珠海市2011年连续发生5起乙型流感疫情的病毒HA1基因分析

目的分析珠海市2011年多起连续发生的流感疫情中分离的乙型流感毒株HA1基因特性,阐述流感暴发的原因。方法用MDCK细胞分离培养流感病毒,提取病毒核酸,采用RT-PCR扩增病毒HA基因并测定核苷酸序列,用ClustalX和MEGA4.1分析结果。结果珠海市2011年多起连续发生的流感疫情中分离的乙型流感病毒属Victoria系,与2011年流感监测分离株2011C-IN-0056-7相比,没有核苷酸的丢失和插入,没有糖基化位点的改变,核苷酸同源性在97.3%以上,氨基酸有1~3个位点发生了变异,属于同一变异株。与2010-2011年北半球乙型流感疫苗株B/Brisbane/60/2008相比较,核苷酸同源性在98.5%以上,氨基酸有1~4个位点发生变异,也属于同一变异株。结论引起本市流感连续暴发疫情的原因可能是本地流行株抗原漂移所致,与疫苗株B/Brisbane/60/2008核苷酸和氨基酸同源性都很高,吻合性较好,如果能够在儿童中普遍接种,应该能够起到很好的预防作用。

南平市2009年季节性H1N1流感病毒血凝素HA1基因特征研究

目的了解南平市2009年季节性H1N1流感病毒血凝素HA1基因特征。方法随机选取4株从哨点医院分离到的季节性H1N1流感毒株,进行核酸提取和RT-PCR扩增,获得HA1基因片段,测定核苷酸序列,分析其基因特征。结果 4株季节性H1N1流感病毒与A/California/01/2009(H1N1)高度同源,同源性高达99.1%;相对于当前疫苗代表株A/Brisbane/59/2007(H1N1),其HA1区出现V131A、S141N、I184V、G185A、N186D、A189T和F260Y的氨基酸位点的改变;糖基化位点未发生改变。结论南平市2009年分离的季节性H1N1流感病毒抗原性发生一定的突变,但变异程度不大,应密切关注疫苗株对毒株的免疫效果。

2006～2008年B型流感病毒泰山分离株血凝素基因序列分析

目的分析泰安市2006~2008年度分离的B型流感病毒HA1基因序列,探究其基因变异特点及种系进化分布,为流感防治提供技术支持。方法采集监测医院流感样病例鼻、咽拭子标本,分离流感病毒并进行型别鉴定,选取部分B型流感病毒株提取病毒RNA,采用逆转录-聚合酶链反应扩增血凝素基因,扩增产物经纯化后进行血凝素基因HAl区核苷酸序列测定并推导编码的氨基酸序列,然后用DNAsTAR MegAlign序列分析软件进行基因种系进化特性分析。结果 2006/2007年度分离的B型流感病毒均为Victroria系;2007/2008年度以Yamagata系为优势株,也有少量Victroria系活动。与B/Shanghai/361/2002/2和B/Tianjin/144/05比较,Yamagata系泰山分离株HA氨基酸替换数为8~10个,所有毒株均在7~9个相同氨基酸位点发生了相同替换;与疫苗推荐株B/Malaysia/2506/2004比较,Vic-troria系泰山分离株氨基酸替换数为2~3个,所有毒株均在HA2个相同氨基酸位点发生了相同替换。结论 Yama-gata系泰山分离株HA1基因特性已发生改变,从基因水平说明当地Yamagata系流行株抗原发生了变异;Victroria系分离株基因特性虽有所改变,但是否已成为有流行病学意义的变异株,尚有待进一步观察。2006/2007年度流感疫苗对当地B型流感应有一定预防作用,2007/2008年度疫苗对B型流感的预防效果欠佳。

1999-2008年广东省韶关市H3亚型流行性感冒病毒的变迁

目的通过A型流行性感冒(流感)病毒H3亚型血凝素HA1基因的变异,探讨韶关市1999-2008年H3亚型流感病毒的变迁。方法复苏韶关市疾病预防控制中心保存的历年H3亚型流感毒株,提取病毒RNA,RT-PCR扩增病毒HA1基因,纯化产物进行核苷酸序列测定,使用DNAStart MegAlign等生物软件包对序列进行分析。结果研究测定了4个年份的流感毒株,与代表株A/Panama/2007/1999相比,同源性为91.3%～93.8%,在5个抗原决定簇共14个氨基酸发生变异,RBS上有6个位点发生变异,各毒株均在不同的位点上增加了一个糖基化位点;与代表株A/Fujian/411/2002比较,同源性为90.2%～97.7%,18个氨基酸变异发生在5个抗原决定簇,10个氨基酸变异发生在RBS,A/SG/199/1999,A/SG/y009/2008分别增加了一个糖基化位点;与代表株A/Wisconsin/67/2005比较,同源性从88.3%～98.4%,共有14个氨基酸变异发生在5个抗原决定簇,RBS上有9个氨基酸发生变异,各毒株均在不同的位点上增加了一个糖基化位点;本次研究的毒株变异率逐渐下降,变异最活跃的两个氨基酸第158和173位点分别位于B和D抗原决定簇。结论韶关市H3亚型流感病毒在1999-2008年间发生了3次抗原性变异,每一次变异大约间隔3～4年。从2008年的氨基酸变异情况得知,H3亚型流感病毒的抗原性漂移有增强的趋势。