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杂交鲟和匙吻鲟HSP70 cDNA克隆与序列分析
被引量:
8
1
作者
高宇
袁改玲
+1 位作者
李大鹏
陈昌福
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期85-89,共5页
采用RT-PCR法从杂交鲟(♀Huso huso×♂Acipenserschrencki)和匙吻鲟(Polyodonspathula)肝脏RNA克隆获得HSP70基因的全长cDNA(HSP70 cDNA)。所测定的HSP70 cDNA序列与NCBI/GenBank上登载的鲫(GenBank No.DQ872648)同源性最高,杂交...
采用RT-PCR法从杂交鲟(♀Huso huso×♂Acipenserschrencki)和匙吻鲟(Polyodonspathula)肝脏RNA克隆获得HSP70基因的全长cDNA(HSP70 cDNA)。所测定的HSP70 cDNA序列与NCBI/GenBank上登载的鲫(GenBank No.DQ872648)同源性最高,杂交鲟和匙吻鲟分别达96%和98%,杂交鲟HSP70序列为382 bp,匙吻鲟为334 bp。将杂交鲟和匙吻鲟与其它脊椎动物HSP70氨基酸序列用DNAstar软件进行相似度比较,鱼类与哺乳动物、两栖类非洲爪蟾之间HSP70氨基酸序列相似度平均值分别为86.2%和86.8%。鱼类之间的氨基酸序列相似度较大,平均为93.8%,表现出较高的保守性。以HSP70核苷酸序列为分子标记,用MEGA4软件中最大简约法(MP)构建了12个物种HSP70系统发育树,识别出3个大的单系类群:杂交鲟、匙吻鲟、团头鲂、鲫、鲤、斑马鱼聚为类群一(bootstrap 96);虹鳟和大西洋鲑聚为类群二(bootstrap 100);人类和褐家鼠类聚为类群三(bootstrap 89)。
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关键词
热应激蛋白HSP70
杂交鲟
匙吻鲟
克隆
序列分析
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职称材料
题名
杂交鲟和匙吻鲟HSP70 cDNA克隆与序列分析
被引量:
8
1
作者
高宇
袁改玲
李大鹏
陈昌福
机构
华中农业大学水产学院
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期85-89,共5页
基金
国家自然科学基金项目(30970529)
家畜疫病病原生物学国家重点实验室(中国农业科学院兰州兽医研究所)开放课题资助
文摘
采用RT-PCR法从杂交鲟(♀Huso huso×♂Acipenserschrencki)和匙吻鲟(Polyodonspathula)肝脏RNA克隆获得HSP70基因的全长cDNA(HSP70 cDNA)。所测定的HSP70 cDNA序列与NCBI/GenBank上登载的鲫(GenBank No.DQ872648)同源性最高,杂交鲟和匙吻鲟分别达96%和98%,杂交鲟HSP70序列为382 bp,匙吻鲟为334 bp。将杂交鲟和匙吻鲟与其它脊椎动物HSP70氨基酸序列用DNAstar软件进行相似度比较,鱼类与哺乳动物、两栖类非洲爪蟾之间HSP70氨基酸序列相似度平均值分别为86.2%和86.8%。鱼类之间的氨基酸序列相似度较大,平均为93.8%,表现出较高的保守性。以HSP70核苷酸序列为分子标记,用MEGA4软件中最大简约法(MP)构建了12个物种HSP70系统发育树,识别出3个大的单系类群:杂交鲟、匙吻鲟、团头鲂、鲫、鲤、斑马鱼聚为类群一(bootstrap 96);虹鳟和大西洋鲑聚为类群二(bootstrap 100);人类和褐家鼠类聚为类群三(bootstrap 89)。
关键词
热应激蛋白HSP70
杂交鲟
匙吻鲟
克隆
序列分析
Keywords
heat shock protein 70
hybrid sturgeom polyodon spathula
clones
sequence analysis
分类号
Q959.463 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杂交鲟和匙吻鲟HSP70 cDNA克隆与序列分析
高宇
袁改玲
李大鹏
陈昌福
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
8
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