期刊文献+
共找到38篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
Confirmation of Pearl Millet-Napiergrass Hybrids Using EST-Derived Simple Sequence Repeat (SSR) Markers
1
作者 Charlie D. Dowling Byron L. Burson +2 位作者 Jamie L. Foster Lee Tarpley Russell W. Jessup 《American Journal of Plant Sciences》 2013年第5期1004-1012,共9页
Prospects for deploying perennial grasses that are currently considered leading candidates for dedicated energy crops over large acreages are debatable because of several limitations, including vegetative propagation ... Prospects for deploying perennial grasses that are currently considered leading candidates for dedicated energy crops over large acreages are debatable because of several limitations, including vegetative propagation or small seed size, low biomass production during the first growing season, and incomplete assessments of crop invasiveness risk. Pearl Millet-Napiergrass hybrids (“PMN”;Pennisetum glaucum [L.] R. Br. × P. purpureum Schumach.), in contrast, are large-seeded, sterile feedstocks capable of high biomass production during establishment year. Novel methods are warranted for confirmation of PMN hybrids, as traditional morphological observations can be inconclusive and chromosome number determination using cytological methods is laborious and time consuming. Six putative PMN lines were produced in this study, and 10 progeny from each line were evaluated using morphological traits, seed fertility, flow cytometry, and expressed sequence tag-simple sequence repeat (EST-SSR) markers. All putative hybrid lines were sterile and failed to produce seed. The PMN hybrids could not be distinguished from either parent using flow cytometry due to highly similar nuclear genome DNA contents. A number of paternal napiergrass-specific EST-SSRs were identified for each PMN line, and four paternal-specific EST-SSRs conserved across all napiergrass accessions were selected to screen the putative PMN hybrids. These EST-SSRs confirmed that all F1 individuals analyzed were PMN hybrids. The use of paternal-specific markers therefore provides a valuable tool in the development of both “Seeded-yet-Sterile” biofuel PMN feedstocks and additional PMN cultivar-and parental species-specific markers. 展开更多
关键词 PENNISETUM glaucum PENNISETUM purpureum Bulked Segregant Analysis Marker-Assisted Selection Marker-Assisted Breeding EST-SSR Expressed sequence Tag simple sequence Repeat Microsatellites Biofuel Biofuels PEARL MILLET × NAPIERGRASS PEARL MILLET NAPIERGRASS interSPECIFIC Hybrid PCR Polymerase chain reaction Comparative Genomics
下载PDF
A Simplified Rice DNA Extraction Protocol for PCR Analysis 被引量:4
2
作者 CHEN Wen-yue CUI Hai-rui +2 位作者 BAO Jin-song ZHOU Xiang-sheng SHU Qing-yao 《Rice science》 SCIE 2006年第1期67-70,共4页
A simple protocol was established for DNA extraction using etiolated rice seedlings, whereby rice DNA was directly extracted in 0.5 mol/L NaOH solution in a single eppendorf tube. Results of comparative PCR analyses a... A simple protocol was established for DNA extraction using etiolated rice seedlings, whereby rice DNA was directly extracted in 0.5 mol/L NaOH solution in a single eppendorf tube. Results of comparative PCR analyses and electrophoresis showed that the DNA extracted using this method was as good and useful as that using standard CTAB method. 展开更多
关键词 DNA extraction RICE polymerase chain reaction molecular marker simple sequence repeats TRANSGENE
下载PDF
斑玉蕈种质资源评价及遗传多样性分析
3
作者 王红 刘俊杰 +4 位作者 温浩 张鹏 曹君 肖军 黄竹青 《中国食用菌》 2023年第6期41-47,共7页
利用体细胞不亲和性、核糖体基因转录间隔区域(internal transcribed spacer,ITS)序列和简单序列重复区间(inter-simple sequence repeat,ISSR)对67株斑玉蕈种质资源进行鉴定评价,并分析遗传多样性。结果表明,67株斑玉蕈菌株被分为15组... 利用体细胞不亲和性、核糖体基因转录间隔区域(internal transcribed spacer,ITS)序列和简单序列重复区间(inter-simple sequence repeat,ISSR)对67株斑玉蕈种质资源进行鉴定评价,并分析遗传多样性。结果表明,67株斑玉蕈菌株被分为15组,组内无拮抗反应,组间拮抗反应明显。褐色品系和白色品系间拮抗反应明显。采用邻接法(neighbor-joinging,NJ)构建系统进化树,将其分为3个类群,种内遗传距离为0~0.079 4,平均遗传距离为0.005 5±0.001 6。11条ISSR引物,扩增出51个多态性片段,菌株间Nei’s遗传距离为0.034 7~0.627 2。经非加权算数平均配对法(unweighted pair-group method with arithmetic mean,UPGMA)聚类分析,将其分为3个大类群,类群I中分为6个小类群。 展开更多
关键词 斑玉蕈 拮抗反应 ITS ISSR 遗传多样性分析
下载PDF
ISSR-PCR在石斛种间鉴别中的应用 被引量:73
4
作者 沈颖 徐程 +1 位作者 万小凤 张铭 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期423-427,共5页
目的 采用ISSR-PCR方法对石斛属9种植物进行鉴别,探讨不同种石斛在DNA分子水平上的差异。方法 选取10条由SSR组成的引物,对9种石斛进行PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳分析。结果 10条引物中有7条扩增出多态性条带。每条引物可检测的多态性位... 目的 采用ISSR-PCR方法对石斛属9种植物进行鉴别,探讨不同种石斛在DNA分子水平上的差异。方法 选取10条由SSR组成的引物,对9种石斛进行PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳分析。结果 10条引物中有7条扩增出多态性条带。每条引物可检测的多态性位点最少7个,最多14个,扩增片段大小为220-1260 bp。其中,引物UBC-807和UBC-864具有较高的多态性条带比率,均可以独立将所有被测种区分开来。结论ISSR-PCR作为一种简便、可靠的分子标记鉴定技术,可以作为石斛属种间鉴别的方法之一。 展开更多
关键词 石斛属 鉴别 引物 多态性位点 扩增片段 琼脂糖凝胶电泳 同种 ISSR-PCR 分子标记 鉴定技术
下载PDF
杏ISSR反应体系的优化和指纹图谱的构建 被引量:59
5
作者 刘威生 冯晨静 +3 位作者 杨建民 刘冬成 张爱民 李绍华 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期626-629,共4页
以杏品种清密沙为试材,用引物UBC825〔序列为(AC)8T〕研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响。结果表明:Primer、Mg2+、Taq酶浓度对扩增效果有明显影响,而模板DNA和dNTPs含量对扩增结果影响不大。优化的反应体系... 以杏品种清密沙为试材,用引物UBC825〔序列为(AC)8T〕研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响。结果表明:Primer、Mg2+、Taq酶浓度对扩增效果有明显影响,而模板DNA和dNTPs含量对扩增结果影响不大。优化的反应体系为:20μL的反应体系中含10ng模板DNA、0.1mmol/LdNTP、0.25μmol/LPrimer、2.5mmol/LMg2+,0.5UTaqPolymerase。适宜退火温度为50-52.1℃。用引物UBC825和UBC868〔序列为(GAA)5〕在优化的反应条件下建立了5个种12份杏材料的ISSR指纹图谱。 展开更多
关键词 ISSR(intersimple sequence repeat) 反应体系 退火温度 优化
下载PDF
石蒜属植物种质资源ISSR-PCR反应体系的建立 被引量:14
6
作者 张雷凡 高燕会 +3 位作者 朱玉球 刘志高 童再康 黄华宏 《浙江林学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期156-161,共6页
为进一步开展石蒜属Lycoris植物种质资源遗传多样性研究,利用正交试验设计的方法,从Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP和引物等5因素4水平,对石蒜属植物ISSR(intersimple sequence repeats)反应体系进行优化,确立了石蒜属植物ISSR的最佳反应体... 为进一步开展石蒜属Lycoris植物种质资源遗传多样性研究,利用正交试验设计的方法,从Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP和引物等5因素4水平,对石蒜属植物ISSR(intersimple sequence repeats)反应体系进行优化,确立了石蒜属植物ISSR的最佳反应体系:在20μL反应体系中,含1×Buffer,模板DNA 50 ng,2.5 mmol.L-1氯化镁(MgCl2),0.15 mmol.L-1dNTP,25.05 nkatTaq聚合酶,0.5μmol.L-1引物。进一步进行梯度退火试验,确定最适宜退火温度为57℃。 展开更多
关键词 植物学 石蒜属 简单序列重复区间(ISSR) 正交设计 PCR聚合酶链反应体系
下载PDF
一种可用于PCR分析的水稻DNA简易提取法 被引量:33
7
作者 陈文岳 包劲松 +1 位作者 周祥胜 舒庆尧 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期561-563,共3页
以水稻黄化苗为材料,用NaOH溶液抽提DNA,对其用于基于PCR技术的DNA标记中的效果进行了分析。结果发现,用0.5mol/LNaOH对黄化苗进行直接处理,并用等量1mol/LTrisHCl进行稀释、中和,离心所得的上清液即可直接用于各种PCR扩增和随后的DNA... 以水稻黄化苗为材料,用NaOH溶液抽提DNA,对其用于基于PCR技术的DNA标记中的效果进行了分析。结果发现,用0.5mol/LNaOH对黄化苗进行直接处理,并用等量1mol/LTrisHCl进行稀释、中和,离心所得的上清液即可直接用于各种PCR扩增和随后的DNA标记鉴别,包括转基因PCR片段检测、微卫星标记多态性分析(琼脂糖电泳法或毛细管电泳法),用这种方法提取的DNA可以在短期内保存,在PCR分析中其效果与用常规CTAB法提取的DNA相当。 展开更多
关键词 DNA提取 水稻 聚合酶链式反应 分子标记 微卫星标记 转基因
下载PDF
何首乌ISSR-PCR反应体系的建立与优化 被引量:12
8
作者 赵振华 严萍 +1 位作者 焦旭雯 赵树进 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期567-569,共3页
目的建立和优化ISSR-PCR反应体系。方法通过单因素实验研究ISSR反应体系中主要成分(模板、TaqDNA聚合酶、Mg2+、引物、dNTPs)以及退火温度对扩增结果的影响。结果建立了适合何首乌ISSR分析的反应体系和扩增程序,即在25μl反应体系中,内... 目的建立和优化ISSR-PCR反应体系。方法通过单因素实验研究ISSR反应体系中主要成分(模板、TaqDNA聚合酶、Mg2+、引物、dNTPs)以及退火温度对扩增结果的影响。结果建立了适合何首乌ISSR分析的反应体系和扩增程序,即在25μl反应体系中,内含1×Taq酶配套缓冲液、100 ng模板、1.5 UTaqDNA聚合酶、1.5 mmol/L Mg2+、0.6μmol/L引物、0.2 mmol/L dNTPs。扩增程序为94℃预变性5 min;然后是94℃变性45 s,(据不同引物的退火温度)复性1 min,72℃延伸1.5 min,共35个循环;72℃延伸7 min,4℃保存。结论这一优化体系的建立为今后利用ISSR标记技术进行何首乌鉴定及种质资源遗传多样性分析提供了一个标准化程序。 展开更多
关键词 何首乌 简单重复序列区间扩增多太性 反应体系 建立与优化
下载PDF
应用ISSR-PCR对10个菊花品种进行遗传多样性分析 被引量:6
9
作者 程华 李琳玲 +4 位作者 张心玲 方佳 郑永生 姜德志 程水源 《湖北农业科学》 北大核心 2011年第20期4292-4297,共6页
中国的菊花(Chrysanthemum morifolium Ramat.)品种数量众多,形态变异丰富,适应性强,分布广泛,遗传背景非常复杂,这为菊花品种的资源调查、分类鉴定、遗传多样性分析等带来了困难。试验采用分子标记技术,对福白菊(C.morifolium cv.Fubai... 中国的菊花(Chrysanthemum morifolium Ramat.)品种数量众多,形态变异丰富,适应性强,分布广泛,遗传背景非常复杂,这为菊花品种的资源调查、分类鉴定、遗传多样性分析等带来了困难。试验采用分子标记技术,对福白菊(C.morifolium cv.Fubaiju)、杭白菊(C.morifolium cv.Hangbaiju)等10个菊花品种进行了分类鉴定及亲缘关系研究,结果显示,在简单序列重复区间扩增-聚合酶链式反应(Inter-simple sequence repeat-Polymerase chain reaction,ISSR-PCR)分子标记反应体系及引物的筛选方面,选择了条带数量多和清晰度高的菊花反应体系,应用野生福白菊对39条ISSR引物进行了筛选,淘汰了扩增效果差、带型不易辨认的引物,最终确定12条引物用于菊花品种的鉴定。ISSR-PCR聚类分析结果表明,12条ISSR引物扩增出了185条清晰的、重复性好的ISSR条带,其中多态性条带有176条,多态性比率高达95.1%。应用NTSYS 2.10e软件进行UPGMA法聚类分析,在相似系数0.55处可将10个菊花品种大致分为3类,结果福白菊与其他杭菊品种在遗传上有较大的差异。 展开更多
关键词 菊花 简单序列重复区间扩增-聚合酶链式反应 分子标记 遗传多样性
下载PDF
西洋杜鹃ISSR-PCR反应体系的建立及优化 被引量:3
10
作者 郑宇 何天友 +3 位作者 陈凌艳 陈礼光 荣俊冬 郑郁善 《福建林学院学报》 CSCD 北大核心 2011年第2期126-130,共5页
以西洋杜鹃(Rhododendron hybridum)叶片提取的基因组DNA为材料,用引物UBC880(序列为GGA GAG GAG AGGAGA)研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对该种植物ISSR扩增结果的影响。确立了可用于西洋杜鹃ISSR-PCR分析的最适宜的PCR反应体系... 以西洋杜鹃(Rhododendron hybridum)叶片提取的基因组DNA为材料,用引物UBC880(序列为GGA GAG GAG AGGAGA)研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对该种植物ISSR扩增结果的影响。确立了可用于西洋杜鹃ISSR-PCR分析的最适宜的PCR反应体系:20μL PCR反应体积中,含10 ng模板DNA,0.25 mmol.L-1 dNTPs,2.0 mmol.L-1 Mg2+,1.0U Taq DNA聚合酶,0.4μmol.L-1引物,并确定引物UBC 880的最适退火温度为54.4℃。PCR扩增程序:94℃预变性5 min,94℃变性45 s,54.4℃退火45 s,72℃延伸1.5 min,共40个循环后,72℃延伸7 min,4℃保存。应用该ISSR体系对11份西洋杜鹃种质进行了扩增,证实了该体系的适用性和稳定性。 展开更多
关键词 西洋杜鹃 简单序列重复区间 反应体系 优化
下载PDF
濒危树种格氏栲ISSR-PCR反应体系的建立 被引量:3
11
作者 林义君 刘金福 +2 位作者 潘东明 洪伟 吴则焰 《福建林学院学报》 CSCD 北大核心 2011年第2期115-119,共5页
以濒危珍稀树种格氏栲为材料,对ISSR反应体系中的各个主要影响因子进行优化筛选。首次建立可用于格氏栲ISSR-PCR分析的反应体系:20μL PCR反应体系中包括1 ng.μL-1模板DNA,0.10 mmol.L-1dNTP,2.0μL 10×PCR buffer(缓冲液),0.2μm... 以濒危珍稀树种格氏栲为材料,对ISSR反应体系中的各个主要影响因子进行优化筛选。首次建立可用于格氏栲ISSR-PCR分析的反应体系:20μL PCR反应体系中包括1 ng.μL-1模板DNA,0.10 mmol.L-1dNTP,2.0μL 10×PCR buffer(缓冲液),0.2μmol.L-1引物,0.037 5 U.μL-1 Taq酶,11.3μL ddH2O,2.0 mmol.L-1 MgCl2。扩增程序:94℃预变性5 min,94℃变性30 s,复性45 s,72℃延伸1.5 min,循环34次,最后72℃延伸10 min,4℃保存。 展开更多
关键词 格氏栲 简单重复序列区间—聚合酶链式反应 体系优化
下载PDF
福建省玉米大斑病菌ISSR-PCR反应体系的优化和引物的筛选 被引量:3
12
作者 代玉立 甘林 +5 位作者 阮宏椿 杨静民 石妞妞 杜宜新 陈福如 杨秀娟 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期810-817,共8页
【目的】明确适用于福建省玉米大斑病菌ISSR分子标记的反应体系和引物。【方法】采用单因素水平优化法对ISSR-PCR扩增反应中的Taq聚合酶用量、dNTPs浓度、Mg^2+浓度、模板DNA浓度、PCR反应循环数以及引物的最佳退火温度等重要参数进行... 【目的】明确适用于福建省玉米大斑病菌ISSR分子标记的反应体系和引物。【方法】采用单因素水平优化法对ISSR-PCR扩增反应中的Taq聚合酶用量、dNTPs浓度、Mg^2+浓度、模板DNA浓度、PCR反应循环数以及引物的最佳退火温度等重要参数进行优化。【结果】适合福建省玉米大斑病菌群体遗传多样性分析的ISSR-PCR反应体系(25μL)为:Taq聚合酶0.55 U、dNTPs 0.30 mmol·L^-1、Mg 2+1.30 mmol·L^-1、DNA模板100 ng、引物10 pmol。ISSR-PCR扩增程序为:94℃预变性4 min;94℃变性45 s,51.2~56.0℃退火45 s,72℃延伸1.5 min,35个循环;72℃延伸10 min。利用优化的反应体系从56条ISSR引物中筛选出稳定性好、多态性高的引物10条:UBC117、UBC118、UBC808、UBC835、UBC847、UBC855、UBC856、UBC857、UBC866和UBC887,其最佳退火温度分别为55.6、53.1、51.2、51.2、56.0、53.1、53.1、51.2、51.2和51.2℃。利用优化的ISSR-PCR反应体系对21株供试菌株进行PCR扩增,结果表明,相同地理来源以及不同地理来源菌株间的DNA多态性均不同,表明福建省玉米大斑病菌群体存在丰富的遗传多样性。【结论】本研究优化的ISSR-PCR反应体系和筛选的引物可用于福建省玉米大斑病菌群体遗传多样性和遗传结构的研究。 展开更多
关键词 玉米大斑病菌 反应体系 简单序列重复区间扩增多态性 玉米大斑病 遗传多样性
下载PDF
沙棘属植物的ISSR-PCR反应体系的建立 被引量:4
13
作者 肖蔚 张浩 +1 位作者 陈雏 阿呷尔布 《华西药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期481-483,共3页
目的建立沙棘的简单重复序列区间聚合酶链反应(ISSR-PCR)优化反应体系。方法对影响ISSR-PCR反应的各因子,如模板DNA用量、TaqDNA聚合酶浓度、镁离子浓度、dNTP浓度等进行单因素梯度实验。结果筛选出了优化的反应条件。结论建立的反应体... 目的建立沙棘的简单重复序列区间聚合酶链反应(ISSR-PCR)优化反应体系。方法对影响ISSR-PCR反应的各因子,如模板DNA用量、TaqDNA聚合酶浓度、镁离子浓度、dNTP浓度等进行单因素梯度实验。结果筛选出了优化的反应条件。结论建立的反应体系多态性高,系统稳定,可应用于沙棘属植物遗传多样性研究和亲缘关系分析。 展开更多
关键词 沙棘 简单重复序列区间 反应体系 单因素梯度实验 优化
下载PDF
白芨ISSR-PCR反应体系的建立及优化 被引量:4
14
作者 刘亭 金露 +3 位作者 兰波 何彬 李靖 王永林 《贵阳医学院学报》 CAS 2014年第4期455-458,462,共5页
目的:建立并优化白芨ISSR-PCR反应体系,为白芨种质资源分子评价奠定技术基础。方法:应用单因素和正交试验研究ISSR-PCR反应体系中模板DNA、Mg2+、引物、dNTP、BSA及Taq DNA聚合酶等6个主要成分对扩增结果的影响,优化出ISSR-PCR最佳反应... 目的:建立并优化白芨ISSR-PCR反应体系,为白芨种质资源分子评价奠定技术基础。方法:应用单因素和正交试验研究ISSR-PCR反应体系中模板DNA、Mg2+、引物、dNTP、BSA及Taq DNA聚合酶等6个主要成分对扩增结果的影响,优化出ISSR-PCR最佳反应体系。结果:优化后25μL反应体系中含100 ng DNA模板、2.0 mmol/L Mg2+、2.5μmol/L引物、0.2 mmol/L dNTP浓度、3.75 g/L BSA及1.25 U Taq DNA聚合酶。结论:建立了适用于白芨的ISSR-PCR最佳反应体系。 展开更多
关键词 白芨 简单序列重复区间扩增多态性技术 聚合酶链反应 体系优化 单因素试验 正交试验
下载PDF
爱玉ISSR反应体系的建立与优化 被引量:3
15
作者 史辉 黄其梅 +2 位作者 叶美娜 阮少江 陈勇 《吉首大学学报(自然科学版)》 CAS 2014年第2期73-78,共6页
通过单因子试验和正交设计,对影响爱玉ISSR-PCR扩增效果的因素,如模板DNA用量、Taq酶用量、dNTPs浓度、引物浓度、延伸时间和循环次数等指标进行优化.实验确立了可用于爱玉ISSR-PCR分析最适宜的反应体系:20μL反应体积中含1ng模板DNA、1... 通过单因子试验和正交设计,对影响爱玉ISSR-PCR扩增效果的因素,如模板DNA用量、Taq酶用量、dNTPs浓度、引物浓度、延伸时间和循环次数等指标进行优化.实验确立了可用于爱玉ISSR-PCR分析最适宜的反应体系:20μL反应体积中含1ng模板DNA、1.0U Taq酶、0.4μmol/L引物和0.18mmol/L dNTPs;PCR扩增程序为94℃预变性4min;94℃变性45s,53℃退火45s,72℃延伸2.5min,共35个循环;72℃延伸7min,4℃保存.应用该体系对14份爱玉种质进行扩增,证实了该体系的适用性和稳定性. 展开更多
关键词 爱玉 ISSR 反应体系 正交设计
下载PDF
迎红杜鹃ISSR-PCR反应体系建立 被引量:3
16
作者 张艳红 沈向群 +1 位作者 刘旭颖 赵凤军 《湖北农业科学》 北大核心 2010年第11期2657-2659,共3页
利用正交设计L16(45)方法对迎红杜鹃(Rhododendron mucronulatum Turcz.)ISSR-PCR(Inter-simple sequence repeat-Polymerase chain reaction products)反应体系的5因素(TaqDNA聚合酶、Mg2+、DNA模板、dNTP、引物)在4个水平上进行了优... 利用正交设计L16(45)方法对迎红杜鹃(Rhododendron mucronulatum Turcz.)ISSR-PCR(Inter-simple sequence repeat-Polymerase chain reaction products)反应体系的5因素(TaqDNA聚合酶、Mg2+、DNA模板、dNTP、引物)在4个水平上进行了优化试验。结果表明,ISSR-PCR反应体系各因素在设定的不同水平对PCR反应结果都有影响,其中引物浓度的影响最大;筛选出了各反应因素的最佳水平,建立的迎红杜鹃ISSR-PCR反应最佳体系(25μL)为2.0μL10×Buffer、0.3μL Taq DNA聚合酶(5U/μL)、2μLDNA模板(20ng/μL),2.5μL dNTPs(2.5mmol/L)、2μL引物(10μmol/L)。 展开更多
关键词 迎红杜鹃 正交设计 简单重复序列区间-多聚酶链式反应体系
下载PDF
地龙ISSR-PCR反应体系的建立与优化 被引量:4
17
作者 吴文如 李薇 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期1573-1575,共3页
目的建立和优化地龙ISSR-PCR反应体系。方法以地龙药材为实验试材,采用异丙醇沉淀法提取了地龙总DNA模板,对地龙ISSR-PCR反应体系中各个主要影响因子进行了优化和筛选。结果建立了标记位点清晰、稳定、重复性好,可用于地龙ISSR分析的最... 目的建立和优化地龙ISSR-PCR反应体系。方法以地龙药材为实验试材,采用异丙醇沉淀法提取了地龙总DNA模板,对地龙ISSR-PCR反应体系中各个主要影响因子进行了优化和筛选。结果建立了标记位点清晰、稳定、重复性好,可用于地龙ISSR分析的最佳反应体系,50μl体系中含有:1×Taq酶配套缓冲液,DNA模板50ng,2.5UTaqDNA聚合酶,2mmol/LMgCl2,0.8μmol/L引物,0.2mmol/LdNTPs。扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性30s,(据不同引物的退火温度)复性30s,72℃延伸1.5min,共35个循环;72℃延伸5min,反应结束后,4℃保存。结论这一优化体系的建立为今后利用ISSR标记技术进行地龙类药用动物鉴定及种质资源遗传多样性分析奠定了基础。 展开更多
关键词 地龙 ISSR 反应体系 建立和优化
下载PDF
麻楝ISSR-PCR反应体系的建立及优化 被引量:1
18
作者 武冲 仲崇禄 +3 位作者 张勇 姜清彬 陈羽 陈珍 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期620-626,共7页
模板DNA、引物、三磷酸碱基脱氧核苷酸(dNTPs),镁离子(Mg2+)浓度、Taq DNA聚合酶的用量以及退火温度是影响简单序列重复区间扩增-聚合酶链式反应(ISSR-PCR)的主要因素。以麻楝Chukrasia tabularis叶片基因组DNA为试验材料,系统地测试这... 模板DNA、引物、三磷酸碱基脱氧核苷酸(dNTPs),镁离子(Mg2+)浓度、Taq DNA聚合酶的用量以及退火温度是影响简单序列重复区间扩增-聚合酶链式反应(ISSR-PCR)的主要因素。以麻楝Chukrasia tabularis叶片基因组DNA为试验材料,系统地测试这6个因素对麻楝ISSR-PCR反应结果的影响。结果表明:最优的反应体系为20μL反应体系中含30 ng模板DNA,1.00μmol.L-1随机引物,0.15 mmol.L-1dNTPs,2.50 mmol.L-1Mg2+,2.50×16.67nkat Taq DNA聚合酶。最佳退火温度为56℃,ISSR-PCR反应程序为94℃预变性5.0 min,94℃变性45 s,56℃退火45 s,72℃延伸1.5 min,40个循环;72℃再延伸7.0 min,4℃保存。应用优化的ISSR-PCR反应体系对24份麻楝个体材料进行扩增,均能扩增出丰富稳定的条带。 展开更多
关键词 林木育种学 麻楝 ISSR PCR条件 优化
下载PDF
送春与多花兰杂种ISSR-PCR反应体系的建立与优化 被引量:1
19
作者 周丽 胡春根 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第17期7904-7906,共3页
[目的]建立与优化送春与多花兰杂种ISSR-PCR的反应体系。[方法]用CTAB法提取送春、多花兰和送春×多花兰杂种的基因组DNA,针对ISSR-PCR扩增的体系中的Taq酶浓度、Mg2+浓度、dNTP浓度和引物的用量4个因素,进行L9(43)正交试验,用引物U... [目的]建立与优化送春与多花兰杂种ISSR-PCR的反应体系。[方法]用CTAB法提取送春、多花兰和送春×多花兰杂种的基因组DNA,针对ISSR-PCR扩增的体系中的Taq酶浓度、Mg2+浓度、dNTP浓度和引物的用量4个因素,进行L9(43)正交试验,用引物UBC827扩增两亲本的混合DNA,所得PCR产物在琼脂糖凝胶上检测,同时针对去离子甲酰胺对反应的影响进行初步对照试验。[结果]根据PCR产物的琼脂糖凝胶检测结果,由试验得到的最佳反应体系为:1×buffer、2.5 mmol/L Mg2+、0.6μmol/L引物0、.25 mmol/L dNTP、1 UTaq酶、0.4μl去离子甲酰胺5、0 ng模板DNA,总体积为20μl。[结论]该反应体系的建立为利用ISSR技术进行兰花遗传连锁图谱构建、基因定位、种质资源鉴定与分类等提供参考。 展开更多
关键词 ISSR 反应体系 正交设计
下载PDF
板栗ISSR反应体系的优化及河北省板栗生态型的分析 被引量:4
20
作者 韩继成 刘庆香 +2 位作者 王广鹏 张新忠 孔德军 《河北农业科学》 2008年第4期64-65,68,共3页
以早丰和燕明2个板栗品种为试材,应用编号为ISSR52的引物,对ISSR反应体系中的dNTPs、Taq DNA聚合酶、引物、模板和甲酰胺等主要影响因子进行了优化筛选。结果表明:20μL ISSR反应体系各组分的最适浓度分别为1×Buffer(含2.0 mmol/L... 以早丰和燕明2个板栗品种为试材,应用编号为ISSR52的引物,对ISSR反应体系中的dNTPs、Taq DNA聚合酶、引物、模板和甲酰胺等主要影响因子进行了优化筛选。结果表明:20μL ISSR反应体系各组分的最适浓度分别为1×Buffer(含2.0 mmol/L的Mg2+),dNTPs 0.2 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U,引物0.2μmol/L,模板25 ng。加人2.0%的甲酰胺有利于减轻背景的干扰。利用该体系对9个河北省板栗品种(系)和1个山东省板栗品种进行了分析,以明确河北省板栗居群的遗传多样性。通过对53个ISSR引物的重复筛选,获得了19个稳定的ISSR引物,在10个品种(系)中共产生93条带,33.3%为多态性条带。通过聚类分析进一步明确河北省板栗可分为燕山和太行山2个生态型,并且太行山地区的板栗具有较高的遗传多样性。 展开更多
关键词 板栗 简单重复序列区间 反应体系 遗传多样性
下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部