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银杏GbGGPS基因的克隆及序列分析 被引量:12
1
作者 张洪娟 谭碧玥 曹福亮 《南京林业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期8-12,共5页
利用RACE技术克隆并获得了银杏牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因(GbGGPS基因)。银杏GbGGPS基因的cDNA全长为1 641 bp,含有1个1 176 bp的可读框,编码391个氨基酸序列。生物信息学预测GbGGPS蛋白的分子质量为42.51 ku,理论等电点为5.98,... 利用RACE技术克隆并获得了银杏牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因(GbGGPS基因)。银杏GbGGPS基因的cDNA全长为1 641 bp,含有1个1 176 bp的可读框,编码391个氨基酸序列。生物信息学预测GbGGPS蛋白的分子质量为42.51 ku,理论等电点为5.98,N端有叶绿体信号肽,其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。蛋白质同源分析表明,GbGGPS含有多聚异戊二烯基合成酶家族中保守的5个特征性结构域和2个富含天冬氨酸的区域。同源建模分析显示GbGGPS序列与薄荷GGPS蛋白的三维结构及活性位点高度相似。系统进化分析表明,银杏GGPS蛋白归属植物进化支,且与加拿大红豆杉、挪威云杉、北美冷杉的GGPS蛋白归为同一分支。 展开更多
关键词 银杏萜内酯 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(ggps) 蛋白质结构 生物信息学分析
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绿色杜氏藻DvGGPS生物信息学及转录差异研究 被引量:3
2
作者 周静 龚一富 +4 位作者 马颖瑞 刘浩 朱帅旗 王何瑜 严小军 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期635-642,共8页
香叶酰香叶酰焦磷酸合成酶(GGPS)能够催化焦磷酸异戊烯酯(IPP)与二甲基丙烯焦磷酸(DMAPP)反应形成二萜化合物通用前体香叶酰基香叶酰焦磷酸(GGPP)。为深入了解GGPS蛋白在类胡萝卜素合成途径中的作用,通过Illumina Hi Seq TM 2000高通量... 香叶酰香叶酰焦磷酸合成酶(GGPS)能够催化焦磷酸异戊烯酯(IPP)与二甲基丙烯焦磷酸(DMAPP)反应形成二萜化合物通用前体香叶酰基香叶酰焦磷酸(GGPP)。为深入了解GGPS蛋白在类胡萝卜素合成途径中的作用,通过Illumina Hi Seq TM 2000高通量测序获得Dv GGPS基因c DNA全长序列,对GGPS基因序列进行生物信息学分析,并研究花生四烯酸(AA)、乙酰水杨酸(ASA)和硫酸铈铵(ACS)对Dv GGPS基因转录水平的影响及绿色杜氏藻类胡萝卜素含量变化。生物信息学分析结果表明,Dv GGPS基因c DNA全长2 229 bp,含1 041 bp开放阅读框,编码346个氨基酸。GGPS蛋白质序列理论等电点(p I)为5.82,相对分子质量为37.66 k Da,该蛋白为疏水性蛋白,无信号肽和跨膜区域。二级结构预测显示该蛋白分子中α-螺旋结构最多,占57.23%。同源比对结果表明,绿色杜氏藻GGPS蛋白与雨生红球藻亲缘关系最近。qRT-PCR结果表明,62.5 mg·L^(-1)AA、50 mg·L^(-1)ASA和0.8 mg·L^(-1)ACS处理的Dv GGPS基因转录水平达到最高,此时类胡萝卜素含量也均有提高,说明绿色杜氏藻类胡萝卜素的生物学合成可能是通过诱导Dv GGPS基因表达实现的,Dv GGPS基因在类胡萝卜素生物合成中起关键作用。Dv GGPS基因的克隆及表达调控研究为今后探明类胡萝卜素积累的分子机理提供了重要参考,也为进一步通过代谢工程手段提高绿色杜氏藻类胡萝卜素含量奠定了理论基础。 展开更多
关键词 绿色杜氏藻 ggps基因 生物信息学分析 类胡萝卜素
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血浆GGPPS水平预测急性呼吸窘迫综合征严重程度及预后的研究
3
作者 高婷 许天祥 +3 位作者 代琴 岳阳 吕红旭 王晓霞 《内蒙古医学杂志》 2023年第8期897-902,共6页
目的研究血浆香叶基香叶基焦磷酸合成酶(Geranyl geranyl diphosphate synthase,GGPPS)表达水平与急性呼吸窘迫综合征(Acute respiratory distress syndrome,ARDS)患者严重程度的关系及其预后的判断价值。方法通过酶联免疫吸附法(Enzyme... 目的研究血浆香叶基香叶基焦磷酸合成酶(Geranyl geranyl diphosphate synthase,GGPPS)表达水平与急性呼吸窘迫综合征(Acute respiratory distress syndrome,ARDS)患者严重程度的关系及其预后的判断价值。方法通过酶联免疫吸附法(Enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)检测ARDS患者(ARDS组)和健康人群(对照组)血浆GGPPS水平,比较两组血浆GGPPS表达情况,比较轻度、中度、重度ARDS患者GGPPS表达水平,并对ARDS患者死亡组与存活组血浆GGPPS表达水平进行比较,同时分析ARDS患者血浆GGPPS表达与其他临床指标的关系,并绘制受试者工作特征曲线(Receiver operating characteristic curve,ROC),判断血浆GGPPS表达水平对ARDS患者预后价值。结果ARDS组血浆GGPPS水平表达明显高于对照组,并随着病情加重表达水平增高。ARDS死亡组血浆GGPPS水平高于ARDS存活组。ARDS患者中血浆GGPPS水平高表达,与高APACHEⅡ评分(r=0.429,P=0.000)、高SOFA评分(r=0.305,P=0.006)、低氧合指数(r=-0.836,P=0.000)、高白细胞计数(r=0.340,P=0.002)、高C反应蛋白(r=0.325,P=0.003)及高Lac(r=0.438,P=0.000)相关。血浆GGPPS水平预测ARDS患者预后的AUC是0.764,对ARDS患者预后有预测价值,最佳预测阈值为134.92 ng/L。结论ARDS患者血浆GGPPS表达水平高于正常人群,且其表达水平与ARDS病情严重程度及预后相关,GGPPS有望成为评估ARDS病情严重程度及预后的生物标志物。 展开更多
关键词 急性呼吸窘迫综合征 香叶基香叶基焦磷酸合成酶 预后 生物标志物
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cDNA cloning, chromosome mapping and expression characterization of human geranylgeranyl pyrophosphate synthase 被引量:2
4
作者 赵勇 余龙 +4 位作者 高洁 付强 华益民 张宏来 赵寿元 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2000年第6期613-622,共10页
Geranylgeranyl pyrophosphate (GGPP) mainly participates in post-translational modification for various proteins including Rho/Rac, Rap and Rab families, as well as in regulation for cell apoptosis. Geranylgeranyl pyro... Geranylgeranyl pyrophosphate (GGPP) mainly participates in post-translational modification for various proteins including Rho/Rac, Rap and Rab families, as well as in regulation for cell apoptosis. Geranylgeranyl pyrophosphate synthase (GGPPS), which catalyzes the condensation reaction between farnesyl diphosphate and isopentenyl diphosphate, is the key enzyme for synthesizing GGPP. We report the isolation of a gene transcript showing high homology with Drosophila GGPPS cDNA. The transcript is 1 466 bp in length and contains an intact open reading frame (ORF) ranging from nt 239 to 1 138. This ORF encodes a deduced protein of 300 residues with calculated molecular weight of 35 ku. The deduced protein shows 57.5% identity and 75% similarity with Drosophila GGPPS, and contains five characteristic domains of prenyltransferases. Northern hybridization revealed that human GGPPS was expressed highest in heart, and moderately in spleen, testis, brain, placenta, lung, liver, skeletal muscle, kidney and pancreas. No obvious bands were detected in other examined tissues. The GGPPS gene was located on human chromosome 1q43 by Radiation Hybrid mapping method. It was proved that there was a putative predisposing gene for prostate cancer in this region, and that analogs of GGPP can inhibit the geranylgeranylation of p21 rap protein in PC-3 prostate cancer cell lines. These facts suggest that GGPPS may be one of the candidate genes for prostate cancer. 展开更多
关键词 geranylgeranyl pyrophosphate synthase cDNA CLONING tissue distribution HUMAN CHROMOSOME 1q43.
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烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因NtGGPPS1的克隆和功能分析 被引量:10
5
作者 魏攀 孟利军 +9 位作者 陈千思 刘萍萍 谢小东 王燃 武明珠 张剑锋 魏春阳 杨军 林福呈 李锋 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第4期8-15,共8页
为进一步明确烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因NtGGPPS1的功能,根据已公布的普通烟草(Nicotiana tabacum)GGPPS1基因编码区序列设计特异性引物,从普通烟草K326中克隆到NtGGPPS1基因。构建荧光表达载体PFF19-Nt GGPPS1-GFP,对NtGGP... 为进一步明确烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因NtGGPPS1的功能,根据已公布的普通烟草(Nicotiana tabacum)GGPPS1基因编码区序列设计特异性引物,从普通烟草K326中克隆到NtGGPPS1基因。构建荧光表达载体PFF19-Nt GGPPS1-GFP,对NtGGPPS1基因进行亚细胞定位研究。通过荧光定量PCR分析了普通烟草K326在不同激素处理下NtGGPPS1基因的表达量变化。构建NtGGPPS1基因的RNAi载体pHellsgate2-Nt GGPPS1,通过农杆菌浸染烟草K326后获得NtGGPPS1基因显著下调的烟株,检测了烟株中质体色素含量的变化情况。结果表明:Nt GGPPS1融合蛋白基因的绿色荧光分布在烟草BY-2细胞的质体上,表明该基因定位于质体。用茉莉酸甲酯(MeJA)处理烟草后,NtGGPPS1基因的表达量显著升高,而用生长素(IAA)处理后,该基因的表达量下降。与对照相比,在NtGGPPS1基因下调的烟株中其质体色素含量均显著降低,预示NtGGPPS1参与了烟草β-胡萝卜素的生物合成。 展开更多
关键词 普通烟草 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶 亚细胞定位 激素处理 质体色素
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烟草NtGGPPS 3基因的亚细胞定位和组织表达分析 被引量:4
6
作者 孙建生 夏玉珍 +6 位作者 李正风 蔡联合 陈千思 王燃 魏春阳 杨军 李锋 《贵州农业科学》 CAS 2015年第8期38-41,共4页
为研究烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因NtGGPPS 3在烟草萜类物质合成中的功能,构建NtGGPPS 3与GFP融合蛋白的植物表达载体,并通过基因枪法瞬时转化烟草悬浮细胞BY2,研究该基因的亚细胞定位情况,并对该基因在烟草不同生育期不同器... 为研究烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因NtGGPPS 3在烟草萜类物质合成中的功能,构建NtGGPPS 3与GFP融合蛋白的植物表达载体,并通过基因枪法瞬时转化烟草悬浮细胞BY2,研究该基因的亚细胞定位情况,并对该基因在烟草不同生育期不同器官中的表达量进行分析。结果表明:NtGGPPS 3定位在烟草的叶绿体和质膜上;NtGGPPS 3基因在普通烟草主要生育期各组织中均表达,在叶片中表达量较高,在打顶期的茎中表达量明显上升。表明,该基因可能参与叶绿素、类胡萝卜素和质体醌等与光合作用相关萜类化合物的合成,也可能参与激素和防御相关的萜类物质合成。 展开更多
关键词 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因 亚细胞定位 组织表达 萜类化合物
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烟草NtGGPPS4基因的克隆和功能初步分析 被引量:1
7
作者 李锋 孟利军 +6 位作者 史艳梅 郑庆霞 刘萍萍 魏春阳 王燃 杨军 罗朝鹏 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第1期1-5,共5页
为明确烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因Nt GGPPS4的功能,从普通烟草中克隆到该基因,构建了超量表达载体p CAMBIA1300-Nt GGPPS4,并通过农杆菌介导法转化烟草。进一步测定了转基因烟株中西柏烷二萜醇和质体色素的含量。结果表明:... 为明确烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因Nt GGPPS4的功能,从普通烟草中克隆到该基因,构建了超量表达载体p CAMBIA1300-Nt GGPPS4,并通过农杆菌介导法转化烟草。进一步测定了转基因烟株中西柏烷二萜醇和质体色素的含量。结果表明:共鉴定出4株Nt GGPPS4表达量明显升高的转基因植株,且转基因植株中α-西柏三烯二醇(α-cembrenediol,α-CBD)和β-西柏三烯二醇(β-cembrenediol,β-CBD),以及新黄质、紫黄质、叶黄素、叶绿素a、叶绿素b和β-胡萝卜素等6种质体色素含量都有显著提高。表明Nt GGPPS4参与了烟草西柏烷二萜醇和类胡萝卜素的生物合成。 展开更多
关键词 烟草 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因 超量表达 功能分析
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NtGGPPS4基因RNAi载体构建与功能分析
8
作者 李锋 王根发 +7 位作者 武明珠 刘向真 郑庆霞 刘萍萍 王燃 罗朝鹏 杨军 魏攀 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第12期10-14,共5页
为研究NtGGPPS4在合成烟草萜类化合物中的功能,构建了该基因的RNAi表达载体pHellsgate2-NtGGPPS4,通过农杆菌介导法进行遗传转化。使用荧光定量PCR技术检测转基因烟株中NtGGPPS4的表达量,采用溶剂萃取法从转基因烟株中提取西柏三烯醇和... 为研究NtGGPPS4在合成烟草萜类化合物中的功能,构建了该基因的RNAi表达载体pHellsgate2-NtGGPPS4,通过农杆菌介导法进行遗传转化。使用荧光定量PCR技术检测转基因烟株中NtGGPPS4的表达量,采用溶剂萃取法从转基因烟株中提取西柏三烯醇和质体色素,并分别使用GC-MS、LC-MS测定其含量。结果表明,在NtGGPPS4表达量明显下降的转基因烟株中,α-西柏三烯二醇、β-西柏三烯二醇、新黄质、紫黄质、β-胡萝卜素、叶绿素a、叶绿素b和叶黄素的含量明显下降。表明NtGGPPS4参与调控了烟叶中西柏三烯醇和质体色素的生物合成。 展开更多
关键词 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶 萜类化合物 西柏三烯醇 质体色素 RNAI
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芥蓝牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因BoaGGPPS1的克隆及表达分析 被引量:3
9
作者 薛生玲 江敏 +5 位作者 常嘉琪 段妍雯 陈涛 郝宇 张芬 孙勃 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期259-265,共7页
本试验以芥蓝为试验材料,通过同源序列检索分析设计特异性引物,采用反转录PCR方法成功分离出芥蓝GGPPS1基因。BoaGGPPS1基因CDS全长为1 113 bp,编码370个氨基酸。生物信息学分析结果显示,BoaGGPPS1蛋白的等电点为6.07,相对分子量为39 7... 本试验以芥蓝为试验材料,通过同源序列检索分析设计特异性引物,采用反转录PCR方法成功分离出芥蓝GGPPS1基因。BoaGGPPS1基因CDS全长为1 113 bp,编码370个氨基酸。生物信息学分析结果显示,BoaGGPPS1蛋白的等电点为6.07,相对分子量为39 790,不含跨膜结构域和信号肽。序列分析结果显示,BoaGGPPS1与其他植物GGPPS高度保守,与结球甘蓝的一致性最高,达到98%。系统进化树分析结果表明,BoaGGPPS1与十字花科其他植物的亲缘关系较近,与结球甘蓝的亲缘关系最近。BoaGGPPS1基因在芥蓝不同器官中均有表达,其中叶片中的表达量最高,根系中的表达量最低。构建原核表达载体p EASY-Blunt E1-BoaGGPPS1,并对其进行诱导表达,结果发现该蛋白在大肠杆菌体内主要以包涵体的形式存在。 展开更多
关键词 芥蓝 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶 基因克隆 表达分析
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竹叶花椒ZaGGPPS基因克隆与表达分析 被引量:1
10
作者 关淑文 王毅 +3 位作者 郝佳波 原晓龙 陆斌 李贤忠 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期598-605,共8页
为了揭示竹叶花椒萜类代谢的分子机理及嫁接对其风味的影响,该文依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)基因的全长cDNA序列,命名为ZaGG... 为了揭示竹叶花椒萜类代谢的分子机理及嫁接对其风味的影响,该文依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)基因的全长cDNA序列,命名为ZaGGPPS,并利用NCBI、ProParam、SignalP 4.1 server、DNAMAN和MEGA 7.0软件对ZaGGPPS基因进行生物信息学分析,并比较其在嫁接树和实生树中的表达量。结果表明:ZaGGPPS包含完整的cDNA开放阅读框(OFR),由1086 bp组成,编码361个氨基酸。其蛋白的相对分子量为39079.14 Da,理论等电点pI为6.38。Blast比对结果显示该蛋白质属于GGPPS家族蛋白,含有2个GGPPS蛋白特有的天冬氨酸富集基序,分别是“DDXXXXD”和“DDXXD”,以及5个特征性功能结构域。系统进化树结果显示竹叶花椒与芸香科植物甜橙(Citrus sinensis)、克里曼丁桔(C.clementina)、柚子(C.maxima)等亲缘关系较近。荧光定量PCR检测显示,ZaGGPPS基因在竹叶花椒中的表达量从高到低分别为实生树的叶、嫁接树的叶、实生树的茎、嫁接树的茎。牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶是竹叶花椒萜类化合物生物合成途径中的关键酶,通过嫁接可影响ZaGGPPS基因在叶和茎中的表达量。该文对竹叶花椒ZaGGPPS基因进行了克隆与分析,为后续深入研究竹叶花椒香气形成的分子机理及利用分子生物学手段选育优良品种提供理论依据。 展开更多
关键词 竹叶花椒 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶 克隆 生物信息学分析
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烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因的克隆及分析 被引量:17
11
作者 李锋 李明 +3 位作者 金立锋 罗朝鹏 杨军 林福呈 《烟草科技》 EI CAS 北大核心 2012年第5期60-64,78,共6页
采用RACE技术,从烟叶中克隆了一个新的编码GGPPS蛋白的基因,命名为Ntggpps3,并对其进行了生物信息学分析。Ntggpps3的cDNA序列为1251 bp,包含一个长度为1092 bp的开放阅读框,编码363个氨基酸。NtGGPPS3蛋白与其他植物GGPPSs高度保守。... 采用RACE技术,从烟叶中克隆了一个新的编码GGPPS蛋白的基因,命名为Ntggpps3,并对其进行了生物信息学分析。Ntggpps3的cDNA序列为1251 bp,包含一个长度为1092 bp的开放阅读框,编码363个氨基酸。NtGGPPS3蛋白与其他植物GGPPSs高度保守。生物信息学预测结果表明,NtGGPPS3的分子量为39.5 kD,等电点为6.28,为亲水性蛋白,N端有叶绿体信号肽。二级结构主要由螺旋和无规则卷曲组成,三级结构含有两个富含天冬氨酸的区域,并通过同源建模构建了NtGGPPS3的3D模型。进化分析表明,植物的GGPPS分为大亚基和小亚基两个分支,而且NtGGPPS3属于大亚基。 展开更多
关键词 萜类化合物 [牛尨]牛儿基[牛尨]牛儿基焦磷酸合成酶 克隆 生物信息学分析
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烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因家族的全基因组鉴定 被引量:8
12
作者 李泽锋 魏攀 +8 位作者 夏玉珍 王中 武明珠 王燃 罗朝鹏 金立锋 杨军 林福呈 李锋 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1-8,共8页
为了揭示烟草栊牛儿基[牛 ]牛儿基焦磷酸合成酶(Geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPPS)基因家族的特征和功能,利用生物信息学方法对烟草GGPPS家族进行了全基因组查找、鉴定及相关分析。在普通烟草中共鉴定出9个成员(大亚基... 为了揭示烟草栊牛儿基[牛 ]牛儿基焦磷酸合成酶(Geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPPS)基因家族的特征和功能,利用生物信息学方法对烟草GGPPS家族进行了全基因组查找、鉴定及相关分析。在普通烟草中共鉴定出9个成员(大亚基7个、小亚基2个),林烟草、绒毛状烟草中分别鉴定出5个成员(大亚基4个、小亚基1个)。GGPP5的开放阅读框长度为999~1119bp,编码332~372个氨基酸,蛋白质分子量为36.2~40.7kD,等电点为5.41~8.32。大亚基和小亚基基因分别含有1个和2个外显子;大亚基与小亚基均具有DD(XX)。D和CXXXC保守性基序,但存在一定的差异。在进化过程中,烟草GGPPS家族可能发生了串联重复复制和片断复制;普通烟草GGPPS家族可能发生了基因丢失,NtabGGPPS1-1和NtabGGPPS1—2较其他成员进化速率快,同时可能受到了净化选择。 展开更多
关键词 普通烟草 林烟草 绒毛状烟草 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(ggpPS) 基因家族 全基因组
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西瓜GGPS基因果实特异性表达载体构建与遗传转化 被引量:3
13
作者 吕品 李朋伟 +1 位作者 马双武 赵文恩 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期432-437,455,共7页
[目的]将牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPS)基因转化西瓜。[方法]利用RT-PCR技术克隆西瓜果实GGPS基因CDS区;构建由果实特异性启动子AGPL1调控GGPS基因、以nptⅡ为筛选标记基因的植物表达载体... [目的]将牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPS)基因转化西瓜。[方法]利用RT-PCR技术克隆西瓜果实GGPS基因CDS区;构建由果实特异性启动子AGPL1调控GGPS基因、以nptⅡ为筛选标记基因的植物表达载体,并转入农杆菌EHA105;通过农杆菌介导法对西瓜品种"红一号"进行遗传转化。[结果]经过卡那霉素筛选和PCR初步鉴定,获得4株转基因阳性植株。[结论]构建了GGPS基因果实特异性表达载体,并将其转入西瓜品种"红一号"中,转化效率为0.13%。 展开更多
关键词 西瓜 ggps基因 AGPL1启动子 农杆菌介导 遗传转化
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发根农杆菌介导丹参牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶1基因RNA干扰载体的转化 被引量:5
14
作者 张蕾 程义勇 +1 位作者 漆小泉 高志贤 《生物技术通讯》 CAS 2009年第6期786-788,共3页
目的:利用发根农杆菌ACCC10060介导丹参牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶1基因(SmGGPS1)RNA干扰(RNAi)载体转化丹参叶片,生成SmGGPS1的RNAi转基因毛状根。方法:根据已克隆到的SmGGPS1特异区域设计并合成2段RNAi序列,分别插入RNAi双元载体pK7G... 目的:利用发根农杆菌ACCC10060介导丹参牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶1基因(SmGGPS1)RNA干扰(RNAi)载体转化丹参叶片,生成SmGGPS1的RNAi转基因毛状根。方法:根据已克隆到的SmGGPS1特异区域设计并合成2段RNAi序列,分别插入RNAi双元载体pK7GWIWG2D(Ⅱ)中,构建2个含卡那霉素(Kan)和绿色荧光蛋白(GFP)双筛选标记的植物表达载体pK7GWIWG2D(Ⅱ)-SmGGPS1-RNAi2和pK7GWIWG2D(Ⅱ)-SmGGPS1-RNAi3;利用带有上述2个RNAi载体的发根农杆菌ACCC10060侵染丹参叶片,诱导生成转基因毛状根;通过Kan抗性筛选和GFP绿色荧光观察统计转化率。结果:分别得到SmGGPS1-RNAi2和SmGGPS1-RNAi3转基因毛状根301根和399根,平均转化率为60.34%。结论:首次建立了发根农杆菌介导的外源基因转化丹参的体系。 展开更多
关键词 丹参 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶 RNA干扰载体 发根农杆菌
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高产脂思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因的克隆及表达 被引量:2
15
作者 王毅 原晓龙 +1 位作者 陈伟 李江 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2018年第6期711-716,共6页
以高产脂思茅松为材料,基于转录组数据分析,采用RT-PCR方法获得思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)基因的c DNA序列,Gen Bank登录号为KM382173.1.序列分析显示,思茅松GGPS基因c DNA全长1 152 bp,编码383个氨基酸,属于GGPS家族.... 以高产脂思茅松为材料,基于转录组数据分析,采用RT-PCR方法获得思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)基因的c DNA序列,Gen Bank登录号为KM382173.1.序列分析显示,思茅松GGPS基因c DNA全长1 152 bp,编码383个氨基酸,属于GGPS家族.序列比对分析显示,思茅松GGPS拥有GGPS家族特有的两个功能保守结构域FARM(DDLPSMDND)、SARM(DDILD),其与马尾松GGPS的同源性为78.07%.系统进化树分析显示,思茅松GGPS与马尾松GGPS的亲缘关系最近.荧光定量PCR分析表明,在思茅松的树皮中,GGPS基因的表达明显受到割脂物理伤害的诱导,在高产脂思茅松个体幼枝中的表达量远远高于在低产脂思茅松个体的表达量. 展开更多
关键词 高产脂 思茅松 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(ggps) 荧光定量PCR 基因功能
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GGPPS及其抑制剂在肿瘤中的研究进展 被引量:1
16
作者 王鑫 许天祥 +3 位作者 李彦庆 任猛 贾向东 王晓霞 《生命的化学》 CAS 2023年第6期831-840,共10页
香叶基香叶基焦磷酸合酶(geranylgeranyl diphosphate synthase,GGPPS)是甲羟戊酸途径中的一种分支酶,参与蛋白质异戊二烯化。GGPPS通过介导多条细胞信号通路,在细胞的生物学功能和疾病的发生机制中发挥关键作用,调节各种疾病的病理进展... 香叶基香叶基焦磷酸合酶(geranylgeranyl diphosphate synthase,GGPPS)是甲羟戊酸途径中的一种分支酶,参与蛋白质异戊二烯化。GGPPS通过介导多条细胞信号通路,在细胞的生物学功能和疾病的发生机制中发挥关键作用,调节各种疾病的病理进展。GGPPS在肿瘤中表达异常,而表达水平与预后密切相关,故有望成为肿瘤早期诊治的一种新兴的生物指标。本文主要对GGPPS的生物学功能、在肿瘤中的作用及其抑制剂在肿瘤中的应用进行总结,寻求其在未来肿瘤疾病防治中的潜在价值。 展开更多
关键词 香叶基香叶基焦磷酸合酶 ggpPS抑制剂 肿瘤
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烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶小亚基基因的克隆及组织表达谱 被引量:10
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作者 林世锋 王仁刚 +6 位作者 张孝廉 邹颉 钟晓武 郭玉双 付强 赵杰宏 任学良 《烟草科技》 EI CAS 北大核心 2014年第2期70-75,共6页
为揭示牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)小亚基在烟草(Nicotiana tabacum)中的生理功能,采用电子克隆的方法,结合RT-PCR和SMART RACE技术,从烟草中克隆到1个牛儿基牛儿基焦磷酸合成酶小亚基基因的cDNA序列,命名为NtGGPPS5(GenBank... 为揭示牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)小亚基在烟草(Nicotiana tabacum)中的生理功能,采用电子克隆的方法,结合RT-PCR和SMART RACE技术,从烟草中克隆到1个牛儿基牛儿基焦磷酸合成酶小亚基基因的cDNA序列,命名为NtGGPPS5(GenBank登陆号:KF316932)。该基因全长1320 bp,编码332个氨基酸,与番茄(Solanum lycopersicum,XP_004246572)及其野生种(Solanum pennellii,ADZ24721)的GGPPS小亚基的氨基酸序列一致性均为92%,具有一个特征性的异戊二烯合成酶保守的天门冬氨酸富集区。进化分析表明,植物GGPPS分为大亚基和小亚基两个分支,而且NtGGPPS5属于小亚基。实时荧光定量PCR试验表明,NtGGPPS5基因在烟草根、茎、叶和芽中均有表达,表达量为芽>叶>茎>根。 展开更多
关键词 烟草 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶小亚基 基因克隆 组织表达
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基于过表达技术的烟草NtGGPPS1基因功能的研究 被引量:3
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作者 李锋 王燃 +8 位作者 武明珠 郑庆霞 王中 王峰 刘萍萍 罗朝鹏 金立锋 杨军 魏攀 《河南大学学报(自然科学版)》 CAS 2019年第2期180-185,共6页
将NtGGPPS1-T质粒和spCAMBIA1300载体分别双酶切(SalⅠ和KpnⅠ)后连接,转化,挑取单克隆,筛选得到植物超量表达载体spCAMBIA1300-NtGGPPS1,并通过农杆菌介导侵染栽培烟草K326,在获得阳性转基因烟草后,进行定量RT-PCR以定量分析烟草牻牛... 将NtGGPPS1-T质粒和spCAMBIA1300载体分别双酶切(SalⅠ和KpnⅠ)后连接,转化,挑取单克隆,筛选得到植物超量表达载体spCAMBIA1300-NtGGPPS1,并通过农杆菌介导侵染栽培烟草K326,在获得阳性转基因烟草后,进行定量RT-PCR以定量分析烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因NtGGPPS1在转基因植株中的转录积累.同时,通过LC-MS和GC-MS检测转基因植株中质体色素和萜类化合物含量的变化.结果显示,与对照组相比,NtGGPPS1基因在编号为Nt1-OE1、2、3、4、7植株中表达上调,阳性转基因烟草中新黄质、紫黄质、叶黄素、叶绿素a、叶绿素b和β-胡萝卜素6种质体色素,以及烟叶中代表性二萜类物质α-西柏三烯二醇(α-CBD)和β-西柏三烯二醇(β-CBD)的含量明显增加.以上结果表明,NtGGPPS1基因参与了烟草中质体色素和二萜类化合物的生物合成. 展开更多
关键词 烟草 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因 过表达 质体色素 萜类化合物
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三七GGPPS基因CDS序列克隆及原核表达 被引量:1
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作者 唐美琼 闵丹丹 +2 位作者 赵以民 胡营 李刚 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第15期3667-3671,共5页
目的为研究GGPPS基因在三七中的功能,从三七中克隆GGPPS基因CDS序列,并进行原核表达。方法以3年生三七叶组织为材料,依据Genbank中已报道的GGPPS基因序列设计引物,利用RT-PCR技术,克隆得到编码区序列;克隆片段连接到p ET-30α(+)表达载... 目的为研究GGPPS基因在三七中的功能,从三七中克隆GGPPS基因CDS序列,并进行原核表达。方法以3年生三七叶组织为材料,依据Genbank中已报道的GGPPS基因序列设计引物,利用RT-PCR技术,克隆得到编码区序列;克隆片段连接到p ET-30α(+)表达载体,转入大肠杆菌BL21后,在异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导下进行表达。结果三七GGPPS基因CDS序列全长1 032 bp,编码343个氨基酸。SDS-PAGE结果表明,所构建的原核表达载体表达的融合蛋白大小在29 000~44 000,且表达产物主要以不溶性包涵体形式存在。结论成功克隆了三七GGPPS基因CDS序列,建立了稳定的原核表达体系,为进一步研究其在三七中的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 三七 ggpPS基因 CDS 克隆 原核表达
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菘蓝牦牛儿基牦牛儿基焦磷酸合成酶基因(IiGGPPS1)的克隆及其表达特性分析 被引量:5
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作者 韩立敏 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1172-1178,共7页
本研究通过分析菘蓝转录组数据库得到一条牦牛儿基牦牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)的编码序列,利用RT-PCR扩增得到其全长,命名为Ii GGPPS1,利用生物信息学方法对该基因及其编码的蛋白进行分析,并对该基因的功能、表达特性进行了研究。研究... 本研究通过分析菘蓝转录组数据库得到一条牦牛儿基牦牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)的编码序列,利用RT-PCR扩增得到其全长,命名为Ii GGPPS1,利用生物信息学方法对该基因及其编码的蛋白进行分析,并对该基因的功能、表达特性进行了研究。研究结果表明:Ii GGPPS1的c DNA序列全长为1 086 bp,开放阅读框长1 080 bp,编码359个氨基酸。Ii GGPPS1蛋白与其它植物GGPPSs高度保守,蛋白N端含有叶绿体信号肽,二级结构主要由螺旋和无规则卷曲组成,同源建模结果显示Ii GGPPS1蛋白是个同源二聚体。组织特异表达分析表明该基因在叶片中的表达量最高,根中次之,茎中最低,且受虫害颜色浅的叶片中该基因表达量显著低于正常叶片中的表达量,推测该基因可能与二萜化合物叶绿素的合成相关。该结果将为进一步研究菘蓝牦牛儿基牦牛儿基焦磷酸合成酶基因(Ii GGPPS1)的功能及其表达调控奠定理论基础,也可为菘蓝的生长、发育调节与品质改良积累研究资料。 展开更多
关键词 菘蓝 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶 克隆 生物信息学分析 组织表达特性
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