高盐低pH值法提取大豆不同组织DNA的效果

以大豆品种吉农18和吉林47的叶片、种子和鼓粒期鲜豆荚为材料,利用优化的高盐低pH值法提取大豆基因组DNA,同时采用改良的SDS法和CTAB法进行提取,并对DNA的纯度、浓度及提取质量进行比较分析。结果表明,在以大豆种子和鼓粒期鲜豆荚为材料时,高盐低pH值法提取基因组DNA的效果最佳,其纯度及浓度均高于改良的SDS法和CTAB法,且该方法具有成本低、步骤简单、时间短、不使用或少用有毒试剂等优点,是一种高效、快速、经济的大豆基因组DNA提取方法。

改良CTAB法和高盐低pH值法提取花生DNA的效果

采用改良CTAB法和高盐低pH法提取花生总DNA,结果表明,高盐低pH法提取的花生DNA分子量略小,DNA有一定程度的降解,但得率大大高于CTAB法,按我们稍有改动的实验方法,每克鲜重的叶片,可提取1000μg以上的DNA。两种方法提取的DNA均可酶切完全,RAPD-PCR扩增,结果相同。高盐低pH值法廉价、步骤少、易掌握,是提取花生DNA较好的方法。

高盐低pH值法提取玉米基因组DNA的研究

优化建立了基于玉米叶片的高盐低pH值法提取玉米基因组DNA,经琼脂糖电泳检测表明,提取的DNA主带清晰、无降解现象、质量好,满足基于SSR标记的5色荧光电泳检测系统。此方法比目前提取植物基因组DNA常用的CTAB法和SDS法具有成本低、步骤简单、不使用酚、氯仿、异戊醇等有毒有机试剂的优点,是提取玉米基因组DNA的一种较好的方法。

小麦叶绿体DNA提取方法研究

以成熟的中国春小麦叶片为材料,采用改进的高盐-低pH方法提取叶绿体DNA,经琼脂糖凝胶电泳和PCR扩增,结果表明:所提取的小麦叶绿体DNA纯度高(OD260/280=1.89,OD260/230=2.23),适于PCR反应、基因扩增和酶切鉴定等分子操作,为深入研究小麦叶绿体基因组奠定了基础。

枣叶绿体基因组DNA提取方法研究

提取高质量的叶绿体基因组DNA是叶绿体基因组测序分析的重要环节。研究以冬枣、晋枣成熟叶片为材料,采用高盐-低pH法和改良的高盐-低pH法比较研究枣叶绿体分离和叶绿体DNA（cpDNA）提取。结果表明,高盐-低pH法提取的cpDNA,其OD260nm/OD280nm值均为1.28,质量低,不能满足后续测序要求;改良高盐-低pH法提取的cpDNA产量明显得到提高,且cpDNA结构完整、质量高、纯度好,OD260nm/OD280nm值介于1.8~2.0,无降解现象,RNA消化完全,能满足后续测序要求。

改良高盐低pH方法提取陈旧大麻DNA初探

目的探讨建立室温保存10年以上大麻干叶及大麻树脂DNA提取方法。方法采用SDS及改良高盐低pH方法,改变提取缓冲液中β-巯基乙醇终浓度,增加用酚、氯仿快速抽提过程,提取新鲜和陈旧大麻(树脂)DNA,应用大麻叶绿体trnL intron引物进行PCR,琼脂糖凝胶电泳法检测扩增产物。结果用高盐低pH方法获得了10年以上大麻干叶及树脂清晰的电泳图谱,其中成功提取了1份23年陈旧大麻的DNA。结论高盐低pH方法操作简便、实用,可望用于陈旧、微量大麻植株的DNA检测,对于涉毒案件中特殊大麻标本的检验具有一定意义。

芒果属植物叶绿体DNA提取方法的研究

为了探究不同提取方法对芒果属植物叶绿体DNA提取质量的影响,以芒果和扁桃的成熟叶片为材料,比较植物叶绿体DNAout试剂盒法和高盐-低p H法分离叶绿体及提取叶绿体DNA效果。结果表明:叶绿体DNAout试剂盒法能够较好地去除蛋白质、酚类、多糖等代谢物质,OD260/OD230大于2.000,OD260/OD280在1.800~1.900之间。高盐-低p H法提取叶绿体DNA产率高达75.8 ng/μL,远大于叶绿体DNAout试剂盒法提取叶绿体DNA最高产率42.8 ng/μL,2种方法所得模板电泳图和SSR标记图谱谱带完整性皆好。显微镜下观察叶绿体,2种方法都可以得到杂质少、背景清晰的叶绿体显微成像效果,但高盐-低p H法提取的叶绿体细胞器密度更高。2种方法获得的叶绿体DNA均可满足后续研究工作的需要。

高粱基因组DNA提取方法的比较与优化

目的:比较CTAB法和高盐低pH法提取高粱总DNA效果,进一步优化建立高盐低pH值法提取高粱基因组DNA的方法。方法:采用CTAB法、高盐低pH法对高粱叶片DNA进行提取,并从电泳结果、纯度、得率三方面进行比较研究。通过提取缓冲液中SDS浓度的优化,不同组织器官的DNA提取纯化以及不同沉淀方法的优化,比较不同方法对高粱基因组DNA提取的影响。结果:高盐低pH法DNA平均得率为689.36μg/g,略小于CTAB法的718.26μg/g,但其A260/A230平均值为1.854,比CTAB法的2.164更接近标准要求。高盐低pH法提取高粱基因组DNA的适宜条件确定如下:提取液中含有2%SDS、2%PVP、2%β-巯基乙醇;水浴时间30min;沉淀方法采用0.7体积异丙醇室温沉淀的沉淀方法。结论:综合考虑高盐低pH法是提取高粱基因组DNA的最佳方法。

不同方法提取大豆基因组DNA的效果比较

[目的]采用不同方法对大豆基因组DNA进行提取,为大豆基因组DNA的提取提供参考。[方法]采用CTAB法、SDS法和高盐低pH值法对大豆基因组DNA进行提取,对提取的DNA进行光密度、紫外光谱、琼脂糖凝胶电泳和DNA限制性内切酶图谱等的检测。[结果]光密度和光谱检测结果表明,SDS法的提取量和纯度均优于CTAB法和高盐低pH值法;琼脂糖凝胶电泳检测结果表明,SDS法提取的基因组DNA谱带较CTAB法和高盐低pH值法提取的基因DNA谱带粗、亮、重复性好;限制性内切酶检测结果表明,3种方法所得基因组DNA均能被HindⅢ和EcoRⅠ酶切,但SDS法所得基因组DNA的酶切效果最好。[结论]SDS法的提取效果明显优于CTAB法和高盐低pH值法。

海洋单细胞四爿藻基因组DNA的微量提取

四爿藻具有坚硬的囊壳和特殊的细胞壁组成,细胞不易破碎,且含有丰富的糖蛋白,易对DNA造成污染,使其基因组DNA提取较为困难、纯度不高。研究对比传统的CTAB法与高盐低pH法提取四爿藻DNA,高盐低pH法快速经济,得到的基因组DNA纯度较高,是一种行之有效的四爿藻基因组DNA提取方法。该法通过改变抽提介质,提高细胞破碎效率,减少抽提次数,有效去除污染,提取的基因组DNA不仅可以成功进行nrDNA转录间隔区(ITS)扩增,而且扩增产物适合于进行测序分析,这为其它淡水和海洋单细胞及多细胞藻类基因组DNA的提取也提供了借鉴。

剑叶龙血树叶DNA三种不同提取方法的比较分析

采用CTAB法、改良SDS法、高盐低pH法提取了剑叶龙血树叶DNA,并通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳检测了不同方法的提取效果.结果表明:CTAB法所提取的DNA浓度与纯度均高于其它2种方法,泳带分布集中,无拖尾现象,A260/A280=1.81,DNA浓度为735 ng/μL,能满足RAPD、SSR/ISSR扩增的要求,是提取龙血树叶片DNA的最佳方法.

中国野生葡萄叶绿体分离及叶绿体DNA提取的研究

以中国野生刺葡萄、山葡萄、桑叶葡萄和东南葡萄的成熟叶片为材料,比较柱式植物叶绿体DNAout试剂盒和改良的高盐-低pH法分离叶绿体及提取cpDNA效果。结果显示:(1)2种方法均分离得到了中国野生葡萄的叶绿体,但与柱式植物叶绿体DNAout试剂盒相比,改良的高盐-低pH法得到的叶绿体浓度高、杂质少,更适合中国野生葡萄叶绿体分离。(2)柱式植物叶绿体DNAout试剂盒提取的cpDNA,其OD260/OD280在1.28~1.36之间,质量浓度为4.2~7.8ng·μL^(-1),质量低,不能满足后续测序要求;而改良的高盐-低pH法提取的cpDNA,其OD260/OD280值在1.84~1.90之间,质量浓度为2 514.4~4 133.7ng·μL^(-1),质量高,纯度好,能满足后续测序要求。研究表明,改良的高盐-低pH法能简便、快速获得中国野生葡萄完整叶绿体及高质量cpDNA,并且提取的cpDNA可满足后续测序要求,为葡萄属植物叶绿体基因组的深入研究奠定了基础。

菊芋叶绿体分离方法比较研究

以菊芋叶片为材料,通过比较提取其叶绿体DNA的5种方法(改良高盐-低pH法、Percoll密度梯度离心法、GENMED试剂盒物理法、GENMED试剂盒化学法及DNaseⅠ差速离心分离法),筛选出适合菊芋叶绿体NDA的提取方法。利用显微镜、核酸蛋白测定仪、琼脂糖凝胶电泳及菊芋基因特异引物RAPD检测。结果显示:改良高盐-低pH法分离得到的叶绿体在40×物镜下其数目多,浓度高,背景清晰,提取菊芋叶片cpDNA的OD_(260)/OD_(280)为1.926,质量浓度为295.63μg/μL。经10 g/L琼脂糖凝胶电泳检测发现,cpDNA条带清晰整齐,无核DNA污染;且提取的cpDNA通过4对引物均能扩增到片段。结果表明,改良高盐-低pH法能够快速获得菊芋高质量的叶绿体DNA。

白草种子基因组DNA五种提取方法的比较

用5种方法 (传统CTAB法、改良CTAB法、高盐低p H法、改良SDS法、试剂盒法)对白草种子基因组DNA进行提取,分别用紫外分光光度计法、琼脂糖凝胶电泳法、PCR扩增检测提取的DNA的质量。结果表明,传统CTAB法提取的DNA浓度低,含有较多杂质,抑制PCR反应;改良SDS法和改良CTAB法提取的DNA纯度低,不符合检测要求;高盐低pH法和试剂盒法提取的DNA纯度高、完整性好,但试剂盒法成本高、DNA得率低。所以高盐低pH法为5种方法中最经济、效果最好的白草种子DNA提取方法。

不同方法从绞股蓝种子中提取基因组DNA的研究

以绞股蓝种子为研究材料，采用改良的CTAB法、改良的SDS法和高盐低pH法对绞股蓝基因组DNA进行提取，对提取效果采用紫外分光光度计检测、琼脂糖凝胶电泳和RAPD进行综合比较分析。结果表明：3种提取方法所获得的DNA，其OD260/OD280多数都在1．80～2．00，琼脂糖凝胶电泳结果也显示DNA的质量很好，改良的SDS法提取效率显著好于改良的CTAB法和高盐低pH法；而且改良的SDS法提取的DNA的RAPD图谱条带最亮、最清晰。因此，从DNA产量、质量等方面综合考虑，改良的SDS法为绞股蓝种子DNA提取的有效方法。

甘薯叶绿体分离及其DNA提取

为建立高效的甘薯叶绿体分离方法,比较了2种叶绿体分离方法,即高盐-低pH法和Percoll密度梯度法.研究显示,2种方法都能分离得到完整、纯净的叶绿体.再用CTAB法可从纯叶绿体中提取DNA,用2种方法分离的叶绿体DNA经分光光度计检测,高盐-低pH法和Percoll密度梯度法A260/A280数值分别为1.81和1.89,高盐-低pH法分离得到的叶绿体DNA产率更高,鲜质量分数为270 ng/g;Percoll密度梯度法分离得到的叶绿体DNA产率较低,鲜质量分数为90 ng/g.该研究为深入探究甘薯叶绿体基因组结构、功能等提供基础.

锐尖山香圆基因组DNA提取方法比较研究

为了研究不同方法对锐尖山香圆基因组DNA提取质量的影响,以选择出最适宜的提取方法。以锐尖山香圆叶片为试验材料,采用CTAB法、SDS法、高盐低pH值法和尿素法提取其基因组DNA,并对提取的基因组DNA OD_(260/280)值、OD_(260/230)值、DNA浓度、DNA产率、琼脂糖凝胶电泳、酶切验证和ISSR-PCR扩增产物进行比较分析。结果表明,应用高盐低pH值法和尿素法提取的基因组DNA含有蛋白质和多糖等杂质较多,DNA纯度较低;CTAB法提取的基因组DNA含有一些酚类物质和盐等杂质,DNA纯度较低;SDS法提取的基因组DNA纯度、浓度和产率最高,酶切和ISSR-PCR检测效果最好。SDS法提取的锐尖山香圆基因组DNA质量和产量最好,可用于后续相关分子生物学研究。

割手密叶绿体DNA的高效提取方法

为了提取高质量的割手密叶绿体DNA(chloroplast DNA,cp DNA),本研究立足于高效、省时、低耗的原则,以割手密幼叶为材料,采用改进的高盐-低p H法经差速离心分离叶绿体、DNaseⅠ处理、10%SDS和蛋白酶K裂解叶绿体、DNA萃取、乙醇沉淀等一系列操作。所提取的割手密cp DNA经显微观察、紫外吸收光度测定、琼脂糖凝胶电泳、叶绿体基因特异引物PCR扩增等进行检测,结果表明该提取方法简单高效,A260/A280的比值介于1.9~2.0,cp DNA纯度高,浓度为2.90μg/μL,适用于基因扩增等分子操作。研究结果为进一步开展割手密叶绿体基因功能、系统发育、遗传多样性等方面的研究奠定了基础。

茶树叶绿体DNA提取方法研究

为了探究茶树叶绿体DNA（chloroplast DNA，cpDNA）的提取方法，本研究采用改进的高盐-低pH法和Percoll密度梯度法提取cpDNA。结果表明，两种方法提取的cpDNA经分光光度计检测，A260/A280值在1．80～1．90，高盐-低pH法提取的cpDNA产率为0．65μg/g，Percoll密度梯度法提取的cpDNA产率为0．07μg/g。提取的cpDNA经PCR检测，均能扩增出目标片段，但高盐-低pH法效果更好。研究结果为进一步研究茶树叶绿体基因组结构、功能等方面奠定基础。

葱属蔬菜作物叶绿体DNA提取及其质量评价体系的建立

为了探究不同提取方法对葱属蔬菜作物叶绿体DNA提取效果的影响,首先以大葱叶片为实验材料,采用高盐低p H值法和蔗糖DNase法,对其进行叶绿体DNA提取测试。结果表明,高盐低pH法优于蔗糖DNase法,其DNA纯度相似,A260/A280值分别1.984和1.977;产率差异大,分别为0.482μg/g FW (fresh weight, FW)和0.059μg/g FW,高盐低pH值法是蔗糖DNase法产率的8.17倍。随后,利用叶绿体MatK、线粒体Atp6和核LFY基因设计引物,根据各组引物自身的扩增效率,以试剂盒提取的总DNA为对照,分别对三种细胞器DNA拷贝数的比值进行评估研究,高盐低pH法提取叶绿体DNA含量是试剂盒法的78.38倍,而蔗糖DNase法为15.51倍,高盐低pH法是蔗糖DNase法的5.05倍。高盐低pH法提取的叶绿体DNA产率和含量均优于蔗糖DNase法,同时在此基础建立了细胞器DNA含量定量分析方法。随后我们用高盐低pH法对葱属蔬菜作物的洋葱、大蒜和韭菜进行了测试,获得了预期的效果。该研究为今后葱属作物高效、高纯度、无污染的叶绿体DNA提取和葱属蔬菜作物细胞器全基因组测序提供依据。