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Interaction between Heparin and Fibronectin: Using Quartz Crystal Microbalance with Dissipation, Immunochemistry and Isothermal Titration Calorimetry
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作者 李贵才 WANG Caiping +2 位作者 杨苹 ZHOU Jie ZHU Pingchuan 《Journal of Wuhan University of Technology(Materials Science)》 SCIE EI CAS 2015年第5期1074-1084,共11页
The adsorption behavior of heparin and fibronectin was studied by quartz crystal microbalance with dissipation(QCM-D), and the interaction between heparin and fibronectin was evaluated using immunochemistry and isothe... The adsorption behavior of heparin and fibronectin was studied by quartz crystal microbalance with dissipation(QCM-D), and the interaction between heparin and fibronectin was evaluated using immunochemistry and isothermal titration calorimetry(ITC) measurement. The results showed that there was competitive adsorption between heparin and fibronectin, and the preadsorption of fibronectin could prevent subsequent heparin adsorption to some extent, and the adsorbed Hep/Fn complex on the surface was in a rigid form. The bioactivity of heparin and fibronectin could be affected by the bulk concentration of each, and both heparin and fibronectin in Hep/Fn complex formed under p H 4 condition displayed larger bioactivity than that formed under p H 7 condition. Moreover, the fibronectin showed more exposed cell-binding sites at the p H value lower than physiological condition. The results of ITC further suggested that the interaction between heparin and fibronectin under p H 4 was stronger than under p H 7, and the complex was also more stable. The study brings forth the detailed interaction between heparin and fibronectin, which will be helpful for better understanding the interaction mechanism of the two biomolecules. The results may be potentially useful for the development of new generation of cardiovascular biomaterials. 展开更多
关键词 HEPARIN FIBRONECTIN QCM-D IMMUNOCHEMISTRY isothermal titration calorimetry
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Thermodynamics of clayedrug complex dispersions: Isothermal titration calorimetry and high-performance liquid chromatography
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作者 Ana-Maria Totea Juan Sabin +5 位作者 Irina Dorin Karl Hemming Peter R.Laity Barbara R.Conway Laura Waters Kofi Asare-Addo 《Journal of Pharmaceutical Analysis》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期78-85,共8页
An understanding of the thermodynamics of the complexation process utilized in sustaining drug release in clay matrices is of great importance.Several characterisation techniques as well as isothermal calorimetry were... An understanding of the thermodynamics of the complexation process utilized in sustaining drug release in clay matrices is of great importance.Several characterisation techniques as well as isothermal calorimetry were utilized in investigating the adsorption process of a model cationic drug(diltiazem hydrochloride,DIL)onto a pharmaceutical clay system(magnesium aluminium silicate,MAS).X-ray powder diffraction(XRPD),attenuated total reflectance Fourier transform infrared spectroscopy(ATRFTIR)and optical microscopy confirmed the successful formation of the DIL-MAS complexes.Drug quantification from the complexes demonstrated variable behaviour in the differing media used with DIL degrading to desacetyl diltiazem hydrochloride(DC-DIL)in the 2 M HCl media.Here also,the authors report for the first time two binding processes that occurred for DIL and MAS.A competitor binding model was thus proposed and the thermodynamics obtained suggested their binding processes to be enthalpy driven and entropically unfavourable.This information is of great importance for a formulator as care and consideration should be given with appropriate media selection as well as the nature of binding in complexes. 展开更多
关键词 Clay-drug complex dispersions Magnesium aluminium silicate Diltiazem hydrochloride isothermal titration calorimetry High performance liquid chromatography
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ITC研究达卡巴嗪与DNA反应动力学 被引量:2
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作者 王欢 王姣 +3 位作者 李宗孝 赵微微 蒲小华 程花蕾 《发光学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第12期1560-1565,共6页
利用等温滴定量热(ITC)、光谱、粘度测量等方法,研究了小牛胸腺DNA与抗癌药物达卡巴嗪的相互作用。结果表明:达卡巴嗪与DNA作用后,吸收光谱会出现增色、蓝移和粘度减小等现象。采用ITC法得到了结合常数以及结合位点数,发现达卡巴嗪与... 利用等温滴定量热(ITC)、光谱、粘度测量等方法,研究了小牛胸腺DNA与抗癌药物达卡巴嗪的相互作用。结果表明:达卡巴嗪与DNA作用后,吸收光谱会出现增色、蓝移和粘度减小等现象。采用ITC法得到了结合常数以及结合位点数,发现达卡巴嗪与DNA以非经典嵌插式及表面作用两种方式结合。对于嵌插式,ΔH1〈0,ΔS1〉0,K1=5.63×10~4,结合位点数0.10;对于药物分子仅与DNA表面发生作用而并未嵌入到DNA分子的疏水部分的结合方式,ΔH_2〉0,ΔS_2〉0,K_2=1.00×10~3,结合位点数9.99。同时发现紫外法得到的结合常数是Ka=6.70×10~4,与ITC的嵌插式吻合。 展开更多
关键词 DNA 达卡巴嗪 光谱法 作用机理 等温滴定量热
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紫外光谱与ITC法研究乌头碱与粘虫DNA相互作用 被引量:2
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作者 刘叶 赵微微 +2 位作者 李宗孝 程花蕾 何欢 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第3期851-856,共6页
DNA是生物体遗传信息的载体,研究药物与DNA的相互作用对探讨其作用机理及新药的设计合成具有重要意义。利用紫外吸收光谱技术,微量量热法,等温滴定量热法以及分子模拟技术研究了乌头碱在水溶液中的溶解行为,探讨了乌头碱与粘虫DNA、鲑鱼... DNA是生物体遗传信息的载体,研究药物与DNA的相互作用对探讨其作用机理及新药的设计合成具有重要意义。利用紫外吸收光谱技术,微量量热法,等温滴定量热法以及分子模拟技术研究了乌头碱在水溶液中的溶解行为,探讨了乌头碱与粘虫DNA、鲑鱼精DNA、小牛胸腺DNA的相互作用。实验发现,乌头碱在水溶液中的溶解过程为准一级反应,半衰期(t_(1/2))为0.691h。乌头碱分别与三种DNA作用均为体现出沟槽和表面两种结合形式:沟槽结合时,结合常数Ka_1为10~5,结合位点数为0.40~0.60,且反应为焓驱动的自发过程;表面结合时,乌头碱分子仅与DNA表面发生作用而并未嵌到DNA分子的疏水部分,结合常数Ka_2为10~3,结合位点较大。分子模拟显示,乌头碱均以氢键作用力结合在三种DNA分子的沟槽区,且乌头碱分子中C_8上的酯基对粘虫DNA,鲑鱼精DNA和小牛胸腺DNA链上的碱基有特异性识别,依次为T33,T34和G16,C9,C8。模拟计算获得反应的结合能与实验测定所得ΔG值接近,同时,依据实验数据判定的作用力类型在分子模拟中得到印证,即理论计算与实验基本吻合。 展开更多
关键词 乌头碱 DNA 紫外光谱 等温滴定量热 模拟计算 反应驱动力
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Application of a simple calorimetric data analysis on the binding study of cyanide ions by Jack bean urease 被引量:1
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作者 G.Rezaei Behbehani A.A.Saboury +1 位作者 M.Mohebbian S.Ghammamy 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2010年第4期457-460,共4页
Cyanide ion was studied as an effector of Jack bean urease(JBU) at 300 K in 30 mmol/LTris buffer,pH 7 by isothermal titration calorimetry(ITC).The simple novel model was used for CN^- + JBU interaction over the whole ... Cyanide ion was studied as an effector of Jack bean urease(JBU) at 300 K in 30 mmol/LTris buffer,pH 7 by isothermal titration calorimetry(ITC).The simple novel model was used for CN^- + JBU interaction over the whole range of CN^- concentrations.The binding parameters recovered from the simple novel model were attributed to the cyanide ion interaction.It was found that cyanide ion acted as a noncooperative inhibitor of JBU,and there is a set of 12 identical and independent binding sites for CN^- ions.The di... 展开更多
关键词 isothermal titration calorimetry Cyanide ion Jack bean urease Binding parameter
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Interaction of bovine serum albumi with two alkylimidazolium-based ionic liquids investigated by microcalorimetry and circular dichroism
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作者 Lan-Ying Zhu Guang-Qian Li Fu-Yin Zheng 《Journal of Biophysical Chemistry》 2011年第2期147-152,共6页
The interactions of bovine serum albumin (BSA) with two alkylimidazolium-based ionic liquids, 1-butyl-3-methylimidazolium tetrafluoroborate ([bmim]BF4) and 1-butyl-3-methylimidazolium hexafluorophosphate ([bmim]PF6), ... The interactions of bovine serum albumin (BSA) with two alkylimidazolium-based ionic liquids, 1-butyl-3-methylimidazolium tetrafluoroborate ([bmim]BF4) and 1-butyl-3-methylimidazolium hexafluorophosphate ([bmim]PF6), in buffer solutions at pH 7.0 were investigated by isothermal titration calorimetry (ITC) and circular dichroism (CD). CD spectra showed that the two ionic liquids changed the secondary structure of BSA. Data process was based on the supposition that there were several independent types of binding sites on each BSA molecule for the two ligand molecules. The results obtained by using this supposition combined with Langmuir adsorption model showed that there were two types of such binding sites. One was the high affinity binding site, and the other was the low affinity binding site. The binding constants, changes in enthalpy, entropy and Gibbs free energy for the two types of binding were obtained, which showed that the two types of binding were driven by a favorable entropy increase. Furthermore, for either the ionic liquids, the number of the high affinity binding sites is much smaller than that of the low affinity ones. These results were interpreted with the molecular structure of BSA and the different substituent groups on imidazole ring of the two ionic liquid molecules. 展开更多
关键词 isothermal titration calorimetry Circular DICHROISM Spectra Alkylimidazolium-Based Ionic Liquids Bovine Serum Albumin
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Spectroscopic and calorimetric studies of congo red dye-amyloid peptide complexes
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作者 Kazushige Yokoyama Andrew D. Fisher +2 位作者 Amanda R. Amori Daniel R. Welchons Ruel E. McKnight 《Journal of Biophysical Chemistry》 2010年第3期153-163,共11页
Thermodynamic properties of complexes of Con ?go Red (CR) dye with amyloid ? (A?) peptides were studied by both absorption spectroscopy and isothermal titration calorimetry (ITC). Based on the absorption spectrum for ... Thermodynamic properties of complexes of Con ?go Red (CR) dye with amyloid ? (A?) peptides were studied by both absorption spectroscopy and isothermal titration calorimetry (ITC). Based on the absorption spectrum for the formation of CRAβ complexes in phosphate buffered saline solution (pH 7.4), van’t Hoff plots over a temperature range of 10oC to 70oC were created for CRAβ140, Aβ1228, and Aβ142. The plot for CR Aβ1228 complex showed a relatively linear feature within the given temperature range with ?H = –10.1 ?0.6 kJ/mol and ?S = + 0.128 ? 0.002 kJ/(mol K). However, the plot for CRAβ140 and CRAβ142 complexes exhibited two distinct linear regions with opposite slopes centered at a specific temperature, Ts, which was 54.7 ? 0.2℃ and 34.8 ? 0.2℃, respectively. The ITC experiments conducted at 25℃in water exhibited quite a different situation from the above mentioned spectroscopic approach. The ITC studies yielded a ?H of –85.3 ? 0.2 kJ/mol for the CRAβ1228 complex with negative entropy change –0.152 kJ/mol K). For CRAβ140, the ITC studies indicated the presence of two binding sites with ?H1 = –81.8 ? 0.3 kJ/mol and ?H2 = –119.5 ? 0.2 kJ/mol with K1 = 5.5 ? 0.7 ? 106 M1 and K2 = 6.9 ? 2.4 ? 108 M1, respectively. These binding constants are consistent with the model suggested by several studies. Both binding sites showed negative entropy changes suggesting that the formation of the complex is enthalpically driven. The disagreement in thermochemical values between two different methods confirmed that the enthalpy and entropy are heavily dependent on temperature and buffer/salt environment, and may involve inherently different reaction paths. 展开更多
关键词 Amyloid Beta CONGO Red Dye-Protein Interaction Van’t HOFF Plot isothermal titration calorimetry Binding Site Temperature
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Microcalorimetric Study of Acetylcholine and Acetylthiocholine Hydrolysis by Acetylcholinesterase
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作者 Paulo Alexandre A.de Almeida Neves Eliane Novato Silva Paulo S.L.Beirao 《Advances in Enzyme Research》 2017年第1期1-12,共12页
Acetylcholinesterase (AChE) is an important enzyme responsible for the cleavage of acetylcholine. Studies of the activity of this enzyme use an artificial substrate, acetylthiocholine, because a product of its catalys... Acetylcholinesterase (AChE) is an important enzyme responsible for the cleavage of acetylcholine. Studies of the activity of this enzyme use an artificial substrate, acetylthiocholine, because a product of its catalysis, thiocholine, readily generates a light absorbing product upon reaction with Elman’s reagent 5,5’-dithiobis-(2-nitrobenzoic acid (DTNB). The hydrolysis of acetylcholine cannot be assayed with this method. The isothermal titration calorimetry can assay the hydrolysis of both substrates, without requiring additional reagents other than the enzyme and the substrate. To compare kinetic values obtained in the hydrolysis of acetylcholine (ACh) and acetylthiocholine (ATCh), with carbaryl acting as inhibitor, a calorimetric technique was used to evaluate kinetic properties of the two reactions. This method can show the hydrolysis of both substrates by the heat exchange that occurs during catalysis. In addition, it allowed the assessment of the AChE inhibition by carbaryl, a common insecticide. The results show a similarity between values obtained with both substrates, which are slightly higher for acetylcholine, the enzyme natural substrate. Enzymatic parameters values from ATCh and ACh were similar to each other and inhibitory constants using carbaryl were also similar, displaying that any approach to ACh is feasible using ATCh. The results obtained from ITC show the precision achieved by the calorimetric method. 展开更多
关键词 ACETYLCHOLINESTERASE ACETYLCHOLINE ACETYLTHIOCHOLINE isothermal titration calorimetry CARBARYL
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大球盖菇咸味肽的受体感知机制研究
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作者 李文 陈万超 +4 位作者 吴迪 张忠 刘朋 李正鹏 杨焱 《食品安全质量检测学报》 CAS 2024年第20期167-175,共9页
目的探究在不同咸味受体共存体系下,受体的大球盖菇咸味肽识别和结合特性,受体对咸味肽的竞争结合机制。方法采用分子互作技术构建了多受体-肽分子竞争结合体系,研究了咸味受体上皮细胞Na+通道的阿米洛利敏感钠离子通道蛋白(amiloride s... 目的探究在不同咸味受体共存体系下,受体的大球盖菇咸味肽识别和结合特性,受体对咸味肽的竞争结合机制。方法采用分子互作技术构建了多受体-肽分子竞争结合体系,研究了咸味受体上皮细胞Na+通道的阿米洛利敏感钠离子通道蛋白(amiloride sensitive sodium channel protein,SCNN)1α、SCNN1β和SCNN1γ3个亚基受体,与咸味受体TRPV1共存体系下,对大球盖菇咸味肽KSWDDFFTR(KR-9P)的竞争结合特性。结果咸味肽KR-9P能够同时被多种咸味受体识别和结合。SCNN1β、SCNN1γ和TRPV1受体共存的多受体-肽分子竞争结合体系中,分子间结合反应遵循焓减放热反应,肽分子数量(饱和/非饱和)和受体结合顺序,对分子间的结合影响不大,受体和肽分子之间发生多位点、多数量的分子结合,分子间结合亲和力处于强结合水平(10^(–9)~10^(–8)M)。多个互作分子共存的混合体系并不利于熵驱动的SCNN1α受体结合肽分子的反应发生,分子间结合亲和力在中等水平(10^(–4)M)。结论不同咸味受体在竞争结合咸味肽时展现出不同的互作机制。SCNN1β、SCNN1γ和TRPV1受体共存会产生咸味肽感知呈味增效的效果,SCNN1α和TRPV1受体之间的肽分子竞争结合,会影响SCNN1α受体感知结合咸味肽。本研究解析了不同咸味受体竞争结合咸味肽的互作机制,为理解咸味肽的受体感知机制提供参考。 展开更多
关键词 咸味肽 咸味受体 竞争结合 等温滴定量热法
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等温滴定量热法研究镉离子与GMP的亲合机理
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作者 于劲松 黄煦 +10 位作者 任方圆 黎瑛婕 李朝霞 阿丽娅 吕欣欣 曹慧 袁敏 叶泰 吴秀秀 郝丽玲 徐斐 《工业微生物》 CAS 2024年第1期184-190,共7页
利用等温滴定量热法研究镉离子与鸟嘌呤核糖核苷酸(GMP)的亲合过程,重点分析不同比例的镉离子和GMP结合时的异同,实验结果显示:(1)镉离子和GMP的浓度比不同会对二者的结合过程产生显著影响,在低浓度比下,反应为焓驱动的放热反应;在高浓... 利用等温滴定量热法研究镉离子与鸟嘌呤核糖核苷酸(GMP)的亲合过程,重点分析不同比例的镉离子和GMP结合时的异同,实验结果显示:(1)镉离子和GMP的浓度比不同会对二者的结合过程产生显著影响,在低浓度比下,反应为焓驱动的放热反应;在高浓度比下,反应为吸热反应。从镉离子和GMP浓度比为20∶1时的ITC滴定曲线和OneSite模型拟合结果可知,镉离子和GMP是接近并按照1∶1的比例结合的,二者的亲合力K值为1.21E 4±2.26E 3。(2)推测GMP与镉离子有两个结合位点,一个为放热结合位点,一个为吸热结合位点,在低浓度比下,只有放热结合位点发生结合。当浓度比到达一定值后,会激活吸热结合位点,同时发生吸热结合和放热结合。因为吸热结合位点的结合能力更强,最终可能呈现为吸热反应。(3)通过反滴法和正滴法的比较,同一浓度下,不同的滴加方式也会对结合结果造成较大的影响。该研究所采用的方法可以很好地从宏观的热力学角度分析金属镉离子与GMP的亲合机理,以期为后续镉离子印迹物制备过程中功能单体的筛选提供重要的试验基础和理论指导。 展开更多
关键词 等温滴定量热法 镉离子 功能单体
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环糊精包合三丁酸甘油酯的分子机制研究
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作者 董雪 李兆丰 +4 位作者 顾正彪 班宵逢 洪雁 程力 李才明 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期105-112,共8页
以环糊精(cyclodextrin,CD)为主体,三丁酸甘油酯(tributyrin,TB)为客体,采用共沉淀法制备CD/TB包合物,通过核磁共振、相溶解度、等温滴定微量热及分子模拟对其包合机制进行研究。结果表明,单一环糊精(α-CD、β-CD、γ-CD)均可与三丁酸... 以环糊精(cyclodextrin,CD)为主体,三丁酸甘油酯(tributyrin,TB)为客体,采用共沉淀法制备CD/TB包合物,通过核磁共振、相溶解度、等温滴定微量热及分子模拟对其包合机制进行研究。结果表明,单一环糊精(α-CD、β-CD、γ-CD)均可与三丁酸甘油酯形成包合比为1∶1的包合物,其中β-CD最适于包合三丁酸甘油酯;环糊精包合三丁酸甘油酯是自发进行的微放热过程,焓熵协同驱动促进环糊精包合三丁酸甘油酯,其中熵驱动在包合过程中占主导地位,疏水作用力为主要作用;复配环糊精(α-CD∶β-CD∶γ-CD=2∶7∶1,物质的量之比)包合三丁酸甘油酯过程中的熵变(24.3 cal/mol K)比单一环糊精(β-CD为17.8 cal/mol K)提高了36.52%,同时包合稳定常数提高了79.21%,说明复配环糊精可提供更多与三丁酸甘油酯分子尺寸相匹配的疏水空腔,包合能力更强,从而达到更稳定的包合效果;最终,通过解析单一环糊精包合三丁酸甘油酯的分子对接模型,推测出复配环糊精协同包合三丁酸甘油酯的包合构象。该研究为环糊精包合体系的机制研究提供了参考依据。 展开更多
关键词 环糊精 三丁酸甘油酯 ^(1)H核磁共振 包合机理 等温滴定微量热 分子模拟
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Exploring the taste presentation and receptor perception mechanism of salty peptides from Stropharia rugosoannulata based on molecular dynamics and thermodynamics simulation 被引量:1
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作者 Wen Li Shuai Sun +6 位作者 Wanchao Chen Haile Ma Tingzhao Li Zhong Zhang Di Wu Mengqiu Yan Yan Yang 《Food Science and Human Wellness》 SCIE CAS CSCD 2024年第4期2277-2288,共12页
The taste presentation and receptor perception mechanism of the salty peptide of Stropharia rugosoannulata were predicted and verified using peptide omics and molecular interaction techniques.The combination of aspart... The taste presentation and receptor perception mechanism of the salty peptide of Stropharia rugosoannulata were predicted and verified using peptide omics and molecular interaction techniques.The combination of aspartic acid(D)and glutamic acid(E),or peptide fragments composed of arginine(R),constitute the characteristic taste structural basis of salty peptides of S.rugosoannulata.The taste intensity of the salty peptide positively correlates with its concentration within a specific concentration range(0.25–1.0 mg/mL).The receptor more easily recognizes the first amino acid residue at the N-terminal of salty peptides and the aspartic acid residue in the peptides.GLU513,ASP707,and VAL508 are the critical amino acid residues for the receptor to recognize salty peptides.TRPV1 is specifically the receptor for recognizing salty peptides.Hydrogen bonds and electrostatic interactions are the main driving forces for the interactions between salty peptides and TRPV1 receptors.KSWDDFFTR has the most potent binding capacity with the receptor and has tremendous potential for application in sodium salt substitution.This study confirmed the taste receptor that specifically recognizes salty peptides,analyzed the receptor-peptide binding interaction,and provided a new idea for understanding the taste receptor perception of salty peptides. 展开更多
关键词 Salty peptide Molecular docking Biolayer interferometry isothermal titration calorimetry
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新型Na^(+)/H^(+)逆向转运蛋白UPF0118的Na^(+)结合鉴定
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作者 李红洋 华贝杰 姜巨全 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期62-70,共9页
UPF0118蛋白是一种新型Na^(+)(Li^(+))/H^(+)逆向转运蛋白,属于AI-2E超家族,目前已被划分至Na^(+)/H^(+)逆向转运蛋白亚家族,但无直接证据表明该蛋白可与Na+产生相互作用。为鉴定UPF0118蛋白是否具有Na^(+)结合功能,利用PCR技术扩增upf0... UPF0118蛋白是一种新型Na^(+)(Li^(+))/H^(+)逆向转运蛋白,属于AI-2E超家族,目前已被划分至Na^(+)/H^(+)逆向转运蛋白亚家族,但无直接证据表明该蛋白可与Na+产生相互作用。为鉴定UPF0118蛋白是否具有Na^(+)结合功能,利用PCR技术扩增upf0118基因编码序列,通过Eco RⅠ和PstⅠ酶切位点构建至原核表达载体p ETDuet-1,转化至E. coli BL21*(DE3),对诱导后大量表达的蛋白进行Ni^(2+)亲和层析和凝胶过滤层析,利用等温滴定量热技术对纯化蛋白进行滴定。结果表明,在pH 5.5条件下,Na^(+)滴入导致蛋白溶液产生明显放热现象。在pH 5.5条件下该蛋白具有Na^(+)结合功能,证明该蛋白Na+结合功能为其功能单元与分子机制的研究奠定基础。 展开更多
关键词 UPF0118 Na^(+)/H^(+)逆向转运蛋白 等温滴定量热法 蛋白纯化
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光谱法、量热法以及分子对接研究酸枣仁皂苷A与中心蛋白的作用 被引量:2
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作者 张文龙 胡颖媛 +1 位作者 郭丽丽 裴科 《食品安全质量检测学报》 CAS 2024年第3期286-292,共7页
目的研究酸枣仁皂苷A(jujuboside A,JuA)与八肋游仆虫中心蛋白(Euplotes octocarinatus centrin,EoCen)的相互作用。方法采用圆二色光谱(circular dichroism spectroscopy,CD)以及三维荧光光谱研究EoCen的构象变化;采用稳态荧光光谱与... 目的研究酸枣仁皂苷A(jujuboside A,JuA)与八肋游仆虫中心蛋白(Euplotes octocarinatus centrin,EoCen)的相互作用。方法采用圆二色光谱(circular dichroism spectroscopy,CD)以及三维荧光光谱研究EoCen的构象变化;采用稳态荧光光谱与等温滴定量热法(isothermal titration calorimetry,ITC)研究JuA与EoCen作用的机制;分子对接技术模拟JuA与EoCen的结合位点。结果JuA以摩尔比1:1结合于EoCen的C端(二者反应的结合常数约为10^(5)L/mol),由ITC拟合结果可知,JuA与EoCen复合物的形成是放热的过程,熵变对自由能的贡献较小,主要由焓变驱动。EoCen与JuA结合后,构象发生变化,α-螺旋含量减少,酪氨酸残基的微环境变化,EoCen的C端不再结合蜂毒素。结论JuA主要通过范德华力与EoCen结合,从而改变EoCen的构象,抑制其与靶蛋白的结合。 展开更多
关键词 八肋游仆虫中心蛋白 酸枣仁皂苷A 圆二色光谱 三维荧光光谱 稳态荧光光谱 等温滴定量热法 分子对接技术
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SAE1与SAE2蛋白相互作用肽抑制剂的多种体外筛选体系的构建与评价
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作者 胡晨阳 陆绍永 杨秀岩 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期567-575,共9页
目的·构建用于发现小泛素样修饰蛋白(small ubiquitin-like modifier,SUMO)的活化酶亚基1(SUMO-activating enzyme subunit 1,SAE1)与亚基2(SUMO-activating enzyme subunit 2,SAE2)相互作用的肽抑制剂的多种体外筛选体系,并对不... 目的·构建用于发现小泛素样修饰蛋白(small ubiquitin-like modifier,SUMO)的活化酶亚基1(SUMO-activating enzyme subunit 1,SAE1)与亚基2(SUMO-activating enzyme subunit 2,SAE2)相互作用的肽抑制剂的多种体外筛选体系,并对不同筛选体系的优势与不足进行评价。方法·将编码SAE1和SAE2的目的基因分别插入pET-28a载体以构造原核蛋白表达质粒,在大肠埃希菌中表达并纯化人源SAE1和SAE2蛋白;利用纯化的蛋白先后构建等温滴定量热检测(isothermal titration calorimetry,ITC)实验、荧光偏振(fluorescence polarization,FP)实验、表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)实验和基于SAE酶活的荧光实验等多种筛选体系。尝试利用不同的筛选体系检测候选多肽的抑制活性,基于检测结果,从灵敏度、稳定性、检测通量和检测成本等维度评价各筛选体系的优缺点与适用性。结果·经ITC测得SAE1和SAE2蛋白在体外相互作用的解离常数(K_(d))为0.96μmol/L,并将活性最好的多肽PEPT7改造为FP实验的示踪剂(tracer),但同SAE2的亲和力无法满足FP的要求;SPR测得SAE1和SAE2相互作用的K_(d)值为1.13μmol/L,与ITC数据接近;基于SAE酶活的荧光实验筛选得到抑制活性最强的多肽HP1B[半数抑制浓度(half-maximalinh ibitory concentration,IC_(50))达15.72μmol/L],SPR进一步确定其同SAE1的亲和力为34.4μmol/L。结论·尝试构建并比较了多种常见的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)抑制剂的筛选体系。其中,ITC的检测通量低,且难以准确评估结合热不显著的低亲和力多肽;FP体系的可行性高度依赖于示踪剂同靶点蛋白之间的强亲和力,同样无法用于低亲和力多肽的筛选与优化;SPR检测的灵敏度高,但检测成本较高;酶活实验兼具高灵敏度、稳健性、高通量和可接受的检测成本,是最适宜的筛选方法。 展开更多
关键词 SUMO活化酶亚基1 SUMO活化酶亚基2 多肽抑制剂 药物筛选 等温滴定量热检测实验 荧光偏振实验 表面等离子共振实验 基于酶活的荧光实验
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等温滴定量热法测定脲酶催化尿素水解反应动力学 被引量:11
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作者 宋熙熙 邵爽 +2 位作者 雷群芳 方文军 林瑞森 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期175-179,共5页
采用等温滴定量热法研究脲酶催化尿素的水解反应(尿素浓度147mmol·L-1,脲酶浓度3.0×10-7mmol·L-1,pH=7.0磷酸缓冲溶液)动力学,测定了该反应在298.15~318.15K温度范围内的反应速率常数kcat和米氏常数Km等动力学参数.结... 采用等温滴定量热法研究脲酶催化尿素的水解反应(尿素浓度147mmol·L-1,脲酶浓度3.0×10-7mmol·L-1,pH=7.0磷酸缓冲溶液)动力学,测定了该反应在298.15~318.15K温度范围内的反应速率常数kcat和米氏常数Km等动力学参数.结果表明:在实验条件下,脲酶催化尿素的水解反应符合Michaelis-Menten机理;温度对kcat的影响遵循阿累尼乌斯方程,表观活化能为16.6kJ·mol-1;等温滴定量热法可有效地用于酶催化反应动力学参数的测定,是具有应用前景的研究酶活性的方法. 展开更多
关键词 等温滴定量热 酶催化反应 脲酶 动力学参数
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丹皮酚及其两种同分异构体与牛血清白蛋白相互作用的热力学研究 被引量:16
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作者 刘敏 朱兰英 +2 位作者 曲秀葵 孙德志 林瑞森 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第16期1555-1560,共6页
在298.15K下利用等温滴定微量热法研究了丹皮酚(2'-羟基-4'-甲氧基苯乙酮,Pae)及其两种同分异构体(2'-羟基-5'-甲氧基苯乙酮,Hma;4'-羟基-3'-甲氧基苯乙酮,Ace)与牛血清白蛋白(BSA)在缓冲溶液(pH≈7.0)中的相... 在298.15K下利用等温滴定微量热法研究了丹皮酚(2'-羟基-4'-甲氧基苯乙酮,Pae)及其两种同分异构体(2'-羟基-5'-甲氧基苯乙酮,Hma;4'-羟基-3'-甲氧基苯乙酮,Ace)与牛血清白蛋白(BSA)在缓冲溶液(pH≈7.0)中的相互作用.从药物分子在蛋白质分子上有多种类型相互独立的结合位点的假定出发,应用Langmuir吸附模型对这三种同分异构体与BSA相互作用的量热数据进行了处理.结果表明,有两类结合位点存在,同时计算出了两类结合模式的结合常数、焓变、熵变及吉布斯自由能变等热力学数据.这两类结合主要以焓驱动为主,并且在同一类结合位点上,Pae,Hma以及Ace与BSA结合过程的焓变绝对值依次减小,这主要是由于客体分子苯环上取代基的相对位置不同而引起热力学数据的差异.圆二色谱研究表明这三种同分异构体的加入均使BSA的二级结构发生变化,说明这种生物大分子-药物分子相互作用既包含结合反应也包含小分子诱导BSA分子部分结构改变的过程. 展开更多
关键词 等温滴定微量热法 牛血清白蛋白 丹皮酚 圆二色法
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等温滴定量热法研究牛血清白蛋白与十二烷基二羟乙基甲基溴化铵的相互作用 被引量:5
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作者 胡晓环 童威 +2 位作者 邵爽 雷群芳 方文军 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期525-529,共5页
用等温滴定热量计测定了牛血清白蛋白(BSA)与十二烷基二羟乙基甲基溴化铵(DDHAB)的相互作用焓,探讨了表面活性剂浓度、温度和盐浓度等对相互作用焓的影响.BSA与表面活性剂相互作用焓是静电作用、去水化作用、疏水作用和表面活性剂胶束... 用等温滴定热量计测定了牛血清白蛋白(BSA)与十二烷基二羟乙基甲基溴化铵(DDHAB)的相互作用焓,探讨了表面活性剂浓度、温度和盐浓度等对相互作用焓的影响.BSA与表面活性剂相互作用焓是静电作用、去水化作用、疏水作用和表面活性剂胶束化等协同作用的结果,在其他条件保持不变时,相互作用焓随表面活性剂浓度改变,在临界胶束浓度(CMC)前后区域分别出现吸热峰.加入NaCl可引起相互作用焓峰值及其位置的变化. 展开更多
关键词 等温滴定量热法 牛血清白蛋白 表面活性剂 相互作用
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环糊精与新型表面活性剂的主客体相互作用 被引量:17
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作者 曲秀葵 孙德志 +2 位作者 郑文清 刘敏 魏西莲 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第1期116-119,共4页
在298.15K下用微量热法结合核磁共振法研究了α-环糊精,β-环糊精与十二烷基多氧乙烯磺酸钠C12EnS(n=1,3)在水溶液中的包结作用.实验结果表明,"-环糊精与客体的包合是焓、熵共驱的过程,α-环糊精与客体的包合则是焓驱动过程."... 在298.15K下用微量热法结合核磁共振法研究了α-环糊精,β-环糊精与十二烷基多氧乙烯磺酸钠C12EnS(n=1,3)在水溶液中的包结作用.实验结果表明,"-环糊精与客体的包合是焓、熵共驱的过程,α-环糊精与客体的包合则是焓驱动过程."-环糊精与两种客体包合的化学计量比随客体中氧乙烯链的不同而不同,而α-环糊精与两种客体包合的化学计量比则无差别.1HNMR数据表明,C12EnS的存在使两种环糊精上各质子的化学位移向高场移动,从微观上证明了包结作用的发生. 展开更多
关键词 环糊精 ^1H核磁共振 包合物 微量热 十二烷基多氧乙烯基磺酸钠
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脲和盐酸胍诱导过氧化氢酶去折叠的研究 被引量:15
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作者 焦铭 梁毅 +1 位作者 李洪涛 王曦 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第9期1362-1368,共7页
用荧光相图法分别研究了脲和盐酸胍诱导牛肝过氧化氢酶去折叠的过程 .当脲浓度从 0依次增大至 0 5 0 ,4 5和8 0mol/L时 ,过氧化氢酶从天然四聚体依次转变为蓬松的四聚体、部分折叠的无活性二聚体和去折叠态 ,而当盐酸胍浓度从 0依次变... 用荧光相图法分别研究了脲和盐酸胍诱导牛肝过氧化氢酶去折叠的过程 .当脲浓度从 0依次增大至 0 5 0 ,4 5和8 0mol/L时 ,过氧化氢酶从天然四聚体依次转变为蓬松的四聚体、部分折叠的无活性二聚体和去折叠态 ,而当盐酸胍浓度从 0依次变化至 0 65 ,2 5和 6 0mol/L时 ,过氧化氢酶则从天然四聚体依次转变为部分折叠的激活二聚体、部分折叠的单体和去折叠态 ,这表明无论是用脲还是用盐酸胍作为变性剂 ,该蛋白的变性过程都符合“四态模型” ,但这两种变性剂诱导该蛋白去折叠的途径和机制有较大差异 .实验结果表明荧光相图法可以检测蛋白质去折叠的中间态 .用等温滴定量热法研究了盐酸胍诱导过氧化氢酶去折叠过程的热力学 ,2 5 0℃时低浓度盐酸胍诱导该蛋白从天然四聚体转变为部分折叠的激活二聚体的本征摩尔构象变化焓、Gibbs自由能和熵分别为 -69 2kJ·mol-1,6 43kJ·mol-1和 -2 5 4J·K-1·mol-1,据此推断盐酸胍通过熵效应和静电效应来稳定和激活该二聚体 . 展开更多
关键词 盐酸胍 诱导 过氧化氢酶 去折叠 蛋白质 热力学 等温滴定量热法 荧光相图法
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