南方多个猪场爆发该病,GETV在畜禽养殖及公共卫生方面的危害渐渐受到人们的关注。目前,尚无用于预防和治疗盖塔病毒感染的商业化疫苗和药物。由于对GETV研究较少,其生物学特性、对不同物种的致病性和致病机制以及流行趋势在很大程度上均是未知的。【目的】建立高效的GETV反向遗传操作平台,为深入研究GETV基因组结构与功能、致病机制以及开发新型疫苗奠定基础。【方法】采取化学合成的方式人工合成了两端分别含有锤头状核酶(HamRz)和丁肝病毒核酶(HdvRz)序列的GETV SC483株基因组全长,并克隆至低拷贝pOK12-CMV载体中,从而获得含有GETV SC483株基因组全长cDNA克隆的重组质粒pGETV-SC483。将纯化的重组质粒pGETV-SC483转染BHK-21细胞进行病毒拯救。对拯救病毒进行连续传代、鉴定以及生物学特性分析,并对感染性克隆质粒pGETV-SC483在大肠杆菌中的遗传稳定性进行验证。【结果】重组质粒pGETV-SC483转染BHK-21细胞后,48 h即可观察到GETV感染引起的典型细胞病变,获得的拯救病毒命名为rSC483。分别提取拯救病毒和亲本病毒基因组RNA,对病毒基因组进行RT-PCR扩增、Not I酶切以及序列测定。结果表明,拯救病毒不同于亲本病毒,其含有人为引入以消去Not I酶切位点的G4332A突变的分子标记。使用GETV特异性抗体作为检测抗体的间接免疫荧光试验和病毒粒子形态学电镜负染观察结果进一步表明,GETV拯救成功。噬斑形成试验和一步生长曲线试验结果表明,拯救病毒与亲本病毒具有相似的复制能力和增殖特性。另外,感染性克隆质粒pGETV-SC483在大肠杆菌DH5α中连续传代后的测序结果表明,该重组质粒具有良好的遗传稳定性。【结论】成功构建了稳定、高效的GETV SC483株全长cDNA感染性克隆,为GETV生物学特性及致病机理研究以及新型疫苗开发提供了技术平台。 展开更多
关键词 盖塔病毒 cdna感染性克隆 病毒拯救 反向遗传操作系统
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Engineering infectious foot-and-mouth disease virus in vivo from a full-length genomic cDNA clone of the A/AKT/58 strain 被引量:6
5
作者 BAI XingWen1, LI PingHua1, CAO YiMei1, LI Dong1, LU ZengJun1, GUO JianHong1, SUN DeHui1, ZHENG HaiXue2, SUN Pu1, LIU XiangTao1, LUO JianXun1 & LIU ZaiXin1 1 Key Laboratory of Animal Virology of Ministry of Agriculture, National Foot-and-Mouth Disease Reference Laboratory of China, State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology, Lanzhou Veterinary Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou 730046, China 2 Veterinary Research Institute, Guangdong Agricultural Academy of Sciences, Guangzhou 510640, China 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2009年第2期155-162,共8页
Two full-length genomic cDNA clones, pTA/FMDV and pCA/FMDV, were constructed that contained three point-mutants [A174G and A308G (not present in pTA/FMDV); T1029G] in the genome compared with the wild type A/AKT/58 st... Two full-length genomic cDNA clones, pTA/FMDV and pCA/FMDV, were constructed that contained three point-mutants [A174G and A308G (not present in pTA/FMDV); T1029G] in the genome compared with the wild type A/AKT/58 strain of foot-and-mouth disease virus. These two viruses were rescued by co-transfection of pCA/FMDV with pCT7RNAP, which can express T7 RNA polymerase in BHK-21 cell-lines, or by transfection of the in vitro transcribed RNA. Their biological properties were analyzed for their antigenicity, virulence in suckling-mice (LD50) and growth kinetics in BHK-21 cells. The in vivo rescued viruses showed high pathogenicity for 3-day-old unweaned mice (LD50=10?7.5). However, the in vitro transcribed RNA derived from pTA/FMDV had lower pathogenicity for suckling-mice (LD50=10?6), and the in vivo transcribed RNA recovered from pCA/FMDV co-transfected with pCT7RNAP showed no significant differences from the wild type virus. These data showed that recovery of the infectious foot-and-mouth disease virus directly from the use of in vivo techniques was better than from in vitro methods. Furthermore, the reverse genetic procedure technique was simplified to a faster one-step procedure based on co-transfection with pCT7RNAP. These results suggest that in vivo RNA tran- scripts may be more valuable for engineering recombinant foot-and-mouth disease virus than in vitro RNA transcripts, and may contribute to further understanding of the biological properties, such as replication, maturation and quasispecies, of the foot-and-mouth disease virus. 展开更多
关键词 foot-and-mouth disease virus infectious cdna cloneS in vivo transcription A/AKT/58 STRAIN
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Infectious foot-and-mouth disease virus derived from a cloned full-length cDNA of OH/CHA/99 被引量:7
6
作者 LIUGuangqing LIUZaixin XIEQingge CHENYingli BAOHuifang LIUXiangtao 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2004年第11期1137-1141,共5页
The China foot-and-mouth virus (FMDV) iso-late OH/CHA/99 was isolated from swine, which was unable to infect bovine thyroid cells in vitro or to cause typical dis-ease in bovines following intradermal inoculation in t... The China foot-and-mouth virus (FMDV) iso-late OH/CHA/99 was isolated from swine, which was unable to infect bovine thyroid cells in vitro or to cause typical dis-ease in bovines following intradermal inoculation in the tongue. To enhance antigenicity, replication, maturation and pathogenicity studies of OH/CHA/99, an infectious full- length cDNA clone, designated pBlFMDV, was prepared. The in vitro and in vivo biological properties of the virus derived from pBlFMDV were studied by analyzing antigenicity, plaque morphology and virulence in pigs. The results showed that the virus derived from pBlFMDV had the same biologi-cal properties as the parent strain OH/CHA/99; the full- length infectious cDNA clone, pBlFMDV, will be very useful in studies of the antigenicity, virulence, pathogenesis, matu-ration and replication of FMDV. 展开更多
关键词 OH/CHA/99 全长cdna 传染性克隆 pBIFMDV 口蹄疫 FMDV
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中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160病毒株感染性全基因组cDNA克隆的构建与分析 被引量:10
7
作者 杨益良 梁国栋 +6 位作者 付士红 何海怀 李晓宇 邓娟 苏乃伦 王力华 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期173-180,共8页
报告了中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160株的感染性全基因组cDNA克隆的构建与鉴定.利用RT-PCR方法获得覆盖病毒全长基因组的cDNA片段,以低拷贝质粒pBR322作为骨架,将基因组cDNA置于SP6 RNA聚合酶启动子之后,基因组3'末端带有35个... 报告了中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160株的感染性全基因组cDNA克隆的构建与鉴定.利用RT-PCR方法获得覆盖病毒全长基因组的cDNA片段,以低拷贝质粒pBR322作为骨架,将基因组cDNA置于SP6 RNA聚合酶启动子之后,基因组3'末端带有35个连续的A,通过DNA重组技术组装成病毒基因组全长cDNA克隆.该克隆可在大肠杆菌DH5a中稳定扩增.经体外转录,RNA转录体转染BHK-21细胞,细胞发生病变,恢复病毒滴度达到107~108pFU/ml.全基因组cDNA克隆构建过程中引入的沉默突变(8 453位核苷酸由C变为T)产生Xba Ⅰ酶切位点作为遗传标记,在子代恢复病毒的基因组中稳定存在.从细胞病变的特征、BHK-21细胞的空斑形态、病毒的抗原性、病毒在细胞中的生长动力学特征以及对乳鼠的致病性等方面比较,恢复病毒和亲本病毒XJ-160没有显著区别,提示获得了具有感染性的XJ-160病毒全长cDNA克隆.该病毒感染性全基因组cDNA克隆可以作为反向遗传学系统,为进一步研究病毒复制和致病机制,以及开发相应的载体表达系统提供分子生物学工具. 展开更多
关键词 感染性全基因组cdna克隆 恢复病毒 辛德毕斯病毒 XJ-160病毒株 中国 分离
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猪繁殖与呼吸综合征病毒CH-1a株基因组全长cDNA克隆的构建 被引量:4
8
作者 薛强 周艳君 +2 位作者 刘光清 仇华吉 童光志 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期401-407,共7页
猪繁殖与呼吸综合征病毒 (PRRSV)嗜好在PAM和其他单核细胞上生长 ,如果把PRRSV作为一种病毒活载体 ,它就可以携带外源抗原高效进入猪体的免疫系统 ,更好地刺激机体产生免疫应答。本实验根据PRRSV基因组和克隆载体的限制性内切酶酶切位... 猪繁殖与呼吸综合征病毒 (PRRSV)嗜好在PAM和其他单核细胞上生长 ,如果把PRRSV作为一种病毒活载体 ,它就可以携带外源抗原高效进入猪体的免疫系统 ,更好地刺激机体产生免疫应答。本实验根据PRRSV基因组和克隆载体的限制性内切酶酶切位点 ,将PRRSV基因组设计为 8段进行了反转录和扩增 (RT_PCR) ,将得到的片段克隆到质粒pBluescriptIISK(_)或pMD 18T_vetcor中。在扩增 5’端时 ,运用 5’RACE获得了基因组 5’最末端序列 ,在亚克隆入pOK12前在 5’端上游引入了T7启动子序列。选取一个克隆在 3’端紧挨ORF7下游引入了PacⅠ位点 ,以期作为感染性分子克隆的分子标志。将扩增片段在pBuescriptIISK(_)中进行了部分连接后 ,亚克隆于低拷贝质粒pOK12中 ,在pOK12中进行了长片段的连接 ,并获得了基因组全长cDNA克隆。进行全基因测序后 ,在 3处发现有 6个核苷酸的缺失 ,运用插入突变修补丢失的碱基 ,最终获得了含有PRRSVCH_la株基因组全长cDNA的重组质粒pOKCH_laF和含有分子标志PcaⅠ的基因组全长cDNA克隆pOKCH_laPacIF。在本试验中构建的基因组全长cDNA克隆为进一步获得具有感染性的PRRSV分子克隆并研究该病毒基因组结构和功能奠定了基础。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRPSV) 基因组全长cdna克隆 感染性分子克隆
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甜菜黑色焦枯病毒新疆分离物基因组RNA的序列分析及侵染性cDNA克隆构建 被引量:3
9
作者 席德慧 曹云鹤 +5 位作者 郭立华 原雪峰 蔡祝南 韩成贵 李大伟 于嘉林 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期309-313,共5页
甜菜黑色焦枯病毒(Beet black scorch virus,BBSV)新疆分离物(BBSV-X)和宁夏分离物(BBSV-N)分别来自生态环境不同的新疆和宁夏的甜菜产区,自然条件下,BBSV-X含有卫星RNA,BBSV-N不含有卫星RNA。为明确二者的分子差异,以BBSV-X基因组RNA... 甜菜黑色焦枯病毒(Beet black scorch virus,BBSV)新疆分离物(BBSV-X)和宁夏分离物(BBSV-N)分别来自生态环境不同的新疆和宁夏的甜菜产区,自然条件下,BBSV-X含有卫星RNA,BBSV-N不含有卫星RNA。为明确二者的分子差异,以BBSV-X基因组RNA为模板,通过RT-PCR扩增获得了全长cDNA克隆。序列分析显示,BBSV-X基因组RNA全长为3 644个核苷酸,与以往报道的BBSV-N相同,且核苷酸序列一致性高达99.45%。除5′和3′非翻译区各有一个核苷酸发生变异外,核苷酸序列差异主要存在于ORF1通读区和ORF6,氨基酸序列差异仅存在于ORF1的通读区。构建获得了BBSV-X的侵染性cDNA克隆,用体外转录物定量接种了苋色藜(Chenopodiumamaranticolor)和豇豆(Vigna sinensis),结果显示BBSV-X与BBSV-N之间在致病性上存在一定的差异。 展开更多
关键词 甜菜黑色焦枯病毒 新疆分离物 侵染性cdna克隆 致病性
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猪捷申病毒Swine/CH/IMH/03全长cDNA克隆的构建 被引量:2
10
作者 吴波平 冯力 +4 位作者 时洪艳 陈建飞 孙东波 高秀春 白兴华 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期929-933,942,共6页
为构建猪捷申病毒(Porcine testhovirus,PTV)感染性克隆,进行病毒基因组结构、功能及新型疫苗研究,根据NCBI发表的PTV Swine/CH/IMH/03株及Talfan株核苷酸序列,设计并合成了4对特异性引物,PCR扩增并克隆覆盖PTV Swine/CH/IMH/03全长基... 为构建猪捷申病毒(Porcine testhovirus,PTV)感染性克隆,进行病毒基因组结构、功能及新型疫苗研究,根据NCBI发表的PTV Swine/CH/IMH/03株及Talfan株核苷酸序列,设计并合成了4对特异性引物,PCR扩增并克隆覆盖PTV Swine/CH/IMH/03全长基因组的4个片段。经过反复拼接和测序,最终将PTV全长cDNA定向克隆到pBluescript SK(+)中。PCR、双酶切及测序鉴定证明PTV全长cDNA克隆构建成功。与Swine/CH/IMH/03亲本株及NCBI登录的其他PTV毒株序列比对发现,该克隆只有3个位点存在核苷酸及氨基酸突变,分别位于2A、2C及3D中。 展开更多
关键词 PTV 全长cdna克隆 感染性克隆
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Ⅰ型鸭肝炎病毒基因组全长cDNA克隆的构建与分析 被引量:2
11
作者 云涛 倪征 +5 位作者 刘光清 余斌 陈柳 华炯钢 李双茂 张彦明 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2010年第5期27-31,共5页
【目的】建立Ⅰ型鸭病毒性肝炎(Duck hepatitis virus,DHV)的反向遗传系统。【方法】根据Ⅰ型鸭肝炎病毒(DHV-Ⅰ)ZJ-V/2006株全基因组序列设计并合成5对特异引物,进而应用RT-PCR技术分5段扩增了DHV全基因组cDNA。将扩增的cDNA重叠片段A... 【目的】建立Ⅰ型鸭病毒性肝炎(Duck hepatitis virus,DHV)的反向遗传系统。【方法】根据Ⅰ型鸭肝炎病毒(DHV-Ⅰ)ZJ-V/2006株全基因组序列设计并合成5对特异引物,进而应用RT-PCR技术分5段扩增了DHV全基因组cDNA。将扩增的cDNA重叠片段A、B、C和DE片段分别克隆到载体pBluescriptⅡKS(+)中,获得了DHV-ⅠZJ-V/2006株全长基因组cDNA克隆pBLDHV。在扩增5′末端时,引入ApaⅠ酶切位点和SP6启动子序列;在基因组3′末段PolyA尾引入NruⅠ酶切位点,以供cDNA模板的线性化之用。【结果】核酸序列分析表明,DHV-ⅠZJ-V/2006株基因组全长为7 711个核苷酸,与DHV-ⅠZJ-V BHK-21细胞分离株的同源性为99.9%;全长基因组中有6个核苷酸发生突变,均未导致对应的氨基酸发生改变,为沉默突变。【结论】成功构建了DHV-ⅠZJ-V/2006株基因组全长cDNA。 展开更多
关键词 Ⅰ型鸭病毒性肝炎 全长cdna克隆 感染性克隆
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海南番木瓜环斑病毒全长cDNA克隆及其侵染性克隆构建 被引量:3
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作者 赵光远 庹德财 +2 位作者 沈文涛 黎小瑛 周鹏 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2015年第5期911-917,共7页
为了从分子水平上解析番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)的致病机理,寻找广谱、有效的抗病毒新策略,培育具有应用前景的抗病新品种,利用RT-PCR和快速cDNA末端扩增技术(RACE)对引起番木瓜环斑病毒病的PRSV海南海口分离物(... 为了从分子水平上解析番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)的致病机理,寻找广谱、有效的抗病毒新策略,培育具有应用前景的抗病新品种,利用RT-PCR和快速cDNA末端扩增技术(RACE)对引起番木瓜环斑病毒病的PRSV海南海口分离物(PRSV-HN2)的基因组cDNA进行了全序列测定。PRSV-HN2全长cDNA包含10 326 nt(不包括3′端的polyA,Gen Bank登录号为KF791028),能编码3 346个氨基酸。对PRSV-HN2基因组核苷酸序列及其推导的氨基酸序列进行了结构和功能分析,结果表明,其与其它23个PRSV分离物的核酸序列相似度达81%-91%,氨基酸相似度为88%-94%。利用酵母同源重组系统成功构建其侵染性克隆载体并通过农杆菌转化与侵染,最终获得其侵染性克隆。这为在分子水平上研究PRSV遗传变异、侵染及致病机理奠定理论基础。 展开更多
关键词 番木瓜环斑病毒 全长cdna 克隆 酵母同源重组 序列分析 侵染性克隆
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从PRRSV BJ-4株基因组全长cDNA获得感染性病毒 被引量:2
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作者 冉智光 陈小云 +3 位作者 杨汉春 郭鑫 盖新娜 王芳 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期423-429,共7页
对已构建的覆盖猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)BJ-4全长cDNA的6个重组质粒进行测序,并对部分点突变进行定点回复突变,将突变片段顺次连接,获得了全长cDNA克隆pWSK-DCBA。通过体外转录获得病毒基因组RNA,将RNA与脂质体混合后直接转染MARC... 对已构建的覆盖猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)BJ-4全长cDNA的6个重组质粒进行测序,并对部分点突变进行定点回复突变,将突变片段顺次连接,获得了全长cDNA克隆pWSK-DCBA。通过体外转录获得病毒基因组RNA,将RNA与脂质体混合后直接转染MARC-145细胞,获得拯救病毒(rV68)。rV68能在MARC-145细胞上稳定传代,并可引起PRRSV特征性的细胞病变(CPE)。增殖动态分析表明,rV68在MARC-145细胞上的生长有所迟滞,达到最高滴度的培养时间比亲本病毒延迟12h,但滴毒无显著差异(P>0.05)。结果表明,构建的BJ-4全长cDNApWSK-DCBA具有感染性,为研究中国PRRSV的分子致病与免疫机制、新型疫苗等奠定了基础。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 感染性cdna克隆 拯救病毒
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应用Gibson Assembly方法构建狂犬病病毒SRV9株重组感染性cDNA克隆 被引量:1
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作者 王伟 魏玉圆 +3 位作者 翟少华 毛丽萍 皮文辉 简子健 《动物医学进展》 北大核心 2017年第11期11-17,共7页
应用Gibson Assembly连接法精确快速构建狂犬病病毒SRV9株重组感染性cDNA克隆,为狂犬病病毒感染性cDNA克隆的构建提供新的方法。应用Gibson Assembly连接法在同一反应体系内,将多个片段和经限制性内切酶线性化的载体,按设计的顺序进行连... 应用Gibson Assembly连接法精确快速构建狂犬病病毒SRV9株重组感染性cDNA克隆,为狂犬病病毒感染性cDNA克隆的构建提供新的方法。应用Gibson Assembly连接法在同一反应体系内,将多个片段和经限制性内切酶线性化的载体,按设计的顺序进行连接,实现多个片段的一步组装。设计带有20bp^30bp重叠序列的PCR引物,扩增得到带有重叠序列的狂犬病病毒5个结构蛋白基因和增强型荧光蛋白基因。扩增的片段和线性化的载体经胶回收纯化后,与Gibson连接液混合后,50℃反应60min,连接产物转化Stbl3感受态细胞,提取重组质粒,经PCR、酶切和测序鉴定,缺失了病毒伪基因Ψ区和糖蛋白基因的跨膜区并且将增强型荧光蛋白基因插入糖蛋白基因终止密码子前,构建了全长17 600bp的重组质粒,完成了重组全长感染性cDNA克隆的构建。 展开更多
关键词 狂犬病病毒 GIBSON Assembly连接法 构建 感染性cdna克隆
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马动脉炎病毒基因组全长cDNA克隆的构建 被引量:1
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作者 韦祖樟 袁世山 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期139-142,共4页
根据马动脉炎病毒(Equine arteritis virus,EAV)Bucyrus株全基因组序列设计并合成EAV特异引物,进而应用RT-PCR技术分6段扩增了EAV全基因组cDNA。将扩增的各个cDNA重叠片段PE124、PE631、PE1854、PE5191、PE61107、PE97Q分别克隆到载体PC... 根据马动脉炎病毒(Equine arteritis virus,EAV)Bucyrus株全基因组序列设计并合成EAV特异引物,进而应用RT-PCR技术分6段扩增了EAV全基因组cDNA。将扩增的各个cDNA重叠片段PE124、PE631、PE1854、PE5191、PE61107、PE97Q分别克隆到载体PCR BluntⅡ-TOPO中,建立了EAV初级cDNA克隆。在扩增5′末端时,引入NotⅠ酶切位点和T3启动子序列;在基因组3′末段PolyA尾引入XhoⅠ酶切位点,后者供cDNA模板的线性化之用。将扩增片段在PCR BluntⅡ-TOPO中依次连接,最后亚克隆到质粒pBluescriptⅡKS(+)中,获得了EAV全长基因组cDNA克隆pWEAV。核酸序列分析表明:该毒株基因组全长为12 704个核苷酸,与EAVBucyrus分离株的同源性为99.1%;全长基因组中有104个核苷酸发生突变,相应地导致编码区内34个氨基酸的改变。 展开更多
关键词 马动脉炎病毒 全长cdna克隆 感染性克隆
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鸭坦布苏病毒基因组全长cDNA克隆构建与分析
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作者 云涛 陈柳 +4 位作者 张存 倪征 华炯钢 余斌 叶伟成 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第11期1910-1915,共6页
根据鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)ZJ-407株全基因组序列设计并合成4对特异的Infusion引物,应用RT-PCR技术分4段扩增了DTMUV全基因组c DNA。通过In-fusion技术将扩增的c DNA重叠片段A,B,C和D片段分别克隆到载体p BluescriptⅡ... 根据鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus,DTMUV)ZJ-407株全基因组序列设计并合成4对特异的Infusion引物,应用RT-PCR技术分4段扩增了DTMUV全基因组c DNA。通过In-fusion技术将扩增的c DNA重叠片段A,B,C和D片段分别克隆到载体p BluescriptⅡKS(+)中,获得了DTMUV全长基因组c DNA克隆p SK-T7-DTMUV。在扩增5'末端时,引入T7启动子序列;在基因组3'末段引入SmaⅠ酶切位点,以供c DNA模板的线性化之用。核酸序列分析表明,DTMUV毒株基因组全长为10 990个核苷酸,与DTMUV ZJ-407 DF-1细胞分离株的同源性为99.9%;全长基因组中有9个核苷酸发生突变,其中7处为沉默突变,2处导致相对应的氨基酸发生改变,且这两处均位于非结构蛋白NS5。结果表明,本研究成功构建了DTMUV ZJ-407株基因组全长c DNA,为其感染性c DNA的拯救奠定基础。 展开更多
关键词 鸭坦布苏病毒 全长cdna克隆 感染性克隆
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黄瓜花叶病毒卫星RNA XJs1侵染性cDNA克隆构建及其生物学功能初步研究
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作者 席德慧 林宏辉 向本春 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期219-222,共4页
利用RT_PCR的方法,获得了黄瓜花叶病毒卫星RNA XJs1的全长侵染性cDNA克隆pMSC20。序列分析显示,XJs1全长384nt(GenBank登录号:DQ070748),比较XJs1与具有代表性的CMV卫星RNA的序列结构表明,在XJs1核苷酸序列的325nt^350nt间,具有典型的... 利用RT_PCR的方法,获得了黄瓜花叶病毒卫星RNA XJs1的全长侵染性cDNA克隆pMSC20。序列分析显示,XJs1全长384nt(GenBank登录号:DQ070748),比较XJs1与具有代表性的CMV卫星RNA的序列结构表明,在XJs1核苷酸序列的325nt^350nt间,具有典型的坏死型卫星RNA保守序列。通过体外转录,将XJs1与不含卫星RNA的辅助病毒分离物CMV_AH组合接种普通烟和心叶烟并进行检测。初步研究结果表明,XJs1为一致弱卫星RNA。 展开更多
关键词 黄瓜花叶病毒 卫星RNA 侵染性eDNA克隆 生物学功能
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Development and characterization of a clinical strain of Coxsackievirus A16 and an eGFP infectious clone 被引量:7
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作者 Chenglin Deng Xiaodan Li +4 位作者 Siqing Liu Linlin Xu Hanqing Ye Cheng-Feng Qin Bo Zhang 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2015年第4期269-276,共8页
Coxsackievirus A16(CA16) is one of the major causes of hand, foot, and mouth disease(HFMD) worldwide, which is a common illness that affects children. The frequent occurrence of HFMD outbreaks has become a serious pub... Coxsackievirus A16(CA16) is one of the major causes of hand, foot, and mouth disease(HFMD) worldwide, which is a common illness that affects children. The frequent occurrence of HFMD outbreaks has become a serious public health problem in Asia. Therefore, it is important to understand the pathogenesis and replication of CA16. In this study, a stable infectious c DNA clone of an epidemic strain of Coxsackievirus A16(CA16) was assembled, and subsequently a reporter virus(e GFP-CA16) was constructed by inserting the e GFP gene between the 5'-UTR and the N-terminus of VP4, with the addition of a 2A protease cleavage site(ITTLG) at its C-terminus. This was transfected into Vero cells to generate infectious recombinant viruses. The growth characteristics and plaque morphology, in vitro, in mammalian cells were found to be indistinguishable between the parental and recombinant viruses. Although the e GFP-CA16 showed smaller plaque size as compared to recombinant CA16, both were found to exhibit similar growth trends and EC50 of NITD008. In summary, this stable infectious c DNA clone should provide a valuable experimental system to study CA16 infection and host response. The e GFP-CA16 is expected to provide a powerful tool to monitor e GFP expression in infected cells and to evaluate the antiviral activity of potential antiviral agents in the treatment of CA16 infections. 展开更多
关键词 Coxsackievirus A16(CA16) infectious cdna clone REP
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Sequencing and rescuing a highly virulent classical swine fever virus: Chinese strain cF114 from a full-length cDNA clone 被引量:3
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作者 NIE Yuchun CHEN Jianguo DING Mingxiao 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2003年第11期1124-1128,共5页
The complete nucleotide sequence of classical swine fever virus (CSFV) strain cF114 (F114 strain propa- gated on PK-15 cells) was cloned by RT-PCR. The analyses of nucleotide and amino acids identity between cF114 and... The complete nucleotide sequence of classical swine fever virus (CSFV) strain cF114 (F114 strain propa- gated on PK-15 cells) was cloned by RT-PCR. The analyses of nucleotide and amino acids identity between cF114 and F114, Brescia, Alfort or C strain were 99.41%, 96.80%, 86.03%, 95.70% and 99.28%, 98.54%, 93.33%, 97.41% re- spectively. The cDNA fragments with correct sequence were ligated into a full-length cDNA and inserted into pMC18 plasmid (pMC12297). A full-length infectious viral RNA was synthesized by runoff transcription and transfected to PK15 cells. Viruses were recovered from transfected cells which wese titrated on PK-15 cells by endpoint dilution and indirect immunofluorescence with a CSFV-specific monoclonal antibody. The antigenicity and replication kinetics of the plasmid-derived virus (vM12297) were similar to the parental virus in vitro. The E01 or E2 gene was replaced with the genes from strain C and the pM/CE01 and pM/CE2 with chimeric full-length cDNA of cF114 were generated. The infectious viruses were obtained from pM/CE01 and pM/CE2. Both of the chimeric viruses can infect PK-15, SK- 6 and primary testicle cell of swine. The chimeric viruses can grow to a titer of 8?05 F-PFU/mL. These results are very important for understanding the genes related to the CSFV propagation and pathogenesis. 展开更多
关键词 无性繁殖 荧光免疫检验法 单克隆抗体 DNA序列 猪瘟病毒
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农杆菌介导的CMV侵染性克隆及2b缺失突变体构建 被引量:17
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作者 姚敏 张天奇 +2 位作者 田志超 王源超 陶小荣 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第14期3060-3068,共9页
【目的】构建农杆菌介导的黄瓜花叶病毒(CMV)侵染性克隆,测试缺失CMV 2b基因后的侵染表型。【方法】首先将pHST40上的1x35S-MCS-HDVRZ-NOS转移到中间载体pBluescript SK Ⅱ上,用pRTL2上的2x35S替换中间载体上的1x35S增强子序列,然后将2x... 【目的】构建农杆菌介导的黄瓜花叶病毒(CMV)侵染性克隆,测试缺失CMV 2b基因后的侵染表型。【方法】首先将pHST40上的1x35S-MCS-HDVRZ-NOS转移到中间载体pBluescript SK Ⅱ上,用pRTL2上的2x35S替换中间载体上的1x35S增强子序列,然后将2x35S-MCS-HDVRZ-NOS转移到微型植物表达载体pCB301,构建适用于病毒侵染性克隆和农杆菌浸润的植物表达载体,在此基础上将CMV Fny株系的全长cDNA基因组构建到该植物表达载体的2x35S启动子和HDV核酶之间,通过农杆菌浸润在本氏烟中瞬时表达产生具有侵染活性的CMV基因组RNA,进一步缺失2b来测试该缺失突变体侵染植物的表型。【结果】构建了一个用于构建RNA病毒侵染性克隆的植物表达载体pCB301-2x35S-MCS-HDVRZ-NOS,将CMV Fny的3条基因组分别构建在这个植物表达载体上后,通过农杆菌浸润本氏烟可诱导产生曲叶、花叶和矮化等症状,进一步对2b进行缺失,表明该缺失突变体接种本氏烟早期具有微弱曲叶症状,中后期表现无症,RT-PCR检测表明CMV Fny 2b缺失突变体能够系统侵染本氏烟。【结论】在改造的微型植物表达载体pCB301-2x35S-MCS-HDVRZ-NOS上构建了CMV的侵染性克隆,构建的侵染性克隆通过农杆菌介导可快速高效侵染植物。2b对CMV Fny在本氏烟中的症状发展具有重要作用,但2b对其在本氏烟上的复制和系统侵染并不是必需。 展开更多
关键词 黄瓜花叶病毒 侵染性克隆 农杆菌浸润 2b缺失突变体
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