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Gap-PCR与反向斑点杂交技术检测α-地中海贫血 被引量:3
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作者 覃桂芳 周莹 +2 位作者 刘鑫 赵林 赵红英 《中国临床新医学》 2010年第7期638-640,共3页
目的探讨Gap-PCR与反向斑点杂交技术在α-地中海贫血中的应用价值。方法采用PCR(即Gap-PCR)技术检测缺失型α-地中海贫血;用反向斑点杂交技术检测非缺失型α-地中海贫血。结果在3 896份标本中共检出237例α地贫,阳性检出率为6.08%;通过G... 目的探讨Gap-PCR与反向斑点杂交技术在α-地中海贫血中的应用价值。方法采用PCR(即Gap-PCR)技术检测缺失型α-地中海贫血;用反向斑点杂交技术检测非缺失型α-地中海贫血。结果在3 896份标本中共检出237例α地贫,阳性检出率为6.08%;通过Gap-PCR技术检测出56例α缺失型地贫,基因型分别为东南亚缺失型(--^(SEA)、右侧缺失型(-α^(3.7)和左侧缺失型(-α^(4.2));4例HbH型;通过反向斑点杂交技术检测出8例非缺失型α地贫,基因型分别为αα/α^(QS)和αα/α^(WS)。结论α-地中海贫血是我国南方影响最大的常见遗传病之一,应加强对地中海贫血的血液学筛查和基因诊断,提高诊断符合率。 展开更多
关键词 gap-pcr 反向斑点杂交技术 Α-地中海贫血
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GAP-PCR技术快速对α-地贫血基因诊断方法的研究 被引量:3
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作者 李芳芳 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 2001年第5期58-59,共2页
目的 :建立跨越断裂点的PCR技术 (也称裂口PCR、gap -PCR)为α -地贫血基因诊断提供良好的方法。方法 :应用 gap -PCR技术对 382例病人进行α -地贫血基因诊断。扩增产物带出现 10 5 3bpDNA片段时表示为α类珠蛋白基因型 (αα/αα) ,... 目的 :建立跨越断裂点的PCR技术 (也称裂口PCR、gap -PCR)为α -地贫血基因诊断提供良好的方法。方法 :应用 gap -PCR技术对 382例病人进行α -地贫血基因诊断。扩增产物带出现 10 5 3bpDNA片段时表示为α类珠蛋白基因型 (αα/αα) ,出现 743bpDNA片段增带时表示为缺失型HbH病 (α - / - - SEA) ,若样品为胎儿则为Barts水肿综合症 (- - SEA/ - - SEA) ,同时出现 10 5 3bp和 743bp两个DNA片段的扩增带表示为α -地贫杂合子 (- - SEA/αα)。结果 :382例人中 ,32 5例为正常基因型 (αα/αα) ,49例为α -地贫杂合子 (- - SEA/αα) ,8例为缺血失型HbH病 (α - / - - SEA)。结论 :gap -PCR技术应用于α -地中海贫血的血液学筛查具有简便、快速、准确的特点 。 展开更多
关键词 Α-地中海贫血 基因诊断 裂口PCR
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α-地中海贫血融合基因检测的临床应用 被引量:1
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作者 魏云芳 唐健 +1 位作者 张若鹏 何建萍 《海南医学》 CAS 2023年第11期1620-1623,共4页
目的探讨目前分子诊断常规方法在α-地中海贫血融合基因检测中的应用。方法通过缺口PCR(gap-PCR)、PCR-导流杂交法、反向点杂交法等常规临床地中海贫血基因检测试剂盒以及高通量测序技术检测昆明市妇幼保健院2020年1月1日至12月31日婚... 目的探讨目前分子诊断常规方法在α-地中海贫血融合基因检测中的应用。方法通过缺口PCR(gap-PCR)、PCR-导流杂交法、反向点杂交法等常规临床地中海贫血基因检测试剂盒以及高通量测序技术检测昆明市妇幼保健院2020年1月1日至12月31日婚育体检中心1例α_(2)珠蛋白融合基因样本。结果PCR-导流杂交法在-α^(4.2)突变位点有弱显影;反向点杂交法在-α^(4.2)突变位点有明显显影,gap-PCR法未出现-α^(4.2)缺失型阳性电泳条带,gap-PCR法见融合基因条带;α2珠蛋白基因测序结果显示有7个融合基因突变位点。结论Gap-PCR法可初步检测α-地中海贫血融合基因,高通量测序技术可准确检测α-地中海贫血融合基因突变位置。 展开更多
关键词 融合基因 地中海贫血 基因检测 gap-pcr 高通量测序技术
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低比例DNA污染对地中海贫血基因检测结果的影响
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作者 许晨霞 王德刚 +4 位作者 张艳芳 董兴盛 唐海深 梁睿 彭建明 《分子诊断与治疗杂志》 2023年第3期409-412,421,共5页
目的 研究低比例DNA污染对地中海贫血基因检测结果判读的影响,以及荧光定量PCR(QF-PCR)技术的鉴定污染的能力。方法 2019年1月至2020年1月在中山市博爱医院进行地中海贫血基因检测的11 128名受检者中,选取其中7例确诊基因型分别为-a^(4.... 目的 研究低比例DNA污染对地中海贫血基因检测结果判读的影响,以及荧光定量PCR(QF-PCR)技术的鉴定污染的能力。方法 2019年1月至2020年1月在中山市博爱医院进行地中海贫血基因检测的11 128名受检者中,选取其中7例确诊基因型分别为-a^(4.2)/aa、-a3.7/--^(SEA)、aWSa/--^(SEA)、a^(CS)α/aa、βCD41-42/βN、a^(CS)a/aa β^(IVS-Ⅱ-654)/βN、a^(QS)a/aa的患者为研究对象,提取外周血DNA,建立污染模型。用QF-PCR技术检测低比例污染样本。分别用PCR-流式荧光杂交方法和Gap-PCR+反向点杂交法检测污染模型。结果 当DNA污染比例小于10%(2 ng/μL)时QF-PCR技术易漏检,而PCR-流式荧光杂交法能提示3.7缺失型(Gap-PCR不提示);反向点杂交膜条法能提示WS、QS突变型α地贫和17种突变型β地贫(PCR-流式荧光杂交法不提示)。结论 两种方法相比较PCR-流式荧光杂交法对检测3.7缺失型更加灵敏,反向点杂交膜条检测法对α、β点突变的检测灵敏度更高。 展开更多
关键词 地中海贫血 QF-PCR PCR-流式荧光杂交 gap-pcr+反向点杂交
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四川南充地区1056例地中海贫血初筛阳性样本的基因诊断结果分析 被引量:11
5
作者 杜利君 邢晏 +5 位作者 蒋兴亮 张兵 李欣 杨杉 赵佳 何玉霞 《川北医学院学报》 CAS 2018年第4期574-577,共4页
目的:了解四川南充地区人群α、β-地中海贫血的基因类型及分布特征。方法:选取南充市中心医院2015年7月至2017年7月就诊的MCV、MCH异常(MCV<80 fl和或MCH<27 pg),且已排除缺铁性贫血和其他贫血性疾病的疑似地中海贫血患者,采集E... 目的:了解四川南充地区人群α、β-地中海贫血的基因类型及分布特征。方法:选取南充市中心医院2015年7月至2017年7月就诊的MCV、MCH异常(MCV<80 fl和或MCH<27 pg),且已排除缺铁性贫血和其他贫血性疾病的疑似地中海贫血患者,采集EDTA抗凝静脉血3 m L,采用国际先进的多聚酶链扩增(GAP-PCR)技术和DNA芯片反向斑点杂交检测技术进行α、β-地中海贫血基因检测,包括α-地贫的3种缺失型(--SEA/αα、-α4.2/αα、-α3.7/αα、)、3种突变型(-ααCS/αα、-ααQS/αα、-ααWS/αα)及β-地贫的17种突变位点。结果:1 056例样本中共检出α、β-地贫330例,检出率为31.3%。其中,α-地贫168例(15.9%),β-地贫161例(15.3%),αβ复合突变1例(0.1%)。在330例确诊地贫样本中,α-地贫168例,构成比50.9%,有6种亚型:--SEA/αα、-α4.2/αα、-α3.7/αα、-ααCS/αα、-ααQS/αα、--SEA/-α3.7,以--SEA/αα(72.6%)、-α3.7/αα(17.9%)为主,占α-地贫的90.5%;β-地贫161例,构成比8.8%,有6种类型:CD17、CD41-42、-28、-29、IVS-II 654、CD41-42/-29,其中最常见的3种突变类型为:CD17(50.3%)、CD41-42(31.1%)及IVS-II 654(14.3%),占β-地贫的95.7%;α复合β-地贫1例(0.3%),基因型为-α3.7/αα复合βIVS-II-654M。1 056例受检者中,男性369例,检出地贫90例(24.4%),女性687例,检出地贫240例(34.9%),女性地贫基因检出率明显高于男性,差异具有统计学意义(χ2=12.423,P=0.001)。结论:四川南充地区是地中海贫血高发地区之一,α-地贫最常见的基因型为--SEA/aa,β-地贫以17M突变型最常见。 展开更多
关键词 地中海贫血 基因诊断 多聚酶链扩增(gap-pcr)技术 DNA芯片反向斑点杂交检测技术
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广东地区中国型~Gγ^+(~Aγ δ β)~0地中海贫血的基因鉴定及分析 被引量:5
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作者 黄革 黎卓辉 +2 位作者 郑有为 吴际 刘胜男 《临床输血与检验》 CAS 2019年第5期465-468,共4页
目的对22例中国型Gγ^+(Aγδβ)0地中海贫血进行基因检测,分析临床特征并探讨其检测意义。方法分析血液学参数、血红蛋白电泳结果及常规α地贫基因和β地贫基因检测结果等,找到126例疑似中国型Gγ^+(Aγδβ)0地贫携带者,利用gap-PCR... 目的对22例中国型Gγ^+(Aγδβ)0地中海贫血进行基因检测,分析临床特征并探讨其检测意义。方法分析血液学参数、血红蛋白电泳结果及常规α地贫基因和β地贫基因检测结果等,找到126例疑似中国型Gγ^+(Aγδβ)0地贫携带者,利用gap-PCR检测中国型Gγ^+(Aγδβ)0地贫基因。结果126例疑似地贫携带者中检测出20例中国型Gγ^+(Aγδβ)0地贫携带者,其胎儿血红蛋白(HbF)为7.31%~19.31%,血红蛋白(Hb)为94~141g/L、红细胞平均体积(MCV)为58~77.6fL、红细胞平均血红蛋白(MCH)为18.2~25.7pg。另检测到2例患者为中国型Gγ+(Aγδβ)0地贫合并其他常见β地贫,其在临床上表现为中重型地贫。结论在HbF(>2.5%)偏高的人群中,中国型Gγ^+(Aγδβ)0地贫检出比例不低,其中国型Gγ^+(Aγδβ)0地贫杂合子表现为无贫血或者轻度贫血症状,而中国型Gγ^+(Aγδβ)0地贫合并其他β地贫时则表现为中重型贫血,临床应注意进行产前诊断以降低此类患儿比率。 展开更多
关键词 中国型Gγ+(Aγδβ)0地中海贫血 gap-pcr 临床特征
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利用NGS技术同时检测缺失和点突变型地中海贫血 被引量:2
7
作者 黄杰 杨旭 +2 位作者 孙楠 孙彬裕 曲守方 《分子诊断与治疗杂志》 2019年第2期79-85,95,共8页
目的建立一种跨越断裂点PCR(Gap-PCR)结合下一代测序技术的地中海贫血基因检测方法。方法对地中海贫血核酸国家参考品进行PCR扩增,PCR产物进行高通量测序。结果 32例国家参考品涉及的3种α突变型别,16种β突变型别,4种α缺失型别,2种β... 目的建立一种跨越断裂点PCR(Gap-PCR)结合下一代测序技术的地中海贫血基因检测方法。方法对地中海贫血核酸国家参考品进行PCR扩增,PCR产物进行高通量测序。结果 32例国家参考品涉及的3种α突变型别,16种β突变型别,4种α缺失型别,2种β缺失型别全部检出,均与原型别一致。结论本研究通过建立基于Gap-PCR结合下一代测序技术检测地贫的方法进一步完善了遗传病基因诊断方法,对遗传病的携带人群筛查,优生优育咨询,防止出生缺陷等方面具有重要意义。 展开更多
关键词 gap-pcr 高通量测序 地中海贫血 缺失型别 突变型别
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α缺失型地中海贫血患者红细胞参数分析 被引量:1
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作者 吕小林 张世锟 汪丁枝 《实验与检验医学》 CAS 2021年第5期1099-1101,共3页
目的探讨不同α缺失型地中海贫血患者红细胞各参数特点。方法应用PCR-膜反向点杂交技术(reversed dot blot,RDB)、跨越断裂点PCR技术(Gap-PCR)检测α、β地中海贫血基因,全自动血细胞分析仪检测红细胞(RBC)、血红蛋白(Hb)、红细胞平均体... 目的探讨不同α缺失型地中海贫血患者红细胞各参数特点。方法应用PCR-膜反向点杂交技术(reversed dot blot,RDB)、跨越断裂点PCR技术(Gap-PCR)检测α、β地中海贫血基因,全自动血细胞分析仪检测红细胞(RBC)、血红蛋白(Hb)、红细胞平均体积(MCV)、平均红细胞血红蛋白含量(MCH)、平均红细胞血红蛋白浓度(MCHC)、红细胞分布宽度(RDW-CV),运用SPSS19.0系统统计分析试验组与健康对照组以及--^(SEA)/、-α^(4.2)/、-α^(3.7)/、-α^(3.7)/--^(SEA)&-α^(4.2)/--^(SEA)各组之间红细胞各参数是否有统计学意义。结果⑴与健康对照组相比,α缺失型地中海贫血组Hb、MCV、MCH、MCHC明显减低,RDW-CV明显增高,差异有统计学意义(P<0.01);⑵以α^(4.2)/、-α^(3.7)/两组相比,--^(SEA)/组MCV、MCH、MCHC三指标明显下降,且-α^(3.7)/--^(SEA)&-α^(4.2)/--^(SEA)组结果下降更为明显,均具有统计学意义(P<0.01);RDW-CV各组间无统计学意义。结论α缺失型地中海贫血患者大部分红细胞指标可出现明显变化,且这种变化与缺失片段长度密切相关。 展开更多
关键词 α缺失型地中海贫血 gap-pcr PCR-膜反向点杂交
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江西地区24例罕见β-地中海贫血患者基因型分析 被引量:4
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作者 罗海艳 刘艳秋 +2 位作者 谢康 邹永毅 陆清 《实验与检验医学》 CAS 2020年第3期466-469,共4页
目的对常规基因检测结果与表型不符的β-地中海贫血(简称β-地贫)高风险患者(MCV<80fl、MCH<27pg,HbA2>3.5%)行β-珠蛋白基因分析,降低β-地贫的漏检率及误诊率,同时了解江西地区罕见β-地贫的基因突变类型及频率,丰富江西地区... 目的对常规基因检测结果与表型不符的β-地中海贫血(简称β-地贫)高风险患者(MCV<80fl、MCH<27pg,HbA2>3.5%)行β-珠蛋白基因分析,降低β-地贫的漏检率及误诊率,同时了解江西地区罕见β-地贫的基因突变类型及频率,丰富江西地区β-地贫基因突变谱。方法采用跨越断裂点聚合酶链反应(Gap-PCR)与Sanger测序技术对24例表型与基因型不符的β-地贫高危患者行β-珠蛋白基因大片段缺失与点突变分析。结果 24例患者均检出罕见β-珠蛋白基因突变,共9种突变类型。其中缺失型突变4例,β-台湾型缺失地贫(Taiwan Residents)及β-东南亚缺失地贫(SEA-HPFH)各2例。罕见点突变型20例,共7种突变类型。点突变CD54-58(-TATGGGCAACCCT)β0杂合突变人次共计8例,检出率高达33.3%(8/24),-31 (A>G)β+杂合突变人次共计3例,检出率高达12.5%(3/24)。结论江西地区罕见β-地贫基因突变类型中,CD54-58(-TATGGGCAACCCT)β0突变与-31(A>G))β+突变频率较高;对表型与基因型不符的β-地贫高危患者行进一步基因分析可发现罕见β-地贫基因突变,为β-地贫携带者家系的遗传咨询与产前诊断提供重要支持。 展开更多
关键词 地中海贫血 Β-珠蛋白基因 gap-pcr Sanger测序
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Genetic diagnosis history and osteoarticular phenotype of a nontransfusion secondary hemochromatosis 被引量:4
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作者 Dan-Dan Ruan Yu-Mian Gan +8 位作者 Tao Lu Xiao Yang Yao-Bin Zhu Qing-Hua Yu Li-Sheng Liao Ning Lin Xin Qian Jie-Wei Luo Fa-Qiang Tang 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2020年第23期5962-5975,共14页
BACKGROUND It is not easy to identify the cause of various iron overload diseases because the phenotypes overlap.Therefore,it is important to perform genetic testing to determine the genetic background of patients.AIM... BACKGROUND It is not easy to identify the cause of various iron overload diseases because the phenotypes overlap.Therefore,it is important to perform genetic testing to determine the genetic background of patients.AIM To investigate the genetic background of a patient with hemochromatosis complicated by psoriasis on both lower extremities.METHODS Ten years ago,a 61-year-old male presented with iron overload,jaundice,hemolytic anemia and microcytic hypochromic anemia.Computed tomography of the left knee joint showed enlargement of the tibial medullary cavity and thinned bone cortices.Magnetic resonance imaging showed hepatic hemochromatosis,extensive abnormal signals from bone marrow cavities and nodular lesions in the lateral medullary cavity of the upper left lateral tibia.Single photon emission computed tomography showed radial dots of abnormal concentration in the upper end of the left tibia and radial symmetry of abnormal concentrations in joints of the extremities.The patient showed several hot spot mutations of the HFE and G6PD genes detected by next-generation sequencing,but no responsible gene mutation was found.The thalassemia gene was detected by gap-PCR.RESULTS The patient was found to carry the-α4.2 and--SEA deletion mutations of the globin gene.These two mutations are common causes of Southeast Asianα-thalassemia,but rarely cause severe widespread non-transfusion secondary hemochromatosis osteoarthropathy.The simultaneous presence of an auxiliary superposition effect of a rare missense mutation of the PIEZO1 gene(NM_001142864,c.C4748T,p.A1583V)was considered.Moreover,several rare mutations of the IFIH1,KRT8,POFUT1,FLG,KRT2,and TGM5 genes may be involved in the pathogenesis of psoriasis.CONCLUSION The selection of genetic detection methods for hemochromatosis still needs to be based on an in-depth study of the clinical manifestations of the disease. 展开更多
关键词 HEMOCHROMATOSIS Hemochromatosis osteoarthropathy Next-generation sequencing THALASSEMIA gap-pcr PIEZO1 gene
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林窗对凋落物分解过程中细菌群落结构和多样性的影响 被引量:9
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作者 张明锦 张健 +5 位作者 纪托未 刘华 李勋 张艳 杨万勤 陈良华 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2015年第8期1287-1294,共8页
基于细菌16S rDNA 的PCR-DGGE 方法,以林下(US)为对照,研究了长江上游低山丘陵区人为采伐形成的马尾松(Pinus massoniana)人工林7 种不同大小林窗(G1:100 m^2、G2:225 m^2、G3:400 m^2、G4:625 m^2、G5:900 m^2、G6:1 225 m^... 基于细菌16S rDNA 的PCR-DGGE 方法,以林下(US)为对照,研究了长江上游低山丘陵区人为采伐形成的马尾松(Pinus massoniana)人工林7 种不同大小林窗(G1:100 m^2、G2:225 m^2、G3:400 m^2、G4:625 m^2、G5:900 m^2、G6:1 225 m^2、G7:1 600 m^2)在冬夏两季对凋落物分解过程中细菌群落结构和多样性的影响.结果表明,凋落物中的细菌群落结构和多样性受到林窗大小的显著影响,这种差异性受到季节的影响.有些菌纲只出现在特定大小的林窗,例如,绿弯菌纲(Chloroflexi)和放线菌纲(Actinobacteria)都只出现在US 和G1 林窗,芽孢杆菌纲(Bacilli)只出现在大中型(G4-G7)林窗,黄杆菌纲(Flavobacteria)只出现在中型(G4 和G5)林窗,浮霉菌纲(Planctomycetacia)只存在于G5、G7 和US.冬夏两季细菌群落结构差异较大,冬季的细菌类群高于夏季.在冬季,细菌群落的多样性与林窗大小、凋落物含水率、日平均温度、凋落物的全碳、可溶性有机碳和全氮含量显著相关;在夏季,细菌群落的多样性仅与日平均温度和全碳含量显著相关.总体来看,变形菌门是凋落物分解过程中的优势类群,有利于凋落物分解过程中的碳氮循环.林窗的形成改变了凋落物中的细菌群落结构和组成,减小了凋落物分解过程中细菌群落的丰富度指数、多样性指数和均匀度指数,但增大了优势度指数.冬季的细菌群落的丰富度、多样性和均匀度高于夏季,优势度则低于夏季. 展开更多
关键词 林窗 凋落物分解 细菌群落 多样性 PCR-DGGE
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Ⅰ型神经纤维瘤病基因GRD区突变研究 被引量:2
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作者 周列民 宁玉萍 +1 位作者 周珏倩 刘焯霖 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期254-256,共3页
目的 对39例Ⅰ型神经纤维瘤病(NF1)患者基因的部分GTP酶活化蛋白相关功能区(GRD区)的cDNA突变进行研究。方法 应用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)分段扩增GRD区域上的cDNA序列,用单链构象多态性(SSCP)及直接测序法对RT-PCR产物进... 目的 对39例Ⅰ型神经纤维瘤病(NF1)患者基因的部分GTP酶活化蛋白相关功能区(GRD区)的cDNA突变进行研究。方法 应用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)分段扩增GRD区域上的cDNA序列,用单链构象多态性(SSCP)及直接测序法对RT-PCR产物进行突变分析。结果 仅发现1例点突变G3918T颠换,导致1306精氨酸(R)变成亮氨酸(L)。结论NF1基因的GRD区可能不是NF1基因突变的热点区域。 展开更多
关键词 I型神经纤维瘤病 GAP相关功能区 反转录聚合酶链反应 单链构象多态性
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CON43蛋白及mRNA在子宫内膜异位症中表达及意义 被引量:1
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作者 谯建 姚珍薇 令狐华 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 2005年第2期196-199,共4页
目的:探讨间隙连接蛋白CON4 3mRNA及蛋白在子宫内膜异位症中的表达及意义。方法:对2 0例子宫内膜异位症内膜用免疫组化法检测CON4 3蛋白的表达,用RT -PCR检测其mRNA表达,并与2 1例其他良性疾病子宫的内膜进行比较。结果:CON4 3蛋白主要... 目的:探讨间隙连接蛋白CON4 3mRNA及蛋白在子宫内膜异位症中的表达及意义。方法:对2 0例子宫内膜异位症内膜用免疫组化法检测CON4 3蛋白的表达,用RT -PCR检测其mRNA表达,并与2 1例其他良性疾病子宫的内膜进行比较。结果:CON4 3蛋白主要在内膜腺上皮细胞浆中表达,内异症组中CON4 3蛋白表达较对照组显著降低;且内异症组中CON4 3mRNA较对照组显著降低。结论:子宫内膜异位症中间隙连接蛋白CON4 3在mRNA水平和蛋白水平较对照组显著降低,可能是导致内膜上皮细胞间的物质和信号传递减低或缺失,内膜细胞在它处游走。 展开更多
关键词 子宫内膜异位症 CON43蛋白 MRNA 基因表达 RT-PCR
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微阵列芯片法在α-地中海贫血检测中的方法学评价 被引量:1
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作者 蔡鹏飞 覃柳群 +6 位作者 罗世强 陈丽竹 钟青燕 王敬仁 王秋华 黄钧 严提珍 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1907-1910,共4页
目的:对微阵列芯片法用于地中海贫血基因检测进行临床评价。方法:收集166份地中海贫血基因受检者的外周血样本,按照双盲对照试验,分别应用微阵列芯片法和Gap-PCR法联合PCR-反向点杂交法对各样本进行地中海贫血基因检测,评价微阵列芯片... 目的:对微阵列芯片法用于地中海贫血基因检测进行临床评价。方法:收集166份地中海贫血基因受检者的外周血样本,按照双盲对照试验,分别应用微阵列芯片法和Gap-PCR法联合PCR-反向点杂交法对各样本进行地中海贫血基因检测,评价微阵列芯片法的特异性、灵敏度、阳性预测值、阴性预测值及总符合率。两种方法不一致时,对于缺失型α-地中海贫血采用多重连接依赖探针扩增(MLPA)法进行验证。结果:微阵列芯片法与GapPCR法比较,特异性为100%(70/70),灵敏度为96.88%(93/96),阳性预测值为100%(93/93),阴性预测值为95.89%(70/73),约登指数为0.969,总符合率为97.59%(162/166);与PCR-反向点杂交法比较,其特异性为100%(125/125),灵敏度为100%(41/41),阳性预测值为100%(41/41),阴性预测值为100%(125/125),约登指数为1,总符合率为100%(166/166)。结论:微阵列芯片法用于α-地中海贫血基因检测具有特异性高、灵敏度高、高通量等优点。 展开更多
关键词 Α-地中海贫血 微阵列芯片法 gap-pcr PCR-反向点杂交
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神经再生素对背根神经节细胞GAP-43和NF-L基因表达的影响 被引量:32
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作者 丁斐 刘梅 顾晓松 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期231-234,共4页
目的 :观察中药有效组分神经再生素作用于神经细胞生长过程中 ,相关基因的表达变化 ,探讨神经再生素促神经生长的分子生物学机制。方法 :采用RT PCR法 ,观察神经再生素在促大鼠背根神经节生长过程中(4h、12h、2 4h) ,生长相关蛋白 43(GA... 目的 :观察中药有效组分神经再生素作用于神经细胞生长过程中 ,相关基因的表达变化 ,探讨神经再生素促神经生长的分子生物学机制。方法 :采用RT PCR法 ,观察神经再生素在促大鼠背根神经节生长过程中(4h、12h、2 4h) ,生长相关蛋白 43(GAP 43)和神经丝蛋白 (NF L)基因表达的变化。结果 :神经再生素可使背根神经节细胞GAP 43和NF LmRNA的表达量增加。结论 :神经再生素可作用于体外培养的神经细胞 。 展开更多
关键词 神经再生素 生长相关蛋白 神经丝蛋白 RT-PCR 基因表达 背根神经节细胞
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一种新的3.8kb缺失α地贫基因的鉴定
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作者 黄革 郑有为 +2 位作者 王景健 吴际 刘胜男 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期997-1000,共4页
目的首次报道一种新的3.8 kb缺失α地贫基因,利用gap-PCR技术建立该缺失片段检测方法。方法采集先证者及其母亲外周血,进行血液学参数常规地贫基因检测,对常规基因检测结果存在疑问标本重新设计新gap-PCR引物及体系以测试发现证实新的... 目的首次报道一种新的3.8 kb缺失α地贫基因,利用gap-PCR技术建立该缺失片段检测方法。方法采集先证者及其母亲外周血,进行血液学参数常规地贫基因检测,对常规基因检测结果存在疑问标本重新设计新gap-PCR引物及体系以测试发现证实新的缺失α地贫基因类型。结果先证者检出新的α珠蛋白基因缺失,缺失片段大小为3814 bp,确认先证者α地贫基因型为-α4.2/-α3.8,其母亲基因型为αα/-α3.8。结论本研究首例报告了一种新发现的3.8 kb缺失α地贫基因,丰富了世界地中海贫血突变基因数据库,特异性gap-PCR的建立为该类型地贫基因检出提供方便、有效的检测手段。 展开更多
关键词 Α地中海贫血 基因缺失 跨越断裂点PCR 首报
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TaqMan实时荧光定量PCR检测毕赤酵母基因组中外源基因拷贝数 被引量:6
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作者 李凯 高宏雷 +4 位作者 高立 祁小乐 高玉龙 徐延伟 王笑梅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期742-746,共5页
以3-磷酸甘油醛脱氢酶为内参基因,建立一种快速检测毕赤酵母基因组中外源基因拷贝数的TaqMan荧光定量PCR方法。通过对反应参数进行优化,建立针对目的基因和内参基因的双标准曲线,并对重组酵母基因组中外源基因和内参基因的拷贝数进行同... 以3-磷酸甘油醛脱氢酶为内参基因,建立一种快速检测毕赤酵母基因组中外源基因拷贝数的TaqMan荧光定量PCR方法。通过对反应参数进行优化,建立针对目的基因和内参基因的双标准曲线,并对重组酵母基因组中外源基因和内参基因的拷贝数进行同时定量检测,外源基因与内参基因起始模板拷贝数的比值即为外源基因在重组酵母菌株基因组中的拷贝数。结果表明,2条标准曲线在101~108拷贝.μL-1具有良好的线性关系,以及良好的敏感性和重复性。利用该方法对60株重组酵母菌株进行荧光定量PCR检测,结果筛选到38株单拷贝插入菌株和22株多拷贝插入菌株。本研究所建立的TaqMan探针荧光定量PCR方法方便、高效,可用于重组毕赤酵母基因组中外源基因拷贝数的检测。 展开更多
关键词 TaqMan荧光定量PCR 毕赤酵母 基因拷贝数 GAP基因
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引物间同源性和裂口对PCR扩增的影响 被引量:4
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作者 周鹏 《生命科学研究》 CAS CSCD 2000年第1期35-40,共6页
采用 PC/ Gene软件对能扩增出特异带和不能扩增的 PCR引物进行同源性比较 ,同源间“裂口 ( gaps)”差数的统计 ,得出同源率小于或等于 35% ,“裂口”差数大于或等于 3,是获得理想 PCR扩增效果的关键参数之一的结论 。
关键词 引物同源率 “裂口”差数 引物设计 PCR扩增
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跨跃断裂位点PCR检测α-珠蛋白生成障碍性贫血基因缺失及其临床应用
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作者 黄涛 何进才 《现代检验医学杂志》 CAS 2008年第2期113-114,共2页
目的评价跨跃断裂位点PCR(GAP-PCR)法检测α-珠蛋白生成障碍性贫血基因缺失(-α3.7,-α4.2,-SEA)的可行性,并进行初步临床应用。方法用GAP-PCR法检测158例临床疑诊为α-珠蛋白生成障碍性贫血病人血标本,用金标准Southern blot法进行盲... 目的评价跨跃断裂位点PCR(GAP-PCR)法检测α-珠蛋白生成障碍性贫血基因缺失(-α3.7,-α4.2,-SEA)的可行性,并进行初步临床应用。方法用GAP-PCR法检测158例临床疑诊为α-珠蛋白生成障碍性贫血病人血标本,用金标准Southern blot法进行盲法平行检测,评价前者方法学性能。结果GAP-PCR法检出α-珠蛋白生成障碍性贫血基因缺失阳性率为42.41%(67/158),其中αα/--SEA为32.91%(52/158),-α3.7/αα为6.96%(11/158),-α4.2/αα为1.90%(3/158),-α3.7/--SEA为0.63%(1/158),与Southern blot法完全一致。GAP-PCR法检测敏感度、特异度和准确度均为100%。结论此法检测结果准确,操作简便,为α-珠蛋白生成障碍性贫血诊断和筛查的有效方法。 展开更多
关键词 α-珠蛋白生成障碍性贫血 跨跃断裂位点-聚合酶链反应 基因诊断
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优化易错PCR条件以提高毕赤酵母GAP启动子文库突变效率 被引量:1
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作者 秦秀林 钱江潮 储炬 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期211-217,共7页
高效的随机突变策略对于构建含有丰富突变体的启动子文库至关重要。为了建立一个突变率适中并能获得较多有益突变子的易错PCR(error-prone PCR,EP-PCR)条件,实现毕赤酵母GAP启动子的高效突变,对EP-PCR反应条件进行了优化。考察了模板浓... 高效的随机突变策略对于构建含有丰富突变体的启动子文库至关重要。为了建立一个突变率适中并能获得较多有益突变子的易错PCR(error-prone PCR,EP-PCR)条件,实现毕赤酵母GAP启动子的高效突变,对EP-PCR反应条件进行了优化。考察了模板浓度、反应循环数和Mg2+浓度对EP-PCR的产物得率和突变率的影响后,确定了适于GAP启动子突变的EP-PCR条件:模板浓度、反应循环数和Mg2+浓度分别为1 ng/μL、25和10 mmol/L。优化EP-PCR条件后,GAP启动子突变率为1.1%,连续进行3轮EP-PCR后突变率可达到4.0%。利用优化后EP-PCR对GAP启动子进行随机突变,筛选了250个突变子,获得5个启动子强度高于野生型GAP启动子的突变体,有益突变达到了2%,可用于构建GAP启动子文库。 展开更多
关键词 易错PCR 突变效率 随机突变 毕赤酵母 GAP启动子
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