Enumeration,Genetic Characterization and Antimicrobial Susceptibility of Lactobacillus and Streptococcus Isolates from Retail Yoghurt in Beijing,China

Lactic acid bacteria （LAB） are widely used in food industries. Correct identification and safety evaluation of these bacteria at the species even strain level should take considerations into account. In this study, the LAB were recovered from yoghurt and characterized phenotypically and genetically. Fifty-two isolates of LAB from 31 yoghurt samples were cultured and grouped into 6 species including Luctobucillus bulguricus （24 isolates）, Streptococcus thermophilus （15 isolates）, L. ucidophilus （7 isolates）, L. porucusei/cusei （3 isolates）, L. delbrueckii （2 isolates）, and L. fermentum （1 isolate）, based on their Gram-staining, colony morphology and biochemical properties.

高致病性新城疫病毒的分离和生物学特性分析

为鉴定导致黑龙江省肇源县2022年某养殖场鸭大量死亡的病原,并分析其生物学特性,本研究将病死鸭组织病料样品处理后接种9日龄SPF鸡胚连续传代分离出病毒后,利用PCR检测临床症状相似的各类禽源病毒,结果显示,除新型新城疫病毒(NDV)外未检测到其他病原。通过测定鸡胚半数致死量(ELD_(50))、平均致死时间(MDT)、1日龄雏鸡脑部致死指数(ICPI)及7日龄雏鸭的感染试验,评估分离株的毒力及致病性;对分离株F基因测序并进行遗传进化分析。结果显示,该病毒株的ELD_(50)为1×10^(-2)ELD_(50)/m L,MDT为58.6 h,ICPI为1.625,致病性试验结果显示,雏鸭全部死亡且解剖发现内脏组织等出现剖检病变;测序结果显示该分离株F基因全长1662 bp,其编码氨基酸裂解位点区序列为^(112)RRQRRF^(117),具有典型强毒力特性;F基因遗传进化树结果显示,该分离病毒属于Class II基因III型,与2000年~2017年在中国家禽中持续流行的病毒株聚为一大分支,且它们F基因序列的一致性为99.8%~99.9%,分离病毒与疫苗株Mukteswar、B1、La Sota、clone30、VG/VA、V4和中国标准嗜内脏速发型强毒株F48E8 F基因的一致性分别为99.6%、88.6%、88.4%、88.6%、88.4%、91.3%、92.1%。本研究为鸭新城疫的防控和疫苗的研制奠定了基础。

鹅星状病毒XX株的分离鉴定及遗传特征分析

为研究引起雏鹅痛风疫情的鹅星状病毒(Goose astrovirus,GAstV)河南流行株的基因组特征,从患有痛风的雏鹅样品中分离了1株GAstV,命名为XX株,并对分离毒株进行了全基因组测序和遗传特征分析。结果显示,GAstV XX株可在LMH细胞上稳定传代,但无明显的细胞病变;该毒株基因组全长7252 bp,与代表性毒株GD、AstV/SDPY/Goose/1116/17、AAstV/Goose/CHN/2017/SD01的基因组核苷酸序列同源性分别为98.1%、98.7%、98.7%。系统进化分析结果显示,GAstV XX株与GD、AstV/SDPY/Goose/1116/17、AAstV/Goose/CHN/2017/SD01等毒株处于同一进化分支,属于禽星状病毒1群。ORF2编码蛋白氨基酸序列分析结果显示,与已报道的GAstV流行毒株相比,GAstV XX株存在多个氨基酸位点的突变。

酵母DNA修复基因RAD16温度敏感突变株的分离及人类互补基因的鉴定

用PCR介导的基因重组法敲除酵母RAD16基因,用羟胺处理酵母RAD16基因表达质粒,获得RAD16基因突变库,并将其转化RAD16基因敲除的酵母细胞.用平皿复制法获得温度敏感突变株rad16-ts2,经互补试验证实,该突变表型为RAD16基因突变所致.将人cDNA表达文库转化rad16-ts2后筛选温度敏感拯救(rescue)表型,回收拯救表型酵母细胞中的质粒.测序结果表明,所获得的人cDNA克隆为HLTF/Zbu1/SMACA3基因.比较分析显示,人类该基因编码蛋白质氨基酸序列与酵母Rad16的同一性为32%,相似性则达50%.人HLTF/Zbu1/MACA3基因在HeLa细胞中过表达,可显著抑制过氧化氢损伤和UV照射诱导的细胞凋亡.

南京市首例甲型H1N1(2009)流感病毒分离及其血凝素基因遗传变异分析

对南京市首例甲型H1N1(2009)病毒进行细胞分离,获得一株具有较高血凝活性的病毒,命名为A/Nanjing/1/2009。在全基因组测序的基础上,对分离株的血凝素基因(haemagglutinin,HA)的遗传特征进行了详细研究。分离株HA蛋白不具有多碱基HA裂解位点,具有低致病性流感病毒特点。与参考株A/California/04/2009相比,分离株A/Nanjing/1/2009HA蛋白的有5个氨基酸发生了突变,其中一个位于Ca抗原位点208位氨基酸(R→K),这一突变虽然还不会影响抗原性的改变,但预示了新甲型H1N1(2009)抗原漂移的启动。分离株有5个潜在糖基化位点,这与近年来古典猪H1N1和北美三源重配猪H1病毒完全一致,保留了古典猪H1病毒的特点。与禽H1病毒相比,分离株HA蛋白受体结合位点上的190(E→D)和225(G→D)位点发生突变,这可能成为新甲型H1N1(2009)在人际间传播的一个重要分子基础。此外,其它受体结合位点上相关氨基酸同时具有人和猪流感病毒的特点。本研究对南京市早期流行的甲型H1N1(2009)流感病毒的HA蛋白的分子遗传特征进行了详细研究,对进一步监测病原变异具有重要指导意义。

基于柔性负荷的孤立多能互补建筑能源系统优化设计

构建基于柔性负荷的多能互补建筑能源系统是解决孤立乡村能源供给问题的有效手段。采用Matlab/Simulink建立孤立多能互补建筑能源系统优化模型,并以系统的费用年值最低为优化目标,基于遗传算法求解计算。研究结果表明,与不考虑柔性负荷相比,柔性电负荷、柔性热负荷、柔性电/热负荷参与调节时,系统的费用年值分别降低了5.24%、33.11%与35.50%。柔性电负荷参与调节后,负荷向光伏出力时段平移,储能电池和柴油发电机的容量得以降低。与仅有柔性热负荷参与调节相比,柔性电、热负荷同时参与调节时,室内温度波动平缓,波动振幅小。

江苏首例甲型H1N1(2009)流感病毒分离及其血凝素分子遗传特征分析

2009年6月12日,江苏确诊首例甲型H1N1(2009)病例。通过细胞和鸡胚分离系统,我们分离到一株具有较高血凝活性的病毒,命名为A/Jiangsu/1/2009。为了跟踪病毒的变异情况,我们开展了病毒的全基因组测序工作,在此基础上对其血凝素基因(Haemagglutinin,HA)的遗传特性进行了详细研究。分离株HA蛋白不具有多碱基HA裂解位点,具有低致病性流感病毒特点。与参考株A/California/04/2009相比,分离株A/Jiangsu/1/2009HA蛋白的有4个氨基酸发生了突变,但都不在已知的抗原位点上。分离株有5个潜在糖基化位点,这与近年来古典猪H1N1和北美三源重配猪H1病毒完全一致,保留了古典猪H1的特点。与禽流感H1病毒相比,分离株HA蛋白受体结合位点上的E190D和G225D发生突变,这可能成为新甲型H1N1(2009)在人际间传播的一个重要分子基础。此外,其它受体结合位点上相关氨基酸同时具有人和猪流感病毒的特点。本研究首次对早期流行的甲型H1N1(2009)流感病毒的HA蛋白的分子遗传特征进行了详细研究,对进一步监测病原变异具有重要指导意义。

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型（EV71）分离株的基因特征。方法采集手足口病患者标本进行病毒分离培养，阳性标本进行RT-PCR鉴定后，选取29株EV71分离毒株，对其VP1区进行核苷酸序列测定，并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树。结果从439份标本中分离肠道病毒215株，经RT-PCR鉴定，93株为EV71。选取其中29株进行VP1基因全序列测定，根据VP1全基因序列构建系统发生树，29株毒株均在C基因型中，与c4亚型属同一分支，与c4亚型代表株核苷酸同源性为91．7％～99．4％，氨基酸同源性为96．6％～100．0％。结论宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型。

白条草蜥多态性微卫星位点的分离与鉴定

白条草蜥(Takydromus wolteri)是一种年产多窝卵的蜥蜴。为了对其婚配制度、同一雌性个体所产卵的窝内和窝间的父权状况、种群的遗传结构和物种的进化历史等研究内容进行探讨,本研究筛选出白条草蜥的9个具有高度多态性的微卫星位点。微卫星位点筛选自包含(AC)n和(ATAG)n重复片度的微卫星富集文库。在白条草蜥安徽滁州种群的16～32个个体中对上述位点进行检测后发现,上述座位的等位基因数目范围为12～20个,期望杂合度范围为0.894～0.955,观测杂合度范围0.565～0.938,表明这些微卫星标记具有良好的遗传多样性,它们将在白条草蜥的种群遗传结构、基因流水平、种群分化和婚配制度的研究中发挥重要作用。

鹅星状病毒江苏分离株JSSQ遗传特征分析

【背景】自2016年以来,我国山东、安徽、江苏、广东等养鹅地区暴发了一种以痛风为主要特征的急性传染病。【目的】研究引起江苏某鹅场雏鹅痛风的鹅星状病毒(goose astrovirus,GAstV)的基因组特征。【方法】从疑似患有痛风的雏鹅肝脏样品中分离到一株GAstV,命名为JSSQ,并对JSSQ全基因组序列及遗传特征进行分析。【结果】GAstV JSSQ株可在LMH细胞上稳定传代,无明显细胞病变;该毒株基因组全长7 175 nt,与其他已报道的鹅星状病毒参考株相似性为57.3%-99.1%。系统进化分析显示,JSSQ与参考毒株AHAU3亲缘关系最近,处于同一分支。重组分析显示,在GAstVJSSQ基因组中的第807和2818位点发生了2次重组,起源于GD AHAU2(major parent)和AHAU4(minor parent)。抗原表位分析显示,在ORF2区出现多处氨基酸突变,存在P64S、A224T、A228S、Q229P等独特突变,可引起抗原表位的变化。【结论】不同地区GAstV可能存在不同生物学特性,在防控中应予以注意。

猪源弓形虫的分离鉴定及基因型的研究

本研究的目的是分离鉴定江西省某猪场猪感染的弓形虫虫株并研究其多位点基因型。以江西省某猪场病死的后备母猪肺门淋巴结为材料,经触片、瑞氏染色,镜检可见弓形虫滋养体;将该阳性病料腹腔接种BALB/c小鼠,经连续传代分离得到弓形虫虫株(命名为TgPJX13),用基于B1基因的半巢式PCR方法对该分离虫株进行鉴定,得到弓形虫的特异条带。测序表明,TgPJX13株扩增片段序列与NCBI中的弓形虫B1基因序列完全一致。用PCR-RFLP方法在11个基因位点(其中SAG1、SAG2、SAG3、5′+3′SAG2、BTUB、GRA6、c22-8、c29-2、L358和PK1为核基因位点,Apico为顶质体基因位点)对TgPJX13虫株进行基因型鉴定,确定该虫株的基因型为ToxoDB#9。弓形虫TgPJX13株的成功分离和鉴定为进一步研究其毒力及生物学特性奠定了基础。