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菠菜HD-ZIP Ⅲ基因家族鉴定与表达分析
1
作者
刘梓涵
张琪悦
+4 位作者
袁满
翁莉
邵锋
顾立君
蔡晓锋
《上海师范大学学报(自然科学版中英文)》
2024年第3期352-361,共10页
植物叶片在生长发育过程中,近-远轴极性的建立与维持是叶片正常行使光合效应、呼吸作用、蒸腾作用的结构基础.HD-ZIPⅢ是重要的叶片近轴极性基因,本研究在菠菜(Spinacia oleracea)基因组中鉴定到3个HD-ZIPⅢ基因家族成员,依次命名为SoHB...
植物叶片在生长发育过程中,近-远轴极性的建立与维持是叶片正常行使光合效应、呼吸作用、蒸腾作用的结构基础.HD-ZIPⅢ是重要的叶片近轴极性基因,本研究在菠菜(Spinacia oleracea)基因组中鉴定到3个HD-ZIPⅢ基因家族成员,依次命名为SoHB1,SoHB2和SoHB3,并对其蛋白理化性质、保守结构域和进化关系进行了分析.研究结果表明:3个HD-ZIPⅢ蛋白都具有4个保守结构域.共线性分析表明:菠菜SoHB1,SoHB2和SoHB3分别与拟南芥ATHB8,ATREV和ATHB15存在共线性关系.启动子顺式作用元件预测结果表明:菠菜HD-ZIPⅢ家族基因启动子上游包含光响应、逆境胁迫反应、激素响应等顺式作用元件.在不同叶型菠菜种质中的表达模式分析结果表明:单戟型叶片的SoHBs表达量最高;此外,经干旱胁迫处理后,SoHB1,SoHB2和SoHB3的基因表达量普遍下降;对菠菜包括根、茎、薹叶、功能叶、薹叶柄、功能叶柄等部位进行表达分析,发现SoHB1在根部表达最为丰富,SoHB2和SoHB3在薹叶处表达最为丰富.
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关键词
菠菜(Spinacia
oleracea)
hd-zip
ⅲ
基因家族
干旱胁迫
基因表达量
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职称材料
水稻HD-Zip Ⅲ家族成员OsHox10的功能分析
被引量:
2
2
作者
杨波
罗倩
+6 位作者
靳亚军
熊炜
孔晓聪
王荃
邳瑞雪
石雨鹭
栾维江
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018年第5期36-41,共6页
为了探究HD-ZipⅢ家族成员之一OsHox10在水稻发育中的功能,构建了OsHox10的过量表达载体并获得了转基因株系,明确了OsHox10基因的表达模式和亚细胞定位,并初步了解它与植物激素及抗旱性的关系.表型观察发现,过量表达OsHox10能使水稻叶...
为了探究HD-ZipⅢ家族成员之一OsHox10在水稻发育中的功能,构建了OsHox10的过量表达载体并获得了转基因株系,明确了OsHox10基因的表达模式和亚细胞定位,并初步了解它与植物激素及抗旱性的关系.表型观察发现,过量表达OsHox10能使水稻叶片出现不同程度的皱缩、卷曲,尤其是靠近叶鞘部分卷曲明显. OsHox10基因的组织特异性表达结果表明,OsHox10在水稻不同器官中都有表达,但主要在分裂旺盛的部位,如茎顶端分生组织及不同时期的幼穗中表达量较高.亚细胞定位结果表明,OsHox10定位于细胞质中或者细胞膜上.分析OsHox10在植物激素及干旱条件处理下的表达,结果发现,激素及干旱处理均能够诱导OsHox10基因的表达,表明OsHox10可能与水稻响应激素信号和干旱胁迫有关.
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关键词
水稻
hd-zip
ⅲ
家族
OsHox10
过表达
亚细胞定位
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职称材料
HD-Zip Ⅲ转录因子家族与植物细胞分化
被引量:
13
3
作者
朱莹莹
于亮亮
+1 位作者
汪杏芬
李来庚
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期199-209,共11页
细胞分化是生物生长发育的重要过程,受到一系列信号的精确调控。植物特有的转录因子HD-Zip Ⅲ在细胞分化中发挥了重要作用。该文对HD-Zip Ⅲ基因类型和结构特点进行了简要介绍,重点论述了HD-Zip Ⅲ在胚胎形态发生、顶端分生组织形成、...
细胞分化是生物生长发育的重要过程,受到一系列信号的精确调控。植物特有的转录因子HD-Zip Ⅲ在细胞分化中发挥了重要作用。该文对HD-Zip Ⅲ基因类型和结构特点进行了简要介绍,重点论述了HD-Zip Ⅲ在胚胎形态发生、顶端分生组织形成、叶极性建立和维管组织分化等发育过程中的作用,系统总结了HD-Zip Ⅲ基因在不同层次受到的调控,探讨了该家族基因与陆生维管植物进化的关系。
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关键词
细胞分化
hd-zip
ⅲ
植物发育
转录因子
原文传递
普通烟草HD-Zip Ⅲ家族全基因组鉴定和表达分析
被引量:
6
4
作者
陈浣
吕婧
孙玉合
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第8期3034-3041,共8页
植物HD-Zip Ⅲ家族基因在维持分生组织生长、调节避荫反应、决定新生叶背腹性方面起着重要作用。我们通过生物信息学分析对普通烟草(Nicotiana tobacum)TN90基因组序列中的HD-Zip Ⅲ进行广泛预测,并分析了其理化性质、基因结构、进化关...
植物HD-Zip Ⅲ家族基因在维持分生组织生长、调节避荫反应、决定新生叶背腹性方面起着重要作用。我们通过生物信息学分析对普通烟草(Nicotiana tobacum)TN90基因组序列中的HD-Zip Ⅲ进行广泛预测,并分析了其理化性质、基因结构、进化关系、亚细胞定位、表达谱等信息。本研究在栽培烟草TN90中发现了19个HD-Zip Ⅲ基因的候选序列,通过系统发生分析,可将栽培烟草HD-Zip Ⅲ基因家族成员分为两个亚家族。所有基因参与烟草叶、茎、根、花等各个器官的不同发育时期的表达。这些研究为烟草HD-Zip Ⅲ基因功能的深入分析提供了理论依据。
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关键词
栽培烟草
hd-zip
ⅲ
基因家族
进化分析
基因表达分析
原文传递
水稻中两个同源异型结构域转录因子的亚细胞定位
5
作者
李政龙
申奥
栾维江
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2014年第3期62-65,共4页
为了对水稻同源异型结构域转录因子HD-ZipⅢ家族中的HDZ1和HDZ2进行亚细胞定位,利用RT-PCR技术从水稻cDNA中扩增HDZ1和HDZ2的编码区(去除终止密码子序列),与绿色荧光蛋白GFP编码框融合,构建2个转录因子的瞬时表达载体,采用农杆菌介导的...
为了对水稻同源异型结构域转录因子HD-ZipⅢ家族中的HDZ1和HDZ2进行亚细胞定位,利用RT-PCR技术从水稻cDNA中扩增HDZ1和HDZ2的编码区(去除终止密码子序列),与绿色荧光蛋白GFP编码框融合,构建2个转录因子的瞬时表达载体,采用农杆菌介导的转化方法转化至烟草中进行瞬时表达分析.结果表明:PCR扩增所得为目的基因片段HDZ1和HDZ2;二者与载体质粒pCAMBIA35S-GFP连接获得的融合表达载体成功移至烟草中并表达;确定HDZ1主要定位于烟草叶片的气孔中,而HDZ2定位于烟草表皮细胞的细胞膜上.二者在亚细胞中的定位不同,可能在水稻生长发育中所起的作用也不相同.
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关键词
水稻
同源异型结构域
hd-zip
ⅲ
转录因子
绿色荧光蛋白
亚细胞定位
下载PDF
职称材料
番茄SlHB8基因的克隆及其对非生物胁迫的响应
6
作者
杨洋
先志强
+1 位作者
陈日远
郝彦伟
《北方园艺》
CAS
北大核心
2019年第18期10-18,共9页
HD-Zip Ⅲ转录因子家族在植物的生长发育中发挥着重要作用。以Micro-Tom番茄为试材,采用RT-PCR、荧光定量PCR以及生物信息学的方法,研究了番茄SlHB8基因的序列特征、表达模式以及在非生物胁迫下的响应,以期为鉴定SlHB8基因在番茄中的功...
HD-Zip Ⅲ转录因子家族在植物的生长发育中发挥着重要作用。以Micro-Tom番茄为试材,采用RT-PCR、荧光定量PCR以及生物信息学的方法,研究了番茄SlHB8基因的序列特征、表达模式以及在非生物胁迫下的响应,以期为鉴定SlHB8基因在番茄中的功能奠定基础。结果表明:番茄中含有1个编码HD-Zip Ⅲ转录因子的基因SlHB8。该基因全长2 523 bp,编码841个氨基酸,含有HD、bZip、START和MEKHLA 4个保守结构域,与拟南芥的ATHB8同源性最高。SlHB8在番茄各组织中均有表达,在茎中的表达量最高。高低温、干旱、伤害、乙烯、水杨酸处理均能诱导该基因下调表达,而赤霉素、脱落酸、生长素处理均能使该基因的表达先增加再下降。利用PLACE和PlantCARE对SlHB8启动子区域的顺式作用元件进行预测分析发现,SlHB8启动子含有赤霉素、脱落酸、水杨酸、热激、伤害、干旱等顺式作用元件。表明SlHB8可能在番茄的非生物胁迫应答中发挥重要调控作用。
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关键词
番茄
SlHB8
hd-zip
ⅲ
转录因子
非生物胁迫
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职称材料
题名
菠菜HD-ZIP Ⅲ基因家族鉴定与表达分析
1
作者
刘梓涵
张琪悦
袁满
翁莉
邵锋
顾立君
蔡晓锋
机构
上海师范大学生命科学学院
上海市崇明区蔬菜科学技术推广站
出处
《上海师范大学学报(自然科学版中英文)》
2024年第3期352-361,共10页
基金
上海市科技创新行动计划农业科技领域项目(21N11900500)。
文摘
植物叶片在生长发育过程中,近-远轴极性的建立与维持是叶片正常行使光合效应、呼吸作用、蒸腾作用的结构基础.HD-ZIPⅢ是重要的叶片近轴极性基因,本研究在菠菜(Spinacia oleracea)基因组中鉴定到3个HD-ZIPⅢ基因家族成员,依次命名为SoHB1,SoHB2和SoHB3,并对其蛋白理化性质、保守结构域和进化关系进行了分析.研究结果表明:3个HD-ZIPⅢ蛋白都具有4个保守结构域.共线性分析表明:菠菜SoHB1,SoHB2和SoHB3分别与拟南芥ATHB8,ATREV和ATHB15存在共线性关系.启动子顺式作用元件预测结果表明:菠菜HD-ZIPⅢ家族基因启动子上游包含光响应、逆境胁迫反应、激素响应等顺式作用元件.在不同叶型菠菜种质中的表达模式分析结果表明:单戟型叶片的SoHBs表达量最高;此外,经干旱胁迫处理后,SoHB1,SoHB2和SoHB3的基因表达量普遍下降;对菠菜包括根、茎、薹叶、功能叶、薹叶柄、功能叶柄等部位进行表达分析,发现SoHB1在根部表达最为丰富,SoHB2和SoHB3在薹叶处表达最为丰富.
关键词
菠菜(Spinacia
oleracea)
hd-zip
ⅲ
基因家族
干旱胁迫
基因表达量
Keywords
spinach(Spinacia oleracea)
hd-zip
ⅲ
gene family
drought stress
gene expression
分类号
S636.1 [农业科学—蔬菜学]
下载PDF
职称材料
题名
水稻HD-Zip Ⅲ家族成员OsHox10的功能分析
被引量:
2
2
作者
杨波
罗倩
靳亚军
熊炜
孔晓聪
王荃
邳瑞雪
石雨鹭
栾维江
机构
天津师范大学生命科学学院
天津师范大学天津市动植物抗性重点实验室
出处
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018年第5期36-41,共6页
基金
现代产业技术体系-水稻种质创新岗Ⅳ资助项目(ITTRRS2018006)
天津市自然科学基金重点资助项目(16JCZDJC33400)
2014年天津市级大学生创新训练资助项目(20140065045)
文摘
为了探究HD-ZipⅢ家族成员之一OsHox10在水稻发育中的功能,构建了OsHox10的过量表达载体并获得了转基因株系,明确了OsHox10基因的表达模式和亚细胞定位,并初步了解它与植物激素及抗旱性的关系.表型观察发现,过量表达OsHox10能使水稻叶片出现不同程度的皱缩、卷曲,尤其是靠近叶鞘部分卷曲明显. OsHox10基因的组织特异性表达结果表明,OsHox10在水稻不同器官中都有表达,但主要在分裂旺盛的部位,如茎顶端分生组织及不同时期的幼穗中表达量较高.亚细胞定位结果表明,OsHox10定位于细胞质中或者细胞膜上.分析OsHox10在植物激素及干旱条件处理下的表达,结果发现,激素及干旱处理均能够诱导OsHox10基因的表达,表明OsHox10可能与水稻响应激素信号和干旱胁迫有关.
关键词
水稻
hd-zip
ⅲ
家族
OsHox10
过表达
亚细胞定位
Keywords
rice
hd-zip
ⅲ
family
OsHox10
overexpression
subcellular localization
分类号
Q984 [生物学—人类学]
下载PDF
职称材料
题名
HD-Zip Ⅲ转录因子家族与植物细胞分化
被引量:
13
3
作者
朱莹莹
于亮亮
汪杏芬
李来庚
机构
中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期199-209,共11页
基金
国家杰出青年基金(No.30725025)
国家自然科学基金(No.30972329)
文摘
细胞分化是生物生长发育的重要过程,受到一系列信号的精确调控。植物特有的转录因子HD-Zip Ⅲ在细胞分化中发挥了重要作用。该文对HD-Zip Ⅲ基因类型和结构特点进行了简要介绍,重点论述了HD-Zip Ⅲ在胚胎形态发生、顶端分生组织形成、叶极性建立和维管组织分化等发育过程中的作用,系统总结了HD-Zip Ⅲ基因在不同层次受到的调控,探讨了该家族基因与陆生维管植物进化的关系。
关键词
细胞分化
hd-zip
ⅲ
植物发育
转录因子
Keywords
cell differentiation
hd-zip
ⅲ
plant development
transcription factor
分类号
Q942 [生物学—植物学]
原文传递
题名
普通烟草HD-Zip Ⅲ家族全基因组鉴定和表达分析
被引量:
6
4
作者
陈浣
吕婧
孙玉合
机构
中国农业科学院烟草研究所/烟草行业烟草基因资源利用重点实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第8期3034-3041,共8页
基金
中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-TRIC02)资助
文摘
植物HD-Zip Ⅲ家族基因在维持分生组织生长、调节避荫反应、决定新生叶背腹性方面起着重要作用。我们通过生物信息学分析对普通烟草(Nicotiana tobacum)TN90基因组序列中的HD-Zip Ⅲ进行广泛预测,并分析了其理化性质、基因结构、进化关系、亚细胞定位、表达谱等信息。本研究在栽培烟草TN90中发现了19个HD-Zip Ⅲ基因的候选序列,通过系统发生分析,可将栽培烟草HD-Zip Ⅲ基因家族成员分为两个亚家族。所有基因参与烟草叶、茎、根、花等各个器官的不同发育时期的表达。这些研究为烟草HD-Zip Ⅲ基因功能的深入分析提供了理论依据。
关键词
栽培烟草
hd-zip
ⅲ
基因家族
进化分析
基因表达分析
Keywords
Nicotiaaa tobacum,
hd-zip
ⅲ
gene family, Phylogenetic evolution analysis, Gene expression analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
水稻中两个同源异型结构域转录因子的亚细胞定位
5
作者
李政龙
申奥
栾维江
机构
天津师范大学生命科学学院
天津师范大学天津市动植物抗性重点实验室
出处
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2014年第3期62-65,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(31171515)
天津市自然科学基金重点资助项目(11JCZDJC17900)
文摘
为了对水稻同源异型结构域转录因子HD-ZipⅢ家族中的HDZ1和HDZ2进行亚细胞定位,利用RT-PCR技术从水稻cDNA中扩增HDZ1和HDZ2的编码区(去除终止密码子序列),与绿色荧光蛋白GFP编码框融合,构建2个转录因子的瞬时表达载体,采用农杆菌介导的转化方法转化至烟草中进行瞬时表达分析.结果表明:PCR扩增所得为目的基因片段HDZ1和HDZ2;二者与载体质粒pCAMBIA35S-GFP连接获得的融合表达载体成功移至烟草中并表达;确定HDZ1主要定位于烟草叶片的气孔中,而HDZ2定位于烟草表皮细胞的细胞膜上.二者在亚细胞中的定位不同,可能在水稻生长发育中所起的作用也不相同.
关键词
水稻
同源异型结构域
hd-zip
ⅲ
转录因子
绿色荧光蛋白
亚细胞定位
Keywords
rice
homeodomain hd-zip ⅲ
transcription factors
green fluorescent protein
subcellular localization
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
番茄SlHB8基因的克隆及其对非生物胁迫的响应
6
作者
杨洋
先志强
陈日远
郝彦伟
机构
华南农业大学园艺学院
重庆大学生命科学学院
出处
《北方园艺》
CAS
北大核心
2019年第18期10-18,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(31870286)
广东省自然科学基金资助项目(2017A030313114,2018A030310205)
广州市科技计划资助项目(201804010031)
文摘
HD-Zip Ⅲ转录因子家族在植物的生长发育中发挥着重要作用。以Micro-Tom番茄为试材,采用RT-PCR、荧光定量PCR以及生物信息学的方法,研究了番茄SlHB8基因的序列特征、表达模式以及在非生物胁迫下的响应,以期为鉴定SlHB8基因在番茄中的功能奠定基础。结果表明:番茄中含有1个编码HD-Zip Ⅲ转录因子的基因SlHB8。该基因全长2 523 bp,编码841个氨基酸,含有HD、bZip、START和MEKHLA 4个保守结构域,与拟南芥的ATHB8同源性最高。SlHB8在番茄各组织中均有表达,在茎中的表达量最高。高低温、干旱、伤害、乙烯、水杨酸处理均能诱导该基因下调表达,而赤霉素、脱落酸、生长素处理均能使该基因的表达先增加再下降。利用PLACE和PlantCARE对SlHB8启动子区域的顺式作用元件进行预测分析发现,SlHB8启动子含有赤霉素、脱落酸、水杨酸、热激、伤害、干旱等顺式作用元件。表明SlHB8可能在番茄的非生物胁迫应答中发挥重要调控作用。
关键词
番茄
SlHB8
hd-zip
ⅲ
转录因子
非生物胁迫
Keywords
tomato
SlHB8
hd-zip
ⅲ
transcription factor
abiotic stress
分类号
S641.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
菠菜HD-ZIP Ⅲ基因家族鉴定与表达分析
刘梓涵
张琪悦
袁满
翁莉
邵锋
顾立君
蔡晓锋
《上海师范大学学报(自然科学版中英文)》
2024
0
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职称材料
2
水稻HD-Zip Ⅲ家族成员OsHox10的功能分析
杨波
罗倩
靳亚军
熊炜
孔晓聪
王荃
邳瑞雪
石雨鹭
栾维江
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018
2
下载PDF
职称材料
3
HD-Zip Ⅲ转录因子家族与植物细胞分化
朱莹莹
于亮亮
汪杏芬
李来庚
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
13
原文传递
4
普通烟草HD-Zip Ⅲ家族全基因组鉴定和表达分析
陈浣
吕婧
孙玉合
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
6
原文传递
5
水稻中两个同源异型结构域转录因子的亚细胞定位
李政龙
申奥
栾维江
《天津师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2014
0
下载PDF
职称材料
6
番茄SlHB8基因的克隆及其对非生物胁迫的响应
杨洋
先志强
陈日远
郝彦伟
《北方园艺》
CAS
北大核心
2019
0
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职称材料
已选择
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