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运动对大学生肠道菌群影响的系统综述
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作者 刘昭志 黄丽 +4 位作者 田浩冬 李岚 陈晓 陶云飞 彭莉 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第11期2394-2401,共8页
背景:运动对肠道菌群的调节与人体健康密切相关,但肠道菌群涉及多方面因素影响,国内外研究尚缺乏有关运动对大学生肠道菌群影响的较为一致的证据。目的:探讨运动对大学生肠道菌群多样性和物种组成的影响。方法:通过系统检索PubMed、Web ... 背景:运动对肠道菌群的调节与人体健康密切相关,但肠道菌群涉及多方面因素影响,国内外研究尚缺乏有关运动对大学生肠道菌群影响的较为一致的证据。目的:探讨运动对大学生肠道菌群多样性和物种组成的影响。方法:通过系统检索PubMed、Web of Science、Embase、Medline、Cochrane Library、中国知网、万方、维普数据库,筛选后纳入8篇实证研究,对其采用半定量的方法进行分析。结果与结论:①在运动改变大学生肠道菌群物种多样性方面,高强度间歇训练和太极拳运动均能显著提升大学生肠道菌群的物种多样性,而有氧运动对大学生肠道菌群多样性的提升效果不显著;②在运动影响肠道菌群物种组成方面,3种运动方式均能显著改变大学生肠道中菌群的组成结构,可以提高瘤胃球菌、普氏粪杆菌、布劳提亚菌等有益菌的丰度,降低埃希氏菌属等有害菌的丰度;相较于高强度间歇训练,有氧运动和太极拳运动引起了更多有益菌丰度的提升;③除肠道菌群特征的变化外,运动还可以改善大学生体成分、心肺功能以及执行功能等,这些健康效益与运动引起的菌群变化密切相关,这些菌群可通过代谢调节、屏障功能以及神经调节对机体产生健康效益;④虽然目前已有研究证实了运动与肠道菌群存在关联,但运动影响肠道菌群的机制尚未明确,同时定位与宿主健康相关的菌群是未来以肠道菌群为治疗靶点的关键,这些均值得学者进一步关注和探究。 展开更多
关键词 运动干预 大学生 肠道菌群 菌群多样性 物种组成
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绿樟肖叶甲肠道细菌多样性分析及功能菌株的筛选
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作者 胡连清 彭俊琪 +6 位作者 陈露 刘雯雯 冯瑞章 周万海 魏琴 秦晓红 查黎萍 《宜宾学院学报》 2024年第6期102-108,共7页
为分析绿樟肖叶甲肠道内生细菌群落结构及功能特点,采用高通量测序技术与纯培养技术相结合的方法分析绿樟肖叶甲肠道内生细菌多样性及群落结构,并通过选择培养基筛选其中的功能菌. Illumina MiSeq测序结果表明,绿樟肖叶甲肠道内生细菌... 为分析绿樟肖叶甲肠道内生细菌群落结构及功能特点,采用高通量测序技术与纯培养技术相结合的方法分析绿樟肖叶甲肠道内生细菌多样性及群落结构,并通过选择培养基筛选其中的功能菌. Illumina MiSeq测序结果表明,绿樟肖叶甲肠道内生细菌隶属于15门、24纲、56目、97科、140属;通过COG功能分类统计发现,绿樟肖叶甲肠道中参与“碳水化合物运输和代谢”及“氨基酸转运与代谢”功能的菌群的相对丰度较高.纯培养结果显示,从绿樟肖叶甲肠道分离的37株内生细菌隶属于4门4纲4目4科9属;通过功能选择培养基筛选出23株产蛋白酶功能菌、6株产酯酶功能菌、3株产脂肪酶功能菌.这表明绿樟肖叶甲肠道内生细菌的群落多样且功能丰富. 展开更多
关键词 绿樟肖叶甲 肠道细菌 多样性分析 高通量测序技术 纯培养
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丁酸梭菌对钝吻黄盖鲽幼鱼生长性能、肠道结构和肠道菌群的影响
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作者 徐晓莹 史文凯 +4 位作者 张宁 卢波 李秀梅 张晓明 刘蓬 《水产科技情报》 2024年第3期169-174,共6页
为研究丁酸梭菌对钝吻黄盖鲽(Pseudopleuronectes yokohamae)幼鱼生长和肠道健康的影响,选取体长(10.28±0.08)cm、体质量(13.72±0.90)g的钝吻黄盖鲽幼鱼共180尾,随机分为试验组(饲料中添加丁酸梭菌菌液)和对照组,开展了为期4... 为研究丁酸梭菌对钝吻黄盖鲽(Pseudopleuronectes yokohamae)幼鱼生长和肠道健康的影响,选取体长(10.28±0.08)cm、体质量(13.72±0.90)g的钝吻黄盖鲽幼鱼共180尾,随机分为试验组(饲料中添加丁酸梭菌菌液)和对照组,开展了为期42 d的饲养对比试验,采用体尺性状测量、肠道组织切片观察和高通量测序等方法,分析了饲料中添加丁酸梭菌菌液对钝吻黄盖鲽生长性能、肠道结构和肠道菌群的影响。试验结果显示,与对照组相比,试验组幼鱼的增重率、特定生长率和肥满度均显著提高(P<0.05),饲料系数显著降低(P<0.05);肠道组织的绒毛长度极显著增加(P<0.01),绒毛宽度显著增加(P<0.05)。高通量测序结果显示,在门和属水平上,试验组和对照组均表现出不同程度的差异;饲料中添加丁酸梭菌可以增加钝吻黄盖鲽幼鱼肠道中潜在有益菌的数量,促进肠道分解、代谢饲料的功能。结果表明,饲料中添加丁酸梭菌能提高钝吻黄盖鲽幼鱼的生长性能,改善其肠道结构,调节肠道菌群的比例,促进肠道健康。 展开更多
关键词 丁酸梭菌 钝吻黄盖鲽 生长性能 肠道结构 肠道菌群
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南美白对虾肠道微生物群落的分子分析 被引量:37
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作者 李可 郑天凌 +1 位作者 田蕴 袁建军 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期649-653,共5页
采用分子生物学手段16S rDNA克隆文库方法对实验室养殖条件下的南美白对虾肠道细菌进行了多样性研究。用限制性片段长度多态性(RFLP)方法从文库中筛选出可能不同细菌来源的克隆子12个,测定其16S rDNA片段核甘酸序列,将所获得的序列与Gen... 采用分子生物学手段16S rDNA克隆文库方法对实验室养殖条件下的南美白对虾肠道细菌进行了多样性研究。用限制性片段长度多态性(RFLP)方法从文库中筛选出可能不同细菌来源的克隆子12个,测定其16S rDNA片段核甘酸序列,将所获得的序列与GenBank数据库进行BLAST比对,结果表明:南美白对虾肠道的16S rDNA克隆文库中126个克隆子分属2个不同的细菌类群:变形细菌(Proteobacteria)和厚壁细菌(Firmicutes),其中厚壁细菌为优势菌群占到75.4%,且与最相似序列同源性均低于94%;变形细菌占到24.6%,与最相似序列同源性均高于98%,分别为希瓦氏菌属(Shewanella),泛菌属(Pantoea),Aranicola属,假单胞菌属(Pseudomonas)和弧菌属(Vibrio)。 展开更多
关键词 南美白对虾 肠道 细菌多样性
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肠道菌群多样性变性梯度凝胶电泳分析法的建立 被引量:14
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作者 刘健华 陈杖榴 +1 位作者 李云 俞道进 《中国兽医科技》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期445-449,共5页
采用珠磨法、冻融研磨法和酶法对粪便细菌进行裂解,提取粪便细菌DNA,并采用16SrRNAV3区引物(P3GCf、P2r)和V6V8区引物(U968GCf、L1401r)扩增细菌16SrRNA基因可变区,对变性梯度凝胶电泳(DGGE)方法用于肠道菌群多样性分析的各种条件进行... 采用珠磨法、冻融研磨法和酶法对粪便细菌进行裂解,提取粪便细菌DNA,并采用16SrRNAV3区引物(P3GCf、P2r)和V6V8区引物(U968GCf、L1401r)扩增细菌16SrRNA基因可变区,对变性梯度凝胶电泳(DGGE)方法用于肠道菌群多样性分析的各种条件进行了优化,建立了分析人和动物粪便菌群多样性的DGGE方法。2对引物的粪便DGGE结果都表明,珠磨法和冻融研磨法对细菌的裂解效果优于酶法;P3GCf、P2r引物的条带数明显多于U968GCf、L1401r引物;珠磨法PCRDGGE对普通拟杆菌、青春双歧杆菌和粪肠球菌的检测限分别为(6.4±0.1)×102、(6.1±0.7)×103和(7.2±0.2)×105个细菌,珠磨法对这3种细菌的检测限均低于酶法。结果表明,珠磨法和P3GCf、P2r引物更适宜用于粪便菌群多样性DGGE分析。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳 肠道菌群 DNA提取 菌群多样性
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基于16S rRNA基因序列分析家蚕肠道细菌的多样性 被引量:22
6
作者 许刚 孙振丽 +3 位作者 胡小龙 薛仁宇 曹广力 贡成良 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期641-649,共9页
家蚕肠道菌群与蚕体对营养物质的消化吸收及健康性密切相关。为了解家蚕肠道细菌的多样性及雌、雄个体间肠道细菌类群的差异,通过应用454焦磷酸测序技术检测细菌16S rRNA基因序列的方法分析家蚕5龄第3天雌、雄幼虫中肠内容物中的细菌类... 家蚕肠道菌群与蚕体对营养物质的消化吸收及健康性密切相关。为了解家蚕肠道细菌的多样性及雌、雄个体间肠道细菌类群的差异,通过应用454焦磷酸测序技术检测细菌16S rRNA基因序列的方法分析家蚕5龄第3天雌、雄幼虫中肠内容物中的细菌类群,共发现5 578个分类操作单元(operational taxonomic units),包括14个门、21个纲、30个目、71个科、120个属的细菌,雌、雄个体在上述分类阶元共有的肠道细菌菌群分别为8、9、20、38和46种。在属水平上对细菌菌群构成的分析显示,雄蚕肠道中的主要优势细菌为代尔夫特菌属Delftia、橙单胞菌属Aurantimonas、肠球菌属Enterococcus、嗜糖假单胞菌属Pelomonas、青枯菌属Ralstonia、台湾温单胞菌属Tepidimonas、假单胞菌属Pseudomonas、阿斯普罗单胞菌属Aspromonas、甲基杆菌属Methylobacterium和葡萄球菌属Staphylococcus;雌蚕肠道中的主要优势细菌为代尔夫特菌属Delftia、橙单胞菌属Aurantimonas、假单胞菌属Pseudomonas、嗜糖假单胞菌属Pelomonas、佩特罗菌属Petrobacter、肠球菌属Enterococcus、台湾温单胞菌属Tepidimonas、狭义的梭菌属Clostridium sensu stricto、阿斯普罗单胞菌属Aspromonas。其中,雄蚕肠道中有23个属的细菌丰度是雌蚕的1.5倍以上,在雌蚕肠道中有7个属的细菌丰度是雄蚕的1.5倍以上,表明雌性与雄性家蚕肠道细菌类群的组成和比率存在明显差异。基于16S rRNA基因序列的聚类分析显示,家蚕肠道中的优势细菌属可分为2个大类。家蚕肠道细菌的多样性研究结果可作为探讨雌蚕和雄蚕经济性状差异的新线索。 展开更多
关键词 家蚕肠道 细菌类群 多样性 性别差异 16S RRNA基因序列 454焦磷酸测序
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ERIC-PCR对山东省东平湖4种常见淡水鱼肠道菌群多样性的分析 被引量:6
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作者 周玉法 刘敬博 +2 位作者 苗增民 蔡玉梅 李代军 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第S1期139-142,共4页
分析山东省东平湖常见4种淡水鱼肠道菌群多样性的差异。采用ERIC-PCR(enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR,ERIC-PCR)技术,得到鱼肠道菌群的ERIC-PCR指纹图谱,并用NT-SYS-pc(Version 2.10)软件进行分析。成功建立了山... 分析山东省东平湖常见4种淡水鱼肠道菌群多样性的差异。采用ERIC-PCR(enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR,ERIC-PCR)技术,得到鱼肠道菌群的ERIC-PCR指纹图谱,并用NT-SYS-pc(Version 2.10)软件进行分析。成功建立了山东省东平湖常见4种淡水鱼肠道菌群的ERIC-PCR指纹图谱,了解肠道菌群的差异。草鱼和鲢鱼肠道菌群较为相似,与鲫鱼、鲤鱼肠道菌群差异较大。表明4种淡水鱼类的肠道菌群的组成有明显的差别,食性差异大的鱼类之间肠道菌群差异更明显。 展开更多
关键词 淡水鱼 肠道菌群 多样性 ERIC-PCR
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冷冻原肠浸泡解冻池水细菌多样性分析 被引量:2
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作者 仇保丰 宋鸿雁 +4 位作者 董蓉莲 高雪梅 蒋荧梅 顾炳泉 胡顺林 《动物医学进展》 北大核心 2017年第5期43-48,共6页
为了研究冷冻原肠浸泡解冻池水的细菌多样性,采集3份水样直接提取细菌基因组总DNA,再分别用PCR技术扩增出细菌16S rDNA并构建基因文库,经PCR鉴定后从3个文库中分别随机挑取50个阳性克隆进行DNA序列测定。分别对3个文库的测序结果进行分... 为了研究冷冻原肠浸泡解冻池水的细菌多样性,采集3份水样直接提取细菌基因组总DNA,再分别用PCR技术扩增出细菌16S rDNA并构建基因文库,经PCR鉴定后从3个文库中分别随机挑取50个阳性克隆进行DNA序列测定。分别对3个文库的测序结果进行分析发现,除去24.00%~32.00%为无法鉴定的未培养细菌和未分类细菌以外,其余细菌来自于芽胞杆菌纲、γ-变形菌纲、放线菌纲和黄杆菌纲,分别占各文库克隆总数的38.00%~42.00%、20.00%~26.00%、4.00%~8.00%和0~2.00%。除去44株无法鉴定的细菌,进一步对其他106株细菌进行分析发现,其中2株放线菌目细菌和5株肠杆菌科细菌无法进一步鉴定,其余99个菌株包含了来自19个属的至少30种细菌,且肠球菌属、变形杆菌属和芽胞杆菌属为其中的优势菌属。本研究显示冷冻原肠浸泡解冻池水中细菌多样性较高,其中部分细菌为致病菌和条件致病菌。 展开更多
关键词 冷冻原肠 解冻池 细菌多样性 16SrDNA文库
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果园生混合干草对羔羊胃肠道细菌多样性的影响 被引量:2
9
作者 李腾飞 刘崇义 +4 位作者 靳旭妹 曹馨悦 陈新义 王莹莹 龙明秀 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1821-1830,共10页
利用渭北果园行间种植的优质牧草,研究不同配比混合干草对奶山羊公羔瘤胃及肠道细菌微生物区系的影响,为渭北旱塬“果–草–畜”生态种养循环模式提供理论基础。选择24只2月龄体重相近且健康的萨能奶山羊公羔,随机分成4组,每组3个重复,... 利用渭北果园行间种植的优质牧草,研究不同配比混合干草对奶山羊公羔瘤胃及肠道细菌微生物区系的影响,为渭北旱塬“果–草–畜”生态种养循环模式提供理论基础。选择24只2月龄体重相近且健康的萨能奶山羊公羔,随机分成4组,每组3个重复,每个重复2只羊。以当地传统饲喂方式为对照组(CK),主要为农作物秸秆[玉米(Zea mays)秸秆和小麦(Triticum aestivum)秸秆]、紫花苜蓿(Medicago sativa)和少量田间杂草;3个处理组,分别由两种干草按1꞉1的比例混合组成,即紫花苜蓿+燕麦(Avena sativa)混合干草(Ⅰ组)、紫花苜蓿+多年生黑麦草(Lolium perenne)(Ⅱ组)、毛苕子(Vicia villosa)+多年生黑麦草(Ⅲ组),饲喂85 d后进行取样测定。利用16S rDNA技术对瘤胃和盲肠细菌组成进行测定分析。结果显示:1)与CK组相比,Ⅱ组可以显著提高羔羊肠道菌群Alpha多样性(P<0.05),Ⅰ组和Ⅲ组高于CK组,但不显著(P>0.05)。2)在肠道细菌相对丰度中,3个处理组厚壁菌门相对丰度显著高于CK组(P<0.05),Ⅱ组中拟杆菌门相对丰度显著高于其他3个组(P<0.05),3个处理组罗姆布茨菌(Romboutsia)、梭状芽胞杆菌(Clostridium)的相对丰度显著高于CK组(P<0.05);瘤胃细菌菌群相对丰度中,Ⅲ组中拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度显著高于其他3个组(P<0.05),同时Ⅱ组的变形菌门(Proteobacteria)相对丰度显著高于其他3个组(P<0.05),Ⅲ组普氏菌属(Prevolla)的相对丰度显著高于其他组(P<0.05);Ⅱ和Ⅲ组中理研菌科(Rikenellaceae)RC9的相对丰度显著高于CK组(P<0.05)。综上,饲喂不同果园混合干草可以提高羔羊胃肠道细菌群落多样性,增加胃肠道中有益细菌的丰度,减少致病菌的丰度,促进羔羊健康,其中以紫花苜蓿+多年生黑麦草混合干草效果最佳。 展开更多
关键词 混合干草 细菌多样性 瘤胃 肠道 羔羊 16S rDNA 果园生草
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变性梯度凝胶电泳技术及其在动物肠道菌群研究中的应用 被引量:5
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作者 赵春苗 徐春厚 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第7期62-65,共4页
变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术是一种新型的用于检测核酸变异和点突变的电泳方法,主要根据突变型和野生型核酸序列的不同而导致其变性浓度的差异,从而利用变性梯度胶进行分离,可用于肠道菌群结... 变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术是一种新型的用于检测核酸变异和点突变的电泳方法,主要根据突变型和野生型核酸序列的不同而导致其变性浓度的差异,从而利用变性梯度胶进行分离,可用于肠道菌群结构多样性和种群动态变化的研究。文章对DGGE技术的原理、在肠道菌群多样性和动态性的应用、局限性及发展前景及上综述。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳 肠道菌群 多样性 动态变化
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高原低氧环境对肠道菌群影响的研究进展 被引量:4
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作者 杜文琪 闫馨 +1 位作者 马燕 张伟 《解放军医学院学报》 CAS 北大核心 2023年第8期933-937,共5页
肠道菌群的动态平衡是维持人体健康的重要标志之一。环境是影响肠道菌群组成多样性和丰度的重要因素,肠道菌群可以通过改变其组成来适应环境的变化。世代生活在低氧环境下的人群会发生特定基因的改变,从而会影响肠道菌群的多样性和丰度... 肠道菌群的动态平衡是维持人体健康的重要标志之一。环境是影响肠道菌群组成多样性和丰度的重要因素,肠道菌群可以通过改变其组成来适应环境的变化。世代生活在低氧环境下的人群会发生特定基因的改变,从而会影响肠道菌群的多样性和丰度。高原低氧环境与肠道菌群之间相互联系的研究对低氧环境人群的健康具有重要意义,目前关于低氧环境对于肠道菌群组成影响的具体作用机制研究未见报道。本文重点综述高原低氧环境下人体肠道菌群的变化及其可能原因的研究进展,以期为后续研究提供参考。 展开更多
关键词 肠道菌群 高原 低氧 影响因素 菌群多样性
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养殖河[鱼屯]肠道细菌16S rDNA多样性分析 被引量:3
12
作者 尹雪梅 张公亮 +2 位作者 孙黎明 庞薇 侯红漫 《大连工业大学学报》 CAS 北大核心 2014年第5期316-320,共5页
从养殖河[鱼屯]肠道内容物中提取细菌基因组DNA,通过PCR和TA克隆构建了细菌的16SrDNA基因文库研究肠道内容物细菌的多样性。结果表明,大部分序列通过NCBI数据库的BLAST搜索发现相似率为88%-99%,共有8个OTUs的序列相似率小于98%;鉴定出4... 从养殖河[鱼屯]肠道内容物中提取细菌基因组DNA,通过PCR和TA克隆构建了细菌的16SrDNA基因文库研究肠道内容物细菌的多样性。结果表明,大部分序列通过NCBI数据库的BLAST搜索发现相似率为88%-99%,共有8个OTUs的序列相似率小于98%;鉴定出4类系统发育菌群,分别是变形菌门γ亚群(Gamma-Proteobacteria,44.8%)、CFB菌群细菌(Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides,6.9%),厚壁菌门(Firmicutes,13.8%)、Unclassified group(34.5%),其中变形菌门γ亚群为肠道内容物中的优势细菌类群。文库多样性分析结果显示养殖河鱼屯肠道内容物中有着丰富的细菌多样性群落。 展开更多
关键词 养殖河[鱼屯] 克隆文库 16S RDNA 肠道细菌多样性
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复合益生菌粉对人体肠道菌群多样性的作用 被引量:12
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作者 刘冠兰 冯勋 +5 位作者 朱文韬 吴明科 李玉玺 白妍睿 扎拉加 张春江 《兰州大学学报(医学版)》 CAS 2021年第1期8-15,共8页
目的采集新鲜粪便样本,通过16S高通量测序方法,分析对比志愿者服用复合益生菌粉前后的粪便微生物组成和结构差异,评估复合益生菌粉对其肠道菌群多样性及相关菌类丰度的影响。方法以23例健康志愿者为研究对象,每日早、晚各补充1袋复合益... 目的采集新鲜粪便样本,通过16S高通量测序方法,分析对比志愿者服用复合益生菌粉前后的粪便微生物组成和结构差异,评估复合益生菌粉对其肠道菌群多样性及相关菌类丰度的影响。方法以23例健康志愿者为研究对象,每日早、晚各补充1袋复合益生菌粉,为期30 d;采集服用复合益生菌粉前后的新鲜粪便样品,对样本相关处理后,使用Illumina NovaSeq PE250上机测序。结果服用复合益生菌粉后,肠道菌群的多样性增加,菌群组成发生改变;在门水平上,服用复合益生菌粉前,志愿者粪便微生物中都是厚壁菌门、拟杆菌门占比最高,服用复合益生菌粉后,厚壁菌门显著增加(P<0.01)而拟杆菌门显著减少;厚壁菌门与拟杆菌门相对丰度的比值从1.83增加到3.10,趋近于正常成年人的比值。在属水平上,肠杆菌、类杆菌、罗斯氏菌属、普雷沃菌属及巨藻菌在服用复合益生菌粉前,都占比较高,而在服用复合益生菌粉后,嗜胆菌属相对丰度显著减少;罗斯氏菌属、粪球菌属、镰刀菌属、布氏孢子虫、梭状芽孢杆菌、Romboutsia 6类有益菌属的相对丰度均显著增加(P<0.05),且与已有研究一致,6类有益菌属丰度的增加,有利于改善炎症性肠病,并降低患病风险。结论连续30 d摄入复合益生菌粉,可使肠道菌群中有益菌丰度增加,对志愿者的肠道菌群多样性及组成产生有益影响。 展开更多
关键词 益生菌 肠道菌群 菌群多样性
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重症监护室肺部感染患者肠道菌群特征分析 被引量:1
14
作者 文杨 蒋小艳 +3 位作者 王浩园 范文辉 周茂霖 周强 《国际检验医学杂志》 CAS 2023年第17期2101-2107,共7页
目的探究重症监护室(ICU)肺部感染患者的肠道菌群特征,为肺部感染的危重症患者微生态靶向治疗提供借鉴。方法收集2021年3-9月入住重庆高新区人民医院ICU的肺部感染患者粪便样本78例,ICU非肺部感染患者粪便样本22例,健康人群的粪便样本40... 目的探究重症监护室(ICU)肺部感染患者的肠道菌群特征,为肺部感染的危重症患者微生态靶向治疗提供借鉴。方法收集2021年3-9月入住重庆高新区人民医院ICU的肺部感染患者粪便样本78例,ICU非肺部感染患者粪便样本22例,健康人群的粪便样本40例,采用16S rRNA测序技术对粪便菌群进行检测鉴定,通过生物信息学方法比较并分析ICU肺部感染患者肠道菌群结构特征。结果ICU肺部感染患者的肠道微生物与健康人群相比,alpha多样性显著降低。ICU肺部感染患者肠道菌群以厚壁菌门、拟杆菌门、普雷沃菌属和拟杆菌属为主。处于极度失调(单一菌群丰度>50%)的ICU肺部感染患者的肠道菌群主要富集了普雷沃菌属、拟杆菌属、肠球菌和埃希菌等细菌。LEfSe分析提示,疣微菌科是ICU肺部感染患者肠道菌群中的标志性微生物。ICU肺部感染患者与健康人群相比,糖类和氨基酸代谢通路有所降低。另外,患者年龄结构、体质量指数、急性生理与慢性健康评分系统Ⅱ评分和住院时间与部分肠道菌群存在紧密联系。结论ICU肺部感染患者与健康人群相比,肠道菌群多样性显著降低。ICU肺部感染患者中肠道菌群极度失调者,可能由于感染特殊菌属(普雷沃菌、肠球菌、埃希菌等)引起自身免疫系统失调并诱导炎症因子产生从而引起肺部炎症,提示肠道菌群与ICU肺部感染患者联系密切。肠道菌群中的疣微菌科及其代表菌属阿克曼菌可为ICU肺部感染患者微生态靶向治疗提供参考。 展开更多
关键词 危重症患者 肺部感染 肠道菌群 16S rRNA测序 菌群多样性
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实验室饲养和野外生存条件下东方田鼠肠道菌群的多样性 被引量:2
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作者 冯洁 沈志敏 +3 位作者 王胜昌 林金杏 柏熊 谢建云 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期188-194,共7页
目的探讨实验室饲养和野外生存条件下东方田鼠肠道菌群的分布和差异。方法应用高通量测序技术测定实验室饲养和野外捕捉东方田鼠的肠道细菌16S rDNA-V4-V5区序列,统计操作分类单元(OTUs)数量,分析菌群物种丰度、分布及差异性。结果稀疏... 目的探讨实验室饲养和野外生存条件下东方田鼠肠道菌群的分布和差异。方法应用高通量测序技术测定实验室饲养和野外捕捉东方田鼠的肠道细菌16S rDNA-V4-V5区序列,统计操作分类单元(OTUs)数量,分析菌群物种丰度、分布及差异性。结果稀疏曲线表明取样数量合理,测序充分。在门水平,实验室饲养和野外生存的肠道菌群分布和占比基本相似,实验组有1个独有的门,即黏胶球形菌门(Lentisphaerae),野生组有3个独有的门,分别是梭杆菌门(Fusobacteria)、奇古菌门(Thaumarchaeota)和未分类的门,丰度差异最大的为软壁菌门(Tenericutes)。在属水平,野外东方田鼠肠道细菌较实验室饲养的丰富,丰度差异最大的为瘤胃球菌属(Ruminococcus)。结论获得了实验室饲养和野外生存条件下东方田鼠肠道菌群结构和差异性,进一步充实了东方田鼠基础生物学数据。 展开更多
关键词 东方田鼠 肠道菌群 16S RDNA 多样性
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养殖塘和市售小龙虾肠道细菌多样性的比较 被引量:6
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作者 邓祥宜 李池茜 +3 位作者 张涵池 柯奥 鲍晓龙 李继伟 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2021年第3期44-52,共9页
养殖塘与市售小龙虾在摄食、存活率方面存在明显差异。为了揭示这些差异是否与肠道细菌群落组成有关,通过Illumina高通量测序技术研究了养殖塘和市售小龙虾肠道细菌群落组成,并对群落功能进行了分析。结果显示,养殖塘小龙虾肠道细菌群... 养殖塘与市售小龙虾在摄食、存活率方面存在明显差异。为了揭示这些差异是否与肠道细菌群落组成有关,通过Illumina高通量测序技术研究了养殖塘和市售小龙虾肠道细菌群落组成,并对群落功能进行了分析。结果显示,养殖塘小龙虾肠道细菌群落组成与市售小龙虾差异明显。养殖塘小龙虾肠道细菌优势门为变形菌门(Proteobacteria)(占49.98%~58.11%)、厚壁菌门(Firmcutes)(9.51%~36.76%)、软壁菌门(Tenericutes)(6.02%~26.96%)和拟杆菌门(Bacteroidetes)(4.06%~4.14%);市售小龙虾肠道细菌主要优势门为拟杆菌门(21.05%~39.22%)、厚壁菌门(20.51%~35.94%)、暂定门RsaHF231(11.55%~46.34%)和变形菌门(4.29%~11.04%)。在属水平上,柠檬酸杆菌属和哈夫尼菌属是养殖塘小龙虾肠道中的正常核心菌群,但其在市售样本中占比较低;暂定门RsaHF231未分类属、拟杆菌属、丹毒丝菌科的[Anaerorhabdus]_furcosa_group和g_ZOR0006是市售小龙虾肠道中的优势类群,但在养殖塘样本中含量较低。COG功能预测结果显示,养殖塘小龙虾肠道细菌群落的代谢功能较市场样本旺盛。与养殖塘小龙虾相比,市售小龙虾肠道细菌群落组成和功能有较大差异,这可能与其摄食减少、存活率降低有关。 展开更多
关键词 小龙虾(克氏原螯虾) 肠道微生物 细菌群落多样性 高通量测序 功能预测
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探讨半夏泻心汤联合盐酸伊立替康治疗对大鼠肠道菌群的影响
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作者 邹媛媛 裴静波 +1 位作者 周文英 王亚坤 《中国现代医生》 2023年第14期72-76,共5页
目的探讨半夏泻心汤对盐酸伊立替康(irinotecan hydrochloride,CPT-11)相关的大鼠肠道菌群的影响。方法选取70只雄性大鼠适应性喂养1周后,采用随机数字表法分为空白对照组、模型对照组、半夏泻心汤低剂量组、半夏泻心汤中剂量组、半夏... 目的探讨半夏泻心汤对盐酸伊立替康(irinotecan hydrochloride,CPT-11)相关的大鼠肠道菌群的影响。方法选取70只雄性大鼠适应性喂养1周后,采用随机数字表法分为空白对照组、模型对照组、半夏泻心汤低剂量组、半夏泻心汤中剂量组、半夏泻心汤高剂量组、5-氨基水杨酸组,以及半夏泻心汤+5-氨基水杨酸组,每组10只。所有大鼠腹腔注射CPT-11溶液造模,根据组别和剂量分别对各组灌胃半夏泻心汤和5-氨基水杨酸。10d后麻醉处死大鼠取材,测量大鼠胃残留率、小肠推进率。采用16S rDNA测序分析大鼠肠道粪便中的菌群种类,采用香浓–威纳(Shannon-wiener)指数计算各组大鼠粪便样品中菌群的多样性。采用索雷森(Sorenson)指数比较各组大鼠肠道菌群16S rDNA-PCR-DGGE图谱的相似性。结果相比于空白对照组,模型组大鼠增重缓慢,胃残留率升高,肠推进率降低,菌群多样性指数和相似性指数降低,肠杆菌数量增多,拟杆菌、双歧杆菌、肠球菌和乳酸杆菌数量减少,差异均有统计学意义(P<0.05);与模型对照组相比,半夏泻心汤低、中、高剂量组大鼠的胃残留率降低,肠推进率提高,肠杆菌数量减少,拟杆菌、双歧杆菌、肠球菌和乳酸杆菌数量增多,差异均有统计学意义(P<0.05);与半夏泻心汤中剂量组比较,半夏泻心汤与5-氨基水杨酸联合治疗后,大鼠的肠推进率提高,拟杆菌、双歧杆菌、肠球菌和乳酸杆菌增多,差异均有统计学意义(P<0.05)。治疗后第10天,半夏泻心汤各剂量组、5-氨基水杨酸组、半夏泻心汤+5-氨基水杨酸组的菌群多样性指数、菌群相似性指数均显著高于模型对照组(P<0.05),且半夏泻心汤中剂量组的菌群多样性指数、菌群相似性指数显著高于半夏泻心汤低、高剂量组(P<0.05);半夏泻心汤+5-氨基水杨酸组的菌群多样性指数、菌群相似性指数均显著高于5-氨基水杨酸组(P<0.05),结论半夏泻心汤能够显著改善大鼠由CPT-11导致的肠道菌群失调现象,缓解大鼠体质量下降的症状,使得模型大鼠胃残留率降低、肠推进率增加。 展开更多
关键词 半夏泻心汤 盐酸伊立替康 肠道菌群 菌群多样性指数 菌群相似性指数
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黄河三角洲宽体金线蛭肠道菌群多样性分析
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作者 梁照东 崔庆华 《安徽农学通报》 2024年第23期35-39,共5页
为探究宽体金线蛭肠道与土壤环境中细菌群落多样性差异,本研究使用高通量测序技术测定了该物种肠道和土壤中的细菌群落。结果表明,金线蛭肠道和土壤样品中的细菌群落多样性和群落结构存在明显差异,表明土壤对肠道细菌群落的建立影响不... 为探究宽体金线蛭肠道与土壤环境中细菌群落多样性差异,本研究使用高通量测序技术测定了该物种肠道和土壤中的细菌群落。结果表明,金线蛭肠道和土壤样品中的细菌群落多样性和群落结构存在明显差异,表明土壤对肠道细菌群落的建立影响不大。与土壤样品相比,肠道样品中的细菌丰富度和多样性明显降低;肠道中的优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)40.64%、变形杆菌(Proteobacteria)28.94%和拟杆菌门(Bacteroidota)16.20%等,土壤中的优势菌门为变形杆菌48.95%、拟杆菌门16.69%和放线菌门(Actinobacteriota)14.85%等;肠道中优势属为气单胞菌属(Aeromonas)23.76%、鲸杆菌属(Cetobacterium)9.98%和刺骨鱼属(Epulopiscium)8.16%。土壤类群中优势属为氢噬胞菌属(Hydrogenophaga)6.16%、黄杆菌属(Flavobacterium)11.36%和气单胞菌属5.26%。两者在转运通路、碳循环通路和免疫等方面存在差异。研究结果为了解宽体金线蛭的肠道细菌群落及与土壤环境间的关系提供参考。 展开更多
关键词 宽体金线蛭 肠道菌群 土壤菌群 菌群多样性
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热应激环境下育成鸡肠道菌群多样性及黏膜结构的相关性分析 被引量:25
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作者 李永洙 陈常秀 +1 位作者 金泽林 郑中华 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期71-80,共10页
为分析热应激环境下育成鸡肠道菌群以及黏膜结构的变化,揭示热应激下家禽肠道中正常菌群定植与黏膜结构变化的相关性,选取健康状况相似的10周龄日照琅琊鸡96只,设适温对照组((24±1)℃,Ⅰ)和高温组((38±1)℃),随机分在2个人工... 为分析热应激环境下育成鸡肠道菌群以及黏膜结构的变化,揭示热应激下家禽肠道中正常菌群定植与黏膜结构变化的相关性,选取健康状况相似的10周龄日照琅琊鸡96只,设适温对照组((24±1)℃,Ⅰ)和高温组((38±1)℃),随机分在2个人工环境气候舱中饲养,试验期为14d。采用16SrDNA PCR-DGGE技术,分析热应激处理后1d(Ⅱ)、7d(Ⅲ)和14d(Ⅳ)时十二指肠、空肠及回肠部位内容物细菌群落多样性以及组织黏膜形态变化、肠黏膜上皮内杯状细胞数量。结果表明:热应激持续时间越长,对回肠部位菌群影响越大,Ⅲ组十二指肠与回肠部位优势细菌菌群组成分离明显;Ⅳ组十二指肠、空肠与回肠部位优势细菌菌群组成具有明显差异。不同热应激时段在空肠部位可检测到罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)、螺旋链霉菌(Streptomyces spiralis)、Plebeius杆菌属细菌(Bacteroides plebeius strain)和嗜酸乳杆菌(L.acidophilus),而回肠部位可检测到拟杆菌属(Bacteroidetes)和不可培养的细菌等;Ⅲ组十二指肠、空肠和回肠的绒毛长度、宽度、隐窝深度及绒毛高度/隐窝深度(V/C)均发生了明显的变化,各肠段的绒毛长度均明显下降,其中回肠绒毛长度减少最为显著(P<0.05);十二指肠、空肠隐窝深度及V/C均出现明显下降(P<0.05),各肠段肠壁厚度均显著比对照组低(P<0.05)。Ⅲ组空肠和回肠内杯状细胞的数量明显减少,其中回肠差异显著(P<0.05)。结果显示,热应激对育成鸡各肠段细菌菌群组成的影响很大,并且黏膜组织结构发生了明显变化,从而破坏消化道菌群平衡,导致消化吸收功能严重受阻。 展开更多
关键词 热应激 育成鸡 肠道菌群 肠黏膜结构 多样性
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克罗恩病患者肠道菌群多样性变化研究初探 被引量:6
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作者 沈海燕 阮水良 +4 位作者 徐水凌 陆其明 杨志宏 罗鼎天 陈春晓 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2016年第6期662-666,共5页
目的探讨克罗恩病(CD)患者肠道菌群多样性变化。方法收集8例确诊CD患者的粪便标本(CD组),以同期8例健康人群粪便作为对照组(CN组)。收集新鲜粪便样本提取DNA,并将样本进行PCR扩增,最终进行16SrRNA数据分析。结果测序共获得990 890条高... 目的探讨克罗恩病(CD)患者肠道菌群多样性变化。方法收集8例确诊CD患者的粪便标本(CD组),以同期8例健康人群粪便作为对照组(CN组)。收集新鲜粪便样本提取DNA,并将样本进行PCR扩增,最终进行16SrRNA数据分析。结果测序共获得990 890条高质量序列,CD组和CN组多样性指数Shannon和Simpson比较差异有统计学意义(t=-3.802和t=-2.886,P<0.05)。OTUs(可操作分类学单位)比较韦恩图显示CD组共有7 437株菌种,而CN组共有7 744株菌种,其中3 438株菌种重叠。LDA差异贡献分析图提示CD患者肠道菌群以芽胞杆菌、变形菌、乳杆菌目、放线菌目、异常球菌纲、栖热菌目、假单胞菌目和交替单胞菌目等为主要特征差异细菌菌类,而CN组则以双歧杆菌目及双歧杆菌科,Odoribacteraceae、Christensenellaceae、弧菌目及弧菌科等为主要特征差异细菌菌类。据物种进化树的样本菌落分布图显示:两组样本厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门、变形菌门、疣微菌门、酸杆菌门和螺旋菌门占主要门类分布。CD组及CN组细菌科类分析结果:毛螺菌科、韦荣球菌科、瘤胃菌科、丹毒丝菌科、红蝽菌科、紫单胞菌科、双歧杆菌科、普雷沃菌科、拟杆菌科、产碱菌科和链球菌科在两组样本中共同存在。同时从该进化树可发现,CD组中红蝽菌科、产碱菌科、丹毒丝菌科和链球菌科相对于CN组优势丰度分布,而普雷沃菌科、拟杆菌科和双歧杆菌科比CN组丰度明显减少。此外,Dethiosulfovibrionaceae、丙酸杆菌科、盐单胞菌科、希万菌科等为CD组特有菌种。结论 CD组的菌群多样性明显少于CN组,CD组有其特有优势菌群。 展开更多
关键词 克罗恩病 肠道菌群 16SrRNA高通量测序 多样性
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