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Microfluidic approaches for synthetic gene circuits' construction and analysis
1
作者 Fengyu Zhang Yanhong Sun Chunxiong Luo 《Quantitative Biology》 CAS CSCD 2021年第1期47-60,共14页
Background:Microfluidic systems have advantages such as a high throughput,small reaction volume,and precise control of the cellular position and environment.These advantages have allowed microfluidics to be widely use... Background:Microfluidic systems have advantages such as a high throughput,small reaction volume,and precise control of the cellular position and environment.These advantages have allowed microfluidics to be widely used in several fields of synthetic biology in recent years.Results'.In this article,we reviewed the microfluidic-based methods for synthetic biology from two aspects:the construction of synthetic gene circuits and the analysis of synthetic gene systems.We used some examples to illuminate the progresses and challenges in the steps of synthetic gene circuits construction and approaches of gene expression analysis with microfluidic systems.Conclusion:Comparing to traditional methods,microfluidic tools promise great advantages in the synthetic genetic circuit building and analysis process.Moreover,new microfluidic systems together with the mathematical modeling of synthetic circuits or consortiums are desirable to perform complex genetic circuit construction and understand the natural gene regulation in cells and population interactions better. 展开更多
关键词 MICROFLUIDICS synthetic gene circuit ANALYSIS
原文传递
The Simulation Gene Regulatory Boolean Network based on the Seauential Circuit
2
作者 Zhencheng FANG 《International Journal of Technology Management》 2014年第8期46-49,共4页
关键词 基因调控网络 布尔网络 电路仿真 人类基因组计划 EDA技术 基因数据 生化环境 网络模型
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微生物酸胁迫耐受性能强化的研究进展 被引量:1
3
作者 胡锦超 沈文琦 +7 位作者 徐超业 樊雅祺 卢浩宇 蒋雯杰 李世龙 晋洪晨 骆健美 王敏 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期137-149,共13页
微生物在发酵生产中常面临各种酸性物质的累积,由此造成的酸胁迫严重抑制了菌株的发酵活力和生产性能。因此,微生物在长期进化过程中,通过协调胞内的多个生理系统、代谢途径和调控网络形成了复杂的响应机制以应对低pH胁迫。工业微生物... 微生物在发酵生产中常面临各种酸性物质的累积,由此造成的酸胁迫严重抑制了菌株的发酵活力和生产性能。因此,微生物在长期进化过程中,通过协调胞内的多个生理系统、代谢途径和调控网络形成了复杂的响应机制以应对低pH胁迫。工业微生物酸胁迫耐受性能的强化是提高其生产效率的关键手段。本文概述了近年来利用适应性实验室进化、预适应、基因组重排、基因工程、全局转录机制工程、系统生物学和合成生物学等方法提高微生物耐酸性能的研究进展,并讨论了相关研究面临的挑战和未来的发展方向。 展开更多
关键词 微生物 酸胁迫 耐受性强化 菌株改造 基因线路
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合成生物学和肿瘤治疗 被引量:1
4
作者 张百红 岳红云 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第13期2533-2536,共4页
合成生物学通过发现、认识和重构分子部件来编辑新的生物学功能,其合成的细菌、基因线路、蛋白质和糖类、核酸、病毒以及多细胞,现在已经用于肿瘤的细菌治疗、细胞治疗和肿瘤疫苗等临床领域。未来合成生物学可能带来全新的多功能蛋白质... 合成生物学通过发现、认识和重构分子部件来编辑新的生物学功能,其合成的细菌、基因线路、蛋白质和糖类、核酸、病毒以及多细胞,现在已经用于肿瘤的细菌治疗、细胞治疗和肿瘤疫苗等临床领域。未来合成生物学可能带来全新的多功能蛋白质、代谢通路和多细胞结构,这将改变现有的肿瘤治疗模式。 展开更多
关键词 肿瘤 合成生物学 基因线路
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放射诱导正反馈基因环路调控Wt-p53表达对肺腺癌移植瘤的抑制作用 被引量:4
5
作者 毛丽伟 王卫东 +2 位作者 廖国清 王红梅 陈正堂 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期473-476,共4页
目的:探讨放射控导的wt-p53蛋白正反馈基因环路对肺腺癌细胞裸鼠移植瘤放射增敏作用及机制。方法:将治疗组pE6R4-p53-EGFP/H1299细胞和对照组pE6-p53-EGFP/H1299、pR4-p53-EGFP/H1299、H1299(p53-/-)细胞分别注射于裸鼠背部皮下,建立裸... 目的:探讨放射控导的wt-p53蛋白正反馈基因环路对肺腺癌细胞裸鼠移植瘤放射增敏作用及机制。方法:将治疗组pE6R4-p53-EGFP/H1299细胞和对照组pE6-p53-EGFP/H1299、pR4-p53-EGFP/H1299、H1299(p53-/-)细胞分别注射于裸鼠背部皮下,建立裸鼠移植瘤模型;X线照射后,绘制肿瘤生长曲线;计算各组抑瘤率;免疫组化法检测瘤组织wt-p53表达;计算TCD50及放射增敏比(SER)。结果:pE6R4-p53-EGFP/H1299+IR组移植瘤生长明显受抑制,抑瘤率(86.41%)明显高于对照组pE6-p53-EGFP/H1299+IR组(70.76%)、pR4-p53-EGFP/H1299+IR组(35.53%)和H1299+IR组(12.58%)。免疫组化提示pE6R4-p53-EGFP/H1299组比pR4-p53-EGFP/H1299、pE6-p53-EGFP/H1299组wt-p53蛋白表达量明显增高。pE6R4-p53-EGFP/H1299组和对照组pE6-p53-EGFP/H1299和H1299(p53-/-)荷瘤鼠TCD50分别为12.1Gy、15.2Gy和19.4Gy,SER分别为1.6和1.28。结论:放射控导的wt-p53蛋白正反馈基因环路能在体内正常激活并发挥抗肿瘤生物学效应,且显著增加了瘤组织对放射的敏感性。 展开更多
关键词 基因环路 X线 肺腺癌
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放射控导正反馈基因环路对肺癌wt-p53基因靶向性表达的研究 被引量:3
6
作者 毛丽伟 王卫东 +1 位作者 李德志 陈正堂 《重庆医学》 CAS CSCD 2007年第19期1921-1923,共3页
目的构建pE_6R_4/p53/GFP重组质粒并检测其在人非小细胞肺癌H1299(p53—/—)细胞的辐射诱导表达。方法用嵌合型增强子E_6R_4取代pci-neo质粒的CMV增强子,将wt-p53cDNA全长序列、IRES_2-EGFP报告基因片段构建于嵌合型增强子E_6R_4下游,获... 目的构建pE_6R_4/p53/GFP重组质粒并检测其在人非小细胞肺癌H1299(p53—/—)细胞的辐射诱导表达。方法用嵌合型增强子E_6R_4取代pci-neo质粒的CMV增强子,将wt-p53cDNA全长序列、IRES_2-EGFP报告基因片段构建于嵌合型增强子E_6R_4下游,获得pE_6R_4/p53/GFP重组质粒,采用脂质体法将重组质粒转染人非小细胞肺癌H1299(p53—/—)细胞;采用RT-PCR方法鉴定wt-p53基因整合情况;Western-blot方法检测不同辐射剂量8mVX线照射后,被转染细胞中wt-p53蛋白表达水平和持续时间。结果酶切和测序鉴定pE_6R_4/p53/GFP重组质粒构建正确;不同剂量8mVX线照射后,4Gy照射剂量时wt- p53基因表达最强,且持续时间延长。结论成功将辐射反应元件和正反馈基因环路技术相结合,实现了wt-p53基因的表达调控,为进一步研究非小细胞肺癌的放射-基因联合治疗奠定了基础。 展开更多
关键词 基因环路 X线 非小细胞肺癌细胞
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基于基因表达式的演化硬件进化和优化算法 被引量:11
7
作者 谢方军 唐常杰 +2 位作者 元昌安 左劼 陈安龙 《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2005年第7期1415-1420,共6页
电路进化设计是可进化硬件研究的重要内容·针对电路进化设计做了如下工作:(1)融合了数据挖掘、基因表达式编程与传统电路进化技术,提出两阶段电路进化方法·该方法包括基于表达式树遗传编程进化算法的电路进化阶段和基于挖掘... 电路进化设计是可进化硬件研究的重要内容·针对电路进化设计做了如下工作:(1)融合了数据挖掘、基因表达式编程与传统电路进化技术,提出两阶段电路进化方法·该方法包括基于表达式树遗传编程进化算法的电路进化阶段和基于挖掘频繁数字电路算法的电路优化阶段·(2)给出了详尽的实验·实验表明6次多项式函数发现的平均进化代数为442代、乘法器电路的平均进化代数为2292代·比笛卡尔遗传编程和NEHF(NovelEvolvableHardwareFramework)快6倍以上·用MFDC对乘法器电路进化结果进行挖掘后,得到了比传统电路更有效的乘法器电路· 展开更多
关键词 电路进化 基因表达式编程 数据挖掘 挖掘频繁数字电路
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放射控导的wt-p53蛋白正反馈基因环路对肺腺癌细胞周期、凋亡及放射敏感性的影响 被引量:2
8
作者 毛丽伟 廖国清 +2 位作者 王红梅 王卫东 陈正堂 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期462-465,共4页
目的研究体外环境放射控导的wt-p53蛋白正反馈基因环路对肺腺癌细胞细胞周期、凋亡率及放射敏感性的影响。方法采用直线加速器8MV-X线,400MU/min、4Gy、源皮距100cm的照射条件照射治疗组pE6R4-p53-EGFP/H1299转染细胞和对照组H1299(p53-... 目的研究体外环境放射控导的wt-p53蛋白正反馈基因环路对肺腺癌细胞细胞周期、凋亡率及放射敏感性的影响。方法采用直线加速器8MV-X线,400MU/min、4Gy、源皮距100cm的照射条件照射治疗组pE6R4-p53-EGFP/H1299转染细胞和对照组H1299(p53-/-)、pE6-p53-EGFP/H1299和pR4-p53-EGFP/H1299转染细胞,12h后收集各组细胞,流式细胞仪分析该环路在放射线诱导下对肺腺癌细胞周期和细胞凋亡率的影响;绘制细胞放射剂量-存活曲线,计算平均致死剂量(Do)值及放射增敏比(sensitive enhancement ratio,SER)。结果4Gy8MV-X线照射治疗组和对照组细胞后12h,治疗组细胞在照射后(75.13±1.42)%发生明显G0/G1期阻滞;照射后各组细胞凋亡率均高于照射前,照射后治疗组细胞凋亡率为(23.73±0.21)%,分别是对照组H1299(p53-/-)细胞[(4.17±0.12)%]、pE6-p53-EGFP/H1299细胞[(15.67±0.32)%]、pR4-p53-EGFP/H1299细胞[(9.23±0.15)%]的5.69、1.51倍和2.57倍。治疗组pE6R4-p53-EGFP/H1299细胞和对照组pE6-p53-EGFP/H1299、H1299(p53-/-)细胞Do值分别0.91、1.073、1.413Gy,根据Do值计算SER分别为2.63和1.34。结论放射可诱导wt-p53蛋白正反馈基因环路上调wt-p53蛋白表达,从而调控肺腺癌细胞发生显著G/G1阻滞,使细胞凋亡比例增加,显著提高了肺腺癌细胞放射敏感性。 展开更多
关键词 放射治疗剂量 肿瘤抑制蛋白p53 基因环路 非小细胞肺癌 细胞系 肿瘤 辐射耐受性 体外研究
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基于基因表达式程序设计的电路优化算法研究 被引量:4
9
作者 颜雪松 时晨 黄士坦 《微电子学与计算机》 CSCD 北大核心 2008年第1期120-122,126,共4页
基于Xilinx Virtex-Ⅱ系列FPGA控制逻辑块(CLB)矩阵特点以及每一个控制逻辑块能实现任何2输入1输出的逻辑功能的特点,提出了一种基于基因表达式程序设计的电路优化算法。在该算法中染色体由按线性方式连接的逻辑单元矩阵组成,采用的遗... 基于Xilinx Virtex-Ⅱ系列FPGA控制逻辑块(CLB)矩阵特点以及每一个控制逻辑块能实现任何2输入1输出的逻辑功能的特点,提出了一种基于基因表达式程序设计的电路优化算法。在该算法中染色体由按线性方式连接的逻辑单元矩阵组成,采用的遗传操作包括变异和杂交,并利用真值表进行适应度评估。实验证明,所得到的电路结构优于传统方法。 展开更多
关键词 基因表达式 电路优化 演化硬件 遗传操作
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合成生物学重要研究方向进展 被引量:30
10
作者 丁明珠 李炳志 +3 位作者 王颖 谢泽雄 刘夺 元英进 《合成生物学》 2020年第1期7-28,共22页
合成生物学作为一个新兴的交叉学科领域,随着DNA合成技术的进步和合成生物学理念的深入,多个研究方向取得了长足发展。本文主要对基因回路、基因组设计合成、细胞工厂和人工多细胞体系的进展进行了综述。可设计构建的人工基因线路的复... 合成生物学作为一个新兴的交叉学科领域,随着DNA合成技术的进步和合成生物学理念的深入,多个研究方向取得了长足发展。本文主要对基因回路、基因组设计合成、细胞工厂和人工多细胞体系的进展进行了综述。可设计构建的人工基因线路的复杂度逐步提升,人工控制更加精细;组装技术取得快速进展的同时,人工基因组的设计深度也在不断拓展,设计合成的人工基因组由支原体拓展向大肠杆菌,甚至真核生物酿酒酵母,推动了生物进化演化的研究;细胞工厂的设计构建在逐步挑战代谢途径更长、复杂程度更高的化合物的合成,模块化和正交化策略对复杂细胞工厂构建的支撑作用日益明显,鲁棒性和适配性成为细胞工厂构建需要考虑的重要问题;人工多细胞体系的设计构建已经从设计构建两菌体系向多菌体系扩展,通过多种原则进行设计,实现更加复杂的预期功能。本文也对合成生物学与其他学科交叉融合产生的一些新研究方向进行了简介。 展开更多
关键词 合成生物学 基因回路 基因组设计合成 细胞工厂 人工多细胞体系
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有向图基因表达式程序的电路演化模型 被引量:7
11
作者 陶砚蕴 林家骏 徐萃华 《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第1期94-99,共6页
为提高组合逻辑电路的进化速率和成功率,在基因表达式的基础上,结合图形结构提出了有向图基因表达式(GGEP)模型.其中基因表达式包含符号和连接两部分,通过基因显示型映射得到的连接非循环有向图可以很好地描述进化电路,最大正确输出且... 为提高组合逻辑电路的进化速率和成功率,在基因表达式的基础上,结合图形结构提出了有向图基因表达式(GGEP)模型.其中基因表达式包含符号和连接两部分,通过基因显示型映射得到的连接非循环有向图可以很好地描述进化电路,最大正确输出且逻辑门数最少的电路为最优电路;提出了中立变异算法,使变异发生在基因表达式的非编码区域,产生电路进化的中立效果,并分析了该算法的复杂度,测试了中立对电路演化的影响.电路实验结果证明:GGEP模型比其他方法成功率高,演化速率快4~20倍;中立存在的GGEP模型的收敛速率和成功率都要比非中立变异的演化模型高出近一倍. 展开更多
关键词 数字电路 电路演化模型 基因表达式 遗传规划 中立性
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脉冲电流电磁场对淋巴细胞染色单体互换的影响 被引量:1
12
作者 姚学玲 陈景亮 +1 位作者 徐晓宙 徐传骧 《西安交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第8期855-859,共5页
通过不同模式的脉冲电流电磁场(PCEMFs)对离体的人体外周血淋巴细胞进行电磁辐射,初步得出PCEMFs对淋巴细胞姊妹染色单体互换(SCE)影响的规律:细胞SCE和破坏的程度与PCEMFs的磁感应强度Bm及其变化梯度dB/dt呈正相关关系.提出了使细胞SC... 通过不同模式的脉冲电流电磁场(PCEMFs)对离体的人体外周血淋巴细胞进行电磁辐射,初步得出PCEMFs对淋巴细胞姊妹染色单体互换(SCE)影响的规律:细胞SCE和破坏的程度与PCEMFs的磁感应强度Bm及其变化梯度dB/dt呈正相关关系.提出了使细胞SCE发生变异的临界参考指标,其中Bm为0 15T,dB/dt为1 8×104T/s,破坏的临界参考指标分别为2 64T和3 3×104T/s,为强电流脉冲放电环境的电磁防护研究提供了实验依据.细胞SCE及破坏的程度和PCEMFs中电场和磁场的空间相对位置有关,电场和磁场相互垂直的PCEMFs对细胞的影响程度比其他结构形式的PCEMFs显著. 展开更多
关键词 脉冲电流电磁场 姊妹染色单体互换 临界参考指标
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活体生物计算模型的研究进展及展望(英文)
13
作者 刘向荣 赵东明 +1 位作者 郗方 李菲 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2008年第12期2103-2108,共6页
活体生物计算模型是基于生物体内各种生化分子以特定的形式互相协作、处理信息的能力而出现的一种新的计算模型.由于其计算组成部件是直接镶嵌在生物活体里面,并且显示具有一定的计算能力,这可以使人们深入研究生物体信息处理能力以及... 活体生物计算模型是基于生物体内各种生化分子以特定的形式互相协作、处理信息的能力而出现的一种新的计算模型.由于其计算组成部件是直接镶嵌在生物活体里面,并且显示具有一定的计算能力,这可以使人们深入研究生物体信息处理能力以及获得对这种能力的有效控制.该文介绍了近几年几类体内生物计算模型,用于求解NP完全问题、基因逻辑电路、分子自动机研究状况,并对未来的发展方向进行了展望. 展开更多
关键词 生物计算 体内 NP问题 基因电路 分子自动机
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具有长期感应尿酸浓度功能的稳定细胞系的构建与鉴定
14
作者 凌婧怡 赵威 +4 位作者 曲国龙 阚乃鹏 温国霞 刘刚 陈惠鹏 《生物技术通讯》 CAS 2016年第2期153-157,共5页
目的:利用合成生物学方法构建具有尿酸感应作用的基因回路,稳定转染细胞系,构建长期自发稳定感应尿酸浓度的细胞系p-Huc O8-SEAP-m UTs。方法:以耐辐射型球菌R1基因组中转录抑制物基因huc R及其结合位点基因huc O为基本元件,人工合成优... 目的:利用合成生物学方法构建具有尿酸感应作用的基因回路,稳定转染细胞系,构建长期自发稳定感应尿酸浓度的细胞系p-Huc O8-SEAP-m UTs。方法:以耐辐射型球菌R1基因组中转录抑制物基因huc R及其结合位点基因huc O为基本元件,人工合成优化的转录抑制物基因m UTs及其结合位点的8串联结构基因huc O8,将m UTs和huc O8作为已知功能的生物模块,用于完成基因回路的构建,并稳定转染Hep G2细胞;通过实时定量PCR检测稳定细胞系中目的基因表达的稳定性,通过检测分泌型碱性磷酸酶(SEAP)的表达量来验证对尿酸的感应作用回路及其长期可逆性。结果和结论:构建了p-Huc O8-SEAP-m UTs稳定细胞系,稳定株不同代数之间目的基因的表达稳定;p-Huc O8-SEAP-m UTs稳定细胞系能有效地反映环境中的尿酸浓度,且比瞬时转染细胞系更加敏感,可逆性良好,没有明显的"记忆效应"。 展开更多
关键词 合成生物学 基因回路 尿酸 稳定细胞系
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一种基于GEP的演化硬件复杂电路优化算法 被引量:4
15
作者 李康顺 梁九生 +1 位作者 张文生 李元香 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2008年第18期83-86,共4页
演化硬件是近年来新兴的研究热点,它是演化算法和可编程逻辑器件相结合而形成的硬件设计新方法。在演化硬件中门电路的优化设计是一个重要的研究领域。提出一种新的基于基因表达式程序设计(GEP)的算法来进行复杂优化电路的设计,通过仿... 演化硬件是近年来新兴的研究热点,它是演化算法和可编程逻辑器件相结合而形成的硬件设计新方法。在演化硬件中门电路的优化设计是一个重要的研究领域。提出一种新的基于基因表达式程序设计(GEP)的算法来进行复杂优化电路的设计,通过仿真实验表明,该算法不仅收敛速度快,而且还能利用该算法优化大规模的门电路,克服了传统优化方法的求解速度慢甚至不收敛等缺点。该算法较传统的电路优化方法更简单、更高效。 展开更多
关键词 基因表达式程序设计 演化硬件 优化电路
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一种基于并行GEP的复杂电路优化算法 被引量:3
16
作者 李康顺 郭肇禄 张文生 《四川大学学报(工程科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第1期156-161,178,共7页
数字电路设计的优化是演化硬件中的研究热点,传统的优化方法主要是利用代数法和卡诺图求解法,但是在规模较大时却难于求出或无法求出最优的电路结构。提出一种新的基于并行基因表达式程序设计优化复杂数字电路的算法(COPGEP),该算法通... 数字电路设计的优化是演化硬件中的研究热点,传统的优化方法主要是利用代数法和卡诺图求解法,但是在规模较大时却难于求出或无法求出最优的电路结构。提出一种新的基于并行基因表达式程序设计优化复杂数字电路的算法(COPGEP),该算法通过各子种群之间优良个体的迁移,有效地传播优良个体,充分发挥了优良个体的导向作用,提高了传统GEP的全局寻优能力以及求解精度和收敛速度。通过仿真实验表明,该算法比传统GEP收敛速度更快,能够克服传统GEP算法在优化变量个数多于5个的数字逻辑电路时收敛速度慢,甚至不收敛等缺点。 展开更多
关键词 因表达式程序设计 并行算法 演化硬件 优化电路
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微生物合成腺苷蛋氨酸的研究进展 被引量:3
17
作者 赵伟军 黄磊 徐志南 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期99-105,共7页
腺苷蛋氨酸(SAM)是一种存在于所有细胞中的重要代谢产物,对肝病、抑郁症等疾病具有良好疗效,并且无任何副作用,市场需求巨大。目前,国内外学者对SAM的生物合成进行了广泛的研究,一方面在传统发酵法工业化生产SAM的基础上进一步改进发酵... 腺苷蛋氨酸(SAM)是一种存在于所有细胞中的重要代谢产物,对肝病、抑郁症等疾病具有良好疗效,并且无任何副作用,市场需求巨大。目前,国内外学者对SAM的生物合成进行了广泛的研究,一方面在传统发酵法工业化生产SAM的基础上进一步改进发酵策略;另一方面通过代谢工程优化宿主菌代谢网络或者利用基因电路等巧妙筛选方法来进行理性化育种。综述了微生物高效生产SAM的研究进展,讨论了微生物高效生产SAM的意义及存在的问题,旨为提高SAM工业化生产效率提供指导性意义。 展开更多
关键词 腺苷蛋氨酸 酵母 基因电路 发酵 代谢改造
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基于人工选择的组合电路优化算法
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作者 方振国 曹晴晴 陈得宝 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2012年第11期4056-4059,共4页
针对一般组合电路的优化算法复杂、优化过程时间长、优化效率偏低等问题,提出一种人工选择方式下的组合电路优化算法。该算法模拟物种进化时的家养模式,将最小项作为基因,函数表达式作为染色体,把逻辑电路的优化过程演变为遵循电路定律... 针对一般组合电路的优化算法复杂、优化过程时间长、优化效率偏低等问题,提出一种人工选择方式下的组合电路优化算法。该算法模拟物种进化时的家养模式,将最小项作为基因,函数表达式作为染色体,把逻辑电路的优化过程演变为遵循电路定律的基因变异、重组、寻优的过程。算法通过有利的变异条件,提高了算法的收敛速度和效率。通过与简单免疫、多目标遗传、自适应免疫算法的实验比较,证明了该算法的有效性和优越性。 展开更多
关键词 组合电路 优化算法 人工选择 本征基因 染色体
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利用表达谱数据噪音建立基因调控布尔网络
19
作者 王丽琴 刘思琦 《张家口职业技术学院学报》 2013年第1期58-60,共3页
电路理论研究方法已经非常成熟。由于电路理论中的分析方法和基因网络结构功能很相似,因此可以采用电路理论中的分析方法,利用基因表达谱中的数据噪音,建立基因调控布尔网络。对基因和蛋白质,利用表达谱数据中的噪音建立基因调控布尔网... 电路理论研究方法已经非常成熟。由于电路理论中的分析方法和基因网络结构功能很相似,因此可以采用电路理论中的分析方法,利用基因表达谱中的数据噪音,建立基因调控布尔网络。对基因和蛋白质,利用表达谱数据中的噪音建立基因调控布尔网络给出实例。 展开更多
关键词 电路理论 基因调控网络 布尔逻辑函数 卡诺图
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放射诱导HSV-TK基因在肺癌细胞中靶向、高效性表达的研究 被引量:5
20
作者 康保国 王卫东 +1 位作者 陈正堂 李德志 《重庆医学》 CAS CSCD 2007年第6期505-507,510,共4页
目的构建放射诱导的同步放大基因电路,通过基因电路调控HSV-TK基因在肺癌细胞中靶向、高效性表达,以提高放射-基因治疗的有效性和靶向性。方法利用分子克隆的方法将HSV-TK基因插入到同步放大基因电路载体的下游,并采用脂质体介导重组载... 目的构建放射诱导的同步放大基因电路,通过基因电路调控HSV-TK基因在肺癌细胞中靶向、高效性表达,以提高放射-基因治疗的有效性和靶向性。方法利用分子克隆的方法将HSV-TK基因插入到同步放大基因电路载体的下游,并采用脂质体介导重组载体和对照载体转染肺癌细胞A549;G418筛选阳性克隆,转染细胞给予2Gy X线照射后,检测照射前后不同时相点细胞内TK表达情况,及不同浓度前药GCV对转染重组载体和对照载体的肺癌细胞的生长抑制率。结果照射后转染同步放大重组载体的细胞内TK的表达明显强于对照组,且随时间的推移而逐渐增强,以照射后16h最为明显。同一浓度的GCV对转染同步放大载体的A549细胞的抑制率明显高于对照组和未转染组,IC50也明显低于对照组和未转染组。结论同步放大基因电路明显增强了靶细胞内HSV-TK基因的表达,进一步完善了放射-基因治疗这一新的肿瘤治疗模式。 展开更多
关键词 肺肿瘤 基因电路 HSV-TK基因 放射基因-治疗
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