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Mining Applicable Elite Alleles of Growth Duration, Plant Height and Panicle Number per Plant by Conditional QTL Mapping in Japonica Rice 被引量:2
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作者 Jian-hua JIANG Qi-bing ZHAO +4 位作者 Qiang-ming LIU Lan CHEN Fu-long CHEN Bao-jian QIAO De-lin HONG 《Rice science》 SCIE 2011年第3期196-203,共8页
Unconditional and conditional QTL mapping were conducted for growth duration (GD), plant height (PH) and effective panicle number per plant (PN) using a recombinant inbred line (RIL) population derived from a cross be... Unconditional and conditional QTL mapping were conducted for growth duration (GD), plant height (PH) and effective panicle number per plant (PN) using a recombinant inbred line (RIL) population derived from a cross between two japonica rice varieties Xiushui 79 and C Bao. The RIL population consisted of 254 lines was planted in two environments, Nanjing and Sihong, Jiangsu Province, China. Results showed that additive effects were major in all of QTLs for GD, PH and PN detected by the two methods, and the epistatic effects explained a small proportion of phenotypic variation. No interactions were detected between additive QTL and environment, and between epistatic QTL pairs and environment. After growth duration was adjusted to an identical level, RM80-160bp was detected as an applicable elite allele for PN, with an additive effect of 0.71. When effective panicle number per plant was adjusted to an identical level, RM448-240bp was detected as an applicable elite allele for GD, with an additive effect of 4.64. After plant height was adjusted to an identical level, RM80-160bp was detected as an applicable elite allele for PN, with an additive effect of 0.62, and RM448-240bp was detected as an applicable elite allele for GD, with an additive effect of 3.89. These applicable elite alleles could be used to improve target traits without influencing the other two traits. 展开更多
关键词 japonica rice growth duration plant height effective panicle number per plant unconditional QTL mapping conditional QTL mapping recombinant inbred line
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湖南省似大地水准面模型对比研究
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作者 喻艳梅 尹羿晖 《科技创新与应用》 2024年第26期109-112,共4页
正常高系统是以似大地水准面为基准的高程系统,也是中国目前采用的高程系统。随着GNSS定位技术的广泛应用,已能在10-7~10-9的精度量级上获得测量点的平面位置,但是却一直未能以相应的精度求解点的高程值。因此,通过建立高精度、高分辨... 正常高系统是以似大地水准面为基准的高程系统,也是中国目前采用的高程系统。随着GNSS定位技术的广泛应用,已能在10-7~10-9的精度量级上获得测量点的平面位置,但是却一直未能以相应的精度求解点的高程值。因此,通过建立高精度、高分辨率的区域似大地水准面模型提升高程测量的精度,成为重要的技术手段。该文通过对湖南省2007似大地水准面模型后期各似大地水准面模型的对比研究,找到模型的差异,并对差异较大的地区进行特征分析,查找形成差异的原因,可为全省二、三等水准网测量和大地水准面再精化工作提供参考。 展开更多
关键词 大地水准面 高程异常 似大地水准面模型 等值线图 模型对比
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基于InDel标记的谷子株高QTL定位 被引量:1
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作者 杜晓芬 钱枰励 +5 位作者 唐楚楚 杜德杰 韩康妮 李禹欣 王智兰 王军 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期217-225,共9页
插入/缺失(InDel)标记在植物基因组中广泛分布,然而谷子中InDel标记的数量十分有限。为挖掘InDel位点和开发分子标记,本研究基于衡谷12号和长农35号的深度重测序结果,分析其单核苷酸多态性(SNP)、InDel和结构变异(SV)。利用JoinMap 4软... 插入/缺失(InDel)标记在植物基因组中广泛分布,然而谷子中InDel标记的数量十分有限。为挖掘InDel位点和开发分子标记,本研究基于衡谷12号和长农35号的深度重测序结果,分析其单核苷酸多态性(SNP)、InDel和结构变异(SV)。利用JoinMap 4软件构建连锁遗传图谱,利用WinQTLCart 2.5软件定位株高数量性状位点(QTL),利用生物信息学、测序和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)进行候选基因分析。研究表明,3种变异类型数量由多到少排序为SNP>InDel>SV;获得1392个在衡谷12号和长农35号中具有多态性的InDel标记,多态性率为35.14%,这些标记在谷子9条染色体上分布不均;获得一张包含467个InDel标记的谷子遗传连锁图谱,该图谱总图距448.45 cM,平均图距0.96 cM;利用F2群体定位了4个株高QTL(qPH5-1、qPH5-2、qPH9-1和qPH9-2),进一步利用重组自交系(RIL)群体对其中2个效应值较大的QTL(qPH5-1和qPH9-2)进行验证,结果重新检测到qPH9-2,似然比的自然对数(LOD)值为93.6,加性效应为-46.15,解释表型贡献率(PVE)达91.06%;Seita.9G080400在编码区存在2处非同义突变,且在茎中表达水平呈极显著差异,推测Seita.9G080400可能是控制株高的关键候选基因。本研究开发的InDel标记能够良好地应用于株高QTL定位,同时可为谷子种质资源鉴定、亲缘关系分析等研究提供一套好用的分子标记。 展开更多
关键词 谷子 重测序 标记开发 连锁遗传图谱 株高 QTL
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控制玉米株高基因PHR1的基因克隆
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作者 杨晨曦 周文期 +8 位作者 周香艳 刘忠祥 周玉乾 刘芥杉 杨彦忠 何海军 王晓娟 连晓荣 李永生 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期55-66,共12页
株高属于玉米理想株型育种的一个重要指标,不但影响玉米机械化收获,更与玉米的倒伏性和生物产量密切相关。本研究以低剂量快中子(4.19 Gy)辐照诱变玉米自交系KWS39获得的矮秆低穗位突变体为研究对象,该突变体命名为plant height reducin... 株高属于玉米理想株型育种的一个重要指标,不但影响玉米机械化收获,更与玉米的倒伏性和生物产量密切相关。本研究以低剂量快中子(4.19 Gy)辐照诱变玉米自交系KWS39获得的矮秆低穗位突变体为研究对象,该突变体命名为plant height reducing mutant-1(phr-1),开展了表型性状的田间调查分析,并利用phr-1×B73获得的F2分离群体,借助极端性状混池测序分析法(BSA-seq)及目标区段重组交换鉴定的方法,基于B73参考基因组对目标区段内的基因进行挖掘和功能注释,定位候选基因。研究结果表明,在1号染色体Bin1.06区间可能存在变异位点,进而利用大的分离群体结合目标区段多态性标记开发,将目标区段精细定位分子标记到Umc1122和Umc1583a两个标记之间约600 kb区间,该区段内存在一个控制株高的已知基因Brachytic2(BR2),BR2编码一个调控玉米茎秆中生长素极性运输的糖蛋白。候选基因测序结果表明,phr-1是BR2基因在第4个外显子处插入了165 bp的序列,导致第547位氨基酸变为终止子,蛋白翻译提前终止。phr-1的基因突变位点和变异方式与已报道的br2-1单个碱基发生变异位点完全不同,通过等位杂交实验证明了phr-1突变体就是br2-1的一个新等位突变体,候选基因就是BR2基因。本研究为玉米BR2基因在玉米株高遗传改良中提供了新的种质资源。 展开更多
关键词 玉米 株高 穗位高 BSA混池测序 基因定位 功能分析
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展颖野生稻株高性状的遗传与SD1基因的等位变异分析 被引量:1
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作者 杨先冬 刘伟 +3 位作者 曹利霞 李孝辉 陆怡 傅雪琳 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期18-26,共9页
为了探究SSSL-B50和华粳籼74(HJX74)株高差异的原因,利用SSSL-B50与HJX74回交构建F2群体进行株高性状遗传分析与基因定位。结果显示,F1植株表现为高秆;260个单株组成的F2群体株高出现分离,高秆植株与半矮秆植株分离比例符合3∶1(χ^(2)=... 为了探究SSSL-B50和华粳籼74(HJX74)株高差异的原因,利用SSSL-B50与HJX74回交构建F2群体进行株高性状遗传分析与基因定位。结果显示,F1植株表现为高秆;260个单株组成的F2群体株高出现分离,高秆植株与半矮秆植株分离比例符合3∶1(χ^(2)=0.18<3.84),说明SSSL-B50高秆性状为显性性状,受1对显性等位基因控制。利用IciMapping软件对F2进行连锁分析,将SSSL-B50携带的高秆基因定位在1号染色体代换片段上的标记S18和X161之间38.38~39.07 Mb。候选基因筛选分析发现,定位区间内存在着“绿色革命”基因座位SD1。对展颖野生稻、SSSL-B50及HJX74进行SD1基因测序及序列比对,发现HJX74的CDS序列与展颖野生稻、SSSL-B50相比有280 bp的缺失,导致氨基酸编码提前终止。qRT-PCR结果表明,SD1表达量在SSSL-B50茎秆的第2,3,4节均显著高于HJX74。此外,与前人报道结果相比,展颖野生稻SD1基因编码的氨基酸序列发生了2处改变(E100G、Q339R)。研究结果弄清楚了展颖野生稻单片段代换系SSSL-B50高秆性状受SD1调控,同时从展颖野生稻鉴定到了SD1的新等位型SD1Glu。 展开更多
关键词 展颖野生稻 株高 染色体片段代换系 基因定位 等位型
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融合星载GNSS-R数据和多变量参数全球海洋有效波高深度学习反演法
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作者 布金伟 余科根 +4 位作者 汪秋兰 李玲惠 刘馨雨 左小清 常军 《测绘学报》 EI CSCD 北大核心 2024年第7期1321-1335,共15页
星载GNSS-R作为一种新兴的观测方法,最近被应用于有效波高反演。现有研究通常使用从延迟多普勒图中提取的特征值以构建经验地球物理模型函数反演SWH。然而,使用多个变量参数作为模型输入具有很大挑战。为此,本文提出了一个融合星载GNSS-... 星载GNSS-R作为一种新兴的观测方法,最近被应用于有效波高反演。现有研究通常使用从延迟多普勒图中提取的特征值以构建经验地球物理模型函数反演SWH。然而,使用多个变量参数作为模型输入具有很大挑战。为此,本文提出了一个融合星载GNSS-R数据和多变量参数反演全球海面SWH的深度学习网络模型(GloWH-Net)。为了验证本文模型的性能,ERA5、WaveWatchⅢ和AVISO SWH数据被用作广泛测试的参考数据,以评估GloWH-Net模型和先前模型(即经验模型和机器学习模型)的SWH反演性能。结果表明,当分别使用ERA5、WaveWatchⅢ和AVISO SWH作为参考值时,所提的GloWH-Net模型反演SWH的均方根误差分别为0.330、0.393和0.433 m,相关系数分别为0.91、0.89和0.84。相比基于最小方差估计器的经验组合模型反演SWH的均方根误差分别降低了53.45%、48.06%和40.63%;相比袋装树机器学习模型反演SWH的均方根误差分别降低了21.92%、18.72%和4.47%。表明了本文方法在反演全球海面SWH方面具有显著优势。 展开更多
关键词 GNSS-R 延迟多普勒图 海洋有效波高 经验模型 深度学习模型
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无人机技术在大面积建筑物高度测量中的应用
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作者 王赫 张欢 《城市勘测》 2024年第1期149-152,共4页
基于倾斜摄影测量原理,以天津市滨海新区某地区为研究区域,采用大疆公司Phantom 4 RTK无人机航摄系统获取测区影像数据,利用ContextCapture(Smart 3D)软件构建三维实体模型,并使用EPS软件进行模型空间信息的采集绘制工作,完成大比例尺... 基于倾斜摄影测量原理,以天津市滨海新区某地区为研究区域,采用大疆公司Phantom 4 RTK无人机航摄系统获取测区影像数据,利用ContextCapture(Smart 3D)软件构建三维实体模型,并使用EPS软件进行模型空间信息的采集绘制工作,完成大比例尺地形图同时量取测区范围内所有房屋建筑物的高度。最后均匀选取部分点位与全站仪测量点位数据进行精度对比分析,得到平面点位误差均小于0.1 m,并计算出平面中误差为0.087 m,高度中误差为0.044 m,符合规范的要求,证明了技术的可行性。 展开更多
关键词 倾斜摄影测量 三维建模 大比例尺地形图 高度量测 技术应用
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我国陆地区域似大地水准面对数字化测图的适用性分析
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作者 张雪萍 聂建亮 +1 位作者 王莉莉 杨新海 《测绘标准化》 2024年第1期11-15,共5页
全球导航卫星系统(GNSS)与区域似大地水准面能够代替低等级水准测量,获取正常高成果。为服务于各省不同比例尺测图项目,本文分析我国陆地区域似大地水准面对数字化测图的适用性。首先,统计国内各省(市)的区域似大地水准面精度情况;然后... 全球导航卫星系统(GNSS)与区域似大地水准面能够代替低等级水准测量,获取正常高成果。为服务于各省不同比例尺测图项目,本文分析我国陆地区域似大地水准面对数字化测图的适用性。首先,统计国内各省(市)的区域似大地水准面精度情况;然后,推导不同比例尺测图中,似大地水准面模型为满足不同地形类别下高程点的限差应达到的精度。结果表明,大多数省(市)的区域似大地水准面模型均优于±0.1 m,能够满足中大比例尺测图需要,可以为各省开展不同比例尺测图提供技术服务。 展开更多
关键词 正常高 区域似大地水准面 数字化测图 水准测量
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大场景中基于IHDT的激光回环检测算法
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作者 董杰 蒋林 +2 位作者 陈跃龙 吴广卓 汤勃 《农业装备与车辆工程》 2024年第11期109-115,122,共8页
针对大场景下机器人定位和地图构建中的累积漂移偏差问题,提出一种基于强度、高度与密度三进制模式(IHDT)描述子的激光回环检测算法。将点云空间划分为三进制单元块提取全局描述子IHDT,其中包含点云的强度、高度和密度信息。为提高回环... 针对大场景下机器人定位和地图构建中的累积漂移偏差问题,提出一种基于强度、高度与密度三进制模式(IHDT)描述子的激光回环检测算法。将点云空间划分为三进制单元块提取全局描述子IHDT,其中包含点云的强度、高度和密度信息。为提高回环检测的效率,避免直接匹配大场景中的关键帧,采用两阶段搜索算法;为确定与当前帧IHDT描述子最为相似的候选帧,通过检索历史帧IHDT的二进制矩阵,进而确定最终的目标回环索引。在KITTI 05大场景中,所提IHDT-LIO-SAM算法的轨迹均方根误差和标准差分别为1.81、2.23 m,相较于基于欧式距离的LIO-SAM回环检测算法分别减少34%和50%,显著降低了误差。在拥有多个回环的大场景中,所提方法展现出了更好的适应性。 展开更多
关键词 大场景 回环检测 强度、高度与密度三进制模式 同步定位建图
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Mining Elite Alleles of Growth Duration and Productive Panicle Number per Plant by Association Mapping with Conditional Phenotypic Value in Japonica Rice 被引量:1
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作者 JIANG Jian-hua CHEN Lan +2 位作者 LIU Qiang-ming HE Ying-jun HONG De-lin 《Rice science》 SCIE 2013年第3期200-206,共7页
To provide genetic information and materials for breeding hybrid japonica rice with wide adaptability and strong competitive advantage of yield, elite alleles and their carrier varieties of growth duration (GD) and ... To provide genetic information and materials for breeding hybrid japonica rice with wide adaptability and strong competitive advantage of yield, elite alleles and their carrier varieties of growth duration (GD) and productive panicle number per plant (PN) were detected. A natural population composed of 94 japonica varieties was phenotyped for the GD, PN and plant height (PH) in two environments. The conditional phenotypic data were transferred by the linear model method in software QGAStation 1.0, and association mapping based on the unconditional and conditional phenotype values of GD and PN was analyzed by using general linear model in software TASSEL. A total of 34 simple sequence repeat (SSR) marker loci associated with GD and PN were detected in the two environments. Among them, 15 were associated with GD, and 19 were associated with PN. Four elite alleles of RM8095-120bp, RM7102-176bp, RM72-170bp and RM72-178bp were associated with GD, and their carrier varieties were Hongmangshajing, Nipponbare, Hongmangshajing and Nannongjing 62401, respectively. These elite alleles from the carrier varieties can shorten GD by 2.03-9.93 d when they were introduced into improved materials. RM72-182bp associated with PN was an elite allele, and its carrier variety was Xiaoqingzhong. It can increase PN by three when introduced into improved materials. Moreover, these elite alleles can be used to improve target traits without influencing another two traits. 展开更多
关键词 japonica rice growth duration productive panicle number per plant plant height association mapping with conditional phenotypic value elite allele
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The Validity of Open-Source Elevations for Different Topographic Map Scales and Geomatics Applications
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作者 Gomaa M. Dawod Ibrahim E. Ascoura 《Journal of Geographic Information System》 2021年第2期148-165,共18页
This paper presents an analysis of four open-source Global Digital Elevation Models (GDEMs) and compares them on two topographic profiles (nearly flat, and hills regions) for mapping and geomatics applications. The ch... This paper presents an analysis of four open-source Global Digital Elevation Models (GDEMs) and compares them on two topographic profiles (nearly flat, and hills regions) for mapping and geomatics applications. The chief intention is to investigate if GDEMs-based heights, contour intervals, slopes, and topographic profiles are valid for all map scales of topographic mapping, which constitutes a major issue in mapping activities. Two case studies, the Nile delta in Egypt and Makkah city in Saudi Arabia, have been utilized to represent flat and moderate-topography patterns. The investigated GDEMs include the most-recent released models: ASTER v.3, ACE 2, SRTMGL1 v.3, and NASADEM_HGT v.1 released in 2019 and 2020 with spatial resolutions of 1 and 3 arc seconds. Available accurate Ground Control Points (GCP) consist of 540 stations in the Nile delta and 175 stations in Makkah. Based on the available datasets in two study areas, it has been found that the accuracy of investigated GDEMs over known checkpoints ranges from ±2.5 and ±5.1 meters in the Nile delta region, while it varies between ±5.1 and ±8.0 meters in the Makkah area. That indicates that the utilization of GDEMs in topographic mapping differs significantly between flat and hilly spatial regions. Therefore, it is recommended to avoid using GDEMs for developing topographic maps of scale 1:25,000 or larger in flat regions and map scale 1:50,000 or larger in hilly regions. Additionally, the accomplished results showed that all GDEM-based slopes do not match with the actual slopes from known GCP over cross section’s length up to 30 kilometers. Thus, it is concluded that GDEMs are not the appropriate heights’ source for topographic mapping at medium and large map scales, and could not be utilized for topographic profiling in precise engineering and geomatics applications. 展开更多
关键词 Topographic maps GDEMs heightS map Scales Contour Interval
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Analysis of unmanned aerial vehicle navigation and height control system based on GPS 被引量:3
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作者 Jianjun Zhang Hong Yuan 《Journal of Systems Engineering and Electronics》 SCIE EI CSCD 2010年第4期643-649,共7页
According to the characteristic of global positioning system(GPS) reflection signals,a GPS delay mapping receiver system scheme is put forward,which not only satisfies the unmanned aerial vehicle(UAV) guidance loc... According to the characteristic of global positioning system(GPS) reflection signals,a GPS delay mapping receiver system scheme is put forward,which not only satisfies the unmanned aerial vehicle(UAV) guidance localization but also realizes height measurement.A code delay algorithm is put forward,which processes the direct and land reflected signal and outputs the navigation data and specular point.The GPS terrain reflected echo signal mathematical equation is inferred.The reflecting signal area,when the GPS signal passes the land,is analyzed.The height survey model reflected land surface characteristic is established.A simulation system which carries guidance localization of the UAV and the height measuring control through the GPS direct signal and the land reflected signal is designed,taken the GPS satellite as the illumination source,the receiver is put on the UAV.Then the UAV guidance signal,the GPS reflection signal and receiver's parallel processing are realized.The parallel processing reduces UAV's payload and raises system's operating efficiency.The simulation results confirms the validity of the model and also provides the basis for the UAV's optimization design. 展开更多
关键词 height measuring global positioning system(GPS) reflected signal delay mapping receiver unmanned aerial vehicle(UAV).
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基于水稻矮秆长粒CSSL-Z688的QTL鉴定及SSSLs培育 被引量:2
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作者 李苗苗 李儒香 +9 位作者 秦鱼河 邓岢莉 余金琎 徐光益 向思茜 杨正林 桑贤春 凌英华 何光华 赵芳明 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期33-44,共12页
水稻株高、粒型等性状是由多基因控制的数量性状,遗传基础复杂.水稻染色体片段代换系(CSSL)是研究复杂性状的理想遗传材料,然而目标基因的水稻单片段代换系(SSSL)的培育则需要多年多代逐步完成.以4代换片段的水稻矮秆长大粒CSSL-Z688为... 水稻株高、粒型等性状是由多基因控制的数量性状,遗传基础复杂.水稻染色体片段代换系(CSSL)是研究复杂性状的理想遗传材料,然而目标基因的水稻单片段代换系(SSSL)的培育则需要多年多代逐步完成.以4代换片段的水稻矮秆长大粒CSSL-Z688为研究材料,鉴定出7个株高及粒型性状的数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL);进一步培育了目标QTL的5个纯合单片段代换系和5个杂合单片段代换系,其中6个QTLs(qPH1-1,qPH1-2,qGL1,qGL12,qRLW1和qGWT1)能够被纯合单片段代换系所验证.还鉴定出11个新QTLs,分别为qPH2,qGL1-2,qGL2,qGW1,qRLW1-2,qRLW2,qRLW12,qGWT1-2,qGWT2,qGWT6和qGWT12,其中7个QTLs尚未被报道.QTL加性和显性效应表明:水稻株高、粒长、千粒质量等表型同时受到多个QTL加性和显性效应的共同影响,如来自供体西恢18的qph1-1,qPH1-2,qPH2的加性效应和qPH1-1/qph1-1及qPH1-2/qph1-2和qPH2/qph2的显性效应共同影响株高的遗传;来自西恢18的qGL1,qgl1-2,qGL2和qGL12的加性效应及qGL1/qgl1的显性效应共同影响水稻粒长的遗传;来自西恢18的qGWT1,qGWT1-2,qGWT2,qGWT6和qGWT12的加性效应及qGWT1/qgwt1,qGWT1-2/qgwt1-2,qGWT6/qgwt6,qGWT2/qgwt2和qGWT12/qgwt12的显性效应共同影响千粒质量的遗传.这些结果表明单片段代换系的构建可有效地将遗传复杂的数量性状分解为单位点进行研究,为以单片段代换系为平台的水稻分子设计育种提供了重要遗传信息. 展开更多
关键词 水稻 染色体片段代换系(CSSL) 粒型 株高 QTL定位
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调控玉米株高和穗位高候选基因Zmdle1的定位 被引量:6
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作者 周文期 张贺通 +8 位作者 何海军 龚佃明 杨彦忠 刘忠祥 李永生 王晓娟 连晓荣 周玉乾 邱法展 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期821-837,共17页
【目的】株高是玉米株型育种的重要目标性状之一,不仅与玉米籽粒的机械化收获及抗倒伏相关,也与玉米产量密切相关。因此,挖掘玉米株高 QTL/基因并解析其功能具有重要的理论和育种价值,定位一个新的玉米矮秆基因 ZmDLE1,阐明其生物学功能... 【目的】株高是玉米株型育种的重要目标性状之一,不仅与玉米籽粒的机械化收获及抗倒伏相关,也与玉米产量密切相关。因此,挖掘玉米株高 QTL/基因并解析其功能具有重要的理论和育种价值,定位一个新的玉米矮秆基因 ZmDLE1,阐明其生物学功能,为加速改良玉米的株型提供重要的理论依据和基因资源。【方法】利用化学诱变剂甲基磺酸乙酯(EMS)诱变甘肃省农业科学院作物研究所自育玉米骨干自交系 LY8405,M2后代分离获得一个单基因调控隐性遗传的玉米矮秆低穗位突变体,M3、M4后代能稳定遗传,命名为 dwarf and low ear mutant1(Zmdle1),通过与 Mo17 杂交构建 F2分离群体,借助极端性状混池测序分析法(BSA-seq)及目标区段重组交换鉴定的方法,基于 Mo17 参考基因组对目标区段内的基因进行挖掘和功能注释,定位候选基因。【结果】开展了 Zmdle1 表型鉴定,突变体 Zmdle1 苗期表型与对照 LY8405 无显著性差异,成熟期植株株高和穗位高较 LY8405 分别降低 87.2 和 55.4 cm,为 35.0%和 62.9%,差异极显著。细胞形态学观察表明,穗下节间数减少及节间细胞长度缩短是导致 Zmdle1 的株高和穗位高显著降低的主要原因。利用 F2:3遗传群体,进行突变基因的遗传分析,后代野生型和突变体植株分离比例符合 3:1(χ^(2)=2.854),说明突变基因为细胞核遗传的单隐性基因。因此,根据 BSA-seq 结果,将候选基因 ZmDLE1 初步定位在玉米第 1 染色体 Bin1.09-1.10 区段约 15 Mb 区间内,进一步利用 Mo17 和Zmdle1 重测序结果开发多态性分子标记,通过图位克隆手段精细定位目标基因,最终将候选基因定位到约 600 kb 大小区间,该区间内有 16 个候选基因。比对重测序数据,发现 Zm00001d033231 在第 2062位置碱基 G 变成 A,导致氨基酸由甘氨酸变成丝氨酸,且转录水平表达比 LY8405 极显著降低,Zm00001d033234 第 223 位置碱基由 T变成C,导致第75位氨基酸由丝氨酸变成脯氨酸,转录水平无显著差异,通过对该候选区段群体关联分析及功能注释发现Zm00001d033231 和Zm00001d033234均与玉米生长发育相关。【结论】定位到第 1 染色体末端 Bin1.09区段候选基因 ZmDLE1,有效调控玉米株高和穗位高,精细定位缩小目标区段至600 kb区间内 Zm00001d033231 与株高显著关联。 展开更多
关键词 玉米 株高 穗位高 BSA-seq 基因定位 关联分析
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基于BSA-seq和RNA-seq挖掘水稻株高相关QTL 被引量:2
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作者 吴元明 林佳怡 +4 位作者 柳雨汐 李丹婷 张宗琼 郑晓明 逄洪波 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期173-184,共12页
株高是影响水稻产量稳定性的重要因素之一,水稻株高相关QTL的定位及候选基因的挖掘,有助于深入了解株高分子调控机制,进而为培育理想株型的水稻品种奠定基础。以油占8号及广西野生稻为亲本构建的285个CSSL群体为试验对象,结合NGS与BSA-... 株高是影响水稻产量稳定性的重要因素之一,水稻株高相关QTL的定位及候选基因的挖掘,有助于深入了解株高分子调控机制,进而为培育理想株型的水稻品种奠定基础。以油占8号及广西野生稻为亲本构建的285个CSSL群体为试验对象,结合NGS与BSA-seq等方法,利用SNP和InDel两种分子标记进行关联分析,对可能与株高相关的基因组区段进行定位。结果显示,Δ(SNP-index)分子标记在Chr.7和Chr.10中分别关联到3.205和1.311 Mb大小的候选基因组区域。Δ(InDel-index)标记关联到的基因组区域大小分别为2.848和1.292 Mb,且全部包含于Δ(SNP-index)关联到的区间内。结合GO、KEGG、Uniprot、eggNOG等数据库中的功能注释、高质量多态性位点筛选以及已有的株高相关转录组数据,最终关联到Chr.7中的5个候选基因,包括功能和机理已知的OsTCP21。RT-qPCR结果显示,OsTCP21在高株和矮株中的表达差异与已有研究结果相一致,LOC_Os07g05050和LOC_Os07g02850在高株中表达量较高,LOC_Os07g04220和LOC_Os07g02770在矮株中表达量较高。这5个候选基因在水稻株高性状的调控中起重要的作用,OsTCP21是一个关键调控基因。 展开更多
关键词 水稻 株高 定位 BSA-seq RNA-SEQ
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北斗卫星反射信号岸基海面高度反演精度的评估 被引量:1
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作者 张云 赵乐久 +3 位作者 孟婉婷 秦瑾 盛志超 杨树瑚 《北京航空航天大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第5期999-1008,共10页
北斗B3I信号作为新一代民用码,相较于北斗B1I信号,具有码速率更高、码片宽度更窄等特点。目前,利用北斗卫星导航系统反射测量(BDS-R)技术对北斗B3I信号进行海面高度反演的研究较少。基于此,在2020年9月7日山东威海附近海域,接收B1I/B3I... 北斗B3I信号作为新一代民用码,相较于北斗B1I信号,具有码速率更高、码片宽度更窄等特点。目前,利用北斗卫星导航系统反射测量(BDS-R)技术对北斗B3I信号进行海面高度反演的研究较少。基于此,在2020年9月7日山东威海附近海域,接收B1I/B3I双频段的直射和反射信号数据,分别采用时延-多普勒(DDM)和载波相位延迟进行岸基海面高度反演。通过实测的同比数据验证反演精度,在信号特性和测高方法2个维度评估北斗B1I和B3I信号海面高度反演的性能。结果显示:采用DDM测高方法,B1I频段和B3I频段的反演结果与实测数据的平均绝对误差和均方根误差分别为1.18 m、1.48 m和0.84 m、1.10 m;采用载波相位延迟测高方法,B1I频段和B3I频段的反演结果与实测数据的平均绝对误差和均方根误差分别为0.12 m、0.15 m和0.10 m、0.12 m。由于信号特性差异,B3I频段的DDM测高结果相较于B1I频段的测高结果精度提高了28%;B3I频段的载波相位延迟测高结果精度略优于B1I频段,两者差异不明显。实验对北斗B1I和B3I信号特性和测高方法导致的反演精度差异的评估,证明了B1I和B3I反射信号均能适用于海面高度反演的需求。 展开更多
关键词 北斗卫星导航系统反射测量 岸基 时延-多普勒 载波相位延迟 海面高度反演 精度评估
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基于Super-GBS的高粱株高和节间数QTL定位 被引量:1
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作者 徐建霞 丁延庆 +5 位作者 冯周 曹宁 程斌 高旭 邹桂花 张立异 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期185-194,共10页
株高及相关性状是影响高粱株型和产量的关键因素,定位影响这些性状的主效QTL,为高粱的分子遗传改良提供依据。以美国高粱品种BTx623和贵州酒用高粱品种红缨子杂交构建的包含205个家系的重组自交系(RIL)群体为材料,在5个环境条件下调查... 株高及相关性状是影响高粱株型和产量的关键因素,定位影响这些性状的主效QTL,为高粱的分子遗传改良提供依据。以美国高粱品种BTx623和贵州酒用高粱品种红缨子杂交构建的包含205个家系的重组自交系(RIL)群体为材料,在5个环境条件下调查株高和节间数。利用Super-GBS技术进行基因分型,建立SNP标记遗传图谱,采用完备区间作图法(ICIM)开展QTL定位。结果表明,在第1、3、4、8、9染色体上一共检测到18个QTL,其中,与株高和节间数相关的QTL分别为7和11个。有10个主效QTL在多个环境中或2个性状中被重复检测到,其中q PH9.1与已知的株高基因Dw1一致,而q PH1.2、qPH3.2、qIN3.2以及q IN8.1所在区间内包含了4个与影响水稻株高或节间伸长的基因同源。 展开更多
关键词 高粱 株高 节间数 QTL定位 候选基因
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番茄短节间基因BRACHYTIC(BR)的精细定位及其候选基因特异性分子标记的开发
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作者 杨沛 宁宇 +10 位作者 魏凯 刘晓林 杨孟霞 李珊珊 王孝宣 国艳梅 刘磊 李鑫 杜永臣 李君明 黄泽军 《中国蔬菜》 北大核心 2023年第11期47-55,共9页
番茄株型矮化紧凑有利于实现轻简化栽培。短节间突变位点brachytic(br)已经成功应用于番茄矮化育种。利用Heinz1706与含br位点的无限生长型樱桃番茄品种VFNT Cherry构建的F2分离群体,通过交换单株筛选及后代鉴定,将br位点定位到分子标记... 番茄株型矮化紧凑有利于实现轻简化栽培。短节间突变位点brachytic(br)已经成功应用于番茄矮化育种。利用Heinz1706与含br位点的无限生长型樱桃番茄品种VFNT Cherry构建的F2分离群体,通过交换单株筛选及后代鉴定,将br位点定位到分子标记HP5589和ZP273之间约14.9 kb的范围内。根据番茄基因组注释信息ITAG 4.0版本,该区间存在2个基因Solyc01g066970和Solyc01g066980,均为开花促进因子(Flowering Promoting Factor 1,FPF1)的同源基因。第2代重测序数据分析发现VFNT Cherry中Solyc01g066980基因的大部分序列缺失。根据该序列变异开发了1个共显性PCR分子标记BRD,试验结果将有助于番茄株型分子改良和株高调控分子机理研究。 展开更多
关键词 番茄 株高 短节间 精细定位 分子标记
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普通小麦(浙农林12×CASL7AS)DH系株高的分析
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作者 陈玉翠 胡鑫 +3 位作者 赵燕昊 彭星木 丁明全 戎均康 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期1524-1533,共10页
小麦株高与植株倒伏密切相关,影响小麦产量。为挖掘小麦株高QTL位点和候选基因,从遗传和分子水平上解释株高分子机理,本研究将野生二粒小麦染色体臂置换系CASL7AS为母本,课题组自选株系浙农林12(简称ZNL12)为父本,杂交F 1经过花培得到17... 小麦株高与植株倒伏密切相关,影响小麦产量。为挖掘小麦株高QTL位点和候选基因,从遗传和分子水平上解释株高分子机理,本研究将野生二粒小麦染色体臂置换系CASL7AS为母本,课题组自选株系浙农林12(简称ZNL12)为父本,杂交F 1经过花培得到178个DH群体。通过4年2个种植点株高数据,利用55K SNP芯片构建高密度遗传图谱,对小麦株高性状进行QTL分析。该遗传连锁图谱包含3655个SNP标记,长度为4738.45 cM,标记间平均遗传距离为1.30 cM,覆盖了小麦21条染色体。其中,A、B、D染色体组分别含有标记1466、1492和697个。QTL分析共检测出53个QTL位点,分布于1A、3A、5A、7A、1B、3B、4B、5B、7B、2D、4D、6D和7D染色体上,可解释2.80%~38.50%表型变异。其中,稳定主效QTL有2个,分别为QPh.zafu.4B-1和QPh.zafu.4D-1,其贡献率分别为25.18%~38.50%和20.67%。经细胞生物学分析,基因型为(0,2)矮秆植株胚芽鞘的表皮细胞长度显著短于基因型为(2,0)的高秆植株,基因型为(0,0)、(2,2)中间型的植株胚芽鞘表皮细胞长度无显著差异,由此推测小麦株高的变异由细胞长度因素决定。QPh.zafu.4B-1候选基因Rht-B1b基因编码区矮秆株系,第904核苷酸处发生碱基“C-T”的突变,形成终止密码子(CAG-TAG);而QPh.zafu.4D-1候选基因Rht-D1b基因编码区矮秆株系,第781核苷酸处碱基突变“G-T”,编码氨基酸中缬氨酸变为天冬氨酸。结果为小麦株高候选基因的筛选和QTL定位提供了优异的遗传位点和候选基因,未来可用于小麦抗倒伏相关的分子标记辅助育种。 展开更多
关键词 六倍体小麦 株高 QTL定位 双单倍体
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基于半直接法的高度激光里程计
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作者 高珂 肖辉勇 +3 位作者 姜宇凡 李琼峰 杨济源 王斐 《应用科技》 CAS 2023年第5期1-7,共7页
针对同步定位与建图(simultaneous localization and mapping,SLAM)在户外环境中定位与建图鲁棒性、准确性不足的问题,提出了一种基于半直接法的高度激光里程计(height laser odometer based on semi-direct method,SLO)。与现有的激光... 针对同步定位与建图(simultaneous localization and mapping,SLAM)在户外环境中定位与建图鲁棒性、准确性不足的问题,提出了一种基于半直接法的高度激光里程计(height laser odometer based on semi-direct method,SLO)。与现有的激光里程计算法相比,该方法避免了三维点云的显式计算,主动对三维点进行降维处理生成图片,避免了三角测量误差和单目视觉SLAM中的尺度不确定性和尺度漂移问题。在高度图的基础上结合了直接方法和间接方法,使得系统在使用迭代最近点算法(iterative closest point,ICP)进行帧间匹配时更稳定、更轻便并且计算量小。高度图的使用弥补了直接方法的灰度不变性假设的缺点,并减少了照明的影响。在KITTI数据集和井下作业自动导向车(automated guided vehicle,AGV)平台上的实验结果表明,本文提出的方法有较高的鲁棒性与准确性。 展开更多
关键词 激光里程计 高度图 半直接法 激光SLAM 单目视觉 迭代最近点算法 三维点云 自动导向车
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